Biochimie des Protéines · 2.3 Structure tertiaire 2.3.1 Maintien de la structure Type...

Biochimie des Protéines

Licence STS Biologie-Biochimie UEO26 L3

Vincent Vedel

Chap. 2: Structure des protéines

• 2.1 Structure primaire

• 2.2 Structure secondaire

• 2.3 Structure tertiaire

• 2.4 Structure quaternaire

Introduction

2.1 Structure primaire 2.1.1 Structure primaire linéaire

2.1 Structure primaire 2.1.1 Structure primaire linéaire

2.2 Structure secondaire

2.2 Structure secondaire 2.2.1 L’hélice alpha

2.2 Structure secondaire 2.2.2 Le feuillet beta

2.2 Structure secondaire 2.2.3 Hélice vs feuillet

résidu

fréquence dans une hélice α (1=distribution aléatoire)

résidu fréquence dans un feuillet β (1=distribution aléatoire)

E 1,59 V 1,87

A 1,41 I 1,67

L 1,34 Y 1,45

M 1,3 C 1,40

Q 1,27 W 1,35

K 1,23 F 1,33

R 1,21 L 1,22

F 1,16 T 1,17

I 1,09 M 1,14

H 1,05 Q 0,98

W 1,02 S 0,96

D 0,99 R 0,84

V 0,90 H 0,80

T 0,76 A 0,72

N 0,76 K 0,69

Y 0,74 G 0,58

C 0,66 E 0,52

S 0,57 N 0,48

G 0,43 D 0,39

P 0,34 P 0,31

2.2 Structure secondaire 2.2.4 Autres structures secondaires

2.2 Structure secondaire 2.2.4 Autres structures secondaires

2.3 Structure tertiaire 2.3.1 Maintien de la structure

Type d'interaction Changement dans l'énergie libre (en kJ/mol)

lien covalent (carbone-carbone) -350 (très solide!)

interaction hydrophobique -10

interaction ionique (pont de sel) -4

pont hydrogène (entre H et F,O ou N) -3

forces de Van der Waals -1

2.3 Structure tertiaire 2.3.2 Fibres et globules

2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

2.3 Structure tertiaire 2.3.4 Les chaperones

2.3 Structure tertiaire 2.3.5 Quand la structure tertiaire cafouille

Dr Stanley Prusiner Photo (c) 2000 The Nobel Institute.

2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique

2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique

2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique: par le protéasome

2.4 Structure quaternaire 2.4.1 Hémoglobine

2.4 Structure quaternaire 2.4.1 Hémoglobine

2.4 Structure quaternaire 2.4.2 Anémie falciforme