Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie ?· Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Métabolique…

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    11-Sep-2018

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  • Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Mtabolique

    1. Rappel en Bionergtique

    Thermodynamique Aspect Enzymatique Oxydorduction

    2. La chane respiratoire mithocondriale (CRM) Les diffrents complexes Thorie chimio-osmotique Bilans nergtiques

    3. Le mtabolisme

    3.1. Le mtabolisme des glucides Voie dEmbden-Meyerhof : la glycolyse

    Ractions Bilan nergtique Les sources de glucose Rgulation Devenir du pyruvate

    La glycognognse La noglucognognse

    3.2. Le cycle de Krebs Les ractions Le bilan nergtique

    3.3. Le mtabolisme des lipides La -oxydation des acides gras

    Activation Transport Etapes de la dgradation Bilans energtiques Cas particuliers

    La voie de Wakil Formation du palmitate Dsaturations

    Formation des Triglycrides

    3.4. Le mtabolisme des protines Dgradation des acides amins

    Dsamination oxydative Transamination Cycle de lure Dgradation du squelette carbon

    Synthses de certains acides amins

  • Quelques sites : http://ww.snv.jussieu.fr/bmedia/ http://www.gwu.edu/~mpb/index.html http://fr.wikibooks.org/wiki/Les_principales_voies_du_m%C3%A9tabolisme#La_cha.C3.AEne_respiratoire

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    3 / 16

    N

    NN

    N

    NH2

    O

    OHOH

    CH2

    O

    P

    O

    P

    O

    O

    HO O

    HO

    CH2

    CHOH

    CHOH

    CHOH

    CH2

    N

    NN

    NH

    O

    O

    H3C

    H3C

    FAD

    CH2

    HN

    NH

    N

    NH

    O

    O

    H3C

    H3C

    FADH2

    N

    N N

    N

    NH2

    O

    OHOH

    CH2OPO

    OH

    O

    P

    OH

    O OO

    OHOH

    CH2 N

    CONH2

    +

    NAD+

    N

    CONH2

    NADH + H+

    O

    OOH

    CH2

    NADP+ - NADPH + H+

    P OHO

    OH

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    4 / 16

    N

    N N

    N

    NH2

    O

    OHO

    CH2OPO

    OH

    O

    P

    OH

    O O CH2

    Co-enzyme A

    P OHO

    OH

    C CHOH

    CH3

    CH3

    CO NH CH2 CH2 CO NH CH2 CH2 SH

    acide panthothnique

    -mercaptothylamine

    N

    N N

    N

    NH2

    O

    OHOH

    CH2OPOPOPHO

    O

    OH

    OO

    OH OH

    AMP

    ADP

    ATP

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    5 / 16

    Les complexes de la chane respiratoire mitochondriale

    Composition des complexes de la chane de transport dlectrons

    Complexe protomres masse molaire(kDa) Composants

    complexe I : NADH-coenzyme Q

    oxydorductase 25 800 1 FMN22 24 atomes Fe - S

    dans 5 8 centres

    complexe II : succinate-coenzyme Q

    oxydorductase 4 125 1 FAD7 8 atomes Fe - S dans

    3 centrescytochrome b

    complexe III : coenzyme Q-cytochrome c

    oxydorductase 8

    2 centres Fe - Scytochrome b560cytochrome b566cytochrome c1

    complexe IV : cytochrome c oxydase 12 220

    cytochrome acytochrome a32 ions cuivre

    Complex I NADH + H+ FMN Fe2+S CoQ

    NAD+ FMNH2 Fe3+S CoQH2

    Complex II Succinate FAD Fe2+S CoQ

    Fumarate FADH2 Fe3+S CoQH2 Complex III CoQH2 cyt b ox Fe2+S cyt c1 ox cyt c red

    CoQ cyt b red Fe3+S cyt c1 red cyt c ox

    Complex IV cyt c red cyt a ox cyt a3 red O2

    cyt c ox cyt a red cyt a3 ox 2 H2O

    ATPase (complexe V)

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    6 / 16

    La CRM : les complexes et les lments mobiles Le gradient de protons Les bilans nergtiques de la CRM

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    7 / 16

    Les ractions de la Glycolyse

    Bilans nergtiques de la glycolyse

    Valeurs des enthalpies libres standards et physiologiques des ractions de la glycolyse

    G0 G Raction kJ.mol-1

    1 -16,7 -33,5 2 +1,7 -2,5 3 -14,2 -22,2 4 +23,9 -1,3 5 +7,6 +2,5 6 +12,6 -3,4 7 -37,6 +2,6 8 +8,8 +1,6 9 +3,4 -6,6 10 -62,8 -33,4

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    8 / 16

    Fructose et Galactose : autres sources de glucose pour la glycolyse

    La glycognolyse

    Rgulation, de la phosphorylase

    Bilan de la glycognolyse

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    9 / 16

    Rgulation de la glycolyse

    Fermentation lactique et son bilan nergtique Fermentation alcoolique

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    10 / 16

    Dcarboxylation oxydative du pyruvate Rgulation de la PDH

    Les navettes

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    11 / 16

    Rgulation de la glucognognse

    Glucognognse

    Noglucognognse

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    12 / 16

    Les ractions du cycle de Krebs

    Valeurs des enthalpies libres standards des ractions du cycle de Krebs Raction G0

    kJ.mol-1 1 -32,2 2 +6,3 3 -20,9 4 -33,5 5 -2,9 6 0,0 7 -3,8 8 +29,7

    Description de la raction 4 du cycle de Krebs

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    13 / 16

    Bilan nergtique du cycle de Krebs

    Bilan nergtique de la Glycolyse et du Cycle de Krebs

    Rgulation du cycle de Krebs

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    14 / 16

    Activation des acides gras

    Transport Carnitine Hlice de Lynen Bilan nergtique de la -oxydation des acides gras

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    15 / 16

    Navette citrate

    Etapes de la synthse des acides gras

    Bilan de la synthse du palmitate

  • BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU

    16 / 16

    Dgradation du groupement amine des acides amins

    Cycle de lUre Elimination de lure

    Dgradation du squelette carbon Schma des voies de synthse des acides amins

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