Upload
timothee-poisot
View
577
Download
1
Embed Size (px)
Citation preview
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus (Monogenea) parasites de sparidésSpéciations en cours?
Timothée Poisot Olivier Verneau Yves Desdevises
Stage de M2 effectué à l’Observatoire Océanographique de Banyuls-sur-MerUMR CNRS 7628 “Modèles en Biologie Cellulaire et Évolutive”
Univ. Paris 6
18 septembre 2008
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 1 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Les monogènes
Parasites de poissons(principalement)Cycle de vie direct(hôte-environnement-hôte)Degré de spécificitéimportant
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 2 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Les monogènes
Parasites de poissons(principalement)Cycle de vie direct(hôte-environnement-hôte)Degré de spécificitéimportant
Ventouseantérieure
Hapteur�xé sur le�lament
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 2 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Les monogènes
Parasites de poissons(principalement)Cycle de vie direct(hôte-environnement-hôte)Degré de spécificitéimportant
Hôte 1
Hôte 2
Hôte 3
Parasite 1
Parasite 2
Parasite 3
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 2 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Les monogènes
Parasites de poissons(principalement)Cycle de vie direct(hôte-environnement-hôte)Degré de spécificitéimportant
Hôte 1
Hôte 2
Hôte 3
Parasite 1
Parasite 2
Parasite 3
Hypoth
èse!
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 2 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus parasites de sparidésDesdevises et coll. (2002, Evolution)
L. elegansL. coronatusL. furcosusF. echeneisL. mormyriL. verberisL. drummondiL. virgulaL. imperviusL. parisiL. mirandusL. gracilisL. bidensL. hiliiL. knoeppfleriL. ergensiL. fraternusL. ignoratusL. baeriL. erythrini
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 3 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus parasites de sparidésDesdevises et coll. (2002, Evolution)
S. cantharus
B. boops
S. salpa
L. mormyrus
D. sargus
D. cervinus
O. melanura
D. puntazzo
D. annularis
D. vulgaris
S. aurata
P. acarne
P. bogaraveo
D. dentex
P. pagrus
P. erythrinus
L. elegansL. coronatusL. furcosusF. echeneisL. mormyriL. verberisL. drummondiL. virgulaL. imperviusL. parisiL. mirandusL. gracilisL. bidensL. hiliiL. knoeppfleriL. ergensiL. fraternusL. ignoratusL. baeriL. erythrini
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 3 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus parasites de sparidésDesdevises et coll. (2002, Evolution)
S. cantharus
B. boops
S. salpa
L. mormyrus
D. sargus
D. cervinus
O. melanura
D. puntazzo
D. annularis
D. vulgaris
S. aurata
P. acarne
P. bogaraveo
D. dentex
P. pagrus
P. erythrinus
L. elegansL. coronatusL. furcosusF. echeneisL. mormyriL. verberisL. drummondiL. virgulaL. imperviusL. parisiL. mirandusL. gracilisL. bidensL. hiliiL. knoeppfleriL. ergensiL. fraternusL. ignoratusL. baeriL. erythrini
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 3 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Évolution des Lamellodiscus : hypothèses
Transfert d’hôteMis en évidence pourGyrodactylus (e.g. Huyse etcoll. 2005)Supposé important pourLamellodiscus (Desdeviseset coll. 2002)
Spéciation indépendanteMis en évidence pourDactylogyrus (Šimková etcoll. 2004)Jamais étudié pourLamellodiscus
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 4 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Objectifs
Détection d’événements de spéciationÉvaluation du statut taxonomique
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 5 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Objectifs
Détection d’événements de spéciationÉvaluation du statut taxonomique
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 5 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Morphométrie
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 6 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Morphométrie
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 6 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Séquençage
18S (SSU) 5.8SITS 1
COI
500pb Taille variable
300pb
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 7 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Détecter de potentielles spéciationsPoisot et Desdevises (soumis, Parasitology)
PourquoiRôle adaptatif du hapteurMesures facilementidentifiables
AnalyseACPHierarchical clustering etbootstrap non paramétrique
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 8 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Spéciations entre les hôtes ?
D. sargus D. vulgaris O. melanura−6−4
−20
24
Lamellodiscus elegans ?
D. puntazzo D. sargus D. vulgaris L. mormyrus S. salpa
−6−4
−20
24
Lamellodiscus ignoratus
D. sargus D. vulgaris
−4−2
02
4
Lamellodiscus kechemirae ?
D. puntazzo D. sargus D. vulgaris
−8−6
−4−2
02
Lamellodiscus ergensi ?
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 9 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Spéciations intra-hôte ?Le cas de Lamellodiscus elegans sur Diplodus sargus
6 5 4 3 2 1 0 1 2 3 4
2.5
1.5
0.5
0.5
1.0
1.5
2.0
1st axis: 74.5 %
2nd
axis
: 9.
28 %
D. sargus 1D. sargus 1
D. sargus 2
D. sargus 2
D. sargus 2
D. sargus 3D. sargus 3
D. sargus 3D. sargus 6
D. sargus 6
D. sargus 7
D. sargus 7D. sargus 7
D. sargus 7
D. sargus 7
D. sargus 8
D. sargus 8D. sargus 8
D. sargus 8
D. sargus 9
D. sargus 9D. sargus 9
D. sargus 9
100
48
44
90
37
62
63
53
57
43
39
8
99
44
14
85
12
7
38
31
68
11
Hosts 1, 8 and 9
Hosts 2, 3, 6 and 7
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 10 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Spéciations intra-hôte ?Le cas de Lamellodiscus elegans sur Diplodus sargus
Value on first axis of PCA
Dis
tribu
tion
−6 −4 −2 0 2 4
0.00
0.05
0.10
0.15 D. sargus 1
D. sargus 1
D. sargus 2
D. sargus 2
D. sargus 2
D. sargus 3D. sargus 3
D. sargus 3D. sargus 6
D. sargus 6
D. sargus 7
D. sargus 7D. sargus 7
D. sargus 7
D. sargus 7
D. sargus 8
D. sargus 8D. sargus 8
D. sargus 8
D. sargus 9
D. sargus 9D. sargus 9
D. sargus 9
100
48
44
90
37
62
63
53
57
43
39
8
99
44
14
85
12
7
38
31
68
11
Hosts 1, 8 and 9
Hosts 2, 3, 6 and 7
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 10 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Vers une nouvelle phylogénie (18S)Poisot, Verneau et Desdevises (en préparation)
D. aequans
L. echeneis
L. furcosus
L. furcosus
L. coronatus
L. furcosus
L. drummondi
L. elegans
L. elegans
L. elegans
L. elegans
L. mormyri
L. verberis
L. obeliae
L. virgula
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. bidens
L. hilii
L. gracilis
L. mirandus
L. parisi
L. impervius
0.89
0.57
0.99 (0.80)
1.00 (0.86)
0.95 (0.95)
0.94
1.00 (100)
1.00
1.00 (1.00)
0.79
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
1.00 (0.87)
1.00 (0.82)
0.64
0.99 (0.87)
2
1
E
MVB
LDB
MCO
“Éspèces” paraphylétiquesPas de congruence entremorphologie et génétique
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 11 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Vers une nouvelle phylogénie (18S)Poisot, Verneau et Desdevises (en préparation)
D. aequans
L. echeneis
L. furcosus
L. furcosus
L. coronatus
L. furcosus
L. drummondi
L. elegans
L. elegans
L. elegans
L. elegans
L. mormyri
L. verberis
L. obeliae
L. virgula
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. bidens
L. hilii
L. gracilis
L. mirandus
L. parisi
L. impervius
0.89
0.57
0.99 (0.80)
1.00 (0.86)
0.95 (0.95)
0.94
1.00 (100)
1.00
1.00 (1.00)
0.79
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
1.00 (0.87)
1.00 (0.82)
0.64
0.99 (0.87)
2
1
E
MVB
LDB
MCO
“Éspèces” paraphylétiquesPas de congruence entremorphologie et génétique
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 11 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ...
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
2
1
ELe groupe “ignoratus” n’estpas monophylétique
Deux LITUs, falcus (1) andabbreviatus (2)Des individus dans leclade “ergensi” (E)
Diversité intra-LITU pourfalcus et abbreviatus ≈diversité intra-spécifiqueÉvolution morphologique 6=évolution moléculaire :pression de sélection forte !
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 12 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ...
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
2
1
ELe groupe “ignoratus” n’estpas monophylétique
Deux LITUs, falcus (1) andabbreviatus (2)Des individus dans leclade “ergensi” (E)
Diversité intra-LITU pourfalcus et abbreviatus ≈diversité intra-spécifiqueÉvolution morphologique 6=évolution moléculaire :pression de sélection forte !
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 12 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ...
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
2
1
ELe groupe “ignoratus” n’estpas monophylétique
Deux LITUs, falcus (1) andabbreviatus (2)Des individus dans leclade “ergensi” (E)
Diversité intra-LITU pourfalcus et abbreviatus ≈diversité intra-spécifiqueÉvolution morphologique 6=évolution moléculaire :pression de sélection forte !
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 12 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ...
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
2
1
ELe groupe “ignoratus” n’estpas monophylétique
Deux LITUs, falcus (1) andabbreviatus (2)Des individus dans leclade “ergensi” (E)
Diversité intra-LITU pourfalcus et abbreviatus ≈diversité intra-spécifiqueÉvolution morphologique 6=évolution moléculaire :pression de sélection forte !
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 12 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ...
L. abbreviatus
L. abbreviatus
L. confusus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. ignoratus
L. diplodi
L. ignoratus
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. neifari
L. baeri
L. erythrini
L. ergensi
L. ergensi
L. fraternus
L. sanfillipoi
L. kechemirae
L. tomentosus
L. knoeppfleri
L. falcus
L. falcus
L. ignoratus
L. ignoratus
0.93
0.91
1.00
0.64
1.00
0.94
0.78
0.66 1.00
0.93 (0.76)
0.92 (0.72)
1.00 (0.73)
0.94
0.79
0.60
0.77
2
1
ELe groupe “ignoratus” n’estpas monophylétique
Deux LITUs, falcus (1) andabbreviatus (2)Des individus dans leclade “ergensi” (E)
Diversité intra-LITU pourfalcus et abbreviatus ≈diversité intra-spécifiqueÉvolution morphologique 6=évolution moléculaire :pression de sélection forte !
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 12 / 13
Introduction Méthodes Utilisation de la morphométrie Phylogénie et diversité
Merci de votre attention
Timothée Poisot (Obs. Banyuls) Spéciations chez Lamellodiscus 18 septembre 2008 13 / 13