3_me cours de G_n_tique appliqu_e

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  • 8/7/2019 3_me cours de G_n_tique appliqu_e

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    2. Les vecteurs de2. Les vecteurs declonageclonage

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    Dfinitions : transgense et transgneDfinitions : transgense et transgne

    Transgense :

    p rocessus de transformation gntique

    introduction de caractres nouveaux dans une cellule

    absence de barrire entre les es pces

    Transgne : gne

    transfr un organisme laide de :

    vecteurs naturels ou artificielsmoyens ph ysiques ou c h imiques

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    2. Les vecteurs de clonage2. Les vecteurs de clonage

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    2.1. Structure des vecteurs2.1. Structure des vecteurs

    ORI : origine derplication

    sites de restrictiongne de rsistance

    une substancechimique

    vecteur

    z one de sites de restriction

    une origine de rplication

    utilisation de gne rsistant des substances c h imiques(ex: antibiotiques)

    utilisation du gne de la B - galactosidase

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    2.3. Les plasmides2.3. Les plasmides

    molcule dADN circulaire double brin

    3 100 kb

    unit de r p lication autonome :

    ORI : origine de r p licationr p lication ind pendante du gnome de la celluleh te

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    2.3. Les plasmides2.3. Les plasmides

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    2.3.1. Le vecteur pBR 3222.3.1. Le vecteur pBR 322

    sites multi p les et uniques pour enzymes de restriction connues "polylinker " = rgion sites multi p le de clonage.

    Un gne de rsistance lam p icilline (antibiotique)

    Un gne de rsistance la ttracycline (antibiotique)

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    2.3.1. Le vecteur pBR 3222.3.1. Le vecteur pBR 322

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    2.3.2. L2.3.2. Lee Plasmide pUCPlasmide pUC

    des sites multi p les et uniques des enzymes de restriction connues

    Un gne de rsistance lam p icilline

    Le gne lac Z qui code pour la B - galactosidase dans lo pronlactose

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    a . Lopron lactosea . Lopron lactose

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    b . Le gne lacZb . Le gne lacZ

    Le gne Z (a pp el lacZ) gne code pour la B - galactosidase

    Insertion du fragment dADN dans le p lasmide pUC :

    zone du gne codant pour la B - galactosidaseinactivation du gne

    Donc

    pas insertion ADN = activit enzymatiqueinsertion ADN = perte de lactivit enzymatique

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    b . Le gne lacZb . Le gne lacZ

    V rification de la p rsence ou labsence de lactivit enzymatiquede la B - galactosidase :

    com pos X - galsi cliv par la B - galactosidase = X - gal passe de lincolore au bleu

    pour mtaboliser le X - gal, la cellule doit tre ex pose uninducteur : IP TG (isopropylthio- B -D-galactoside).

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    b . Le gne lacZb . Le gne lacZ

    Colonies bleues = clones non recombinants ( pas de fragmentdADN insr)

    Colonies blanc h es = clones recombinants, insertion du fragmentdADN

    Slection visuelle des bactries transformes par les p lasmidesrecombinants

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    LLee Plasmide pUCPlasmide pUC

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    2.3.3. Avantages et inconvnients des plasmides

    Inconvnients :

    faible efficacit pour la transformation des bactriesim possibilit dinsrer des larges fragments dADN

    A vantages :

    petite taille du vecteur

    slection des p lasmides recombinants

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    2.4. Les bactriophages

    virus qui infectent les bactries

    ADN double brin

    gnome : 50 et 150 kb

    les extrmits de lADN = sim p les brins sur une longueur rduite

    forment des extrmits cohsives = squences cos (cohsives)

    5-G AATTC-33-CTTAA G-5

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    2.4.1. Le phage L

    ADN double brin

    gnome : 50 kb

    squences cos

    tte du virus

    queue du virus

    deux parties individualises :

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    2.4.2. Multiplication du phage2.4.2. Multiplication du phage L L

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    2.4.3. Avantages et inconvnients des phages

    Inconvnients :

    nombre de sites de restriction restreintsobligation dem paqueter lADN

    le maniement des ph ages est p lus com p lexe

    A vantages :

    taille des fragments dADN insrs su prieure aux p lasmidestransformation des bactries par les ph ages p lus efficace que

    pour les p lasmides

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    22.5. Les cosmides.5. Les cosmides

    vecteurs artificiels hybrides

    un gne de rsistance aux antibiotiques (am p icilline)

    une origine de r p lication

    site cos dun ph age L

    em paquet dans la tte dun virus L

    infecte les bactries

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    22.5.1. Les cosmides.5.1. Les cosmides

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    2.5.2. Avantages et inconvnients des cosmides2.5.2. Avantages et inconvnients des cosmides

    A vantages :

    taille des fragments insrables peut atteindre 50 kb

    transformation des bactries par les cosmides p lusefficace que pour les p lasmides

    Inconvnients :

    Obligation dem paqueter lADN

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    2.6. Autres types de vecteurs2.6. Autres types de vecteurs

    2.6.1. Les BAC

    (c h romosomes artificiels de bactries)

    fragments d'ADN de taille 100 350 kb.

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    2.6.2. Les YAC2.6.2. Les YAC

    ch romosome artificiel de levure

    I nconvnient :

    fragments insrs subissent parfois des rarrangements(insertions, dltions)

    pas absolument re p rsentatifs de la rgion initiale introduite

    analyse des grands gnomes (gnome humain)

    utiliss pour insrer de lADN tranger dans les cellules eucaryotes

    clonage de fragments de grande taille (jusqu' 1500kb)