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Volume 4, Numéro 1 1
Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique - AOÛT 2018 -
TABLE DES MATIERES
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MOT DU DIRECTEUR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
LES GROS DOSSIERS : C’est la rentrée! . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
NOUVELLES DU MOIS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3
LE RAYONNEMENT DES MEMBRES DU DEPARTEMENT . . . . . . . . . . . . 6
CONGRÈS À VENIR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9
ARTICLES PUBLIES PAR LES EQUIPES DU DEPARTEMENT . . . . . . . . . .11
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MOT DU DIRECTEUR
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LES GROS DOSSIERS!
C’est la rentrée! La rentrée à l’Université Laval: une semaine bien chargée! Avec 50 000 étudiants qui commencent leurs cours le 4 septembre prochain, la rentrée à l’Université Laval, ce n’est pas une petite affaire. Outre les activités d’intégration des nouveaux étudiants organisées par l'Association des étudiant(e)s en biochimie, microbiologie et bio-informatique de l'Université Laval (AEBBMUL) (groupe Facebook pour l’intégration, page Facebook de l’AEBBMUL), l’université organise aussi des activités. Pour plus de détails, cliquez ici. Message pour tous les étudiants utilisateurs du RTC
N’oubliez pas d’aller faire encoder votre abonnement sur votre Carte OPUS. Vous pouvez toujours le faire à la rentrée UL, mais soyez conscients qu’il y a beaucoup d’étudiants qui ont la même idée que vous. Faites-le avant la rentrée, vous allez économiser énormément
de temps. Ce conseil vous est offert par des étudiants du département qui ont perdu beaucoup de temps à faire la file par le passé! Plus d’info ici. Le Centre d’aide: une ressource des plus utiles. Même si nous ne sommes qu’à l’orée de la session, il est important de se souvenir que l’Université Laval propose aux étudiants tout un ensemble de ressources pour leur réussite scolaire. « Le Centre d’aide aux étudiants offre des services de soutien et de consultation aux étudiantes et aux étudiants en matière d’orientation, de réussite scolaire, de bien-être psychologique et de situations de handicap. Attentif au devenir des étudiantes et des étudiants de l’Université Laval, il participe activement à la mise en place de conditions favorables à la persévérance et à la réussite de ces derniers dans leur cheminement à l’université en favorisant leur épanouissement personnel et scolaire. »
NOUVELLES DU MOIS
Sylvain: Officier de l’Ordre du Canada! Le 5 juillet dernier à Québec, Sylvain Moineau a reçu son titre d'Officier de l'Ordre du Canada des mains de la Gouverneure Générale du Canada, Julie Payette. De l'aveu même de Sylvain, ce fut une journée extraordinaire! Félicitations encore une fois, Sylvain, pour ton travail exceptionnel qui te permet d'obtenir ce prestigieux titre. Cette reconnaissance souligne la passion et l’esprit de collaboration de Sylvain qui ont mené à de précieuses avancées scientifiques dans son domaine. Sylvain est un spécialiste de renommée mondiale des bactériophages. Il est d’ailleurs le conservateur de la plus grande collection de ces virus au monde.
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Crédit photo: Crédit photo: Sgt Johanie Maheu, Rideau Hall © BSGG, 2018
Nos diplômés 2018! Voici une partie des diplômés 2018 du département accompagnés de plusieurs de leurs enseignants. Cette photo a été prise lors de l’événement départemental qui s’est tenu avant la majestueuse collation des grades en juin dernier. Cet événement a permis à la famille et aux amis de nos diplômés de faire connaissance avec les membres du département. L’événement fut un réel succès! Bravo encore à tous nos diplômés!
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L’équipe iGEM ULaval
L'équipe iGEM-ULaval va participer en octobre prochain à la plus grosse compétition de biologie synthétique au monde : Le Jamboree iGEM. Leurs travaux de recherche progressent bien. Nous vous invitons à suivre les aventures de l'équipe iGEM ULaval via leur page Facebook!
Notez que pour participer à l'événement de cet automne à Boston, l'équipe doit amasser encore beaucoup d’argent pour payer pour l’inscription et le voyage des participants. Vous pouvez les encourager via leur campagne gofundme.
Les microbes et vous: bientôt une version pour tous! Le département a obtenu une subvention du programme d’appui au développement d’activités de formation continue 2018-2019 de la Direction de la formation continue pour créer des modules de formation continue grand public à partir du cours « Les microbes et vous » offert depuis l’hiver dernier à la communauté universitaire. Vous pouvez voir la vidéo promotionnelle du cours en cliquant ici.
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Adieu Yvette C'est avec tristesse que nous avons appris le décès de Madame Yvette Desrochers, ancienne employée au département jusqu'à sa retraite en 2008. Nous présentons nos plus sincères condoléances à la famille, aux amis et aux anciens collègues de Yvette. Message aux étudiants de 2e et 3e cycles et à leur superviseur Le Guide de l'étudiante et de l'étudiant (version PDF) a été mis à jour. Vous pourrez le consulter à partir de l'intranet de notre site Web sous l'onglet "Étudiants inscrits à la maîtrise et au doctorat".
LE RAYONNEMENT DES MEMBRES DU DEPARTEMENT AU COURS DES
DERNIERES SEMAINES
Caroline Duchaine reconnue par l’IUCPQ Caroline Duchaine s'est vu décerner le prix Recherche pour son travail exceptionnel dans le domaine de l'aérobiologie de la part de l'Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec (IUCPQ). Ces honneurs sont totalement mérités! Le Dr Denis Richard, directeur du Centre de recherche de l'IUCPQ, en a profité pour souligner sa rigueur et sa productivité remarquable qui, couplées à sa renommée internationale, font d'elle une ambassadrice extraordinaire du Centre. Sur la photo, M. Denis Bouchard, président-directeur général de l'Institut, est en compagnie de Mme Caroline Duchaine.
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Daniel Grenier: un prix pour sa prolifique carrière Félicitations à Daniel Grenier, professeur associé au département, qui a reçu le Prix Micheline-Blain du Réseau de recherche en santé buccodentaire et osseuse (RSBO) pour l’ensemble de sa carrière. Voir les détails ici.
Subvention majeure pour Christian Landry Christian Landry a décroché une subvention Fondation des Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC) de 2.1M$ sur 7 ans pour faire de la biologie synthétique et de la biologie des systèmes! Bravo Christian pour ton succès à ce concours hyper compétitif !
Alice au tableau d’honneur
Bravo à Alice Lévesque qui verra son nom sur le Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales pour l’année 2018 puisqu'elle a obtenu à l'unanimité des membres du jury des notes excellentes pour son mémoire. P.S. Sur la photo, Alice est habillée pour affronter la horde d'insectes piqueurs du Grand Nord!
Un billet vers les geysers pour Myriam Labbé Myriam Labbé, étudiante dans l'équipe d'Alexander Culley, ira présenter ses travaux en Islande au Arctic Circle Assembly 2018 (19 au 21 octobre 2018) en étant l'une des gagnantes du concours "Mon projet nordique" du FRQNT!
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Deux étudiantes s’illustrent aux Journées de la recherche en santé 2018 Marie-Stéphanie Fradette et Nadine Morin ont remporté un prix de l'excellence de la communication scientifique, volet affiche 1er et 2e cycle lors des Journées de la recherche en santé 2018 qui ont eu lieu les 23 et 24 mai dernier.
Une bourse de leadership pour François Rouleau
François Rouleau, étudiant à la maîtrise dans le laboratoire de Christian Landry, a reçu une Bourse de leadership et développement durable (PBLDD) de l’Université Laval. Cette bourse soutient les étudiants talentueux démontant des réalisations exceptionnelles dans l’un des six secteurs d’activité suivants : artistique, entrepreneurial, environnemental, scientifique, social/humanitaire ou sportif.
Parmi les gagnants lors des journées scientifiques de l’IUCPQ Félicitations à Hamza M’Bareche et Karine Duquette-Lozeau, étudiants gradués dans l’équipe de Caroline Duchaine ainsi qu’à William Harvey, stagiaire de l’équipe de Steve Charette. Ils ont tous remporté un prix (2e position) pour la présentation de leurs affiches lors de la 28e édition des journées scientifiques de l’Institut universitaire en cardiologie et pneumologie de Québec (IUCPQ).
Marie-Laurence doublement reconnue! Bravo à Marie-Laurence Lemay, étudiante au doctorat dans l'équipe de Sylvain Moineau, qui en plus de recevoir le 2018 CSM Graduate Ambassador Award de la Société canadienne des microbiologistes a aussi remporté un prix pour sa présentation par affiche lors du congrès de la CSM tenu récemment à Winnipeg!
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Un prix de la CSM pour Rachel
Rachel Morin-Pelchat du laboratoire de Sylvain Moineau s'est vu accorder le "CSM Undergraduate Award" pour l'année 2018 par la Société canadienne des microbiologistes.
Un prix pour Émilie Félicitations à Émilie Tremblay, étudiante au doctorat en microbiologie et dirigée par Guillaume Bilodeau professeur associé au département. Émilie a remporté la bourse d’études de la Société de protection des plantes du Québec (SPPQ) lors de la rencontre annuelle de la SPPQ et de la SCP (Société Canadienne de Phytopathologie) à Québec. La SPPQ décerne annuellement une bourse pour encourager les étudiantes et les étudiants à poursuivre des études graduées dans le domaine de la protection des végétaux. Nicolas et Françoise performent à la journée des stagiaires du GREB Nicolas Lemire et Françoise Bourque-Leblanc, étudiants du département et stagiaires
dans l’équipe de Sylvain Moineau, se sont illustrés lors de la Journée des stagiaires du Groupe de recherche en écologie buccale (GREB)! Plus d’info ici.
CONGRÈS À VENIR
7e Journée de la recherche en sciences et génie Étudiants des cycles supérieurs, vous avez jusqu’au 24 août 2018 pour soumettre vos propositions d’affiche ou de présentation orale pour la 7e Journée de la recherche en sciences et génie du 21 septembre prochain, au pavillon Alexandre-Vachon. Plus de détails sur Facebook.
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BÉNÉFIQ, où la RECHERCHE et l’INDUSTRIE s’allient pour la SANTÉ Le rendez-vous international sur les ingrédients et aliments santé se tiendra du 2 au 4 octobre 2018, au Centre des congrès de Québec au Canada.
CRISPR 2019 Sylvain Moineau et son équipe en collaboration avec des scientifiques de Toronto organiseront le congrès international 2019 qui rassemblera l'ensemble de la communauté CRISPR! Ce sera un événement majeur!
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ARTICLES PUBLIES PAR LES DIFFERENTES EQUIPES DE RECHERCHE DU
DEPARTEMENT Voici la liste des articles publiés par les professeurs réguliers et associés au département pour la période allant du 1er mai au 31 juillet 2018. Si une de vos publications n’apparaît pas dans la liste ci-dessous, merci de nous le signaler et nous la présenterons dans la prochaine publication de l’Infolettre. 1: Hynes AP, Rousseau GM, Agudelo D, Goulet A, Amigues B, Loehr J, Romero DA, Fremaux C, Horvath P, Doyon Y, Cambillau C, Moineau S. Widespread anti-CRISPR proteins in virulent bacteriophages inhibit a range of Cas9 proteins. Nat Commun. 2018 Jul 25;9(1):2919. 2: Groulx N, Urch B, Duchaine C, Mubareka S, Scott JA. The Pollution Particulate Concentrator (PoPCon): A platform to investigate the effects of particulate air pollutants on viral infectivity. Sci Total Environ. 2018 Jul 1;628-629:1101-1107. 3: Chiu CC, Keeling CI, Bohlmann J. Cytochromes P450 Preferentially Expressed in Antennae of the Mountain Pine Beetle. J Chem Ecol. 2018 Jul 25. 4: Mazon M, Larouche V, St-Louis M, Schindler D, Carreau M. Elevated blood levels of Dickkopf-1 are associated with acute infections. Immun Inflamm Dis. 2018 Jul 20. 5: Vincent AT, Charette SJ. Completion of genome of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida 01-B526 reveals how sequencing technologies can influence sequence quality and result interpretations. New Microbes New Infect. 2018 May 31;25:24-26. 6: Picq S, Lumley L, Šíchová J, Laroche J, Pouliot E, Brunet BMT, Levesque RC, Sperling FAH, Marec F, Cusson M. Insights into the Structure of the Spruce Budworm (Choristoneura fumiferana) Genome, as Revealed by Molecular Cytogenetic Analyses and a High-Density Linkage Map. G3 (Bethesda). 2018 Jul 31;8(8):2539-2549. 7: Zhang HH, Zhou QZ, Wang PL, Xiong XM, Luchetti A, Raoult D, Levasseur A, Santini S, Abergel C, Legendre M, Drezen JM, Béliveau C, Cusson M, Jiang SH, Bao HO, Sun C, Bureau TE, Cheng PF, Han MJ, Zhang Z, Zhang XG, Dai FY. Unexpected invasion of miniature inverted-repeat transposable elements in viral genomes. Mob DNA. 2018 Jun 18;9:19. 8: Néron S, Fournier D, Cloutier M, Laganière J, Thibault L, Simard C. Unraveling the effects of an oxygen shock on cord blood units. Blood Cells Mol Dis. 2018 Jun 20. pii: S1079-9796(18)30213-4. 9: Gagné-Thivierge C, Barbeau J, Levesque RC, Charette SJ. A new approach to study attached biofilms and floating communities from Pseudomonas aeruginosa strains of various origins reveals diverse effects of divalent ions. FEMS Microbiol Lett. 2018 Jul 1;365(14). 10: Mbareche H, Veillette M, Dubuis MÈ, Bakhiyi B, Marchand G, Zayed J, Lavoie J, Bilodeau GJ, Duchaine C. Fungal bioaerosols in biomethanization facilities. J Air Waste Manag Assoc. 2018 Jun 25. 11: Wang Y, Wang Y, Sun L, Grenier D, Yi L. The LuxS/AI-2 system of Streptococcus suis. Appl Microbiol Biotechnol. 2018 Jun 25.
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12: Wang Y, Yi L, Sun LY, Liu YC, Wen WY, Li XK, Mei JJ, Ding K, Wu TC, Grenier D. Identification and characterization of a Streptococcus suis immunogenic ornithine carbamoytransferase involved in bacterial adherence. J Microbiol Immunol Infect. 2018 Jun 13. pii: S1684-1182(18)30156-7. 13: Ngazoa-Kakou S, Philippe C, Tremblay DM, Loignon S, Koudou A, Abole A, Ngolo Coulibaly D, Kan Kouassi S, Kouamé Sina M, Aoussi S, Dosso M, Moineau S. Complete Genome Sequence of Ebrios, a Novel T7virus Isolated from the Ebrie Lagoon in Abidjan, Côte d'Ivoire. Genome Announc. 2018 Jun 21;6(25). pii: e00280-18. 14: Tremblay ED, Duceppe MO, Berube JA, Kimoto T, Lemieux C, Bilodeau GJ. Screening for exotic forest pathogens to increase survey capacity using metagenomics. Phytopathology. 2018 Jun 20. 15: LeBel G, Vaillancourt K, Yi L, Gottschalk M, Grenier D. Dipeptidylpeptidase IV of Streptococcus suis degrades the porcine antimicrobial peptide PR-39 and neutralizes its biological properties. Microb Pathog. 2018 Jun 15. pii: S0882-4010(17)31471-7. 16: Bengtsson-Palme J, Richardson RT, Meola M, Wurzbacher C, Tremblay ÉD, Thorell K, Kanger K, Eriksson KM, Bilodeau GJ, Johnson RM, Hartmann M, Henrik Nilsson R. Metaxa2 Database Builder: Enabling taxonomic identification from metagenomic or metabarcoding data using any genetic marker. Bioinformatics. 2018 Jun 15. 17: Dionne U, Chartier FJM, López de Los Santos Y, Lavoie N, Bernard DN, Banerjee SL, Otis F, Jacquet K, Tremblay MG, Jain M, Bourassa S, Gish GD, Gagné JP, Poirier GG, Laprise P, Voyer N, Landry CR, Doucet N, Bisson N. Direct Phosphorylation of SRC Homology 3 Domains by Tyrosine Kinase Receptors Disassembles Ligand-Induced Signaling Networks. Mol Cell. 2018 Jun 21;70(6):995-1007.e11. 18: Roy B, Philippe C, Loessner MJ, Goulet J, Moineau S. Production of Bacteriophages by Listeria Cells Entrapped in Organic Polymers. Viruses. 2018 Jun 13;10(6). pii: E324. 19: Mottawea W, Duceppe MO, Dupras AA, Usongo V, Jeukens J, Freschi L, Emond-Rheault JG, Hamel J, Kukavica-Ibrulj I, Boyle B, Gill A, Burnett E, Franz E, Arya G, Weadge JT, Gruenheid S, Wiedmann M, Huang H, Daigle F, Moineau S, Bekal S, Levesque RC, Goodridge LD, Ogunremi D. Salmonella enterica Prophage Sequence Profiles Reflect Genome Diversity and Can Be Used for High Discrimination Subtyping. Front Microbiol. 2018 May 4;9:836. 20: Brisebois E, Veillette M, Dion-Dupont V, Lavoie J, Corbeil J, Culley A, Duchaine C. Human viral pathogens are pervasive in wastewater treatment center aerosols. J Environ Sci (China). 2018 May;67:45-53. 21: Listyarifah D, Nieminen MT, Mäkinen LK, Haglund C, Grenier D, Häyry V, Nordström D, Hernandez M, Yucel-Lindberg T, Tervahartiala T, Ainola M, Sorsa T, Hagström J. Treponema denticola chymotrypsin-like proteinase is present in early-stage mobile tongue squamous cell carcinoma and related to the clinicopathological features. J Oral Pathol Med. 2018 May 10. 22: Lagha AB, Groeger S, Meyle J, Grenier D. Green tea polyphenols enhance gingival keratinocyte integrity and protect against invasion by Porphyromonas gingivalis. Pathog Dis. 2018 Jun 1;76(4). 23: Vincent AT, Charette SJ, Barbeau J. Unexpected diversity in the mobilome of a Pseudomonas aeruginosa strain isolated from a dental unit waterline revealed by SMRT Sequencing. Genome. 2018 May;61(5):359-365.
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24: Wolters JF, Charron G, Gaspary A, Landry CR, Fiumera AC, Fiumera HL. Mitochondrial Recombination Reveals Mito-Mito Epistasis in Yeast. Genetics. 2018 May;209(1):307-319. 25: Fagua G, Condamine FL, Brunet BMT, Clamens AL, Laroche J, Levesque RC, Cusson M, Sperling FAH. Convergent herbivory on conifers by Choristoneura moths after boreal forest formation. Mol Phylogenet Evol. 2018 Jun;123:35-43. 26: Haas B, Grenier D. Understanding the virulence of Streptococcus suis: A veterinary, medical, and economic challenge. Med Mal Infect. 2018 May;48(3):159-166.
