1 Service de Bactériologie Département des Maladies infectieuses et parasitaires Faculté de Médecine Vétérinaire Chapitre 5: Les grands groupes bactériens

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Service de BactériologieDépartement des Maladies infectieuses et parasitaires

Faculté de Médecine Vétérinaire



Chapitre 5:

Les grands groupes bactériens

Chapitre 5:

Les grands groupes bactériens

Cours de bactériologie3ème candidature


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Les grands groupes bactériensLes grands groupes bactériens

Plan général du chapitrePlan général du chapitre

Taxonomie Nomenclature Systématique des bactéries d’intérêt médical

Taxonomie Nomenclature Systématique des bactéries d’intérêt médical

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• Critères historiques de classification

• morphologie: protozoaires, bactéries

• coloration: Gram, Ziehl-Neelsen, Giemsa, Köster

• biochimie: biotypage (= galerie biochimique)

• moléculaires: - chaînes métaboliques

- enzymes respiratoires

- membrane externe

- paroi

- génétique: ADN et ARNr

Taxonomie

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espèce: ≥ 70 % d’homologie des chromosomes

ΔTm entre les chromosomes homologues et hybrides ≤ 5°C

! critères phénotypiques simples !

(E.) coli et (S.) enterica

genre, famille: membrane, paroi, enzymes,…

Escherichia et Salmonella, Enterobacteriaceae

ordre, classe: séquences des ARNr

Enterobactériales, Gammaproteobactéries

embranchement (= phylum), série, division, règne, domaine: critères supérieurs: morphologie, structure, …

Protéobactéries, (série), Gracilicutes, (règne), (Eu)bactéries

• Critères actuels de classification Taxonomie

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« Ce n’est pas le bactériologiste qui s’amuse

à rendre le monde bactérien complexe

mais ce dernier qui, petit à petit,

révèle sa complexité au bactériologiste »

« Ce n’est pas le bactériologiste qui s’amuse

à rendre le monde bactérien complexe

mais ce dernier qui, petit à petit,

révèle sa complexité au bactériologiste »

• Ne tirez pas sur le professeur Taxonomie

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Binomiale en LATIN(en italique OU souligné)

Origine: - homme « célèbre »

- morphologie

- culture

- biochimie

- géographie

- pathologie

• Principes Nomenclature

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Famille M-aceae Enterobacteriaceae

Genre M Salmonella Escherichia

Espèce m subterranea coli bongori fergusonii enterica hermanii

vulneris

Sous-espèce subsp m enterica houtenaearizonae indicadiarizonae salamae

• Exemple Nomenclature


Pathotype (Pathovar)- Escherichia coli sérovar O101:K30:H- pathovar entérotoxinogène ou ETEC (STa+ F5+) des diarrhées du veau nouveau-né- Escherichia coli sérovar O141:K85:H- pathovar vérotoxinogène ou VTEC (Stx2e+ F18+) de la maladie de l’œdème du porcelet sevré

Biotype (Biovar)- Brucella melitensis biovars Melitensis (3), Abortus (7), Suis (5), Ovis, Canis, Neotomae

Sérotype (Sérovar) - Salmonella enterica sérovar Typhimurium- Leptospira interrogans sérovar Icterohaemorrhagiae- Escherichia coli sérovar O101: K30: H-- Streptococcus canis (séro)groupe G- Les biovars de Brucella melitensis sont subdivisées en sérovars A, M ou RLysotype (Lysovar)- Brucella melitensis biovar Abortus sérovar A lysovar Tbilissi- Salmonella enterica sérovar Typhimurium lysovar DT104

• Au-delà de l’espèce/sous-espèce Nomenclature

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C. Importance médicale en denrées alimentaires d’origine animale (DAOA)- intoxications alimentaires chez l’homme

A. Définition- forme/assemblage, coloration de Gram- rapport avec l’oxygène (aérobie, anaérobie, microaérobie, …)- catalase, oxydase, mobilité, sporulation- métabolisme (R et/ou F), test O/F (F, O, -, non applicable)- colorations de Ziehl-Neelsen, de Giemsa, de Köster

B. Biologie- habitat, résistance dans le milieu extérieur- pouvoir pathogène: obligé, opportuniste, absent- espèces pathogènes, syndromes cliniques et hôtes

D. Importance en technologie des DAOA- détérioration des denrées alimentaires- mauvaise fabrication

Systématique des bactéries d’intérêt medical

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Les grands groupes bactériens Gram+Les grands groupes bactériens Gram+

Longs et minces filaments spiralés Gram- (Gracilicutes)- aérobies; microaérobies; anaérobies; non cultivables

Coques Gram+ (Firmicutes) - catalase+; catalase-Bâtonnets Gram+ (Firmicutes)- petits réguliers; petits irréguliers; ramifiés; grands réguliersBactéries Gram+ sans paroi (Mollicutes)- les « mycoplasmes »

Bactéries Gram- intracellulaires obligées (Gracilicutes)- avec ou sans hôtes intermédiaires

Coccobacilles et bâtonnets Gram- poussant sur Gassner (Gracilicutes)- oxydase- O/F:F; oxydase+ O/F:O; oxydase+ O/F:F; oxydase+ O/F:-Coccobacilles, bâtonnets, filaments et coques Gram- ne poussant pas sur Gassner (Gracilicutes)- aéro-anaérobies, métabolisme R&F, O/F:F; aérobies, métabolisme R, O/F: O ou nég; microaérobies, métabolisme R, O/F: NA; anaérobies facultatives, métabolisme F, O/F:F; anaérobies strictes, métabolisme F, O/F:NA

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Coques

Bâtonnets

Staphylococcusaéroanaérobies O/F:F amas en grappes

Micrococcusaérobies O/F:O ou nég., amas en grappes

Streptococcus anaérobies facultatifsEnterococcus O/F:FLactococcus chaînes(+ technologie DAOA)

Peptococcus anaérobies stricts Peptostreptococcus O/F:NA chaînes

Aerococcus aéro-(anaérobies)viridans O/F:F

chaînes

Gram +

Catalase +

Catalase -

Catalase faible ou nég.

Oxydase -

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Les grands groupes bactériens GRAM+Les grands groupes bactériens GRAM+

StaphylococcusStreptococcusEnterococcus

A. Définition

Coques (0,5 – 1,5 µm)

mobilité -spores -

test O/F: F

aéroanaérobies anaérobies facultatifs

catalase –catalase +

métabolisme Fmétabolisme R&F

Amas irréguliers (3 plans de division) Chaînettes (1 plan de division)

Sérotypie: Groupes de Lancefield


• saprophytes: eau, air, sols, animaux

peau, nasopharynx, génital, intestin (lait)• + ou – résistant aux conditions extérieures

• pathogènes opportunistes

Staphylococcus StreptococcusEnterococcus

B. Biologie

suppuration et abcès superficiels et profonds, mammites, rhinites, …

troubles digestifs (genre Enterococcus)

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StaphylococcusStreptococcusEnterococcus

Staph. aureus BB, CV, HO

Stap. intermedius CN, CT, CV

Staph. hyicus PC

Staph. schleiferi CN

troubles cutanés, otites, bactériémies, abcès, mammites, …

Str. agalactiae, dysgalactiae subsp. dysgalactiae, uberis BBmammites Str. equi subsp zooepidemicus, equi subsp. equi, dysgalactiae subsp. equisimilis CVtroubles respiratoires, génitaux & cutanés Str. equisimilis, porcinus, suis PCtroubles respiratoires, abcès, endocardite Str. canis, groupe L CNtroubles respiratoires, génitaux & cutanés Str. iniae, melleri, difficilis,… Poissonstroubles cutanés et internes (abcès, ulcères) Ent. faecalis, faecium… Tousbactériémie, abcès Aerococcus viridans Tousbactériémie, endocardite, méningite (rare)

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C. Importance au niveau des denrées alimentaires (pour l’homme)

Staphylococcus aureus, intermedius, hyicus, epidermidis

intoxication alimentaire: vomissements, coliques, diarrhée

évolution favorable en 24h (le + souvent)

production d’une ou plusieurs entérotoxine(s)

Enterococcus sp. = indicateur de contamination fécale des aliments

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Importance technologique dans la fabrication de certaines denrées

Enterococcus faecalis

maturation des fromages/flaveur prononcée des fromages mûrs

Lactococcus lactis

production d’acide dans le cadre des fermentations du lait

Enterococcus sp., Lactococcus sp., Leuconostoc sp., Pediococcus sp., Streptococcus sp.,… = « famille Streptococcaceae »

D. Autres genres d’intérêt technologique

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-Listeriaaéroanaérobie, catalase +, O/:F- Erysipelothrixanaérobie facultative, catalase -, O/F:F- Renibacteriumaéroanaérobie, catalase +, O/F:F- Lactobacillus, Carnobacterium (technologie DAOA)

Gram +

Coques

Bâtonnets

longs (ramifiés)

grands, réguliers, sporulés

petits, réguliers

petits, irréguliers


A. Définition

Listeria Erysipelothrix Renibacterium

catalase -

anaérobies facultatives

métabolisme F

amas intraleucocytairesfilaments

aéroanaérobies

catalase +

métabolisme R&F

aéroanaérobies

catalase +

métabolisme R&F

(mobilité + à 25°C)

petits bâtonnets réguliers

mobilité -

spores -

en paires = _ _ /

(0,5 x 1,0-2,0 µm) (0,2 x 1,0-2,0 µm) (0,3-1,0 x 1,0-1,5 µm)

test O/F: F

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Listeria Erysipelothrix

B. Biologie

Renibacterium

• saprophytes: sols, plantes, eaux, animaux

tube digestif tube digestif (mammifères, organes internes(homme, ruminants) oiseaux, poissons)

• résistants dans le milieu extérieur

• pathogènes opportunistes pathogène obligé

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Listeria monocytogenesBB, OV, HO, rongeurs

Listeria ivanovii OV Erysipelothrix rhusiopathiae

PC, OV, HO

Renibacterium

Renibacterium salmoninarumSalmonidés

« Listériose » « Rouget » « Bacterial Kidney Disease »

Troubles nerveux, Septicémie, arthrose, Néphrite avortements dermatite granulomateuse

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Listeria monocytogenes

Sources: lait non ou mal pasteurisé, fromage, plats semi-préparés, …

femme enceinte: avortement, naissance prématurée d’un

nouveau-né infecté

méningo-encéphalite ou septicémie chez l’adulte

(surtout immunodéprimés)

Renibacterium

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Erysipelothrix rhusiopathiae

contamination par voie digestive exceptionnelle

forme cutanée suite à des blessures lors de manipulation de

carcasses, de poissons, de crustacés, d’abats…

septicémie et endocardite rares (immunodéprimés)


Renibacterium

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Carnobacterium spp

Lactobacillus spp

Certaines espèces sont testées/utilisées comme probiotiques dans les aliments, voire chez l’animal

Petits bâtonnets réguliers

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- Corynebacteriumaéroanaérobie, catalase +, O/F:F- Rhodococcusaérobie strict, catalase +, O/F:O- Arcanobacteriumanaérobie facultative, catalase -, O/F:F- Actinobaculumanaérobie stricte, catalase -, O/F:NA- Brevibacterium, Propionibacterium(technologie DAOA)

Gram +

Coques

Bâtonnets

longs (ramifiés)


petits, réguliers


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petits bâtonnets irréguliers à coques (0,5 x 0,5-3,5 m): CORYNEFORMES

mobilité -spores -

associations en paires = _ _ /

A. Définition

Corynebacterium ActinobaculumRhodococcus Arcanobacterium

aéroanaérobies anaérobiesfacultatives

aérobiesstricts

anaérobiesstrictes

catalase + catalase -catalase + catalase -

métabolisme R&F métabolisme Fmétabolisme R métabolisme F

O/F: F O/F: NAO/F: O O/F: F


B. Biologie

• résistance faible

• parasites: animaux

peau, tractus urogénital

• résistances moyennes

• saprophytes: sols, plantes, animaux

peau, tractus urogénital, tractus respiratoire supérieur, intestin



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C. diphteriae HOdiphtérie (croupe) C. pseudotuberculosis OV (ovis) CVlymphadénites (OV), lymphangites, abcès cutanés (CV)

C. renale C. pilosum BB, OV C. cystitidiscystite, pyélonéphrite, posthite

C. kutscheri rongeurstroubles respiratoires, généraux

Rhodococus equi CV (PC)pneumonie, entérite (CV) lymphadénite (PC)

Arc. pyogenes BB, PCabcès cutanés et internes, mammites, troubles respiratoires

Act. suis PC(comprend les anciennes espèces Eubacterium suis et Actinomyces suis)

cystite, pyélonéphrite, actinophytose de la mamelle


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Petits bâtonnets irréguliers

Propionibacterium spp

Brevibacterium linens

Exemples: P. freudenreichii formation des yeux dans les fromages

(ex: emmental) via production de CO2 à partir d’acide lactique

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3 GENRES anaérobies stricts à facultatifs, catalase -, O/F:NA- Dermatophilus : bactéries coccoïdes- Actinomyces: bactéries corynéformes(une espèce aérobie stricte, catalase +, O/F:O)- Bifidobacterium(technologie DAOA)

2 GENRESaérobies stricts, catalase +, O/F: O ou nég.- Mycobacterium: coccobacilles à bâtonnets, acido-résistance totale, non ramifié- Nocardia: filaments, acido-résistance partielle, ramifié

Gram +

Coques

Bâtonnets

longs (ramifiés)


petits, réguliers


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Les grands groupes bactériens GRAM+Les grands groupes bactériens GRAM+Dermatophilus Actinomyces

A. Définition

spores -

cocciforme streptoccociforme branchements séparation

bâtonnets filamentsbranchements septation

- petits bâtonnets corynéformes- bactéries coccoïdes (1 m)- association en «streptocoques» branchés - longs filaments ramifiés

(0,2 -1,0 x 10 - 50 µm)(5 -20 µm de longueur)

anaérobies strictes, facultatives(A. viscosus: aérobie stricte)(microaérophiles)

(catalase +)

(métabolisme R)

(O/F: O)

mobilité -mobilité +

catalase -

métabolisme F

O/F: NA

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Dermatophilus Actinomyces

B. Biologie


• résistance moyenne

• parasites des animaux

muqueuses digestives (de la bouche à l’anus), peau

• résistance faible

• parasite obligé des animaux

peau

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Dermatophilus Actinomyces

D. congolensis CV, OV, BBCN, CT, CP

« Strawberry foot rot »« Lumpy wool » OVDermatite mycotique

Streptothricose BBDermatite mycotique CV

problèmes cutanés(Dermatite proliférative contagieuse)

Act. bovis BB

Act. viscosus CN Act. hordeovulneris

Act. israeli HO

« actinophytoses » ou granulomes inflammatoiresavec problèmes cutanés, buccaux, osseux, digestifs, respiratoires, mammaires

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Mycobacterium Nocardia

A. Définition

aérobiescatalase +mobilité -spores –

métabolisme R(test O/F: O ou -)

Bâtonnets(filaments)

(0,2-0,6 x 1,0-10,0 m)

filaments

(0,5-1,5 x > 10,0 m)

filaments non branchéssans fragmentation

filaments branchésavec fragmentation

acido-résistance totale(Ziehl-Neelsen)

acido-résistance partielle(Ziehl-Neelsen modifié)

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B. Biologie

pathogènes opportunistesà obligés

pathogènes opportunistes

• Saprophytes des sols, de l’air, des eaux,…

• Parasites des animaux

peau, muqueuses

• Forte résistance

• Pathogènes intracellulaires facultatifs

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Les grands groupes bactériens GRAM+Les grands groupes bactériens GRAM+Mycobacterium Nocardia

Myc. bovis BB (CN, CT, HO)tuberculosis HO (CN, CT, PC)caprae CPavium subsp. avium gallinacésavium subsp. sylvaticum pigeons (ramiers)avium subsp. hominisuis PC, HOgenavense psittacidés

tuberculoses: troubles variables, lésions dans de multiples organes Myc. avium subsp. paratuberculosisparatuberculose: diarrhée BB, OV (CP) Myc. leprae HO (CT)lèpre humaine et féline Mycobacterium sp. toutestuberculoses atypiques Myc. marinum, fortuitum, chelonae, abscessus tuberculoses poissons

Nocardia asteroides CN, BB,

poissonsnocardiose: troubles cutanés, respiratoires et mammaires

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Mycobacterium bovis

Sources: lait cru, non ou mal pasteurisé fromages à base de lait cru

peut évoluer vers une tuberculose pulmonaire ou extra-pulmonaire

primo-infection passe inaperçue et guérison des lésions

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D. Autre genre d’intérêt technologique

Bâtonnets ramifiés

Bifidobacterium spp

Certaines espèces sont testées/utilisées comme probiotiques dans les aliments

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- Bacillus, Paenibacillus, Melissococcus aérobies, catalase +, O/F:Oaéroanaérobies, catalase +, O/F:F- Clostridiumanaérobies strictes, catalase -, O/F:NA- Alicyclobacillus(technologie des DAOA)

Gram +

Coques

Bâtonnetslongs (ramifiés)

grands, réguliers, sporulants

petits, réguliers


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isolés, en paires, en chaînes de longueur variablebactéries sporulantes

Bacillus, Paenibacillus, Melissococcus Clostridium

A. Définition

grands bâtonnets réguliers (0,5 – 1,0 x 2,5 – 20 µm)

mobilité + ou –spores +

aérobies strictes ouaéroanaérobies anaérobies strictes

catalase + catalase -

métabolisme R ou R&F métabolisme F

test O/F: O ou F test O/F: NA

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Clostridium

SPORESSPORES

centrales, paracentrales, subterminales, terminales

• ellipsoïdes non déformantes• ellipsoïdes déformantes• sphériques déformantes

• ellipsoïdes déformantes• sphériques déformantes

• O2 indispensable • O2 inhibitrice

• chute en nutriments • conditions hostiles(toxiques …)

Coloration de Ziehl-Neelsen modifiée pour sporesRésistances mécaniques, physiques, chimiques et biologiques

Bacillus, Paenibacillus, Melissococcus

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Clostridium

B. Biologie• saprophytes: air, eaux, sols, animaux

peau, muqueuses, intestins

• résistance: faible de la forme végétative, forte de la spore

• très nombreuses espèces non pathogènes

• quelques espèces pathogènes obligés ou opportunistes

Septicémie (= charbon bactéridien ou anthrax)MammitesLoques des abeilles (couvin)

Entérites/entérotoxémies/abomasiteHépatites Gangrène (gazeuse)Myosites (= charbons bactérien et parabactérien)Tétanos, botulisme


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Bacillus anthracis BB, HO, PC, charbon bactéridienCV, (autres) (septicémie hémorragique)

Bacillus cereus BB mammites

Paenibacillus larvae Abeilles maladies du couvin= loque américaine= « Powdery scale »

Melissococcus plutoniusAbeilles maladie du couvin= loque européenne


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Cl. chauvoei BB charbon bactérien (myosite) Cl. septicum Tous charbon parabactérien (myosite),

gangrènegazeuse, abomasite (braxy), dermatite

Cl. perfringens Tous entérites, entérotoxémies, gangrène Cl. novyi OV (BB) hépatite nécrosante, gangrène Cl. haemolyticum BB hépatite nécrosante Cl. sordellii Ruminants entérites, entérotoxémies Cl. spiroforme Lapins entérites, entérotoxémies Cl. piliforme CV, CN, CT, hépatite, entérite, myocardite

rongeurs Cl. difficile HO (animaux) entérites Cl. colinum oiseaux entérites, hépatite Cl. tetani Tous paralysie spastique (tétanos) Cl. botulinum Tous paralysie flasque (botulisme)

Cl. argentinense HO

Clostridium

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Clostridium


Bac. cereus, subtilis (thurigiensis dans une moindre mesure)

forme émétique et forme diarrhéique (souvent bénignes, parfois mortelle)

Cl. perfringens

affection intestinale bénigne de courte durée (toxinotype A entérotoxinogène)

entérite nécrosante (toxinotype C)

Cl. botulinum

botulisme d’origine alimentaire (paralysie flasque)

Sources: conserves,….


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Clostridium

D. Altération des denrées alimentaires (goût, couleur, odeur, …)

Exemple #2: Cl. tyrobutyricum gonflement des fromages dû à la

production de gaz (H2) + odeur et goût désagréables (acide butyrique)

Bacillus spp

Alicyclobacillus spp

Cl. tyrobutyricum

Cl. butyricum

Cl. estertheticum

Exemple #1: Al. acidoterrestris dégradation des produits (jus de fruits)

goût médicamenteux, odeur désagréable

Bacillus, Alicyclobacillus

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Classe des Mollicutes: bactéries sans paroi

(= les mycoplasmes)

CLASSIFICATION

4 ordres: Mycoplasmatales, Entomoplasmatales, Acholeplasmatales, Anaeroplasmatales

5 familles: Mycoplasmataceae, Entomoplasmataceae, Spiroplasmataceae, Acholeplasmataceae, Anaeroplasmataceae

8 genres: Mycoplasma, Ureaplasma, Entomoplasma, Mesoplasma, Spiroplasma, Acholeplasma, Anaeroplasma, Asteroleplasma

>200 espèces: certaines espèces des genres Mycoplasma (surtout), Ureaplasma et Acholeplasma peuvent être pathogènes pour les animaux ou l’homme

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Les grands groupes bactériens GRAM+Les grands groupes bactériens GRAM+Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma

A. Définition

• coques, coccobacilles (très petits ~ 0,1 µm), filaments ramifiés

• Gram + (génétiquement) MAIS PAS de paroi coloration Gram -

• anaérobies facultatifs ou stricts (microaérobies)

• mobilité –

• métabolisme F

• O/F: F (ou -)

• coloration de Giemsa

• exigences nutritionnelles (par exemple cholestérol), paasent au travers des filtres (0,22 m) car petitesse et forme malléables

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Mycoplasma - Ureaplasma - Acholeplasma

B. Biologie

• Parasites obligés des organismes supérieurs (animaux, plantes)

• La plupart des espèces sont saprophytes

• Quelques espèces sont pathogènes opportunistes ou primaires

• Résistance faible à moyenne dans le milieu extérieur

• -lactamesR, bacitracineR

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Mycoplasma BB

mycoides subsp. mycoides SC*** pleuropneumonie contagieuse

sp. bovine group 7 pneumonies, arthrites, mammites

bovis*****

dispar*** pneumonies

californicum, canadense mammites

alkalescens arthrites

bovigenitalium troubles génitaux, mammites

bovoculi conjonctivites


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Mycoplasma OV, CP

capricolum subsp. capripneumoniae*** pleuropneumonie contagieuse (CP)

capricolum subsp. capricolum mammites, arthrites,

mycoides subsp. capri pneumonies, kératoconjonctivites,

mycoides subsp. mycoides LC septicémies (CP)

ovipneumoniae*** pneumonie (Agneau)

conjonctivae*** kératoconjonctivite infectieuse (OV)

agalactiae*** mammites, arthrites


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Mycoplasma PC

hyopneumoniae***** pneumonie enzootique

hyorhinis*** pneumonies, polysérosites

hyosynoviae*** arthrites

(haemo)suis* anémie(ex-Eperythrozoon suis) (troubles de la reproduction)


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Mycoplasma CN, CT, CV

cynos/canis*** troubles respiratoires (CN)

haemocanis anémie (CN)(ex-Haemobartonella canis)

felis** troubles respiratoires, conjonctivite (CT) pleurésie (CV)

haemofelis**** anémie infectieuse féline (CT)(ex-Haemobartonella felis)


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gallisepticum*** troubles respiratoires (poulet)sinusite, aérosacculite (dindon)

meleagridis*** aérosacculite, sinusite, arthrites (dindon)

synoviae*** aérosacculite, arthrites, ténosynovites

iowae légère aérosacculite

anseris troubles respiratoires (oie)


Mycoplasma Volaille

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arthritidis*** Arthrites (rats) pulmonis*** Troubles respiratoires et génitaux (rats et souris)

Ureaplasma*

diversum BB Avortements, troubles génitaux

Acholeplasma*

oculi Tous Conjonctivites equifetale CV Avortements (?) axanthum Oie Aérosacculite


Mycoplasma Rongeurs

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Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-





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Gram -

Gassner +coccobacilles

ou bâtonnets,

catalase +

Gassner -

E coliKlebsiellaEnterobacter

SalmonellaProteusYersinia

Pseudomonas PseudomonaceaeBurkholderia aérobies strictesStenotrophomonas oxydase +, O/F:O

Vibrio VibrionaceaeListonella aéro-anaéobiesAeromonas oxydase +, O/F:FPlesiomonas

Bordetella AlcaligenaceaeAlcaligenes aérobies strictes

oxydase +, O/F:-

Enterobacteriaceaeaéro-anaérobies,oxydase -, O/F:F

lactose +

lactose -

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A. Définition


Enterobacteriaceae Vibrionaceae Pseudomonaceae Alcaligenaceae

catalase +

mobilité +/-

spores -

aéroanaérobies aérobies strictes

oxydase - oxydase +

test O/F: F test O/F: O test O/F: -

métabolisme R&F métabolisme R

coccobacilles bâtonnets droits bâtonnets droits coccobacilles ou incurvés à bacilles

(0,3-1,0 x 1,0-6,0 m) (0,5-1,0 x 1,5-3,5 m) (0,5-1,0 x 1,5-5,0 m) (0,2-0,8 x 0,5-2,5 m)


B. Biologie

Enterobacteriaceae

• saprophytes: air, sols, eaux, végétaux, animaux

intestin, peau

• résistance à la dessication (plusieurs mois)

• saprophytes, pathogènes opportunistes ou obligés

plaies, surinfections, diarrhées, cystites,mammites,… septicémies, méningites,…

• subdivision en nombreux sérovars avec une relative spécificité d’hôte

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Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Enterobacteriaceae

• coliformes: Gassner + lactose + (= fermentation du lactose) Escherichia coli***** Diverses tous (voir dia 12 aussi) Klebsiella pneumoniae** Diverses HO (animaux) Enterobacter sp.** Plaies HO, CV (autres) Pantoea (ex-Enterobacter) sp. Plaies, otites tous (rare)

• autres: Gassner + lactose – (pas de fermentation du lactose) Salmonella enterica***** Diverses tous (voir dias 11 & 12) Yersinia pseudotuberculosis*** Généralisée rongeurs, passereaux Y. enterocolitica*** Entérite HO (animaux) Y. pestis** Peste Y. ruckeri Généralisée poissons Edwardsiella tarda** Généralisée, entérite poissons, HO (autres) Ed. ictaluri Généralisées poissons Proteus sp.****, Morganella sp.* Surinfections tous Serratia sp.*, Providencia sp.* Shigella sp.* Entérite, dysenterie HO, primates

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Salmonella enterica subsp. enterica: animaux à sang chaud (mammifères et oiseaux) subsp. arizonae: animaux à sang froid (chaud) + environnement subsp. diarizonae: animaux à sang froid (chaud) + environnement subsp. houtenae: animaux à sang froid + environnement subsp. indica: animaux à sang froid + environnement subsp. salamae: animaux à sang froid + environnement

Salmonella bongori : animaux à sang froid + environnement Salmonella subterranea : environnement

Le genre Salmonella: les espèces et sous-espèces actuelles

Voir aussi fascicule de notes partie 2 pour la comparaison entre nouvelle et ancienne nomenclatures

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Escherichia coli: sérovars O:K:H:F O78:K-:H-:F11: colibacillose généralisée de la volaille O101:K30:H-:F5: diarrhée du veau nouveau-né O103:K-:H-:F-: entérite du lapereau O141:K85:H-:F18: maladie de l’œdème du porcelet O157:K-:H7:F-: entérocolite hémorragique de l’homme

Salmonella enterica: sérovars O:H Typhimurium (O1,4,5,12:H1,2): tous les mammifères Typhimurium variété Copenhagen (O1,4,12:H1,2): pigeon Dublin (O6,8:He,n,x): plutôt associé au bovin Hadar (O1,9,12:H-): diverses espèces, dont le cheval et la volaille Choleraesuis (O6,7:H1,5): plutôt associé au porc

Subdivisions en sérovars: quelques exemples

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Enterobacteriaceae


Escherichia coli

Souches entérotoxinogènes (ETEC): diarrhée du voyageur (une des composantes de la turista)

Souches entérohémorragiques (EHEC O157:H7 et autres): - colite hémorragique- syndrome hémolytique et urémique (HUS)

N.B: E. coli = indicateur de contamination fécale des aliments (cfr Enterococcus)

Enterobacter sakazakii

méningite néonatale, septicémie, entérocolite nécrosante(rare, surtout prématurés et bébés immunodéprimés)

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Enterobacteriaceae


Salmonella enterica subsp. enterica

Sérovars Typhimurium, Enteritidis, … :gastro-entérites + ou - sévères selon la souche, la dose ingérée, …

Sérovars Typhi et Paratyphi (spécifiques de l’homme) :fièvres typhoïde et paratyphoïde

Shigella dysenteriae, Sh. sonnei, Sh. flexneri

dysenterie bacillaire (diarrhée hémorragique)

66


Enterobacteriaceae


Yersinia enterolitica (Y. pseudotuberculosis)

principalement responsables de gastro-entérites fébriles

forme septicémique (immunodéprimés, diabète, cirrhose,…)

Edwardsiella tarda

gastro-entérite aiguë (plus rare)

67


Enterobacteriaceae

D. Altération des denrées alimentaires (goût, couleur, odeur,…)

Proteus sp.

Erwinia sp.

Serratia sp.

Providencia sp.

Morganella sp.

Exemple: Morganella morganii prolifération dans produits

laitiers, poissons décarboxylation histidine production

d’histamine intoxication alimentaire

68


Vibrionaceae

B. Biologie

• eaux douces et marines, égouts, animaux marins

• pas de résistance particulière

• pathogènes obligés ou opportunistes

diarrhées, infections généralisées

• bactéries mésophiles et/ou psychrophiles

69


Vibrionaceae

Vibrio cholerae** Entérite HO V. salmonicida*** Listonella anguillarum*** Généralisée poissons V. ordalii*** V. metschnikovii* Entérite, oiseaux, batraciens

généralisée Aeromonas salmonicida*** Généralisée, Aer. caviae* dermo- poissons Aer. sobria* myonécrose Aer. hydrophila*** Généralisée, poissons, oiseaux

entérite mammifères

Plesiomonas shigelloides Entérite (PC, CN, CT)

70


Vibrionaceae


Vibrio sp.

gastro-entérites (V. vulnificus, V. parahaemolyticus)

entérite suraigüe, mort en quelques heures (V. cholerae = cholera)

Plesiomonas shigelloides

diarrhées variables sur la durée et les signes cliniques

Aeromonas hydrophila

pathologies digestives: - diarrhées aigües très aqueuses - gastro-entérites chroniquespathologies extra-digestives: septicémie parfois mortelle (surtout immunodéprimés)

71


Pseudomonaceae

B. Biologie

• habitat = milieu extérieur

• saprophytes, pathogènes opportunistes

plaies, abcès, surinfections, infections chroniques, … morve

! un pathogène obligé des solipèdes: Burkholderia mallei !

• forte résistance dans le milieu extérieur (sauf Burkholderia mallei)

• résistance naturelle (constitutive) aux antibiotiques (surtout Pseudomonas aeruginosa)

72


Pseudomonaceae

Pseudomonas aeruginosa***** Surinfections tous

Ps. anguilliseptica** Généralisées, poissons Ps. fluorescens** dermomyonécrose

Burkholderia mallei** Morve CV Burk. pseudomallei* Pseudomorve tous

Pseudomonas sp. Comamonas sp. Surinfections HO (animaux) Stenotrophomonas sp.

73

Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Pseudomonaceae


Pseudomonas spp

Shewanella putrefaciens (ex-Pseudomonas putrefaciens)

Exemple: Sh. putrefaciens altération organoleptique des

produits de la mer odeur forte et désagréable

74

Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Alcaligenaceae

B. Biologie

• eaux, sols: peu pathogènes, opportunistes genre Alcaligenes

• animaux: pathogènes, peu résistantes genre Bordetella

Bordetella pertussis** Coqueluche HO B. parapertussis**

B. bronchiseptica***** Infections mammifèresrespiratoires

B. avium*** Infections oiseauxrespiratoires

Alcaligenes sp. Surinfections tous

75






76

Gram -Gassner -

Coccobacilles, bâtonnets aéro-anaérobies, microaérobies, anaérobies métabolisme R&F ou F, O/F: F ou NA catalase +(-), oxydase +(-)

bâtonnets, coccobacilles, filaments anaérobies facultatifs métabolisme F, O/F: F catalase +(-), oxydase +(-)

coccobacilles, bâtonnets, filaments anaérobies strictsmétabolisme F, O/F: NA catalase –(+), oxydase -

coques, coccobacilles, bâtonnets, filaments aérobies strictsmétabolisme R, O/F: O catalase +, oxydase +(-)

coques, coccobacilles, bâtonnets aérobies strictsmétabolisme R, O/F: - catalase v, oxydase v

bâtonnets spiralés courts microaérobiesmétabolisme R, O/F: NA catalase + ou -, oxydase +

77

Gram -Gassner -

Pasteurella coccobacillesMannheimia aéro-anaérobiesAvibacterium métabolisme R&F, O/F: FGallibacterium catalase +, oxydase +Actinobacillus espèces auxotrophes

Haemophilus bâtonnets, microaérobies métabolisme R&F, O/F: NA catalase +, oxydase + auxotrophes

Histophilus bâtonnets, anaérobies métabolisme F, O/F: NA

catalse -, oxydase -

Pasteurellaceae

coccobacilles, bâtonnets aéro-anaérobies, microaérobies, anaérobies métabolisme R&F ou F, O/F: F ou NA catalase +(-), oxydase +(-)

78

Les grands groupes bactériens GRAM-Les grands groupes bactériens GRAM-Pasteurellaceae

A. Définition

• coccobacilles à bâtonnets fins (0,2 - 0,3 x 0,3 - 2,0 µm) ! pléiomorphisme ! • aéroanaérobies (microaérobies, anaérobies, carbacidophiles)

• catalase + (- très rares)

• oxydase + (quelques exceptions -)

• mobilité -

• spores -

• métabolisme R et F (F: anaérobies)

• test O/F: F (ou NA: microaérobies, anaérobies)! certaines espèces: exigence en facteurs V et/ou X !

79


• parasites des muqueuses respiratoires, digestives et génitales des animaux (mammifères, oiseaux, reptiles, poissons)

• pathogènes parfois primaires, souvent secondairestroubles respiratoires (autres)

• certaines espèces non pathogènes

• peu résistants dans le milieu extérieur

Pasteurellaceae

B. Biologie

80


Pasteurella*****

• coccobacilles

• aéroanaérobies

• catalase +

• oxydase +

• mobilité -

• métabolisme R et F

• test O/F: F

Pasteurellaceae

P. multocida***** mammifères, oiseauxtroubles respiratoires + oreille

P. trehalosi** OV (agneaux) (ex-P. haemolytica biotype T) septicémies

P. canis, dagmatis, stomatis** tous + HO gueule des carnivores, infections des plaies

P. canis biotype 2* BB (veau)(troubles respiratoires)

P. caballi* (catalase -) CV pathogénicité ?

« P. pneumotropica »*** rongeurstroubles respiratoires

81


Mannheimia***** (ex-Pasteurella) (cf Pasteurella)

M. haemolytica biotype A***** pneumonies ruminantssepticémie, mammites petits ruminants

M. granulomatis*** pneumonies, métrites lagomorphesgranulomes sous-cutanés bovins (Brésil)

M. varigena* pneumonies, septicémie BB, PCmammite, abcès, …

M. glucosida flore respiratoire normale OV (agneaux)(= M. haemolytica biotype A11)

M. ruminalis non pathogène ruminants (rumen)

Pasteurellaceae

82


Gallibacterium*** (ex-Pasteurella ou ex-Actinobacillus) (cf Pasteurella)

G. anatis**** infections respiratoires, salpingite, gallinacés, pigeonspéricardite, hépatite, septicémie, …

(= Past. haemolytica-like aviaire + Act. salpingitidis + Past. anatis)

Gallibacterium genomospecies 1+2 = autres souches non baptisées

Pasteurellaceae

Avibacterium*** (ex-Pasteurella ou ex-Haemophilus) (cf Pasteurella)

Av. gallinarum *** troubles respiratoires volaille (gallinacés) Av. paragallinarum*** (coryza infectieux)(= ex-Haemophilus gallinarum et paragallinarum)

Av. avium, volantium, spA non pathogènes pigeons(= ex-Pasteurella avium, volantium et spA)

exigence en facteur V

83


Actinobacillus***** (cf Pasteurella)

Pasteurellaceae

Act. lignieresii***** ruminants actinophytose des tissus mous (« langue de bois »)

Act. equuli***** CVsepticémie, néphrite (poulain) ; endocardite, méningite (adulte)

Act. suis*** PC troubles digestifs et respiratoires Act. suis-like CV

Act. pleuropneumoniae***** PC pleuropneumonieexigence en facteur V

« Act. seminis »* OV (béliers) vésiculite, orchite

« Act. capsulatus »* lapins arthrites

84


Haemophilus*****: exigence en facteurs V et/ou X

• très petits bâtonnets

• microaérobies,

carbacidophiles

• catalase +

• oxydase +

• mobilité -

• métabolisme R et F

• test O/F: NA

• croissance lente (2-4 jours)

Pasteurellaceae

Haem. parasuis***** PCmaladie de Glasser (polysérosite fibrineuse)

Haem. haemoglobinophilus CNnon pathogène

Haem. paracuniculus* lapins, rongeurspathogénicité ?

85


Histophilus*****

• petits bâtonnets

• anaérobies,

carbacidophiles

• catalase -

• oxydase -

• mobilité -

• métabolisme F

• test O/F: NA

• croissance lente (2-4 jours)

Hist. somni***** BB, OVInfections multiples respiratoires méningo-encéphalites avortements

! Regroupe les noms suivants !Haemophilus somnusHaemophilus agniHistophilus ovis

Pasteurellaceae

86

Gram -Gassner -

Taylorella bâtonnetsCapnocytophaga bâtonnetsEF4a coccobacillesStreptobacillus filaments perlés

Bâtonnets, coccobacilles, filaments anaérobies facultatifs métabolisme F, O/F: F catalase +(-), oxydase +(-)

87


A. Définition

Taylorella Capnocytophaga

! catalase + !

! oxydase + !

! catalase + ou - !

! oxydase + ou - !mobilité –

spores –

métabolisme F

test O/F: F

petits bâtonnets (pléiomorphisme)

(0,3 - 0,6 x 1,0 - 2,0 µm)

fins bâtonnets(0,5 x 1,0 – 3,0 mm)

anaérobies facultatives (carbacidophiles)

88


B. Biologie

• parasite des muqueuses génitales

• non pathogène pour l’étalon

• pathogène pour la jument

• peu résistant dans le milieu extérieur

Taylorella Capnocytophaga

• parasite des muqueuses buccales

• groupe DF-1 chez l’homme

• groupe DF-2 chez les carnivores

• peu résistant dans le milieu extérieur

T. equigenitalis***** CV (jument) métrite contagieuse équine (CEM)

C. canimorsus*** contamination de morsures, abcès, septicémie

HO, animauxC. cynodegmi* gingivite, stomatite

carnivores

89


Groupe EF4a

• cfr Pasteurella• fermente le glucose MAIS ! inactif sur les autres sucres !• bouche des carnivores HO + animaux infection de plaies par morsure

• bâtonnets longs, filamenteux et « perlés »• muqueuses respiratoire et buccale des rongeurs

infections respiratoires rongeurs« rat-bite fever » HO« Haverhill fever »(contamination à partir de l’eau de boisson)

Streptobacillus moniliformis

Groups EF4a Streptobacillus

90

Gram -Gassner -

BacteroidesDichelobacter BacteroidaceaeFusobacterium

coccobacilles, bâtonnets, filaments anaérobies strictsmétabolisme F, O/F: NA catalase -(+), oxydase -

91


coccobacilles à bâtonnets (1 x 1,0 à 10 µm); filaments (jusqu’à 100 m) renflements, vacuoles, formes en fuseaux (Fusobacterium)

anaérobies stricts

catalase - (+)

oxydase -

mobilité -

spores -

métabolisme F

Test O/F: non applicable

A. Définition

Bacteroides FusobacteriumDichelobacter

92


• nature: sols, aircavités des animaux (tractus digestif, génital)surface des animaux (peau, espace interdigité, onglons)

• saprophytes, pathogènes opportunistes, pathogènes obligés

• résistants dans le milieu extérieur

• certaines espèces très résistantes aux antibiotiques !

B. Biologie

diarrhée, péritonite, abcès, … pododermatites (piétin)


93


Bacteroides fragilis** entérites, péritonites, abcès tous

Dichelobacter nodosus***** piétin OV abcès, furoncles interdigités BB

Fusobacterium necrophorum*****subsp. necrophorum (= ancien biotype A)subsp. fundiliforme (= ancien biotype B)abcès, furoncle interdigités, pododermatite PC, BV, OVabcès disséminés (= nécrobacillose) tous

Fusobacterium nucleatum, russii CN, CTpathogénicité ?


94

Francisella coccobacilles, catalase +, oxydase -Neisseria diplocoques, catalase +, oxydase +FlavobacteriumChryseobacterium bâtonnets, filaments, catalase +, oxydase +TenacibaculumAcinetobacter coques + bâtonnets, catalase +, oxydase -EF4b coccobacilles, catalase +, oxydase +

Gram -

Gassner -

coques, coccobacilles, bâtonnets, filaments aérobies strictsmétabolisme R, O/F: O catalase +, oxydase +(-)

95

Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Francisella

A. Définition

Neisseria

catalase + (faible)

oxydase -

test O/F: O (lentement)

catalase +

oxydase +

test O/F: O

aérobies strictes

mobilité –

spores –

métabolisme R

petits coccobacilles (0,2 x 0,2 - 1,7 µm)

diplocoques aplatis (en grains de café) (0,6 – 1,0 mm)

96


B. Biologie

NeisseriaFrancisella

• parasites obligés: rongeurs et lagomorphes• très sensibles dans le milieu extérieur (sauf eaux + humidité)• pathogènes des animaux et de l’homme• pathogènes intra-cellulaires facultatifs

Genre Francisella

• commensaux des muqueuses de l’homme et des animaux• pathogènes de l’homme• non (ou peu) pathogènes chez l’animal

Genre Neisseria

97


Francisella tularensistularémie = septicémie avec granulomes (pseudotubercules)

subsp. tularensis biotype A lagomorpheshémisphère Nord (Amérique)

subsp. holartica biotype B rongeurs(ex-paleartica) hémisphère Nord (Eurasie)

Fr. novicida ? rongeurs(ex-Fr. tularensis subsp. novicida)pathogénicité ?

Francisella Neisseria

Neisseria gonorrhoeae Gonorrhée HO Neisseria meningitidis Méningite

Neisseria canis ? CN

98



Francisella tularensis (tularémie)

forme gastro-intestinale: via la nourriture ou l’eau contaminées

forme oculaire: inoculation conjonctivale via les doigts souillés

forme ulcéro-ganglionnaire: blessures lors de manipulation d’un animal mort ou malade (80% des cas); plus fréquemment parmi les chasseurs, les forestiers,…

NeisseriaFrancisella

99


A. Définition

Bâtonnets(0,5 x 1,0-3,0 m; filaments jusqu’à 100 m)

aérobies strictes

catalase +

oxydase +

mobilité + (par glissement)

spores-

métabolisme R

test O/F: O

TenacibaculumFlavobacterium Chryseobacterium

100


B. Biologie

• habitants des eaux douces et salées, de l’environnement marin

• habitant des sols (Flavobacterium)

• beaucoup d’espèces non pathogènes

• quelques espèces très pathogènes (poissons)

• infections nosocomiales (HO)

• certaines espèces psychrophiles

• conditions particulières de croissance (Tenacibaculum)


101


Flavobacterium psychrophilum septicémie poissons(ex- Cytophaga psychrophila) lésions cutanées d’eau froide(ex- Flexibacter psychrophilus)

Fl. columnare maladie des alevins truites(ex-Flexibacter columnaris)

Fl. branchiophilum Fl. hydatis maladie des branchies, poissons

(ex-Cytophaga aquatilis) lésions cutanées Fl. johnsoniae

(ex-Cytophaga johnsonae)(ex-Flexibacter aurantiacus)

Tenacibaculum maritimum maladie des branchies poissons (ex-Flexibacter maritimus) lésions cutanées d’eaux salées

Ten. ovolyticum maladie des œufs et alevins poissons(flétan)


102



• genre Chryseobacterium

Exemples: Chr. indologenes altération de produits laitiers

Chr. gleum (beurre notamment) :

Chr. indoltheticum modifications couleur, odeur, …


103


A. Définition

Groupe EF4bAcinetobacter

oxydase –

test O/F: O (-)

oxydase +

test O/F: O

aérobies strictes

catalase +

mobilité –

spores -

métabolisme R

coques + bâtonnets(en code morse)(1,0 - 1,5 x 1,5 - 2,5 µm)

coccobacilles (cfr Pasteurella & groupe EF4a)

104


Groupe EF4bAcinetobacter

• bouche des carnivores

• infections de plaies par morsure(HO, animaux)

• habitants des eaux, sols, muqueuses

• très peu pathogènes

• (sur)infections nosocomiales(HO)

B. Biologie

105



Genre Acinetobacter

• rôle discuté

Exemple: Acinetobacter johnsonii

flore des aliments frais ou altérés

(lait, produits laitiers, carcasse de volailles, poissons)

! quelques souches capsulées (lévanes) aptes à donner une

consistance visqueuse au lait, à la surface des fromages !

Acinetobacter Groupe EF4b

106

Brucella coccobacilles, catalase +, oxydase +Bartonella bâtonnets, catalase -, oxydase -Moraxella avec ex-BranhamellaRiemerella coques à bâtonnets, catalase +, oxydase +BergeyellaLegionella coccobacilles, catalase -, oxydase -Afipia bâtonnets, catalase +, oxydase -

Gram -

Gassner -

coques, coccobacilles, bâtonnets aérobies strictsmétabolisme R, O/F: - catalase v, oxydase v

107


Brucella Bartonella

A. Définition

coccobacilles bâtonnets droits ou incurvés (0,5-0,7 x 0,5-1,5 µm) (0,3 - 0,5 x 1,0 - 1,7 µm)

aérobies strictes (carbacidophiles parfois en primo-culture)

spores – métabolisme R

test O/F: -

catalase + catalase - oxydase v+ oxydase - mobilité - mobilité v

légèrement acido-résistants (Koester) se colore mieux au Giemsa

Presque toutes les souches du genre Brucella possèdent DEUX chromosomes


parasites obligés du tractus génital

dans la nature après avortement (par exemple)

résistantes à la dessication, à la putréfaction

sensibles aux antiseptiques et aux agents physiques

pathogènes intra-cellulaires facultatifs

pathologies: avortementstroubles génitauxbursitesautres

Brucella

B. Biologie

Bartonella

parasites du sang, des globules rouges et des cellules endothéliales hôtes intermédiaires: puces, poux, mouches (?) transmission:

- par contact avec le sang- par griffures- par piqûres de l’arthropode

pathologies: anémiesendocarditelymphadéniteéruption verruqueuse

109


! 8 différentes espèces ou 1 espèce avec différents biotypes !

Br. melitensis (3 biotypes) OV, CP + homme, bovins, porcs Br. abortus (7 biotypes) BB + homme, chiens, ovins, porcs, chevaux Br. suis (5 biotypes) PC (sangliers) + chevaux, homme, chiens,

ruminants sauvages, rongeurs

Br. ovis OV (béliers) ? Br. canis CN ? (homme) Br. neotamae rongeurs (Utah, USA) - « Br. cetaceae » cétacés ? « Br. pinnipediae » pinnipèdes ?

! 8 différentes espèces ou 1 espèce avec différents biotypes !

Br. melitensis biovar Melitensis (3 sous-biotypes) Br. melitensis biovar Abortus (7 sous-biotypes) Br. melitensis biovar Suis (5 sous-biotypes) Br. melitensis biovar Ovis Br. melitensis biovar Canis Br. melitensis biovar Neotamae

Genre Brucella

Brucella Bartonella

110


! Subdivision en sérotypes A (pour Abortus) et/ou M (pour Melitensis) ! Br. Melitensis

Biotype 1 sérotype M périméditerranée Biotype 2 sérotype A asie centrale Biotype 3 sérotype A/M Amérique du sud

Br. Abortus Biotype 1 sérotype A monde (+++) Biotype 2 sérotype A monde (+) Biotype 3 sérotype A Inde, Afrique de l’est Biotype 4 sérotype M rare Biotype 5 sérotype M Royaume-Uni,

Allemagne Biotype 6 sérotype A rare Biotype 9 sérotype M rare

Br. Suis Biotype 1 sérotype A monde (pas en Europe) Biotype 2 sérotype A (+ lièvres) Europe orientale et

centrale Biotype 3 sérotype A Amériques, Chine Biotype 4 séroype A/M (rennes) régions arctiques Biotype 5 sérotype M (rongeurs) ancienne URSS

Br. Ovis sérotype R monde Br. Canis sérotype R monde

Genre Brucella

Brucella Bartonella

111


B. henselae maladie de la griffe du chat HO puces(abcès, lymphadénite, bactériémie, endocardite, …) (Ctenocephalides felis)

B. clarridgeiae idem HO puces

B. bovis ? BB ? (mouches)

B. chomelii ? cervidés ?

B. quintana fièvre des tranchées HO poux

B. bacilliformis fièvre d’Oroya HO mouches(Amérique du Sud)

(Phlebotomus)

Genre Bartonella

Brucella Bartonella

112


Brucella


Brucella Abortus, Melitensis (Suis)

Brucellose = syndrome grippal récurrent (fièvre ondulante)

Séquelles possibles (endocardite)

Infections sub-cliniques fréquentes

Sources: lait et produits laitiers non pasteurisés

maladie professionnelle des vétérinaires et éleveurs

Sources: avortons et enveloppes fœtales

Voie: transcutanée, conjonctivale, …

Bartonella

113


coques (1,0 - 1,5 µm) à bâtonnets (1,0 - 1,5 x 1,5 - 2,5 µm)

aérobies strictes

catalase +

oxydase +

mobilité –

spores –

métabolisme R

test O/F: -

Moraxella Riemerella Bergeyella

A. Définition

114


habitants des muqueuses peu pathogènes (! Exceptions !) résistants dans le milieu extérieur

B. Biologie

M. bovis**** kératoconjonctivite infectieuse BB M. ovis** OV(ex-Branhamella ovis)

R. anatipestifer polysérosite et septicémie canard(= peste du canard)

B. zoohelcum contaminations de plaies par morsure tous(ex-Weeksella) (présence dans la gueule des carnivores: cfr EF4a, EF4b, …)

Moraxella Riemerella Bergeyella

115

Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Legionella

A. Définition

coccobacilles bâtonnets(0,3-0,7 x 2,0-3,0 µm) (0,5-1,0 x 1,5-3,0 m)

aérobies strictes

catalase +(faible)

oxydase v-

mobilité +

spores –

métabolisme R

test O/F: -

Afipia

116


habitants du milieu extérieur notamment dans l’eau douce (lac, rivière, fontaine, machine à glace,…) résistants dans le milieu extérieur non pathogène pour les individus en bonne santé importance très limitée en médecine vétérinaire

B. Biologie

Legionella Afipia

Genre Legionella

Genre Afipia

peu connue habitant des eaux (?) endosymbiotes d’amibes (?) dans les coussinets plantaires du chat (= vecteur mécanique) intracellulaires facultatives

117

Les grands groupes bactériens Gram-Les grands groupes bactériens Gram-Legionella


fièvre de Pontiac (syndrome pseudogrippal)Source: eau de boisson (hôpitaux par exemple)

Legionella pneumophila

Legionella pneumophila Maladie du légionnaire HO Legionella spp. (pneumonie et maladie systémique)

Afipia

Afipia felis Maladie de la griffe du chat HO(plus rare que Bartonella henselae)

118

Gram -

Gassner -

CampylobacterHelicobacterArcobacter

bâtonnets spiralés courts microaérobiesmétabolisme R, O/F: NA catalase + ou -, oxydase +

119


bâtonnets courbes: virgules, S, spires, « mouette » (0,2-0,5 x 0,5-5 µm)

microaérobies

catalase + ou -

oxydase +

mobilité + (tire-bouchon)

spores –

métabolisme R

test O/F: NA

A. Définition

Campylobacter Helicobacter Arcobacter

120


B. Biologie

parasites des muqueuses génitales, stomacales et intestinales

pathogènes obligés, pathogènes opportunistes ou non pathogènes

très sensibles dans le milieu extérieur et aux antiseptiques

quelques résistances à des antibiotiquespolymyxinesR

triméthoprimeR

sulfamidésR


121


C. jejuni*****subsp. jejuni entérites toussubsp. doylei ? HO

C. coli hépatite oiseauxnon/peu pathogène mammifères

C. fetus subsp. fetus*** avortements OV (BB)subsp. venerealis** avortements BB


Genre Campylobacter

122


Genre Helicobacter

H. pylori ulcères gastriques, gastrites HO, CN, CT

H. suis ulcères gastriques, gastrites PC (HO, singes)

H. felis H. heilmannii H. salomonis gastrite, duodénite, hépatite CN, CT, HO H. pylori félidés sauvages H. canis

H. spp. estomac, duodénum, foie animaux de laboratoire,animaux sauvages


123



C. coli, C. lari, C. upsaliensis

gastro-entérites, septicémies

gastro-entérites, septicémies, méningites, avortements

C. jejuni subsp. jejuni

Genre Campylobacter


124




H. pylori

contamination aliments, eaux de surface par matières fécales

gastrites chroniques, ulcères gastro-duodénaux

Genre Helicobacter

A. butzleri

association fréquente avec des cas d’entérites

Genre Arcobacter

! pouvoir pathogène incertain !

125






126

Gram -

Gassner -

Longs et minces filaments spiralésFlagelles périplasmiques

Spirochetaceae: Treponema, Brachyspira, BorreliaLeptospiraceae: LeptospiraAutres: « Spirillum », Anaerobiospirillum

127

Gram -

Gassner -

Treponema spires étroites et régulières, non cultivablesBrachyspira spires étroites et régulières, anaérobies strictesBorrelia spires larges et régulières, microaérobies ou non cultivables

Longs et minces filaments spiralésFlagelles périplasmiques

Spirochetaceae

Leptospiraceae

Leptospira spires étroites et irrégulières, aérobies strictes

Autres

« Spirillum » spires larges et régulières (microaérobies)Anaerobiospirillum spires régulières, bâtonnets longs et épais,

anaérobie strictes

128


A. Définition bâtonnets spiralés fins et longs (0,1 - 0,5 x 3 - 20 µm)

(spires étroites, régulières, (idem) (spires larges, régulières, et peu séparées) et bien séparées)

non cultivables anaérobies strictes microaérobies(ou

non cultivables) coloration de Gram

(peu colorable) (bien colorable) (peu colorable)(coloration de Giemsa) (coloration de Giemsa)

catalase ?/- oxydase ?/-

mobilité + (cils aux deux extrémités sous la membrane externe) spores –

métabolisme ? métabolisme F métabolisme ? test O/F: ? test O/F: NA test O/F: NA

Treponema Brachyspira Borrelia

129


dans les cavités orales, intestinales et/ou génitales

très sensibles dans le milieu extérieur

pouvoir pathogène variable

genre Borrelia: cycle avec hôte intermédiaire obligatoire arthropodes piqueurs hématophages tiques des genres Ixodes, Rhipicephalus, Boophilus, Argos, …

B. Biologie


130


Treponema pallidum syphilis HO T. paraluiscuniculi** « syphilis » lapin

(= lésions cutanées et lymphadénites)

Brachyspira hyodysenteriae***** entérocolite et dysenterie PC Br. pilosicoli** diarrhée CN, PC, HO Br. innocens non pathogène PC

(= ex-Treponema et ex-Serpulina)

Borrelia burgdorferi***** « maladie de Lyme » HO, mammifères B. garinii***** (= fièvre, abattement, érythème, polyarthrites) B. afzeli***** (avortements, néphrites, …)

(cultivables, microaérobies, régions tempérées) B. anserina syndrome d’abattement oiseaux

(non cultivable, régions tropicales) B. theileri peu pathogène ruminants

(non cultivable, régions tropicales)


131


bâtonnets spiralés (0,1 x 6 - 12 µm) en S ou en C (spires étroites et irrégulières)

aérobies strictes (difficiles à cultiver)

Gram – mais peu colorables (coloration de Giemsa)

catalase + oxydase + mobilité +

spores –

métabolisme R test O/F: croissance trop lente et difficile

A. Définition

Leptospira

132


2 groupes qui sont assimilés à 14 espèces subdivisées en sérotypes Espèces/sérovars non pathogènes résistants dans le milieu extérieur

L. alexanderi, L. biflexa, L. parva, L. wolbachii L. meyeri (certains sérovars) habitat: eaux et des boues

Espèces/sérovars pathogènes peu résistants dans le milieu extérieur***** L. alstoni, L. borgpetersnii, L. fainei, L. inadai, L. interrogans,

L. kirschneri, L. noguchii, L. santarosai, L. weilii L. meyeri (certains sérovars) la plupart des souches pathogènes font partie de l’espèce L. interrogans habitat: tubuli rénaux des espèces réservoirs et hôtes les sérovars avec une relative spécificité d’hôte et de réservoir dans le milieu extérieur seulement après contamination par des

décharges contaminées (urines, lochies, …)

B. Biologie

Leptospira

Voir aussi fascicule de notes partie 2 pour la comparaison entre nouvelle et ancienne nomenclatures

133


L. Pomona: bétail, ovins, porcins, équins (canins, félins, humains) L. Canicola: canins, félins, humains, (bovins, porcins, équins) L. Hardjo°: bovins, (ovins, humains, équins) L. Icterohaemorrhagiae: canins, humains, (bovins, porcins, équins) L. Autumnalis: (canins, humains) L. Grippotyphosa: ovins, équins, (bovins, porcins, canins, humains, félins) L. Sejroe: bovins L. Tarrasovi°°: (porcins) L. Australis: (bovins, canins, équins) L. Bataviae: (humains, félins) L. Bratislava: (porcins, équins)

° = L. meyeri °° = L. borgpetersenii

Sérotypes et espèces animales domestiques hôtes primaires (et secondaires)

Leptospira

Leptospirose mammifères(= néphrite interstitielle, hépatite, avortements, …)

134


L. Pomona: bétail, porcs, animaux sauvages L. Canicola: chien et canidés sauvages, bétail, porcs L. Hardjo°: bétail, moutons L. Icterohaemorrhagiae: rats, souris L. Autumnalis, L. Grippotyphosa, L. Sejroe: faune sauvage L. Tarrasovi°°: porc L. Australis: hérisson L. Bataviae: chien, rat, souris L. Bratislava: bétail, porc, chevaux

° = L. meyeri °° = L. borgpetersenii

Sérotypes et espèces animales domestiques réservoirs

Leptospira

135



Leptospira

Leptospires pathogènes

sérovars Icterohaemorrhagiae, Bataviae et Copenhageni

(= réputés les plus pathogènes)

2 formes: ictérique sévère et non ictérique

(signes cliniques très variés)

problème de profession (chevilleurs, bouchers, …)

transmission par contact avec les organes internes

136


position taxonomique incertaine bâtonnets hélicoïdaux (0,2 x 3 - 5 µm) mise en culture non prouvée apparemment microaérobie

A. Définition

« Spirillum »

B. Biologie

muqueuses buccale et respiratoire des rongeurs très sensibles dans le milieu extérieur pouvoir pathogène important

Spirillum minus « rat-bite fever » HO« sodoku »

137


gros bâtonnets spiralés

anaérobies strictes

habitat: intestin

Anaerobiospirillum succinoproducensDiarrhée CN, CT

Anaerobiospirillum

138






139

Gram -

Gassner -

Toutes les cellulesPas d’hôtes intermédiaires

Chlamydiales

Autres

Lawsonia: entérocytesClostridium piliforme: entérocytes, hépatocytes, cardiomyocytes

Cellules endothélialesErythrocytesLeucocytesSystème réticulo-endothélialHôtes intermédiaires

Rickettsiales

140

Gram -

Gassner -

Intracellulaires obligéesToutes les cellulesPas d’hôtes intermédiaires

Chlamydia pas de peptidoglycan

Chlamydophila pas de chaîne de transport d’électrons

Piscichlamydia colorations de Köster et Giemsa

Ordre des Chlamydiales

Chlamydiaceae

141


transmission directe par aérosol pas d’hôte intermédiaire dépendant de la cellule hôte pour la production d’énergie infecte de très nombreux types de cellules

B. Biologie

Chlamydia Chlamydophila Piscichlamydia

A. Définition

corps élémentaire: forme extracellulaire infectante et résistante(0,2 - 0,3 µm)

corps réticulé: forme intracellulaire à l’intérieur d’une vésicule/vacuole bactérie dépourvue de PDG peu colorable au Gram, colorable au Giemsa et Köster entrée dans la cellule divisions morula

142


Chlamydia trachomatis** trachome, urogénital, HOpneumonie

Chlamydia suis non pathogène PC

Chlamydia muridarum ? souris

Chlamydophila pneumoniae pneumonies HO

Chlamydophila psittaci***** psittacose - ornithose oiseaux (HO)

Chlamydophila felis**** conjonctivites, pneumonies CT

Chlamydophila pecorum*** polyarthrites, pneumonies, ruminantsconjonctivites

Chlamydophila abortus*****avortements, OV (BB, HO) infections génitales

Chlamydia caviae ? cobayes

Piscichlamydia salmonis épithéliocytose des branchiessalmonidés

Chlamydia Chlamydophila Piscichlamydia

143

Gram -

Gassner -

Cellules endothélialesErythrocytesLeucocytesSystème réticulo-endothélialHôtes intermédiaires

Anaplasma érythrocytes, tiques Ixodes

Ehrlichia leucocytes mononucléés, tiques Rhipicephalus

Neorickettsia leucocytes mononucléés + intestin (tiques ?)

Ordre des Rickettsiales: coloration de Giemsa

Anaplasmataceae

Rickettsiaceae

Autres

(Rickettsia pas en Europe, tiques diverses)

Piscirickettsia septicémie (?) du poisson, ?

Coxiella cellules réticulo-endothéliales, pas d’hôte intermédiaire, colorations de Köster et Giemsa

144


A. Définition corps élémentaire (0,3 – 1,0 m) =

- forme infectant « l’hôte intermédiaire »- forme libre (genre Coxiella)

corps réticulé = forme intracellulaire libre ou à l’intérieur d’une vacuole

bactéries pourvues d’un PDG

peu colorable au Gram, colorable au Giemsa(genre Coxiella colorable au Köster)

Nombreux remaniements taxonomiques (voir aussi le genre Mycoplasma) Haemobartonella felis***** voir Mycoplasma haemofelisHaemobartonella canis voir Mycoplasma haemocanisEperythrozoon suis*** voir Mycoplasma (haemo)suisAegyptianella pullorum voir Mycoplasmatacea

Anaplasma NeorickettsiaCoxiella Ehrlichia Rickettsia Piscirickettsia

145


B. Biologie

transmission par arthropodes piqueurs hématophages (tiques)

! Biologiquement, le mammifère est souvent un hôte accidentel terminal !

le genre Coxiella ne présente pas d’hôte intermédiaire obligé et se transmet fréquemment par aérosol

dépendant de la cellule hôte pour certaines parties du métabolisme

infecte les érythrocytes:entrée dans la cellule division(s) deux (ou quatre) bactéries

infecte les leucocytes poly- et mononucléés, les cellules du système réticulo-endothélial, les cellules endothélialesentrée dans la cellule divisions « morula »



Anaplasma phagocytophilum*** leucopénie, vasculite tiques ! Leucocytes (surtout polynucléés) (Ixodes ricinus) ex-Ehrlichia phagocytophila OV (BB) (« Tick-borne fever ») ex-Ehrlichia equi CV ?

Coxiella burnetii***** avortements BB (CT) tiquessyndrome grippal HO souvent pas(« Fièvre Q ») d’hôte intermédiaire

! Cellules du système réticulo-endothélial Ehrlichia canis*** leucopénie, CN tiques

thrombocytopénie (Rhipicephalus sanguineus)! Leucocytes (surtout mononucléés)

Neorickettsia risticii** leucopénie, diarrhée CV ? (tiques)(ex-Ehrlichia risticii) (« Potomac horse fever »)! Leucocytes (surtout mononucléés)

Piscirickettsia salmonis septicémie salmonidés NON (?)

En Europe



Anaplasma marginale** anémie, ictère BB arthropodes! Erythocytes (Afrique) (tiques)

An. centrale non pathogène BB idem! Erythocytes (Afrique)

An. ovispeu pathogène OV idem! Erythocytes (anémie, ictère) (Afrique)

Ehrlichia ruminantium oedèmes, péricardite ruminants tiques(ex-Cowdria ruminantium) (« Heart water ») (Afrique) (Amblyomma)! Cellules endothéliales

Neorickettsia syndrome général CN Douve du foiehelminthoeca (« Salmon poisoning ») (Amérique N) du saumon! Cellules du système réticulo-endothélial

Rickettsia rickettsii vasculite, hémorragies, HO (CN, OV) tiques(« Rocky Mountain spotted fever ») (Dermatocentor spp.)

! Cellules endothéliales Rickettsia felis typhus murin (?) HO puces du chat « Pseudotyphus de Californie » (Ctenocephalides

felis)! Cellules endothéliales

Quelques exemples hors Europe


148



Coxiella burnetii (fièvre Q)

forme aiguë: signes cliniques évoquant une grippe

forme chronique (la plus grave): - surtout immunodéprimés - femme enceinte (naissance prématurée, avortement ou mort in utéro)

Sources: eaux et nourriture contaminées(surtout le lait cru et les produits laitiers à base de lait cru)


149

Gram -

Gassner -

Autres

Lawsonia: entérocytes, pas d’hôte intermédiaireClostridium piliforme: entérocytes, hépatocytes, cardiomyocytes (voir bactéries Gram +)

150


petits bâtonnets incurvés(0,2-0,5 x 0,5-1,5 m)

forme de campylobactère

A. Définition

Lawsonia

Complexe adénomatose proliférative: PC- adénomatose bénigne- entérite nécrotique- iléite régionale- entéropathie hémorragique

Lawsonia intracellularis

intracellulaire obligé

symbiote des entérocytes

B. Biologie

151



Coques Gram+ (Firmicutes) - catalase+; catalase-Bâtonnets Gram+ (Firmicutes)- petits réguliers; petits irréguliers; ramifiés; grands réguliersBactéries Gram+ sans paroi (Mollicutes)- les « mycoplasmes »Coccobacilles et bâtonnets Gram- poussant sur Gassner (Gracilicutes)- oxydase- O/F:F; oxydase+ O/F:O; oxydase+ O/F:F; oxydase+ O/F:-Coccobacilles, bâtonnets et coques Gram- ne poussant pas sur Gassner (Gracilicutes)- aéroanaérobies métabolisme R & F; aérobies métabolisme R; microaérobies métabolisme R; anaérobies facultatives métabolisme F; anaérobies strictes métabolisme F


152





Chapitre 6:

Ecologie bactérienne

Chapitre 6:

Ecologie bactérienne



153

Où vivent les bactéries ?

dans la nature cycle de la matière

. non pathogènes

. certains pathogènes (maladies telluriques)

. origine fécale

154


au contact des animaux digestion, flore de barrière, …

peau, muqueuses digestives, respiratoires, génitales, conjonctivales(muqueuses urinaires)

. flore résidente: bactéries commensales bactéries pathogènes opportunistes

. flore non résidente: bactéries non pathogènes bactéries pathogènes opportunistes bactéries pathogènes obligés

155

dans les animaux (sang, organes internes, …)

Pas de flore commensale interne

QUOIQUE …

(sang: période postprandiale)(muscles: spores de Cl. chauvoei, Cl. septicum, …)(foie: spores de Cl. novyi, Cl. haemolyticum, …)(foie <ombilic abcès, foyers de nécrose)

! et surtout le genre Bartonella dans et sur les érythrocytes !


156

Peau – Revêtement cutané - Oreilles externes

Flore résidente Gram positive surtout

Flore non résidente (variée) ‹ extérieur (sols, litière)

• staphylocoques,streptocoques• Arcanobacterium• Actinomyces• clostridies

aéroanaérobies, anaérobies facultatives, anaérobies strictes

essentiellement non pathogènes, pathogènes opportunistes

157

! Circonstances adjuvantes !

• plaies accidentelles, chirurgicales, naturelles

• glandes sébacées, follicules pileux

• pli

• « crasses » (dans l’oreille)

Peau – Revêtement cutané - Oreilles externes

158

Œil - Conjonctive

Idem, mais plus riche en Gram négatives

! Circonstances adjuvantes !• corps étranger• vent• froid

• Moraxella• Branhamella

non pathogènes

pathogènes opportunistes

159

1) Bouche et pharynx

Système digestif

• flore résidente nombreuse et variée

• flore non résidente variée

• biotopes variés: joues, palais, langue (dessus et dessous), gencives, larynx, amygdales

160

1) Bouche et pharynx (suite)

. coques Gram+ et Gram-

. Actinomyces

. pasteurelles, actinobacilles, hémophiles

. coliformes, …

. EF4a, EF4b, M5, Weeksella, Capnocytophaga…

aérobies strictes, aéroanaérobies, anaérobies facultatives, anaérobies strictes

non pathogènes, pathogènes opportunistes locaux ou respiratoires ou systémiques

Système digestif

161

! Circonstances adjuvantes !

• blessure (< nourriture)

• tartre

• stress: voyage, froid,…

1) Bouche et pharynx (suite)

Système digestif

162

rumen

2) Estomacs

! réservoir de certains pathogènes humains !

• Escherichia coli O157: H7

Eubactéries 1010 – 1011 / ml 200 espèces

Archaebactéries 107 – 109 / ml 4 – 5 espèces

Protozoaires ciliés 104 – 106 / ml 25 – 30 espèces

Champignons 103 – 104 / ml 12 espèces

Bactériophages 107 / ml

Système digestif

163

digérant

2) Estomacs (suite)

flore résidente très limitée

hélicobactéries: ulcères, gastrites, cancers,…

Système digestif

164

grêle

3) Intestins

de peu habité (102 / ml) à très habité (107 / ml)

péristaltisme

90 % anaérobies strictes, anaérobies facultatives, microaérobies

Gram+ et Gram- en proportions variables

Bacteroides, Lactobacillus, clostridies, entérocoques, campylobactères

non pathogènes ou pathogènes opportunistes

Système digestif

165

10 % aéroanaérobies Gram + et Gram – (surtout)

entérobactéries, Bacillus

= non pathogènes, pathogènes (Salmonella, Escherichia coli)

! . perturbation de la flore par des antibiotiques (dysbactériose) . perturbation du péristaltisme

3) Intestins

grêle

Système digestif

166

caecum, colon

3) Intestins

très habité 109 – 1011 / ml

peu de péristaltisme

flore similaire: encore plus d’anaérobies strictes

non pathogènes ou pathogènes opportunistes (clostridies, spirochètes)

réservoirs d’autres pathogènes (Salmonella par exemple)

! origine de l’envahissement du grêle ! si perturbation du péristaltisme

Système digestif

167

Flore résidente nombreuse et variée

Flore non résidente variée

Biotopes différents: naseaux, muqueuse, cornets, pharynx, amygdales, …

1) Nez et pharynx

Système respiratoire

168

1) Nez et pharynx (suite)

aérobies strictes aéroanaérobies, anaérobies facultatives,anaérobies strictes

non pathogènes, pathogènes opportunistes locaux,respiratoires profonds (très nombreux)


• staphylocoques, streptocoques, …

• Arcanobacterium pyogenes

• coques Gram -

• bordetelles, pasteurelles, hémophiles, …

• coliformes, …

• mycoplasmes

• Streptobacillus moniliformis

169

bronchopneumonies: mycoplasmes, pasteurelles, actinobacilles, bordetelles, hémophiles, streptocoques, …

1) Nez et pharynx (suite)

rhinite atrophique: B. bronchiseptica + P. multocida gourme: Strep. Equi pyogènes classiques: streptocoques, staphylocoques, Arcanobacterium

pyogenes, …

! blessures, stress, froid, ventilation, poussières, pollution !


170

aucune flore résidente

flore de passage < pharynx

2) Larynx, trachée, bronches, alvéoles


Trachéobonchites/bronchopneumonies/pleuropneumonies:

mycoplasmes, pasteurelles, actinobacilles, bordetelles, hémophiles, streptocoques, …

! stress, froid, voyages, ventilation, poussières, pollution !

171

pas de flore résidente

flore de passage chez femelle < vagin chez mâle (rare) <fourreau

Mécanismes de protection: miction, pH urine, longueur de l’urètre (mâle)

Système urinaire

1) Vessie

2) Cavité pyélique du rein

pas de flore

! interférences avec le flux urinaire, la miction !! infections d’origine hématogène !

172

Flores résidentes commensales abondantes et variées

Flores de passage variées < périnée + matières fécales

< peau, milieu extérieur

Biotopes différents: vulve, vagin, col

prépuce, pénis

Système génital

1) Vulve/Vagin (face vaginale du col) - Fourreau

173

Système génital

femelle: - surtout anaérobies facultatives et strictes: Lactobacillus

- 10 % autres: staphylocoques, streptocoques < périnée

- flores de passage: entérobactéries < matières fécales

vaginite, métrite, cystiteavortements

mâle: de tout < peau, environnement

peu de problèmestransfert vénérien avortements, métrites, cystites, …(Campylobacter fetus, Corynebacterium renale, Taylorella equigenitalis, Actinobaculum suis, …)

1) Vulve/Vagin (face vaginale du col) – Fourreau (suite)

174

pas de flore

Système génital2) Matrice


flore de passage lors de l’ouverture du col

• Possibilité de métrite, de résorption embryonnaire, d’avortements, …

• ? Lien avec délai de retour en chaleurs ?

3) Urètre et glandes annexes (mâle)

175


trayon: flore de passage < peau, litière

! interférence avec la traite, le flux lacté !

! infections d’origine hématogène !

4) Mamelle

Documents

1 Service de Bactériologie Département des Maladies infectieuses et parasitaires Faculté de Médecine Vétérinaire Chapitre 5: Les grands groupes bactériens