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SARS-CoV-2 NGSパネルIllumina&MGIシーケンサー対応!!
【特長】・SARS-CoV-2ウイルスの完全なゲノム配列決定を可能・非常に低いウイルスコピー数に対して卓越した感度・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ・単一チューブ内および5.5時間のワークフロー
【CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel】
本パネルは、SARS-CoV-2用のNGSパネルであり、完全ゲノム配列決定を可能にします。低ウイルスコピー、低シークエンス深度の条件であっても卓越した感度で解析が可能なため、コストの大幅な削減につながります。
非標的DNAの除去 シャープかつクリーンなライブラリピークが取得可能!!
▲バックグラウンドクリーニングを実施(ブルー)、未実施(オレンジ)ライブラリーのフラグメントサイズ分布
RNA
Purification
and QC
1. cDNA Synthesis
2. Target Amplification
3. Background Cleaning
4. Indexing & Amplification
Quality
Control &
Sequencing
CleanPlex Library Preparation Workflow ハンズオンタイム1時間で調製可能!!(トータルアッセイは5.5時間)
CleanPlex® シリーズ
利点・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ・正確なバリアントコール・少ないシークエンスコスト・単一チューブおよびハンズオンタイム3時間のワークフロー・扱いが難しい試料(劣化したFFPE、cfDNA)との互換性・Illumina、MGISeqとの互換性・極めて高い感度(10ngインプットで1%LOD)
独自のプライマー設計アルゴリズム、均一なマルチプレックスPCR増幅、特許取得済のバックグラウンドクリーニングを組み合わせることで、PCR、アンプリコンおよびハイブリッドキャプチャベースのターゲットエンリッチメントテクノロジーの限界を打ち破ることができます。
ターゲットサイズ 29,903 bp
アンプリコンの数 343
アンプリコンのサイズ 116 - 196 bp, Median 149bp
プライマープールの数 2
メジャーな株の完全長をカバー MN908947, MT007544
Wuhan-Hu-1株(MN908947/NC_045512.2)全長を99.7%をカバーするよう設計されています。
独自開発のプライマー!! 大多数のSARS-CoV-2株の全長解析が可能!!
ゲノムカバレッジに関する参考データ
◀PEリード数とInputウイルスコピー数による10×のシークエンス深度のゲノムカバレッジ
低いウイルスコピー数においても高いゲノムカバレッジで解析可能!!
さまざまなウイルス量のサンプルを用いてテストした結果です。20 コピー/rxnであっても、50K PEで高いパフォーマンスを維持し、シークエンスコストを低く抑えることが可能です。
品名 容量 税別価格(For Illumina) 税別価格(For MGI)
CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel
8 rxns ¥139,000 ¥129,000
96 rxns ¥737,000 ¥653,000
384 rxns ¥2,641,000 ¥2,319,000
※ CleanMag Magnetic BeadsはAgencourt™ AMPure™ XP Kit (Beckman Coulter)を代替品としてご使用いただけます。
※CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel for Illuminaのテストデータです。
【お問い合わせ】 試薬部
TEL:052-624-4388 FAX:052-624-4389
メール:biosupport@filgen.jp URL:https://filgen.jp/
代理店
(July.2020)
フィルジェン 株式会社
臨床検体(鼻咽頭スワブ)から抽出した4〜40,000コピー/ µL(input:5.5 μl)RNAを使用したテストデータです。50×のシークエンス深度であっても低いシークエンスコストで全長をカバーすることが可能です。
◀PEリード数とInputウイルスコピー数による50×のシークエンス深度のゲノムカバレッジ
変異検出精度に関する参考データ 非常に高い精度でSARS-CoV-2の変異を検出することが可能!!
◀SARS-CoV-2 MT007544株RNAを使用して本パネルで全長解析を行い、検出が予想される4つの変異の検出率の結果
検出が予想される3箇所のSNVと1箇所の欠損を99%の頻度で検出することが可能です。
製品ラインナップと価格
品名 容量パネルt同時購入
税別価格(For Illumina)パネルと同時購入
税別価格(For MGI)
CleanPlex® Indexed PCR Primers8 rxns ¥32,000 -
96 rxns ¥87,000 ¥120,000
CleanMag® Magnetic Beads1 ml, 9 rxns ¥21,000 ¥21,000
5 ml, 45 rxns ¥43,000 ¥43,000
※ CleanPlex® Indexed PCR Primers と CleanMag Magnetic Beads はPanelに含まれおりませんので別途購入が必要です。
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