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Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie (SNV) Filière : Sciences biologiques Spécialité : Biodiversité et physiologie végétale II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements (Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

virtuelcampus.univ-msila.dzvirtuelcampus.univ-msila.dz/.../uploads/2016/04/Pro-SNV.docx · Web viewTP Autres Continu Examen UE F2 9 18 Techniques d’identification et de quantification

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Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie (SNV)

Filière : Sciences biologiques

Spécialité : Biodiversité et physiologie végétale

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

1- Semestre 1 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UEF1 9 18Aspects biochimiques et pathologie humaines et animales 90h 3h 3h 110h 4 8 30 70

Analyses biochimiques des aliments 67h30 3h 1h30 82h30 3 6 30 70

Enzymologie appliquée 45h 1h30 1h30 55h 2 4 30 70UEM1 5 9Application des méthodes spectrales en analyses biochimiques

60h 1h30 1h 1h30 65 3 5 30 70

Expérimentation animale 45h 1h30 1h30 55 2 4 30 70UED1 1 2Anglais scientifique 45h 1h30 1h30 2 4 30 70UET1 1 1Communication 22h30 1h30 2h30 1 1 - -Total Semestre 1 375h 375 16 30

2- Semestre 2 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UEF2 9 18Techniques d’identification et de quantification 90h 3h 1h30 1h30 110h 4 8 30% 70%

Techniques de biologie moléculaire 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 30% 70%

Techniques d’extraction, de purification et de conservation 45h 1h30 - 1h30 55h 2 4 30% 70%

UEM2 5 9Biochimie Appliquée 60h 1h30 1h30 1h 65h 3 5 30% 70%Hygiène et sécurité dans les laboratoires 45h 1h30 - 1h30 55h 2 4 30% 70%

UED2 1 2Bioinformatique 45h 1h30 - 1h30 55 1 2 30% 70%UET2 1 1Législation 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 100

Total Semestre 2 375 375 16 30

3- Semestre 3 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation 14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UEF3 9 18Activité des substances biochimiques : principes et applications

90h 3h 3h 110h 4 8 30% 70%

Pharmacologie et toxicologie 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 30% 70%Génie immunologique 45h 3h 1h30 - 55h 2 4 30% 70%UEM3 5 9Biostatistiques appliquées au contrôle de qualité 60h 1h30 1h30 1h 65h 3 5 30% 70%

Recherche bibliographique 45h 1h30 1h30 55h 2 4 30% 70%UED3 1 2Immuno-hématologie 45h 1h30 1h30 5h 1 2 30% 70% UET3 1 1Entreprenariat 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 - 100%Total Semestre 3 375h - - - 375 16 30 - -

4- Semestre 4 :

Domaine  : SNVFilière : BiochimieSpécialité : Analyses Biochimiques

Le stage d’initiation à la recherche ou le stage professionnel est obligatoire au cours du 4 ème semestre et représentent 25% du volume horaire global de la filière. Il est équivalent à 6 modules; soit un semestre. Le stage peut se faire dans une structure de recherche affiliée à l’université ou à un établissement ou institution public, semi-public ou privé ou dans une institution dans le domaine de formation de la filièreIl fait l’objet d’un mémoire et d’une soutenance devant un jury et d’une note. Le jury de soutenance est composé d’au moins trois intervenants dans la filière dont l’encadrant du stage.

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.VHS Coeff Crédits

Travail Personnel 225 09 18Stage en entreprise 112.5 05 9Séminaires 37.5 02 3Autre (préciser) - - -Total Semestre 4 375 16 30

Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 382h30 135h 67h30 67h30 652h30TD/ TP 217h30

0165h 67h30- - 90h

Travail personnel 742h30 360h 15h 7h30 0750hMémoire 225h - - - -Stage en entreprise - 112h30 - - -Séminaires - - 37h30 - -Total 1567h30 772h30 187h30 75h 1650hCrédits 72 36 9 3 120% en crédits pour chaque UE 60% 30% 7.5 2.5 100%

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE FondamentalesIntitulé de la matière : Aspects biochimiques de pathologies humaines et animalesCrédits : 8

Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant suivant cette unité est censé connaître les différents aspects biochimiques qui se manifestent lors d'une pathologie humaine et savoir exploiter les résultats d'une analyse médicale.De plus des connaissances équivalentes en ce qui concerne les atteintes chez les animaux.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Biochimie structurale et métabolique, Endocrinologie, Immunologie, Enzymologie.

Contenu de la matière : 

Introduction ;

Aspects biochimiques liés aux pathologies :

1. Hépatiques

2. Autoimmunes

3. Rénales

4. Endocriniennes

5. Respiratoires

6. Sanguines

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Pharmaceutical analysis, chemistry an introduction for medical and health sciences, Principes des techniques de biologie moléculaire, Biologie-cellulaire&moléculaire, Biochimie et biologie moléculaire, Biologie cellulaire & moléculaire : concept & expériences, biologie moléculaire biochimie des communications cellulaires, Précis de biochimie et biologie moléculaire de la biologie à la clinique

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE FondamentalesIntitulé de la matière : Analyses Biochimiques des alimentsCrédits : 6

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant suivant cette unité est censé connaître les différents aspects et techniquesbiochimiques qui régissent le contrôle de qualité des aliments. De plus, les étudiants vontacquérir des notions de normalisation et connaître les normes nationales et internationales

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Biochimie structurale et métabolique.

Contenu de la matière : 

IntroductionStandardisation et normalisation des méthodes d'analyses et expression des résultatsDosages des constituants des aliments (Protéines, sucres, lipides, vitamines, minéraux,cendres et matières sèche)

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Méthodes instrumentales d'analyse chimique et applications, Principes des méthodes d'analyse biochimique, Génie génétique et biotechnologies, Génie enzymatique, Techniques de laboratoires, biotechnologie, Guide des examens de laboratoire, Principes d' analyse instrumentale, Analyse chimique méthodes et techniques , Génie industrielle alimentaire, Analyse chimique volumétrique.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE FondamentalesIntitulé de la matière : Enzymologie AppliquéeCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Avoir des compétences de préparations d'enzymes immobilisées et leurs différentesapplications.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Biochimie structurale et métabolique, Enzymologie.

Contenu de la matière : 

IntroductionRappel des cinétiques enzymatiquesImmobilisation des enzymesApplications des enzymes (médicales, pharmaceutiques et industrielles)

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Génie enzymatique Cinétique chimique. Cinétique enzymatique Enzymologie moléculaire et cellulaire tome 1 et 2, Cinétique chimique et structure de la matière, Biochimie, Biochimie Structure et fonctions des protéines, Les enzymes biocatalyseurs protéiques.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE MéthodologiqueIntitulé de la matière : Application des méthodes spectrales en analyses biochimiques

Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant apprendra les différents dangers, dans les laboratoires, auxquels sont exposéesles personnes y manipulant, les règles de sécurité et le comportement du manipulateurdans un laboratoire d'analyse et/ou de recherche..Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Techniques d'analyses Biochimiques, Microbiologie générale

Contenu de la matière :Chapitre1 : rappel sur les méthodes spectrales : UV-Visible, Infrarouge, Absorption atomique, Emission Atomique... : technologie, réalisation et interprétation de spectres, analyse quantitative ;RMN : technologie, Chapitre2 : Apport des méthodes spectrales en Analyses biochimiques : 1 - Applications qualitatives. 1.1 - acquisition de spectres et interprétations simples. 1.2 - Détermination des structures. 2 - Application quantitatives. 2.1- Applications pharmaceutiques. 2.2- Applications biochimiques. 2.3- Etude des substances végétales.

2.4- Méthodes indirectes : Couplage aux marqueurs fluorescents.2.5- Applications à l’immunofluorescences.

2.5.1- polarisation de fluorescence.2.5.1- fluorescence en temps retardé.

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE MéthodologiqueIntitulé de la matière : EXPERIMENTATION ANIMALE

Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Maîtriser les fondamentaux de l’expérimentation animale.

Etre capable d’utiliser l’appareillage du laboratoire de physiologie.

Connaissances préalables recommandées ( descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement ± Maximum 2 lignes).

Biologie générale, biologie animale, Histologie

Contenu de la matière : Expérimentation animale- Réglementation

- Classification des animaux de laboratoire

- Pratique de l’expérimentation - L’animalerie

- Transport, identification, manipulation, contention et alimentation des animaux

- Hygiène et contrôle de la nourriture

- Notions sur la physiologie d’organes de l’animal de laboratoires, stress, douleur

- Applications professionnelles

Mode d’évaluation : 100% Examen

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc.).

J.V. Laborde. 2000. l’expérimentation et la méthode expérimentale en thérapeutique.

Ed. Masson.

Laurent J. 1997. Expérimentation animale ± Mode d’emploi. Ed. Inserm.

Tam Bourin P. 1998. Livre blanc sur l’expérimentation animale. Ed. CNRS

Karine Lou Matignon. 1998. L’animal objet d’expérience .Ed. Anne carriqre Eds.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE DécouverteIntitulé de la matière : Anglais scientifique

Crédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Lecture et analyse d'articles scientifiques. Communication de résultats de travauxscientifiques.Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Anglais AS1

Contenu de la matière : 

Lecture et analyse d'articles scientifiques. Communication de résultats de travauxscientifiques.

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE TransversaleIntitulé de la matière : Techniques de Communication (TC)Crédits : 1Coefficients : 1

Connaissances préalables recommandées Français de base, notions sur la communicationContenu de la matière : Chapitre 1 : Le formateur et la communication1.1. La communication1.2. Créer le cadre d’une séquence de formation : le « SIOM »Chapitre 2 : La communication dans l’entreprise2.1. La communication dans l’entreprise2.2. Formes de la communication, réseaux et outils de la communicationChapitre 3 : Supports pédagogiques et communication3.1. Quelques points de repères généraux3.2. Préparer et utiliser un diaporama

3.3. Utiliser le tableau à feuilles3.4. Utiliser des flip charts3.5. La technique du métaplan3.6. Intégrer l’audiovisuel dans la formation3.7. Les notes écritesAnnexe : Création d’un diaporamaChapitre 4 : Techniques d’animation de groupes4.1. Les trois fonctions de l’animation de groupes4.2. Méthode magistrale : le choix d’une technique de formation4.3. Méthode démonstrative : la technique de l’exercice pratique (les A.P.)4.4. Méthode de la découverte : choix d’une technique d’animation4.5. L’importance des consignes dans les méthodes démonstratives et de la découverteChapitre 5 : Les différents types et la conduite de réunions5.1. La conduite de réunions5.2. Les différents types de réunionsChapitre 6 : Communication et relation de coaching6.1. Le coaching : quelques points de repère6.2. Les entretiens de coaching6.3. Quelques techniques de coachingChapitre 7 : Les ressources documentaires : où trouver l’information ?7.1. Gestion de l’information7.2. Les grands services d’Internet7.3. Organiser sa recherche documentaire en ligne

Autres : exposés semi mensuels individuels (diaporamas et discussion des exposés des autres matières) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). MUCCHIELLI, R. (2000). La conduite des réunions, Les fondamentaux du travail en groupe (Collection Formation Permanente – Séminaires Mucchielli), ESF éditeur, 2000.WALLEN, D. National Training Laboratories.WATZLAWICK, P. (1979). Une logique de la communication, Paris, Éd. du Seuil, 1979.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE FondamentaleIntitulé de la matière : Techniques d’identification et de quantificationCrédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Apprendre les différentes méthodes utilisées pour l'identification et la quantification dessubstances biologiques.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Techniques biochimiques et méthodes spectrales.

Contenu de la matière : 

-Introduction

-Chromatographie (CCM, GC, CC, HPLC)-Electrophorèse-Spectrophotométrie-Radio biologie et marquage à froid (Immuno assays, Fluorescence, Luminescence)

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Méthodes instrumentales d'analyse chimique et applications, - Chromatographie gaz-solide, Techniques de laboratoires, - Abréger de chimie analytique, appareils et méthodes en biochimie et biologie,- Méthodes instrumentales d'analyse chimique et applications, - Principes d'analyse instrumentale, - Analyse chimique méthodes et techniques, - Chimie analytique. - Biology laboratory manual,

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE FondamentaleIntitulé de la matière : Techniques de biologie moléculaireCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L’objectif de cette mention de master est de dispenser une formation d’excellence en

biologie moléculaire et cellulaire ainsi qu'en biochimie, aussi bien au plan théorique que

pratique, suivie d’une spécialisation dans ces domaines ou dans les autres domaines de la

biologie que sont le développement, la génétique, l’immunologie, la microbiologie, la

bioinformatique ou la biophysique..

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

- voir une connaissance approfondie de la biologie en général et des connaissances

spécialisées dans plusieurs domaines correspondant au champ des enseignements

disciplinaires de la mention,

- maîtriser les techniques de base et les appareillages utilisés en biologie moléculaire,

biochimie et biologie cellulaire qui sont indispensables pour l'ensemble de la biologie,

- savoir mettre en œuvre une démarche expérimentale depuis sa conception jusqu'à la

validation des résultats scientifiques obtenus,

Contenu de la matière : 1 Les origines de la Biologie Moléculaire 2

1.1 La théorie cellulaire

1.2 La biochimie

1.3 La génétique

2 Expériences fondatrices 3

2.1 Quelques dates

2.2 L’expérience de Beadle et Tatum

2.3 La nature chimique des gènes

3 De la structure de l’ADN à la régulation de l’expression des gènes 6

3.1 Quelques dates

3.2 La double hélice d’ADN

3.3 La réplication semi-conservative

3.4 La régulation de l’expression des gènes : l’opéron lactose

4 Du génie génétique à la transgénèse

4.1 Quelques dates

4.2 Electrophorèse de l’ADN

4.3 Les enzymes de restriction et autres enzymes

4.4 Vecteurs et transformation des cellules

4.5 Clonage et expression de gènes chez la bactérie

4.6 L’ADN polymérase

4.7 Séquençage de l’ADN (Méthode de Sanger)

4.8 Amplification de l’ADN (PCR)

4.9 Puces à ADN et réseaux génétiques

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

[1] M. Morange. Histoire de la Biologie Moléculaire. Paris, 1994.

[2] B. Alberts, D. Bray, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, and J.D. Watson. Molecular Biology

of the Cell, 3rd. Garland Publishing

Inc., New-York, 1994.

[3] D. Voet and J.D. Voet. Biochemistry, 3rd. New York, 1995.

[4] F. Jacob. La Logique du Vivant. Paris, 1976.

[5] E. Schrödinger. Qu’est-ce que la vie ? Paris,

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE FondamentaleIntitulé de la matière : Techniques d'extraction, de purification et de conservationCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant sera capable de maîtriser les conditions d'extraction de purification et deconservation des substances biologiques en vue de préserver leurs activités.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Biochimie structurale et métabolique, techniques biochimiques.

Contenu de la matière : 

• Solvants organiques• Types d'extraction (solvant, aqueuse, vapeur etc)

• Moyens de purification : Filtration, Centrifugation, Chromatographie,

Electrophorèse

• Techniques de conservation : Froid (cryoconservation), Evaporation, Lyophilisation

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Méthodes instrumentales d'analyse chimique et applications.

- Chromatographie gaz-solide, Techniques de laboratoires.

- Abréger de chimie analytique, appareils et méthodes en biochimie et biologie.

- Méthodes instrumentales d'analyse chimique et applications.

- Principes d'analyse instrumentale.

- Analyse chimique méthodes et techniques.

- Chimie analytique.

- Biology laboratory manual.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE MéthodologiqueIntitulé de la matière : Biochimie AppliquéeCrédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Cette matière s’intéresse à la synthèse des protéines par génie génétique, aux enzymes immobilisées et certaines méthodes appliquées dans le contrôle de qualité et la répression des fraudes en industries agro-alimentaire

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Avoir des notions fondamentales en biochimie.

Contenu de la matière : Biochimie Appliquée 1.Introduction2.Eléments de biotechnologie

Synthèse des protéines par génie génétiquePeptides synthétiquesEnzymes immobilisés

3.Contrôle de qualité et répression des fraudesDosages potentiométriquesDosages volumétriquesDosages enzymatiquesAnalyses électrophorétiques et immunochimiques

4. Industries agro-alimentaire

Mode d’évaluation :  Continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc) :- Méthodes instrumentales d'analyse Chimique et applications.- Principes des méthodes d'analyse biochimique.- Génie génétique et biotechnologies.

- Génie enzymatique.- Techniques de laboratoires, biotechnologie. - Analyse chimique méthodes et techniques.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE MéthodologiqueIntitulé de la matière : Hygiène et sécurité dans les laboratoires

Crédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant apprendra les différents dangers, dans les laboratoires, auxquels sont exposéesles personnes y manipulant, les règles de sécurité et le comportement du manipulateurdans un laboratoire d'analyse et/ou de recherche..Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Techniques d'analyses Biochimiques, Microbiologie générale

Contenu de la matière : 

Dangers chimiques et biologiquesDangers du matériel biologique : ADN, Plasmides, Virus, Bactéries...Comportement dans le laboratoire :Hygiène dans le laboratoirePréservation de l'environnement (récupération et traitement des déchets

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UE Découverte, Intitulé de la matière : Bioinformatique (BINF)Crédits : 05Coefficients : 3

Connaissances préalables recommandées

Connaissances de bases de l’informatique.

Contenu de la matière : 

1- Introduction à la bioinformatique

2- Banque des données biologiques

3- Techniques de l’application de l’informatique à la biologie (Computational Biology)

4- Application sous forme d’accès aux banques de données

5- Application à l’analyse et au traitement des données biologiques

Autres : exposés semi mensuels individuels (modèles expérimentaux) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE TransversaleIntitulé de la matière : Législation en Analyses BiochimiquesCrédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).L'étudiant suivant cette unité est censé mettre en œuvre des opérations d’analyse et de contrôle utilisant des techniques biochimiques et exploiter des résultats ainsi que La mise en place d'un système d'assurance qualité au laboratoireConnaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Biochimie structurale et métabolique, Endocrinologie, Immunologie, Enzymologie.

Contenu de la matière : Introduction

Les principes généraux de l'assurance qualité

Evaluation externe de la qualité

Comptes rendus d'analyse

Confidentialité

Echantillons

Evaluation

Les normes

Règles générales pour l'exécution des analyses.

Règles d'organisation et de fonctionnement

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Martin A., 1995 - Introduction au laboratoire de biochimie médicale - Edition Ellipse ; Coeur A., 1995 - Guide de Bonne Exécution des Analyses de Biologie médicales : l'assurance qualité dans le laboratoire - Spectra Biologie n°95, pp 17-22.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE FondamentalesIntitulé de la matière : Activités des substances biochimiques : Principes et applicationsCrédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Acquisition de connaissances sur les différentes activités biologiques et les méthodes deleurs études.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Biochimie structurale et métabolique, Immunologie.

Contenu de la matière : 

- Activité enzymatique- Activité antioxydante et anti-inflammatoire- Activités antibactériennes antivirales et antifongiques- Dosage des éléments- Dosage des hormones- Activités anticoagulante et antiglycémiantes- Activités biologiques des anticorps et complément

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Principes des méthodes d'analyse biochimique, ed Nelle éd (1 décembre 1998)- Génie génétique et biotechnologies,

- Génie enzymatique, - Techniques de laboratoires, biotechnologie.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE FondamentalesIntitulé de la matière : Pharmacologie-Toxicologie Crédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes)

Faire une recherche bibliographique sur un sujet scientifique de pointe et se préparer à laréalisation de mémoire de fin de cycle.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Contenu de la matière : 

Mode d’évaluation : Présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc.)

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Méthodologie Intitulé de la matière : Génie Immunologique Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L'étudiant apprendra les différentes méthodes utilisées dans la préparation et le contrôlede qualité des réactifs utilisés dans les tests immunologiques..Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)Immunologie, Techniques immunologiques.

Contenu de la matière : 

Rappel sur les antigènes et les anticorpsPréparation des antigènes (Naturels et synthétiques)Préparations des anticorps polyclonaux, oligoclonaux et monoclonauxMarquages des antigènes et des anticorpsChoix de techniques appliquées en immunologieAnalyses de qualité des réactifs immunologiques

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

- Immunologie sciences de la vie et de la terre- Immunobiologie- Les défenses de l'organisme - Immunologie, fondements de l'immunologie- Précis de biochimie et biologie moléculaire de la biologie à la clinique - Principes des techniques de biologie moléculaire

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Découverte Intitulé de la matière : Biostatistiques appliquées au contrôle de qualité Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes)Ce module tend à introduire les notions de statistique et de probabilité à travers les statistiques descriptives et les variables aléatoires.Connaissances préalables recommandées :Des notions élémentaires de statistique et de mathématique sont un pré-requis indispensable ;Contenu de la matière IntroductionChapitre 1 : Statistique(s) et Probabilité(s)Chapitre 2 : Rappels mathématiquesChapitre 3 : Éléments de calcul des ProbabilitésChapitre 4 : Probabilité Conditionnelle ; Indépendance et Théorème de BayesChapitre 6 : Variables aléatoiresChapitre 7 : Exemples de distributionsChapitre 8 : Statistiques descriptivesChapitre 9 : Fluctuations de la moyenne observée : la variable aléatoire moyenne arithmétiqueChapitre 10 : Estimation - Intervalle de confianceChapitre 11 : Les tests d’hypothèses. PrincipesChapitre 12 : Quelques tests usuels

Chapitre 13 : Tests concernant des variables qualitativesChapitre 14 : Liaison entre deux variables continues : notion de corrélationChapitre 15 : A propos des tests d’hypothèsesChapitre 16 : Analyse des durées de survie ou Analyse des délais de survenue d’un événementAnnexe A : Tables statistiquesA.1 TABLE DE LA VARIABLE NORMALE REDUITE ZA.2 TABLE DU TEST DE WILCOXONA.3 TABLE DU TEST DE MANN-WHITNEY-WILCOXONA.4 TABLE DE Χ2A.5 TABLE DU COEFFICIENT DE CORRELATIONA.6 TABLE DU T DE STUDENTMode d’évaluation :Examen (60%) +TD (40%)

Références2. Carmér, H., 1946. Mathematical Methods of Statistics. Princeton Univ. Press, Princeton, .J.,575p.3. Clark, M.W. et Hosking, P.L., 1986. Statistical Methods for Geographers. John Wiley & Sons, Inc.,New York, 518 p.4. Cressie, N.A.C., 1993. Statistics for Spatial Data. John Wiley & Sons, Inc., New York, 900 p.5. Davis, J.C., 2002. Statistics and Data Analysis in Geology. Third Edition, John Wiley & Sons,638 p.6. ESRI, 1992. Surface Modeling with TIN. 2nd ed. Environmental Systems Research Institute, Inc.,Redlands, CA, 258 p.7. Griffith, D.A., et Amrheim, C.G., 1991. Statistical Analysis for Geographers. Prentice Hall, Inc.,Englewood Cliffs, N.J., 478 p.8. Griffith, D.A., et Amrheim, C.G., 1997. Multivariate Statistical Analysis for Geographers. PrenticeHall, Inc., Upper Saddle River, N.J., 345 p.9

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE méthodologiqueIntitulé de la matière : Recherche bibliographique Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes)

Faire une recherche bibliographique sur un sujet scientifique de pointe et se préparer à laréalisation de mémoire de fin de cycle.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Contenu de la matière : 

Mode d’évaluation :  Présentation d'exposés sur des thèmes choisis.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc.)

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 3Intitulé de l’UE : UE Découverte, Intitulé de la matière : immuno-hématoCrédits : 05Coefficients : 3

Connaissances préalables recommandées Biologie générale, Biologie animale, HistologieContenu de la matière : 

- Dysfonctionnement du système immunitaire

- Physiologie et pathologie des cellules sanguines et médullaires

- L’hémostase et sa pathologie

- Groupes sanguins et applications

- Cytologie Sanguine et médullaire normale et pathologique

- Exploration de l’hémostase

- Instrumentation et automates

- Application des techniques immunologiques à la parasitologie

Autres : exposés semi mensuels individuels (modèles expérimentaux) à discuter pendant la 3ème semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : ANALYSES BIOCHIMIQUESSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE TransversaleIntitulé de la matière : EntreprenariatCrédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Au terme de sa formation l’apprenant peut être amené à entreprendre un projet

d’investissement, à lancer une start-up ou encore à diriger et gérer entreprise. Il à besoin,

dans sa formation, de quelques notions de gestion. L’objet de cet enseignement est

d’initier l’étudiant aux outils de la gestion.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes)

Contenu de la matière : 

PREMIERE PARTIE : ENTREPRENARIATCHAPITRE I : DÉFINITION D‘UN PROJET D’INVESTISSEMENT

CHAPITRE II : LE CYCLE DU PROJET

II.1 – Identification

II.2 – Préparation

II.3 – Evaluation ex ante

II.4 – Mise en œuvre

II.5 – Evaluation ex post

CHAPITRE III : EVALUATION ÉCONOMIQUE ET FINANCIÈRE D’UN PROJET

III.1 – Les étapes de l’étude de facteurs économiques

III.2 – Analyse des dépenses et des recettes d’un projet (flux prévisionnel)

III.3 – Critères de rentabilité

III.3.1 – Valeur actuelle nette (V.A..N.)

III.3.2 – Délai de récupération d’un investissement

III.3.3 – Taux de rendement interne d’un projet (I.E..R.)

CHAPITRE IV : RENTABILITÉ ÉCONOMIQUE ET FINANCIÈRE

IV.1 – Rentabilité économique d’un projet

IV.2 – Rentabilité financière d’un projet

CHAPITRE V : LES EFFETS ATTENDUS D’UN PROJET

V.1 – Effets attendus au niveau de l’emploi

V.2 – Effets attendus sur la balance des paiements

V.3 – Effets attendus sur la croissance

V.4 – Effets attendus sur l’environnement

DEUXIEME PARTIE : GESTION DES ENTREPRISESINTRODUCTION

- Définition de l’entreprise et économie de marché

- L’entreprise et son environnement

CHAPITRE I : L’OBSERVATION DANS L’ENTREPRISE

I.1 – Notions de comptabilité générale et analytique

I.2 – Données techniques

Terre - travail - capital

CHAPITRE II : ANALYSE DE L’ENTREPRISE

II.1 – Analyse comparative

II.2 – Analyse des marges

II.3 – Analyse des prix de revient

II.4 – Analyse isolée des facteurs

CHAPITRE III : LA DÉCISION DANS L’ENTREPRISE

III.1 – Programmation linéaire

III.2 – Notions de choix des investissements

Mode d’évaluation : Examen + Contrôle Continu.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1 - Carlton D. et Perloff J. (1998), « Economie industrielle », Edition De Boecke, Bruxelles. 2 - Combe E. (2002), « La politique de la concurrence », Edition Repères, La Découverte,

Paris. 3 - Combe E. (2004), « Cartels et ententes », Collection Que sais-je ?, Edition PUF, Paris. 4 - Gabszewicz J. J. (2003),« La concurrence imparfaite », Collection Repères, La

Découverte, Paris, 2èmeédition. 5 - Gabszewicz J. J. (2007), « La différenciation des produits », Collection Repères, La

Découverte, Paris. 6 - Varian H. R. (2005), « Introduction à la Microéconomie », Edition De Boeck,

6èmeédition, Bruxelles. 7 - Tirole J. (1995), « Théorie de l’organisation industrielle », Edition Economica, Tomes I

et II, Paris.

Domaine : SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE

Filière : BIOLOGIE

Spécialité : MICROBIOLOGIE de L’ENVIRONNEMENT

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

1- Semestre 1 :Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation

15 sem C TD TP Autres Continu ExamenUE fondamentales 9 18UEF1 Microorganismes et Fonctionnement des Ecosystèmes (MFE) 90h00 3h00 - 3h00 110h00 4 8 40% 60%

UEF2 Virologie Fondamentale (VF) 112h30 3h00 1h30 3h00 137h30 5 10 40% 60%UE méthodologie 5 9UEM1 Analyse des Données Expérimentales en Biologie (ADEB) 105h00 3h00 1h00 3h00 120h00 5 9 40% 60%UE découverte 1 1UED1 Anglais Scientifique (AS1) 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 40% 60%UE transversale 2 2UET1 Communication (C) 45h00 1h.30 1h.30 - 5h00 2 2 40% 60%Total Semestre 1 375 12 4.30 9 375 17 30 - -

2- Semestre 2 

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18UEF3 Interactions Microbiennes (IM) 90h00 3h00 - 3h00 110h00 4 8 40% 60%UEF4  Microorganismes et Santé des Plantes (MSP) 112h30 3h00 1h30 3h00 137h30 5 10 40% 60%UE méthodologies 5 9

UEM2 Hygiène et Sécurité dans les Laboratoires (HSL) 45h00 3h00 - - 55h00 2 4 40% 60%Bioinformatique (BINF) 60h00 1h30 1h30 1h00 65h00 3 5 40% 60%

UE découverte 1 1UED2 Anglais Scientifique (AS2) 22h30 1h30 - - 2.30 1 1 40% 60%UE transversale 2 2UET 2 Législation et Microbiologie de l’Environnement (LME) 45 3 - - 5 2 2 40% 60%Total Semestre 2 375 15 3 7 375 17 30 - -

3- Semestre 3 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18UEF5 Activité des Substances Naturelles: principes et applications (ASN) 112.30 3 1.30 3 137.30 5 10 40% 60%UEF6 Microbiologie Moléculaire (MM) 90 3 - 3 110 4 8 40% 60%UE méthodologie 5 9UEM3 Recherche Bibliographique (RB) 105 3 1 3 120 5 9 40% 60%UE découverte 1 1UED3 Anglais Scientifique (AS3) 22.30 1.30 - - 2.30 1 1 40% 60%UE transversale 2 2UET3 Entreprenariat (EP) 45 3 - - 5 2 2 40% 60%Total Semestre 3 375 13.30 2.30 9 375 17 30 - -

4- Semestre 4 :

Domaine : SNVFilière: BiologieSpécialité : Microbiologie de l’environnement

Stage sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coeff CréditsPrés. Pers.Travail Personnel* 202.30 247.30 9 18Stage en entreprise** 105 120 5 9Séminaires*** 67.30 7.30 3 3Autre (préciser) - - - -Total Semestre 4 375 375 17 30* Travail Personnel (mémoire de fin d'étude) considéré comme unité d’enseignement fondamentale ** Stage en entreprise considéré comme unité d’enseignement méthodologique. *** Séminaires considéré comme unité d’enseignement découverte

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 472.5 262.5 135 112.5 982.5TD 67.5 52.5 - 22.5 142.5TP 270 105 - - 375Travail personnel 990 480 15 15 1500Autre (préciser) - - - - -Total 1800 900 150 150 3000Crédits 72 36 6 6 120% en crédits pour chaque UE 60 30 5 5 100

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : UEF1, Intitulé de la matière : Microorganismes et Fonctionnement des Ecosystèmes (MFE)Crédits : 08Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement

Connaître les différents aspects de l’impact des éléments complexes de l’environnement sur les

fonctions microbiennes.

Connaissances préalables recommandées

Microbiologie générale, Ecologie générale, Biochimie générale.

Contenu de la matière : 1- Cycles biogéochimiques

Cycles biogéochimiques du carbone et de l’azote. Mécanismes biochimiques des transformations.Régulation des transformations microbiennes en environnement complexe

2- Groupes fonctionnelsNotion de groupe fonctionnel. Relations entre diversité microbienne, groupes fonctionnels et fonctions microbiennes de transformation.

3- Impact des perturbations sur les fonctions microbiennes.Liens entre perturbations et stress. Impact des perturbations naturelles (feu, crues, etc.) et anthropiques (pollution, déforestation, pratiques agricoles, etc.) sur la diversité et les fonctions microbiennes.

Autres : exposés semi mensuels individuels à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : UEF2, Intitulé de la matière : Virologie Fondamentale (VF)Crédits : 10Coefficients : 5

Connaissances préalables recommandées

Microbiologie générale et Biochimie générale.

Contenu de la matière : 1. Structure des virus et expression des génomes viraux.2. Génomes et cycles viraux (structures, densité et flux d’information, exception moléculaires et

opportunismes).3. Virus/hôte ; fractionner : virus assistant(s, vecteurs désarmés, cellules complémentaires.4. Stratégies de survie des virus et défenses de l’hôte.5. Pathogenèse et thérapies antivirales.

6. Vecteurs viraux. Vaccinologie7. Techniques récentes en virologie.8. Epidémiologie et virus émergents.

Autres : exposés semi mensuels individuels à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : UEM1, Intitulé de la matière : Analyse des Données Expérimentales en Biologie (ADEB)Crédits : 09Coefficients : 5

Connaissances préalables recommandées

Notions élémentaires en statistiques

Contenu de la matière : 

1. Statistique descriptive : Paramètres de position (variance, écart-type, coefficient de variance…) calculés à partir d’un échantillon. Représentations graphiques.

2. Statistiques inférentielles2.1. Estimation ponctuelle de paramètres d’une population

Notion d’estimateur, de distribution d’échantillonnage d’un estimateur.2.2. Précision d’une estimation

Exemple de l’erreur standard et de l’intervalle de confiance d’une moyenne, détermination de la taille minimale d’un échantillon. Application biologique.

2.3. Tests d’hypothèses : ThéorieLes différentes étapes d’un test d’hypothèse : hypothèse nulle versus hypothèse alternative, conditions d’application, choix du risque maximum de première espèce, statistique utilisée, distribution d’échantillonnage de la statistique, risque d’erreur pris à l’issue du test (risque exact de première espèce = probabilité critique = <p value> des anglo-saxons, risque de seconde espèce). Notion de robustesse d’un test. Notions de puissance d’un test (taille minimale des échantillons). Préjudices associés à l’acceptation ou au rejet d’une hypothèse (compromis entre risques).

2.4. Exemple de tests d’hypothèses appliquées à la biologie.Comparaison de deux moyennes, comparaison de deux pourcentages, analyse de variance à un facteur, test de Khi deux associé à une table de contingence, régression linéaire.

3. Nomenclature statistique utilisée dans un article scientifique.4. La statistique, une aide à la réalisation des protocoles expérimentaux.5. Apport de l’informatique dans l’analyse des données biologiques.

Autres : exposés semi mensuels individuels (modèle expérimental) à discuter pendant la 3 ième

semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : UED1, Intitulé de la matière : Anglais Scientifique (AS1)Crédits : 01Coefficients : 1

Connaissances préalables recommandées

Anglais de base

Contenu de la matière : 

- Comment rédiger un texte scientifique en anglais ;- Comment traduire un texte scientifique en anglais ;- Comment préparer une communication et ou une publication.

Autres : exposés semi mensuels individuels (expliquer un article scientifique : discuter les protocoles) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : UET1, Intitulé de la matière : Techniques de Communication (TC)Crédits : 02Coefficients : 2

Connaissances préalables recommandées Français de base, notions sur la communicationContenu de la matière : 

Chapitre 1 : Le formateur et la communication1.1. La communication1.2. Créer le cadre d’une séquence de formation : le « SIOM »Chapitre 2 : La communication dans l’entreprise2.1. La communication dans l’entreprise2.2. Formes de la communication, réseaux et outils de la communication

Chapitre 3 : Supports pédagogiques et communication3.1. Quelques points de repères généraux3.2. Préparer et utiliser un diaporama3.3. Utiliser le tableau à feuilles3.4. Utiliser des flip charts3.5. La technique du métaplan3.6. Intégrer l’audiovisuel dans la formation3.7. Les notes écritesAnnexe : Création d’un diaporamaChapitre 4 : Techniques d’animation de groupes4.1. Les trois fonctions de l’animation de groupes4.2. Méthode magistrale : le choix d’une technique de formation4.3. Méthode démonstrative : la technique de l’exercice pratique (les A.P.)4.4. Méthode de la découverte : choix d’une technique d’animation4.5. L’importance des consignes dans les méthodes démonstratives et de la découverteChapitre 5 : Les différents types et la conduite de réunions5.1. La conduite de réunions5.2. Les différents types de réunionsChapitre 6 : Communication et relation de coaching6.1. Le coaching : quelques points de repère6.2. Les entretiens de coaching6.3. Quelques techniques de coachingChapitre 7 : Les ressources documentaires : où trouver l’information ?7.1. Gestion de l’information7.2. Les grands services d’Internet7.3. Organiser sa recherche documentaire en ligne

Autres : exposés semi mensuels individuels (diaporamas et discussion des exposés des autres matières) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). MUCCHIELLI, R. (2000). La conduite des réunions, Les fondamentaux du travail en groupe (Collection Formation Permanente – Séminaires Mucchielli), ESF éditeur, 2000.WALLEN, D. National Training Laboratories.WATZLAWICK, P. (1979). Une logique de la communication, Paris, Éd. du Seuil, 1979.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UEF3, Intitulé de la matière : Interactions Microbiennes (IM) Crédits : 08Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement L’objectifs de ce cours est de présenter des notions de base sur :

- Les interactions entre microorganismes et milieu physique.- Les interactions entre microorganismes.- Les interactions avec les organismes supérieurs.

Connaissances préalables recommandéesMicrobiologie générale, Biochimie générale, métabolites secondaires.Contenu de la matière : 

1. Interactions entre microorganismes et milieu physique. Ecologie des microorganismes dans les écosystèmes simples ou complexes. Exemple du sol, un milieu complexe et un bio réacteur microbien. Organisation spatiale de la communauté microbienne et biofilms.

2. Interactions entre microorganismes. Signaux et communication. Quorum sensing. Interaction et dynamique des populations microbiennes. Successions microbiennes : conséquences. biodégradation de composés organiques et en agronomie.

3. Les interactions avec les organismes supérieurs. Les différents types d’interactions. Symbiose et parasitisme. Interactions micro-organismes/ végétaux, processus de colonisation, impact écologique des OGM.Interactions micro-organismes/ animal et homme : flores digestives, bases du pathogène et notion de réservoirs naturels (eau, sol, plantes).

Autres : exposés semi mensuels individuels à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen.

Références : Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle des périodiques, salle d’Internet, etc… Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UEF4, Intitulé de la matière : Microorganismes et Santé des Plantes (MSP) Crédits : 10Coefficients : 5

Connaissances préalables recommandées

Microbiologie générale, Botanique et physiologie végétale Biochimie générale.

Contenu de la matière : 

1- Les populations microbiennes associées à la plante (phytosphère) : localisation, diversité, activité.

2- Pathogènes et parasites, Phytopathologie (virulence, épidémiologie, etc.). Mécanismes de résistance de la plante aux pathogènes. La bactérie pathogène Agrobacterium et le transfert de gènes aux plantes supérieures.

3- Microorganismes bénéfiques. Symbioses : Fixation symbiotique de l’azote, mycorhizes. Symbioses associatives : PGPR, antagonistes, inducteurs de résistance, etc. Sols résistants aux maladies. Lutte biologique, biofertilisation, phytostimulation, revégétalisation des sites dégradés. Inoculums microbiens utilisés en agriculture.

Autres : exposés semi mensuels individuels à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UEM2, Intitulé de la matière : Hygiène et Sécurité dans les Laboratoires (HSL) Crédits : 04Coefficients : 2

Connaissances préalables recommandées

Connaissances de bases d’Hygiène.

Contenu de la matière : 

- Les moyens de l'hygiène et la recherche de la qualité.

- Normes et certification ISO 9000, ISO 9002

- Procédure HACCP: maîtrise des points critiques

- La lecture de la législation nationale et internationale, l’intégration des notions d’hygiène et

sécurité alimentaire dans les procédures de production et les normes appliquées pour chaque

denrée alimentaire.

Autres : exposés semi mensuels individuels (explication des textes législatifs ; exemples de situations reliées à l’hygiène…) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Epreuve écrite + exposésEtablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 34

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UEM2, Intitulé de la matière : Bioinformatique (BINF)Crédits : 05Coefficients : 3

Connaissances préalables recommandées

Connaissances de bases de l’informatique.

Contenu de la matière : 

1- Introduction à la bioinformatique2- Banque des données biologiques3- Techniques de l’application de l’informatique à la biologie (Computational Biology)4- Application sous forme d’accès aux banques de données5- Application à l’analyse et au traitement des données biologiques

Autres : exposés semi mensuels individuels (modèles expérimentaux) à discuter pendant la 3 ième

semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UED2, Intitulé de la matière : Anglais Scientifique (AS2)Crédits : 01Coefficients : 1

Connaissances préalables recommandées

Anglais de base

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 35

- Comment rédiger un texte scientifique en anglais ;- Comment traduire un texte scientifique en anglais ;- Comment préparer une communication et ou une publication.

Autres : exposés semi mensuels individuels (expliquer un article scientifique : discuter les protocoles) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 2Intitulé de l’UE : UET2, Intitulé de la matière : Législation et Microbiologie de l’Environnement (LME)Crédits : 02Coefficients : 2

Connaissances préalables recommandées

Contenu de la matière : Législation :- Organisation des sociétés industrielles et commerciales - Droit du travail - Respect des normes et répression des fraudes- Critères microbiologiques et normes de la qualité des aliments.- Epidémiologie des toxi-infections et les outils d’expertise. - Ecosystèmes microbiens dans les flores intestinales et les germes probiotiques. - Biofilms. - Mesures préventives et les procédés de désinfection et destruction. - Désinfectants et stratégies d’utilisation.- Systèmes CIP ou NEP Nettoyage sur place (Cleaning in Place).

Autres : exposés semi mensuels individuels (explication des textes règlementaires) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Recueil de Textes sur la Prévention Recueil des références des textes règlementaires liés à l’activité du contrôle

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 36

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 3Intitulé de l’UE : UEF5, Intitulé de la matière : Activité des Substances Naturelles : principes et applications (ASN) Crédits : 10Coefficients : 5

Connaissances préalables recommandées

Techniques d’indentification et de quantification, biologie végétale, botanique.

Contenu de la matière : 

1. Les produits naturels d’origine végétale. Comment sont-ils élaborés ?- composés terpéniques- composés poly phénoliques- composés alcaloïdiques

2. Intérêt physiologique des molécules dans la vie de la plante3. Moyens de défense vis-à-vis des agressions4. Systèmes de protection par rapport aux stress extérieurs5. Systèmes de communication avec l’environnement de l’organisme6. Valorisation et application des produits naturels dans l’industrie7. Les principaux composés issus du métabolisme secondaire et leurs dérivés faisant l’objet

d’applications industrielles (agroalimentaire, cosmétique, pharmaceutique).- Activité enzymatique, antioxydante, anti-inflammatoire- Activité antibactérienne, antivirale- Activité anti-coagulantes et anti-agrégante- Activité des hormones- Activité anti-glycémiante- Activité biologiques des anticorps et complément

Autres : exposés semi mensuels individuels (sur des substances naturelles données) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Epreuve écrite, présentation d’exposés sur les thèmes choisis

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 3Intitulé de l’UE : UEF6, Intitulé de la matière : Microbiologie Moléculaire (MM) Crédits : 08

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 37

Coefficients : 4

Connaissances préalables recommandées

Techniques d’indentification et de quantification, biologie végétale, botanique.

Contenu de la matière : 

- Principes de base en génie génétique- le matériel biologique et la purification d'acides nucléiques et de protéines.- Electrophorèse en gel de polyacrylamide et en gel d'agarose.- Les outils enzymatiques du génie génétique (endonucléases de restriction, polymérases et

nucléases).- Vecteurs de clonage (plasmides, bactériophages, virus et chromosomes artificiels).- Génétique microbienne et utilité dans le clonage de gènes :- Clonage génique chez les procaryotes et les eucaryotes;- Ligations de molécules et transformation bactérienne.- Hybridation d'acides nucléiques et techniques de marquage de sondes moléculaires :

Southern-blot et Northern-blot.- Synthèse d'oligonucléotides et utilisations potentielles.- Séquençage d'ADN (conventionnel et automatisé) et analyses informatiques de séquences à

l'aide des banques de données (bioinformatique).- Principes et utilité de la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) pour le clonage et le

diagnostic.

Autres : exposés semi mensuels individuels (explication des techniques expérimentales de Microbiologie Moléculaire) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 3Intitulé de l’UE : UEM3, Intitulé de la matière : Recherche Bibliographique (RB)Crédits : 09Coefficients : 5

Connaissances préalables recommandées -l’outil informatique (l’internet)

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 38

1. Procédures de recherche des articles et des ouvrages dans la bibliothèque et sur Internet (montrer les différents sites scientifiques pour l’étudiant,..)

2. Les outils de recherche documentaireLes cataloguesLes bases de données bibliographiques

3. Critique et synthèse des articles scientifiques (Bibliographie) 4. Méthodologie de rédaction du mémoire de fin d’études (fond et forme) -Cibler les objectifs,

- Matériels utilisés et Méthodologie appliquée - Importance d’un résultat positif et négatif… - Confrontation des résultats à la lumière de la base de données bibliographique - Plan du mémoire, résumé, conclusion et références bibliographiques…

Autres : exposés semi mensuels individuels (recueil organisé d’une recherche sur un mot clé donné) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 3Intitulé de l’UE : UED3, Intitulé de la matière : Anglais Scientifique (AS3) Crédits : 01Coefficients : 1

Connaissances préalables recommandées

Anglais de base

Contenu de la matière : 

- Comment rédiger un texte scientifique en anglais ;

- Comment traduire un texte scientifique en anglais ;

- Comment préparer une communication et ou une publication.

Autres : exposés semi mensuels individuels (expliquer un article scientifique : discuter les protocoles) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et Examen

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Documentation disponible au niveau de la bibliothèque centrale, bibliothèque de la faculté, salle d’archives, salle d’Internet, etc.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 39

Intitulé du Master : Microbiologie de l’EnvironnementSemestre : 3Intitulé de l’UE : UET3, Intitulé de la matière : Entreprenariat (EP)Crédits : 02Coefficients : 2

Objectif pédagogique du cours 1. Appréhender les principes de base du processus de création d’entreprise Appréhender les

principes de base du processus de création d’entreprise2. Donner les éléments fondamentaux du conseil dans les différentes phases de création

d’entreprise.3. Les différents types de financement pour une micro entreprise dans le contexte algérien.4. Réalisation concrète d’un plan d’affaires et du dossier de financement

Contenu de la matière : 

Chapitre 1: Le lancement du Processus de la création1. Pourquoi créer une entreprise?2. Evaluation des compétences entrepreneuriales ; version 2014-2015 3. Idée d'entreprise ;4. Eléments de base pour le lancement du processus de création d’entreprise(o4 éléments)

Chapitre 2: La planification stratégique1. Importance de la planification2. Enoncé de la mission et de la vision3. Définition des objectifs SMART4. SWOT comme une technique de planification stratégique5. Réalisation d'études de marché

Chapitre 3: Le Plan Business1. Qu'est-ce qu'un business plan?2. Pourquoi avons-nous besoin d’élaborer un Business Plan?3. Quels sont les éléments d'un bon Business Plan?

Chapitre 4: Les opérations Commerciales1. Quel est le budget de fonctionnement?2. Comment gérer les coûts des produits et les coûts de fonctionnement?3. Quels sont les coûts de production et comment les gérer?

Chapitre 5: La Stratégie de Marketing de l’Entreprise1. Les bases de la commercialisation d'un produit ou d'un service;2. Exploration de la concurrence et la création d'activités de marketing en conséquence;3. La stratégie de tarification4. Les prévisions de vente

Chapitre 6: La stratégie de communication de l’Entreprise1. Le Plan de communication2. L’Action de communication

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 40

Chapitre 7: Sources et types de financement pour la création d’entreprise1. Avez-vous besoin d'un financement extérieur?2. Quels sont les types de financement?3. Quelles sont les sources de financement dans votre région?4. Structure de soutien en Algérie

Autres : exposés semi mensuels individuels (exposer un plan d’action pour la création d’une entreprise: domaine d'application de l'entreprise) à discuter pendant la 3ième semaine.

Mode d’évaluation : Continu et ExamenRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1. Xavier Lecocq, Benoît Demil, Vanessa Warnier (2006), « Le Business Model, un modèle

d’analyse stratégique », L’Expansion Management Review, no 123, hiver.2. Denis Dauchy, 7 étapes pour un Business Model solide, Dunod 2010.3. Thierry Verstraete, Estèle Jouison-Laffitte, Business Model pour entreprendre, De Boeck

Université, 20094. Thierry Verstraete, Estèle Jouison-Laffitte, « Une théorie conventionnaliste du Business Model

en contexte de création d’entreprise pour comprendre l’impulsion organisationnelle », XenCIFEPME, (Congrès international francophone sur l'entrepreneuriat et la PME), Bordeaux, octobre, 2010

5. Vanessa Warnier, Xavier Lecocq, Benoît Demil (2004), « Le Business Model, l'oublié de la stratégie », Conférence AIMS 2004

6. Bernard Maître, Grégoire Aladjidi, Les Business Models de la nouvelle économie, Dunod 19997. Laurence Lehmann-Ortega, Jean Marc Schoettl, Rupture et perturbation : les deux formes de

l'innovation stratégique AIMS 20058. Estèle Jouison, Délimitation théorique du Business Model AIMS 2005 .9. Henry Chesbrough and Richard S. Rosenbloom: The Role of the Business Model in Capturing

Value from Innovation : Evidence from Xerox Corporation’s Technology Spinoff Companies, Industrial and Corporate Change 2002, vol 11, nb 3, p. 529-555

10. Numéro spécial de la Revue française de gestion sur le modèle économique (Volume 35 numéro 181 de 2008)

11. Bertrand Moingeon et Laurence Lehmann-Ortega (2010), « Genèse et déploiement d’un nouveau business model : l’étude d’un cas désarmant », M@n@gement, 13 : 4, 266-297.

12. http://www.improve-institute.com/ decouverte umlrup processus unifie extrême program ming gestion de projet nouv elles_technologies.html n langage très « techno » pour ce site consacré aux méthodologies de projet en informatique et TIC. Pour les inconditionnels des méthodes « from Silicon Valley »

13. http://www.ffpe-toulouse.org/youthstart /surco/surco-methodologie.htm#mainstreaming Etude menée dans le cadre d'un projet financé par le programme européen faisant apparaître des niches d'activités en milieu rural autour des entreprises susceptibles de générer services et emplois de proximité.

14. http://www.ac-creteil.fr/grisms/ exerciseur/communication/ Site pédagogique de l’académie de Créteil proposant des exercices en méthodologie de projet au niveau Première et Terminale SMS.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 41

15. http://www.educagri.fr/memento/section3/ enseigner/s3618f1som.htm Méthodologie de projet version « éducation socioculturelle dans l’enseignement agricole ». Incontournable pour les projets de développement rural.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 42

Domaine  : Sciences de la Nature et de la Vie (SNV)Filière : Sciences Biologiques

Spécialité : Biodiversité et physiologie végétale

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 43

1- Semestre 1 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu ExamenUE fondamentales 9 18

Biodiversité et écophysiologie végétale 67h30 3 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Taxonomie de plantes supérieures 90 3 3 110 4 8 40% 60%

Pathologie et protection des plantes 45 1h30 1h30 55 2 4 40% 60%

UE méthodologie 5 9Bio-informatique 60 1h30 1 1h30 65 3 5 40% 60%Modélisation appliquée à la biologie végétale 45 1h30 1h30 55 2 4 40% 60%

UE découverte 1 2Changement climatique et biodiversité 45 1h30 1h30 5 2 2 40% 60%

UE transversale 1 1Communication 22h30 1h30 2h30 1 1 - 100%

Total Semestre 1 375 375 16 30

2- Semestre 2 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18Morphogenèse et physiologie de développement 90 3 3 110 4 8 40% 60%

Métabolisme secondaire des plantes 67h30 3 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Conservation des ressources végétales 45 1h30 1h30 55 2 4 40% 60%

UE méthodologie 5 9Biostatistique 67h30 3 1h30 82h30 3 6 40% 60%Méthodes d’échantillonnage 37h30 1h30 1 37 2 3 40% 60%

UE Découverte 1 2Ecosystème steppique 45 1h30 1h30 5 2 2 40% 60%

UE transversales 1 1Législation 22h30 1h30 2h30 1 1 - 100%

Total Semestre 2 375 375 16 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 45

3- Semestre 3 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 10 18Génétique moléculaire des plantes 82h5 3 1 1h30 117h30 4 8 40% 60%

Transgénèse végétale 67h30 3 1h30 82h30 4 6 40% 60%Production végétale et valorisation des plantes 45 1h30 1h30 55 2 4 40% 60%

UE méthodologie 4 9Organisation et valorisation de

la recherche scientifique 67h30 3 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Techniques de production et culture biologique 45 1h30 1h30 30 2 3 40% 60%

UE découverte 1 2Biogéographie 45 1h30 1h30 5 2 2 40% 60%

UE transversales 1 1Entreprenariat 22h30 1h30 2h30 1 1 100 %

Total Semestre 3 375 375 16 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 46

4- Semestre 4 :

Domaine  : Sciences de la Nature et de la Vie (SNV)Filière : Sciences BiologiquesSpécialité : Biodiversité et physiologie végétale

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coeff CréditsMémoire* 375 30Stage en entreprise**Séminaires***Total Semestre 4 375 30* Travail Personnel considéré comme unité d’enseignement fondamentale**Stage en entreprise** considéré comme unité d’enseignement méthodologie.***Séminaires considéré comme unité d’enseignement découverte.

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 337h30 180 67h30 67h30 652h30TD 105 37h30 67h30 - 210TP 157h30 105 - - 262h30Travail personnel 750 352h30 15 7h30 1125Mémoire 375 - - - 375Total 1750 675 150 75 2250+375(mémoire)Crédits 83 28 6 3 120% en crédits pour chaque UE 70% 22.5% 5% 2,5% 100%

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 1Unité d’Enseignement Fondamentale 1Matière 1: Biodiversité et écophysiologie végétaleCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement Cet enseignement permet aux étudiants de :- D’approfondir leurs connaissances sur la diversité des végétaux, et apprendre les méthodes

d’évaluation de la diversité génétique.

- Mesure et appréciation des effets des facteurs de milieu sur le fonctionnement de la plante.Connaissances préalables recommandées : physiologie végétale, Valorisation des plante a intérêt économique).

Contenu de la matière

I. Biodiversité1. Concept, définitions et expression de la diversité génétique : - taxon, espèce, population et pools génétiques - sélection naturelle et domestication des plantes - centres d'origine et de diversification2. Contrôle du flux de gènes et ressources génétiques : - érosion génétique - impacts des activités humaines sur les pools de gènes - les sources de variabilité et son utilisation en amélioration3. Approche synthétique de la biodiversité : la biosystématiqueII. Généralités :

1. Objets de l'écophysiologie2. Nomenclature et actions des facteurs écologiques - Aires de distribution et amplitudes écologiques - Stress, pression écologique et facteurs limitants

- Accommodations et Variations adaptativesIII. Méthodes d'évaluation et de mesure de la diversité génétique1. Prospection2. Les classifications supra et infraspécifiques3. Structure génétique et différenciation intra et interpopulation4. Flux de gènes et distribution écogéographique de la diversité5. Indices de similitudes, Identité et distances génétiques - marqueurs génétiques et identification variétale6. Génétique quantitative et populations expérimentale7. Cytogénétique IV. Ecophysiologie vegetale1. Effets et adaptation en deficit hydrique

1.1. Besoin en eau et réparation biogéographique 1.2. Cycle de l'eau et mécanismes affectant son métabolisme1.3. Effets du déficit hydrique au niveau cellulaire, sur organisme et sur le métabolisme

2. Effet de la salinite et l'adaptation au sel2.1. Caractéristiques des milieux salés 2.2. Actions du sel sur les végétaux2.3. Le sel et la répartition écogéographique2.4. Mécanismes de tolérance à la salinité et similitudes avec les effets du stress hydrique

3. Effet de la temperature et adaptation3.1. La température : limites vie et nomenclature3.2. Les basses températures et l'adaptation au gel3.3. Les hautes températures

4. Les effets physiologiques des pollutions

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 48

4.1. Pollution thermique, 4.2. Pollution hydrique.4.3. Pollution atmosphérique

Travaux pratiques : Caryotypes somatiques et méiotiques et génétique quantitative à traiter en T.D

Travail personnel : Exposé , sortie sur une station d’épuration …

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP

Références - Mazliak, P. 1974. Physiologie végétale : Nutrition et métabolisme - Hopking, W.G. 2003. physiologie végétale. De Boeck Supérieur, 532 pages.- René Heller, Robert Esnault, Claude Lance. 2004. Physiologie végétale : Nutrition.

Dunod, 323 pages.- René Heller. 1981. Physiologie végétale : Nutrition. Masson, 244 pages.Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 1Unité d’Enseignement Fondamentale 1Matière 2 : Taxonomie de plantes supérieures Crédits : 8Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement : - Savoir les grandes familles des angiospermes- Connaître les clés d’identification des plantes à fleures- Avoir une idée sur les nouvelles techniques moléculaires de classificationConnaissances préalables recommandées : botanique, génétique, génétique moléculaire (déjà requis en licence et master S1.

Contenu de la matière :

1. Historique des plantes à fleures2. La diversité du monde angiospermien3. Les caractéristiques des fleurs sont un critère essentiel de la classification des angiospermes.3.1 L’organisation des pieds florales4. La répartition du sexe chez les plantes à fleurs5. Les monocotylédones

5.1. Cycles de vie5.2. La graine5.3. le fruits5.4. Classification

6. les dicotylédones 6.1. Cycles de vie 6.2. La graine

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 49

6.3. Le fruits6.4. Classification- Les dicotylédones Apétales  - Les Dicotylédones Dialypétales - Les Dicotylédones Gamopétales 7. classification par les techniques moléculaires

- Groupe de phylogénie d'angiosperme ou APG :

Le système est basé sur deux gènes de chloroplastes et un codage de gène pour des ribosomes- 1. Eudicots et Eudicotyledons - 2. Monocotylédones ou monocotsLes TP : - Anatomie des fleures de quelques espèces de différentes famillesTravail personnel : Exposé , préparation d’herbier et atelier.

Mode d’évaluation : continus (TP, Travail pers.), Examen final

Références - Ozanda, P. 2004. Flore et végétation du sahara .  CNRS, Paris, 662 p.

- MAIRE R., 1952 - Flore de l'Afrique Du Nord - Volume 1. Paul le Chevalier, Paris, 371p.- QUEZEL, P. et S. Santa. 1962. NOUVELLE FLORE DE L'ALGÉRIE ET DES RÉGIONS

DÉSERTIQUES MÉRIDIONALES. Centre national de la Recherche scientifique, Paris. 1170p.- SPICHIGER. R-E. 2002. Botanique systématique des plantes à fleurs: une approche

phylogénétique nouvelle des Angiospermes des régions tempérées et tropicales. Presse technique et universitaires Romande, Paris. 404 p.

- Soltis, D. E. et alii. 2000. Angiosperm phylogeny inferred from 18S rDNA, rbcL, and atpB sequences.Bot. J. Linn. Soc. 133 : 381-461.

- Sporne, K. R. 1965. The Morphology of Gymnosperms. Hutchinson.- Takhtajan, A. 1997. Diversity and Classification of Flowering Plants. Columbia Univ. Press.- Cronquist, A. 1981. An Integrated System of Classification of Flowering Plants. Columbia Univ.

Press- Groupe de phylogénie d'angiosperme (2003). Une mise à jour de la classification de groupe de

phylogénie d'angiosperme pour les ordres et les familles des usines fleurissantes : APG II. Journal botanique de la société de Linnean 141: 399-436

- Le groupe de phylogénie d'angiosperme. (1998) Une classification ordinale pour les familles des usines fleurissantes. Annales du jardin botanique du Missouri.- Haston, E. ; Richardson, J. E. ; Stevens, P. F. ; Chasse, M. W. ; Harris, D. J. (2007). Un ordre

linéaire des familles du groupe II de phylogénie d'angiosperme. Taxon 56 (1) : 7-12.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 50

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétale

Semestre : 1Unité d’Enseignement Fondamentale 1Matière 3: Pathologies et protection des plantesCrédits : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement. Connaitre des maladies des plantes. Savoir les grands groupes d'agents responsables de maladies chez les végétaux, les mécanismes de résistance, l'épidémiologie et la problématique du diagnostic des maladies, Maîtrise des différentes stratégies de lutte, ainsi que leur évolution vers le concept de lutte intégrée. Les étudiants étudient les principaux paramètres à prendre en compte dans le processus de prise de décision.Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en écologie, Physiologie végétale, botanique et classification des champignons, microbiologie (déjà requis en Licence et en Master S1). Nombre d’heures d’enseignement :

Contenu de la matière :

I- maladies causees par les champignons. 1. Les maladies et accidents chez les plantes. - les objectifs de la pathologie végétale. - signification et classification d’une maladie et des accidents chez une plante. - les conséquences des maladies sur les cultures. - maladies des plantes et accroissement de production agricole. 2. Les principes de phytopathologie. - principes propres a une maladie. - cycle biologique d'un pathogène. - cycle d’une maladie. - principes d'épidémiologie. - principes de lutte contre les maladies. 3 . Les aspects morphologiques symptômes des maladies 4. Les maladies des plantes causées par les champignons. - caractères généraux des champignons - les principaux groupes de champignons phytopathogènes. 5. Etude des maladies spécifiques causées par les champignons. - les pourritures des fruits et légumes, les fontes des semis, - les pourritures racinaires des plantes en plein champ, les galles fongiques, les caries et les charbons et les flétrissements vasculaires. - les maladies foliaires, - les mildious, les oïdiums. , les rouilles. 6- La lutte contre les champignons phytopathogenesII-les maladies virale des vegetaux. 1 introduction

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 51

II Les caractéristiques des virus des végétaux. III. Les symptômes engendrés par les virus chez les végétaux. IV. Les méthodes de diagnostic des maladies virales. - diagnostic biologique, diagnostic sérologique, diagnostic moléculaire et diagnostic par microscopie électronique. V. La lutte contre les virus phytopathogènes : la lutte préventive et la lutte curative- les contrôles phytosanitaires. - la sélection sanitaire des plants et des semences.III-maladies causées par les bactéries1 Introduction 2. Les caractéristiques des bactéries parasites des plantes. 3. Symptomatologie des affections bactériennes. 4. Diagnostic des maladies bactériennes : méthodes classiques et méthodes moléculaires. 5. Conservation et méthodes des bactéries phytopathogènes. 6. La lutte contre les bactérioses. 7. Les angiospermes phytopathogènes7.1. Cycles biologiques de quelques Angiospermes parasites des plantes cultivées7.2. Etablissement de la relation trophique entre les Angiospermes parasites et la plante-hôte7.3. Conséquences du parasitisme

 Mode d’évaluation : continu (TP et travail personnel), examen final : Travaux pratiques :- Isolement de champignons filamenteux à partir de matériel végétal infecté- TP sur les maladies bactériennes- TP sur les angiospermes phytopathogènes (ex : Orobanche, Cuscute)

Travail personnel : Exposé , sortie pour l’INPV de BiskraRéférence :- Jean Seamal, 1989. Traité de pathologie végétale. Presses Agronomiques de Gembloux. 621

pages- Frantz Rapilly, 1991. L'épidémiologie en pathologie végétale : mycoses aériennes. INRA. France.

317 pages- Roger Corbaz. Principes de phytopathologie et de lutte contre les maladies des plantes.

Presses polytechniques et universitaires Romandes. 1990. 286 p.- Ciba-Geigy (Basel). 1979. protection des plantes. 64 pages- Philippe Lepoivre. 2003. Phytopathologie : Bases moléculaires et biologiques des

pathosystèmes et fondements des stratégies de lutte. De Boeck Supérieur. 432 pagesIntitulé : Biodiversité et physiologie végétale Semestre : 1Unité d’Enseignement Méthodologique 1Matière 1 : Bioinformatique Crédits : 5Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement. Apprendre à maîtriser (ou développer) des outils bioinformatiques et biostatistiques permettant d’analyser des données dans divers domaines de la biologie (génétique des populations,

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 52

génomique, protéomique, évolution, etc.), et appliquer ces outils à un thème de recherche spécifique dans l’un de ces domaines.Connaissances préalables recommandées : maîtrise de base de l’outil informatique, biostatistique, biologie cellulaire (noyau et acides nucléique). Génétique (déjà requis en Licence et en master S1)

Contenu de la matière : Les études seront organiser sous forme de travaux pratique :Recherche et similitudes entre séquences (système de scores) les algorithmes et les programmes de comparaison de séquences, comparaison avec les banques. 1. La bioinformatique : définition, description, démarche et principales étapes2. Deux types de molécules support de la bioinformation : les acides nucléiques et les protéines3. Deux types de bioinformation : la séquence des nucléotides et la séquence des acides aminés4. L'obtention des séquences : méthodes de F. Sanger (acide nucléique) et P. Edman (protéine)5. Le séquençage du génome humain6. Le stockage de la bioinformation : les banques de données7. La structuration de la bioinformation : fichiers et formats8. Exemples d'algorithmes et de programmes en bioinformatique9. Exemple d'analyse bioinformatique (aux choix de l’enseignant)10. Les domaines d'étude en "ome" ou "omique"

Travail personnel : Exposé, atelierMode d’évaluation :

- contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des scences de TP

Références :- Frédéric Dardel, François Képès. 2002. Bioinformatique: Génomique et post-génomique.

Editions Ecole Polytechnique. 246 p.- Cynthia Gibas, Per Jambeck. 2002. Introduction à la bioinformatique. O'Reilly. 375 p.- Pavel A. Pevzner, D. Hachez. 2006. Bio-Informatique Moleculaire: Une Approche

Algorithmique. Springer. 314 p.- Denis Tagu, Jean-Loup Risler. 2010. Bio-informatique : Principes d'utilisation des outils.

Editions Quae. 272 p. Intitulé : Biodiversité et physiologie végétale Semestre : 1Unité d’Enseignement Méthodologique 1 Matière 2 : Modélisation appliquée à la biologie végétale Crédits : 2Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement.

Comprendre l’utilisation de la modélisation comme outil de formalisation et synthèse de connaissances

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 53

Etre capable de comprendre les principes de la modélisation, de comprendre des démarches de modélisation appliquées à différents domaines de la biologie et leur intérêt.

En donnant différents exemples de modèles appliqués à la biologie végétale, illustrer les principes de base de construction, test et validation, interprétation de résultats de simulations.

Connaissances préalables recommandées : maîtrise de base de l’outil informatique, biostatistique, ontogenèse végétale (déjà requis en Licence et en master S1

Contenu de la matière :

Objectifs de la modélisation, typologie de modèles et grands types d’utilisation. Introduction aux méthodes et outils de modélisation. Ajustements sur jeux de données expérimentales, calculs de paramètres et de valeurs

statistiques. Prise en main d’un modèle simple et réalisations de simulations. Différentes exemples de modélisation en biologie végétale. Modélisation de l’échelle moléculaire à l’échelle supramoléculaire appliquée aux

biopolymères et à leurs assemblages. Modélisation à l’échelle de la plante : modèle de développement d’une feuille (prairies,

grandes cultures).d’une plante… Modèles d’aide aux décisions techniques à l’échelle d’un agrosystème (parcelle ou serre,

système de cultures, bassin versant ou hydrologique).

Travail personnel : Exposé et atelier.

Mode d’évaluation :

- contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des scences de TP

Intitulé : Biodiversité et Physiologie VégétaleSemestre : 1Unité d’Enseignement découverte 1 Matière 1: Changements climatiques et biodiversité Crédits : 2Coefficient : 2Objectifs de l’enseignement. - Etre informé des changements climatique et connaitre l’impact sur la biodiversité

surtout en Algérie- Les objectifs généraux sont triples : comprendre les origines, les impacts et les

implications majeures des changements climatiques- investir autour du sujet des changements climatiques dans des secteurs d'activité

variés.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 54

Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en écologie, botanique, (déjà requis en Licence). Nombre d’heures d’enseignement :Contenu de la matière :

1. Introduction2. La biodiversité :

2 . 1 . la faune (généralités)2 . 2 . la flore (détaillée) 2 . 2 . 1 . dans le monde 2 . 2 . 2 . en Algérie

Dans les différents étages bioclimatiques

3 . les changements climatiques3 . 1 . définition3 . 2 . les principales causes des changements climatiques

1 . causes géologiques 2 . causes astronomiques 3 . causes liées à l’humanité La pollution, 4 . l’effet de serre5 . L’impact des changements climatiques sur la biodiversité végétale

5 . 1 . présentation des cas dans le mondes (abrégé) 5 . 2 . impact de ces changements en Algérie

5. 2 . 1 . dans les différents étages bioclimatiques1.2.2. Impact sur la végétation spontannée

E . aride et saharien6 . les changements climatiques et la phoeniciculture

6 . 1 . effets sur la diversité variétale 6 . 2 . effets sur les pathologies 6 . 3 . effets sur le cycle biologique

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôles continue par évaluation du travail personnel

Travail personnel : Exposé .

Référence :- Dajoz, Roger. 2008. La biodiversité : l'avenir de la planète et de l'homme. Ellipses, 2008 - 275

pages.- Isabelle Roussel, Helga-Jane Scarwell . 2010. Le changement climatique : Quand le climat

nous pousse à changer d'ère. Presses Univ. Septentrion,  358 pages- Jean Louis Fellous, Catherine Gautier. 2007. Comprendre le changement climatique. Odile

acob,  297 pages.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 55

- Robert Barbault. 1997. Biodiversité : Introduction à la biologie de la conservation. Hachette,  159 pagesIntitulé : Biodiversité et Physiologie Végétale

Semestre : 1Unité d’Enseignement Transversale 1 Matière 1: CommunicationCrédits : 1Coefficient : 1Objectifs de l’enseignement.

Objectifs de l’enseignement : Analyser les objectifs de la communication interne et externe et présenter les méthodologies nécessaires pour conduire les principales actions de communication

Connaissances préalables recommandées Les bases linguistiques

Contenu de la matière :

o Renforcement des compétences linguistiqueso Les méthodes de la Communication o Communication interne et externeo Techniques de réunion

Communication orale et écrite Compétences visées : Capacité de bien communiquer oralement et par écrit - Capacité de bien présenter et de bien s’exprimer en public- Capacité d’écoute et d’échange- Capacité d’utiliser les documents professionnels de communication interne et externe- Capacité de rédiger des documents professionnels de communication interne et externe

Travail personnel : Exposé 

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Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Fondamentale 2Matière 1: Morphogenèse et physiologie de développementCrédits : 8Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement - Acquérir les connaissances fondamentales sur le fonctionnement végétal (croissance,

développement), en insistant sur les liens "structures-fonction", du niveau moléculaire à celui de la plante entière.

- A l'issue du cours, l'étudiant doit être capable de décrire les grandes fonctions végétales et les structures qui les supportent.

- Interpréter le développement végétal comme réalisation d'un programme sous le contrôle de facteurs génétiques, hormonaux et environnementaux.

Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en écologie, Physiologie végétale (métabolisme et nutrition). Botanique (déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :

I. Structure et fonctionnement des méristèmes1. Méristème primaire racinaire2. méristème primaire caulinairea. méristème végétatif

- activité mitotique des diverses zones du point végétatif- étude quantitative des synthèses nucléiques dans les diverses zones du point végétatif- histogenèse et organogenèse- différenciation et dédifférenciation- croissance et développement- phyllotaxie

b. Méristème floral : modification morphologique et structurale du méristème végétatifc. le méristème intercalaire3. Les méristèmes secondaires

- le cambium- le phéllogène

II. Les facteurs généraux de la morphogénèse1. les facteurs génétiques2. les facteurs endogènes 3. la polarité4. la symétrie5. les facteurs de milieu

III. Les aptitudes à la régénération1. régénération par les méthodes traditionnelles marcottage, bouturage2. régénération par culture in vitro

- culture de méristème (réversion)- culture de tissu : Rhizogenèse, calogènese et caulogénèse- rapport auxine/cytokinine

IV. Corrélations morphogénétiques

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1. Gradient morphogénétiques2. Corrélations mutuelles entre organes3. Inhibitionsa. Entre organe de même nature : dominance apicale (théorie hormonale, théorie trophique)b. Entre organes de natures différentes

- tige/feuille : chute des feuilles et de fruits- feuille/bourgeon

V. La dormance des bourgeons1. Installation de la dormance2. Mesure de la dormance3. Levée de la dormanceVI. Aspects de la morphogenèse des végétaux ligneux1. Les croissances rythmiques2. Les différents types de ramification3. Notions de modèle architecturalProgramme de travaux pratiques suggérés1ere séance : Morphologie d'une plante : reconnaissance et disposition des différents organes2éme séance : Réalisation de tracés phyllo taxiques3éme séance : Etude du bouturage: observation de la rhizogenèse et de la calogènes4éme séance : Observation du greffage et suivi5éme séance : Initiation à la culture in-vitro: coupe longitudinale et isolement du bourgeon6éme séance : Visite de pépinière pour les aspects de bouturage, marcottage, etc..

Travail personnel : Exposé , Sorties de terrain :Des visites aux pépinières, de centre de culture In-vitro…

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP

Référence :- VALLADE Jean, 1999. Structure et développement de la plante : morphogenèse et

biologie de reproduction. Ed. DUNOD- HELLER, R 1985. Physiologie végétale : Développement. Masson, Paris.  215 pages- MAZLIAK Paul, 1998. Physiologie végétale : T2.croissance et développement. Ed.

Hermann.- HOPKINS, W.G. 2003. physiologie végétale. De Boeck Supérieur, 532 pages.- LAFON Jean-Patrick, Catherine Tharaud-Prayer, Gilles Lévy. 1987. Biologie des plantes

cultivées: Physiologie du développement génétique et amélioration. Editions de l'ARPEPS, 172 pages

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 58

Intitulé : Biodiversité et Physiologie VégétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Fondamentale 2Matière 2: Métabolisme secondaire des plantesCrédits : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement. Connaître les principales familles structurales des métabolites secondaires d’origine naturelle, leur biogenèse et les relations structure-activité majeures associées à ces dernières.Appréhender les principales méthodes qui permettent de repérer et de valider les propriétés de ces molécules bioactives (intérêt pharmaceutique, cosmétique ou agronomique).Présenter quelques exemples précis de ces molécules, de leurs sources (algues, lichens, champignons, plantes médicinales, cultures cellulaires…) et de leurs applications.

Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en Physiologie végétale, botanique, génétique, Techniques de production (déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :Utilisation traditionnelle des plantes

- en médecine - en cosmétique- en agroalimentaire

Métabolisme secondaire :o Définition, les différentes voies biosynthétiques, les grandes familles structurales de

produits naturels…o Métabolisme et régulationo Organisation spatiale et compartimentation du métabolisme.o Ingénierie métabolique.

Métabolites secondaire d’intérêt pharmaceutique ou cosmétique :o Criblage biologique : Choix/définition des cibles thérapeutiques et du matériel végétal,

méthodologie d’évaluation… o Identification des produits naturels : Application des différents outils de l’analyse

spectroscopique (IR, UV, RMN, SM…) à la caractérisation structurale des métabolites secondaires.

o Exemples de molécules bioactives isolées de quelques espèces végétales en Algérie

Les travaux pratique proposés (aux choix de l’enseignant):

- Procédé d’extraction des huiles essentielles par hydro distillation.- Procédé d’extraction par solvants organique- Identification de la composition par CCM

Le travail personnel :

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- Préparation des exposés sur les plantes médicinale, médecine traditionnelle, phytothérapie, métabolisme secondaire, activité biologiques des substances d’origine végétale…etc.

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôle continue par évaluation du travail personnel

Références

- Juen Bruneton, 9009. Pharmacognosie : Phytochimie, Plantes médicinales. Tec & Doc Lavoisier, 1269 pages.

- Jean-Jacques Macheix,Annie Fleuriet,Christian Jay-Allemand. 2005. Les composés phénoliques des végétaux:Un exemple de métabolites secondaires d'importance économiquePPUR presses polytechniques, 192 pages.

- Abayomi Sofowora. 2010. Plantes médicinales et médecine traditionnelle d'Afrique. KARTHALA Editions, 378 pages.

- Bernard Boullard. 2001. Plantes médicinales du monde : croyances et réalités. De Boeck Secundair, 660 pages.

- Jacques Fleurentin, Jean-Claude Hayon. 2008. Plantes médicinales: Traditions et thérapeutique. Ouest-France, 189 pages.

-  Guy Gilly. 1997. Les plantes à parfum et huiles essentielles à Grasse: botanique, culture, chimie, production et marché. Editions L'Harmattan, 428 pages.

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Fondamentale 2Matière 3: Conservation des ressources phytogénétique Crédits : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement - Connaître l’état des lieux de la biodiversité phytogénétique en Algérie d’une façon générale.- Connaître les moyens de conservation de ces ressources particulièrement par l’utilisation des

techniques récentes de génie génétique- Savoir la diversité génétiques du l’abricotier et les meilleurs moyens de conservation de ces

ressources.Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en écologie, Génétique et Biodiversité végétale. (Déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :

1- Biodiversité :2- Evaluation et mesure de la diversité génétique :3- Stratégie en amélioration des plantes :4- Conservation :5- Multiplication végétative et culture in vitro : 6- Obtention d'haploïdes par culture in vitro :

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7- Les semences futures :8-Ressources phytogénétique de l’arboriculture et de palmier dattier

Les variétés abondantes (toujours cultivées)Les variétés rares (en voie d’extinction)

* Méthodes de préservation des ressources végétale :*les pratiques culturales conventionnelles* la génie génétique (culture in vitro)

Sorties proposées : aux choix (réalisable)- Visite des palmeraies des de Sud de Msila (Boussaada / M’cif)- Visite d’une collection variétale se l’ITDAS à FeliachLes sorties sont évaluées après rédaction d’un rapport (travail personnel)

Travail personnel : Stage en sorties de terrain: - Echantillonnage des plantes

- Echantillonnage des graines Mode d’évaluation :

- contrôle des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôle continus au cours des séances de TP- contrôle continue par évaluation du travail personnel

Références - Léveque, Ch, 2008. La biodiversité au quotidien-Le développement durable à l'épreuve des faits., Paris. 304p.- Dajoz, Roger. 2008. La biodiversité : l'avenir de la planète et de l'homme.. 275p.- Munier, P. 1973. Le palmier dattier. G.-P. Maisonneuve et Larose, Paris. 217p.

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Méthodologique 2Matière 1: Bio statistique Crédits : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement Cette matière permettra à l’étudiant de compléter sa maîtrise de l’outil statistique nécessaire aux analyses numériques des relevés.Connaissances préalables recommandées : Cette maîtrise nécessite des connaissances en maths, statistiques et informatique (déjà requis en Licence). Nombre d’heures d’enseignement :Nombre deContenu de la matière : Bio statistique

1. Statistique descriptiveParamètres de position - la moyenne, la médiane, Le mode

- comparaison de différents paramètres de position Paramètres de dispersion

- variance, écart-type, Coefficient de variation, étendu

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 61

2. Statistique inférentielle- Introduction aux lois de distribution : loi normale- Principe des tests : test de conformité

Comparaison de deux moyennes- Comparaison de plusieurs moyennes : Analyse de la variance à un facteur, à 2 facteurs ANOVA2, avec ou sans répétition

3. Régression linéaire simpleCorrélation de deux variables

- Détermination de la droite de régression.1. Tests statistiques

- Cas de 2 échantillons indépendants* Test de MANN-WHITNCY

* Test des médianes- Cas des échantillons appariés

* Test de WILCOXON* Test des signes

- Cas de plusieurs échantillons : - Test de SPEARMANN (corrélation)

- Test de χ2 5. Analyse des données multivariables - Analyse en composantes principales - Analyse factorielle des correspondances - Régression linéaire multiple - Analyses discriminantes

Travail personnel : AtelierMode d’évaluation :

- contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôle continue par évaluation du travail personnel

Référence :1. Amazallag E., Piccioli N., et Bry F., (1978). Introduction à la statistique. Ed. Hermann, Paris ? 339p. 2. Bernier, J. (2000). Statistique pour l'environnement : traitement bayésien de l'incertitude, Tec et

Doc.3. Chauvat, G. (2002). Statistiques descriptives : résumés des cours, 85 exercices corrigés, 40

problèmes, Armand Colin.4. Falissard, B. (1998). Comprendre et utiliser les statistiques dans les sciences de la vie, Masson. 5. Grais, B., (2003), Méthodes statistiques, Dunod.6. Huguier M, Flahault A., (2003). Biostatistiques au quotidien. Ed. Elsevier, Paris, 206p.7. Lecoutre, J-P., (2006), Statistique et probabilités : manuel et exercices corrigés, Dunod8. Milhaud, X (2001). Statistique. Ed. Belin9. Schwartz D., (1992). Méthodes statistiques à l’usage des médecins et biologistes. Flammarion,

Paris, 306p. 10. Valleron A. Z. et Lazard P., (1995). Exercices programmés de statistiques à l’usage des médecins

et biologistes. Flammarion, Paris, 247p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 62

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Méthodologique 2 Matière 2: Méthodes d’échantillonnage Crédits : 3Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement :- Le but de cet enseignement est d’apprendre aux étudiants la maîtrise des techniques

d’échantillonnage adaptées pour chaque situation Connaissances préalables recommandées : notions fondamentales de l’échantillonnage et de statistique acquis avant (tronc commun, licence) et en parallèle.

Contenu de la matière :

Chapitre 1 : Structure des peuplements Richesse Abondance Densité Diversité

 Chapitre 2 : Choix et contrainte de l’échantillonnage Le prémodèle Descripteurs écologiques Echelle de perception

Chapitre 3 : Plans d’échantillonnage Echantillonnage aléatoire Echantillonnage stratifié Echantillonnage systématique Qualité d’échantillonnage

Chapitre 4 : Echantillonnage des espèces Chapitre 5 : Echantillonnage des grainesStage en sorties de terrain: - Echantillonnage des plantes

- Echantillonnage des grainesLes sorties sont évaluées après rédaction d’un rapport (travail personnel)

Travail personnel : Stage en sorties de terrain: - Echantillonnage des plantes- Echantillonnage des graines Mode d’évaluation :

- contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôles continue par évaluation du travail personnel

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 63

Références - Barbault R., (1981). Ecologie des populations et de peuplement. Ed. Masson, Paris - Blondel J., (1995). Biogéographie approche écologique et évolutive. Ed. Masson, Collection

écologie N° 27. Ed. Masson, 297p. - Frontier S., (1983). Stratégies d’échantillonnage en écologie. Ed. masson, Paris- Giraudoux P., (1990). L’échantillonnage en écologie (cours post-graduation d’écologie).

Université de Dijon .INRA Faune sauvage. 45 p.- Lamot J., Bourlier A., (1969). Problème d’écologie : échantillonnage des peuplements

d’animaux des milieux terrestres. Ed. Masson. 151p.

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Découverte 2Matière 1: Ecosystème Steppique Crédits : 2Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement :- Connaitre les différents écosystèmes steppiques en Algérie en particulier la région de Hodna- Connaître les facteurs de dégradation de l’écosystème Steppique (facteurs anthrpozogène ) - Préservation de patrimoine

Contenu de la matière : - Découverte de l’écosystème steppique :

- Concepts et définitions de l’écosystème steppique.- La Flore des zones steppiques.- La faune steppique (insectes, animaux et autres)- Les interactions à l’intérieur de l’écosystème steppique.- Les facteurs qui influencent sur l’écosystème steppique

Facteurs biotiques Facteurs abiotiques

- Rôles de l’homme pour la préservation des régions l’écosystème steppique, - La valeur économique et sociale de l’écosystème steppique

Sortie de terrain :

Pour cela : l’étudiant doit visiter les zones steppiques en Algérie, soit à titre individuel ou en groupe dans des sorties organisées dont le but est de découvrir cet écosystème et sa vulnérabilité, et les différentes actions de l’homme au niveau de la steppe. Les étudiants doivent préparer un compte rendu pour chaque sortie de terrain. (Travail personnel)

Travail personnel : Sorties sur terrain: - Echantillonnage des plantes- Echantillonnage des graines Mode d’évaluation :- Un travail personnel ou de groupe est préparé et évalué.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 64

Référence :- DJEBAILI, S. 1984. Steppe Algérien : Phytosociologie et écologie. Edition OPU. 220p.- OZENDA, P. 1977. Flore et végétation du Sahara 3édition. Ed. CNRS. 662p.- LE HOUEROU H.N., Problèmes et potentialité des terres arides de l’Afrique de Nord. - QUEZEL P.et SANTA S. , 1962. Nouvelle flore de l’Agerie. Et des régions désertiques

méridionales. Ed. CNRS. Paris .1170p. - DUBOST, Daniel. 2002. Ecologie, aménagement et développement agricole des oasis algériens.

Edition CRSTRA, Algérie. 423 p.- Munier, P. 1973. Le palmier dattier. G.-P. Maisonneuve et Larousse, Paris. 217p.- RHOUMA, Abdelamjid. 2005 Le Palmier Dattier en Tunisie : I. Le patrimoine génétique - Volume

2. IPGRI. 2580p.Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Transversale 2Matière 1: Législation Crédits : 1Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement :Initier l’apprenant aux notions réglementaire, les définitions et origines des textes de loi et les connaissances des conséquences pénales.

Contenu de la matière : Notions générales sur le droit (introduction au droit, droit pénal). Présentation de législation algérienne (www.joradp.dz, références des textes). Règlementation générale (loi sur la protection du consommateur, hygiène, étiquetage

et information, additifs alimentaires, emballage, marque, innocuité, conservation). Règlementation spécifique (travail personnel, exposés). Organismes de contrôle (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML). Normalisation et accréditation (IANOR, ALGERAC). Normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR)

Compétences visées :o Capacité à lire et comprendre un texte de loio Capacité à appliquer une réglementation

Mode d’évaluation :- Un travail personnel ou de groupe est préparé et évalué.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 65

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 3Unité d’Enseignement Fondamentale 3Matière 1: Génétique moléculaire des plantesCrédits : 8Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement. Cet enseignement vise à apprendre aux étudiants quelques techniques de la génétique moléculaire pratiquées pour l’amélioration des plantes Connaissances préalables recommandées : génétique, biologie cellulaire, amélioration des plantes, déjà acquises (tronc commun, licence).

Contenu de la matière : 1. les marqueurs moléculaires. 2. génomique et biodiversité végétale. 3. génomique, caractérisation des gènes marqueurs et QTL. 4. évolutions moléculaires et variation de gène candidats. 5. le blé, céréale modèle pour la sélection et de synthèses en biologie végétale.

Travail personnel : Atelier

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TD

Références - Marie-Hélène Farce. 2000. Génétique moléculaire : principes et application aux populations animales. Editions Quae, 264 pages.- Frank Samouelian,Valérie Gaudin,Martine Boccara. 2009. Génétique moléculaire des plantes. Editions Quae, 230 pages.-  Annie Chartier. 1991. Glossaire de génétique moléculaire et génie génétique. Editions Quae, 48 pages.- Jean-François Morot-Gaudry,Jean-François Briat. 2004. La Génomique en biologie végétale. Editions Quae, 582 pagesIntitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 3Unité d’Enseignement Fondamentale 3Matière 2 : Transgénèse végétaleCrédits : 6Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement. Comprendre et évaluer la pertinence des systèmes d'amélioration végétale en fonction des contraintes de développement et potentialités des plantes cultivées (système reproducteur, cycle de développement) et de l'évolution des technologies disponibles (génétique mendélienne, quantitative, moléculaire, transgenèse, étude des populations, génomique,

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 66

protéomique) afin de proposer des cultures génétiquement adaptées aux besoins de l'humanité (alimentation, environnement, industrie, médecine)Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en Physiologie végétale, botanique, génétique, Techniques de production (déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :Historique et place de la transgénèse dans le contexte scientifique et agronomique.II. Principes de base de l’amélioration génétique chez les Plantes a. caractéristiques recherchées b. générer de la variation : mutagénèse, croisements III. Biotechnologie végétale a. Méthodes de culture in vitro6 Culture de méristèmes, micropropagation, culture de protoplastes, production d’haploïdes, culture d’embryons, embryons somatiques c.Transgenèse végétale Indirecte (utilisation d’Agrobacterium tumefasciens) et Directe (micro-injection, fusion somatique et technique des liposomes, biolistique) IV : Enjeux éthiques Production et commercialisation de plantes comestibles transgéniques a. Impacts environnementaux b. Impacts sur la santé humaine c. Impacts sociaux d. Implications éthiquesV- le clonage de gèneMéthodologies de base / Gènes chimériques de première et de seconde génération / Vecteurs de clonage.VI- Techniques de transfert et d'obtention de plantes transgéniquesVII- Repérage des cellules transformées et contrôle de l'expression des transgènesRecherche de la présence du T-DNA et du nombre de copies (PCR, Southern) / Contrôle de l'expression des transgènes sur systèmes fractionnés et in situ.VIII- Réalisations actuelles, perspectives et réglementation du génie génétique Modèles transgéniques déjà créés / Évaluation des risques / Réglementation et problèmes posés par la détection des O.G.M.

Travail personnel : Atelier

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôle continue par évaluation du travail personnel

Références :- Claudine Franche, Émile Duhoux. 2001. La transgénèse végétale. Elsevier,191 pages- Frank Samouelian,Valérie Gaudin,Martine Boccara. 2009. Génétique moléculaire des

plantes. Editions Quae,  230 pages

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 67

- Alain Esterle, Laurence Schaffar . 1994. Organisation de la recherche et conformisme scientifique. Presses universitaires de France, 325 pages

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Fondamentale 3Matière 3 : Production végétale et valorisation des plantes.Crédits : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement. Comprendre les différents composants de rendement et de la production végétale. Connaître les principales cultures : la biologie et la production.

Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en Physiologie végétale, Biologie et valorisation des plantes d’intérêt économique, techniques de production (déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :1- Généralité sur la production végétale (rendement potentiel et productivité agricole)2-Définitions et notions 3--Les grandes cultures, les céréales

-Biologie des céréales (blé, orge, maïs)-Composantes de la production

4-Arboriculture :-Biologie des arbres fruitiers :

L’abricotier Les agrumes (oranger, mandarinier)Le palmier dattierLa viticulture L’olivier

-La production chez les arbres fruitiers :La production des abricots, des agrumes, la production des dattes, La production des raisins et la production des olives.

5-La culture maraichèreBiologie des solanacées (tomate, pomme de terre)La production de cette filière.

6- Autres cultures.Travail personnel : Sorties proposées : aux choix (réalisable)- Visite aux exploitations agricoles dans la région de Msila (Maâdher de Boussaâda ou autres)- Visite de l’exploitation agricole l’ITDAS de Biskra et l’ITAF de Bentchikao Médéa.

Mode d’évaluation :

- contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôl continue par évaluation du travail personnel

Référence

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 68

- Laurence Amand, Nathalie Langlois. 2009. Agriculture biologique: Les grands principes de production et l'environnement professionnel. Educagri Editions. 235p.

- Gabriel guet. 2003. Mémento d'agriculture biologique: Guide pratique à usage professionnel. France Agricole Editions. 416p.

- Nathalie Langlois, Vincent GAUCHARD, Nathalie LANGLOIS. 2010. Agriculture biologique:  Maîtriser la conversion et ses conséquences. Educagri Editions. 106 p.

- King. F. H. 2007. Irrigation and drainage principles and practice of there cultural phases. Goldberg Press. 536 p.

Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 3Unité d’Enseignement Méthodologique 3Matière 1 : Organisation et valorisation de la recherche scientifiqueCrédits : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement : Le but de cette matière est de savoir les procédures liés à la recherche scientifiques. Il faut apprendre aux étudiants la démarche méthodologique de la recherche et la synthèse bibliographique, la lecture et la rédaction des documents scientifiques. Connaissances préalables recommandées : maîtrises des langues (français, anglais) déjà acquises en terminologie, Anglais (tronc commun, licence…).

Contenu de la matière :I- organisation de la recherche 1. conditions de la production scientifique 2. la recherche et environnement socio-économique. 3. le regroupement des chercheurs et leurs modes d’actions. (Associations, sociétés , Congres). 4. l’organisation du travail de recherche. II - L’éthique et l’intégrité en recherche.III- préparation d’un travail scientifique et analyse bibliographique

1. Généralités et objectifs

2. Concepts théoriques - Choix de sujet - Formulation d’une problématique - Enonciation d’une hypothèse - Opérationnalisation du cadre théorique - Enonciation des conclusions anticipées

3. Concepts appliqués - Préparation des textes empiriques- Traitement des données - Construction et présentation des références bibliographiques

4 - Valorisation de la recherche - Publications et diffusion des résultats de la recherche. - institutions spécialisées dans la valorisation de la recherche (agences, bureau d’étude,

incubateurs…).

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 69

- brevets d’inventeurs scientifiques. - création d’entreprise.

Travaux dirigés : - Plan de rédaction d’un mémoire - Recherches bibliographiques dans une bibliothèque réelle ou virtuelle (internet)

Travail personnel :

- Réflexion sur un thème de recherche et conception d’un plan de travail et structuration d’un travail scientifique complet.

- Résumer un mémoire de fin d’étude ou un article scientifique

Mode d’évaluation : Continu (TD, Travail personnel) : 60%, Examen final 40%

Références

- Beaud M., (2006). L’art de la thèse. Ed. Découverte, Paris, - Marc Couture, René-Paul Fournier. 1999. La recherche en sciences : Guide pratique pour les chercheurs. De Boeck Supérieur, 264 pagesIntitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 2Unité d’Enseignement Méthodologique 3 Matière 2: Techniques de production et culture biologiqueCrédits : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement :- Apprendre les techniques de productions végétale surtout celles biologiques.- Savoir l’état actuel de l’agriculture biologique- Comme finalité : l’étudiant connaître la nécessité de retourner vers les techniques biologiques

pour préserver leurs environnements

Contenu de la matière : Partie 1 : technique de culture

1- Amélioration par les techniques agronomiques2- Biologie florale 

3- La défense des cultures 4- Irrigation et drainage 5- Contraintes hydrique et production  6- Rotation – assolement, bilan hydrique et production 

6. Technique de culture des tissus végétaux.Partie 2 : cultures biologiques :- Introduction- Biosemences- Techniques de laboratoire- Production biologique en champs- Culture biologique du palmier dattier et Production de dattes biologiqueLes TP.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 70

- Un TP sur la mesure des besoins des plantes en eauTravail personnel : Sortie proposée :- Visite d’une unité de démonstration production de dattes biologiques

La sortie est évaluée après rédaction d’un rapport (travail personnel)

Mode d’évaluation : - contrôles des connaissances par un examen en fin du semestre - contrôles continus au cours des séances de TP- contrôles continue par évaluation du travail personnel

Références - Claude Vallée, Gilbert Bilodeau, Cégep Joliette-De Lanaudière. 1999. Les Techniques de Culture

en Multicellules. Presses Université Laval, 394 pages- Roger Jean Gautheret. 1942 - Manuel technique de culture des tissus végétaux. Masson et Cie,

172 pages- Laurence Amand, Nathalie Langlois. 2009. Agriculture biologique: Les grands principes de

production et l'environnement professionnel. Educagri Editions. 235p.- Gabriel guet. 2003. Mémento d'agriculture biologique: Guide pratique à usage professionnel.

France Agricole Editions. 416p.- Nathalie Langlois, Vincent GAUCHARD, Nathalie LANGLOIS. 2010. Agriculture biologique: 

Maîtriser la conversion et ses conséquences. Educagri Editions. 106 p.- King. F. H. 2007. Irrigation and drainage principles and practice of there cultural phases. Goldberg

Press. 536 p.Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 3Unité d’Enseignement Méthodologique 3Matière 1: Biogéographie Crédits : 2Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement :

- Connaître les caractéristiques des zones arides et semi arides surtout en Algérie- Comprendre les effets du climat sur la végétation.- Dans un premier temps, l’Enseignement permettra d'approfondir les critères de définition et de

distinction des variantes des différents types de bioclimats méditerranéens ; ce qui permettra de décrire les principales formations végétales méditerranéennes, qu'il s'agisse des forêts feuillues et résineuses, des "matorrals" (maquis, garrigues), des pelouses et prairies (causses, bords des oueds…).

Connaissances préalables recommandées : Cette matière nécessite des connaissances en écologie, botanique, (déjà requis en Licence et en Master S1).

Contenu de la matière :

Milieux arides et semi-arides1ère Partie : Caractérisation de l’Aridité

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1°) Définition de l’aridité2°) Mesures de l’aridité3°) Typologie des déserts* Déserts zonaux* Déserts côtiers* Déserts d’Abri* Déserts continentaux4°) Histoire des déserts * Variation climatique* Problème de sècheresse* Action anthropique2ème Partie : Les Modelés1°) Les modelés rocheux2°) Les modelés dunaires3°) Le réseau hydrographique3ème Partie : Adaptation du vivant1°) Adaptation physiologique (Végétation...)2°) Adaptation humaine* Exploitation traditionnelle (problème des Nappes fossiles...)* Tentatives d’Aménagement (Nouvelles technologies, Epuisement des nappes..)

Biogéographie de l’espace méditerranéenDéfinition et de distinction des variantes des différents types de bioclimats méditerranéens - les principales formations végétales méditerranéennes, qu'il s'agisse des forêts feuillues et

résineuses, des "matorrals" (maquis, garrigues), des pelouses et prairies (causses, bords des oueds…).

- Les milieux naturels - Les milieux anthropisés - Effets de climat méditérranéen sur les systèmes hydriques, sols, végétations, agricultureTravail personnel : Sorties sur terrain : Les sorties proposées pour la matière sont :

1- Octobre – Novembre : de la région Nord-est et Nord-west d’el Hodna l’objectif est l’observation des différents étages bioclimatiques et différents ainsi que le type de la végétation dans chaque climat.

2- Janvier – février : visite de la région Sud d’el Hodna: étude de la géographie du nord de sahara (cordon dunaire…)

3- Mars : visite de la pleine de l’Outaya et le barrage de la fontaine des gazelles)La sortie est évaluée après rédaction d’un rapport (travail personnel)

Mode d’évaluation : continu (travail personnel) : 50 %, examen final : 50%

Références - CHAUVET, Michel et OLIVIER, Louis, 1993. La biodiversité, enjeu planétaire. Sang de la terre,

416 p- ARNOULD Paul et SIMON Laurent, 2008. Géographie de l'environnement. Belin, 307 p.- BLANDIN Patrick, 2009. De la protection de la nature au pilotage de la biodiversité. Quae, 120 p.- QUEZEL Pierre et MEDAIL Frédéric, 2004. Ecologie et biogéographie des forêts du bassin

méditerranéen. Elsevier, 572 p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 72

- A. Riedacker. 1993. Physiologie Des Arbres Et Arbustes en Zones Arides Et Semi-arides: Séminaire, Paris-Nancy, 20 Mars-6 Avril 1990. John Libbey Eurotext, 489 pages.

- Adolphe Laurent Joanne. Géographie de l’Algérie. C. Lacour,170 pages.Intitulé : Biodiversité et physiologie végétaleSemestre : 3Unité d’Enseignement Transversale 3Matière 1 : Entreprenariat Crédits : 1Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement :Initier l’apprenant au montage de projet, son lancement, son suivi et sa réalisation.

Connaissances préalables recommandées : Ensembles des contenus de la formation

Contenu de la matière : 1. L’entreprise et gestion d’entrepriseo Définition de l’entrepriseo L’organisation d’entrepriseo Gestion des approvisionnements :

- Gestion des achats, - Gestion des stocks - Organisation des magasins

o Gestion de la production :- Mode de production, - Politique de production

o Gestion commerciale et Marketing :- Politique de produits, - Politique de prix, - Publicité,- Techniques et équipe de vente

2. Montage de projet de création d’entrepriseo Définition d’un projet o Cahier des charges de projeto Les modes de financement de projeto Les différentes phases de réalisation de projeto Le pilotage de projet o La gestion des délais o La gestion de la qualitéo La gestion des coûtso La gestion des tâches

Compétences visées :o Compréhension de l’organisation et de fonctionnement d’une entrepriseo Capacité à monter un projet de création d’entrepriseo lancer et à gérer un projeto Capacité à travailler méthodiquemento Capacité à planifier et de respecter les délaiso Capacité à travailler en équipe

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 73

o Capacité d’être réactif et proactif

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 74

Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie

Filière : Biologie

Spécialité : Ecologie des écosystèmes aquatiques

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 75

1- Semestre 1 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18

Origine et fonctionnement des écosystèmes aquatiques

67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%

Méthodes d’études et d’inventaires des peuplements

90h 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Biogéographie 45 h 1h30 - - 55h00 2 4 40% 60%

UE méthodologie 5 9

Hydrochimie et qualité de l’eau

45 h 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%

Dégradation et conservation des écosystèmes aquatiques

60h 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

UE découverte 1 2

La faune des zones humides 45 h 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%

UE transversale 1 1

Techniques de communication 22h30 1h30 - - 02h30 1 1 - 100%

Total Semestre 1 375h 375h 16 30

2- Semestre 2 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18

Systématique limnique 90h00 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Ecologie des peuplements animaux

67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40%60%

Microbiologie de l’eau 45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%UE méthodologie 5 9

Analyse instrumentale 60h00 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%Les maladies à transmission hydrique

45h00 3h - - 55h00 2 4 40% 60%

UE Decouverte 1 2

Biostatistique 45h00 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%UE transversales 1 1

Législation des zones humides

22h30 1h30 - - 02h30 1 1 - 100%

Total Semestre 2 375h 375h 16 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 77

3- Semestre 3 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales 9 18

Eco-éthologie 90h00 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Génétique des populations 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%

Biodiversité, changements globaux et développement durable

45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 440%

60%

UE méthodologie 5 9

Cartographie de la végétation 60h00 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

Système d’information géographique (SIG)

45h00 3h - - 55h00 2 4 40% 60%

UE découverte 1 2

Plans de gestion des zones humides

45h00 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%

UE transversales 1 1

Entreprenariat et étude d'impact

22h30 1h30 - - 02h30 1 1 100 %

Total Semestre 3 375h 375h 16 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 78

4- Semestre 4 :

Domaine  : Sciences de la Nature et de la Vie Filière : BiologieSpécialité : Ecologie des écosystèmes aquatiques

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coeff CréditsMémoire* 200 09 16Stage en entreprise** 60 05 8Séminaires*** 20 3 6Total Semestre 4 280 17 30

VHS Coeff Crédits* Travail Personnel considére comme unité d’enseignement fondamentale**Stage en entreprise** considére comme unité d’enseignement méthodologie.***Séminaires considére comme unité d’enseignement découverte.

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 337h30 157h30 67h30 67h30 630h00TD 157h30 30h00 67h30 - 255hTP 90h00 112h30 - - 202h30Travail personnel 742h30 360h00 15h00 7h30 1125hMémoire 200h00 - - - 200hStage en entreprise** - 60h00 - - 60

Séminaires*** - - 20h00 - 20Total 1527h30 720h 170h00 75h00 2492h30Crédits 72 33 12 3 120% en crédits pour chaque UE 60% 27.5% 10% 2.5% 100%

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Origine et fonctionnement des écosystèmes aquatiquesCrédits : 6

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement A l’issue de cet enseignement, l’étudiant sera capable d’étudier l’écologie d’une

zone humide en vue de son classement (protection).Connaissances préalables recommandées

Ecologie générale, chimie généraleContenu de la matière : 

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Boulaine J. (1996). Histoire d’agronomie en France. Edition Lavoisier. 437p.2. Boutelier P. (1979). Le rôle des roselières dans l’estuaire de la Loire. Université de Nantes. 136p.3. Brix H. (1997). Macrophytes play a role in constructed wetland treatment water Science ans Technology. 35 (5): 11-17.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Méthodes d’études et d’inventaires des peuplements Crédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement Permettre à l’étudiant d’acquérir les notions de bases d’échantillonnage des grandes formations végétales d’Algérie.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 80

IntroductionFonctionnement hydrologique des hydrosystèmes

Echanges avec le milieu environnantRôle des zones humides dans la recharge des nappes et leur drainageAménagement des zones humides

Contrôle des cruesAu niveau du bassin versantEn période des cruesEn aval des zones humides

Dynamique des flux et renouvellement des sédimentsZones humides et dépressionsPlaines alluviales

Connaissances préalables recommandées Notions de biologie végétale des phanérogames

Contenu de la matière : 

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Lamotte J. et Bourliere A. (1969) Problèmes d’écologie: l’échantillonnage des peuplements animaux des milieux terrestres. Masson. 151p.2. Legendre L. et Legendre P. (1979) Ecologie numérique: la structure des données écologiques Tome 2. Masson. 255 p.3. Frontier S. Pichod-Viale D. (1998). Structure, fonctionnement et évolution des écosystèmes. Edition Lavoisier. 419p.4. Siri E. (1973). L’étang : sa faune et sa flore. Edition Boubée. 198p.5. Blondel J. (1995). Biogéographie : approche écologique et évolutive. Edition Masson. 297p.6. Elhaï H. (1968). Biogéographie. Edition Armand Colin. 408p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : BiogéographieCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Acquérir des connaissances sur la répartition des organismes à la surface du globe

et des zones arides et semi arides et la mise en évidence des causes qui régissent cette répartition en général et en particulier en Algérie.Connaissances préalables recommandées

Biocénotique, climatologie, pédologie, taxonomie végétale, taxonomie animale

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 81

- Le pré-modèle- Méthodes d’étude (reptiles, avifaune aquatique, amphibiens…)-Techniques d’échantillonnage (Unité minimale d’échantillonnage, échantillonnage aléatoire simple, échantillonnage systématique, échantillonnage stratifié, autres types d’échantillonnage et échantillonnage des populations animales).- Collecte et analyse des données faunistiques (Présentation des données, applications des différentes méthodes pour l’estimation des densité, traitements statistiques des données et application des méthodes multivariées par l’identification des groupements d’espèces).

Contenu de la matière : I : Eléments de biogéographieAperçu historique de la biogéographie Biogéographie écologique Eléments de géodynamique Etude des aires (délimitation, type d’aires, aires de différents rangs taxonomiques)Territoires et cortèges floristiques (notions, cortèges, richesse floristique, divisions floristiques du monde, régions, domaines et secteurs)Variations chronologique des airesII : ZoogéographieLes aires de distribution géographiques Les empires faunistiques et leurs distributions Les causes de distribution actuelle des êtres vivants Les faunes insulaires

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Eléments de biogéographie et d écologie - Eléments d’écologie - Elément d’écologie, Ecologie fondamentalewww.upmc.fr › ... › Les origines. Histoire de la Terrewww.universalis.fr/encyclopedie/biogeographie/max2.ese.upsud.fr/epc/conservation/EE/pdf/BioGeo_30102010.pdfwww.cnrtl.fr/definition/biogéographiewww.cnrtl.fr/definition/zoogéographiehttps://fr.wikipedia.org/wiki/Zoogéographiewww.africamuseum.be/.../doc/zoogeographiei_fbt2014_comprim.pdf

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : MéthodologieIntitulé de la matière : Hydrochimie et qualité de l’eau.Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Permettre à l’étudiant de bien maîtriser les techniques d’analyse physico-chimique de l’eau (éléments majeurs et sous forme de trace).

Connaissances préalables recommandées Chimie générale, écologie des eaux courantes.

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 82

-Qualité physico-chimique de l’eau,-Dynamique des micropolluants organiques (pesticides, polluants d’origines urbaines et industrielles),- Processus de rétention,-Processus de dégradation,-Adsorption,-Eléments minéraux (dynamique du phosphore, rétention et élimination de l’azote).

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Rodier A. (2004). L’eau : qualité physico-chimique et microbiologique. Edition Dunod. 1247p.2. OECD (1981). Guidelines for testing chemicals methods. Edition Environment Monographs. 213p.3. Linden G. (1984). Techniques d’analyse et de contrôle dans les industries agro-alimentaires. Edition APRIA. 4 volumes.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : MéthodologieIntitulé de la matière : Dégradation et conservation des écosystèmes aquatiques Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement Identification des risques de dégradation des écosystèmes aquatiques sous

pression anthropiques, contribuer à son impact et proposer des solutions adéquates de restauration des écosystèmes dégradés.

Connaissances préalables recommandées Structure et fonctionnement des écosystèmes aquatiquesEcologie fondamentale et appliquéePollution de l’environnement EcotoxicologieGestion des ressources aquatiques.

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 83

IntroductionRappels sur les écosystèmes aquatiques

1. historique2. structure et fonctionnement3. diversité biologique4. rôles et intérêts des écosystèmes aquatiques dans la biosphère

Dégradation des écosystèmes aquatiques1. concept de dégradation2. facteurs et processus de dégradation

Conservation et approches méthodologiques1. notion de conservation2. moyens de conservation3. moyens de préservation4. moyens de restauration

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Angelier E. (2002). Introduction à l’écologie des écosystèmes naturels à l’écosystème humain. Edition Lavoisier. 384p.2. Frontier S. Pichod-Viale D. (1998). Structure, fonctionnement et évolution des écosystèmes. Edition Lavoisier. 419p.3.Faurie C., Ferra C., Medori P., Deviaux J. et Hemptinne L. (2002). Ecologie : approche scientifique et pratique. Edition TEC & DOC. 427p.4. Fustec E. et Leufevre J-C. (2000). Fonctionnement et valeurs des zones humides. Edition Dunod. 463p.Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : DécouverteIntitulé de la matière : La faune des zones humides Crédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement Permettre à l’étudiant da connaitre les différentes espèces faunistiques des écosystèmes aquatiques notamment l’avifaune, l’ichtyofaune et la faune benthique de nos zones humides.

Connaissances préalables recommandées Notions d’écologie des zones humides, systématique animale

Contenu de la matière : 

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 84

- Introduction- Vertébrés L’Avifaune des zones humides Algériennes L’Ichtyofaune des eaux continentales Les Amphibiens- Invertébrés Les phytoplanctons des eaux continentales Les zooplanctons des eaux continentales La faune benthique.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. ALTHMANN J. (1974) Observational study of behavior: sampling methods. Behaviour 4: 227-267.2. Lamotte J. et Bourliere A. (1969) Problèmes d’écologie: l’échantillonnage des peuplements animaux des milieux terrestres. Masson. 151p.3. BALDASSARE G.A., PAULUS S.L., TAMISIER A. et TITMAN R.D. (1988) Workshop summary: Techniques for timing activity of wintering waterfowl. Waterfowl in winter. Univ. Minnesota press, Mineapolis. 23p.4. ISENMANN P. et MOALI A. (2000) Les oiseaux d’Algérie. SEOF. 336p.5. Blondel J. (1995). Biogéographie : approche écologique et évolutive. Edition Masson. 297p.6. Elhaï H. (1968). Biogéographie. Edition Armand Colin. 408p.Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S1Intitulé de l’UE : TransversaleIntitulé de la matière : Techniques de communicationCrédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignementCette matière présente les connaissances sur la langue de la science et de la

communication scientifique. Elle permet le développement de projets encadrés sur la thématique de la formation de master proposé et renseigne sur la vulgarisation des sujets de mémoire ou de la thématique générale des travaux de recherche.

Connaissances préalables recommandées Avoir des connaissances de base en informatique et techniques de

méthodologie.

Contenu de la matière :

- Communication scientifique : perfectionnement à la conception de diaporamas et de posters avec le logiciel Power Point.

- Projet encadré sur un sujet d'actualité en écologie et environnement, avec recherche bibliographique, rédaction d'un rapport et présentation orale.

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 85

1. CARON, R. (1994). Bibliographic records with French Headings . Library Cataloging and Authorities Group. 2. CARON, R. (1994).«Comment citer un document électronique?», In Université Laval, Bibliothèque, Site de la Bibliothèque de l'Université Laval, [En ligne]. http://www.bibl.ulaval.ca/doelec/citedoce.html 3. MORNIN E. (1998). RE: validité des informations issues du web. 4. PELGRIMS, G. (2003). Références bibliographiques. Guide pour les travaux universitaires en Sciences de l’éducation. (Cahiers de la Section des sciences de l’éducation, Hors série). Genève : Université de Genève.Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Systématique limniqueCrédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement Permette à l’étudiant de connaître les principaux groupes d’animaux (micro et

macroinvertébrés) vivants dans les écosystèmes aquatiques.

Connaissances préalables recommandées Connaissance en biologie animale, protozoologie et parasitologie.

Contenu de la matière : 1. Systématique limnique I : Taxonomie des invertébrés (classification des Nématodes, Gastéropodes, Arachnides, Crustacés, Insectes, les Echinodermes). L’étude de l’utilisation des clés de détermination représente à ce titre l’aspect fondamental du cours. 2. Systématique limnique II : Taxonomie et caractères généraux des vertébrés (classification des oiseaux, des reptiles, des mammifères, des poissons, des batraciens ou amphibiens…)

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Beaman M. et Madge S. (1998). Guide encyclopédique des oiseaux du Paléarctique occidental. Edition Nathan. 871p.2. Aguilar J., Dommanget J-L. et préchac R. (1985). Les libellules d’Europe et d’Afrique du Nord. Edition Delachaux et Neistlé. 341p.3. Dedline R., Simon J., Stoquart J-M. et Verrept M. (1983). Le monde animal. Edition A. De Boeck. 1102p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 86

4. Gerard P. (2000). La Zoologie. Edition Dunod. 638p.5. Cramps et Simmons (1971). Les oiseaux. Edition Oxford Press. 7 volumes. 2118p.6. Le Graff B. (1998). Les amphibiens et les reptiles dans leur milieu. Edition Bords. 247p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Ecologie des peuplements animaux.Crédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement Permettre à l’étudiant d’acquérir les différentes techniques d’étude des peuplements animaux des écosystèmes aquatiques.

Connaissances préalables recommandées Ecologie générale, fonctionnement des zones humides.

Contenu de la matière : 

1. Synécologie descriptive Rappel des différents niveaux d’intégration des organismes en écologie (Notions approfondies de biocénose, biotope, écosystèmes, Différentes échelles de perception)Structure des peuplements animaux (Notion de richesse et de diversité, Méthodes de description des paramètres de structure et de comparaison des peuplements, Etude des différents types de distribution des organismes, Insertion des organismes dans l’écosystème - notion de niche écologique)Evolution des peuplements (Evolution des peuplements animaux le long des successions écologiques, Coévolution des espèces en interaction, Mise en place des peuplements et coévolution, Evolution et vieillissement des écosystèmes)

2. Synécologie fonctionnelle Circulation de l’énergie dans l’écosystèmeInteractions entre les différents composants des peuplements (Rappels sur les diverses coactions intra et inter spécifiques, Relations végétaux herbivores, Compétition, Prédation et Parasitisme)Chaînes alimentaires et réseaux trophiques Place de l’homme dans les différents écosystèmes

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Engelhardt W. (1996). La vie dans les étangs, les ruisseaux et les mares. Edition Vigot. 331p.2. Mac Farland D. (2000). Comportement animal. Edition De Boeck. 637p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 87

3. Stichkoskaïa L. (1986). Le langage des animaux. Edition MIR Moscou.241p.4. Favrod C-H. (1975). La vie animale. Encyclopédie du monde acctuel.245p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Microbiologie de l’eau Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Permettre à l’étudiant de se familiariser avec les trois systèmes de classification des bactéries (Bergy, Prévôt et Krassilnikov). Il sera capable de classer les bactéries suivant leurs environnements.

Connaissances préalables recommandées La microbiologie générale et la biochimie microbienne.

Contenu de la matière : 

La taxonomie microbienneAutres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Larpent J-P. (2000). Introduction à la nouvelle classification bactérienne. Edition TEC & DOC. 280p.2. Davet P. (1996). Vie microbienne du sol et production végétale. Edition INRA. 383p.3. Bergy A. (1984-1986). Bergey’s manual of systematic bacteriology. 4 volumes. Williams & Wilkins, Baltimore.4. Leclerc H., Gaillard J-L. et Simonet M. (1995). Microbiologie générale. La bactérie et le monde bactérien. Doin, Paris. 457p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 88

Introduction au monde microbienNotions de biochimie microbienneLes bactéries photosynthétiquesLes bactéries autotrophesLes bactéries hétérotrophes Gram positifLes bactéries hétérotrophes Gram négatifLes bactéries pédonculéesLes bactéries à trichomeLes MyxobactériesLes RickettsiesLes Chlamydies

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : MéthodologiqueIntitulé de la matière : Analyse instrumentale.Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement L’étudiant doit être capable de conduire une recherche théorique et pratique. Il doit

maîtriser toutes les techniques de bases de laboratoires utilisées en biologie.

Connaissances préalables recommandées Chimie générale et analytique

Contenu de la matière : Les techniques courantes

Techniques courantesTechniques de microbiologieTechniques d’extraction, de séparation et de purifications des biomolécules

Les techniques chromatographiquesCCM, en phase gazeuse et liquide (HPLC)

Les techniques électrophoretiquesElectrophorèse en gel polyacrylamide (PAGE), eletrofocalisation, bidimensionnelle, sur agarose, en champs pulsé et capillaire

Techniques spectroscopiquesSpectroscopie UV-Visible, IR, de masse, RMN et spectrofluoremétrie.

Techniques de centrifugation et ultracentrifugation

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1. Multon F. (1991). Techniques d’analyse et de contrôle dans les industries agro-alimentaires. Edition TEC & DOC. 408p.2. Williams M.A. (1977). Quantitatives methods in biology. Edition N.H.317p.3. Work E. (1976). Laboratory Technics. Edition N.H.317p.4. Bobbit A. (1972). Introduction à la chromatographie. Edition Gauthiers-Villars. 268p.Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : MéthodologiqueIntitulé de la matière : Les maladies à transmission hydriqueCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 89

Permettre à l’étudiant de déterminer le rôle joué par les zones humides stagnantes et temporaires dans l’évolution des maladies virales, bactériennes et parasitaires.

Connaissances préalables recommandées Ecologie des zones humides, parasitologie, virologie, ornithologie, bactériologie

Contenu de la matière : 

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Fustec E. et Leufevre J-C. (2000). Fonctionnement et valeurs des zones humides. Edition Dunod. 463p.2. Tamisier A. et Dehorter O. (2000). Camargue canards et Foulques : fonctionnement d’un prestigieux quartier d’hivernage. Edition Centre Ornithologique du Gard. 314p.3. Stickmann-Marny U. (1994). Faune et flore. Edition Vigot.447p.4. Grosclaude G. (1999). L’eau : milieu naturel et maîtrise. Edition INRA. 204p.5. Grosclaude G. (1999). L’eau : Usage et polluants. Edition INRA. 210p.Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : DécouverteIntitulé de la matière : BiostatistiquesCrédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement La statistique joue un rôle essentiel dans de très nombreuses disciplines

scientifique dans le domaine des sciences du vivant. Le programme proposé dans ce module permettra aux étudiants et chercheurs de maîtriser une grande partie des méthodes statistique nécessaire à l’analyse et à l’interprétation de leurs résultats expérimentaux et d’échantillonnages.

Connaissances préalables recommandées Les lois de la probabilité et la statistique descriptive à une et à deux critères.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 90

- Structure des zones humides (habitats) et biodiversité,- Fonctions des zones humides (besoins biologiques),- Rôle des zones humides dans la recharge des nappes et leur drainage,- Typologie et classification,- Production primaire,- Dimensions et performances,- Importance de la dynamique fluviale,- Perturbation hydrologique,- Habitats diversifié pour les espèces animales,- Production des zones humides,

Contenu de la matière : - Introduction- Statistique descriptive (rappels)- Les méthodes statistiques relatives à la corrélation- Les méthodes statistiques relatives à la régression linéaire simple et multiple.- Les méthodes statistiques relatives à la description- Les méthodes statistiques relatives aux moyennes- L’analyse de variance à un critère de classification- L’analyse de variance à deux critères de classification- Les comparaisons particulières de moyennes- Les méthodes statistiques non paramétriques - Calculs statistiques sur ordinateurs (SAS, MINITAB, STATISTICA, ADE4)- Conclusion

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation :  Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Dagnelie P. (2000). Statistique théorique et appliquée. Tome 1 et 2. Edition Université de Boeck et Larcier (Belgique). 1150p.2. Baillargeon G. (2002). Méthodes statistiques. Edition SMG les trois rivières (Québec). 896p.3. Harvey J., Motulsky A. (2002). Biostatistiques : une approche intuitive. Edition Université de Boeck et Larcier (Belgique). 484p. 4. Frontier S., Davout D., Gentilhomme U. et Lagadeuc Y. (2001). Statistique pour les sciences de la vie et de l’environnement. Edition Dunod. 377p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : transversalesIntitulé de la matière : LégislationCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement A l’issue de cet enseignement, l’étudiant sera capable d’étudier l’écologie d’une

zone humide en vue de son classement (protection).

Connaissances préalables recommandées Ecologie générale, biologie végétale, biologie animale, ornithologie

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 91

-Définition d’une zone humide-Evaluation des fonctions des zones humides-Identification des caractéristiques des zones humides (pour la biodiversité)-Valeur culturelle des zones humides-Classements des zones humides (site Ramsar, réserves de la biosphère…) -Les zones humides artificielles

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Fustec E. et Leufevre J-C. (2000). Fonctionnement et valeurs des zones humides. Edition Dunod. 463p.2. Boumezbeur A. (2001). Atlas des zones humides algériennes. Edition DGF. 78p.3. WCMC. (1992). Global biodiversity. Status of the earth’s living resources. A contribution to the global biodiversity strategy. Edition Goombridge, London 127p.4. Yésou P. (1983). Anatidés et zones humides de France métropolitaine. Bulletin Numéro spécial ONC. 315p.5. Williams J.J.R. (1990). Wetlands. A threatened landscape. Basil Blackwell Oxford 419p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Eco-éthologieCrédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement A l’issue de cet enseignement l’étudiant se familiarisera avec l'étude de

comportement des animaux qui exploitent les écosystèmes aquatiques vis-à-vis les facteurs environnementaux.

Connaissances préalables recommandées Ecologie générale

Contenu de la matière : -Généralités sur l'éco-éthologie- Les principaux types d'étude de comportement- L'effet des facteurs du milieu sur le comportement - Les techniques d'étude du comportement- Des exemples sur l'étude de comportement. - L'utilisation du comportement dans la gestion des zones humides.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 92

1. Fustec E. et Leufevre J-C. (2000). Fonctionnement et valeurs des zones humides. Edition Dunod. 463p.2. PointJ-P. (1998). La valeur économique des Hydrosystèmes. Edition Economica. 211p.3. Perillo GME (1995). Geomorphology and sedimentology of estuaries. Edition Elsevier. 471p.4. Gopal B., Turner R.E., Wetzel RG et Whigham D.F. (1982). Wetlands: Ecology and management Edition TEC & DOC. 243p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Génétique des populationsCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement La génétique des populations fait appel aux notions fondamentales d’équilibre des

milieux en insistant sur les fréquences des caractères de cycle biologique à un autre, de même, mention spéciale sera faite sur l’érosion génétique et les remontées biologiques.Connaissances préalables recommandées

Génétique générale et écologie générale.Contenu de la matière : -La population : définition, constitution, structure et propriétés.-La variabilité génétique et les facteurs de son maintien (notion de variation, les polymorphismes, les flux génétiques et les phénomènes migratoires)-Equilibre des populations (loi de Hardy-Weiberg, dynamique des populations, croissance des populations, sélection et mutations)-Evolution et spéciation (notion de micro et de macro évolution, isolement et spéciation, concept actuels de l’évolution et propriétés biologiques de l’espèce)-Bases démographiques des populations (répartition spatiale, survie, influence des facteurs sur les populations, régulation des populations, stabilisation des communautés et stratégies adaptatives).

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Serre J.L. et Perilleux E. (2006). Génétique des populations. Edition Dunod. 261p.2. Claude D. (2001). Biologie des populations animales et végétales. Edition Dunod. 218p.3. Stansfeild D. (1999). Génétique : cours et problèmes. Edition Schaum. 346p.4. Lodé T. (1998). Cours de génétique des populations. Edition Ellipses. 228p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 93

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : FondamentaleIntitulé de la matière : Biodiversité, changements globaux et développement durableCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignementAcquérir des connaissances sur la Biodiversité, les changements globaux et le développement durableConnaissances préalables recommandées Connaissances de base en écologie généraleContenu de la matière : - La diversité biologique : un état des lieux

a- La classification d’un vivant et ses principes (niveaux d’organisation du monde vivant, les hiérarchies taxinomiques, la notion d’espèces et écosystèmes).

b- L’inventaire des espècesc- la systématique, l’information et internetd- Mesurer la diversité biologiquee- La distribution géographique de la biodiversité

- Dynamique de la diversité biologique et conséquences des activités humainesa- L’homme et l’érosion de la diversité biologiqueb- Dynamique de la diversité biologique et pressions anthropiquesc- Changement climatique

- La conservation de la biodiversité et développement durable a- Pourquoi protéger la diversité biologiqueb- Approche de la conservationc- Les aires protégéesd- Une utilisation durable de la biodiversitée- La conservation ex situf- La biologie de la conservationg- Les conventions internationalesh- Mesures concernant la conservation des espèces et les milieux naturels

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposéMode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc). - ACOT P. (1994) :Histoire de l’Ecologie. Que sais-je ? 128p. PUF. Paris - BARBAULT R. (1981) : Ecologie des populations et des peuplements. Ed : Masson. Paris. 200p. - BARBAULT R. (1997) :Ecologie générale, 4 ième édition, Structure et fonctionnement de la biosphère, Ed : Masson. Paris. - BARBAULT R. (2000) :Ecologie générale. Structure et fonctionnement de la biosphère

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 94

(5ème édition). Ed : Dunod. Paris. 326p.

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : MéthodologiqueIntitulé de la matière : Cartographie de la végétation Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement A l’issue de cet enseignement, l’étudiant doit maîtriser les différentes techniques de

cartographie de la végétation et les grandes formations végétales de l’Algérie.

Connaissances préalables recommandées Ecologie générale, botanique, biologie végétale.

Contenu de la matière : 

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Ozenda P. (2000). Les végétaux, organisation et diversité biologique. Edition Masson. 347p.2. Long G. (1974). Diagnostic phytoécologique et aménagement du territoire. Edition Dunod.

Tome 1 : Principes généraux et méthodes. 241p.Tome 2 : Application du diagnostic phytoécologique. 261p.

3. Gounot M. (1969). Méthodes d’étude quantitatives de la végétation. Edition Masson. 407p.4. Guinochet M. (1973). Phytosociologie. Edition Masson. 337p.5. Lacoste A. et salanour P. (1999). Elément de biogéographie. Edition Colin. 176p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 95

-Méthodes d’étude de la végétation (inventaire et échantillonnage)-Principales formations végétales de l’Algérie (foret, steppe, Sahara…).-Cartographie de la végétation des écosystèmes aquatiques

-Ecosystèmes lotiques-Ecosystèmes lentiques

-Cartographie de l’environnement-Cartographie thématique et écologique-Traitement et étude des images satellites

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : MéthodologiqueIntitulé de la matière : Système d’information géographique (SIG) Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement: Acquisition de connaissances sur les avancées récentes dans le domaine de

l’informatique et notamment le développement des techniques satellitaires, et initiation aux connaissances théoriques de base sur le traitement et l'analyse des images satellitaires.

Connaissances préalables recommandées : Notions de base en informatique.

Contenu de la matière :

- Introduction (définition, objectifs, utilisations, apports) - Les spécificités de l’information spatiale - Généralités sur la géomatique (définition et concepts, aperçu sur l’utilisation des graphes en SIG) - Aspects techniques et architecture des SIG - Applications (gestion et conservation des écosystèmes, faune, flore…) Mode d’évaluation : Contrôle continu + examen

Autres : Travail personnel ; exposé

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).1- BEGUIN M. & PUMAIN D. (2003) : La représentation des données géographiques- Statistique et cartographie. 2èmeédition. Ed : Armand Colin. 192p. 2- BORDIN P. (2002) : SIG concepts, outils et données. 1èreédition. Ed : HermèsLavoisier. 260p. 3- DENEGRE J. & SALGE F. (2004) : Les systèmes d’information géographiques. 2Eme édition. Presses universitaires de France (PUF). 128p. 4- GIRARD M.C. (2004) : Traitement des données de télédétection- Série environnement et sécurité. 1èreédition. Ed : Dunod. 530p. 5- LAARIBI A. (2000) :SIG et analyse multicritère. 1ère édition. Editions Hermès-Lavoisier. 192p. 6- LIER P., VALORGE C. & BRIOTTET X. (2008) : Imagerie spatiale- Des principes d’acquisition au traitement des images optiques pour l’observation de la terre. 1ère édition. Ed : Cépaduès. 492p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 96

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S3Intitulé de l’UE : DécouverteIntitulé de la matière : Plans de gestion des zones humidesCrédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement A travers ce module l’étudiant sera capable d’élabore un plan de gestion adéquate

à chaque type de zone humide en basant sur les données différentes par le biais des techniques actuelles. Connaissances préalables recommandées

Ecologie générale, biologie végétale, biologie animale, ornithologie

Contenu de la matière :- Introduction- Les techniques de facilitation- La gestion des zones humides : écologiques, économiques et sociales perspectives - Les processus multipartie- Plan de gestion des zones humides- Collecte et analyse des données.- L’utilisation des techniques pour l’analyse multipartie- L’analyse des problèmes- Conflits de gestion- Stratégies et scénarios

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc). 1. Boumezbeur A. (2001). Atlas des zones humides algériennes. Edition DGF. 78p.2. WCMC. (1992). Global biodiversity. Status of the earth’s living resources. A contribution to the global biodiversity strategy. Edition Goombridge, London 127p.3. www.Wageningen.CD.nl

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 97

Domaine : SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE

Filière : SCIENCES BIOLOGIQUES

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 98

1- Semestre 1 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Autres** Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP* Continu Examen

UEF fondamentales 1 9 18

Diversité des écosystèmes méditerranéens

90h 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Fonctionnement des écosystèmes 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%

Lutte contre la désertification 45 h 1h30 - - 55h00 2 4 40% 60%

UE méthodologie 1 5 8Analyse des données et modélisation

60h 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

SIG et télédétection 45 h 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%

UE découverte 1 1 2

Bioclimatologie 45 h 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%

UE transversales 1Techniques de communication 22h30 1h30 - - 02h30 1 1 - 100%

Total Semestre 1 375h 375h 16 30

* ou sortie pédagogique** Travail personnel

2- Semestre 2 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Autres** Coeff Crédits Mode d'évaluation14-16 sem C TD TP* Continu Examen

UE fondamentales 2 9 18

Caractérisation écolo-gique et pastorale des zones arides 

90h00 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Suivi de la désertification 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%Dynamique passée et actuelle de la végétation

45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40%60%

UE méthodologie 2 5 9

Droit et économie de l’environnement

60h00 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

Gestion des projets 45h00 3h - - 55h00 2 4 40% 60%

UE Découverte 2 1 2

Hydrologie des zones arides et utilisation des ressources en eau 

45h00 1h30 1h30 -05h00

1 2 40% 60%

UE transversales 2 1 1

Initiation à la création d’entreprise

22h30 1h30 - - 02h30 1 1 - 100%

Total Semestre 2 375h 375h 16 30

* ou sortie pédagogique** Travail personnel

3- Semestre 3 :Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 100

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Autres** Coeff Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem C TD TP* Continu ExamenUE fondamentales 3 10 20

Ressources phytogénétiques et faunistiques. Conservation de la biodiversité 

90h 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Agrosystèmes et la conser-vation des connaissances traditionnelles 

67h30 3h 1h30 - 82h30 4 8 40% 60%

Aménagements steppiques 45h00 1h30 1h30 - 55h00 2 4 40% 60%UE méthodologie 3 4 7

Normalisation et Certification 67h30 1h30 - 1h30 65h00 2 4 40% 60%Méthodologie de la recherche et rédaction

45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 3 40% 60%

UE découverte 3 1 2

Biogéographie 45h00 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%

UE transversales 3 1 1

Entreprenariat et étude d'impact

22h30 1h30 - - 02h30 1 1 100 %

Total Semestre 3 375h 375h 16 30

* ou sortie pédagogique** Travail personnel

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 101

4- Semestre 4 :

Domaine  : Science de la nature et de la vieFilière : Sciences Biologiques

Spécialité : Écologie des zones arides

Travail personnel et séminaire : Projet de fin d'étude ou stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coeff CréditsMémoire* 200 09 16Stage en entreprise** 60 05 8Séminaires*** 20 3 6Total Semestre 4 280 17 30

VHS Coeff Crédits* Travail Personnel considére comme unité d’enseignement fondamentale**Stage en entreprise** considére comme unité d’enseignement méthodologie.***Séminaire considère comme unité d’enseignement découverte.

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 337h30 157h30 67h30 67h30 630h00TD 157h30 30h00 67h30 - 255hTP 90h00 112h30 - - 202h30Travail personnel 742h30 360h00 15h00 7h30 1125hMémoire 200h00 - - - 200hStage en entreprise** - 60h00 - - 60

Séminaires*** - - 20h00 - 20Total 1527h30 720h 170h00 75h00 2492h30Crédits 72 33 12 3 120% en crédits pour chaque UE 60% 27.5% 10% 2.5% 100%

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UEF 1Matière: Diversité des écosystèmes méditerranéens Crédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur la diversité et la dynamique du monde méditerranéenConnaissances préalables recommandées Connaissances de base en écologie générale

Contenu de la matière : IntroductionNotion de méditerranéite et limite de la région méditerranéenneCaractères des écosystèmes méditerranéensDiversité du milieu physiqueDiversité physionomique et paysagèreDiversité floristique et faunistiqueDiversité génétiqueSituation dynamique des écosystèmes méditerranéensAspects conceptuelsFacteurs déterminantsPrincipaux modèles dynamiques Impact des perturbations sur les écosystèmes méditerranéens

Mode d’évaluation :  contrôle continu, EMD, Exposés

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Les écosystèmes - Ecologie générale structure et fonctionnement de la biosphère - Ecosystèmes structure, fonctionnement évolution - Eléments d'écologie écologie fondamentale 3édition - Eléments d'écologie écologie appliquée 6édition - Gestion des problèmes environnementaux dans les industries - Ecosystèmes structure fonctionnement - Précis d'écologie - Ecologie de l'écosystème à la biosphèrehttp://www.biodiversite2007.org/article.php3?id_article=167http://www.ecoresponsabilite.environnement.gouv.fr/article.php3?id_article=69http://economiepublique.revues.org/document1703.htmlhttp://vertigo.revues.org/index.html http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosbiodiv/index.php?pid=videotheque&noeud=7http://www.canal-u.fr/themes/environnement_et_developpement_durable/003_ecosystemes_et_biodiversite/la_diversite_biologique_comme_objet_social_et_objet_legal

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UEF 1Matière: Fonctionnement des écosystèmes Crédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement :

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 103

Compréhension des processus fonctionnels relatifs au transfert d’énergie et circulation de matière au sein des systèmes biologiques. Evaluation, bilan et diagnostic des perturbations.Connaissances préalables recommandées Connaissances de base en écologie générale

Contenu de la matière : Introduction : Généralités sur le fonctionnement des écosystèmes :Flux d’énergieAspects thermodynamiquesNotions générales, définitions des paramètres quantitatifs, méthodes de mesure en milieu forestier et herbacé.Transfert d’énergie le long d’une chaîne trophiqueNotion de bilan et de rendements énergétiques Autre analyse des circuits trophiques : circulation de l’énergie en classes de tailleCycle de la matièreCirculation de la matière à l’échelle de la biosphère Les grands types de cycles biogéochimiques et leur perturbationCirculation des éléments à l’échelle des écosystèmes ; Cas des écosystèmes forestiers  et des écosystèmes steppiques : définitions des paramètres du cycle, méthodes d’évaluation, facteurs de variations, bilanCycle de l’eau: Circulation de la matière organique Cycle des éléments biogènes  Phénologie : Définition, Méthodes Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes

Mode d’évaluation : Contrôle continu, EMD, ExposésRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Ecosystèmes structure, fonctionnement évolution - Eléments d'écologie fondamentale 3édition - Eléments d'écologie appliquée 6édition - Gestion des problèmes environnementaux dans les industries - Ecosystèmes structure fonctionnement - Précis d'écologie - Ecologie de l'écosystème à la biosphère - http://www.maxicours.com/se/fiche/8/2/380682.htmlhttp://uved.univ-nantes.fr/sequence2/html/chap1_part1_1.htmlhttp://www.sfecologie.org/regards/2010/10/08/regards-3-mouquet/

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UEF 1Matière: Lutte contre la désertificationCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement :

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 104

L’étudiant aura appris quels sont les moyens…de lutte utilisés. Il pourra à l’avenir contribuer à la recherche de moyens de lutte efficients contre la dégradation des systèmes écologiques.Connaissances préalables recommandées Connaissances de base en écologie générale

Contenu de la matière : I - Notions de restauration et de réhabilitation des écosystèmes dégradés Définition des différents concepts Résistance et résilience

II - Les actions de lutte contre la désertification La gestion rationnelle des ressources  Les mises en défens.Les techniques de réhabilitation artificielle La stabilisation des dunes Les techniques de lutte contre l’érosion hydrique Amélioration des sols Conservation in situ et ex situ de la biodiversité

III - Approche participative pour un développement durable des régions arides et sahariennes IV - Evaluation et impacts des méthodes de LCD appliquées en Algérie

Mode d’évaluation : Contrôle continu, EMD, Exposés

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Ecosystèmes, structure, fonctionnement évolution - Eléments d’écologie - Eléments d’écologie - Eléments de biogéographie et d’écologie - Biodiversité, Dynamique biologique et conservation - Elément d’écologie, Ecologie fondamentalewww.gtdesertification.org/ressourcotheque/files/plaidoyer-lg.pdf www.suds-en-ligne.ird.fr/desertif/lutte/lutte.html www.ma.auf.org/erosion/chapitre1/VI.Lutte.htmlwww.crdg.be/site/images/stories/crdg/publications/fiche-eriosion.pdfhttps://www.u-picardie.fr/beauchamp/mst/Erosion_sol/Erosion-sol.htmwww.giser.be/wp-content/uploads/.../guide-lutte_erosion_parc_opale.pdfwww.giser.be/wp-content/uploads/2011/10/LivretAgriculture_n12.pdfwww.fao.org/docrep/t1765f/t1765f0w.htm

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UEM 1Matière: Analyse des données et modélisationCrédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement :

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 105

Apprendre les méthodes mathématiques utiles à l’interprétation et l’expression statistique d'un résultat expérimental et à son éventuelle modélisation. Connaissances préalables recommandées Notions de base en biostatistiques

Contenu de la matière : I Statistique paramétrique 1. Généralités.2. Statistique descriptive univariée3. Statistique descriptive bivariée4. Statistique inférentielle 5. Régression et corrélations II Statistique non paramétrique Rappels des différents tests statistiques Test de Kolmogorov Smirnov Test de Mann Test de Cox stuart III Analyse des données Rappels sur L’ACP, AFC, CHAAnalyse canonique Les nuées dynamiques La classification neuronale IV ModélisationConcepts fondamentaux ; ajustements, équations différentielles et analyse par objets, vérification et validation Les modèles classiques : Analyse de Markov et Modèles déterministes Modèles de simulation : vérification et validation

Mode d’évaluation : EMD, TD

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). www.xm1math.net/seconde/seconde_chap9_cours.pdfwww.ulb.ac.be/soco/...s.../Exercices%20stat-s-102%20(2012-2013).pdfwww.math.univ-toulouse.fr/~san/PY0106X_stat_exercices.pdfwww.itse.be/statistique2010/co/questionf_median_serie_02.htmlwww.math.univ-angers.fr/~loustau/larochelle.pdfhttps://www.ceremade.dauphine.fr/~xian/Noise/CChap4.pdfhttp://pbil.univ-lyon1.fr/R/enseignement.htmlhttp://www.studyrama.com/article.php3?id_article=841http://www.pifo.uvsq.fr/pedagogie/bime/biostat.htmhttp://www.kb.u-psud.fr/etudes-doctorales-et-masters/cours/Biostat/Biostat.htmhttp://www.biostat.envt.fr/spip/Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UEM 1Matière: SIG et télédétectionCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement :

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 106

Le SIG facilite la manipulation d’une grande masse d’informations géo référenciées et la télédétection, grâce à la répétitivité des scènes, à la bonne résolution spectrale et à la moyenne résolution spatiale et par la nature numérique des données (image numérique), permet la représentation cartographique par la classification des images.Connaissances préalables recommandées Notions d’analyse de données et de cartographie

Contenu de la matière : Chapitre I 1 Concepts et notions. 2 Les composants des SIG. 3 Les trois dimensions outil - information - organisation.4 LE SIG comme projet. LE SIG comme outil d'aide à la décision. 5 LE SIG et la modélisation de la réalité.

Chapitre II traitement et analyse des données 1 Consulter des données2 Traitement des données 3 Requêtes SQL 4 Analyse spatiale 5 Représentation des données 6 Importer/exporter des données

Mode d’évaluation : EMD, TD, réalisation de bases de données et de cartes

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Télédétection et systèmes d'information urbaine - Traitement des données de télédétection - Traitement des données de télédétection : Environnement et ressources naturelles www.ensg.eu/IMG/pdf/bibliographie_ref_teledetection.pdfwww.grss-ieee.org/wp-content/.../07/FR_TUTORIAL_COMPLETO.pdfwww.geographie.ens.fr/IMG/file/.../Teledetection/CTeledetection.pdfhttp : //www.ecologie.gouv.frIMGnatura2000habitatspdftome19320.pdfhttp://pagespro-orange.fralisecomreunion_xyz.pdfhttp://www.institutduliege.comdoc_telechargemanuel_interpretation_habitats_UE_forets.pdf - http://books.google.fr/ http://www.enge.ucl.ac.becartes-RDCOccupation_du_solNotice_occupation_du_sol.phttp://www.erudit.org/revue/cgq/1989/v33/n88/022007ar.pdfhttp://www.erudit.org/documentation/eruditPolitiqueUtilisation.pdfhttp://www.lavilaine.com/telechargement/4_guide.pdfIntitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UED 1Matière: BioclimatologieCrédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement : Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 107

Cet enseignement fournit à l'étudiant une vision synthétique de la diversité écologique et met l'accent sur l'étude des processus et leur dynamique propre, les interactions entre les composants de l'écosystème et les facteurs abiotiques contrôlant ces interactions.Connaissances préalables recommandées Notions en Biostatistiques, informatique et mathématiques.

Contenu de la matière : 1. Les données climatologiques Sources de données, exploitation des données, leurs applications, images satellites (Météosat).2 . Mécanismes de la circulation générale des systèmes de vents : Alizés, vent d'Ouest, vents polaires.3. Classification climatique physique - Basée sur la température - Basée sur la température et la pluviosité4. L'Aridité - Les différents indices d'aridité- Les régions arides dans le Monde, en Afrique, au Maghreb5. Hydrologie- Problèmes spécifiques aux forêts, aux steppes et au Sahara6. Les bilans hydriques (Evapotranspiration réelle ; Evapotranspiration potentielle ; 7. Méthodes de caractérisation du climat méditerranéen 8. Utilisation des synthèses bioclimatiques à des problèmes d'écologie appliquée.

Mode d’évaluation : EMD, TDRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Climatologie générale tome 1+2 - Climatic geomorphology - Climatologie de l'environnement cours et exercices corrigés - Climatologie et hydrologie - Eléments de paléoclimatologie - Climatologie, méthodes & pratiquehttp://www.apprendre-tous-cours.com/meteorologie-c-224.htmlhttp://www.univ-provence.fr/gsite/document.php?pagendx=2649&project=geographiehttp://www.oodoc.com/21982-climatologie-cours.phphttp://www.weborama.fr/societe-media-meteo/Climatologie.shtmlhttp://la.climatologie.free.fr/http://www.notre-planete.info/geographie/climatologie_meteo/changement_0.phphttp://fr.wikipedia.org/wiki/Bioclimatologiehttp://dictionnaire.sensagent.com/bioclimatologie/fr-fr/http://www.inra.fr/toute_l_actu/vient_de_paraitre/bioclimatologie_concepts_et_applications

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 1UET 1Matière: Techniques de communication Crédits :1Coefficients : 1

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 108

Objectifs de l’enseignementCette matière présente les connaissances sur la langue de la science et de la communication scientifique. Elle permet le développement de projets encadrés sur la thématique de la formation de master proposé et renseigne sur la vulgarisation des sujets de mémoire ou de la thématique générale des travaux de recherche.

Connaissances préalables recommandées Avoir des connaissances de base en informatique et techniques de méthodologie.

Contenu de la matière :

- Communication scientifique : perfectionnement à la conception de diaporamas et de posters avec le logiciel Power Point.

- Projet encadré sur un sujet d'actualité, avec recherche bibliographique, rédaction d'un rapport et présentation orale.

Mode d’évaluation : Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites

modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1. CARON, R. (1994). Bibliographic records with French Headings . Library Cataloging and Authorities Group. 2. CARON, R. (1994).«Comment citer un document électronique?», In Université Laval, Bibliothèque, Site de la Bibliothèque de l'Université Laval, [En ligne]. http://www.bibl.ulaval.ca/doelec/citedoce.html 3. MORNIN E. (1998). RE: validité des informations issues du web. 4. PELGRIMS, G. (2003). Références bibliographiques. Guide pour les travaux universitaires en Sciences de l’éducation. (Cahiers de la Section des sciences de l’éducation, Hors série). Genève : Université de Genève.

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UEF 2Matière: Caractérisation écologique et pastorale des zones arides Crédits : 8Coefficients : 4

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 109

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur l’écologie des zones arides et sahariennes, l’adaptation des plantes au milieu aride, l’évaluation de la production, la productivité, la biomasse, la minéralomasse des écosystèmes et savoir établir une carte pastorale Connaissances préalables recommandées Notions d’écologie du cycle SNV

Contenu de la matière : I. CARACTERES GENERAUX1. Présentation er répartition des zones arides et semi arides dans le monde et en Algérie2. Aridité climatique et aridité édaphique - 3. Caractères biotiques et adaptations : Composante végétale, structure et stratégie adaptatives, composante animale 4. Caractères bromatologiques des espèces : Valeur énergétique, appétabilité, indice spécifique de qualité, - ApplicationsII. LES RESSOURCES PASTORALES VEGETALES1. Techniques d'évaluation pastorale des parcours 2. Les ressources pastorales en Algérie steppique III. LES RESSOURCES ANIMALES ET MILIEU HUMAIN1. Ressources animales (ovins et caprins) - 2. Le milieu humain (socio-économie) IV. ZOOTECHNIE1. Environnement naturel du cheptel ovin : origine domestication et introduction du mouton2. Caractéristiques zootechniques de l'élevage ovin3. Notions sur les particularités de la physiologie de la digestion chez les ovins et besoins alimentaires - 4. Etude du comportement alimentaire chez les ovins5. Analyse globale des systèmes d'élevage et systèmes de production6. Les systèmes de conduite alimentaire

Mode d’évaluation : 75% examen+25% Control continuRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Encyclopédie agricole. Zootechnie : moutons - Traité de Zootechnie, tome IV Les ovins- Traité de zootechnie, tome V ; Zoologie et Zootechnie spéciales  - Le pastoralisme, richesse cachée des zones arides ? - L'élevage du mouton dans l'est algérien - L'élevage des Moutons - La production du mouton - Manipulations et interventions en élevage ovin et caprin - https://vertigo.revues.org/5375www.fao.org/docrep/014/i1861f/i1861f10.pdfwww.afpf-asso.org/download.php?type=1&id=533&statut=0www.cndp.fr/crdp-rouen/images/.../conf_afr_diapo_desertification.ppthttps://www.cairn.info/revue-afrique-contemporaine-2006-3-page-103.htmhttps://www.cairn.info/revue-afrique-contemporaine-2006-3-page-103.htmhttps://www.unesdoc.unesco.org/images/0014/001413/141315FO.pdf http://books.openedition.org/irdeditions/1146?lang=fr www.inra.org.ma/publications%5Couvrages%5Celevagemouton.pdfIntitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UEF 2Matière: Suivi de la désertificationCrédits : 6Coefficients : 3

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 110

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur les causes et les processus de désertification.Connaissances préalables recommandées Notions d’écologie du cycle SNV, Connaissance du milieu écologique et humain. Compréhension du fonctionnement de ces écosystèmes

Contenu de la matière : I Notions de désertificationConcepts de désertification  Sensibilité à la désertification et indices de vulnérabilité

II Les Causes et les processus de dégradation La sécheresseLes exploitations abusives et les ressources naturellesLes mutations sociales

III Le dispositif de surveillance de la désertification Les objectifs du dispositif de surveillanceLes mécanismes de surveillance

IV Les indicateurs de la désertification Les indicateurs d’état et les indicateurs d’impactFiabilité des indicateurs

Mode d’évaluation : 75% examen+25% Control continuRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Desertification et aménagement au maghreb - L'Aurès: Un milieu en dégradation et vulnérable à la désertification - https://vertigo.revues.org/6782www.oss-online.org/cd_envi/doc/07/03/06.pdfwww.ebanque-pdf.com/fr_la-desertification-en-algerie.htmlwww.oss-online.org/cd_envi/doc/01/07.pdfwww.sifee.org/static/uploaded/Files/.../C_Dorsouma_etal_comm.pdfhttps://vertigo.revues.org/5375www.iamm.fr/ress_doc/opac_css/doc_num.php?explnum_id=7638www.suds-en-ligne.ird.fr/desertif/desert.pdfhttps://books.google.fr/books?isbn=2709916967www.iamm.fr/ress_doc/opac_css/doc_num.php?explnum_id=5522www.academie-agriculture.fr/system/files.../20040512resume3.pdf?...1www.preventionweb.net/files/resolutions/G0064137.pdfwwwv1.agora21.org/desertification/maroc-meo.pdfIntitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UEF 2Matière: Dynamique passée et actuelle de la végétationCrédits : 4Coefficients : 2

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 111

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur les principaux types de répartition des espèces et les causes de la répartition des biocénoses Connaissances préalables recommandées Notions d’écologie du cycle SNV

Contenu de la matière : I- Les caractéristiques de la répartition géographique des espèces Principaux types de répartitionRépartitions cosmopolitesAires disjointesRépartitions régionalesRépartitions EndémiquesRépartitions vicariantesII - Les causes de la répartition géographique actuelle des biocœnoses Rôle des facteurs paléogéographiquesLa tectonique des plaquesChangements climatiques et genèse des peuplementsIII- Les grandes aires de répartition géographique Les grands biomes terrestres Les écosystèmes aquatiques continentauxIV - La répartition géographiques des zones arides et semi arides en Algérie

Mode d’évaluation : 75% examen+25% Control continuRéférences   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Ecosystèmes, structure, fonctionnement évolution - Eléments de paléoclimatologie - Ecologie générale structure et fonctionnement de la biosphère - Eléments de biogéographie et d’écologie - Ecologie de l'écosystème à la biosphére - Précis d’écologie végétale - Biodiversité, Dynamique biologique et conservation - Elément d’écologie, Ecologie fondamentalehttps://www.erudit.org/revue/vertigo/2013/v13/n2/1026441ar.pdf https://books.google.fr/books?isbn=8495555247www.imep-cnrs.com/Talon/scientif.htmwww.parc-camargue.fr/...php/.../cadre_physique_geographique.pdfwww.lsce.ipsl.fr/Phocea/Vie_des_labos/Ast/ast_groupe.php?id...19www.cen-savoie.org/sites/.../Offre-stage_CEN73_2015-hydro_pedo.pdfwww.ecosociosystemes.fr/dynamique.htmlwww.ecotrop.com/ECOTROP/Paleoecologie.htmlwww.wsl.ch/dienstleistungen/inventare/snp-plots/index_FRwww.imbe.fr/docrestreint.api/153/.../pdf/pons_histoire_imep.pdfwww.vanoise-parcnational.fr/.../292-impact-des-feux-sur-la-richesse-et-l...

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UEM 2Matière: Droit et économie de l’environnementCrédits : 5

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 112

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : Fournir à des personnes non ou peu initiées à l’économie de l’environnement les éléments de base leur permettant d’une part d’analyser sur le plan économique les problèmes qui se posent en matière d’environnement, d’autre de part de dialoguer efficacement avec des spécialistes de la question. Connaitre la législation et réglementations relatives à la conservation et à la protection de la nature et de l’environnementConnaissances préalables recommandées Notions du Biotaststiques du cycle SNV

Contenu de la matière : I- Economie de l’environnement - Les bases de l’économie de l’environnement- Les techniques d’évaluation des biens et services environnementaux- L’analyse économique des instruments des politiques d’environnement - Quelques développements récents en économie de l’environnement

II Droit de l’environnement Aperçu sur la législation et réglementation relatives à la conservation et la protection de la nature et de l’environnement- Les Conventions- Les Protocoles - L’Accord sur les aspects de Droit de Propriétés Intellectuelles en relation avec le Commerce (ADPIC)- Les principes du droit de l’environnement : précaution, participation, information….- Les installations classées pour la protection de l’environnement.- La prévention des risques naturels. - Les conflits d’usage

Mode d’évaluation :  75% examen+25% Control continu

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Code de l’environnement protection de la nature - Gestion des problèmes environnementaux dans les industries - Elément d’écologie, Ecologie fondamentale - Biodiversité, Dynamique biologique et conservation www.les-sorgues-vertes.com/39+les-grands-principes-du-droit-de-lenvir...www.foad-mooc.auf.org/IMG/pdf/module_5.pdfwww.cours-de-droit.net › Cours de droit de l'environnementhttps://www.usherbrooke.ca/environnement/.../environnement/.../Boyer_...https://www.usherbrooke.ca/environnement/.../environnement/.../Massico...https://encyclopediecc.files.wordpress.com/.../fiche-technique-par-ariette-...www.environnement.gov.tn/fileadmin/medias/pdfs/projet.../1_2.pdfwww.developpement-durable.gouv.fr/-Risques-naturels-et-technologique...www.loire-atlantique.gouv.fr/.../Risques-naturels-et-technologiques/...ris...

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UEM 2Matière: Gestion des projets Crédits : 4

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 113

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Placer l’étudiant en situation et de lui faire acquérir les notions méthodologiques indispensables à la réalisation d’un projet de recherche, en particulier en matière de recherche bibliographique et d’analyse critique d’un article scientifique. Faire acquérir aux étudiants les compétences multiples permettant d'appréhender la complexité des projets ; assimiler les concepts et modèles de management de projet ; maîtriser les outils et méthodes permettant de bien concevoir et mettre en œuvre un projet de recherche: acteurs du projet, les sources de financement, l'organisation de la recherche, les procéduresConnaissances préalables recommandées Esprit d’initiative et de synthèse

Contenu de la matière : 

I EVALUATION ECONOMIQUE ET FINANCIERE D’UN PROJET– Les étapes de l’étude de facteurs économiques– Analyse des dépenses et des recettes d’un projet (flux prévisionnel)– Critères de rentabilitéII RENTABILITE ECONOMIQUE ET FINANCIERE– Rentabilité économique d’un projet– Rentabilité financière d’un projetIII LES EFFETS ATTENDUS D’UN PROJET– Effets attendus au niveau de l’emploi– Effets attendus sur la balance des paiements– Effets attendus sur la croissance– Effets attendus sur l’environnement

Mode d’évaluation :  75% examen+25% Control continu

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Gestion des problèmes environnementaux dans les industries - Aide-mémoire Gestion des déchets - Conception des projets forestiers - www.foad-mooc.auf.org/IMG/pdf/CM-Gestion_de_projet_1.pdfhttps://www.toutapprendre.com/formation/les-grands-principes-d-une-bo...ftp://ftp.dsfc.net/support-gestion-de-projet.pdfwww.reunion.cci.fr/.../Les%20outils%20de%20la%20gestion%20de%20...fabrice.sincere.pagesperso-orange.fr/...projet/cours_planification_projet....www.stratec.be/sites/default/files/files/AGIR94-AC.pdfwww.doc-etudiant.fr › Commerce › Managementwww.observatoiredelafranchise.fr › Dossiers franchisewww.startmystory.fr › ... › Construisez vos prévisions financières

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UED 2Matière: Hydrologie des zones arides et utilisation des ressources en eau  Crédits : 2

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 114

Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur l’hydrologie des zones arides, les technique d’irrigation, savoir comment planifier les ressources hydriques et comment éviter l’érosion hydrique. Connaissances préalables recommandées Notions d’écologie et bioclimatologie du cycle SNV

Contenu de la matière : I POTENTIALITES HYDRIQUES : EAUX SUPERFICIELLES ET SOUTERRAINES Méthodes d’évaluation des potentialités Les besoins en eau

II GESTION ET PLANIFICATION DES RESSOURCES EN EAUGestion intégrée des ressources en eauOuvrages hydrauliques pour l’utilisation des ressources

III EROSION HYDRIQUEDégradation hydrogéologique et défense du sol

IV TECHNIQUES D’IRRIGATION ET CAPTAGE DE L’EAU EN ZONES ARIDESNotions générales d’agrométéorologieRéponse des cultures à l’eauGestion de l’irrigation

Mode d’évaluation : 75% examen+25% Control continu

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Elément d’écologie, Ecologie fondamentale - Précis d’écologie végétale - Ecologie des ressources naturelles - Hydrologie et utilisation de la ressource en eau en Algérie - Protection de la distribution d'eau. - Guide de l'alimentation en eaux- Hydrologie urbaine - Hydrologie urbaine t1:captage et traitement - Climatologie et hydrologie - www.riob.org/IMG/pdf/GWP-RIOBManuelDeGIREparBassin.pdfww.un.org/fr/waterforlifedecade/themes/management.shtmlwww.pseau.org/.../2ie_manuel_technique_de_gestion_integree_des_ress...www.puq.ca/.../gestion-integree-des-ressources-eau-afrique-1751.htmlwww.europarl.europa.eu/sides/getDoc.do?pubRef=-//EP//...0...www.fao.org/nr/lada/index.php?option=com_docman...www.developpement-durable.gouv.fr/IMG/pdf/mvmt_terrain.pdfwww.terre-et-eau.univ-avignon.fr/.../plaqu.ens-2013-2017_20141023.p...

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 2UET 2Matière: Initiation à la création d’entrepriseCrédits :1Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 115

Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement - Appréhender les principes de base du processus de création d’entreprise Appréhender les principes de base du processus de création d’entreprise.- Donner les éléments fondamentaux du conseil dans les différentes phases de création d’entreprise.- Les différents types de financement pour une micro entreprise dans le contexte algérien.- Réalisation concrète d’un plan d’affaires et du dossier de financement.

Connaissances préalables recommandées : en économie générale

Chapitre 1: Le lancement du Processus de la création5. Pourquoi créer une entreprise?6. Evaluation des compétences entrepreneuriales ; version 2014-2015 7. Idée d'entreprise ;8. Eléments de base pour le lancement du processus de création d’entreprise

Chapitre 2: La planification stratégique6. Importance de la planification7. Enoncé de la mission et de la vision8. Définition des objectifs SMART9. SWOT comme une technique de planification stratégique10.Réalisation d'études de marché

Chapitre 3: Le Plan Business4. Qu'est-ce qu'un business plan?5. Pourquoi avons-nous besoin d’élaborer un Business Plan?6. Quels sont les éléments d'un bon Business Plan?

Chapitre 4: Les opérations Commerciales4. Quel est le budget de fonctionnement?5. Comment gérer les coûts des produits et les coûts de fonctionnement?6. Quels sont les coûts de production et comment les gérer?

Chapitre 5: La Stratégie de Marketing de l’Entreprise5. Les bases de la commercialisation d'un produit ou d'un service;6. Exploration de la concurrence et la création d'activités de marketing en

conséquence;7. La stratégie de tarification8. Les prévisions de vente

Chapitre 6: La stratégie de communication de l’Entreprise3. Le Plan de communication4. L’Action de communication

Chapitre 7: Sources et types de financement pour la création d’entreprise5. Avez-vous besoin d'un financement extérieur?6. Quels sont les types de financement?7. Quelles sont les sources de financement dans votre région?8. Structure de soutien en Algérie

Mode d’évaluation : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 116

Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Xavier Lecocq, Benoît Demil, Vanessa Warnier (2006), « Le Business Model, un modèle d’analyse stratégique », L’Expansion Management Review, no 123, hiver.

2. Denis Dauchy, 7 étapes pour un Business Model solide, Dunod 2010.3. Thierry Verstraete, Estèle Jouison-Laffitte, Business Model pour entreprendre, De Boeck

Université, 20094. Thierry Verstraete, Estèle Jouison-Laffitte, « Une théorie conventionnaliste du Business

Model en contexte de création d’entreprise pour comprendre l’impulsion organisationnelle », XenCIFEPME, (Congrès international francophone sur l'entrepreneuriat et la PME), Bordeaux, octobre, 2010

5. Vanessa Warnier, Xavier Lecocq, Benoît Demil (2004), « Le Business Model, l'oublié de la stratégie », Conférence AIMS 2004

6. Bernard Maître, Grégoire Aladjidi, Les Business Models de la nouvelle économie, Dunod 1999

7. Laurence Lehmann-Ortega, Jean Marc Schoettl, Rupture et perturbation : les deux formes de l'innovation stratégique AIMS 2005

8. Estèle Jouison, Délimitation théorique du Business Model AIMS 2005 .

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UEF 3Matière: Ressources phytogénétiques et faunistiques - Conservation de la biodiversité Crédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement Connaître la biodiversité des zones arides et semi arides et les méthodes traditionnelles et modernes de conservation de la biodiversité. Connaissances préalables recommandéesNotions d’écologie du cycle SNV

Contenu de la matière : I - ELEMENTS DE BIODIVERSITEConcept de biodiversitéEvaluation de la biodiversitéEtat de nos connaissances sur biodiversité des zones aridesII- RESSOURCES PHYTOGENETIQUES ET FLORISTIQUESDéfinitionImportance quantitative et qualitativeIntérêtIII- IMPORTANCE DES SAVOIR FAIRE ANCESTRAUX DANS L’UTILISATION DE LA BIODIVERSITEIV- VALORISATION DE LA BIODIVERSITE PAR LES TECHNOLOGIES ET LES BIOTECHNOLOGIES MODERNES

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 117

Mode d’évaluation : Evaluation continue des activités pratiques (25%), Evaluation par examen final (75%)

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Biodiversité dynamique biologique et conservation - Ecologie générale structure et fonctionnement de la biosphère - Elément d’écologie, Ecologie fondamentale - Introduction à l'écologie des écosystèmes naturels à l’écosystème humainhttp://www.fnh.org/francais/fnh/uicn/pdf/smdd_biodiv_conservation.pdfhttp://www.ga.undp.org/publications/environnement/fiche_environnement_Tridom.pdfhttp://www.developpement-durable.gouv.fr/article.php3?id_article=6202http://knowledge.cta.int/fr/Dossiers/CTA-et-S-T/CTA-S-T-programme/Documents-d-orientation/Maitriser-la-biodiversite-pour-un-developpement-durable-Document-d-orientation-ACP-no.-2http://termecologie.free.fr/Coursenligne.htmhttp://www.notre-planete.info/ecologie/http://www.ecologie.gouv.fr/rubrique.php3?id_rubrique=541http://www.ensconet.eu/fr/Biodiversite.htmhttp://bch-cbd.naturalsciences.be/gabon/gabondef/convention/biodivnotion/definitionbiodiv.htmhttp://www.techno-science.net/?onglet=glossaire&definition=1061http://www.biodiversite2007.org/article.php3?id_article=167

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UEF 3Matière: Agrosystèmes et la conservation des connaissances traditionnelles  Crédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement Connaître les différents agroécosystèmes, leur antagonisme avec les systèmes naturels environnants, les mises en valeur actuelles et leurs conséquencesConnaissances préalables recommandéesConnaissance du milieu écologique et humain, le fonctionnement des écosystèmes arides et leur sensibilité à la désertification.

Contenu de la matière : I- DIFFERENTS AGRO-ECOSYSTEMES DES REGIONS ARIDESII- GESTION ET AMENAGEMENT DES AGRO-ECOSYSTEMESIII- SYNERGIES ET ANTAGONISMES ENTRE LES AGROECOSYSTEMES ET LES ECOSYSTEMES ENVIRONNANTSIV- MISES EN VALEUR ACTUELLES ET CONSEQUENCESV- PRODUCTIONS SPONTANEES ET POSSIBILITES D’EXPLOITATION ET DE VALORISATION Mode d’évaluation : Evaluation continue des activités pratiques (25%)Evaluation par examen final (75%)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 118

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Ecosystèmes, Agrosystèmes - Modélisation des agroécosystèmes et aide à la décision - Agro-ressources et écosystèmes - Les matières organiques des sols : rôles agronomiques et environnementaux - Agriculture et biodiversité : valoriser les synergies https://www.supagro.fr/web/irc/pages/?idl=19&page=1632&id_page=3401www.iamm.fr/content/download/7489/50105/.../jouve_oasis_2012.pdfwww.diplomatie.gouv.fr/fr/.../Rapport_complet_2012_dgm_cle81f311.p...www.unep.org/documents.multilingual/default.asp?DocumentID...https://books.google.fr/books?isbn=3642792073https://vertigo.revues.org/8821www.oree.org/_script/ntsp-document-file_download.php?...id...id...www.unesco.org/mab/doc/icc/2009/f_agroecosystems.pdfwww.agroparistech.fr › Formation › Cursus ingénieurwww.agroforesterie.fr/.../Fiche-Biodiversite-CASDAR-agroforesterie-AP...www.rncp.cncp.gouv.fr/grand-public/visualisationFiche?format=fr...www.syrphys.com/pdf/plan-formation-biodiv.pdfIntitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UEF 3Matière: Aménagements steppiquesCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Acquérir des connaissances sur les techniques d'aménagement agro-pastoral et les améliorations pastoralesConnaissances préalables recommandéesNotions d’écologie du cycle SNV

Contenu de la matière : 1. Caractérisation générale- Les ressources phytopastorales- Les données socio-économiques- Le milieu physique2. Travaux d'aménagement et de mise en valeur- Les objectifs agro-pastoraux- Analyse critique des travaux réalisés3. Techniques d'aménagement agro-pastoral- Base de l'aménagement- Gestion des parcours (rotation, parcours différé, mise en défens, notion de charge animale)- Améliorations pastorales (les techniques scarifiages pitting de routage, reboisement, plantations fourragères)4. Les perspectives du développement durable5. Les bases de l'aménagement intégré6. Exposés thématiques

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 119

Mode d’évaluation : Evaluation continue des activités pratiques (25%), Evaluation par examen final (75%)

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Parcours des zones arides et semi-aride - Manuel de sylviculture et améliorations pastorales à l'usage des instituteurs - Impact des activités pastorales sur les écosystèmes arides et semi-arideshttp://www.lrrd.org/lrrd26/11/seno26206.html www.iram-fr.org/documents/gestion_agropasto_redev_05.pdfhttps://www.avsf.org/.../le-schema-d-amenagement-pastoral-un-outil-de-s...www.persee.fr/doc/rga_0035-1121_1965_num_53_4_3231www.oecd.org/fr/csao/.../Volume2_Annexe_Transhumance_Final1.pdfwww.cilss.bf/fersol/IMG/pdf/BonnesPratiques_AgroSylvoPastorales.pdfhttps://vertigo.revues.org/15404www.fao.org/docrep/017/i2601f/i2601f.pdfwww.maison-vie-rurale.com/docactus/plaquette_reservoir_bio_BD.pdfwww.gafspfund.org/.../-%20Agriculture%20sector%20strategy%20-%20...

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UEM 3Matière: Normalisation et CertificationCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Acquérir des connaissances sur les normes intégrant le management de l'environnement, pour permettre à un organisme d'évaluer et de maîtriser de manière continue les impacts de ses activités sur l'environnement de ces zones arides.Connaissances préalables recommandéesConnaissance du milieu écologique et humain, le fonctionnement des écosystèmes arides.

Contenu de la matière : 1. Normalisation La normalisation et les pôles de compétitivité Les normes ISO Avantages de la démarche Critiques de la démarche 2. Certification Qu’est-ce que la certification ? L’utilité d’une norme Pour quelle certification opter ? 3. Management environnemental Mise en place d’un système de management environnemental Le manuel environnement Évaluation des performances environnementales des PME

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 120

Mode d’évaluation : Evaluation continue des activités pratiques (25%), Evaluation par examen final (75%)

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Management environnemental, Analyses, stratégies, mise en œuvre – Au coeur de l'ISO 14001:2015 - Le système de management environnemental au centre de la stratégie - Pratiquer le management de l'environnement - Les réponses à vos questions !www.environnement-annuaire.net/management-environnemental.../livres... www.cmatic.info/accueil/normalisation-et-certification/www.novoferm.fr/.../difference-entre-normes-marquage-et-certifications....https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00011413/documentwww.fao.org/docrep/007/y5136f/y5136f07.htmwww.afnor.org/www.fromag.com/pratique/certific.htmlwww.iso.org/iso/fr/home/standards/certification.htmwww.entreprises.gouv.fr/politique-et-enjeux/normalisation-qualitewww.telecharger-magazine.net/.../11804-au-cur-de-liso-140012015-le-s...

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UEM 3Matière: Méthodologie de la recherche et rédactionCrédits : 3Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement Acquérir des connaissances sur les techniques et les principes conventionnels de la recherche scientifique (recherche de l’information, son traitement, les conventions d’écriture du texte scientifique, etc.).Connaissances préalables recommandéesPas de prérequis particuliers.

Contenu de la matière : I : Recherche de l’information scientifique (livresque, électronique)II : Référencement de l’informationIII : Conventions de rédaction du texte scientifiqueIV : Conventions de référencement bibliographiqueV : Conventions typographiques

Mode d’évaluation : Evaluation par examen final (100%)

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Manuel de méthodologie et de rédaction bibliographique - Guide du jeune chercheur en lettres, langues, sciences humaines et sociales - https://www.expertmemoire.com/.../methodologie-redaction-memoire/www.nachez.info/aide/methodomemoire0405.pdfwww.univ-ag.fr/modules/resources/download/.../Guidememoire.pdf

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 121

www.carede.org/.../NOTES_METHODOLOGIQUES_DE_REDACTION...www.baptiste.meles.free.fr/site/B.Meles-Memoire_Master.pdfwww.doc-etudiant.fr › Méthodologie › Mémoirewww.madmoizelle.com › Vis ta vie › Moi, moi et moihttp://www.bibl.ulaval.ca/aide-a-la-recherche/documents-d-aide-a-la-redaction/methodologie-de-la-recherchewww.lcf-reunion.fr/guide-methodologique-sic/Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semstre : 3UED 3Matière: BiogéographieCrédits : 2Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement Acquérir des connaissances sur la répartition des organismes à la surface du globe et des zones arides et semi arides et la mise en évidence des causes qui régissent cette répartition en général et en particulier en Algérie.Connaissances préalables recommandéesBiocénotique, climatologie, pédologie, taxonomie végétale, taxonomie animale

Contenu de la matière : I : Eléments de biogéographieAperçu historique de la biogéographie Biogéographie écologique Eléments de géodynamique Etude des aires (délimitation, type d’aires, aires de différents rangs taxonomiques)Territoires et cortèges floristiques (notions, cortèges, richesse floristique, divisions floristiques du monde, régions, domaines et secteurs) Variations chronologique des aires II : ZoogéographieLes aires de distribution géographiques Les empires faunistiques et leurs distributions Les causes de distribution actuelle des êtres vivants Les faunes insulaires

Mode d’évaluation : Evaluation par examen final (100%)

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Eléments de biogéographie et d écologie - Eléments d’écologie - Elément d’écologie, Ecologie fondamentalewww.upmc.fr › ... › Les origines. Histoire de la Terrewww.universalis.fr/encyclopedie/biogeographie/max2.ese.u-psud.fr/epc/conservation/EE/pdf/BioGeo_30102010.pdfwww.cnrtl.fr/definition/biogéographiewww.cnrtl.fr/definition/zoogéographiehttps://fr.wikipedia.org/wiki/Zoogéographiewww.africamuseum.be/.../doc/zoogeographiei_fbt2014_comprim.pdf

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 122

www.publibook.com/librairie/livre-universitaire.php?isbn...www.notices-pdf.com/cours-de-zoogeographie-pdf.htmlhttps://books.google.fr/books?isbn=2748306147www.ephemeroptera-galactica.com/pubs/pub_s/pubsowar1980p141.pdf

Intitulé du Master : Ecologie des zones arides Semestre : 3UET 3Matière: Entreprenariat et étude d'impact Crédits :1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignementLa mise en lumière d'un instrument de développement qui est le projet tout en montrant les productions qui en découlent d’une part et fourniture aux étudiants le savoir d'établissement d'une étude d'impact tout en ayant la faculté d'évaluer les effets d'une activité quelque soit son origine sur l'environnement d’autre part.

Connaissances préalables recommandéesFacteurs de production, gérer une entreprise, écologie, environnement.

Contenu de la matière : Première partie : Entreprenariat i : Définition d‘un projet d’investissement ii : Le cycle du projet iii : Evaluation économique et financière d’un projet iv : Rentabilité économique et financière v : Les effets attendus d’un projet

Deuxième partie : Etudes d’impact i.  Législation, politiques et dispositifs institutionnels ii. Étude préalable iii. Analyse d’impact et prise de décision iv. Mise en œuvre et suivi v. Gestion du projet vi. Évaluation de l’impact social et environnemental

b. Travaux dirigésEtude de cas d’un projet d’investissement et élaborer une étude d’impact

Mode d’évaluation :  Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités. L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à l’importance des valeurs horaires dispensées.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 123

Références-Gestion des problèmes environnementaux dans les industries.-Guide du naturaliste technique d'observation et d'étude.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 124

Domaine : Science de la Nature et de la Vie (SNV)

Filière : Biologie

Spécialité : Gestion de l’environnement

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 125

1- Semestre 1 :Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coefficient Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu ExamenUE fondamentales 9 18

Diversité des écosystèmes méditerranéens 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%

Fonctionnement des écosystèmes 90h 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%Cartographie et télédétection 45 h 1h30 - - 55h00 2 4 40% 60%

UE méthodologie 5 9 Analyse et protection de l’environnement 45 h 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%

Analyse des données et modélisation 60h 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

UE découverte 1 2

Anglais scientifique 45 h 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%UE transversale 1 1

Techniques de communication 22h30 1h30 - - 02h30 1 1 - 100%Total Semestre 1 375h 375h 16 30

2- Semestre 2 :Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coefficient Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu ExamenUE fondamentales 9 18

Nature et sources de pollution des écosystèmes 90h00 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Ecotoxicologie 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%Bio indicateurs de pollution 45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%

UE méthodologie 5 9Analyse instrumentale 60h00 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%Système d’information géographique (SIG) 45h00 3h - - 55h00 2 4 40% 60%

UE Découverte 1 2

Gestion des projets 45h00 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%UE transversales 1 1

Droit et économie de l’environnement 22h30 1h30 - -

02h301 1 - 100%

Total Semestre 2 375h 375h 16 30

3- Semestre 3 :Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coefficient Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu ExamenUE fondamentales 9 18

Monitoring de l’environnement et analyse du risque toxicologique 90h00 3h 1h30 1h30 110h00 4 8 40% 60%

Impact de l’environnementaux et gestion des risques 67h30 3h 1h30 - 82h30 3 6

40%60%

Biodiversité, changements globaux et développement durable

45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 440%

60%

UE méthodologie 5 9Chimie analytique de l’environnement 60h00 1h30 1h00 1h30 65h00 3 5 40% 60%

Techniques de dépollution et biorémédiation 45h00 3h - - 55h00 2 4 40% 60%

UE découverte 1 2Travail personnel de recherche bibliographique préparatoire au projet du S4

45h00 1h30 1h30 - 05h00 1 2 40% 60%

UE transversales 1 1Entreprenariat et étude d'impact 22h30 1h30 - - 02h30 1 1 100 %

Total Semestre 3 375h 375h 16 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 127

4- Semestre 4 :

Domaine  : Science de la Nature et de la VieFilière : BiologieSpécialité : Gestion de l’Environnement

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

VHS Coefficient CréditsMémoire* 200 09 16Stage en entreprise** 60 05 8Séminaires*** 20 3 6Total Semestre 4 280 17 30* Travail Personnel = unité d’enseignement fondamentale**Stage en entreprise = unité d’enseignement méthodologie.***Séminaires = unité d’enseignement découverte. 5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH UEF UEM UED UET Total

Cours 337h30 157h30 67h30 67h30 630h00TD 157h30 30h00 67h30 - 255hTP 90h00 112h30 - - 202h30Travail personnel 742h30 360h00 15h00 7h30 1125hMémoire 200h00 - - - 200hStage en entreprise** - 60h00 - - 60Séminaires*** - - 20h00 - 20Total 1527h30 720h 170h00 75h00 2492h30Crédits 72 33 12 3 120% en crédits pour chaque UE 60% 27.5% 10% 2.5% 100%

Stage pratique de 30 à 45 jours dans un institut de recherche traitant un sujet relatif à l’axe de formation (Gestion de l’environnement).

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S1Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF) Intitulé de la matière : Diversité des écosystèmes méditerranéens (DEM) Crédit : 8Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement : Etudier la diversité particulière des forêts méditerranéennes a savoir leur grande hétérogénéité biogéographique, historique, climatique et physionomique et, leur instabilité et leur vulnérabilité liées à la fois à l'environnement méditerranéen et à l'activité humaine.

Connaissances préalables recommandées : Ecologie, Biologie végétale, climatologie, Pédologie et Botanique.

Contenu de la matière : Introduction Chapitre 1 : Particularités écologiques des milieux méditerranéens

- Paramètres et types climatiques- Les sols méditerranéens

Chapitre 2 : Structure et organisation des écosystèmes forestiers.Chapitre 3 : Principaux types de végétation et quelques espèces ligneuses importantes du paysage

méditerranéen- Types de forêts méditerranéennes (climat, sol, végétation)

Chapitre 4 : Caractéristiques socio-économiques des pays de la région méditerranéenne.Chapitre 5 : L'avenir des forêts méditerranéennes.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus.

Références  C. Anderson: A forest of voicesJ. Claude : Biodiversité dynamique biologique et conservationR. Evert : Biologie végétaleR. Gorenflot : Biologie végétale et les cormophytesC. Lèvèque : Ecologie de l'écosystème à la biosphèreF, Ramade : Ecologie des ressources naturellesJ. Baudry : Ecologie du paysage concepts méthodes et applicationsB. Robert : Ecologie générale structure et fonctionnement de la biosphèreC. Molles : Ecology concepts and applicationsS. Frontier : Les EcosystèmesA.G. Van Der Valk : Forest EcologyO.J. Schmitz : Ecology and Ecosystem ConservationCh. Korner and Coll. : Forest Diversity and FunctionF. Ramadé : Conservation des écosystèmes méditerranéens : enjeux et perspectives. Les fascicules du Plan Bleu.P. Quézel et M. Barbero : Definition and characterization of Mediterranean-type ecosystems. www.fao.org/DOCREP/X1880F/x1880f03.htmwww.agroparistech.fr/IMG/pdf/mtp-synth08-Spyratos.pdfwww.wikipédia.comwww.Tela.botanica.comIntitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S1Intitulé de la matière : Fonctionnements des écosystèmes (FE)Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF) Crédit : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement : Cette matière a pour objectif de connaître le fonctionnement des écosystèmes selon les aspects quantitatifs et qualitatifs.

Connaissances préalables recommandées : Ecologie, Botanique, Biocénotique.

Contenu de la matière : Introduction

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Chapitre 1. Généralités sur le fonctionnement des écosystèmes- Définitions- Concepts : Aspect quantitatif et qualitatif

Chapitre 2. Flux d'énergie- Notions générales, définitions des paramètres quantitatifs (biomasse, production, productivité)- Méthode de mesure (en milieu herbacé‚ et forestier)- Chaînes et réseaux trophiques- Efficacité des écosystèmes

* Définition* Pyramides écologiques* Bilan et rendement énergétique

- Schéma général du flux d'énergie dans un écosystème- Productivité de divers écosystèmes : étude comparative

Chapitre 3. Cycle de la matière- Circulation de la matière dans les écosystèmes

* Définition* Modèle général* Paramètres généraux influant sur les cycles

- Les grands types de cycles biogéochimiques et leur perturbation* L'eau* Les types gazeux* Les cations biogènes

- Conclusion* Interprétation de l'étude des cycles* Classification des écosystèmes en fonction des cycles

- Phénologie* Définition* Méthodes

NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus.

RéférencesM. Boudru : Forêt et sylviculture boisements et reboisements artificiels B. Robert : Ecologie générale structure et fonctionnement de la biosphèreR. Miller : Ecologie traductionC. Molles : Ecology concepts and applicationsS. Frontier : Ecosystèmes structure. Fonctionnement. EvolutionS. Frontier : Ecosystèmes structure, fonctionnement évolutionA. Lacoste : Eléments de biogéographie et d’écologieF. Dupont : Botanique Systématique moléculaireC. Judd : Botanique systématique une perspective phylogénétiqueC Faurie : Ecologie approche scientifique et pratiqueC. Lèvèque : Ecologie de l'écosystème à la biosphèreF, Ramade : Ecologie des ressources naturelleswww.wikipédia.comwww.Tela.botanica.com

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Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S1Intitulé de l’UE : UE Découverte (UED)Intitulé de la matière : Analyse des données et modélisation (ADM)Crédit : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement : Ce cours donne à l’étudiant les principes de base de traitement de données par l’utilisation du micro-ordinateur.

Connaissances préalables recommandées : des notions de base d’informatique et statistiques.

Contenu de la matière : Chapitre 1 : GénéralitésChapitre 2 : Types de tableurs à utiliser en fonctions des données et des objectifs. Chapitre 3 : Méthodes de traitements des données.Chapitre 4 : Interprétation et présentations des résultats.Chapitre 5 : Statistique différentielle

1. Intervalle de confiance d’une moyenne2. Test de conformité d’une moyenne3. Test de signification et intervalle de confiance d’une différence de deux moyennes : Echantillons indépendants4. Test de signification et intervalle de confiance d’une différence de deux moyennes : Echantillons associés6. Analyse de la variance (ANOVA)7. Test de Normalité (Shapiro et Wilk)8. Comparaison des variances

9. Comparaison des fréquences, proportions et pourcentages (le test χ2)10. Corrélation et régression

Travaux pratiques1. Utilisation de tableurs2. Utilisation d’un logiciel pour un traitement des données.

2.1. Saisie des données.2.2. Analyses statistiques simples (ANOVA), comparaison des moyennes.2.3. Corrélations, Régression, Interprétations.2.4. Analyse des fréquences (tests d’homogénéité, test de conformité).2.5. Analyses statistiques multi variées (AFC, ACP, AFD, classification).

3. Utilisation d’un logiciel de représentation graphique des données.

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références Rm. di Scala : Les bases de l'informatique et de la programmation.F. Serge : Statistique pour les sciences de la vie et de l'environnementG. Cynthia : Introduction à la bio-informatiqueP. Dagnélie: Théorie et méthodes statistiques. Tome 1 et Tome 2. B. Scherer : Biostatistique. http://www.kb.u-psud.fr/etudes-doctorales-et-masters/cours/Biostat/Biostat.htmhttp://www.hsph.harvard.edu/departments/biostatistics/

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/Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S1Intitulé de l’UE : Méthodologique (UEM)Intitulé de la matière : Cartographie de la végétation (CT)Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : A l’issue de cet enseignement, l’étudiant doit maîtriser les différentes techniques de cartographie de la végétation et les grandes formations végétales de l’Algérie.

Connaissances préalables recommandées

1 – Cartographie générale Introduction1.1 - Notions générales

1.1.1 - Définitions1.1.1.1 - Cartographie1.1.1.2 - Carte1.1.1.3 - Echelle1.1.1.4 - Légende

1.1.2 - Notion de bases1.1.2.1 - Les Angles1.1.2.2 - Les distances

1.1.2.2 .1 - Les parallèles1.1.2.2 .2 - Les méridiens

1.1.2.3 - Les coordonnées1.1.2.3.1 - Les cordonnées géographique1.1.2.3.2 - Les cordonnées cartographiques1.1.2.3.3 - Système d'orientation

1.1.2.4 - l'échelle1.1.2.5 - Les méthodes de figuration de la carte topographique

1.2. - Cartographie sur terrain1.2.1 - Le Travail préliminaire 1.2.2 - Travail sur terrain 1.2.3 - Travail de réalisation 1.2.4 - Matériel nécessaire utilisé pour le travail

1.3 - Forme et mode d'expression cartographique 1.3.1 - Forme d'expression cartographique 1.4.2 - Mode d'expression cartographique

1.4 - Exemple de réalisation d'une carte2 - Photographie aérienne 2.1.- Historique et Généralités 2.2 - Caractéristiques de la photo-aérienne

2.2.1 - Type de photo-aérienne 2.2.2 - Caractéristiques de la photo-aérienne verticale de la couverture régulière......

2.1.2.1 - l'échelle 2.1.2.2 - le choix de l'échelle 2.1.2.3 - Caractéristique élémentaire

3 - Télédétection et application

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3.1 - Origine du terme Télédétection 3.2 - Définition3.3 - Principes de la télédétection3.4 - Appareils de mesure

3.4.1 - Satellite à défilement ou héliosynchrone=quasi-polaires3.4.2 - Satellite géostationnaires3.4.3 - Méthodes de la télédétection et interprétation

3.4.3.1 - Préparation ou réalisation de la mission3.4.4.2 - Restitution de l'information

2.4.6 - Traitement des données : optiques, équidensités colorées, traitement numérique, images..

2.2.7 - Application de la télédétection : ressources biologiques, aménagement du territoire..

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 1Intitulé de l’UE : Unité d’enseignement Fondamentale (UEF) Matière : Analyse et protection de l’environnement (APE)Crédits : 4 Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement : Le contenu de cette matière permet à l’étudiant de s’imprégner des méthodes d’analyses physicochimiques et biologiques des différents compartiments dans le contexte de l’évaluation, de la surveillance de la qualité et de la protection de l’environnement. Connaissances préalables recommandées : Différents types d’écosystèmes, compartiments de la biosphère (eau, sol, atmosphère), faune, flore, chimie différents types d’écosystèmes, compartiments de la biosphère (eau, sol, atmosphère), faune, flore, chimie.

Contenu de la matière Chapitre 1 : Analyses physico-chimiques 1- Objectifs des analyses environnementales 2- Les matrices analysées

2.1- Eaux 2.2- Sédiments 2.3- Sols, boues et composts 2.4- Echantillons biologiques 2.5- Echantillons atmosphériques 2.6- Autres types de matrices

3-Les paramètres déterminés3.1- Paramètres physico-chimiques 3.2- Paramètres inorganiques 3.3- Formes chimiques métalliques 3.4- Paramètres organiques 3.5- Exemples de substances réglementées

4- Les types de méthodes

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4.1- Méthodes primaires 4.2- Méthodes relatives 4.3- Méthodes comparatives

Chapitre 2 : Analyses biologiques 1. Relations des organismes aux conditions du milieu

1.1- Notions de bio indicateurs. 1.2- Méthodes biologiques et bio indicateurs

2. Principaux types de méthodes biologiques actuellement utilisées 21- Méthodes biologiques (Méth. Biochimiques, Ecotoxicologiques, Biocénotiques) 2.2- Méthodes indicielles • utilisant les peuplements végétaux (Ex : Indice diatomique) •

utilisant les peuplements animaux (Ex : Indice biotique basé sur les macroinvertébrés benthiques)

Chapitre 3 : Protection de l’environnement : Réglementation algérienne 1. Législation environnementale : définition et étendue 2. Statut juridique actuel en matière de protection et gestion de l’environnement (étude des différentes lois relatives à la protection de l’environnement, protection des ressources naturelles...etc.).

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : Contrôle continu (exposés + rapports de sorties + test) et Examen semestriel

Référence : 1. Ramade F., 2011- Introduction à l'écochimie - Les substances chimiques de l'écosphère à l'homme. Ed. Tec et Doc Lavoisier, Paris. 2. Ramade F., 2010- Dictionnaire encyclopédique des pollutions : De l'environnement à l'homme. Ed. Dunod, Paris. 3. Rodier J. et Coll., 2005- L’analyse de l’eau : Eaux naturelles, Eaux résiduaires, Eau de mer. Ed. Dunod, Paris. 4. Standard methods for the examination of water and wastewater, 1980. Ed. APHA-AWWA-WPCF

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S1Intitulé de l’UE : Transversale (UET)Intitulé de la matière : Techniques de communication (TC)Crédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignementCette matière présente les connaissances sur la langue de la science et de la communication scientifique. Elle permet le développement de projets encadrés sur la thématique de la formation de master proposé et renseigne sur la vulgarisation des sujets de mémoire ou de la thématique générale des travaux de recherche.

Connaissances préalables recommandées : Avoir des connaissances de base en informatique et techniques de méthodologie.

Contenu de la matière :

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- Communication scientifique : perfectionnement à la conception de diaporamas et de posters avec le logiciel Power Point. - Projet encadré sur un sujet d'actualité en écologie et environnement, avec recherche bibliographique, rédaction d'un rapport et présentation orale.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1. CARON, R. (1994). Bibliographic records with French Headings . Library Cataloging and Authorities Group. 2. CARON, R. (1994).«Comment citer un document électronique?», In Université Laval, Bibliothèque, Site de la Bibliothèque de l'Université Laval, [En ligne]. http://www.bibl.ulaval.ca/doelec/citedoce.html 3. MORNIN E. (1998). RE: validité des informations issues du web. 4. PELGRIMS, G. (2003). Références bibliographiques. Guide pour les travaux universitaires en Sciences de l’éducation. (Cahiers de la Section des sciences de l’éducation, Hors série). Genève : Université de Genève.Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Transversale (UET) Intitulé de la matière : Anglais scientifique (AS)Crédit : 2Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement : L’enseignement de la langue anglaise est une nécessité primordiale pour les étudiants en sciences biologiques, cette langue étant l’outil de travail le plus utilisé dans le Monde. L’objectif, à long terme, serait de s’aligner sur les grandes écoles qui exigent la maîtrise de la langue anglaise et parfois l’obtention de diplômes universellement reconnus.

Connaissances préalables recommandées : Les bases de la langue anglaise.

Contenu de la matière : Chapitres qui traitent les aspects suivants : Gestion, pollution, toxicologie et la langue anglaise (ouvrages de bases).

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :D. Anger : Environmental Science C. Molles : Ecology concepts and applications T. Dutoit : Ecologia mediterranea C.M. Rely and Coll. : Science - Development and Validation Of Analytical MethodsP. fletcher and Coll. : Education - The Handbook of Applied Linguistics Cambridge University press : Education - Cambridge Certificate In Advanced English

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http://www.englishclub.com/ http://www.englishclub.com/learn-english.htm Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF) Intitulé de la matière : Nature et sources de pollution des écosystèmes (NSPE)Crédit : 8Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement : Etudier les pollutions qui sont des phénomènes complexes avec autant d'attention, non seulement les caractéristiques des polluants à l'émission, mais aussi leur transport et leurs dilutions, les mécanismes de leur dégradation, la nature des produits issus de cette dégradation, leur biodégradabilité, les phénomènes d'accumulation dans les écosystèmes et ceux de bioconcentration ou de bioamplification, les conséquences écotoxicologiques qu'ils induisent, etc.

Connaissances préalables recommandées : Ecologie, Pollution, Ecotoxicologie et Pathologie des écosystèmes.

Contenu de la matière : Introduction : Définitions Chapitre 1 : Classification des pollutionsChapitre 2 : Type de pollution, nature chimique et source ou agent causalChapitre 3 : Principales sources, formes et effet de la pollutionChapitre 4 : Synthèse sur les grandes sources de pollutionNB : Travaux dirigés et pratiques se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références  A. C. Stern and Coll.: Fundamentals of air pollutionMC. Newman et Coll.: Ecotoxicology a comprehensive treatmentRG Jak et Coll.: Eutrophication management and toxicologyE. Keller : Traitement des pollutions industriellesM.-C. Girard : Sols et environnement J. Pierre : Site et sols polluésA. Roulet : Santé et qualité de l'environnementPrédit : Pollution par les particules atmosphériquesM. Tissut : Plantes, herbicides et désherbageP. de Félice : L’effet de serreC. Bazin : L’analyse de LéauR. François : Gaz à effet de serre & changement climatiqueJ. J. Drevon : Fixation symbiotique de l'azote et développement durableP. Masclet : Environnement pollution atmosphériqueB. Bigot : Déchets et pollution impact sur l'environnement et la santéCollection : Déchets de matières plastique: recyclageAcadémie des Sc. : Contamination des sols par les éléments, les risques et leur gestionhttp://www.epa.gov/acidrain.http://www. wikipédia.com http://cesifs.emse.fr/BULLES/FAYS.20000215/air/presentair.htmlhttp://www.airbreizh.asso.fr/polluant.html

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Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF) Intitulé de la matière : Ecotoxicologie (ECO)Crédit : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement : Cette matière a pour objectif de montrer à l’étudiant que le maintien de la qualité de l’environnement passe par la connaissance de l’état de pollution ou le degré de pollution mais aussi il importe de connaître surtout la nature d’une telle pollution. Parmi les sources de pollution, l’utilisation intensive des produits phytosanitaires constitue de loin la source potentielle des pollutions qui mérite une connaissance approfondie.

Connaissances préalables recommandées : notions d’écologie, chimie et pathologie.

Contenu de la matière : Introduction généraleChapitre 1 : Notions de toxicité

1.1. Définitions1.2. Mode de pénétration des substances toxiques1.3. Différentes phases d’action d’une substance toxique1.4. Manifestations de la toxicité1.5. Evaluation de la toxicité

Chapitre 2 : Relation doses-effets 2.1. Généralités2.2. Cumulait doses- effets génotoxiques

2.2.1. Courbes doses - effets (différents profils)2.2.2. Classification des courbes2.2.3. Analyse et signification des différentes courbes

2.3. Notion de doses maximales et ses limites2.3.1. Introduction2.3.2. Evolution de la notion de doses admissibles2.3.3. Problèmes posés par la dose admissible2.3.4. Notions de doses tolérables2.3.5. Les limites des doses admissibles

Chapitre 3 : Principaux effets physiotoxicologiques3.1. Généralités3.2. Principales altérations somatiques

3.2.1. Neurotoxicité3.2.2. Action sur l’équilibre endocrinien3.2.3. Actions sur les fonctions respiratoires3.2.4. Action sur les organes

3.3. Principaux effets germinaux3.3.1. Action sur le potentiel biotique3.3.2. Action mutagène3.3.3. Action carcinogène3.3.4. Action tératogène

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Chapitre 4 : Influence des facteurs écologiques sur la manifestation de la toxicité4.1. Les facteurs intrinsèques4.2. Les facteurs extrinsèques

Chapitre 5 : Principe de modulation de l’action toxique ou bioactivation et bioinactivation 5.1. Introduction5.2. Les herbicides5.3. Les insecticides

Chapitre 6 : Etude de deux polluants : Hg et Pb6.1. Toxicité du plomb6.2. Toxicité du mercure

Travaux dirigés : Règles de prévention

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :  J. Michel : Aide-mémoire Gestion des déchetsA. Olivier : Chimie et pollutions des eaux souterraines X Merlin : Methodix analyse M. Prescott : Microbiologie M. Tissut : Plantes, herbicides et désherbage Bastien : Programme national d'Ecotoxicologie J. François : Protection phytosanitairesC. Delarras : Surveillance sanitaire et microbiologique des eaux C.A. Heaton : The chemical industryR. Robert : Toxicologie industrielle et intoxications professionnellesC. Frank : Toxicologie: donnée générales. organe ciblesMC. Newman et Coll.: Ecotoxicology a comprehensive treatmentE. Hodgson : Science - textbook of modern toxicologyORS: Manuel de toxicologieG. Lapointe : Notions de toxicologiehttp://www.csst.gc.cahttp://www.ecotoxique.com/lienecotox.htmhttp://portaildurisque.iut.u-bordeaux1.fr/bdecotox.htmhttp://www.ecotoxique.com/index.htmlhttp://www.ac-nancy-metz.fr/enseign/physique/Bidon/ECOTOX/present-ecotox.HTMhttp://www.juturna.org/biblio/Ecotoxicologie/TOXON%20-%20Ademe.pdfIntitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF)Intitulé de la matière : Bio-indicateurs de pollution (BIP)Crédit : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement : Les indicateurs biologiques ou bio-indicateurs sont des espèces animales ou végétales dont les préférences ou exigences écologiques en font des témoins précoces des variations des facteurs abiotiques ou biotiques intervenant dans leur environnement.

Connaissances préalables recommandées : Chimie, Ecologie générale, MicrobiologieEtablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 138

Contenu de la matière : Introduction : Définitions et PrincipesChapitre 1 : Les différents groupes d’êtres vivants connus dans la biosurveillance

1.1- Animaux 1.2- Végétaux (végétaux supérieurs, Lichens, Mousses….)

Chapitre 2 : Les biomarqueurs dans l'évaluation de l'état écologique des milieux aquatiquesChapitre 3 : Bio indicateurs de pollution atmosphériques (exemples)Chapitre 4 : Bio indicateurs du sol (exemples)Conclusion

NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus.

Références : J. Michel : Aide-mémoire Gestion des déchetsJ. Mark : Atmospheric pollutionG. Sosito : Chemistry of soilsB. Fert : Chimie de l'environnement air, eau, sols, déchetsA. Olivier : Chimie et pollutions des eaux souterraines B. Bigot : Déchets et pollution, impact sur l'environnement et la santé A. C. Stern and Coll.: Fundamentals of Air Pollution E. Beck and Coll. : Plant ecology E. Keller : Traitement des pollutions industriellesC. Delarras : Surveillance sanitaire et microbiologique des eaux M. Prescott : Microbiologie http://www.cemagref.fr/Informations/Ex-rechr/systemes-aqua/insectes/insectes-exemple.htmhttp://www.cemagref.fr/Informations/Ex-rechr/systemes-aqua/coste/Coste-chapo.htmhttp://www.cemagref.fr/Informations/Recherch/milieuaq/analyse.htmhttp://www.actu-environnement.com/ae/news/cemagref_bio-indicateurs_eau_4482.php4http://dsf.uqac.ca/dept/eco-con/http://www2.ac-lille.fr/lichen/default.htmhttp://www2.ac-lille.fr/lichen/Page_22.htmhttp://membres.lycos.fr/atmolichen/newpage0.htmlhttp://perso.wanadoo.fr/co-evolution/co-evolution_lichens_DV.htmhttp://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/environnement/lichen.htmlIntitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Transversale (UET) Intitulé de la matière : Droit et économie de l’environnement (DEE)Crédit : 1Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement : Les objectifs visés par cette matière et d’acquérir les principes généraux du droit communautaire de l'environnement, réglementation, origines et sources du droit de l'environnement.

Connaissances préalables recommandées : Economie, Législation et Droit

Contenu de la matière : 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 139

Chapitre 1 : Notions de droit et instruments juridiques.Chapitre 2 : Principes de droit et principe de pollueur-payeurChapitre 3 : Lois, normes et responsabilités.Chapitre 4 : Le droit et les recours du public.Chapitre 5 : Théories économiques de l’environnementChapitre 6 : Les coûts de la dégradation environnementaleChapitre 7 : Comptabilité environnementaleNB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :P. Jean : Environnement et gestion des territoiresR. Moletta : Gestion des problèmes environnementaux dans les industriesG. Pillet : Economie de l’environnement / Ecologie de l’économieA. Heyes : The law and economics of the environmentwww.ecosys.comwww.meso-platform.org

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Transversale (UET) Intitulé de la matière : Gestion des projets (GP)Crédit : 2Coefficient : 1

Objectifs de l’enseignement : Les objectifs visés par cette matière d’une part initier l’étudiant aux outils de la gestion et apprentissage des concepts ainsi que des procédures et canevas applicables à l’élaboration d’un projet et d’autre part orienter l’étudiant et lui permettre de choisir son domaine d’activité .

Connaissances préalables recommandées : Méthodologie de travail.

Contenu de la matière : Première partie: Gestion

1. Introduction2. L’observation dans l’entreprise3. Analyse de l’entreprise4. La décision de l’entreprise

Deuxième partie: Analyses de projets 1. Le projet comme instrument de développement2. Développement et productions générées par le projet3. Description et formulation du projet

Travaux dirigés : Etude de cas d’un projet1. Elaboration des données des projets2. Traitement des données et résultats

Autres : Travail personnel ; exposé

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 140

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :J. Michel : Aide-mémoire Gestion des déchetsM. Miñana : Conduite de projet, volume 1 : Les Clés de l'élaboration d'un bon planningR. Aïm : L'essentiel de la gestion de projetR. Aïm : La gestion de projet (mémentos LMD)H. P. Maders et E. Clet: Comment manager un projet

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Découverte (UED) Intitulé de la matière : SIG (ST)Crédit : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement : L’objectif est de fournir aux étudiants les connaissances théoriques et pratiques de base et l’autonomie nécessaire pour l’implémentation de projets en Système d’Information Géographique.

Connaissances préalables recommandées : Cartographie, analyses des données.

Contenu de la matière : Chapitre 1 :Qu’est-ce qu’un SIG et Pourquoi mettre en place un SIGChapitre 2 : Les données géographiques, les cartes et le SIGChapitre 3 : La modélisation cartographiqueChapitre 4 : Les sources de données, leur acquisition, leur manipulation et leur sauvegarde dans un

SIG.Chapitre 5 : L’analyse des données dans un SIGChapitre 6 : La présentation des résultats d’analyse.Chapitre 7 : La conception de projet SIG et leur mise en placeChapitre 8 : Logiciels, sources de données et le WWWNB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :J. Baudry : Ecologie du paysage concepts méthodes et applicationsF. Burel and J. Baudry : Ecologie du paysage M.A. Schilling : Fondements en Système d’Information Géographique.M.A. Schilling : Système d’Information Géographique avancé.G. Girard : Traitement des données en télédétection. D. Ducrot : Méthodes d’analyse et d’interprétation d’images de télédétection multi-sources

Extraction de caractéristiques du paysage.R. Sandau and Coll. : Small satellites for Earth observation.S. Shekhar and H. Xiong : Encyclopedia of GIS.F. Blasco: le Bulletin d’information du réseau télédétection de l’Auf.www.esri.comwww.mirteledetection.com

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 141

www.xeosimaging.comwww.wikipédia.com

Intitulé du Master : Ecologie des écosystèmes aquatiquesSemestre : S2Intitulé de l’UE : Méthodologique (UED)Intitulé de la matière : Analyse instrumentale (AI)Crédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement L’étudiant doit être capable de conduire une recherche théorique et pratique. Il doit maîtriser

toutes les techniques de bases de laboratoires utilisées en biologie.

Connaissances préalables recommandées Chimie générale et analytique

Contenu de la matière : Chapitre 1 : Les techniques courantes

Techniques courantesTechniques de microbiologieTechniques d’extraction, de séparation et de purifications des biomolécules

Chapitre 2 : Les techniques chromatographiquesCCM, en phase gazeuse et liquide (HPLC)

Chapitre 3 : Les techniques électrophoretiquesElectrophorèse en gel polyacrylamide (PAGE), eletrofocalisation, bidimensionnelle, sur agarose, en champs pulsé et capillaire

Chapitre 4 : Techniques spectroscopiquesSpectroscopie UV-Visible, IR, de masse, RMN et spectrofluoremétrie.

Chapitre 5 : Techniques de centrifugation et ultracentrifugation

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). 1. Multon F. (1991). Techniques d’analyse et de contrôle dans les industries agro-alimentaires. Edition TEC & DOC. 408p.2. Williams M.A. (1977). Quantitatives methods in biology. Edition N.H.317p.3. Work E. (1976). Laboratory Technics. Edition N.H.317p.4. Bobbit A. (1972). Introduction à la chromatographie. Edition Gauthiers-Villars. 268p.

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF)Intitulé de la matière : Monitoring de l’environnement et analyse du risque toxicologique (MEART)Crédit : 8Coefficient : 4

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 142

Objectifs de l’enseignement : Faire découvrir aux étudiants le processus de la surveillance de tout ce qui pourrait se passer dans l’environnement et apprendre à analyser le risque toxicologique.

Connaissances préalables recommandées : Ecotoxicologie, Informatique, Pharmacologie, thérapeutique.

Contenu de la matière : Définitions des principaux conceptsChapitre 1 : Fonctions des observatoires de l'environnementChapitre 2 : Méthodes de l’évaluation environnementaleChapitre 3 : Données générales en toxicologie (Absorption, distribution et élimination des

toxiques).Chapitre 4 : Évaluation toxicologique (détermination de la sécurité et du risque).

- Evaluation des risques naturels- Evaluations des risques technologiques

Chapitre 5 : Actions entreprises pour améliorer la gestion des risquesNB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus Références : G. Jousse : Gestion des risques et de la sécurité.G. Jousse : G. Jousse : Traité de riscologie - La science du risque.Académie des Sc. : Contamination des sols par les éléments, les risques et leur gestionI. Chorus and J. Bartram : Toxic Cyanobacteria in Water : A guide to their public health

consequences, monitoring and management.R. Robert : Toxicologie industrielle et intoxications professionnellesC. Frank : Toxicologie: donnée générales. organe cibleshttp://www.ecotoxique.com/lienecotox.htmhttp://portaildurisque.iut.u-bordeaux1.fr/bdecotox.htmhttp://portaildurisque.iut.u-bordeaux1.frhttp://hse.iut.u-bordeaux1.fr/lesbats/cdsdlIntitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Fondamentale (UEF)Intitulé de la matière : Impact environnementaux et gestion du risque toxicologique (IEGRT)Crédit : 6Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement : Le cours développe les concepts propres à l’étude des effets des toxiques dans les écosystèmes où l’impact sur des populations d’organismes doit être considéré. Il discute de l’évaluation du risque écologique posé par les toxiques environnementaux.

Connaissances préalables recommandées : Ecotoxicologie, Informatique, Pharmacologie, thérapeutique, Ecosystèmes.

Contenu de la matière : IntroductionChapitre 1 : Définition et concepts de l'environnementChapitre 2 : Etablissements classés

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 143

Chapitre 3 : Etudes d'impactsChapitre 4 : Catastrophes écologiquesChapitre 5 : La notion de toxique et ses implications écologiquesChapitre 6 : Toxicologie expérimentale et appliquéeChapitre 7 : Actions entreprises pour la gestion des risquesNB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références :Académie des Sc. : Contamination des sols par les éléments, les risques et leur gestionI. Chorus and J. Bartram : Toxic Cyanobacteria in Water - A guide to their public health consequences, monitoring and management -.R. Robert : Toxicologie industrielle et intoxications professionnellesC. Frank : Toxicologie: donnée générales. organe ciblesP. Wathern : Environmental Impact Assessment: Theory and Practice.C. Landreau : Impact des activités physiques de pleine nature - Outils d'évaluation et gestion environnementale-. M. Guigo: Gestion de l’environnement et systèmes experts.P. André et Coll. : L’évaluation des impacts sur l’environnementhttp://www.oecd.org/about/0,3347,fr_2649_34375_1_1_1_1_1,00.htmlhttp://www.mvma.org/public/library/health/poison.htmlhttp://www.dive.afssa.fr/agritox/guides/guide-agritox.html

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Méthodologie (UEM)Intitulé de la matière : Chimie analytique de l’environnement (CAE)Crédit : 5Coefficient : 3

Objectifs de l’enseignement : Cette matière porte sur la nature et le rôle des divers éléments et composés chimiques présents dans l’environnement et sur leurs conséquences environnementales, sociales et économiques ; familiarise les étudiants aux techniques d'analyse de laboratoire.

Connaissances préalables recommandées : Chimie organique, électrochimie et calculs chimique.

Contenu de la matière : Introduction Chapitre 1 : Surveillance de l’environnement – cadre général-

- objectifs des études, types de matrices et paramètres utilisés, principales méthodes analytiques.

Chapitre 2 : Surveillance de l’environnement – cadre technique -- échantillonnage, prétraitement, analyses des échantillons, sélection des méthodes,

mesure et production des données.Chapitre 3 : Validation et contrôle de qualité – des méthodes de mesures –Chapitre 4 : Essais inter laboratoires et matériaux de référenceChapitre 5 : Les systèmes de qualité.NB : Travaux dirigés et TP se rapportent aux différents chapitres du cours.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 144

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références : P. Quevauviller : Métrologie en chimie de l'environnement G. Michel : Chimie analytique équilibres en solutionR. Ouahes : Chimie annales corrigéesB. Fert : Chimie de l'environnement air, eau, sols, déchets Chimie de l'environnement air, eau, sols, déchets.C. A. Matore : La chimie analytique mesure et sociétéG. Charlot :Chimie analytique quantitativeA. Gilles : Chimie appliquée a l'environnementJ. Nicolas : Echantillonnage et environnement E. Bardez :Mini manuel de chimie générale : chimie des solutions: cours + exos https://dokeos.unige.ch/home/courses/13C005A/http://www.numilog.fr/package/extraits_pdf/e2814.pdfIntitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Méthodologie (UEM)Intitulé de la matière : Techniques de dépollution et biorémédiation (TDB)Crédit : 4Coefficient : 2

Objectifs de l’enseignement : Les objectifs visé par cette matière sont la connaissance de l’ensemble des techniques de dépollution et le potentiel biologique pour stimuler et développer des processus naturels de dégradation.

Connaissances préalables recommandées : Microbiologie, Chimie, biologie végétale.

Contenu de la matière : Chapitre 1 : définition et concepts de dépollution et biorémédiationChapitre 2 : Les techniques de traitement

- Procédés physico-chimiques- Procédés thermiques et biologiques - Le confinement

Chapitre 3 : Choix de la technique de dépollution (exemples : sol, air, eau et nappe)Chapitre 4 : Les différentes méthodes de dépollution et leurs coûts induits.Chapitre 5 : Biodégradation et biorémédiation par les microorganismesChapitre 6 : Phytorémédiation (exemples).NB : Travaux dirigés et TP se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Travail personnel ; exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus 

Références : E. Goglio et Coll.: Traitement des sites et sols polluésI. Chorus and J. Bartram: Toxic Cyanobacteria in Water: A guide to their public health consequences, monitoring and management.J. Amiot: Utilisation des espèces dégradés en vue de production de biomasse. Etat des connaissances et perspectives.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 145

P. JAMES : Lichens et pollution de l’air http://www.planetegene.com/media/pdf/Planete%20Gene%20Dossier%20Bioreporters%20et%.http://files.efbpublic.org/downloads/Environmental_biotechnology_French.pdfhttp://www.lorraine.drire.gouv.fr/webdrire/files/DEI/colloque_SSP11.%20Les%20techn...http://www.cciexpert.net/ged/14-reduction-pollution-eau.pdfhttp://www.airepur.com/doc/statiques/plaquette_airepur.pdfhttp://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/environnement/lichen.htmlhttp://www.ffme.fr/technique/meteorologie/theorie/atmosphere/ composition.htmhttp://www.environnement.gouv.fr/actua/cominfos/dosdir/DIRPPR/air/pollu origines.htmhttp://www.irceline.be/~celinair/french/homefr java.htmlhttp://pedagogie.ac-toulouse.fr/ia81sciences/Defis_scientif/Documentation/LichensD..Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S3Intitulé de l’UE : Fondamentale (UEF) Intitulé de la matière : Biodiversité, changements globaux et développement durable (BCGDD)Crédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Acquérir des connaissances sur la Biodiversité, les changements globaux et le développement durable

Connaissances préalables recommandées : Connaissances de base en écologie générale

Contenu de la matière : Chapitre 1 - La diversité biologique : un état des lieux

a- La classification d’un vivant et ses principes (niveaux d’organisation du monde vivant, les hiérarchies taxinomiques, la notion d’espèces et écosystèmes).b- L’inventaire des espècesc- la systématique, l’information et internetd- Mesurer la diversité biologiquee- La distribution géographique de la biodiversité

Chapitre 2 - Dynamique de la diversité biologique et conséquences des activités humainesc- L’homme et l’érosion de la diversité biologiqued- Dynamique de la diversité biologique et pressions anthropiquesc- Changement climatique

Chapitre - 3 - La conservation de la biodiversité et développement durable i- Pourquoi protéger la diversité biologiquej- Approche de la conservationk- Les aires protégéesl- Une utilisation durable de la biodiversitém- La conservation ex situn- La biologie de la conservationo- Les conventions internationalesp- Mesures concernant la conservation des espèces et les milieux naturels

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus 

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 146

Références : (Livres et polycopiés, sites internet, etc). - ACOT P. (1994) :Histoire de l’Ecologie. Que sais-je ? 128p. PUF. Paris - BARBAULT R. (1981) : Ecologie des populations et des peuplements. Ed : Masson. Paris. 200p. - BARBAULT R. (1997) :Ecologie générale, 4ième édition, Structure et fonctionnement de la biosphère, Ed : Masson. Paris. - BARBAULT R. (2000) :Ecologie générale. Structure et fonctionnement de la biosphère (5ème édition). Ed : Dunod. Paris. 326p.Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S3Intitulé de l’UE : Transversales (UET) Intitulé de la matière : Entreprenariat et étude d'impact (EEI)Crédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement : la mise en lumière d'un instrument de développement qui est le projet tout en montrant les productions qui en découlent d’une part et fourniture aux étudiants le savoir d'établissement d'une étude d'impact tout en ayant la faculté d'évaluer les effets d'une activité quelque soit son origine sur l'environnement d’autre part.

Connaissances préalables recommandées : facteurs de production, gérer une entreprise, écologie, environnement et études d’impact.

Contenu de la matière :Première partie : entreprenariat 1 - définition d‘un projet d’investissement 2 - le cycle du projet 3 - évaluation économique et financière d’un projet 4 - rentabilité économique et financière 5 - les effets attendus d’un projet

Deuxième partie : études d’impact

1 - Législation, politiques et dispositifs institutionnels 2 - Étude préalable 3 - Analyse d’impact et prise de décision 4 - Mise en œuvre et suivi 5 - Gestion du projet 6 - Évaluation de l’impact social et environnementalNB : Travaux dirigés : étude de cas d’un projet d’investissement et élaborer une étude d’impact

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus 

Références :-Gestion des problèmes environnementaux dans les industries.-Guide du naturaliste technique d'observation et d'étude.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 147

Intitulé du Master : Gestion de l’EnvironnementSemestre : S3 Intitulé de l’UE : Transversales (UET) Intitulé de la matière : Travail personnel de recherche bibliographique (TPRB) Crédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement : cette matière permet aux étudiants de faire une recherche bibliographique préparatoire au projet du S4,.

Autres : Travail personnel ; sortie pédagogique, exposé

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances ou présenté à la fin du S3 comme exposé noté

Domaine : SCIENCES DE LA NATURE ET DE VIE

Filière : SCIENCES BIOLOGIQUES

Spécialité : BIOTECHNOLOGIES VEGETALES ET META-GENOMIQUE

II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements(Prière de présenter les fiches des 4 semestres)

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 148

1- Semestre 1 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE FondamentalesUEF1 (O/P) 18Biotechnologies Végétales et Amélioration des Plantes 67h30 3h00 / 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Génétique Végétale 67h30 3h00 1h30 / 82h30 3 6 40% 60%Biologie Moléculaire 67h30 3h00 1h30 / 82H30 3 6 40% 60%UE MéthodologiesUEM1 (O/P) 9Techniques de valorisation des ressources végétales 45h00 1h30 1h30 55h00 2 4 40% 60%

Bioinformatique 60h00 1h30 2h30 / 65h00 3 5 40% 60%UE DécouvertesUED1 (O/P) 2Plantes cultivées à intérêt économiques 45h00 3h00 / / 05h00 2 2 / 100%

UE TransversalesUET (O/P) 1Communication 22h30 1h30 / / 02h30 1 1 / 100%Total Semestre 1 375h00 16h30 5h30 3h00 375h00 30

2- Semestre 2 :

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire Coeff Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE FondamentalesUEF3 (O/P) 18Botanique et Systématique des Plantes Supérieures 67h30 3h00 / 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Méta-Génomique 90h00 3h00 / 3h00 110h00 4 8 40% 60%Relation Plante - Environnement 45h00 1h30 1h30 / 55h00 2 4 40% 60%UE MéthodologiesUEM 2(O/P) 9Echantillonnage et Démarches Expérimentales en Biologie 45h00 1h30 1h00 / 30h00 2 3 40% 60%

Statistique et Modélisation 60h00 3h00 1h00 90h00 3 6 40% 60%UE DécouvertesUED1 (O/P) 3Références Bibliographiques et Rédaction d’Article Scientifique 45h00 3h00 / / 5h00 2 2 / 100%

UE TransversalesUET2 (O/P) 1Législation 22h30 1h30 / / 02h30 1 1 / 100%Total Semestre 2 375h00 16h30 3h30 4h30 375h00 30

3- Semestre 3 :

Unité d’EnseignementVHS V.H hebdomadaire

Coeff CréditsMode d'évaluation

14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 150

UE FondamentalesUEF5 (O/P) 18 Méthodologie et Approches de l’Amélioration Génétique des Plantes

67h30 3h00 / 1h30 82h30 3 6 40% 60%

Technologies de la Culture in Vitro 67h30 3h00 1h30 82h30 3 6

Biologie des Produits Végétaux et Bio-Industrie 67h30 3h00 / 1h30 82h30 3 6 40% 60%

UE MéthodologieUEM3 (O/P) 9Préservation et conservation des ressources Phytogénétiques 45h00 1h30 1h00 / 30h00 2 3 40% 60%

Valorisation et Exploitation de la Recherche Scientifique 60h00 3h00 1h00 / 90h00 3 6 40% 60%

UE DécouvertesUED2 (O/P) 2Microorganismes du Sol et Symbiose Végétale 45h00 1h30 1h30 / 5h00 2 2 40% 60%

UE TransversalesUET3 (O/P) 1 Entreprenariat et Gestion des Projet 22h30 1h30 / / 02h30 1 1 / 100%

Total Semestre 3 375h00 16h30 4h30 4h30 375h00 30

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 151

4- Semestre 4 :

Domaine  : Sciences de la nature et de la VieFilière : Sciences biologiquesSpécialité : Biotechnologies Végétales et méta-génomique

Stage en entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.

Mémoire VHS Coeff CréditsUEF = Travail Personnel 247h30 9 18UEM= Stage en entreprise 120h00 5 9UED= Séminaires 05h00 2 2UET= Autre (préciser) = PPT 02h30 1 1Total Semestre 4 375h00 / 30

5- Récapitulatif global de la formation : (indiquer le VH global séparé en cours, TD, pour les 04 semestres d’enseignement, pour les différents types d’UE)

UE VH

UEF UEM UED UET Total

Cours 382h30 180h00 112h30 67h30 742h30TD 67h30 97h30 22h30 / 187h30TP 157h30 22h30 / / 180h00Travail personnel 742h30 360h00 15h00 07h30 1125h00

Autre (préciser) Mémoire (247h30)

Mémoire (120h00)

Mémoire (05h00)

Mémoire (02h30) 375

Total 1597h30 780h00 155h00 77h30 2610h00Crédits 72 36 8 4 120% en crédits pour chaque UE 60 30 6.66 3.33 100%

III - Programme détaillé par matière(1 fiche détaillée par matière)

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 1 Intitulé de la matière : Biotechnologies Végétales et Amélioration des PlantesCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Maîtrise et exploitation expérimentale des différents aspects de biotechnologie végétale dans les programmes d’amélioration des plantes.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 152

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Biologie végétale, biologie cellulaire, génétique.

Contenu de la matière 1. fondements de la culture in vitro et multiplications des plantes,2. phénomènes physiologiques liés à la réalisation de culture in vitro,3. besoins nutritifs des tissus et cellule cultivés en conditions aseptiques,4. technologie de la culture in vitro :4.1. Application de la culture in vitro : culture des méristèmes, culture de pollen4.2. Biotechnologie et amélioration des plantes4.2. 1. Fusion de protoplastes4.2. 2. Haplo-méthodes (Androgenèse et gynogenèse)4.2. 3. Variations somaclonales4.2.4. Embryogenèse somatique4.2.5. Sauvetage d’embryon4.2.6. Transfert de gènesAutres : Compte renduMode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Gérard Tobelem, Pascale Briand : Biotechnologies: le droit de savoirClaude Durand : Regards sur les biotechnologiesPierre Douzou : Les biotechnologiesLouise Poissant : Art et biotechnologiesDominique de Vienne : Les marqueurs moléculaires en génétique et biotechnologies végétalesChloé Leprince : Les métiers de la biologie et des biotechnologies

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 1Intitulé de la matière : Génétique végétaleCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Connaissance fondamentale sur la génétique végétale et ses applications dans la création variétale

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Biologie cellulaire, génétique, biologie moléculaire de base

Contenu de la matière : 1. Notion de gène et transmission de l’information génétique,2. Structure et fonction des gènes,Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 153

3. Information génétique, code génétique, transcription, traduction,4. Régulation de l’expression des gènes,5. Génétique du développement,5.1. Génétique des populations,5.2. Génétique quantitative6. Ressources génétiques en sélection et amélioration des plantes.NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Anthony J. F. Griffiths, David T. Suzuki, Chrystelle Sanlaville : Introduction à l'analyse génétiqueJean-Louis Serre : La génétiqueAnthony J. F. Griffiths, Chrystelle Sanlaville : Analyse génétique moderneSandy Primrose, Richard Twyman, R. Old, Lionel Domenjoud : Principes de génie génétique

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 1Intitulé de la matière : Biologie moléculaireCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes) : Connaissances fondamentales sur la biologie moléculaire végétale et ses applications dans l’identification des espèces végétales

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes) : Biologie cellulaire, génétique, biologie moléculaire de base.

Contenu de la matière  1- Introduction 2. Définitions 3 - Réplication d’ADN4- Transcription d’ARNm5- Traduction d’ADN et synthèse des protéines6- Techniques de biologie moléculaire7- Clonage

Autres : compte rendu

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 154

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Harvey Lodish, Arnold Berk, Paul Matsudaira, James Darnell, Chris A. Kaiser, Pierre L. Masson : Biologie moléculaire de la celluleJacqueline Etienne, J Etienne-Decant, Eric Clauser, Chantal Housset, Philippe Roingeard : Biochimie génétique, biologie moléculaireNedjma Ameziane, Marc Bogard, Jérôme Lamoril : Principes de biologie moléculaire en biologie cliniqueChristophe Ronsin : L'histoire de la biologie moléculaire: pionniers & hérosDenis Tagu, Christian Moussard : Principes des techniques de biologie moléculaireGérard Coutouly, Emile Klein, Eric Barbieri, Mostafa Kriat : Travaux dirigés de biochimie, biologie moléculaire et bioinformatiqueGérald Karp, Jules Bouharmont, Jean-Claude Wissocq : Biologie cellulaire & moléculaire 6Geoffrey M. Cooper : une approche moléculaireIntitulé du master : Biotechnologies végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 1Intitulé de matière : Techniques de valorisation des ressources végétalesCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : - Acquisition des connaissances nécessaires à la maîtrise des techniques d’extraction et d’analyse

des substances naturelles.

Connaissances préalables recommandées : Bases en phytochimie, Biochimie, Microbiologie, Biologie moléculaire.

Contenu de la matière1. Généralité sur la cellule et le métabolisme végétale2. Classification des substances végétales3. Méthodes de traitement de l’échantillon3. 1. Techniques de prélèvement3. 2. Techniques d'extraction3. 3. Techniques de purification4. Techniques séparatives des molécules (Chromatographie, électrophorèse…etc.)

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références 

- Chimie analytique (Skoog) – Edition De Boeck Université- Chimie des substances odorantes (Teisseire) – Edition Lavoisier Tec et Doc- Génie industriel alimentaire, Les procédés physiques de conservation, Ed. Lavoisier

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 155

-Génie industriel alimentaire tome 2: Techniques séparatives, Edition Lavoisier Tec et Doc- Identification spectrométrique de composés organiques, Ed. De Boeck Université- La chimie analytique : mesure et société, Ed. Lavoisier Tec et Doc- La pharmacie française : ses origines, son histoire, son , Edition Lavoisier- Le génie chimique à l'usage des chimistes, Edition Lavoisier Tec et Doc -Biologie Cellulaire Et Moléculaire (Eduardo D. P, Robertis, E. M. F. De Robertis – 1983), - Biologie moléculaire de la cellule(Harvey Lodish, Arnold Berk, Paul Matsudaira – 2005)- Principes des techniques de biologie moléculaire (Denis Tagu – 1999)

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 1Intitulé de la matière : BioinformatiqueCrédits : 5Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Utilisation de l’outil statistique dans l’exploitation et le traitement des données.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Mathématiques, Informatique, Biologie moléculaire.

Contenu de la matière 1. Outils de la bioinformatique2. Banques de séquences biologiques3. Recherche et similitudes entre séquences (système de scores), algorithmes et programmes de comparaison de séquences5. Liens internet

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). Frédéric Dardel, François Képès : Bioinformatique: Génomique et post-génomiqueGérard Coutouly, Emile Klein, Eric Barbieri, Mostafa Kriat : Travaux dirigés de biochimie, biologie moléculaire et bioinformatique 7Pavel A. Pevzner : Bio-informatique moléculaire: une approche algorithmiqueHarvey J. Motulsky, Annie Robert : Biostatistique: une approche intuitivewww.NCBI.com

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 156

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Découverte1Intitulé de la matière : Plantes cultivées à intérêt économiquesCrédits : 2Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignesAvoir une idée sur les différentes plantes cultivées et connaître les principales cultures à intérêt économique.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Physiologie végétale, Biologie et valorisation des plantes d’intérêt économique, techniques de production.

Contenu de la matière 1. Plantes à intérêt agroalimentaires1. 1. Céréaliculture1. 2. Arboriculture1. 2. 1. Oléiculture1. 2. 2. Viticulture1. 2. 3. phoeniciculture2. Plantes à intérêt industrielles2. 1. Plantes d’intérêt papetier et textiles2. 2. Plantes exotiques

Autres : raport de sortie

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). - Laurence Amand, Nathalie Langlois. 2009. Agriculture biologique: Les grands principes de

production et l'environnement professionnel. Educagri Editions. 235p.- Gabriel guet. 2003. Mémento d'agriculture biologique: Guide pratique à usage professionnel.

France Agricole Editions. 416p.- Nathalie Langlois, Vincent GAUCHARD, Nathalie LANGLOIS. 2010. Agriculture biologique: 

Maîtriser la conversion et ses conséquences. Educagri Editions. 106 p.- King. F. H. 2007. Irrigation and drainage principles and practice of there cultural phases. Goldberg

Press. 536 p.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 157

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 01Intitulé de l’UE : UE Transversale1Intitulé de la matière : CommunicationCrédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement  Analyser les objectifs de la communication interne et externe et présenter les méthodologies nécessaires pour conduire les principales actions de communication

Connaissances préalables recommandées Les bases linguistiques

Compétences visées  Capacité de bien communiquer oralement et par écrit - Capacité de bien présenter et de bien s’exprimer en public- Capacité d’écoute et d’échange- Capacité d’utiliser les documents professionnels de communication interne et externe- Capacité de rédiger des documents professionnels de communication interne et externe

Contenu de la matière - Renforcement des compétences linguistiques- Méthodes de la communication - Communication interne et externe- Techniques de réunion- Communication orale et écrite-

Autres : exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).P. fletcher and Coll: Education - The Handbook of Applied Linguistics Cambridge University press: Education - Cambridge Certificate In Advanced English http://www.englishclub.com/ http://www.englishclub.com/learn-english.htm

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 2Intitulé de la matière : Botanique et systématique des plantes supérieuresCrédits : 6Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 158

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Savoir Identifier et classifier les plantes

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Biologie générale, Botanique

Contenu de la matière : 1. Historique et notions générales de la bio-systématique végétale,2. intérêt de la classification en botanique : Nomenclature et terminologie en taxonomie3. Variation des végétaux et notions de l’Espèce, l’écotype, l’individu, la population et la ressemblance.4. Approches bio systématique et caractères d’identification.4. 1. Caractères morphologiques.4. 2. Caractères anatomiques et cytologiques.4. 3. Caractères chimiques et biochimiques4. 4. Caractères physiologiques et écologiques5. Evolution et classification de quelques familles d’angiospermes (Poacées, Liliacées, Rosacées, Fabacées, Brassicacées, Cucurbitacées, Solanacées, Oléacées, Composées)

Autres : Rapport de sortie

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus.

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). J. Claude : Biodiversité dynamique biologique et conservationR. Evert : Biologie végétaleR. Gorenflot : Biologie végétale et cormophytesF. Ramadé : Conservation des écosystèmes méditerranéens: enjeux et perspectives. Lucien Chancerel : Précis de botanique forestière et biologie de l'arbreFrédéric Dupont, Jean-Louis Guignard Botanique: systématique moléculaireRodolphe-Edouard Spichiger, Murielle Figeat : Botanique : systématique des plantes à fleurs: une approche phylogénétique ...Wilhelm Nultsch, R. Miesch : Botanique générale

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 2 Intitulé de la matière : Méta-génomiqueCrédits : 8Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 159

Analyse des séquences génomiques des organismes présents dans la nature. Arriver à identifier la fonction et la séquence des génomes de ces organismes.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Microbiologie, Biologie, Biologie moléculaire

Contenu de la matière Introduction 1. Philosophie de la méta-génomique2. Méta-génomique et biologie des écosystèmes 2.1. Cadres conceptuels2.2. Outils et méthodes 3. Etude des communautés microbiennes : Intégration des approches complémentaires.4. Transfert horizontal des gènes dans le micro-biome procaryote5. Méta-génomique et analyse des communautés microbiennes 6. Méta-génomique et fondation d’infrastructure mondiale de données 7. Application de la méta-génomique 7.1. Bio-remédiation. 7.2. Bioproduits industriels.

Autres : Exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Tringe et al.: Comparative Metagenomics of Microbial CommunitiesC Manichanh et al.: Reduced diversity of faecal microbiota in Crohn's disease revealed by a metagenomic approach.MARCO Diana: Metagenomics : theory, methods and applications

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 2Intitulé de la matière : Relation Plante-EnvironnementCrédits : 4Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Connaissances sur les avantages que peut procurer la relation des plantes avec les microorganismes et leurs impacts sur l’environnement: finalité de production de bio fertilisant.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Biologie générale, microbiologie générale

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 160

Contenu de la matière : 1. Introduction2. Microflore du sol (rhizosphère et symbiose racinaire)3. Types de symbiose racinaire,3.1. Symbiose mycorrhizienne.3.2. Mise en place des symbioses mycorhizienne dans les écosystèmes.3.3. Facteurs écologiques et génétiques contribuant au maintien de la symbiose mycorhizienne.3.4. Symbiose fixatrice d’azote (rhizobienne)4. Criblage phénotypique et moléculaire du partenaire symbiotique rhizobium.Présentation de la plante hôte.5. Aspects génétique et moléculaire de la symbiose (infection et nodulation).6. Intérêt de la symbiose dans l’environnement et le développement durable

NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Rapport de sortie

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). P. S. Nutman – 1976 Symbiotic nitrogen fixation in plantsSomasegaran, Heinz J. Hoben : Handbook for Rhizobia: methods in legume-rhizobium technologyY. A. Hamdi : Application of nitrogen-fixing systems in soil improvement and management www.wikipédia.comwww.Tela.botanica.comIntitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 2 Intitulé de la matière : Echantillonnage et Démarches expérimentales en biologieCrédits : 3Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Mise en place de protocole expérimental et son suivi

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Statistiques

Contenu de la matière 1. Conception, réalisation et conduite d’une expérimentation et d’essai,2. Méthodes d’échantillonnages,3. Pratique de l’échantillonnage,4. Notions générales sur les enquêtes.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 161

NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

F. Serge : Statistique pour les sciences de la vie et de l'environnementG. Cynthia : Introduction à la bioinformatiqueP. Dagnélie: Théorie et méthodes statistiques. Tome 1 et Tome 2. B. Scherer : BiostatistiqueIntitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 2Intitulé de la matière : Statistique et modélisationCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Utilisation de l’outil statistique dans l’exploitation et le traitement des données.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Mathématiques, informatique.

Contenu de la matière  1. Rappel des statistiques et applications en biologie2. Outils statistiques.3. Analyse d’une expérimentation (bio-statistique).4. Problèmes particuliers.4.1. Modélisation4.2. Différents types de modèles.4.3 Exemple de recherche et élaboration d’un modèle.5. Mesures expérimentales en biologie5.1. Conception, réalisation et conduite d’une expérimentation et d’essai.5.2. Echantillonnage et notions sur les enquêtes.

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc). F. Serge : Statistique pour les sciences de la vie et de l'environnement

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 162

G. Cynthia : Introduction à la bioinformatiqueP. Dagnélie: Théorie et méthodes statistiques. Tome 1 et Tome 2. B. Scherer : Biostatistique. http://www.kb.u-psud.fr/etudes-doctorales-et-masters/cours/Biostat/Biostat.htmhttp://www.hsph.harvard.edu/departments/biostatistics/http://www.biostat.envt.fr/spip/

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Découverte2Intitulé de la matière : Références Bibliographiques et Rédaction d’Articles ScientifiquesCrédits : 2Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Présenter les règles fondamentales d’une recherche bibliographique, rédiger les références bibliographiques, pour les principaux types de document et exploiter un article scientifique.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Références bibliographiques

Contenu de la matière 1. Recherche et classement de références,2. Règles de rédaction,3. Différentes parties d’un article et leur contenu,4. Présentation et exploitation d’articles scientifiques.

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

JEAN-MARIE M. DUBOIS : La rédaction scientifiqueLenoble-Pinson, M : La rédaction scientifique : Conception, rédaction, présentation, signalétiqueIntitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 02Intitulé de l’UE : UE Transversale 2

Intitulé de la matière : Législation

Crédits : 1Coefficients : 1

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 163

Objectifs de l’enseignement Initier l’apprenant aux notions réglementaire, les définitions et origines des textes de loi et les connaissances des conséquences pénales.

Connaissances préalables recommandées Ensembles des contenus de la formation

Compétences visées Capacité à lire et comprendre un texte de loi et capacité à appliquer une réglementation

Contenu de la matière 1. Notions générales sur le droit (introduction au droit, droit pénal).2. Présentation de législation algérienne (www.joradp.dz, références des textes).3. Règlementation générale (loi sur la protection du consommateur, hygiène, étiquetage et information, additifs alimentaires, emballage, marque, innocuité, conservation).4. Règlementation spécifique (travail personnel, exposés).5. Organismes de contrôle (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML).6. Normalisation et accréditation (IANOR, ALGERAC).7. Normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR)

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Control continu et examen

Références   (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

Sites internetwww.biodiv.org/biosafetywww.bioresurse.rowww.fao.orgwww.isaaa.orgIntitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 3 Intitulé de la matière : Méthodologie et Approche de l’Amélioration Génétique des PlantesCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Techniques et méthodes de l’amélioration génétique des plantes.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Génétique, amélioration des plantes, biologie de la reproduction végétale.

Contenu de la matière1. bases de l’amélioration génétique des plantes, stratégies de sélection et création de variétés

(lignés pures, population, hybrides).2. Croisements interspécifiques et inter génériques.3. Sélection et amélioration assistées par marqueurs moléculaires et QTL.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 164

4. Amélioration pour objectifs spécifiques biotiques et abiotiques : Evolution moléculaire et variation de gène candidats

5. Etude de plante modèle : Cas de blé.

Autres : Exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Gérard Tobelem, Pascale Briand : Biotechnologies et droit de savoirClaude Durand : Regards sur les biotechnologiesDominique de Vienne : Les marqueurs moléculaires en génétique et biotechnologies végétalesJean-Pierre Baudoin, Julien Demol, Benoît-Pascal Louant, Robert Maréchal, Guy Mergeai : Amélioration des plantes: application aux principales espèces cultivées Serge Hamon : Des modèles biologiques à l'amélioration des plantesGeorges Valdeyron Génétique et amélioration des plantes F. Bœuf : Les bases scientifiques de l'amélioration des plantes

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 3 Intitulé de la matière : Technologies de la Culture in VitroCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement : Maîtrise et exploitation expérimentale des différents aspects de

biotechnologie végétale dans les programmes d’amélioration des plantes.

Connaissances préalables recommandées : biologie végétale, biologie cellulaire, génétique.

Contenu de la matière 1. Introduction

2. Clonage végétale et variation soma-clonale

3. Culture de méristèmes et de bourgeons

4. Culture d’embryons

5. Culture de protoplastes et hybridation somatique

6. Culture de cellules isolées (support solide et en agitation)

7. Culture d’anthère et de pollen

8. Culture d’ovaires et d’ovules

Autres : Exposés

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 165

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus

Références - Gérard Tobelem, Pascale Briand : Biotechnologies et le droit de savoir

- Claude Durand : Regards sur les biotechnologies

- Pierre Douzou : Les biotechnologies

- Dominique de Vienne : Les marqueurs moléculaires en génétique et biotechnologies

végétales

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Fondamentale 3Intitulé de la matière : Biologie des Produits Végétaux et Bio-industriesCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Connaissance sur le métabolise secondaire de la plante et utilisation de ses produits dans l’industrie

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Biochimie

Contenu de la matière1. Organe de réserve, fibres alimentaires et agents de texture 2. Extraction et isolement des constituants d’intérêt économique (sucre, protéines, lipides, amidon,

bois, fibres, papiers et textiles) 3. Bases biologiques de consommation des produits végétaux (utilisation industrielle)4. Produits du métabolisme secondaire et leurs utilisations : Alimentaires, cosmétiques et parapharmaceutiques

Autres : Exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Michèle Mosiniak, Roger Prat : Les textiles d'origine végétaleIntitulé du Master : Biotechnologies Végétales et méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 3Intitulé de la matière : Préservation et conservation des ressources Phytogénétiques Crédits : 3Coefficients : 2

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 166

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes) :

Connaître l’état des lieux de la biodiversité en milieu steppique et déterminer les moyens de conservation des ressources phytogénétiques via l’apport des biotechnologies végétales et l’utilisation des techniques récentes de génie génétique

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Connaissances en écologie, Génétique et biodiversité végétale.

Contenu de la matière1. Ressources phytogénétiques 1. 1. Etat des lieux et perspectives d’amélioration 1. 2. Préservation et conservation des ressources phytogénitiques1. 2. 1. Pratiques culturales conventionnelles 1. 3. Etude de plante modèle : Palmier dattier (phœnix dactylefera L.) 1. 3. 1. Diversité génétiques du palmier dattier (variétés femelles ou Nekhla et variétés males ou Dhokkar).1. 3. 2. Variétés cultivées et variétés rares 2.. Stratégies en amélioration des ressources phytogénétiques2. 1. Multiplication végétative 2. 2. Régénération in vitro et culture des tissus.

Autres : Exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références - Léveque, Ch, 2008. La biodiversité au quotidien-Le développement durable à l'épreuve des faits., Paris. 304p.- Dajoz, Roger. 2008. La biodiversité : l'avenir de la planète et de l'homme.. 275p.- Munier, P. 1973. Le palmier dattier. G.-P. Maisonneuve et Larose, Paris. 217p.

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et Méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Méthodologie 3 Intitulé de la matière : Organisation et Valorisation de la recherche scientifiqueCrédits : 6Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).Mécanismes et procédures liés à la recherche scientifiques.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 167

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).Exploitation des articles scientifiques

Contenu de la matière I. Organisation de la recherche1. Conditions de la production scientifique2. Recherche et environnement socio-économique.3. Regroupement des chercheurs et leurs modes d’actions. (Association, sociétés savantes, congres).4. Organisation du travail de recherche.II- Valorisation de la recherche1. Publications et diffusion des résultats de la recherche.2. Institutions spécialisées dans la valorisation de la recherche (agences, bureau d’étude,Incubateurs…).3. brevets d’inventeurs scientifiques.4. création d’entreprise.

Autres : Exposés

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances et contrôles continus

Références   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).Morin S. : Encadrement à la rechercheOUELLET A. : Processus de recherche, Approche systémique.

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et Méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Découverte 3 Intitulé de la matière : Microorganismes du sol et Symbiose VégétaleCrédits : 2Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement : Connaissance des avantages que peut procurer la relation des

plantes avec les microorganismes: finalité de production de bio fertilisant.

Connaissances préalables recommandées : Biologie générale, microbiologie générale.

Contenu de la matière 1. introduction

2. Microflore du sol, rhizosphère et symbiose racinaire,

a. Symbiose mycorrhizienne.

b. Mise en place des symbioses mycorrhizienne dans les écosystèmes.

c. Facteurs écologiques et génétiques contribuant au maintien mycorrhizienne.

d. Symbiose fixatrice d’azote (rhizobienne)

3. Criblage phénotypique et moléculaire du partenaire symbiotique :

Rhizobium - plante hôte.

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 168

3. Aspects génétique et moléculaire de la symbiose : infection et nodulation.

4. Intérêt de la symbiose dans l’environnement et le développement durable

NB : Travaux dirigés se rapportent aux différents chapitres du cours.

Autres : Rapport de sortie

Mode d’évaluation : contrôles de connaissances et contrôles continus.

Références :P. S. Nutman – 1976 Symbiotic nitrogen fixation in plants

Somasegaran, Heinz J. Hoben : Handbook for Rhizobia: methods in legume-rhizobium technology

Y. A. Hamdi : Application of nitrogen-fixing systems in soil improvement and management

Intitulé du Master : Biotechnologies Végétales et Méta-génomiqueSemestre : 03Intitulé de l’UE : UE Transversale 3 Intitulé de la matière : Entreprenariat et Gestion des ProjetsCrédits : 1Coefficients : 1

Objectifs de l’enseignement : Initier l’apprenant au montage de projet, son lancement, son suivi et sa réalisation.

Connaissances préalables recommandées : Ensembles des contenus de la formationCompétences visées :Compréhension de l’organisation et de fonctionnement d’une entreprise, capacité à monter un projet de création d’entreprise, lancer et gérer un projet, capacité à travailler méthodiquement, capacité à planifier et à respecter les délais, capacité à travailler en équipe et capacité d’être réactif et proactif.

Contenu de la matière 1. L’entreprise et gestion d’entreprise1. 1. Définition et organisation d’entreprise1. 2. Gestion des approvisionnements : Gestion des achats, gestion des stocks et organisation des magasins

1. 3. Gestion de la production : Mode de production, politique de production

1. 4. Gestion commerciale et Marketing : Politique de produits, politique de prix, publicité et techniques et équipe de vente2. Montage de projet de création d’entreprise2. 1. Définition d’un projet

2. 2. Cahier des charges de projet

2. 3. Les modes de financement de projet

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 169

2. 4. Les différentes phases de réalisation de projet

2. 5. Le pilotage de projet

2. 6. La gestion des délais

2. 7. La gestion de la qualité

2. 8. La gestion des coûts

2. 9. La gestion des tâches

Autres : Compte rendu

Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…Contrôles de connaissances

Références :   (Livres et polycopiés, sites internet, etc).G. Pillet : Economie de l’environnement / Ecologie de l’économieA. Heyes : The law and economics of the environment

Etablissement : Université M. BOUDIAF, Msila Intitulé du master : Biodiversité et Physiologie VégétaleAnnée universitaire : 2016/2017 Page 170