Apport de la modélisation ontologique pour le partage des … · 2020-04-20 · Traitement...

Apport de la modelisation ontologique pour le partagedes connaissances en psychiatrie et la decouverte de

profils resistants

Marion RichardINSERM UMRS 1142

Directeur de these : Jean Charlet

Lundi 21 octobre 2013

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Sommaire

Sommaire

1 Parcours etudiant

2 Projet de theseContexte et identification des besoinsLe projet CovalmoPlan de travail du projet CovalmoLes debuts du projet

3 Conclusions

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Parcours etudiant

Universite de Paris-Sorbonne

Linguiste Informaticienne

Competences acquises en :

Traitement Automatique des Langues

Traitement Automatique de la Parole

Ingenierie des connaissances

Memoire de recherche - M1 : les troubles du langage dans laschizophrenie

Realise en partenariat avec le Dr Isabelle Amado du SHU deSainte-AnneEtude des productions langagieres orales dans un corpus composed’autant de sujets sains que de patients schizophrenesResultats : utilisation reduite de la reference definie : mise encorrelation avec un deficit cognitif. Differenciation entre sujets sains etpatients schizophrenes realisee a 60%

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Projet de these Contexte et identification des besoins

Projet de these I

Contexte

Domaine de la psychiatrie : caracterisation des pathologies

Nomenclatures et classifications : le DSM-IV et la CIM-10

Travail a partir de CRH semi-standardises

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Projet de these Contexte et identification des besoins

Projet de these II

Identification des besoins

Definir un outil permettant de mieux rendre compte desdiagnostics poses et des actes pratiques

Prise en compte de la comorbidite

Permettre l’indexation des dossiers des patients en vue de constituerdes cohortes pour les recherches cliniques

Identifier des profils de sujets resistants

Proposer des outils de recherche d’informations semantiques fondes surune ontologie

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Projet de these Le projet Covalmo

Covalmo

Construction et validation d’une ontologie de la psychiatrie pourl’aide au reperage de patients schizophrenes resistants aux traitementsProjet ANR franco-luxembourgeois de 48 mois, depose et refuse en2013Partenaires : INSERM (fr), CRP Henri Tudor (lu), Centre HospitalierSainte-Anne (fr)

Apports personnels

Proposer des solutions de traitements de corpus afin de concevoir etdevelopper une ontologie apte a repondre aux besoins enonces

Developper des outils de fouille de donnees medicales

Marion Richard, Xavier Aime, Marie-Odile Krebs and JeanCharlet. Au dela du DSM : les ontologies comme aide auxclassifications descriptives psychiatriques ? In Actes de la conferenceSymposium sur l’Ingenierie de l’Information Medicale, SIIM 2013,Lille, France

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Plan de travail du projet Covalmo

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Projet de these Les debuts du projet

Premiere realisation : anonymisation du corpus avecMedina

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Projet de these Les debuts du projet

Construction de l’ontologie a partir de textes

� Le patient decrit la survenue tres reguliere (tous les 2-3 mois) de crisesd’angoisses breves avec repercussion comportementale et somatique,soulagees par le cannabis et le Lexomil, et cela depuis plus de 10 ans. �

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Projet de these Les debuts du projet

Construction du modele des patients

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Projet de these Les debuts du projet

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Projet de these Les debuts du projet

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Projet de these Les debuts du projet

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Projet de these Les debuts du projet

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Projet de these Les debuts du projet

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Projet de these Les debuts du projet

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Conclusions

Conclusions

Mes contributions

Construction d’une ontologie de la psychiatrie et de l’outil defouille de donnees medicales

Pour permettre un etiquetage des CRH plus fin tenant compte de lacomorbiditeA destination avant tout des medecins du Centre HospitalierSainte-Anne et de la communaute psychiatrique

Retombees pour les partenaires et utilisateurs

Indexation semantique fondee sur l’ontologie

Constituer des cohortes pour des etudes cliniques, l’un des besoinsmajeurs du GDR en psychiatrie

Fouille de donnees semantiqueIdentifier des profils de patients resistants, objet des recherches duSHU de sainte-Anne

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