Click here to load reader

BIOCHIMIE STRUCTURALE Les PROTI · PDF fileBIOCHIMIE STRUCTURALE Les PROTIDES Christine CHEVALIER Cours biochimie Protides IFTAB 1 Christine CHEVALIER ... Hiérarchiser et reconnaître

  • View
    298

  • Download
    5

Embed Size (px)

Text of BIOCHIMIE STRUCTURALE Les PROTI · PDF fileBIOCHIMIE STRUCTURALE Les PROTIDES Christine...

  • IFTAB

    BIOCHIMIE STRUCTURALE

    Les PROTIDES

    Christine CHEVALIER

    Cours biochimie Protides IFTAB Christine CHEVALIER 12005-2006

  • BIOCHIMIE STRUCTURALE PROTIDES

    Comptences attendues lissue du cours et des travaux dirigs

    Dcrire les caractristiques des acides amins naturels

    Donner leur classification en fonction de la nature de leur radical et illustrer l'aide d'exemples.

    Dcrire leurs proprits physiques et chimiques en soulignant les proprits originales dues la

    prsence simultane des fonctions amine et acide carboxylique.

    Dgager les proprits prsentant un intrt analytique.

    Dfinir ion mixte, pH isolectrique

    Prciser les caractristiques gomtriques de la liaison peptidique.

    Exposer les proprits physiques et chimiques des peptides intressantes pour l'analyse.

    Donner un exemple de peptides d'intrt biologique : ( glutathion, peptides hormonaux,

    antibiotiques..)

    Hirarchiser et reconnatre les diffrents niveaux de structure des peptides et des protines :

    structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire.

    Illustrer les diffrents niveaux de structure par des exemples simples

    Dfinir les protines fibreuses et les protines globulaires.

    Indiquer les liaisons chimiques faibles participant la stabilisation des structures

    tridimensionnelles.

    Dcrire schmatiquement deux types de structure secondaire : hlice alpha et feuillet pliss

    bta.

    Montrer le rle des liaisons peptidiques et des liaisons hydrognes dans ces architectures.

    Mettre en vidence la relation entre l'intgrit de l'activit spatiale et l'activit biologique

    Indiquer les principaux agents dnaturants

    Dcrire les proprits exploitables dans la prparation et l'analyse des protines : solubilit,

    absorption de la lumire, diffusion, ionisation, ractions colores, proprits immunologiques.

    Connatre les principes, l'intrt et les limites des mthodes d'extraction, de fractionnement, de

    purification, d'identification et de dosage appliqu aux protines.

    Dfinir holoprotines et htroprotines.

    Donner des exemples de protines globulaires et fibreuses.

    Montrer l'aide d'exemples la diversit des htroprotines.

    Cours biochimie Protides IFTAB Christine CHEVALIER 22005-2006

  • Introduction........................................................................................................ 5

    1 Les acides amins .................................................................................. 5

    1.1 Proprits des acides amins ...............................................................................8 1.1.1 Proprits physiques ............................................................................................................... 8

    1.1.1.1 Solubilit.............................................................................................................................. 8 1.1.1.2 Proprits optiques : le pouvoir rotatoire ............................................................................ 8 1.1.1.3 Absorption lumineuse dans lultraviolet............................................................................... 9

    1.1.2 Proprits ioniques.................................................................................................................. 9 1.1.2.1 Cas des acides amins neutres: ......................................................................................... 9 1.1.2.2 Cas des acides amins acides:......................................................................................... 12 1.1.2.3 Cas des acides amins basiques:..................................................................................... 13

    1.1.3 Proprits chimiques communes tous les acides amins.................................................. 16 1.1.3.1 Proprits de la fonction acide carboxylique -COOH ....................................................... 16 1.1.3.2 Proprits de la fonction amine primaire NH2 ................................................................. 16 1.1.3.3 Proprits des fonctions COOH et -NH2 conjointes........................................................ 18

    1.1.4 Proprits chimiques des chanes latrales.......................................................................... 18

    1.2 Mthodes de dosage et danalyse des acides amins ........................................19 1.2.1 Mthodes de dosage total ..................................................................................................... 19

    1.2.1.1 Mthode de Kjeldahl ......................................................................................................... 19 1.2.1.2 Mthode de Srensen....................................................................................................... 20 1.2.1.3 Dosage spectrophotomtrique la ninhydrine ................................................................. 20

    1.2.2 Mthodes de dosage spcifiques de certains acides amins ............................................... 20 1.2.2.1 Dosage spectrophotomtrique dans lultraviolet ............................................................... 20 1.2.2.2 Dosage spectrophotomtrique dans le visible .................................................................. 20

    1.2.3 Techniques de sparation des acides amins ...................................................................... 20 1.2.3.1 llectrophorse................................................................................................................. 20 1.2.3.2 La chromatographie .......................................................................................................... 20

    1.2.3.2.1 Chromatographie papier des acides amins .....................................................21 1.2.3.2.2 Chromatographie sur couche mince des acides amins (CCM) ......................22 1.2.3.2.3 Chromatographie ionique des acides amins ...................................................22 1.2.3.2.4 La chromatographie gazeuse (CG) ..................................................................23

    1.2.3.3 Llectrochromatographie.................................................................................................. 23

    2 les peptides ........................................................................................... 24

    2.1 Proprits de la liaison peptidique et des peptides..............................................24 2.1.1 Squence dun peptide.......................................................................................................... 25

    2.2 Dtermination de la squence dun peptide ........................................................25 2.2.1 Dtermination de la composition brute dun peptide ............................................................. 25 2.2.2 Dtermination de lacide amin N terminal............................................................................ 26 2.2.3 Dtermination de lacide amin C terminal............................................................................ 26 2.2.4 Coupures spcifiques internes .............................................................................................. 26

    2.3 Quelques peptides dintrt biologique ou alimentaire ........................................27 2.3.1 Peptides hormonaux.............................................................................................................. 27 2.3.2 Glutathion .............................................................................................................................. 28 2.3.3 Peptides antibiotiques ........................................................................................................... 28 2.3.4 Peptides dintrt alimentaire ................................................................................................ 29

    3 Les protines ........................................................................................ 29

    3.1 Structure des protines .......................................................................................29 3.1.1 La structure primaire.............................................................................................................. 30 3.1.2 La structure secondaire ......................................................................................................... 30

    3.1.2.1 Lhlice alpha .................................................................................................................... 31

    Cours biochimie Protides IFTAB Christine CHEVALIER 32005-2006

  • 3.1.2.2 Le feuillet ........................................................................................................................ 33 3.1.3 La structure tertiaire............................................................................................................... 33

    3.1.3.1 Maintien de la structure..................................................................................................... 34 3.1.3.2 Protines globulaires......................................................................................................... 34 3.1.3.3 Protines fibreuses............................................................................................................ 35

    3.1.4 La structure quaternaire ........................................................................................................ 35

    3.2 Proprits des protines......................................................................................36 3.2.1 Solubilit ................................................................................................................................ 36 3.2.2 Dnaturation ..................................................

Search related