Doctorante: Kieu Oanh NGUYENDirecteur de Thèse: Pr. Dr. Eric GONTIER

Co-directeur de Thèse: Dr. Rebecca DAUWE

Equipe de recherche

« Procédés pour la production de biomolécules » 

BioPI EA3900- Biologie des Plantes et InnovationUPJV, Faculté des Sciences, 33 rue Saint Leu, 80039

Amiens, France

Date de début de Thèse: Mai 2010

Date de soutenance prévue: Mai 2013

Isatis tinctoria L., Brassicaceae

Indirubine

Agrobacterium rhizogenesTuyau d’arrivée d’air

Solution nutritive

GC-MS et GC-MS et LC-MSLC-MS

La métabolomique: une vision globale des métabolites présents dans la plante…

Analyse du métabolome: révéler des changements métaboliques globaux après l’application d’un traitement

Etude de la bibliographie (base en place, maintien à jour et approfondissement)

Analyses GC-MS et LC-MS sur des extraits de graines et de fruits d’Isatis tinctoria pour caractériser la valeur potentielle des huiles dans les graines.

Même démarche suivie pour les feuilles et les racines de la plante: caractériser « tous » les métabolites présents dans chaque partie de la plante (.

Cultures hydroponiques mises en place pour étudier l’influence de souches bactériennes (Agrobacterium rhizogenes ) sur: la croissance de plantes// augmentation de la vitesse de croissance,

plus de biomasse produite par unité de temps. la biosynthèse des métabolites secondaires et primaires //

approche métabolomique utilisant XC-MS sous la langue R.

Etat d’avancement

XC-MS profiling Extraction des méabolites (et dérivatisation). Chromatographie (GC, LC) couplée à la spectrométrie de masse (MS). Intégration des pics (caractérisés par un temps de rétention RT et un m/z). Analyses statistiques par XC-MS sous la langue R. Identification des pics: AMDIS (Automated Mass spectral Deconvolution

and Identification System) + NIST (libraires: Golm, BioPI – 56 métabolites)

Par GC-MS, 132 métabolites ont été étiquetés dans les feuilles et les racines d’Isatis tinctoria L.:

Etiquetés par groupe : 81 Acide aminés : 23 Sucres : 16 (not identified) Acides organiques : 16 Glucosinolates : 12 (not identified) Autres : 14

Autres composés étiquetés non identifiés : 51

Pour la suite: Continuer à compléter nos résultats de GC-MS et LC-MS. Réaliser des cultures hydroponiques stériles pour l’étude de

l’interaction plante-microorganismes. Tests d’activité anti-microbien de l’extrait de feuilles et de

racines d’Isatis tinctoria.

Difficultés rencontrées Le manque de standards spécifiques engendre une difficulté

pour l’identification des molécules.

Résultats attendus Evaluation du potentiel d’ Isatis tinctoria pour la

production de métabolistes d’intérêt pharmaceutique à partir de cultures hors-sol.

Des publications sur les travaux de thèse.