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jean-paul-nguessan
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Ecologie microbienneCES Bactriologie-Virologie Bactriologie-
Professeur Moussa Fafa Ciss Mdecin Biologiste Facult de Mdecine Dakar
Introduction
cologie
Dfinition de lcologieScience qui tudie conditions dexistence Dun tre vivant Et les rapports qui stablissent Entre cet tre et son environnement
Domaines de lcologie
cologie microbienne cologie culturelle Etc. etc.
Subdivisions de lcologie
Auto cologie : une seule espce/milieu Syncologie : plusieurs espces / milieu Dynamique des populations Modifications et causes de labondance Des espces dans un mme milieu.
cologie applique
Maintien des quilibres biologiques Conservation de la nature Protection des faunes et flores Survie du milieu naturel
cosystme
Dfinition de lcosystme
Ensemble cologique Entre un milieu (sol, eau ) Et des tres vivants Entre lesquels existent des relations nergtiques, trophiques ...
Exemples dcosystme
Lacs Ocans Rivires Forts
Chane alimentaire
Limites de la chane Au dpart : le plancton ou les algues Au bout : les espces carnivores Plancton
Ensemble des tres vivants de petite
taille ou microscopiques
Entrans par les eaux marines/douces
cologie microbienne des ocans
Composition du plancton marin
Bactries Pseudomonas, Acinetobacter Achromobacter, Cytophaga, Flavobacterium, Vibrio, Cellvibrio Bacillus, Clostridium Algue, champignon, levure, protozoaire
Types de plancton
Phytoplancton: algues prdominent Zooplancton: protozoaires prdominent
Exploitation des ocans
Domaines dexploitation biologique Halieutique Aquaculture, conchyliculture Bioconversion des algues Extraction mtaux lourds : or, uranium Fertilit ocan: capacit produire plancton
cologie microbienne eaux douces
Bactries
Consomment les matires organiques Servent daliments aux protozoaires Protozoaires servent daliments aux vairons et aux petits poissons Homme est en bout de chane
Algues
Colonisent les eaux de surface Assurent la photosynthse Assimilent les sels minraux Nourrissent protozoaires et poissons
quilibre biologique naturel
Base = processus de minralisation Micro-organismes spcialiss Micro Algues photosynthtiques Autopuration: paramtres Charge de pollution Nombre/type mtabolique des germes Taux doxygne
Flore de lautopuration
Fixe sur des supports Vgtaux, animaux : pipsamnique Lit, berges de la rivire : pibenthique Couche limoneuse profonde: benthique Libre et en suspension dans eau : campagnes Champs cultivs > reste campagne Surface eaux pollues > fond de leau Saison chaude > autres saisons Habitations, hpitaux, usines
Grands cycles biologiques
Introduction
Cycle de la matire vivante
Dfinition ensemble des transformations chimiques cycliques qui intressent tous les composants de la matire vivante Composants de la matire vivante Composs carbon, soufr, phosphor Substances azotes
Biosphre
Dfinition partie de la plante o seffectue le cycle de la matire Composition
Ocans Continents (sol) Partie infrieure de latmosphre
Cycle de loxygne
PhotosynthseElle a lieu chez Plantes Certaines bactries Processus : CO2 + H2O
CH2O + O2
Respiration arobieElle a lieu chez Bactries Autres Processus : CH2O + O2 CO2 + H2O
Cycle du carbone
Principales bactries
Pseudomonas Bacillus Actinomyctes Bactries cellulolytiques (Cytophaga) Bactries pectinolytiques Bactries dnitrifiantes
Consquences
Formation de lhumus Fertilisation des sols
Cycle du soufre
Figure 3. The Sulfur Cycle
Assimilation des sulfates
Assimilation par les plantes Assimilation par les animaux Assimilation par les bactries
Rduction des sulfates
Formation groupements sulfhydriques Incorpors dans acides amins soufrs Formation composs organiques soufrs
Dcomposition des composs organiques
Sources: animaux et vgtaux morts Cause : micro-organismes microFormation dhydrogne sulfur Dgagement dune odeur nausabonde Exemples : gouts, eaux stagnantes
Oxydation = fin cycle soufre
MicroMicro-organismes responsables Thiobacillus thiooxydans Anarobies soufrs pourpres, vertes H2S est reconverti en sulfates Lieu de la reconversion : biosphre
Cycle de lazote
Bactries concernes
Bactries nitrificatrices Nitrosomonas Nitrobacter Bactries dnitrificatrices Thiobacillus denitrificans Pseudomonas, Achromobacter Enterobacteriaceae
Symbiose bactrie-plante bactrie-
Bactrie : Rhizobium Plantes : lgumineuses Sassocient pour synthtiser lazote
Production dammoniac
Sources: composs azots organiques Animaux morts Vgtaux morts Excrtion directe par les animaux Ammoniac Ure Acide urique
Production de nitrates
Processus = oxydation Ammoniac nitrites (Nitrosomonas) Nitrites nitrates (Nitrobacter) Source de nitrates = ammoniac
But: restituer azote minral aux plantes
Production dazote molculaire
Source dazote = nitrates Mcanisme: dnitrification des nitrates Obtention de lazote molculaire
Destine de lazote molculaire
Atmosphre Plantes vertes (synthse protique) Nodosits des racines des plantes
Destine azote dans cellule
Acide glutamique Acide aspartique Protines Acides nucliques
cologie dun lac stratifi
Figure 4. Ecology of a Stratified lake
Merci