62
Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Chiffres clés Indicateurs hebdomadaires semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) b * Données non consolidées Indicateurs cumulés du 1 er mars 2020 au 12 janvier 2021 Nombre de cas de COVID-19 ayant été hospitalisés (SI-VIC) 277 165 Nombre de décès liés à la COVID-19 (décès en hospitalisation et décès en EHPA et autres EMS) 68 802 S01* S53 Évolution Nombre de nouveaux cas confirmés de COVID-19 (SI-DEP) 126 022 97 025 +30% Taux de positivité (%) pour SARS-CoV-2 (SI-DEP) 6,5% 5,4% +1,1 point Taux de dépistage (/100 000 habitants) pour SARS-CoV-2 (SI-DEP) 2 910 2 666 +9% Nombre d’actes SOS Médecins pour suspicion de COVID-19 2 750 2 417 +14% Nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (réseau OSCOUR ® ) 5 543 5 502 +0,7% Nombre de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC) 8 872 7 460 +19% Nombre de nouvelles admissions en réanimation de patients COVID-19 (SI-VIC) 1 375 1 135 +21% Nombre de décès liés à la COVID-19 (décès en hospitalisation et décès en EHPA et autres EMS) 2 298 2 360 Non consolidée Santé publique France, dans le cadre de ses missions de surveillance, d’alerte et de prévention, analyse et publie les données concernant la COVID-19 issues de son réseau de partenaires et de ses propres études et enquêtes. Ce bilan est basé sur les données rapportées à Santé publique France jusqu’au 13 janvier 2021. COVID-19 Point épidémiologique hebdomadaire du 14 janvier 2021 Santé publique France s’appuie sur un réseau d’acteurs pour assurer la surveillance COVID-19 : médecins libéraux, SAMU Centre 15, médecins hospitaliers, laboratoires de biologie médicale hospitaliers et de ville, sociétés savantes d’infectiologie, de réanimation, de médecine d’urgence, Cnam, Inserm, Insee. Points clés En semaine 01, progression de la circulation du SARS-CoV-2 à un niveau élevé • Forte augmentation du nombre de cas confirmés, plus marquée chez les moins de 20 ans • Augmentation de l’activité de dépistage parmi les personnes symptomatiques • Tendance à l’augmentation des hospitalisations et admissions en service de réanimation • Régions les plus touchées : Provence-Alpes-Côte d’Azur, Bourgogne-Franche-Comté, Grand Est et Auvergne-Rhône-Alpes Mortalité • Mortalité liée à la COVID-19 toujours élevée Variants émergents du SARS-CoV-2 • Identification de 66 cas d’infection au variant VOC 202012/01 (Royaume-Uni) et de 3 cas d’infection au variant 501Y.V2 (Afrique du Sud) Prévention • Vaccination : 247 166 personnes vaccinées au 13 janvier 2021 • Maintien nécessaire des mesures de prévention individuelles et de réduction des contacts • En cas de symptômes, nécessité d’un isolement immédiat et réalisation d’un test dans les plus brefs délais

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 1

Chiffres cleacutes

Indicateurs hebdomadaires semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

b

Donneacutees non consolideacutees

Indicateurs cumuleacutes du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021

Nombre de cas de COVID-19 ayant eacuteteacute hospitaliseacutes (SI-VIC) 277 165

Nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 (deacutecegraves en hospitalisation et deacutecegraves en EHPA et autres EMS)

68 802

S01 S53 Eacutevolution

Nombre de nouveaux cas confirmeacutes de COVID-19 (SI-DEP) 126 022 97 025 +30

Taux de positiviteacute () pour SARS-CoV-2 (SI-DEP) 65 54 +11 point

Taux de deacutepistage (100 000 habitants) pour SARS-CoV-2 (SI-DEP)

2 910 2 666 +9

Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 2 750 2 417 +14

Nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (reacuteseau OSCOURreg)

5 543 5 502 +07

Nombre de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC)

8 872 7 460 +19

Nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation de patients COVID-19 (SI-VIC)

1 375 1 135 +21

Nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 (deacutecegraves en hospitalisation et deacutecegraves en EHPA et autres EMS)

2 298 2 360 Non

consolideacutee

Santeacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance drsquoalerte et de preacutevention analyse et publie les donneacutees concernant la COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires et de ses propres eacutetudes et enquecirctes Ce bilan est baseacute sur les donneacutees rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021

Points cleacutesSanteacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance et

drsquoalerte analyse les donneacutees concernant la COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires Ce bilan est baseacute sur les donneacutees eacutepideacutemiologiques de surveillance de la COVID-19 (SARS-CoV-2) rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 16 deacutecembre 2020

Points cleacutesSanteacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance

drsquoalerte et de preacutevention analyse et publie les donneacutees concernant la COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires et de ses propres eacutetudes et enquecirctes Ce bilan est baseacute sur les donneacutees rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 06 janvier 2021

Points cleacutesSanteacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance et

drsquoalerte analyse les donneacutees concernant la COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires Ce bilan est baseacute sur les donneacutees eacutepideacutemiologiques de surveillance de la COVID-19 (SARS-CoV-2) rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 16 deacutecembre 2020

Points cleacutes

En semaine 01 bull

bull

bull

bull Reacutegions les plus toucheacutees

Mortaliteacute bull Mortaliteacute lieacutee agrave la COVID-19 toujours eacuteleveacutee Nouveaux variants du SARS-CoV-2 bull Preacutevention bull bull Maintien neacutecessaire des mesures de preacutevention individuelles et de reacuteduction des contacts bull En cas de symptocircmes neacutecessiteacute drsquoun isolement immeacutediat et reacutealisation drsquoun test dans les plus brefs deacutelais

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LrsquoESSENTIEL INTER 1 Points cleacutes Inter 2 + Flegraveche devant

COVID-19 Point eacutepideacutemiologique hebdomadaire du 14 janvier 2021

Santeacute publique France srsquoappuie sur un reacuteseau drsquoacteurs pour assurer la surveillance COVID-19 meacutedecins libeacuteraux SAMU Centre 15 meacutedecins hospitaliers laboratoires de biologie meacutedicale hospitaliers et de ville socieacuteteacutes savantes drsquoinfectiologie de reacuteanimation de meacutedecine drsquourgence Cnam Inserm Insee

Points cleacutes

En semaine 01 progression de la circulation du SARS-CoV-2 agrave un niveau eacuteleveacute

bull Forte augmentation du nombre de cas confirmeacutes plus marqueacutee chez les moins de 20 ans

bull Augmentation de lrsquoactiviteacute de deacutepistage parmi les personnes symptomatiques

bull Tendance agrave lrsquoaugmentation des hospitalisations et admissions en service de reacuteanimation

bull Reacutegions les plus toucheacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Mortaliteacute bull Mortaliteacute lieacutee agrave la COVID-19 toujours eacuteleveacutee Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 bull Identification de 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et de 3 cas drsquoinfection au variant 501YV2 (Afrique du Sud) Preacutevention bull Vaccination 247 166 personnes vaccineacutees au 13 janvier 2021 bull Maintien neacutecessaire des mesures de preacutevention individuelles et de reacuteduction des contacts bull En cas de symptocircmes neacutecessiteacute drsquoun isolement immeacutediat et reacutealisation drsquoun test dans les plus brefs deacutelais

Attention saut de section en bas de cette page

LrsquoESSENTIEL INTER 1 Points cleacutes Inter 2 + Flegraveche devant En raison drsquoun deacutefaut de remonteacutees de donneacutees sur les tests par le systegraveme drsquoinformation SI-DEP vers Santeacute Publique France les indicateurs baseacutes sur les donneacutees des tests de diagnostic reacutealiseacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale ont eacuteteacute sous-estimeacutes en semaines 43 et 44 Les indicateurs issus de cette source de donneacutees ne sont pas tous preacutesenteacutes comme habituellement dans ce point eacutepideacutemiologique qui inclut toutes les autres sources de la surveillance COVID-19 Ce problegraveme est en cours de reacutesolution avec les acteurs concerneacutes et une mise agrave jour de ces donneacutees sera reacutealiseacutee degraves que possible

France meacutetropolitaine Texte courant gras violet bull Texte courant Texte courant

bull Texte courant

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 2

Point de situation en semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 agrave un niveau eacuteleveacute en France suite aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee De plus lrsquoeacutemergence de variants pourrait conduire agrave une acceacuteleacuteration de lrsquoeacutepideacutemie et neacutecessite une vigilance accrue et un renforcement du respect des mesures drsquoisolement en cas de symptocircmes ou de cas de COVID-19 dans lrsquoentourage Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage a augmenteacute suite agrave la baisse observeacutee en semaine 53 lors des congeacutes de fin drsquoanneacutee Un total de 18 003 cas confirmeacutes a eacuteteacute rapporteacute en moyenne chaque jour durant la semaine 01 Le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation en semaine 01 (+30 par rapport agrave la semaine 53) Le nombre de cas confirmeacutes a augmenteacute dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge et de faccedilon plus marqueacutee chez les 0-19 ans (+46) Le taux de positiviteacute (65) a continueacute agrave augmenter par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (+11 point) Lrsquoaugmentation plus importante du nombre de cas par rapport agrave celle du nombre de personnes testeacutees est en faveur drsquoune reacuteelle augmentation de la circulation du virus entre les semaines 53 et 01

Plusieurs indicateurs du contact-tracing sont en augmentation refleacutetant lrsquoimpact des fecirctes de fin drsquoanneacutee ce qui pourrait conduire agrave une augmentation du nombre de cas dans les prochains jours

En milieu hospitalier les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation ont augmenteacute Le nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 eacutetait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation

Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 incluant les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital et en eacutetablissements meacutedico-sociaux eacutetait toujours eacuteleveacute cette semaine Plus de 68 000 deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021

Soixante-six cas drsquoinfection au variant eacutemergent du SARS-CoV-2 deacutetecteacute au Royaume-Uni et trois cas drsquoinfection au variant eacutemergent du SARS-CoV-2 deacutetecteacute en Afrique du Sud ont eacuteteacute rapporteacutes en France Plusieurs actions sont meneacutees actuellement pour mieux eacutevaluer et suivre la diffusion sur le territoire national de ces variants eacutemergents Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacute aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Les mesures de preacutevention et de distanciation sociale restent les principaux moyens permettant de freiner la circulation du virus SARS-CoV-2 et drsquoen reacuteduire lrsquoimpact sur le systegraveme de soins et la mortaliteacute Lrsquoadheacutesion agrave ces mesures est drsquoautant plus essentielle dans le contexte de lrsquoidentification de variants eacutemergents avec une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires

La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Le deacuteploiement des vaccins dans les reacutegions est en cours afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront baseacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021 Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence de variants eacutemergents sur le territoire

Il reste enfin deacuteterminant que chaque personne preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 srsquoisole immeacutediatement et reacutealise un test diagnostique dans les plus brefs deacutelais Lrsquoutilisation des outils numeacuteriques (TousAntiCovid) est eacutegalement recommandeacutee pour renforcer les mesures de suivi des contacts et drsquoisolement rapide

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 3

SOMMAIRE

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE 4

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE 6

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - ENQUEumlTE FLASH 15

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS 17

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX 23

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) 26

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo 27

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER 29

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES

PEacuteDIATRIQUES 35

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute 37

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute 39

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 46

PREacuteVENTION 48

SITUATION INTERNATIONALE 49

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL 52

SYNTHEgraveSE 55

SOURCES DES DONNEacuteES 60

Les donneacutees de laquo Surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo laquo Surveillance des professionnels en eacutetablissements de santeacute raquo et laquo Signalement drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 nosocomiales raquo sont preacutesenteacutees une semaine sur deux Bilan des clusters Le nombre de clusters a augmenteacute de faccedilon importante depuis la mise en place du systegraveme drsquoinformation laquo Monic raquo (SI-Monic) Cependant ce nombre est actuellement fortement sous-estimeacute Depuis plusieurs semaines la notification des clusters et leur saisie dans SI-Monic sont prioriseacutes de faccedilon heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions et les deacutecisions prises par les Agences reacutegionales de santeacute la prioriteacute pouvant ecirctre donneacutee agrave la criticiteacute des clusters ou agrave certaines collectiviteacutes Il nrsquoest donc pas possible actuellement de produire des indicateurs nationaux de qualiteacute agrave partir de la base de donneacutees issue du SI-Monic Le SI-Monic constituera agrave nouveau un outil pertinent si les niveaux de transmission du SARS-CoV-2 atteignent ceux ayant justifieacute sa mise en place agrave la sortie du premier confinement en mai 2020

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 4

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE Reacuteseau Sentinelles La surveillance des infections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale par le Reacuteseau Sentinelles permet drsquoestimer leur incidence en France meacutetropolitaine Ces donneacutees cliniques sont compleacuteteacutees depuis le 13 septembre 2020 par une surveillance virologique pour une partie des personnes chez lesquelles sont reacutealiseacutes des preacutelegravevements Les reacutesultats des deux derniegraveres semaines seront consolideacutes dans les prochaines semaines

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) le taux drsquoincidence de consultations pour une IRA a eacuteteacute estimeacute agrave 95100 000 habitants (intervalle de confiance agrave 95 [82-108]) en France meacutetropolitaine en augmentation par rapport agrave celui de la semaine 53 65100 000 habitants (IC95 [55-75]) (Figure 1) En semaine 01 sur les 27 preacutelegravevements effectueacutes chez des patients preacutesentant une IRA 5 preacutelegravevements se sont aveacutereacutes positifs pour le SARS-CoV-2 2 eacutetaient positifs pour un rhinovirus et 1 pour un meacutetapneumovirus Aucun ne srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal Depuis la semaine 37 sur les 571 preacutelegravevements effectueacutes chez les patients qui ont eacuteteacute testeacutes pour les diffeacuterents virus respiratoires surveilleacutes sur preacutelegravevement nasopharyngeacute 223 (39) eacutetaient positifs pour un rhinovirus 104 (18) pour le SARS-CoV-2 6 pour un meacutetapneumovirus et 1 pour un virus respiratoire syncytial (VRS) Un preacutelegravevement srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal de type BVictoria en semaine 49 Figure 1 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) des cas drsquoIRA vus en meacutedecine geacuteneacuterale par semaine depuis la semaine 122020 (du 16 au 22 mars) France meacutetropolitaine

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source Reacuteseau Sentinelles

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 5

Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 165 495 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 11 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 2 750 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode La majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (16) Auvergne-Rhocircne-Alpes (14) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (12) Nouvelle-Aquitaine (11) et Hauts-de-France (10)

En semaine 01 apregraves une hausse de 16 en S53 la hausse du nombre drsquoactes meacutedicaux pour suspicion

de COVID-19 tous acircges se poursuit avec 2 750 actes enregistreacutes (vs 2 417 actes en S53 soit +14 donneacutees consolideacutees) Cette hausse concernait les 15-44 ans (+25 soit +324 actes) et les enfants de moins de 15 ans (+73 soit +116 actes dont +104 eacutetaient enregistreacutes chez les 5-14 ans) Le nombre drsquo actes concernant les 45-64 ans eacutetait stable (-15) et en baisse (-22) chez les 65 ans et plus La reacutepartition des actes par classe drsquoacircge eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 3 5-14 ans 8 15-44 ans 57 45-64 ans 20 65-74 ans 5 75 ans et plus 7

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception de Centre-Val de Loire Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte dAzur Les hausses les plus importantes eacutetaient observeacutees en Normandie (+67 soit +82 actes) Pays de la Loire (+44 soit +45 actes) Icircle-de-France (+27 soit +95 actes) Hauts-de-France (+22 soit +51 actes) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+20 soit +63 actes) La part des actes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere hausse agrave 46 (vs 38 en S53) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 6

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

0

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1500

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1-S

01 Tau

x d

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ts

Tau

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00 0

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ab

itan

ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

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SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 2: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 2

Point de situation en semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 agrave un niveau eacuteleveacute en France suite aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee De plus lrsquoeacutemergence de variants pourrait conduire agrave une acceacuteleacuteration de lrsquoeacutepideacutemie et neacutecessite une vigilance accrue et un renforcement du respect des mesures drsquoisolement en cas de symptocircmes ou de cas de COVID-19 dans lrsquoentourage Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage a augmenteacute suite agrave la baisse observeacutee en semaine 53 lors des congeacutes de fin drsquoanneacutee Un total de 18 003 cas confirmeacutes a eacuteteacute rapporteacute en moyenne chaque jour durant la semaine 01 Le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation en semaine 01 (+30 par rapport agrave la semaine 53) Le nombre de cas confirmeacutes a augmenteacute dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge et de faccedilon plus marqueacutee chez les 0-19 ans (+46) Le taux de positiviteacute (65) a continueacute agrave augmenter par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (+11 point) Lrsquoaugmentation plus importante du nombre de cas par rapport agrave celle du nombre de personnes testeacutees est en faveur drsquoune reacuteelle augmentation de la circulation du virus entre les semaines 53 et 01

Plusieurs indicateurs du contact-tracing sont en augmentation refleacutetant lrsquoimpact des fecirctes de fin drsquoanneacutee ce qui pourrait conduire agrave une augmentation du nombre de cas dans les prochains jours

En milieu hospitalier les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation ont augmenteacute Le nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 eacutetait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation

Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 incluant les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital et en eacutetablissements meacutedico-sociaux eacutetait toujours eacuteleveacute cette semaine Plus de 68 000 deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021

Soixante-six cas drsquoinfection au variant eacutemergent du SARS-CoV-2 deacutetecteacute au Royaume-Uni et trois cas drsquoinfection au variant eacutemergent du SARS-CoV-2 deacutetecteacute en Afrique du Sud ont eacuteteacute rapporteacutes en France Plusieurs actions sont meneacutees actuellement pour mieux eacutevaluer et suivre la diffusion sur le territoire national de ces variants eacutemergents Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacute aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Les mesures de preacutevention et de distanciation sociale restent les principaux moyens permettant de freiner la circulation du virus SARS-CoV-2 et drsquoen reacuteduire lrsquoimpact sur le systegraveme de soins et la mortaliteacute Lrsquoadheacutesion agrave ces mesures est drsquoautant plus essentielle dans le contexte de lrsquoidentification de variants eacutemergents avec une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires

La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Le deacuteploiement des vaccins dans les reacutegions est en cours afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront baseacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021 Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence de variants eacutemergents sur le territoire

Il reste enfin deacuteterminant que chaque personne preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 srsquoisole immeacutediatement et reacutealise un test diagnostique dans les plus brefs deacutelais Lrsquoutilisation des outils numeacuteriques (TousAntiCovid) est eacutegalement recommandeacutee pour renforcer les mesures de suivi des contacts et drsquoisolement rapide

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SOMMAIRE

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE 4

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE 6

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - ENQUEumlTE FLASH 15

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS 17

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX 23

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) 26

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo 27

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER 29

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES

PEacuteDIATRIQUES 35

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute 37

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute 39

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 46

PREacuteVENTION 48

SITUATION INTERNATIONALE 49

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL 52

SYNTHEgraveSE 55

SOURCES DES DONNEacuteES 60

Les donneacutees de laquo Surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo laquo Surveillance des professionnels en eacutetablissements de santeacute raquo et laquo Signalement drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 nosocomiales raquo sont preacutesenteacutees une semaine sur deux Bilan des clusters Le nombre de clusters a augmenteacute de faccedilon importante depuis la mise en place du systegraveme drsquoinformation laquo Monic raquo (SI-Monic) Cependant ce nombre est actuellement fortement sous-estimeacute Depuis plusieurs semaines la notification des clusters et leur saisie dans SI-Monic sont prioriseacutes de faccedilon heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions et les deacutecisions prises par les Agences reacutegionales de santeacute la prioriteacute pouvant ecirctre donneacutee agrave la criticiteacute des clusters ou agrave certaines collectiviteacutes Il nrsquoest donc pas possible actuellement de produire des indicateurs nationaux de qualiteacute agrave partir de la base de donneacutees issue du SI-Monic Le SI-Monic constituera agrave nouveau un outil pertinent si les niveaux de transmission du SARS-CoV-2 atteignent ceux ayant justifieacute sa mise en place agrave la sortie du premier confinement en mai 2020

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SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE Reacuteseau Sentinelles La surveillance des infections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale par le Reacuteseau Sentinelles permet drsquoestimer leur incidence en France meacutetropolitaine Ces donneacutees cliniques sont compleacuteteacutees depuis le 13 septembre 2020 par une surveillance virologique pour une partie des personnes chez lesquelles sont reacutealiseacutes des preacutelegravevements Les reacutesultats des deux derniegraveres semaines seront consolideacutes dans les prochaines semaines

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) le taux drsquoincidence de consultations pour une IRA a eacuteteacute estimeacute agrave 95100 000 habitants (intervalle de confiance agrave 95 [82-108]) en France meacutetropolitaine en augmentation par rapport agrave celui de la semaine 53 65100 000 habitants (IC95 [55-75]) (Figure 1) En semaine 01 sur les 27 preacutelegravevements effectueacutes chez des patients preacutesentant une IRA 5 preacutelegravevements se sont aveacutereacutes positifs pour le SARS-CoV-2 2 eacutetaient positifs pour un rhinovirus et 1 pour un meacutetapneumovirus Aucun ne srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal Depuis la semaine 37 sur les 571 preacutelegravevements effectueacutes chez les patients qui ont eacuteteacute testeacutes pour les diffeacuterents virus respiratoires surveilleacutes sur preacutelegravevement nasopharyngeacute 223 (39) eacutetaient positifs pour un rhinovirus 104 (18) pour le SARS-CoV-2 6 pour un meacutetapneumovirus et 1 pour un virus respiratoire syncytial (VRS) Un preacutelegravevement srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal de type BVictoria en semaine 49 Figure 1 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) des cas drsquoIRA vus en meacutedecine geacuteneacuterale par semaine depuis la semaine 122020 (du 16 au 22 mars) France meacutetropolitaine

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source Reacuteseau Sentinelles

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Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 165 495 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 11 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 2 750 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode La majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (16) Auvergne-Rhocircne-Alpes (14) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (12) Nouvelle-Aquitaine (11) et Hauts-de-France (10)

En semaine 01 apregraves une hausse de 16 en S53 la hausse du nombre drsquoactes meacutedicaux pour suspicion

de COVID-19 tous acircges se poursuit avec 2 750 actes enregistreacutes (vs 2 417 actes en S53 soit +14 donneacutees consolideacutees) Cette hausse concernait les 15-44 ans (+25 soit +324 actes) et les enfants de moins de 15 ans (+73 soit +116 actes dont +104 eacutetaient enregistreacutes chez les 5-14 ans) Le nombre drsquo actes concernant les 45-64 ans eacutetait stable (-15) et en baisse (-22) chez les 65 ans et plus La reacutepartition des actes par classe drsquoacircge eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 3 5-14 ans 8 15-44 ans 57 45-64 ans 20 65-74 ans 5 75 ans et plus 7

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception de Centre-Val de Loire Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte dAzur Les hausses les plus importantes eacutetaient observeacutees en Normandie (+67 soit +82 actes) Pays de la Loire (+44 soit +45 actes) Icircle-de-France (+27 soit +95 actes) Hauts-de-France (+22 soit +51 actes) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+20 soit +63 actes) La part des actes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere hausse agrave 46 (vs 38 en S53) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 6

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

3500

4000

4500

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300

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5002

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36

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43

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46

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47

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48

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49

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50

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51

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0-S

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202

0-S

53

202

1-S

01 Tau

x d

e d

eacutep

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100 0

00 h

ab

itan

ts

Tau

x d

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cas1

00 0

00 h

ab

itan

ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

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SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

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Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

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Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

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Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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SOMMAIRE

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE 4

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE 6

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - ENQUEumlTE FLASH 15

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS 17

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX 23

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) 26

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo 27

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER 29

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES

PEacuteDIATRIQUES 35

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute 37

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute 39

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 46

PREacuteVENTION 48

SITUATION INTERNATIONALE 49

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL 52

SYNTHEgraveSE 55

SOURCES DES DONNEacuteES 60

Les donneacutees de laquo Surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo laquo Surveillance des professionnels en eacutetablissements de santeacute raquo et laquo Signalement drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 nosocomiales raquo sont preacutesenteacutees une semaine sur deux Bilan des clusters Le nombre de clusters a augmenteacute de faccedilon importante depuis la mise en place du systegraveme drsquoinformation laquo Monic raquo (SI-Monic) Cependant ce nombre est actuellement fortement sous-estimeacute Depuis plusieurs semaines la notification des clusters et leur saisie dans SI-Monic sont prioriseacutes de faccedilon heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions et les deacutecisions prises par les Agences reacutegionales de santeacute la prioriteacute pouvant ecirctre donneacutee agrave la criticiteacute des clusters ou agrave certaines collectiviteacutes Il nrsquoest donc pas possible actuellement de produire des indicateurs nationaux de qualiteacute agrave partir de la base de donneacutees issue du SI-Monic Le SI-Monic constituera agrave nouveau un outil pertinent si les niveaux de transmission du SARS-CoV-2 atteignent ceux ayant justifieacute sa mise en place agrave la sortie du premier confinement en mai 2020

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 4

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE Reacuteseau Sentinelles La surveillance des infections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale par le Reacuteseau Sentinelles permet drsquoestimer leur incidence en France meacutetropolitaine Ces donneacutees cliniques sont compleacuteteacutees depuis le 13 septembre 2020 par une surveillance virologique pour une partie des personnes chez lesquelles sont reacutealiseacutes des preacutelegravevements Les reacutesultats des deux derniegraveres semaines seront consolideacutes dans les prochaines semaines

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) le taux drsquoincidence de consultations pour une IRA a eacuteteacute estimeacute agrave 95100 000 habitants (intervalle de confiance agrave 95 [82-108]) en France meacutetropolitaine en augmentation par rapport agrave celui de la semaine 53 65100 000 habitants (IC95 [55-75]) (Figure 1) En semaine 01 sur les 27 preacutelegravevements effectueacutes chez des patients preacutesentant une IRA 5 preacutelegravevements se sont aveacutereacutes positifs pour le SARS-CoV-2 2 eacutetaient positifs pour un rhinovirus et 1 pour un meacutetapneumovirus Aucun ne srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal Depuis la semaine 37 sur les 571 preacutelegravevements effectueacutes chez les patients qui ont eacuteteacute testeacutes pour les diffeacuterents virus respiratoires surveilleacutes sur preacutelegravevement nasopharyngeacute 223 (39) eacutetaient positifs pour un rhinovirus 104 (18) pour le SARS-CoV-2 6 pour un meacutetapneumovirus et 1 pour un virus respiratoire syncytial (VRS) Un preacutelegravevement srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal de type BVictoria en semaine 49 Figure 1 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) des cas drsquoIRA vus en meacutedecine geacuteneacuterale par semaine depuis la semaine 122020 (du 16 au 22 mars) France meacutetropolitaine

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source Reacuteseau Sentinelles

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Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 165 495 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 11 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 2 750 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode La majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (16) Auvergne-Rhocircne-Alpes (14) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (12) Nouvelle-Aquitaine (11) et Hauts-de-France (10)

En semaine 01 apregraves une hausse de 16 en S53 la hausse du nombre drsquoactes meacutedicaux pour suspicion

de COVID-19 tous acircges se poursuit avec 2 750 actes enregistreacutes (vs 2 417 actes en S53 soit +14 donneacutees consolideacutees) Cette hausse concernait les 15-44 ans (+25 soit +324 actes) et les enfants de moins de 15 ans (+73 soit +116 actes dont +104 eacutetaient enregistreacutes chez les 5-14 ans) Le nombre drsquo actes concernant les 45-64 ans eacutetait stable (-15) et en baisse (-22) chez les 65 ans et plus La reacutepartition des actes par classe drsquoacircge eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 3 5-14 ans 8 15-44 ans 57 45-64 ans 20 65-74 ans 5 75 ans et plus 7

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception de Centre-Val de Loire Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte dAzur Les hausses les plus importantes eacutetaient observeacutees en Normandie (+67 soit +82 actes) Pays de la Loire (+44 soit +45 actes) Icircle-de-France (+27 soit +95 actes) Hauts-de-France (+22 soit +51 actes) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+20 soit +63 actes) La part des actes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere hausse agrave 46 (vs 38 en S53) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 6

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

3500

4000

4500

0

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300

400

5002

02

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30

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31

202

0-S

32

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0-S

33

202

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34

202

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35

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36

202

0-S

37

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202

0-S

39

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0-S

40

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202

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42

202

0-S

43

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0-S

44

202

0-S

45

202

0-S

46

202

0-S

47

202

0-S

48

202

0-S

49

202

0-S

50

202

0-S

51

202

0-S

52

202

0-S

53

202

1-S

01 Tau

x d

e d

eacutep

ista

ge

100 0

00 h

ab

itan

ts

Tau

x d

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cid

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ce (

cas1

00 0

00 h

ab

itan

ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

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SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

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Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

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Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

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Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 4: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 4

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE Reacuteseau Sentinelles La surveillance des infections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale par le Reacuteseau Sentinelles permet drsquoestimer leur incidence en France meacutetropolitaine Ces donneacutees cliniques sont compleacuteteacutees depuis le 13 septembre 2020 par une surveillance virologique pour une partie des personnes chez lesquelles sont reacutealiseacutes des preacutelegravevements Les reacutesultats des deux derniegraveres semaines seront consolideacutes dans les prochaines semaines

En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) le taux drsquoincidence de consultations pour une IRA a eacuteteacute estimeacute agrave 95100 000 habitants (intervalle de confiance agrave 95 [82-108]) en France meacutetropolitaine en augmentation par rapport agrave celui de la semaine 53 65100 000 habitants (IC95 [55-75]) (Figure 1) En semaine 01 sur les 27 preacutelegravevements effectueacutes chez des patients preacutesentant une IRA 5 preacutelegravevements se sont aveacutereacutes positifs pour le SARS-CoV-2 2 eacutetaient positifs pour un rhinovirus et 1 pour un meacutetapneumovirus Aucun ne srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal Depuis la semaine 37 sur les 571 preacutelegravevements effectueacutes chez les patients qui ont eacuteteacute testeacutes pour les diffeacuterents virus respiratoires surveilleacutes sur preacutelegravevement nasopharyngeacute 223 (39) eacutetaient positifs pour un rhinovirus 104 (18) pour le SARS-CoV-2 6 pour un meacutetapneumovirus et 1 pour un virus respiratoire syncytial (VRS) Un preacutelegravevement srsquoest aveacutereacute positif pour un virus grippal de type BVictoria en semaine 49 Figure 1 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) des cas drsquoIRA vus en meacutedecine geacuteneacuterale par semaine depuis la semaine 122020 (du 16 au 22 mars) France meacutetropolitaine

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source Reacuteseau Sentinelles

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Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 165 495 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 11 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 2 750 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode La majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (16) Auvergne-Rhocircne-Alpes (14) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (12) Nouvelle-Aquitaine (11) et Hauts-de-France (10)

En semaine 01 apregraves une hausse de 16 en S53 la hausse du nombre drsquoactes meacutedicaux pour suspicion

de COVID-19 tous acircges se poursuit avec 2 750 actes enregistreacutes (vs 2 417 actes en S53 soit +14 donneacutees consolideacutees) Cette hausse concernait les 15-44 ans (+25 soit +324 actes) et les enfants de moins de 15 ans (+73 soit +116 actes dont +104 eacutetaient enregistreacutes chez les 5-14 ans) Le nombre drsquo actes concernant les 45-64 ans eacutetait stable (-15) et en baisse (-22) chez les 65 ans et plus La reacutepartition des actes par classe drsquoacircge eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 3 5-14 ans 8 15-44 ans 57 45-64 ans 20 65-74 ans 5 75 ans et plus 7

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception de Centre-Val de Loire Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte dAzur Les hausses les plus importantes eacutetaient observeacutees en Normandie (+67 soit +82 actes) Pays de la Loire (+44 soit +45 actes) Icircle-de-France (+27 soit +95 actes) Hauts-de-France (+22 soit +51 actes) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+20 soit +63 actes) La part des actes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere hausse agrave 46 (vs 38 en S53) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 6

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

0

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1-S

01 Tau

x d

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itan

ts

Tau

x d

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00 0

00 h

ab

itan

ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 20

Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

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Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

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Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 58

Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 5: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

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Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 165 495 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 11 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 2 750 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode La majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (16) Auvergne-Rhocircne-Alpes (14) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (12) Nouvelle-Aquitaine (11) et Hauts-de-France (10)

En semaine 01 apregraves une hausse de 16 en S53 la hausse du nombre drsquoactes meacutedicaux pour suspicion

de COVID-19 tous acircges se poursuit avec 2 750 actes enregistreacutes (vs 2 417 actes en S53 soit +14 donneacutees consolideacutees) Cette hausse concernait les 15-44 ans (+25 soit +324 actes) et les enfants de moins de 15 ans (+73 soit +116 actes dont +104 eacutetaient enregistreacutes chez les 5-14 ans) Le nombre drsquo actes concernant les 45-64 ans eacutetait stable (-15) et en baisse (-22) chez les 65 ans et plus La reacutepartition des actes par classe drsquoacircge eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 3 5-14 ans 8 15-44 ans 57 45-64 ans 20 65-74 ans 5 75 ans et plus 7

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception de Centre-Val de Loire Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte dAzur Les hausses les plus importantes eacutetaient observeacutees en Normandie (+67 soit +82 actes) Pays de la Loire (+44 soit +45 actes) Icircle-de-France (+27 soit +95 actes) Hauts-de-France (+22 soit +51 actes) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+20 soit +63 actes) La part des actes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere hausse agrave 46 (vs 38 en S53) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 6

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

0

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1500

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1-S

01 Tau

x d

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ts

Tau

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00 0

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ab

itan

ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

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SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 60

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 6: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

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SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) Jusqursquoau 12 mai 2020 cette surveillance srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis le 13 mai elle repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive SI-DEP vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont actuellement pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests RT-PCR les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR depuis le 17 octobre) ainsi que ceux reacutealiseacutes hors laboratoire (TROD depuis le 16 novembre) Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lorsque le code postal de la personne testeacutee est disponible les donneacutees sont attribueacutees au deacutepartement et reacutegion de reacutesidence lorsqursquoil ne lrsquoest pas les donneacutees ne sont prises en compte que pour les analyses nationales (reacutegion et deacutepartement non disponibles) Cas confirmeacute de COVID-19 une personne preacutesentant une infection par SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage Au niveau national en semaine 01 1 953 125 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 1 789 074 en S53 soit +9) En S01 126 022 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes nombre en hausse par rapport agrave celui de la semaine 53 ougrave 97 025 nouveaux cas avaient eacuteteacute rapporteacutes soit +30 (Figures 4 et 5) Au 13 janvier 2021 un total de 2 830 442 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

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Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

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Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 20

Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 24

Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 25

Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 26

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

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SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 51

En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 53

501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 7: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 7

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Note Du 21 janvier au 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC) Pendant cette peacuteriode toutes les personnes preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 testeacutes par RT-PCR sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SI-DEP) Du fait de lrsquointeacutegration incomplegravete des TA TROD dans la base SI-DEP au cours des premiegraveres semaines ont eacuteteacute pris en compte dans le calcul des cas confirmeacutes les cas de COVID-19 confirmeacutes par TA et transmis par lrsquoAssurance maladie par la base ContactCovid (soit 41 291 cas jusqursquoau 19 novembre 2020) Les donneacutees inteacutegreacutees dans le systegraveme SI-DEP permettent theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques

En S01 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 65 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (54 en S53 soit +11 point) (Figure 4)

Le taux national drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 188 cas100 000 habitants en S01 et en hausse par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (145 cas100 000 hab en S53 +30) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 2 910100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la semaine 53 (2 666 100 000 hab +9) (Figure 6)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

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Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

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Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

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Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

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Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 20

Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 24

Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 25

Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 26

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 27

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 44

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 45

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 48

PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 49

SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 51

En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 55

SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

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Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 8

Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et taux de deacutepistage par semaine depuis la semaine 232020 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

La proportion des tests effectueacutes en S01 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP de Santeacute publique France le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 en leacutegegravere diminution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (97 en S53)

Analyse par classes drsquoacircge En semaine 01 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 83 chez les 0-14 ans 243 chez les 15-44 ans 187 chez les 45-64 ans 144 chez les 65-74 ans et 230 chez les 75 ans et plus (Figure 7a) En semaine 01 le taux drsquoincidence a augmenteacute par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge La hausse la plus marqueacutee eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (+46) suivis par les 15-44 ans (+33) les 45-64 ans (+27) les 75 ans et plus (+24) et les 65-74 ans et plus (+20) (Figure 7a) Parmi les plus jeunes les taux drsquoincidence suivaient la mecircme dynamique avec +47 chez les 0-9 ans +46 chez les 10-19 ans et +36 chez 20-29 ans En semaine 01 par rapport agrave la S53 le taux de deacutepistage eacutetait en augmentation dans toutes les classes drsquoacircge Lrsquoaugmentation la plus marqueacutee eacutetait chez les 75 ans et plus (+23) suivis par les 45-64 ans (+15) les 65-74 ans (+14) les 0-14 ans (+12) et les 15-44ans (+2) (Figure 7b) En semaine 01 le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en hausse par rapport agrave la S53 dans toutes les classes drsquoacircge chez les 0-14 ans (+24 points) les 15-44 ans (+15 point) les 45-64 ans (+06 point) les 65-74 ans (+03 point) et les 75 ans et plus (+01 point) (Figure 7c)

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ts)

Semaines

Taux dincidence Taux de deacutepistage

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 19

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 21

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

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SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 59

Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 60

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 9: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 9

Figure 7 Eacutevolution des taux drsquoincidence (7a) de deacutepistage (7b) et de positiviteacute (7c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021) 7a

7b

7c

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

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La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

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ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

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Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 27

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

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Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 44

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 55

SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 10

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes Parmi lensemble des personnes testeacutees en S01 (quel que soit le reacutesultat du test) 78 se deacuteclaraient sans symptocircme proportion en diminution par rapport agrave la S53 (83) Le nombre de personnes testeacutees asymptomatiques eacutetait quasi-stable en S01 par rapport agrave la S53 (1 312 118 en S01 vs 1 302 229 en S53 soit +08) et le nombre de personnes symptomatiques eacutetait en augmentation en S01 (360 888 en S01 vs 268 980 en S53 soit +34) En S01 53 des cas preacutesentaient des symptocircmes (donneacutees disponibles pour 111 662 cas) Cette proportion est stable par rapport agrave la S53 ougrave elle eacutetait de 52 (Figure 8) En S01 par rapport agrave la S53 une augmentation du nombre de cas eacutetait observeacutee chez les personnes testeacutees symptomatiques (59 504 vs 44 582 en S53 soit +33) et chez les personnes testeacutees asymptomatiques (52 158 vs 41 657 en S53 soit +25) (Figure 8) En S01 le taux de positiviteacute eacutetait de 165 chez les personnes symptomatiques stable par rapport agrave la S53 (166) Il eacutetait de 40 chez les asymptomatiques (vs 32 en S53) (Figure 8) Figure 8 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non de symptocircmes (2 253 639 cas deacutecrits) par semaine depuis la semaine 232020 France meacutetropolitaine (donneacutees au 13 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

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Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

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Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

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Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

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En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

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PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

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La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

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ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

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Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 22

Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 23

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 24

Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 25

Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 26

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

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SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 51

En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 53

501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 60

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 11

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 123 896 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (donneacutees consolideacutees pour S53 avec 95 439 nouveaux cas +30) Le taux de positiviteacute eacutetait de 65 en S01 en hausse par rapport agrave la S53 (55 en S53 soit +11 point) Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes a augmenteacute en S01 avec 191 cas100 000 habitants (vs 147 en S53 +30) Le taux de deacutepistage eacutetait de 2 939100 000 habitants en S01 en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 694 en S53 +9) Au niveau deacutepartemental le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes eacutetait en semaine 01 au-dessus du seuil de 100100 000 habitants dans 88 deacutepartements meacutetropolitains (72 deacutepartements en S53) Les deacutepartements preacutesentant les taux drsquoincidence (100 000 habitants) les plus eacuteleveacutes eacutetaient les Alpes-Maritimes (458) le Jura (362) le Territoire de Belfort (340) le Doubs (336) la Haute-Marne (331) et la Haute-Saocircne (307) avec des taux en hausse par rapport agrave la S53 (Figure 9a) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur agrave 10 dans quatre deacutepartements en S01 (cinq en S53) Les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans la Haute-Loire (109) le Doubs (106) le Cher (103) le Jura (101) et la Drocircme (99) (Figure 9b) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (100 000 habitants) en S01 eacutetaient les Alpes-Maritimes (4 949) Paris (4 432) les Bouches du Rhocircne (4 337) la Corse du Sud (4 022) le Var (3 898) et les Ardennes (3 801) (Figure 9c)

En outre-mer En Guadeloupe les indicateurs SI-DEP eacutetaient en hausse en semaine 01 avec un taux drsquoincidence de 31100 000 habitants (27 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait de 32 (21 en S53) En Martinique les indicateurs eacutetaient stables en S01 taux drsquoincidence de 22100 000 habitants (25 en S53) et taux de positiviteacute de 18 (18 en S53) Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 avec un taux drsquoincidence de 125100 000 habitants (62 en S53) et un taux de positiviteacute de 66 (36 en S53) En Guyane les indicateurs eacutetaient en hausse en S01 le taux drsquoincidence eacutetait de 291100 000 habitants (181 en S53) et le taux de positiviteacute de 113 (91 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en hausse en S01 (88100 000 habitants vs 62 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait stable (108 vs 107 en S53) Agrave La Reacuteunion en S01 le taux drsquoincidence eacutetait en hausse (32100 000 habitants vs 24 en S53) et le taux de positiviteacute eacutetait relativement stable agrave 20 (22 en S53)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 17

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

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Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

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SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

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Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

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Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

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Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

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Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 57

Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 58

Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 59

Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 60

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

Page 12: COVID-19 : point épidémiologique du 14 janvier 2021 · 2021. 1. 14. · Point épidémiologique COVID-19 / Situation au 14 janvier 2021 / p. 1 Point épidémiologi s’appuie sur

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 12

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute (9b) et de deacutepistage (nombre de tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 04 au 10 janvier 2021 par deacutepartement France (donneacutees au 13 janvier 2021)

9a 9b

9c

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 16

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

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ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 18

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

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SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 44

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 45

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 46

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 48

PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 49

SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

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POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

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SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 57

Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 58

Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 59

Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 60

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 13

Point de situation des cas de variants eacutemergents Les cas confirmeacutes drsquoinfections dues aux variants eacutemergents du SARS-CoV-2 sont recenseacutes par le Centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires sur la base des preacutelegravevements envoyeacutes par les laboratoires de biologie meacutedicale publics ou priveacutes qui sont alors seacutequenceacutes au CNR et des reacutesultats de seacutequenccedilages parfois reacutealiseacutes par certains laboratoires et qui leur sont communiqueacutes Le recours au CNR pour cette surveillance des variants eacutemergents suit les recommandations de la conduite agrave tenir pour la deacutetection et lrsquoinvestigation des cas suspects ou confirmeacutes de variants mise agrave jour le 08012021 par Santeacute publique France et le CNR et diffuseacutee par le ministegravere chargeacute de la Santeacute Chacun de ces cas fait lobjet drsquoune information de lrsquoAgence reacutegionale de santeacute concerneacutee avec mise en place des mesures de contact-tracing et de preacutevention habituelles

Au 13 janvier 2021 69 cas drsquoinfection agrave des variants eacutemergents eacutetaient recenseacutes en France 66 cas du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) et 3 cas du variant 501YV2 (Afrique du Sud) Ces cas correspondent agrave des patients preacuteleveacutes entre le 13 deacutecembre 2020 et le 04 janvier 2021 (Tableau 1) Ce deacutecompte ninclut pas les eacuteventuels cas secondaires voire tertiaires recenseacutes lors des investigations et qui nrsquoauraient pas fait lrsquoobjet drsquoun seacutequenccedilage Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine un ou plusieurs cas confirmeacutes du variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) dans 11 reacutegions (Figure 10) et du variant 501YV2 (Afrique du Sud) dans 2 reacutegions (Grand Est et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur) Aucun nrsquoa eacuteteacute rapporteacute en Outre-mer Tableau 1 Nombre incident de cas drsquoinfection de COVID-19 variants eacutemergents par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes de variants eacutemergents

dont variant VOC 20201201

(Royaume-Uni)

dont variant 501_V2 (Afrique du Sud)

NA 9 9 0

S50 1 1 0

S51 3 2 1

S52 26 24 2

S53 29 29 0

S01 1 1 0

Total 69 66 3

Cas en cours drsquoinvestigation pour lesquels la date de preacutelegravevement nrsquoest pas renseigneacutee

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

Figure 10 Reacutepartition des cas drsquoinfection de COVID-19 variant VOC 20201201 (Royaume-Uni) par reacutegion

rapporteacutes agrave Santeacute publique France jusqursquoau 13 janvier 2021 inclus France

Reacutegion de reacutesidence ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute effectueacute ou agrave deacutefaut reacutegion ougrave le test RT-PCR a eacuteteacute seacutequenceacute

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 15

PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

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La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

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ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

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Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

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PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 27

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

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Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 44

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

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Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

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Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

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PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

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En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 55

SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 14

En semaine 52 110 seacutequenccedilages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par le CNR Les donneacutees de la semaine 53 (146 seacutequenccedilages) et de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees (Tableau 2) Tableau 2 Nombre de virus seacutequenceacutes par le CNR par motif de seacutequenccedilage par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S50-2020 agrave S01-2021 France (n=399 donneacutees au 13 janvier 2021)

Nombre total de virus seacutequenceacutes par

le CNR

Nombre de virus seacutequenceacutes selon le motif de seacutequenccedilage

Cas en provenance du Royaume-Uni ou contact dun cas en provenance

du Royaume-Uni

Cas en provenance dAfrique du Sud ou contact dun cas en

provenance dAfrique du Sud

Cas dont le reacutesultat du test RT-PCR est discordant

(cible S non deacutetecteacutee) en provenance ou non du

Royaume-Uni

Surveillance habituelle

S50 62 1 61

S51 79

2 77

S52 110 20 2 37 51

S53 146 36 1 42 67

S01 2 2

Les donneacutees des semaines 53 et 01 ne sont pas consolideacutees

En semaine 01 51 cas confirmeacutes de COVID-19 mentionnaient le Royaume-Uni comme pays de provenance et 6 cas confirmeacutes mentionnaient lrsquoAfrique du Sud (Tableau 3) Agrave noter que les cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni ou drsquoAfrique du Sud nrsquoont pas tous fait lrsquoobjet drsquoune demande de seacutequenccedilage pour identification du variant Des preacutecisions seront apporteacutees ulteacuterieurement Tableau 3 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) selon le pays de provenance rapporteacutes agrave Santeacute publique France de S51-2020 agrave S01-2021 France (donneacutees au 13 janvier 2021)

Cas confirmeacutes en provenance du Royaume-Uni

Cas confirmeacutes en provenance dAfrique du Sud

S51 9 0

S52 44 3

S53 42 1

S01 51 6

Les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees

Source SI-DEP

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PREacuteSENCE DU VARIANT VOC 20201201 (ROYAUME-UNI) EN FRANCE - Reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash CNR Virus des infections respiratoires Santeacute publique France des 07 et 08 janvier 2021 Afin drsquoeacutetablir une premiegravere cartographie du degreacute de diffusion du variant VOC 20201201 en France une premiegravere enquecircte Flash a eacuteteacute proposeacutee agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes par le CNR Virus des infections respiratoires (Laboratoire associeacute de Lyon Pr Bruno Lina) et Santeacute publique France Lrsquoobjectif de cette enquecircte conduite les 07 et 08 janvier 2021 en collaboration avec un reacuteseau de virologues hospitaliers coordonneacute par lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes eacutetait drsquoidentifier parmi les preacutelegravevements avec reacutesultat de RT-PCR COVID-19 positif drsquoeacuteventuels cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 du SARS-CoV-2 Cette recherche reposait sur une approche en deux eacutetapes appliqueacutee aux preacutelegravevements pour RT-PCR COVID-19 traiteacutes lors de ces deux journeacutees par les LBM participants Dans un premier temps lrsquoutilisation drsquoun kit RT-PCR commercialiseacute par la socieacuteteacute Thermo Fisher Scientific (TaqPathtrade COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit) telle que deacutecrite par le laboratoire associeacute au CNR Virus des infections respiratoires [1] En effet le variant VOC20201201 porte plusieurs mutations dont huit sont localiseacutees dans le gegravene S la mutation del21765-21770 provoque la perte du signal pour lrsquoune des trois cibles deacutetectables par le kit Thermo Fisher Scientific geacuteneacuterant des reacutesultats de RT-PCR dits laquo discordants raquo Dans un second temps et afin de confirmer ces suspicions les eacutechantillons avec reacutesultat discordant eacutetaient analyseacutes par seacutequenccedilage pour confirmation Nous preacutesentons ici les reacutesultats preacuteliminaires de la premiegravere eacutetape (identification drsquoeacutechantillons avec un reacutesultat discordant) la consolidation des donneacutees de cette enquecircte nrsquoeacutetant pas termineacutee et les activiteacutes de seacutequenccedilage eacutetant toujours en cours Les principaux reacutesultats en termes de participation des laboratoires et de nombre de preacutelegravevements inclus figurent au Tableau 4 Agrave cette enquecircte ont participeacute 89 laboratoires reacutepartis sur les 13 reacutegions de France meacutetropolitaine repreacutesentant 19 de lrsquoactiviteacute de RT-PCR COVID-19 lors de ces deux journeacutees ou encore 25 des RT-PCR rendues positives au niveau national

Tableau 4 Reacutesultats preacuteliminaires agrave lrsquoeacutechelle nationale Enquecircte Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Nombre de laboratoires participants 89

Nombre de preacutelegravevements RT-PCR inclus 97 664

Nombre de preacutelegravevements avec un reacutesultat RT-PCR positif 7 465

Nombre de reacutesultats discordants 281

La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants rapporteacutee au total des RT-PCR positives est de 38 Par ailleurs les donneacutees actuelles du CNR dans le cadre de la surveillance des variants sur le territoire franccedilais ont montreacute que 38 des reacutesultats discordants eacutetaient ensuite confirmeacutes par seacutequenccedilage Sur la base de ces donneacutees il est ainsi possible drsquoestimer que le variant VOC 20201201 serait responsable de 1 agrave 2 des cas de COVID-19 actuellement diagnostiqueacutes en France

[1] Bal A et al Two-step strategy for the identification of SARS-CoV-2 variant of concern 20201201 and other variants with spike deletion H69-V70 France August to December 2020 httpswwwmedrxivorgcontent1011012020111020228528v3 [Preprint]

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La proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants varie par ailleurs drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre suggeacuterant une preacutesence heacuteteacuterogegravene du variant VOC 20201201 sur le territoire (Tableau 5) La participation variable et parfois faible des LBM selon les reacutegions incite toutefois agrave la prudence dans ces comparaisons geacuteographiques ce drsquoautant que les analyses sont agrave ce stade baseacutees sur la reacutegion du laboratoire preacuteleveur et que lrsquoindication des preacutelegravevements traiteacutes par ces LBM (appartenance eacuteventuelle agrave un cluster ou autre chaicircne de transmission anteacuteceacutedent de voyage) nrsquoest pas connue Tableau 5 Proportion de reacutesultats de RT-PCR discordants par reacutegion du laboratoire preacuteleveur Enquecircte

Flash 07-08 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur RT-PCR discordantes ()

Auvergne-Rhocircne-Alpes 32

Bourgogne-Franche Comteacute 111

Bretagne 09

Corse 00

Centre-Val de Loire 41

Grand Est 00

Hauts de France 19

Icircle-de-France 57

Nouvelle Aquitaine 00

Normandie 00

Occitanie 29

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 46

Pays de la Loire 64

France (non attribuable) 09

Total France meacutetropolitaine 38

Reacutesultats agrave interpreacuteter avec prudence car participation des LBM plus faible et lt100 RT-PCR positives au total Reacutesultats issus de plusieurs laboratoires speacutecialiseacutes traitant des preacutelegravevements issus de tout le territoire

Cette enquecircte sera reacutepeacuteteacutee agrave intervalles reacuteguliers et les reacutesultats de cette premiegravere eacutedition doivent encore ecirctre consolideacutes ils seront communiqueacutes degraves que lrsquoensemble des donneacutees et reacutesultats de seacutequenccedilage seront disponibles Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale participants dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoeacutetablir ce premier eacutetat des lieux

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ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes contacts des personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser prospectivement les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les Agences reacutegionales de santeacute en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale drsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees ContactCovid) permettent de srsquoassurer de lrsquoefficaciteacute de ce dispositif de suivi et complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les indicateurs sont produits agrave partir de ContactCovid base de donneacutees individuelles anonymiseacutees selon la meacutethodologie preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 17 septembre 2020 La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France httpswwwsantepubliquefrancefrmediafiles01-maladies-et-traumatismesmaladies-et-infections-respiratoiresinfection-a-coronavirusdefinition-de-cas-16-11-20

Dans cette partie les tests RT-LAMP sont assimileacutes agrave des tests RT-PCR Lrsquoanneacutee de naissance des personnes (cas et contacts) enregistreacutees dans la base ContactCovid est transmise agrave Santeacute publique France depuis le 22 octobre 2020 avec des donneacutees reacutetrospectives jusqursquoau mois de juillet 2020

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes Au cours de la premiegravere semaine de 2021 le nombre de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts agrave risque a fortement augmenteacute 123 230 nouveaux cas confirmeacutes (vs 90 922 en S53-2020 soit +36) et 219 033 nouvelles personnes-contacts agrave risque (vs 168 154 en S53-2020 soit +30) (Figure 11)

En semaine 01 le pourcentage de nouveaux cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique (29) eacutetait en leacutegegravere baisse apregraves une hausse observeacutee en semaines 52 et 53 (respectivement 33 et 32) Au niveau reacutegional la majoriteacute des cas diagnostiqueacutes par un test antigeacutenique lrsquoeacutetait en Icircle-de-France (27 du total national) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (14) et Auvergne-Rhocircne Alpes (13) La plupart des reacutegions ont reacutealiseacute plus de RT-PCR que de tests antigeacuteniques mais ces derniers ont repreacutesenteacute 63 des diagnostics confirmeacutes agrave Mayotte 43 en Icircle-de-France et 34 en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur durant cette semaine Figure 11 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Le nombre de cas enregistreacute diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 432020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique Source ContactCovid ndash Cnam

En semaine 01 lrsquoacircge moyen eacutetait stable chez les cas (44 ans cette valeur variant entre 44 et 46 ans depuis

S46) et chez les personnes-contacts (36 ans contre 37 ans en S53) Parmi les personnes-contacts agrave risque

la part des 65 ans et plus (93) a diminueacute apregraves avoir augmenteacute depuis la S46 (105 en S53 95 en

S52 83 en S51)

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Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes Tous les cas confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes agrave lrsquoAssurance maladie reccediloivent en premier lieu un message SMS leur demandant de preacuteparer un entretien teacuteleacutephonique et drsquoeacutetablir la liste de leurs personnes-contacts agrave risque Ces personnes-contacts sont informeacutees par SMS contenant un lien cliquable qui renvoie vers un site internet preacutesentant leurs droits et lrsquoensemble des informations portant sur les mesures sanitaires agrave respecter Les personnes-contacts qui ne vont pas au bout de la deacutemarche sur le site internet ou celles pour lesquelles lrsquoAssurance maladie ne dispose pas de numeacutero de teacuteleacutephone portable continuent agrave ecirctre appeleacutees Ainsi une personne-contact prise en charge par lrsquoAssurance maladie pour ce suivi correspond soit agrave une personne ayant reccedilu un SMS et ayant eacuteteacute au bout du processus sur le site internet soit agrave une personne contacteacutee par teacuteleacutephone

En semaine 01-2021 la proportion de cas et de personnes-contacts agrave risque ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable (93 pour les cas et 96 pour les personnes-contacts) En S01 la proportion des cas investigueacutes eacutetait la plus basse en Guadeloupe (77) agrave La Reacuteunion (84) et en Icircle-de-France (86) En S01 la proportion des personnes-contacts agrave risque investigueacutees eacutetait supeacuterieure agrave 91 dans toutes les reacutegions Agrave lrsquoeacutechelle nationale la proportion de cas ayant pu ecirctre investigueacutes eacutetait leacutegegraverement plus importante chez ceux acircgeacutes de moins de 65 ans (94) que ceux acircgeacutes de 65 ans et plus (89)

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas est stable agrave 19 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 (20 en S53 contre 17 en S52) (Figure 12) La proportion de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque (50 en S01) a diminueacute apregraves une hausse agrave la fin de lrsquoanneacutee 2020 (53 en S53 51 en S52 49 en S51) Figure 12 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

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Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas restait le plus faible chez les cas acircgeacutes de 75 ans et plus (06 personne-contact agrave risque par cas en S01 contre 07 en S53) et le plus eacuteleveacute chez les cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans (24 personnes-contacts agrave risque par cas en S01 contre 26 en S53)

En semaine 01 les cas de moins de 65 ans avaient 7 de personnes-contacts agrave risque de 65 ans et plus en leacutegegravere diminution apregraves une hausse en S53 (9 en S53 contre 7 en S52) (Figure 13) Parmi les personnes-contacts des cas de 65 ans et plus 33 avaient eacutegalement plus de 65 ans en augmentation par rapport agrave la S53 (+24)

Entre les semaines 53-2020 et 01-2021 le nombre absolu de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de 10 agrave 19 ans a augmenteacute (Figure 14) En parallegravele le nombre de contacts agrave risque entre personnes acircgeacutees de moins de 60 ans et personnes acircgeacutees de plus de 60 ans a diminueacute mais reste toujours plus eacuteleveacute qursquoau cours des semaines preacuteceacutedant les fecirctes de fin drsquoanneacutee notamment en cours de confinement (Figure 14) On observe eacutegalement cette baisse pour les contacts agrave risque entre personnes de 20-39 ans et de 50-69 ans Figure 13 Proportion de contacts de 65 ans et plus suivant lrsquoacircge du cas index du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

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Figure 14 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut du couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (confinement) 53-2020 et 01-2021 (fecirctes de fin drsquoanneacutee) France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie vacances estivales rentreacutee scolaire situation au deacutebut des couvre-feux etc La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Par exemple les cas identifieacutes en semaine 53 acircgeacutes de 20 agrave 29 ans avaient en moyenne 021 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 40 agrave 49 ans et 078 personne-contact agrave risque acircgeacutee de 20 agrave 29 ans Lrsquointeraction sans mesures barriegraveres des 20-29 ans est donc plus faible avec les 40-49 ans qursquoavec les 20-29 ans Valeurs calculeacutees quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation Source ContactCovid ndash Cnam

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Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En semaine 01 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 52 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait stable (22 jours) (Figure 15) Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient

En S01 les deacutelais de diagnostic pour les reacutegions ultra-marines restaient supeacuterieurs agrave la meacutetropole notamment en Martinique (42 jours) Ils srsquoeacutetaient neacuteanmoins raccourcis en Guadeloupe (26 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) et agrave La Reacuteunion (25 jours en S01-2021 vs 29 jours en S53-2020) Le faible nombre de cas dans les deacutepartements drsquooutre-mer rend cependant cet indicateur tregraves volatile et sujet agrave des variations individuelles importantes

Le deacutelai de diagnostic moyen eacutetait en leacutegegravere diminution pour les cas diagnostiqueacutes par tests RT-PCR (22 jours contre 24 jours en S53-2020) se rapprochant du deacutelai de 21 jours (similaire agrave la semaine preacuteceacutedente) observeacute pour les tests antigeacuteniques Figure 15 Deacutelai moyen (en jours) entre la date des premiers signes cliniques et la date de preacutelegravevement parmi

les cas symptomatiques par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France

Note le deacutelai est calculeacute chez les cas confirmeacutes avec une date de premiers signes cliniques et de preacutelegravevement renseigneacutees En semaine 01 cela repreacutesente 52 des cas identifieacutes Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable pour la semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque drsquoun autre cas eacutetait de 258 une valeur stable par rapport agrave la S53 (254) et plus haute qursquoen S52 (203) (Figure 16) La proportion de cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque eacutetait la plus faible en Guadeloupe (99) et la plus haute dans la reacutegion Pays de la Loire (329) (Figure 17)

La proportion des personnes-contacts devenues cas eacutetait en augmentation passant de 126 (semaine drsquoidentification des personnes-contacts S52) agrave 148 (S53)

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Figure 16 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 10 janvier 2021 France Note les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 432020 Source ContactCovid ndash Cnam

Figure 17 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personne-contact agrave risque durant la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) par reacutegion France

Note deacutelai moyen calculeacute quand au moins 30 cas avec lrsquoinformation La ligne verticale correspond agrave la moyenne nationale Source ContactCovid ndash Cnam

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

En S01 la proportion de nouveaux cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) poursuivait son augmentation depuis la S51-2020 4 en S01 3 en S53 2 en S52 et 1 en S51 En revanche cette proportion est resteacutee stable depuis la S51 pour les personnes-contacts (autour de 1)

En S01 la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartenait pas au mecircme foyer que le cas index a leacutegegraverement diminueacute par rapport agrave la S53 mais restait eacuteleveacutee passant de 69 en S53 agrave 66 en S01 (contre 58 en S51 et S52)

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SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Donneacutees cumuleacutees depuis deacutebut mars 2020 Du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 23 414 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (httpssignalementsocial-santegouvfr) (Tableau 6)

Il srsquoagissait de 14 521 (62) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres EHPA) et 8 893 (38) dans les autres ESMS (Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 6)

Parmi les 14 521 signalements en EHPA 11 857 (82) eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Parmi les 23 414 signalements en ESMS 156 006 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 6) Parmi les 21 003 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 20 828 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

Tableau 6 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide

enfance3 Autres4 Total

Signalements5 14 521 6 368 1 020 1 505 23 414

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 135 680 16 771 1 076 2 479 156 006

Deacutecegraves7 hocircpitaux 8 143 332 0 36 8 511

Deacutecegraves7 eacutetablissements 20 828 124 0 51 21 003

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 65 377 12 953 1 138 1 306 80 774

1Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4Autres eacutetablissements

5Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacute 7Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Donneacutees recueillies depuis deacutebut juillet 2020 Depuis deacutebut juillet 2020 le nombre de signalements de cas de COVID-19 dans les ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S43 avec 1 693 signalements enregistreacutes (Figure 18) Le nombre de signalements a diminueacute entre les semaines 44 et 48 puis srsquoest stabiliseacute ensuite Le nombre de signalements a baisseacute en S53 avec 276 signalements enregistreacutes vs 551 en S52 puis a augmenteacute en semaine 01-2021 ougrave 522 signalements ont eacuteteacute enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 sont encore provisoires La proportion drsquoEHPA par reacutegion ayant signaleacute au moins un nouvel eacutepisode en S01-2021 sur le territoire meacutetropolitain est comprise entre 1 et 6 Depuis le 20 juillet parmi les 10 446 EHPA 5 826 (56) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Parmi les 8 844 eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 2 559 (29) ont deacuteclareacute au moins un eacutepisode Depuis fin juillet le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS a augmenteacute pour atteindre un pic en S45 (21 936 cas) a diminueacute jusqursquoen S49 (10 881 cas) puis srsquoest stabiliseacute Une leacutegegravere diminution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee pour les semaines 52 et 53 (7 599 en S52 et 6 982 en S53) (vs 10 024 en S51) En semaine 01-2021 une leacutegegravere augmentation de nombre de cas confirmeacutes est constateacutee avec 8 431 cas confirmeacutes enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 01-2021 doivent ecirctre consolideacutees (Figure 19)

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Figure 18 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Figure 19 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 25

Apregraves ecirctre resteacute stable de la semaine 29 agrave la semaine 36 le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement drsquoaccueil dans les ESMS a augmenteacute de la semaine 37 agrave la semaine 46 (S46 1 490 deacutecegraves) puis a diminueacute jusqursquoen semaine 48 et srsquoest stabiliseacute depuis En semaine 01-2021 405 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS reste stable pour les deacutecegraves en eacutetablissement et pour les deacutecegraves agrave lrsquohocircpital malgreacute les fluctuations observeacutees dues agrave un retard de saisie pendant les vacances de fin drsquoanneacutee (Figure 20) La consolidation des donneacutees permettra de confirmer lrsquoeacutevolution observeacutee Figure 20 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 10 janvier 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 08 janvier 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours Semaine 01 donneacutees non consolideacutees

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 26

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 327 079 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 12 janvier 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgences ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) semaine de rentreacutee scolaire 5 543 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (repreacutesentant 24 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence OSCOURreg) ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Apregraves 3 semaines de hausse le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges se stabilise en S01 (+07 5 543 en S01 vs 5 502 en S53) La part drsquoactiviteacute eacutetait stable agrave 24 Les hospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient en leacutegegravere hausse agrave 58 (vs 56 en S53) En semaine 01 les passages pour suspicion de COVID-19 tous acircges eacutetaient stables On notait toutefois une hausse chez les enfants de 5-14 ans (+43 soit +13 passages) et dans une moindre mesure chez les adultes de 45-64 ans (+4 soit +58 passages) (Figure 21) La reacutepartition des passages par classe drsquoacircges eacutetait comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans 1 5-14 ans 1 15-44 ans 21 45-64 ans 25 65-74 ans 16 75 ans et plus 35 Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient toujours en hausse dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Nouvelle-Aquitaine (+29 soit +92 passages) Pays de la Loire (+22 soit +42 passages) Occitanie (+12 soit +36 passages) Normandie (+11 soit +18 passages) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+6 soit +44 et +48 passages respectivement) ainsi qursquoen Guyane (+72 soit +26 passages) et Guadeloupe (+100 soit +6 passages) Les passages eacutetaient stables ou en baisse dans les autres reacutegions En semaine 01 comme les preacuteceacutedentes semaines sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute des passages eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (20) Auvergne-Rhocircne-Alpes (18) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (17) Grand Est (14) et Bourgogne-Franche-Comteacute (10) Figure 21 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 France

Figure 22 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 01-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter GEODES

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NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests RT-PCR incluant les tests RT-LAMP et antigeacuteniques positifs) des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine est supeacuterieure agrave 1 de faccedilon significative dans les trois sources de donneacutees Ainsi agrave partir agrave partir des donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) lrsquoestimation au 09 janvier est de 119 (IC95 [118-120]) Agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19 lrsquoestimation du nombre de reproduction au 09 janvier est de 102 (IC95 [100-105]) Agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) lrsquoestimation au 10 janvier est de 106 (IC95 [104-109]) (Figure 23) Au 09 janvier 2021 les estimations des R-effectif agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 7)

Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier 2021 sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions meacutetropolitaines Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans 3 autres reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Icircle-de-France et Pays de la Loire

Agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 6 reacutegions meacutetropolitaines Centre-Val de Loire Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Elles sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute et Bretagne

Agrave partir des trois sources de donneacutees les estimations du nombre de reproduction sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 4 reacutegions Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur En Outre-mer les estimations du nombre de reproduction au 09 janvier agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP sont significativement supeacuterieures agrave 1 en Guadeloupe Guyane La Reacuteunion et Mayotte et sont supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Martinique Lrsquoestimation du nombre de reproduction est supeacuterieure agrave 1 significativement en Guyane agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) Agrave partir des hospitalisations rapporteacutees dans SI-VIC les estimations du nombre de reproduction au 10 janvier sont eacutegalement supeacuterieures agrave 1 mais de faccedilon non significative en Guyane et agrave La Reacuteunion

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 28

Figure 23 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars au 09 janvier 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC Tableau 7 Nombre de reproduction effectif du 09 janvier 2021 agrave partir des tests RT-PCR et antigeacuteniques positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 10 janvier agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegions R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP OSCOURreg SI-VIC

France meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 116 (114-118) 104 (097-111) 102 (097-108)

Bourgogne-Franche-Comteacute 111 (109-114) 097 (088-105) 100 (092-108)

Bretagne 134 (129-139) 093 (078-110) 110 (094-128)

Centre-Val de Loire 124 (121-128) 098 (083-113) 115 (102-128)

Corse 120 (107-135) NC 091 (046-151)

Grand Est 106 (104-107) 095 (088-102) 099 (093-105)

Hauts-de-France 122 (120-124) 089 (079-098) 099 (092-107)

Ile-de-France 122 (120-124) 100 (094-107) 096 (091-102)

Normandie 126 (122-129) 116 (100-132) 126 (114-138)

Nouvelle-Aquitaine 130 (128-133) 113 (102-125) 124 (113-136)

Occitanie 129 (126-132) 112 (100-124) 126 (115-137)

Pays de la Loire 113 (109-116) 114 (099-129) 113 (101-126)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 122 (120-124) 109 (102-117) 115 (107-122)

France meacutetropolitaine 119 (118-120) 102 (100-105) 106 (104-109)

France ultra-marine

Guadeloupe 125 (103-148) NC NC

Guyane 145 (135-155) 154 (118-195) 116 (081-156)

La Reacuteunion 131 (117-147) NC 140 (081-215)

Martinique 103 (082-127) NA NC

Mayotte 125 (109-141) NC NC Note Pour les territoires ultra-marins les estimations agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP doivent ecirctre interpreacuteteacutees avec preacutecaution car elles peuvent ecirctre affecteacutees par les deacuteplacements entre ces territoires et la meacutetropole pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 29

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC) Depuis le 1er mars 2020 1 963 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 277 165 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 8) minus lrsquoacircge meacutedian des patients est de 73 ans et 53 sont des hommes minus 47 799 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes minus 204 390 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 12 janvier 2021 24 737 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 2 688 en reacuteanimation Tableau 8 Nombre de personnes hospitaliseacutees (dont en reacuteanimation) pour COVID-19 le 12 janvier 2021 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger Source SI-VIC

N N N N

Total 24 737 2 688 204 390 47 799

Classes dacircge

Total 24 515 2 660 202 818 47 533

0-14 ans 51 lt1 8 lt1 2 507 1 4 lt1

15-44 ans 804 3 101 4 25 684 13 356 1

45-64 ans 3 405 14 758 28 52 642 26 3 916 8

65-74 ans 5 094 21 1 084 41 39 887 20 7 861 17

75 et + 15 161 62 709 27 82 098 40 35 396 74

Reacutegions

Total 24 703 2 678 204 359 47 773

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3956 16 379 14 29671 15 7221 15

Bourgogne-Franche-Comteacute 1854 8 180 7 10608 5 2885 6

Bretagne 554 2 38 1 3549 2 775 2

Centre-Val de Loire 943 4 113 4 5846 3 1429 3

Corse 26 lt1 12 lt1 523 lt1 116 lt1

Grand Est 3062 12 314 12 22530 11 6440 13

Hauts-de-France 2298 9 249 9 18832 9 4754 10

Icircle-de-France 4728 19 558 21 56372 28 12598 26

Normandie 1273 5 99 4 6239 3 1636 3

Nouvelle-Aquitaine 1182 5 153 6 8355 4 1907 4

Occitanie 1327 5 174 6 10801 5 2285 5

Pays de la Loire 830 3 76 3 6571 3 1476 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 2519 10 318 12 20009 10 3873 8

Outre-Mer

La Reacuteunion 49 lt1 5 lt1 729 lt1 53 lt1

Martinique 12 lt1 2 lt1 375 lt1 44 lt1

Mayotte 5 lt1 0 lt1 561 lt1 43 lt1

Guadeloupe 52 lt1 4 lt1 771 lt1 168 lt1

Guyane 33 lt1 4 lt1 2017 1 70 lt1

Le 12 janvier 2021 Depuis le 01 mars 2020

Hospitalisations Dont Reacuteanimations Retours agrave domicile Deacutecegraves

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 30

Apregraves une diminution en semaine 52 puis une stabilisation en semaine 53 le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a augmenteacute entre les semaines 53 et 01 8 872 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 7 460 en S53 soit +19 (Figure 24a) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 eacutetait de 132100 000 habitants en S01 vs 111 en S53 Figure 24a Nombre hebdomadaire de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 24b Nombre de cas de COVID-19 en cours drsquohospitalisation par jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en hausse dans toutes les reacutegions de France excepteacute en Corse (-17) Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes en S01 ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (255100 000 habitants) Grand Est (217) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (210) Auvergne-Rhocircne-Alpes (171) Normandie (136) Centre-Val de Loire (131) Hauts-de-France (130) et Icircle-de-France (115) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 90 pour 100 000 habitants (Figure 25) Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guyane avec 114100 000 habitants en leacutegegravere augmentation par rapport agrave la S53 (100 soit +4 hospitalisations) Une tendance agrave lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee agrave La Reacuteunion (20 en S01 vs 08 en S53 soit +10 hospitalisations) Martinique (11 en S01 vs 06 en S53 soit +2 hospitalisations) Le taux drsquohospitalisations se stabilisait en Guadeloupe (08 en S01 vs 05 en S53 soit +1 hospitalisation) et diminuait agrave Mayotte (29 en S01 vs 39 en S53 soit -3 hospitalisations) Figure 25 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21 deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 31

Apregraves srsquoecirctre stabiliseacute entre les semaines 49 et 53 le nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute en semaine 01 1 375 nouvelles hospitalisations ont eacuteteacute deacuteclareacutees en S01 contre 1 135 en S53 soit +21 (Figure 26a) Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation eacutetait de 21100 000 habitants en S01 vs 17 en S53 Figure 26a Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

Figure 26b Nombre de cas de COVID-19 en reacuteanimation selon le jour de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC Source SI-VIC

En semaine 01 le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans

toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) ougrave il a diminueacute

Les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-

Alpes-Cocircte drsquoAzur (33100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (28) Grand Est (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (26) Icircle-de-France (23) Corse (23) et Hauts-de-France (21) Les autres reacutegions de France meacutetropolitaine rapportaient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 27)

Dans les reacutegions drsquooutre-mer en S01 le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation

de patients COVID-19 eacutetait observeacute agrave La Reacuteunion et en Guyane (035100 000 habitants) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en augmentation agrave La Reacuteunion (035 vs 012 en S53 soit +2 admissions en reacuteanimation) Les taux drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient en diminution en S01 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Guyane (035 vs 069100 000 habitants soit -1 admission en reacuteanimation) en Guadeloupe (027 vs 053 soit -1 admission en reacuteanimation) Figure 27 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 21deacutecembre 2020 et le 10 janvier 2021 (S52 agrave S01) France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 32

Le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 1 893 deacutecegraves ont eacuteteacute deacuteclareacutes en S01 contre 1 711 en S53 soit +11 (Figure 28) Figure 28 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute entre les semaines 48 et 53 le nombre des deacuteclarations de retours agrave domicile survenus apregraves une hospitalisation pour COVID-19 a augmenteacute en semaine 01 passant de 5 565 en S53 agrave 7 137 en S01 soit + 28 (Figure 29) Figure 29 Nombre hebdomadaire de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 19 mars 2020 France (donneacutees au 10 janvier 2021)

S122020 Donneacutees incomplegravetes car deacutemarrage de SI-VIC en cours de semaine

Source SI-VIC

NB Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en reacuteanimation ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Ce deacutelai peut ecirctre particuliegraverement important dans le cas de rattrapage de deacuteclaration drsquoanciens dossiers de patients Ce deacutelai entraine un retard dans lrsquoobservation des tendances et peut aboutir agrave une sur-estimation des incidences si des eacutevegravenements anciens sont comptabiliseacutes au cours de la semaine de deacuteclaration

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 33

Les graphiques preacuteceacutedents (Figures 24a 26a 28 29) sont preacutesenteacutes par date de deacuteclaration Afin de preacuteciser les tendances les statuts des patients hospitaliseacutes sont aussi preacutesenteacutes par date drsquoadmission des patients agrave lrsquohocircpital (Figures 30 et 31) ou par date de deacutecegraves (Figure 32) Une tendance agrave lrsquoaugmentation est observeacutee en semaine 01 par comparaison agrave la semaine 53 pour le nombre drsquohospitalisations (+6) et pour le nombre drsquoadmissions en reacuteanimation (+5) Toutefois les donneacutees de la S01 ne sont pas encore consolideacutees

Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis agrave lrsquohocircpital par semaine drsquoadmission agrave lrsquohocircpital depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 31 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 admis en service de reacuteanimation pendant leur hospitalisation par semaine drsquoadmission en reacuteanimation depuis le 24 feacutevrier 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Figure 32 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de patients COVID-19 par semaine de deacutecegraves depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees Source SI-VIC

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 34

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre Les services de reacuteanimation participants surveillent eacutegalement les cas graves de grippe depuis cette date Cette surveillance a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer Le protocole de la surveillance et la fiche de recueil sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le bulletin grippe hebdomadaire Agrave noter que dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux la peacuteriode drsquoinclusion des donneacutees peut diffeacuterer drsquoune reacutegion agrave lrsquoautre afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de la surveillance dans la reacutegion

Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 parmi les 4 887 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 71 eacutetaient des hommes lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) et 63 eacutetaient acircgeacutes de 65 ans et plus 63 eacutetaient des professionnels de santeacute

89 des patients admis en reacuteanimation preacutesentaient au moins une comorbiditeacute et cette proportion eacutetait de 84 parmi ceux acircgeacutes de moins de 65 ans Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) (45 des cas signaleacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) lrsquohypertension arteacuterielle (45) et le diabegravete (31) (Tableau 9)

Parmi les 3 677 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 47 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 3 932 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation

892 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour dont 2 chez des professionnels de santeacute Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 74 ans (IIQ [68-79]) 82 des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus Lrsquoinformation sur les comorbiditeacutes eacutetait disponible pour 876 patients parmi eux 828 (95) preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (53) lrsquoobeacutesiteacute (40 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) et les pathologies cardiaques (37) (Tableau 9) Entre le 05 octobre 2020 et le 12 janvier 2021 2 649 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees Tableau 9 Comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 12 janvier 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France (donneacutees au 12 janvier 2021)

1Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacute(s) parmi celles listeacutees dans le tableau 2Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients pour lesquels lIMC est renseigneacute n=4 309 et n=776)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 35

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France sont disponibles sous httpswwweurosurveillanceorgcontent1028071560-7917ES202025222001010

Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

Cent cinquante-huit cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas

avaient le 3 ans et 75 le 11 ans)

Pregraves de trois-quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou seacuterologie pour SARS-CoV-2

positives (n=256 72) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 18 (5) patients (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 24 patients (7) Pour les 58 patients restants (16) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 298 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 208 cas (70) Parmi les 58 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que pour 5 drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 168 enfants (47) et en uniteacute de soins critiques pour 72

(20) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (146 cas 41) Auvergne-

Rhocircne-Alpes (54 cas 15) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (44 cas 12) Grand Est (20 cas 6) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 20 cas (Tableau 10)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de 4 agrave 5 semaines apregraves lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 avait eacuteteacute

observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 fin septembre 140 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 10 janvier 2021 tous confirmeacutes agrave lrsquoexception drsquoun cas probable et de trois cas possibles (Figure 33)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 36

Tableau 10 Distribution du nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 114 8 7 17 146

Auvergne-Rhocircne-Alpes 38 3 2 11 54

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 33 1 4 6 44

Grand Est 13 2 2 3 20

Pays de la Loire 9 1 1 6 17

Nouvelle-Aquitaine 11 1 0 4 16

Normandie 4 1 2 5 12

Occitanie 7 0 0 1 8

Bourgogne-Franche-Comteacute 4 1 0 2 7

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Hauts-de-France 3 0 2 0 5

Bretagne 0 0 1 1 2

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 11 0 0 0 11

Guadeloupe 4 0 1 2 7

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

Total 256 18 24 58

356

Figure 33 Distribution hebdomadaire des hospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et des hospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

0

5 000

10 000

15 000

20 000

25 000

Cas PIMS hospitaliseacutes (Nb)

Anneacutee 2020 Anneacutee 2021

Cas COVID-19 hospitaliseacutes (Nb)

Lien confirmeacute Lien probable

Lien possible Lien non eacutetabli

Hospitalisations COVID-19 (tout acircge)

Donneacutees provisoires au 120121 date de lanalyse

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 37

SURVEILLANCE DES PROFESSIONNELS EN EacuteTABLISSEMENTS DE SANTEacute Mise en place le 22 avril 2020 cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salarieacutes drsquoun eacutetablissement de santeacute (PES) drsquohospitalisation public ou priveacute ayant eacuteteacute infecteacutes par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020 Ces donneacutees sont deacuteclareacutees chaque semaine par un reacutefeacuterent de chaque eacutetablissement et susceptibles drsquoecirctre corrigeacutees a posteriori au cours de la peacuteriode de surveillance

Depuis le dernier bilan publieacute le 31 deacutecembre 2020 1 802 cas suppleacutementaires ont eacuteteacute deacuteclareacutes portant agrave 61 526 le nombre de professionnels en eacutetablissement de santeacute (PES) infecteacutes pour la peacuteriode du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 La reacutepartition actualiseacutee du nombre hebdomadaire de cas deacuteclareacutes montre apregraves un pic de la deuxiegraveme vague atteint en semaine 44 une diminution jusqursquoagrave la semaine 48 puis une stagnation entre les semaines 49 et 51 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Aucun deacutecegraves suppleacutementaire lieacute agrave la COVID-19 nrsquoa eacuteteacute deacuteclareacute depuis le dernier bilan de fin deacutecembre 2020 Au total 18 deacutecegraves lieacutes agrave lrsquoinfection agrave SARS-CoV-2 ont eacuteteacute enregistreacutes depuis le 1er mars 2020 survenus chez 5 meacutedecins 5 aides-soignants 2 professionnels de santeacute classeacutes laquo autres raquo et 6 professionnels non soignants Parmi les deacutecegraves deacuteclareacutes aucun nrsquoest survenu depuis juin Pendant la deuxiegraveme vague (S37 agrave S50-2020) 23 186 PES travaillant dans les eacutetablissements participant agrave notre enquecircte ont eacuteteacute contamineacutes par le SARS-CoV-2 Parmi les 23 186 cas 14 573 (63) eacutetaient des professionnels de santeacute et 2 375 (10) des professionnels non soignants Pour 27 des cas la cateacutegorie professionnelle nrsquoeacutetait pas renseigneacutee Les deux professions le plus souvent rapporteacutees eacutetaient les infirmiers (N=4 806 21 des cas) et les aides-soignants (N=4 419 19 des cas) La proportion de PES deacuteclareacutes infecteacutes par le SARS-CoV-2 parmi lrsquoensemble des PES participant agrave lrsquoenquecircte eacutetait eacutegale agrave 49 Les kineacutesitheacuterapeutes (68) et les aides-soignants (54) eacutetaient les professions proportionnellement les plus impacteacutees (Tableau 11)

Figure 34 Nombre de professionnels atteints de la COVID-19 deacuteclareacutes dans les eacutetablissements de santeacute participant par semaine depuis le 13 avril 2020 (donneacutees au 11 janvier 2021 N=37 353) France

Les donneacutees pour S52 S53 (2020) et S1 (2021) sont en cours de consolidation Note Les cas anteacuterieurs au 13 avril 2020 (N=24 173) ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France de maniegravere reacutetrospective et agreacutegeacutee sans preacutecision sur leur semaine de signalement

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 38

Tableau 11 Nombre et proportion de professionnels atteints de COVID-19 deacuteclareacutes par cateacutegorie professionnelle dans les eacutetablissements de santeacute participant entre la semaine 37 et la semaine 50 de 2020 (donneacutees du 11 janvier 2021) France

Cateacutegorie professionnelle Nombre de cas parmi les PES

Infirmier 4 806 40

Aide-soignant 4 419 54

Meacutedecin 1 302 29

Interne 630 40

Kineacutesitheacuterapeute 232 68

Sage-femme 150 26

Autre professionnel soignant 2 187 36

Autre professionnel non soignant 2 375 19

Inconnu 6 238 NA

Total 22 339 49

Source de donneacutees pour le nombre total de professionnels par cateacutegorie professionnelle par reacutegion SAE donneacutees 2018 httpswwwsae-diffusionsantegouvfrsae-diffusionaccueilhtm NB Les cas survenus parmi la cateacutegorie professionnelle laquo eacutelegraveves raquo (N=847) nrsquoont pas eacuteteacute pris en compte dans cette analyse en lrsquoabsence de deacutenominateur connu

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 39

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation pour COVID-19 et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 12 janvier 2021 68 802 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 47 799 deacutecegraves eacutetaient survenus au cours drsquoune hospitalisation et 21 003 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements meacutedico-sociaux (EMS) (donneacutees au 10 janvier 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national apregraves consolidation des donneacutees le nombre hebdomadaire de deacutecegraves restait stable en semaine 53 avec 2 360 deacutecegraves vs 2 344 en S52 (+07 donneacutees consolideacutees) En semaine 01 2 298 deacutecegraves eacutetaient recenseacutes mais les donneacutees nrsquoeacutetant pas consolideacutees cette tendance ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee En S53 une augmentation eacutetait constateacutee pour les deacutecegraves survenus en ESMS (+16) associeacutee agrave une stagnation des deacutecegraves survenus en hospitalisation (-4) En S01 les deacutecegraves survenus agrave lrsquohocircpital augmentaient (+11 donneacutees consolideacutees) Lrsquoeacutevolution des deacutecegraves en ESMS entre les S53 et S01 ne peut pas ecirctre interpreacuteteacutee car les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees Le taux hebdomadaire de deacutecegraves agrave lrsquoeacutechelle nationale eacutetait de 34 pour 100 000 habitants en S01 (vs 35 en S53 et 35 en S52 ndash donneacutees consolideacutees pour S52 et S53) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient toujours observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute (74100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (54) et Grand Est (51) suivis de la reacutegion Auvergne-Rhocircne-Alpes (45) (Figure 35) Entre les semaines 52 et 53 (donneacutees consolideacutees) le taux de deacutecegraves diminuait ou restait stable dans 7 reacutegions meacutetropolitaines comme la semaine preacuteceacutedente Le taux de deacutecegraves augmentait en Normandie (+51) Bourgogne-Franche-Comteacute (+20) Icircle-de-France (+14) Grand Est (+8) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+6) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (+5) Malgreacute des donneacutees encore non consolideacutees pour la S01 6 reacutegions rapportent drsquoores et deacutejagrave une augmentation du taux de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Centre-Val de Loire (+37) Icircle-de-France (+31) Occitanie (+23) Hauts-de-France (+21) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (+12) Bretagne (+6) (donneacutees non consolideacutees) Figure 35 Taux hebdomadaires de deacutecegraves dus agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 21 deacutecembre 2020 au 10 janvier 2021 (S51 agrave S53) par reacutegion France

du 21 au 27 deacutecembre 2020 du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021 du 04 au 10 janvier 2021

Semaine 01 donneacutees non consolideacutees pour les EHPA et autres ESMS

Source SI-VIC et ESMS

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 40

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 28 927 certificats contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12)

- Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 85 ans et 925 des personnes avaient 65 ans et plus - Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

- 54 de ces certificats de deacutecegraves contenaient une mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 18 836 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 35 de ces deacutecegraves et une mention drsquohypertension arteacuterielle pour 22

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 2 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de comorbiditeacute (ou pas de comorbiditeacute renseigneacutee) et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Pour la semaine 01-2021 (du 04 au 10 janvier 2021) 1 121 deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 26 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 36) Ce nombre de deacutecegraves est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+ 122 deacutecegraves soit +12 par rapport agrave la S53) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 53

Parmi les 1 121 personnes deacuteceacutedeacutees sur la semaine eacutecouleacutee avec une mention de COVID-19 dans le certificat 935 (83) eacutetaient acircgeacutees de 75 ans et plus 125 (11) eacutetaient acircgeacutees de 65 agrave 74 ans et 60 (5) eacutetaient acircgeacutees de 45 agrave 64 ans Une personne deacuteceacutedeacutee eacutetait acircgeacutee de 15 agrave 44 ans La hausse la plus forte en semaine 01-2021 est observeacutee dans la classe drsquoacircge des plus de 75 ans (+135 deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente) Figure 36 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 10 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 41

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 11 janvier 2021 France (donneacutees au 12 janvier 2021)

Sexe n

Hommes 15 736 54

Femmes 13 190 46

Cas selon la classe dacircge Sans comorbiditeacute ou

non renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 3 100 3 0

15-44 ans 60 34 116 66 176 1

45-64 ans 570 29 1 429 71 1 999 7

65-74 ans 1 246 30 2 887 70 4 133 14

75 ans ou plus 8 215 36 14 401 64 22 616 78

Tous acircges 10 091 35 18 836 65 28 927 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 6 564 35

Hypertension arteacuterielle 4 166 22

Diabegravete 3 021 16

Pathologie respiratoire 2 478 13

Pathologie reacutenale 2 384 13

Pathologies neurologiques 1 612 9

Obeacutesiteacute 1 041 6

Immunodeacuteficience 429 2

Ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires

1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 42

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat-civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre) jusqursquoen S53 (du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021) avec une hausse jusqursquoen S45 (du 02 au 08 novembre) puis une diminution amorceacutee agrave partir de la S47 (du 16 au 22 novembre) (Figure 37) On note toutefois une stabilisation des effectifs sur les semaines 49 et 50 (du 30 novembre au 13 deacutecembre) avant une nouvelle diminution jusqursquoen semaine 53 Lrsquoexcegraves de mortaliteacute au niveau national eacutetait compris entre +6 et +8 en semaines 40 agrave 42 +21 en S43 +26 en S44 +33 en S45 +31 en S46 +25 en S47 +21 en S48 +20 en S49 +19 en semaine 50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 Lrsquoexcegraves sur les semaines 45 et 46 a atteint un niveau exceptionnel Du fait du deacutelai habituel de transmission des donneacutees lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine

Au niveau reacutegional (Figures 38 et 40) la dynamique du nombre de deacutecegraves sur les derniegraveres semaines est heacuteteacuterogegravene selon les reacutegions En Auvergne-Rhocircne-Alpes les effectifs de deacutecegraves sont agrave nouveau en leacutegegravere augmentation en semaine 53 apregraves une diminution pendant 6 semaines conseacutecutives Dans les reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur les effectifs de deacutecegraves sont stabiliseacutes depuis la semaine 49 agrave un niveau eacuteleveacute En Centre-Val de Loire les effectifs de deacutecegraves semblent se stabiliser agrave la limite haute de la marge de fluctuation habituelle apregraves une diminution observeacutee en S52 Enfin dans les reacutegions Icircle-de-France Normandie et Occitanie les effectifs de deacutecegraves semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle agrave partir de la S51

Au total le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S41 dans 2 reacutegions en S42 dans 4 reacutegions en S43 dans 8 reacutegions en S44 et S45 dans 10 reacutegions en S46 dans 12 reacutegions en S47 dans 11 reacutegions en S48 dans 10 reacutegions en S49 dans 9 reacutegions en S50 dans 11 reacutegions en S51 agrave S53 dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Agrave lrsquoeacutechelon deacutepartemental 33 deacutepartements preacutesentaient un excegraves de mortaliteacute par rapport agrave la mortaliteacute attendue en S43 31 deacutepartements en S44 48 deacutepartements en S45 47 deacutepartements en S46 38 deacutepartements en semaines 47 agrave 49 31 deacutepartements en S50 28 deacutepartements en S51 20 deacutepartements en S52 et 19 deacutepartements en S53 (Figure 39)

Ces excegraves concernent principalement les personnes de 65 ans ou plus

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier sur les semaines 51 agrave 53 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Figure 37 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 France

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 43

Figure 38 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par reacutegion France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Figure 39 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues sur les semaines 51 52 et 53 de 2020 par deacutepartement France (donneacutees au 12 janvier 2021)

du 14 au 20 deacutecembre 2020

du 21 au 27 deacutecembre 2020

du 28 deacutecembre 2020 au 03 janvier 2021

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12

Sources Santeacute publique France - Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 44

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 18-2014 agrave la semaine 53-2020 dans les reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur France

Auvergne-Rhocircne-Alpes

Bourgogne-Franche-Comteacute

Grand Est

Hauts-de-France

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Sources Santeacute publique France ndash Insee

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 45

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 27 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (httpswwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute est noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoest accrue agrave partir de la S43 jusqursquoen S46 (Figure 41) Le nombre de deacutecegraves srsquoest stabiliseacute jusqursquoen S49 avant drsquoaborder une diminution en S50 qui srsquoest poursuivie entre S51 et S53 Les nombres de deacutecegraves en S52 et S53 semblent revenir dans les marges de fluctuation habituelle Les effectifs sur les deux derniegraveres semaines sont toutefois agrave prendre avec prudence compte tenu de la peacuteriode des fecirctes de fin drsquoanneacutee susceptible drsquoaccroitre les deacutelais de transmission des donneacutees Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans dix-sept paysreacutegions en S49 et S50 dans seize pays en S51 et dans quatorze pays en S52 (Angleterre Estonie Danemark Pays-Bas Belgique Luxembourg Allemagne (Hesse) France Italie Gregravece Autriche Suisse Sloveacutenie et Portugal) (Figure 42) Figure 41 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 27 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 03-2017 agrave la semaine 53-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

Figure 42 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 52-2020 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 05 janvier 2021)

Source EuroMOMO

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VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les publics prioritaires pour la vaccination sont notamment les personnes acircgeacutees reacutesidents en EHPAD ou en uniteacute de soins de longue dureacutee (USLD) les prersonnels de ces eacutetablissements preacutesentant des comorbiditeacutes les soignants acircgeacutes de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les pompiers de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes les aides agrave domicile de plus de 50 ans ou preacutesentant des comorbiditeacutes ainsi que les personnes handicapeacutees vulneacuterables prises en charge dans les foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes et les maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees Agrave compter du 18 janvier 2021 les personnes acircgeacutees de plus de 75 ans auront eacutegalement la possibiliteacute de se faire vacciner La campagne de vaccination sera accompagneacutee drsquoun suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Il conviendra drsquoestimer pour chaque population cible et pour lesquelles les donneacutees le permettront (par exemple les reacutesidents et les professionnels en EHPAD) agrave diffeacuterentes eacutechelles geacuteographiques la proportion des personnes vaccineacutees pour la dose initiale puis pour la seconde dose Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale drsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Le traitement eacutepideacutemiologique de ces donneacutees permettra la production drsquoindicateurs qui feront lrsquoobjet drsquoune publication reacuteguliegravere sur le site internet de Santeacute publique France drsquoanalyses dans les points eacutepideacutemiologiques hebdomadaires et seront en accegraves libre en open data sur la plateforme Geacuteodes Comme au deacutemarrage de tout systegraveme de surveillance les premiegraveres donneacutees reccedilues par Santeacute publique France font lrsquoobjet drsquoanalyse de qualiteacute Les publications seront reacutealiseacutees degraves que la qualiteacute et la compleacutetude des donneacutees seront assureacutees Des donneacutees plus complegravetes tenant compte notamment du sexe de lrsquoacircge ainsi que des populations cibles (reacutesidents des Ehpad professionnels des Ehpad) pourront alors ecirctre preacutesenteacutees Pendant la peacuteriode intermeacutediaire les donneacutees preacutesenteacutees sont issues des remonteacutees drsquoinformations transmises par les Agences reacutegionales de santeacute (ARS) et publieacutees sur datagouvfr Le nombre de vaccinations en France est obtenu par recueil quotidien aupregraves des ARS des donneacutees reacutegionales de vaccination recenseacutees aupregraves des eacutetablissements pour personnes acircgeacutees (vaccination des reacutesidents et des professionnels des eacutetablissements) et des centres de vaccination (vaccination des professionnels de santeacute) Au 13 janvier 2021 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France (Tableau 13)

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 47

Tableau 13 Nombre de personnes vaccineacutees (1 dose) contre la COVID-19 et couverture vaccinale (100 000 habitants) au 13 janvier 2021 France

Nombre de personnes vaccineacutees Couverture vaccinale

Reacutegions (N) ( 100 000 habitants)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 24 979 311

Bourgogne-Franche-Comteacute 14 102 507

Bretagne 10 574 317

Centre-Val de Loire 8 085 316

Corse 1 252 363

Grand Est 20 692 375

Hauts-de-France 17 763 298

Ile-de-France 50 881 414

Normandie 18 971 574

Nouvelle-Aquitaine 28 428 474

Occitanie 23 743 401

Pays de la Loire 12 354 325

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 14 769 292

France meacutetropolitaine 246 593 380

Guadeloupe 197 52

Guyane 0 0

La Reacuteunion 0 0

Martinique 376 105

Mayotte 0 0

France entiegravere 247 166 368

Source Agences reacutegionales de santeacute datagouvfr

La liste des centres de vaccination est disponible agrave lrsquoadresse httpssantefrcarte-vaccination-covid Afin de faciliter lrsquoaccegraves aux supports drsquoinformation et aux connaissances disponibles les donneacutees actualiseacutees sur le vaccin COVID-19 sont disponibles sur le site vaccination-info-servicefr accessible au grand public comme aux professionnels de santeacute Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 48

PREacuteVENTION

Adoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale Les donneacutees proviennent de lrsquoEnquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars agrave deacutecembre 2020 La vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev a eacuteteacute reacutealiseacutee au moment du deuxiegraveme deacuteconfinement

Les reacutesultats de la derniegravere enquecircte CoviPrev laquo vague 19 raquo reacutealiseacutee entre le 14 et le 16 deacutecembre 2020 sont disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La prochaine enquecircte est preacutevue du 18 au 20 janvier 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique de la semaine suivante

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 49

SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 90 054 813 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde - dont 1 945 610 deacutecegraves - au 13 janvier 2021

Foyers majeurs

Les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situent actuellement dans la zone Ameacuteriques (2 522 297 cas et 38 183 deacutecegraves rapporteacutes en semaine 01) et en Europe (1 806 928 cas et 36 041 deacutecegraves rapporteacutes en S01) respectivement agrave lrsquoorigine de 51 et 36 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 45 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S01 (du 04 janvier au 10 janvier 2021) (Figure 43) Les pays qui rapportent le plus grand nombre de cas en S01 sont les Eacutetats-Unis (+1 786 773 nouveaux cas) le Royaume-Uni (+417 620) le Breacutesil (+313 130) la Russie (+165 167) lrsquoAllemagne (+142 861) lrsquoAfrique du Sud (+125 287) et la France (+126 022) Les pays avec les plus fortes incidences rapporteacutees en S01 sont lrsquoIrlande (887 cas100 000 habitants) la Reacutepublique tchegraveque (847 cas100 000 habitants) la Sloveacutenie (666 cas100 000 habitants) le Royaume-Uni (615 cas100 000 habitants) Israeumll (573 cas100 000 habitants) le Panama (540 cas100 000 habitants) et les Eacutetats-Unis (540 cas100 000 habitants) Figure 43 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021)

Source OMS

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Tendances Comparativement agrave la semaine 53 toutes les reacutegions OMS ont observeacute une hausse du nombre de cas en S01 sauf lrsquoAsie du Sud-Est ougrave ce nombre est resteacute stable (Tableau 14) Le nombre de deacutecegraves eacutetait en augmentation en Afrique (+31) dans la reacutegion des Ameacuteriques (+18) ainsi que dans la reacutegion du Pacifique occidental (+14) et en Europe (+6) Tableau 14 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 rapporteacutes dans le monde en semaine 01-2021 et eacutevolution par rapport agrave la semaine 53-2020

Note Les flegraveches rouges repreacutesentent une augmentation du nombre de cas de plus de 5 par apport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de plus de 5 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Une flegraveche noire repreacutesente une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Source OMS

Par reacutegion Dans la reacutegion des Ameacuteriques le nombre de nouveaux cas hebdomadaires a deacutepasseacute 2 500 000 en S01 et on compte 38 138 nouveaux deacutecegraves ce qui repreacutesente une hausse de respectivement 30 et 18 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Les Eacutetats-Unis restent le pays le plus toucheacute par lrsquoeacutepideacutemie dans la reacutegion avec 1 786 773 nouveaux cas (540 cas 100 000 hab) et 20 633 nouveaux deacutecegraves rapporteacutes en S01 Le nombre de deacutecegraves journaliers aux Eacutetats-Unis a atteint des nombres records de lrsquoordre de 4 000 deacutecegraves en 24h Les autres pays avec les plus grands nombres de nouveaux cas sont le Breacutesil (313 130 nouveaux cas soit 177 nouveaux cas100 000 hab) et la Colombie (100 688 nouveaux cas soit 198 nouveaux cas100 000 hab) Les Eacutetats-Unis repreacutesentaient 71 de tous les nouveaux cas et 54 des deacutecegraves dans la reacutegion des Ameacuteriques Pour plus de deacutetails sur la zone Ameacuteriques cliquez ici La reacutegion Europe a continueacute de signaler un nombre eacuteleveacute de cas en S01 avec plus de 18 million de nouveaux cas et 36 041 nouveaux deacutecegraves soit une augmentation de 10 des cas et de 7 des deacutecegraves par rapport agrave la S53 Les pays de la reacutegion Europe ayant signaleacute le plus grand nombre de nouveaux cas eacutetaient le Royaume-Uni (+417 620 nouveaux cas soit 615 nouveaux cas 100 000 hab) la Russie (+165 167 nouveaux cas soit 113 nouveaux cas 100 000 hab) et lrsquoAllemagne (142 861 nouveaux cas soit 171 nouveaux cas 100 000 hab) suivis de la France (122 565 nouveaux cas soit 188 nouveaux cas 100 000 hab) et de lrsquoItalie (90 684 nouveaux cas soit 193 nouveaux cas 100 000 hab) Le plus grand nombre de deacutecegraves a eacuteteacute signaleacute au Royaume-Uni (6 298 +51) en Allemagne (6 071 +35) et en Italie (3 409 +1) Pour plus de deacutetails sur lrsquoEurope cliquez ici Une augmentation importante de cas et de deacutecegraves par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) est observeacutee en reacutegion Afrique Plus de 174 000 nouveaux cas et 4 300 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes soit une hausse de respectivement 34 et 31 Le nombre de nouveaux cas rapporteacutes est en augmentation depuis mi-septembre 2020 mais cette tendance srsquoacceacutelegravere depuis fin novembre Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont lrsquoAfrique du Sud (125 287 nouveaux cas soit 211 cas100 000 hab +27) le Nigeria (8 315 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +49) et le Zimbabwe (6 008 nouveaux cas soit 40 cas100 000 hab +293) Les pays rapportant le plus grand nombre de deacutecegraves en S01 sont lrsquoAfrique du Sud (3 649 +37) le Zimbabwe (106 +194) et la Zambie (72 +620) En Afrique du Nord la situation reste preacuteoccupante au Maroc (9 496 cas en S01 chiffre en baisse de 19 par rapport agrave S53) et tout particuliegraverement en Tunisie qui atteint un niveau record du nombre de cas confirmeacutes hebdomadaires depuis le deacutebut de la pandeacutemie avec 15 535 cas pour la S01 (soit +32 par rapport agrave la S53) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 51

En reacutegion Asie du Sud-Est les indicateurs de lrsquoeacutepideacutemie continuent de baisser une tendance observeacutee depuis mi-septembre On deacutenombre plus de 200 000 nouveaux cas et 3 200 nouveaux deacutecegraves soit une diminution de 1 et 12 respectivement par rapport agrave la S53 Les pays rapportant les nombres de cas les plus eacuteleveacutes sont lrsquoInde avec 126 319 nouveaux cas soit 9 cas100 000 hab (-7) lrsquoIndoneacutesie avec 59 913 nouveaux cas soit 22 cas100 000 hab (+16) et le Bangladesh avec 6 198 nouveaux cas soit 4 cas100 00 hab (-13) Ces trois pays sont eacutegalement les pays cumulant le plus de deacutecegraves en S01 avec respectivement 1 564 (-14) 1 392 (-11) et 157 deacutecegraves (-8) LrsquoInde demeure le pays rapportant le plus grand nombre de cas et de deacutecegraves dans la reacutegion depuis la deuxiegraveme semaine drsquoavril 2020 Pour plus de deacutetails sur lrsquoAsie du Sud-Est cliquez ici En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale plus de 171 000 nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse de 11 alors que la reacutegion avait preacutesenteacute une baisse continue du nombre de cas entre le 23 novembre et le 28 deacutecembre 2020 Le nombre de deacutecegraves rapporteacutes continue toutefois de diminuer pour la 7e semaine conseacutecutive (-9) Les pays avec le plus grand nombre de cas sont lrsquoIran (42 964 nouveaux cas soit 51 cas100 000 hab +1) le Liban (29 145 nouveaux cas soit 427 cas100 000 hab +72) et les Eacutemirats arabes unis (16 061 nouveaux cas soit 162 cas100 000 +49) Ces trois pays repreacutesentent agrave eux seuls plus de la moitieacute (52) des nouveaux cas de la reacutegion Le plus grand nombre de deacutecegraves est observeacute en Iran (662 -23) au Pakistan (340 -23) et en Egypte (401 +3) ces pays enregistrant 60 des deacutecegraves de la reacutegion En Israeumll le nombre de cas continue drsquoaugmenter pour la 8e semaine conseacutecutive avec un nombre record de cas hebdomadaire atteint depuis le deacutebut de la pandeacutemie en S01 49 605 cas (+41 par rapport agrave la S53) pour les deacutecegraves 5e semaine conseacutecutive drsquoaugmentation avec 43 drsquoaugmentation entre la S53 et la S01 Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici

En reacutegion Pacifique occidental le nombre de nouveaux cas est de 71 000 soit une augmentation de 36 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (S53) Si une tendance agrave la hausse est observeacutee depuis fin octobre 2020 cette augmentation marque une acceacuteleacuteration de la situation Les trois pays rapportant le plus grand nombre de cas sont le Japon (39 821 cas soit 32 cas 100 000 hab +68) la Malaisie (16 186 nouveaux cas soit 50 cas100 000 hab +20) et les Philippines (8 881 nouveaux cas soit 8 cas100 000 hab +12) Les pays rapportant cette semaine le plus grand nombre de deacutecegraves sont le Japon (448 +34) la Coreacutee du Sud (163 +6) et les Philippines (145 -22) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 52

POINT SUR LES VARIANTS EacuteMERGENTS DU SARS-CoV-2 AU NIVEAU INTERNATIONAL Plusieurs nouveaux variants du SARS-CoV-2 ont eacuteteacute identifieacutes au cours des derniers mois et font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere notamment VOC 20201201 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni et 501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud Un troisiegraveme variant ayant eacutemergeacute au Breacutesil (B1128) est en cours drsquoinvestigation

VOC 20201201 (Royaume-Uni)

Le 14 deacutecembre 2020 le Royaume-Uni a signaleacute agrave lOMS la circulation drsquoun variant particulier du SARS-CoV-2 identifieacute reacutetrospectivement sur un premier cas fin septembre dans le Kent (Sud-Est de lAngleterre) Ce variant est deacutenommeacute VOC 20201201 pour laquo Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01 raquo Des travaux preacuteliminaires suggegraverent que la transmissibiliteacute de ce variant est plus eacuteleveacutee que celle des variants circulant actuellement mais aucun eacuteleacutement nrsquoindique agrave ce jour qursquoil serait agrave lrsquoorigine de formes plus seacutevegraveres chez les personnes infecteacutees ou qursquoil pourrait eacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Lrsquoeacutevaluation de risque rapide de lrsquoEuropean Centre for Disease Control (ECDC) en date du 29 deacutecembre 2020 estime que la probabiliteacute drsquointroduction et de circulation de ce variant hors du Royaume-Uni est tregraves eacuteleveacutee

Dans le monde au total 50 pays ont rapporteacute au 12 janvier 2021 des cas confirmeacutes de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 vs 38 pays la semaine preacuteceacutedente Selon les donneacutees disponibles agrave lrsquoOMS tous les continents rapportent officiellement des cas confirmeacutes avec ce variant sauf encore lrsquoAfrique (Figure 44) Selon le dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS et les premiegraveres donneacutees disponibles la distribution par acircge et sexe de ce variant serait similaire agrave celle des autres variants circulant sur la mecircme peacuteriode En revanche une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee serait rapporteacutee avec un taux drsquoattaque chez les cas secondaires de lrsquoordre de 11 agrave 15 Pour plus de deacutetails dans le Weekly epidemiological update de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 cliquez ici Figure 44 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant VOC 20201201 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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501YV2 (Afrique du Sud) En Afrique du Sud le gouvernement signalait le 18 deacutecembre 2020 leacutemergence dun autre variant deacutesigneacute 501YV2 Ce nouveau variant a eacuteteacute deacutetecteacute par une plateforme de recherche (KRISP) qui conduit une surveillance geacutenomique de routine du SARS-CoV-2 agrave partir deacutechantillons collecteacutes dans plus de 50 eacutetablissements de santeacute diffeacuterents du Cap oriental du Cap occidental et du KwaZulu-Natal Ce variant serait apparu deacutebut aoucirct Deacutebut novembre il eacutetait le variant dominant dans les provinces du Cap oriental et du Cap occidental

Dans le monde au 12 janvier 2021 selon les donneacutees du dernier Weekly epidemiological update de lrsquoOMS au total 20 pays dans le monde rapportaient des cas confirmeacutes COVID-19 avec le variant 501YV2 vs 10 la semaine derniegravere

Dans la reacutegion des Ameacuteriques il nrsquoy a toujours pas de cas confirmeacutes avec ce variant mais des cas suspects sont en cours de veacuterification au Canada et au Breacutesil En Asie le Japon rapporte des cas confirmeacutes alors que la Chine veacuterifie quelques cas suspects En Afrique mis agrave part lrsquoAfrique du Sud qui rapporte des centaines de cas confirmeacutes des cas suspects sont en cours de confirmation au Botswana et en Zambie (Figure 45)

Selon lrsquoOMS ce nouveau variant 501YV2 serait plus contagieux que les autres variants qui circulent deacutejagrave en Afrique du Sud mais nrsquoengendrerait pas de formes plus seacutevegraveres

Figure 45 Pays et territoires rapportant des cas confirmeacutes et des cas suspects (en cours de confirmation) de COVID-19 avec le variant 501YV2 (donneacutees au 12 janvier 2021)

Source OMS

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Variant B1128 (Breacutesil)

Le 9 janvier 2021 le ministegravere de la Santeacute japonais notifiait agrave lrsquoOMS la deacutetection drsquoun nouveau variant diffeacuterent de ceux repeacutereacutes au Royaume-Uni et en Afrique du Sud chez 4 voyageurs en provenance du Breacutesil le variant avec lignage B1128

Le ministegravere de la Santeacute breacutesilien a eacuteteacute informeacute par les autoriteacutes japonaises que ce variant comporte 12 mutations dont 3 retrouveacutees dans les variants VOC 20201201 et 501YV2 (mutations K417NT E484K et N501Y)

Pour plus de deacutetails sur les informations issues du ministegravere de la Santeacute du Breacutesil cliquez ici

Par ailleurs les chercheurs breacutesiliens rapportent en parallegravele lrsquoeacutemergence drsquoun variant similaire avec la mutation E484K qui a probablement eacutevolueacute indeacutependamment de la variante deacutetecteacutee chez les voyageurs japonais

Dans une eacutetude publieacutee dans le magazine Virologicalorg et co-signeacutee par des chercheurs britanniques et breacutesiliens le 12 janvier dernier ce variant laquo Manaus raquo (du nom de la capitale de lAmazonas dougrave il serait parti) preacutesenterait des taux dattaque tregraves eacuteleveacutes repreacutesentant 42 des tests positifs RT-PCR recueillis entre le 15 et le 23 deacutecembre 2020 agrave Manaus

Pour plus de deacutetails sur cette eacutetude cliquez ici

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent par ailleurs qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants eacutemergents du SARS-CoV-2 - Eacutevaluation de risque de lrsquoECDC httpswwwecdceuropaeusitesdefaultfilesdocumentsCOVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-variants-EU-EEApdf - Synthegravese de lrsquoOMS httpswwwwhointcsrdon31-december-2020-sars-cov2-variantsen - Weekly report de lrsquoOMS du 12 janvier 2021 httpswwwwhointpublicationsmitemweekly-epidemiological-update---12-january-2021

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 55

SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 01 (du 04 au 10 janvier 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques de suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 montraient une progression de la circulation du SARS-CoV-2 dans un contexte de circulation du virus agrave un niveau deacutejagrave eacuteleveacute Cette augmentation fait suite agrave la peacuteriode de vacances et aux rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee et agrave lrsquoapparition de variants dont la transmissibiliteacute est potentiellement plus eacuteleveacutee Dans ce contexte il y a un risque que la circulation virale continue de srsquointensifier dans les semaines agrave venir Au niveau national en semaine 01 le recours au deacutepistage eacutetait en augmentation par comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente pendant laquelle une diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage avait eacuteteacute constateacutee en fin drsquoanneacutee (+9 entre S53 et S01 et -39 entre S52 et S53) En semaine 01 le taux de deacutepistage eacutetait de 2 910100 000 habitants (soit 1 953 125 personnes testeacutees) Il restait le plus eacuteleveacute chez les 15-44 ans (3 759) mais agrave un niveau stable (+2) tandis qursquoune augmentation eacutetait constateacutee chez les 75 ans et plus (3 591 +23) Le deacutepistage eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+34 entre S53 et S01) qui repreacutesentaient 22 des personnes testeacutees en S01 (vs 17 en S53) tandis qursquoil eacutetait stable chez les personnes asymptomatiques (+1) En semaine 01 lrsquoaugmentation du nombre de nouveaux cas confirmeacutes srsquoaccentue davantage par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+30 vs +17 entre S53 et S52) dans lrsquoensemble des classes drsquoacircge avec un nombre total de cas confirmeacutes de 126 022 (vs 97 025 cas en S53) Le taux drsquoincidence eacutetait de 188 pour 100 000 habitants (vs 145 en S53) avec 18 003 cas confirmeacutes en moyenne chaque jour En semaine 01 les personnes de 15 agrave 44 ans eacutetaient les plus toucheacutees par le SARS-CoV-2 (incidence de 243100 000 habitants en S01) suivies de celles acircgeacutees de 75 ans et plus (230) puis de 45-64 ans (187) Lrsquoaugmentation eacutetait observeacutee dans toutes les classes drsquoacircge mais plus fortement chez les moins de 15 ans (+46) Chez les plus jeunes les taux drsquoincidence ont augmenteacute de 47 chez les 0-9 ans (50100 000) et de 46 chez les 10-19 ans (184) Parmi lrsquoensemble des cas diagnostiqueacutes en semaine 01 la proportion des personnes preacutesentant des symptocircmes (53 des cas) eacutetait stable en comparaison agrave la semaine preacuteceacutedente (52) Le nombre de cas eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques (+33 entre S53 et S01) et asymptomatiques (+25) Le taux de positiviteacute au niveau national (65) eacutetait en augmentation par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (54 soit +11 point) en particulier chez les moins de 15 ans (101 +24 points) Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes progresse plus fortement que celle du deacutepistage signifiant un reacuteel accroissement du nombre de contaminations entre les semaines 53 et 01 En semaine 01 les indicateurs de contact tracing montrent lrsquoimpact des rassemblements festifs de fin drsquoanneacutee sur lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie Le nombre de nouveaux cas observeacute en semaine 53 poursuit sa hausse en semaine 01 en lien avec lrsquoaugmentation marqueacutee du nombre de personnes-contacts observeacutee en semaine 53 Le nombre moyen de personnes-contacts par cas en semaine 01 reste stable tout comme la proportion de personnes-contacts qui nrsquoappartiennent pas au mecircme foyer que le cas index et la proportion de cas revenant drsquoun voyage (hors deacutepartement ou pays de reacutesidence) En semaine 01 les contacts agrave risque semblent moins intergeacuteneacuterationnels qursquoen semaine 53 avec une diminution du nombre de contacts agrave risque entre les plus de 60 ans et les plus jeunes Neacuteanmoins ces proportions semblent toujours plus eacuteleveacutees qursquoau cours des semaines de confinement et il faudra en mesurer lrsquoeacutevolution dans les jours et semaines agrave venir Les chaicircnes de transmission continuent agrave ecirctre mieux identifieacutees un quart des nouveaux cas appartiennent agrave une chaicircne connue (vs 254 en S53 et 203 en S52) Comme en semaine 53 cela pourrait indiquer une faciliteacute agrave retracer une liste complegravete des personnes-contacts durant cette peacuteriode de regroupement entre proches Neacuteanmoins cette situation nrsquoest pas homogegravene sur lrsquoensemble du territoire

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En meacutedecine geacuteneacuterale le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait en augmentation en comparaison agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (95100 000 habitants en S01 vs 65 en S53) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait eacutegalement en hausse en semaine 01 (+14 entre S53 et S01) pour la 2e semaine conseacutecutive Dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel avait atteint un pic en semaine 45 puis entameacute une deacutecroissance Une augmentation du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 est observeacutee en semaine 01 alors que les donneacutees de la semaine 01 ne sont pas consolideacutees Cette augmentation pourrait ecirctre lieacutee aux interactions sociales plus freacutequentes en peacuteriode de fin drsquoanneacutee Le nombre de nouveaux deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 survenus chez les reacutesidents eacutetait en diminution depuis la semaine 46 et semble se stabiliser ces derniegraveres semaines Il est neacutecessaire drsquoattendre la consolidation des donneacutees des derniegraveres semaines pour confirmer cette tendance Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 aux urgences est stable en semaine 01 (+07) apregraves trois semaines de hausse mais cela est probablement agrave mettre en lien avec la modification du recours aux soins durant les congeacutes de fin drsquoanneacutee En milieu hospitalier en semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations et de nouvelles admissions en reacuteanimation par date de deacuteclaration ont augmenteacute par rapport agrave la semaine 53 (respectivement +19 et +21) Par date drsquoadmission les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees du fait du deacutelai de deacuteclaration pendant la peacuteriode de fin drsquoanneacutee Cependant cette tendance agrave lrsquoaugmentation est deacutejagrave observeacutee agrave ce jour +6 pour le nombre de personnes hospitaliseacutees et +5 pour le nombre de personnes admises en reacuteanimation Le nombre de patients hospitaliseacutes en France pour COVID-19 restait eacuteleveacute avec 24 737 cas de COVID-19 hospitaliseacutes le 12 janvier 2021 dont 2 688 en reacuteanimation En France meacutetropolitaine les estimations du R-eff calculeacutees agrave partir des trois sources sont supeacuterieures agrave 1 de faccedilon significative (119 pour les donneacutees virologiques (tests PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP) 106 pour les donneacutees drsquohospitalisations (SI-VIC) et 102 pour les passages aux urgences (OSCOURreg) pour suspicion de COVID-19) Le passage de cet indicateur au-dessus de 1 montre une progression de la circulation du virus Les valeurs de R-eff qui permettent de deacutecrire la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie ne doivent pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse de la situation locale Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves incluant les deacutecegraves survenus en milieu hospitalier et dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (deacutecegraves survenus agrave domicile non inclus) restait stable agrave un niveau eacuteleveacute en semaine 53 en comparaison de la semaine preacuteceacutedente (2 360 vs 2 344 deacutecegraves en S52 +07) En semaine 01 2 298 deacutecegraves avaient eacuteteacute recenseacutes mais les donneacutees des deacutecegraves en ESMS nrsquoeacutetant pas consolideacutees lrsquoeacutevolution ne peut pas encore ecirctre interpreacuteteacutee Agrave noter que le nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 est eacuteleveacute plus de 68 000 deacutecegraves sont actuellement comptabiliseacutes sur la peacuteriode du 1er mars 2020 au 12 janvier 2021 Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis la semaine 40 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) Au niveau national lrsquoexcegraves de mortaliteacute a atteint un niveau exceptionnel en semaine 45 (+33) et en semaine 46 (+31) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute eacutetait de +19 en S50 +15 en semaine 51 et +11 en semaine 52 et se maintient agrave un niveau eacuteleveacute Du fait des deacutelais de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil lrsquoestimation de lrsquoexcegraves de deacutecegraves pour la semaine 53 sera preacuteciseacutee la semaine prochaine Lrsquoaugmentation du nombre de cas confirmeacutes pourrait preacutesager une augmentation suppleacutementaire du nombre drsquohospitalisations et de deacutecegraves dans les semaines agrave venir En effet les formes graves surviennent agrave distance du deacutebut des signes cliniques les hospitalisations et les admissions en reacuteanimation surviennent avec un deacutecalage drsquoune agrave deux semaines apregraves le deacutebut des signes et le deacutecegraves avec un deacutecalage de 3 agrave 4 semaines

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Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines La majoriteacute des reacutegions meacutetropolitaines restait fortement toucheacutee par lrsquoeacutepideacutemie en semaine 01 Une augmentation du taux drsquoincidence a eacuteteacute observeacutee dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines En semaine 01 les plus forts taux drsquoincidence eacutetaient agrave nouveau observeacutes dans lrsquoest de la France dans les reacutegions les plus impacteacutees Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (311100 000 habitants) Bourgogne-Franche-Comteacute (285) Grand Est (239) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (222) Ces quatre reacutegions ainsi que la reacutegion Centre-Val de Loire preacutesentaient les taux de positiviteacute les plus eacuteleveacutes Agrave noter que contrairement aux autres reacutegions lrsquoaugmentation du taux drsquoincidence eacutetait infeacuterieure agrave celle du taux de deacutepistage en Grand Est (+4 vs +8) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (+15 vs +17) En semaine 01 les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient en hausse dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Corse ougrave le taux a diminueacute Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes ont eacuteteacute enregistreacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 01 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmissions en reacuteanimation eacutetaient rapporteacutes en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Bourgogne-Franche-Comteacute Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation a augmenteacute dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine excepteacute en Grand Est (-8) Bourgogne-Franche-Comteacute (-7) Bretagne (-6) et Centre-Val de Loire (-2) En semaine 01 les plus forts taux de deacutecegraves (donneacutees hospitaliegraveres consolideacutees et donneacutees ESMS non consolideacutees) rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Bourgogne-Franche-Comteacute Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur Grand Est et Auvergne-Rhocircne-Alpes En semaine 53 un excegraves du nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait enregistreacute dans 6 reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Bourgogne-Franche-Comteacute Centre-Val-de-Loire Grand Est Hauts-de-France et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane les indicateurs virologiques eacutetaient en augmentation en semaine 01 (taux drsquoincidence et taux de positiviteacute) Le taux drsquohospitalisations eacutetait en augmentation modeacutereacutee (114100 000 habitants en S01 vs 100 en S53) En Guadeloupe les taux drsquoincidence et de positiviteacute eacutetaient en augmentation Le taux drsquohospitalisations se stabilisait (08 en S01 vs 05 en S53) En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations tendait agrave augmenter (11 en S01 vs 06 en S53) Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations a augmenteacute (20 en S01 vs 08 en S53) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence eacutetait en augmentation tandis que le taux de positiviteacute eacutetait stable Le taux drsquohospitalisations diminuait (29 en S01 vs 39 en S53) Pour en savoir + les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

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Surveillances speacutecifiques et populationnelles Les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie restaient les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus ainsi que celles preacutesentant des comorbiditeacutes Les personnes acircgeacutees de 65 ans et plus repreacutesentaient 91 des personnes deacuteceacutedeacutees de la COVID-19 agrave lrsquohocircpital depuis le 1er mars 2020 et 68 des personnes hospitaliseacutees en reacuteanimation le 12 janvier 2021 La surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation lors de la 2e vague indiquait une proportion eacuteleveacutee drsquohommes (71) de personnes de 65 ans et plus (63) et de cas preacutesentant une comorbiditeacute (89) dont les plus freacutequentes eacutetaient lrsquoobeacutesiteacute lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete Pour 42 des patients hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 un recours agrave la ventilation invasive avait eacuteteacute neacutecessaire Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 1er mars 2020 et le 10 janvier 2021 356 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (298 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 205 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans La surveillance speacutecifique des professionnels travaillant dans les eacutetablissements de santeacute mise en place depuis le 1er mars 2020 rapportait 61 526 cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 au 11 janvier 2021 Parmi ces cas 18 eacutetaient deacuteceacutedeacutes en lien avec leur infection agrave SARS-CoV-2 (aucun deacutecegraves rapporteacute depuis juin 2020) Le nombre hebdomadaire de cas rapporteacutes eacutetait stable entre les semaines 49 et 51 apregraves une diminution depuis la semaine 45 Les donneacutees des semaines 52 53-2020 et 01-2021 ne sont pas consolideacutees Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par la COVID-19 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres (httpsgeres-covidvoozanoonetgeres) ouverte agrave tous les professionnels de santeacute quel que soit leur mode drsquoexercice et visant agrave documenter les circonstances de leur contamination Dans le cadre de la surveillance des infections nosocomiales (e-SIN) entre le 1er janvier 2020 et le 03 janvier 2021 2 729 signalements de cas de COVID-19 nosocomiaux survenus au cours ou au deacutecours drsquoune prise en charge dans un eacutetablissement de santeacute ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees disponibles dans le Point eacutepideacutemiologique du 07 janvier 2021)

Variants eacutemergents du SARS-CoV-2 Suite agrave lrsquoidentification des variants SARS-CoV-2 eacutemergents signaleacutes agrave lrsquoOMS mi-deacutecembre 2020 VOC 20201201 (Variant Of Concern year 2020 month 12 variant 01) deacutetecteacute au Royaume-Uni et 501YV2 deacutetecteacute en Afrique du Sud une surveillance a eacuteteacute mise en place en France afin drsquoeacutevaluer et de suivre leur diffusion sur le territoire national Le 9 janvier 2021 un nouveau variant B1128 ayant eacutemergeacute au Breacutesil a eacutegalement eacuteteacute notifieacute agrave lrsquoOMS Aucun cas drsquoinfection au nouveau variant B1128 nrsquoa eacuteteacute signaleacute agrave ce jour en France Au 13 janvier 2021 66 cas drsquoinfection au variant VOC 20201201 (variant identifieacute au Royaume-Uni) et trois cas drsquoinfection au variant 501YV2 (variant identifieacute en Afrique du Sud) ont eacuteteacute confirmeacutes en France meacutetropolitaine Ces cas ont eacuteteacute recenseacutes dans diffeacuterentes reacutegions de France meacutetropolitaine Il est probable que la diffusion de ces variants sur le territoire national soit actuellement sous-estimeacutee Les reacutesultats preacuteliminaires de lrsquoenquecircte Flash Variant meneacutee les 7 et 8 janvier 2021 sur les tests RT-PCR positifs au SARS-CoV-2 montraient que les cas de COVID-19 lieacutes au variant VOC 20201201 pourraient repreacutesenter 1 agrave 2 des cas actuellement recenseacutes en France Ces cas de COVID-19 lieacutes au variant du Royaume-Uni semblent reacutepartis de maniegravere heacuteteacuterogegravene sur le territoire de France meacutetropolitaine mais cette analyse doit rester prudente du fait drsquoune participation variable des laboratoires selon les reacutegions et dans lattente des reacutesultats des analyses de seacutequenccedilage en cours

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Agrave ce jour il nrsquoy a pas drsquoeacuteleacutement en faveur drsquoune plus grande seacuteveacuteriteacute des cas induits par ce variant Cependant il se distingue des virus circulants par une capaciteacute de diffusion plus importante Les travaux meneacutes en Angleterre ont conclu agrave une transmissibiliteacute augmenteacutee de plus de 50 voire de 75 par rapport aux souches circulant actuellement Des travaux de modeacutelisation sont en cours afin drsquoestimer lrsquoimpact sur la dynamique eacutepideacutemique de la diffusion probable de ce variant en France dans les prochaines semaines Le renforcement de la surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 qui associe Santeacute publique France le CNR et plusieurs laboratoires feacutedeacutereacutes au sein de lrsquoANRS Maladies Infectieuses Eacutemergentes associeacutes aux travaux de modeacutelisation permettront de guider les deacutecisions concernant la neacutecessiteacute drsquoun renforcement des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie

Preacutevention

Les derniegraveres donneacutees concernant lrsquoadoption des mesures de preacutevention et santeacute mentale issues de la vague 19 (14-16 deacutecembre 2020) de lrsquoenquecircte CoviPrev ont eacuteteacute publieacutees dans le Point eacutepideacutemiologique du 24 deacutecembre 2020 La campagne de vaccination a deacutebuteacute le 27 deacutecembre 2020 et srsquoest intensifieacutee depuis le 04 janvier 2021 Elle a viseacute dans un premier temps essentiellement les reacutesidents en EHPAD et certains professionnels de ces eacutetablissements Un eacutelargissement des cibles vaccinales est en cours ainsi qursquoun deacuteploiement des vaccins dans lrsquoensemble des reacutegions afin drsquoaugmenter la couverture vaccinale de la population-cible Lrsquoacceacuteleacuteration de la vaccination est primordiale pour faire face agrave lrsquoaugmentation de la circulation du SARS-CoV-2 et agrave la preacutesence sur le territoire national de variants eacutemergents qui preacutesentent une contagiositeacute supeacuterieure aux variants actuellement majoritaires Dans lrsquoattente des indicateurs qui seront fondeacutes sur le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid et drsquoapregraves les donneacutees transmises par les Agences reacutegionales de Santeacute (ARS) 247 166 personnes avaient eacuteteacute vaccineacutees contre la COVID-19 en France au 13 janvier 2021

Pour en savoir + - sur la vaccination Vaccination Info Service - sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

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SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraves hellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution les comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 61

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 Situation au 14 janvier 2021 p 62

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Delphine Viriot Christine Campegravese Nelly Fournet Nicolas Meacutethy Judith Benrekassa Didier Che Systegravemes de surveillance Fatima Aiumlt El Belghiti Denise Antona Jonathan Bastard Ghaya Ben Hmidene Anne Berger-Carbonne Clara Blondel Christophe Bonaldi Isabelle Bonmarin Mathias Bruyand Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Meacutelanie Colomb-Cotinat Kostas Danis Julien Durand Myriam Fayad Julie Figoni Laure Fonteneau Ceacutecile Forgeot Camille Fortas Anne Fouillet Scarlett Georges Katia Hamdad Imene Horrigue Yu Jin Jung Edith Laurent Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Isabelle Poujol Alexandra Septfons Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Pierre-Etienne Toulemonde Sophie Vaux Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

14 janvier 2021

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