Formation SIG-SantéFormation SIG-Santé

Marc SourisMarc Souris

Master Géographie de la SantéMaster Géographie de la Santé

Paris X. NanterreParis X. Nanterre

Laboratoire de Cartographie Appliquée Laboratoire de Cartographie Appliquée

IRD - BondyIRD - Bondy

SIG et Santé : exemplesSIG et Santé : exemples

Des gènes aux SIG : un ensemble de Des gènes aux SIG : un ensemble de techniques pour étudier les maladiestechniques pour étudier les maladies

SérologieSérologieCaractérisation des Caractérisation des VirusVirus

SéquençageSéquençageTCAATATGC TCAATATGC TCAATATGC

TCAATATGC TCAATATGC TCAATATGC

TCAATATGC TCAATATGC TCAATATGC

TCAATATGC

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TélédétectionTélédétection

SIG et bases de données spatialesSIG et bases de données spatiales

PCRPCR

Isolation des Isolation des virusvirus

CollecteCollecte

CaptureCapture

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

SIG, télédétectionSIG, télédétection :: données et méthodes pour la géographie et données et méthodes pour la géographie et l’environnement, avec de nouvelles techniques en sciences spatiales, l’environnement, avec de nouvelles techniques en sciences spatiales, en bases de données, en informatique, en statistiquesen bases de données, en informatique, en statistiques

Un objectif majeurUn objectif majeur :: mettre en évidence les facteurs de risques et les mettre en évidence les facteurs de risques et les processus d’émergence et de diffusion des maladies, de manière à processus d’émergence et de diffusion des maladies, de manière à comprendre les mécanismes pour contrôler et réduire le risque comprendre les mécanismes pour contrôler et réduire le risque d’infectiond’infection

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

De grands axes d’applicationDe grands axes d’application ::

► La géographie de la santé et l’étude des relations société-santéLa géographie de la santé et l’étude des relations société-santé

► L’épidémiologie spatiale et les rapports santé-environnement, l’étude L’épidémiologie spatiale et les rapports santé-environnement, l’étude des facteurs de risque et de vulnérabilité (analyse statistique, analyse des facteurs de risque et de vulnérabilité (analyse statistique, analyse spatiale et géostatistique, analyse spatio-temporelle)spatiale et géostatistique, analyse spatio-temporelle)

► La mise en évidence et la modélisation des évolutions spatio-La mise en évidence et la modélisation des évolutions spatio-temporelles des phénomènes de santé (émergences, processus de temporelles des phénomènes de santé (émergences, processus de diffusion, endémies, épidémies)diffusion, endémies, épidémies)

► La préparation et l’évaluation des sondages sur bases spatialesLa préparation et l’évaluation des sondages sur bases spatiales

► L’optimisation des ressources médicales et l’aménagement du L’optimisation des ressources médicales et l’aménagement du territoireterritoire

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Epidémiologie et SIG : une démarche éprouvéeEpidémiologie et SIG : une démarche éprouvée

► La cartographie des données épidémiologiques (cas, incidences, La cartographie des données épidémiologiques (cas, incidences, prévalences), à différentes échelles de temps et d’espaceprévalences), à différentes échelles de temps et d’espace

► La cartographie de facteurs de risques supposésLa cartographie de facteurs de risques supposés

► L’analyse statistique et géostatique pour la recherche de facteurs de L’analyse statistique et géostatique pour la recherche de facteurs de risquesrisques

► L’analyse des processus spatio-temporelL’analyse des processus spatio-temporel

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Exemple de maladie émergente ou ré-émergente : la fièvre DengueExemple de maladie émergente ou ré-émergente : la fièvre Dengue

► Maladie virale (4 différents virus induisant 4 sérotypes)Maladie virale (4 différents virus induisant 4 sérotypes)

► Maladie transmise par des moustiques (Maladie transmise par des moustiques (Aedes Aegyptii, Aedes Aedes Aegyptii, Aedes AlbopictusAlbopictus) adaptés aux humains et aux environnements urbains) adaptés aux humains et aux environnements urbains

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Exemple de maladie émergente ou ré-émergente : la fièvre DengueExemple de maladie émergente ou ré-émergente : la fièvre Dengue

► Maladie tropicaleMaladie tropicale

► Pas de vaccin disponiblePas de vaccin disponible

► La lutte anti-moustique est actuellement le seul moyen de lutteLa lutte anti-moustique est actuellement le seul moyen de lutte

Distribution de la dengue dans le monde. Distribution de la dengue dans le monde. CDC, 2005CDC, 2005

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Fièvre Dengue : facteurs environnementaux de l’émergenceFièvre Dengue : facteurs environnementaux de l’émergence

► Température et pluieTempérature et pluie

► Urbanisation et usage du solUrbanisation et usage du sol

► Conditions démographiques et sero-prévalence des populationsConditions démographiques et sero-prévalence des populations

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Exemple de maladie émergente : l’influenza aviaireExemple de maladie émergente : l’influenza aviaire

► Maladie virale (virus H5N1)Maladie virale (virus H5N1)

► Mortalité très élevée chez les poulets et certains oiseauxMortalité très élevée chez les poulets et certains oiseaux

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

Facteurs d’émergences et de diffusion de l’influenza aviaire en Asie, Facteurs d’émergences et de diffusion de l’influenza aviaire en Asie, toujours inconnustoujours inconnus► Climat ?Climat ?

► Réseau de transport (transport de volaille) ? Pratiques agricoles ?Réseau de transport (transport de volaille) ? Pratiques agricoles ?

► Zones lacustres (aires de repos pour les oiseaux migrateurs) ?Zones lacustres (aires de repos pour les oiseaux migrateurs) ?

Les SIG dans le domaine de la santéLes SIG dans le domaine de la santé

► Analyser les relations santé-environnement, pour comprendre les conditions Analyser les relations santé-environnement, pour comprendre les conditions d’émergence et de diffusion des maladies afin d’adapter une réponse sanitaire d’émergence et de diffusion des maladies afin d’adapter une réponse sanitaire adéquate (lutte contre les vecteurs, éducation des populations, changement adéquate (lutte contre les vecteurs, éducation des populations, changement de pratiques sociétales…)de pratiques sociétales…)

► Analyser les systèmes de surveillance et de lutte sanitaire (contrôles, Analyser les systèmes de surveillance et de lutte sanitaire (contrôles, confinements, restrictions de déplacements, abattages d’animaux, etc…)confinements, restrictions de déplacements, abattages d’animaux, etc…)

► Adapter le système de soin et de secours aux effectifs de populationAdapter le système de soin et de secours aux effectifs de population

► Améliorer la signalisation et la gestion du trafic routierAméliorer la signalisation et la gestion du trafic routier

► Mise en place de systèmes d’alerte rapide à partir de déclarations Mise en place de systèmes d’alerte rapide à partir de déclarations spatialisées en temps réelspatialisées en temps réel

Les SIG sont aussi des outils d’aide à la décisionLes SIG sont aussi des outils d’aide à la décision

Exemples de domaines d’applicationExemples de domaines d’application : :

Les principales sources d’informationLes principales sources d’information

► Déterminants de l’état de santéDéterminants de l’état de santé, au niveau individuel ou agrégé, émanant de , au niveau individuel ou agrégé, émanant de différents organismes publics (ministère de la santé, hôpitaux, bureau des différents organismes publics (ministère de la santé, hôpitaux, bureau des statistiques, direction des recensements, office de météorologie, chambre statistiques, direction des recensements, office de météorologie, chambre d’agriculture…)d’agriculture…)

► Données environnementalesDonnées environnementales sur les facteurs de risques supposés sur les facteurs de risques supposés

Pollution de l’air, qualité de l’eau, nuisances sonoresPollution de l’air, qualité de l’eau, nuisances sonores ClimatClimat Activités économiquesActivités économiques Environnement urbain, usage du sol, cadastreEnvironnement urbain, usage du sol, cadastre

► Relevés et mesures de terrainRelevés et mesures de terrain (observation, inventaire, capture, (observation, inventaire, capture, prélèvement…) prélèvement…)

► Interprétation d’Interprétation d’images satellitairesimages satellitaires, de , de photos aériennesphotos aériennes

Des mises en garde naturellesDes mises en garde naturelles

► Les phénomènes de santé sont toujours Les phénomènes de santé sont toujours multifactorielsmultifactoriels, et la variabilité , et la variabilité aléatoire d’un caractère particulier est grande. Désagréger spatialement les aléatoire d’un caractère particulier est grande. Désagréger spatialement les données augmente la variabilité aléatoire et diminue la puissance statistiquedonnées augmente la variabilité aléatoire et diminue la puissance statistique

► En épidémiologie, lorsque l’on travaille à partir d’échantillons, il faut s’assurer En épidémiologie, lorsque l’on travaille à partir d’échantillons, il faut s’assurer de leur de leur représentativitéreprésentativité. La représentativité spatiale implique l’utilisation de . La représentativité spatiale implique l’utilisation de méthodes adaptées à l’autocorrélation spatialeméthodes adaptées à l’autocorrélation spatiale

► Attention à l’interprétation des Attention à l’interprétation des agrégatsagrégats de données de données

► Attention à l’adéquation entre la Attention à l’adéquation entre la résolutionrésolution des images satellites et l’ des images satellites et l’échelleéchelle du phénomène étudiédu phénomène étudié

Exemples développés dans le coursExemples développés dans le cours

1. Distribution spatiale et évolution spatio-temporelle de l'incidence de la dengue1. Distribution spatiale et évolution spatio-temporelle de l'incidence de la dengue

Objectif de l'exercice : dresser des cartes du nombre de cas et de taux Objectif de l'exercice : dresser des cartes du nombre de cas et de taux d’incidence annuelle et mensuelle de dengue en Thaïlande par districtd’incidence annuelle et mensuelle de dengue en Thaïlande par district

2.2. Capacité d'hospitalisation par arrondissementCapacité d'hospitalisation par arrondissementObjectif de l'exercice : montrer l’inégale répartition des capacités Objectif de l'exercice : montrer l’inégale répartition des capacités d’hospitalisation dans la ville de Quitod’hospitalisation dans la ville de Quito

3. Détermination du centre de soins le plus proche pour chaque îlot urbain3. Détermination du centre de soins le plus proche pour chaque îlot urbainObjectif de l'exercice : déterminer pour chaque pâté de maisons quel est le Objectif de l'exercice : déterminer pour chaque pâté de maisons quel est le centre de soin le plus proche dans la ville de Quitocentre de soin le plus proche dans la ville de Quito

Géographie de la santéGéographie de la santé

Exemples développés dans le coursExemples développés dans le cours

4. Zones d’intervention des pompiers4. Zones d’intervention des pompiersObjectif de l’exercice : dresser une carte de la couverture des interventions des Objectif de l’exercice : dresser une carte de la couverture des interventions des pompiers dans la ville de Quito en vue d’implanter des nouvelles casernes là où pompiers dans la ville de Quito en vue d’implanter des nouvelles casernes là où elles font le plus défautelles font le plus défaut

5. Pratiques spatiales des patients en affection long durée (ALD)5. Pratiques spatiales des patients en affection long durée (ALD) Objectif de l’exercice : spatialiser les consultations de patients en ALD et les Objectif de l’exercice : spatialiser les consultations de patients en ALD et les représenter sur une carte des flux. représenter sur une carte des flux.

Géographie de la santéGéographie de la santé

Exemples développés dans le coursExemples développés dans le cours

66. . Traitement de données météorologiques en vue d’une étude de corrélation taux Traitement de données météorologiques en vue d’une étude de corrélation taux d’incidence-environnementd’incidence-environnementObjectif de l'exercice : calcul d’une température minimale moyenne par district à Objectif de l'exercice : calcul d’une température minimale moyenne par district à partir des relevés de stations météorologiquespartir des relevés de stations météorologiques

7.7. Création d’un indice environnemental à partir d’une image satelliteCréation d’un indice environnemental à partir d’une image satelliteObjectif de l'exercice : Calculer un indice environnemental (indice de végétation) Objectif de l'exercice : Calculer un indice environnemental (indice de végétation) pour chaque individu d’une enquête cas-témoin. Comparaison des distributions pour chaque individu d’une enquête cas-témoin. Comparaison des distributions statistiques.statistiques.

8. Émergence et diffusion de la grippe aviaire en Thaïlande8. Émergence et diffusion de la grippe aviaire en ThaïlandeObjectif de l'exercice : Se familiariser avec les test de géostatistique ave le but Objectif de l'exercice : Se familiariser avec les test de géostatistique ave le but d’analyser l’émergence et la diffusion de la grippe aviaire.d’analyser l’émergence et la diffusion de la grippe aviaire.

Épidémiologie spatiale et Épidémiologie spatiale et environnementenvironnement

Exemples développés dans le coursExemples développés dans le cours

9. 9. Exposition à un facteur de risque : population affectée par les émanations des Exposition à un facteur de risque : population affectée par les émanations des bus dans la ville de Quitobus dans la ville de QuitoObjectif de l’exercice : évaluation de la population exposée aux plus fort taux de Objectif de l’exercice : évaluation de la population exposée aux plus fort taux de pollution atmosphérique et détermination d’un échantillon pour vérifier si les pollution atmosphérique et détermination d’un échantillon pour vérifier si les troubles respiratoires sont liés à la pollution automobile troubles respiratoires sont liés à la pollution automobile

10. 10. Identification des habitats favorables à certaines espèces d’animaux ou Identification des habitats favorables à certaines espèces d’animaux ou d’insectes transmettant des pathologies à l’homme (moustiques, rats…). d’insectes transmettant des pathologies à l’homme (moustiques, rats…). Représentation de la probabilité de présence d’un animal (moustiques)Représentation de la probabilité de présence d’un animal (moustiques)Objectif des exercices: représenter les zones susceptibles d’être affectées par la Objectif des exercices: représenter les zones susceptibles d’être affectées par la présence d’animaux ou d’insectes vecteurs de maladiesprésence d’animaux ou d’insectes vecteurs de maladies

Facteurs de risqueFacteurs de risque

FinFin Marc Souris, 2010