8/14/2019 Biologie : Microbiologie prdictive

1/2

24 s LACTUALIT POITOU-CHARENTES s N 54 s

Microbiologie

tre jeunes docteurs en science. Laurat de plusieurs

concours daide la cration dentreprise, le projet

voit le jour et la socit MTis Biotechnologies (du

nom de Mtis, desse de toutes les sciences et de tous

les savoirs dans la mythologie grecque), implante

Limoges, est effectivement cre en fvrier 2000.

La cytomtrie en flux est une technique analytique et

prparative relativement rcente. Son objectif est

danalyser, pour ventuellement les trier, des cellules

en suspension. Le principe utilis est simple : les cel-

lules sont incubes en prsence de marqueurs spci-fiques de molcules choisies. On peut par exemple

marquer spcifiquement deux populations de cellu-

les du sang : les lymphocytes T et les lymphocytes B.

La suspension est ensuite injecte devant un faisceau

laser. Les cellules, qui passent en file indienne devant

la source lumineuse, diffractent la lumire et met-

tent alors une fluorescence. Cette mission de lumire

varie selon la nature et la quantit de marqueur fix

par la cellule. Les donnes lumineuses sont collec-

tes puis filtres avant dtre converties en donnes

numriques et analyses par ordinateur. Un modulede tri peut aussi sparer les cellules, toujours sur le

mme principe de marquages diffrents. Cette tech-

nique en plein essor sapplique aujourdhui divers

domaines de la biologie vgtale, animale (dont

lhomme), et de la microbiologie.Les activits de MTis Biotechnologies sexercent

autour de trois ples : la microbiologie, la sant hu-

maine et la recherche et le dveloppement, particu-

lirement dans le domaine du diagnostic vtrinaire,

explique Stphane Sermadiras, le prsident de

lentreprise. Nous disposons de trois laboratoires. Le

premier est ddi la sant humaine, la culture de

cellules et au tri cellulaire. Nous y effectuons de la

recherche sous contrat en mettant notre technologie

et nos comptences au service des industries phar-

maceutiques, cosmtiques et mme de certains labo-ratoire de recherche. Le second est un laboratoire de

recherche et dveloppement, ax sur le dveloppement

et la validation de nouveaux tests microbiologiques

et sur lamlioration de protocoles existant dj dans

ce domaine. Enfin, un laboratoire ddi lanalyse

de routine, entirement automatis, sera opration-

nel cet automne. Sa capacit de production sera de

800 analyses par jour.

La cration de cette entreprise rpondait un besoin

vident. En effet, par comparaison avec des mtho-

des plus traditionnelles danalyse microbiologique, lesintrts de la cytomtrie en flux sont nombreux. Les

classiques cultures sur bote de Ptri sont longues (de

E

biologie

Une analyse rapide spcifique et fiable : la cytomtrie

en flux rpond la demande des industries

pharmaceutique, agroalimentaire et vtrinaire

Par Laetitia Becq-Giraudon

prdictive

n 1998, lide de crer une socit qui dve-

lopperait les nouvelles applications de la

cytomtrie en flux nat dans lesprit de qua-

8/14/2019 Biologie : Microbiologie prdictive

2/2

s LACTUALIT POITOU-CHARENTES s N 54 s 25

2 14 jours), peu sensibles et peu fiables. Des mtho-

des alternatives pour lanalyse microbiologique ra-

pide ont donc petit petit fait leur apparition. Lune

des plus utilises est la PCR, qui fait appel directe-

ment la biologie molculaire. Bien que spcifique,

cette mthode reste encore chre, brevete et relati-

vement longue. Dautre part, elle ne permet pas de

visualiser une diffrence entre un micro-organisme

viable ou non viable. Lindustrie tait donc deman-

deuse dune mthode rapide, fiable, spcifique et

quantitative et peu coteuse. En matire de micro-

biologie, MTis Biotechnologies a donc pour objectif

de rpondre cette demande de service venant de

toute lindustrie agroalimentaire. Les mthodes que

nous mettons au point permettent danalyser des pro-

duits solides, liquides ou gazeux. Grce des proc-

dures de marquage par anticorps ou activit enzyma-

tique spcifique par exemple, ces produits sont ana-

lyss par cytomtrie en flux, ajoute Stphane

Sermadiras. Les avantages de la mthode sont trs

comptitifs. En particulier, grce lautomatisation,

les rsultats sont obtenus en quelques minutes au lieu

de plusieurs jours et avec une sensibilit prs de mille

fois suprieure une analyse classique. Et ils sont

quantitatifs, ce qui est primordial en matire de scu-

rit alimentaire par exemple. Quarante tests sont dis-

ponibles dans ce domaine et quarante-quatre suppl-

mentaires devraient ltre dici la fin de lanne. Nous

pouvons par exemple rechercher, outre la flore totale

dun aliment, les bactries Escherichia coli, Salmonella

ou Listeria. Cest le cas dans le lait ou le poisson. Nous

effectuons ces tests pour un panel dentreprises assez

large : salaisons et industries charcutires, industries

de la viande, fruits, jus de fruits, compotes, eaux, pro-

duits laitiers, crales, poissons... Nous intervenons

aussi bien sur les matires premires que sur des pro-

duits finis ou en cours de fabrication. Dun point de

vue plus pratique, cette microbiologie prdictive vise

dterminer quelle sera la qualit microbiologique dun

produit au moment de sa date limite de consommation,

par exemple partir de la connaissance de sa qualit

microbiologique le jour de la premire analyse.Enfin,MTis Biotechnologiesse positionne aussi au

sein de lindustrie vtrinaire dont les attentes sont

les mmes que celles de lindustrie agroalimentaire :

disposer dune analyse rapide, sensible, spcifique et

fiable. Les solutions dveloppes pour lhygine ali-

mentaire sont applicables au diagnostic vtrinaire.

Il sagit danalyser les micro-organismes pathognes

vecteurs de maladies, notamment dans les troupeaux

dlevage. Dans ce cadre, les objectifs de lentreprise

sont donc le dveloppement de tests plus rapides et

plus sensibles que ceux existant dj, avec, terme,lespoir de commercialiser des kits de diagnostics

auprs des laboratoires danalyses vtrinaires. s

Phnotype de la

population de

lymphocites B

purifie partir

de cellulesmononucles.

Christian Dumas est professeur

lEcole normale suprieure de Lyon

et membre de lInstitut universitaire

de France. Par ailleurs, il dirige un

laboratoire mixte CNRS-ENS-

Universit de Lyon sur la

reproduction sexue des plantes.

LActualit. Quels sont les

apports de la bioinformatique

la biologie vgtale?

Christian Dumas. Labioinformatique est une discipline

assez rcente. Ses apports la

biologie vgtale sont du mme

ordre que ceux fournis aux autres

disciplines biologiques : humaine,

animale, etc. Il sagitessentiellement de comparer des

squences et de mettre au point

des dispositifs permettant

didentifier tout ou partie dune

squence qui prsente des

homologies avec dautres dj

stockes dans les banques de

donnes. Il peut sagir de mettre au

point des modles informatiques

danalyse pour tudier lvolution

de certains gnes (squences) et de

retrouver les filiations entre gnes

(donc les individus, les familles).

Enfin, linformatique et les

mathmatiques vont peut-tre

apporter des lois de codification

du vivant qui nexistent pas encore.

La connaissance approfondie

des gnomes et de leur

organisation a permis la

cration de plantes

gntiquement modifies.

A-t-elle modifi les notions

dthique en matire de

biologie vgtale ?

Il y a la mme thique en matire de

biologie vgtale que dans les

autres sciences en gnral, les

sciences biologiques en

particulier : celle du chercheur.

Concernant les OGM, on devrait

parler de prsomptions plutt que

de risques avrs, surtout pour lesplantes transgniques dites de

nouvelles gnrations.

Codifier

le vivant