Cours de Biochimie (PACES, UE1)

Responsables de l’enseignement:

•Professeur Hubert de Verneuil

•Professeur François Moreau-Gaudry

•Professeur Philippe Derache

Cours magistraux: 25 heures

Enseignements dirigés: 5 heures

1 PACES UE1 Biochimie

Cours de Biochimie

•Introduction générale

•Acides aminés, peptides, protéines

•Enzymologie

•Glucides et Lipides

•Catabolisme glucidique

•Production d’énergie

•Mise en réserve de l’énergie

•Contrôle hormonal du métabolisme glucido-lipidique

2 PACES UE1 Biochimie

Ouvrages de référence

•Principe de Biochimie: Lehninger (Ed Flammarion)

•La Biochimie: Stryer (Ed Flammarion)

•Biochimie de Harper (Ed de Boeck Université)

•Chimie Biochimie et Biologie moléculaire: Sablonniere (Ed Omniscience)

•Biochimie et Biologie moléculaire: Kamoun, Lavoinne, de Verneuil (Ed

Flammarion)

•Aide mémoire de Biochimie et de Biologie moléculaire: Lavoinne et Békri

(Ed Flammarion)

3 PACES UE1 Biochimie

Introduction générale Quelques définitions:

•Génome: ensemble des molécules d’ADN contenant les gènes

Génome nucléaire (chromosomes) 24.000 gènes

Génome mitochondrial: 37 gènes

•Transcriptome: ensemble des ARN synthétisés à partir des gènes

actifs

•Protéome: ensemble des protéines présentes dans la cellule,

synthétisées à partir des ARN messagers

•Métabolome: ensemble des macromolécules (sauf les protéines) et

molécules simples (métabolites) que l’on trouve dans une cellule.

4 PACES UE1 Biochimie

Les bases moléculaires de la Vie

•La Biochimie est une discipline enseignée

Universelle

En constante mutation

Médicale

Physiopathologie

Diagnostic

Traitement

En lien étroit avec la nutrition

5 PACES UE1 Biochimie

Les lois physico-chimiques

Particularités:

•Température réactionnelle: 37 °C

•pH neutre le plus souvent

•Milieu hétérogène: interactions multiples

6 PACES UE1 Biochimie

L’expérimentation

•in vitro: tube à essai, cultures cellulaires, organes

d’animaux isolés

•in vivo: sur l’organisme entier

•ex vivo: réimplantation de cellules ou de tissus, modifiés

ou non, dans un organisme vivant (biothérapies)

7 PACES UE1 Biochimie

Biochimie: chimie du vivant

•Structure des molécules

•Localisation cellulaire, dans les organes

•Métabolisme

Anabolisme

Catabolisme

•Evénements générés par le métabolisme

8 PACES UE1 Biochimie

La place de la Biochimie

1A 10 A 100 A 1000 A 104 A 105 A

Dimensions de quelques molécules biologiques, organites et cellules

Liaison C-C

Bactéries Ribosome Hémoglobine Glucose

Limite de résolution

du microscope optique

ATOME

MOLECULES

MACROMOLECULES

ORGANITES CELLULES

1 nm 1mm 10 mm

9 PACES UE1 Biochimie

Les acteurs moléculaires •Les minéraux

•Les molécules organiques

•Les protéines

•Les glucides et les polysaccharides

•Les lipides

•Les nucléotides et les acides nucléiques

•Les molécules du vivant sont porteuses d’information

Action locales: médiateurs

Action à distance

Neurotransmetteurs

Hormones

Autres: interleukines…

10 PACES UE1 Biochimie

Interactions entre biomolécules

•Protéines – protéines

•Glucides – protéines

•Lipides – protéines

•Acides nucléiques - protéines

•Hormone – récepteur

•Substrat – enzyme

•Ligand - récepteur

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11 PACES UE1 Biochimie