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Généralités/ Structure
des enzymes
M1/Biochimie Appliquée
Dr. DASSAMIOUR S.
Dr.DASSAMIOUR/Univ-Batna 2
Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Organismes vivants
Bactéries …
Végétaux Animaux
Diverses
réactions :
Impliquant
Enzymes
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Protéines globulaires
PM: 104 à 2.106 Da
Ex : Ribonucléase: 124 AA => 13700 Da
Glutamate DH: 850 AA => 2.106 Da
(complexe multienzymatique).
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Classification structurale
1. Nombres d’unités polypeptidiques
Enzyme Nombre de
polypeptide
Exemple
Monomérique 1 Lysozyme (129
AA)
Oligomérique Plusieurs LDH(4 monomères)
Glutamate DH (8
monomères)
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Classification structurale
2. Homogénéité constitutionnelle
Enzyme Composition
Holoprotéine Protéine seule
Holoenzyme =
Hétéroprotéine
*Apoenzyme (de nature protéique)
+
* Co-facteur (non protéique) :
- coenzyme (organique)
- co-facteur minéral
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Organisations possibles d’une enzyme
Protéine seule
Apoenzyme + Coenzyme
Apoenzyme + cofacteur minéral
Apoenzyme + Coenzyme+ cofacteur
minéral
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Types des cofacteurs
Coenzymes organiques : dérivent de
vitamines ou autres molécules
organiques :
Co-substrat / groupement prosthétique
Cofacteurs ions métalliques: Cu++, Fe++,
Mg++, etc.
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M1 Biochimie appliquée
Exemples d’enzymes à coenzymes
A. Enzymes d’oxydoréduction:
1. Coenzymes nicotiniques (NAD+ et NADP+)
2. Coenzymes flaviniques (FAD et FMN)
3. Coenzymes quinoniques (Ubiquinone (Q10) et
plastoquinone (PQ)).
4. Métalloporphyrines (cytochromes)
5. Acide ascorbique
6. Acide lipoïque
7. Glutathion
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M1 Biochimie appliquée
B. Enzymes de transfert de groupements
et de radicaux:
1. LES COENZYMES DE TRANSPORT DES
RADICAUX MONOCARBONES:
1.1. COENZYME DE TRANSPORT DE CO2(Biotine, vit
K)
1.2. COENZYMES DE TRANSPORT DE RADICAUX
AUTRES QUE CO2 (Folates, S-ADENOSYL METHIONINE).
2. COENZYMES DE TRANSPORT DE RADICAUX A
DEUX OU PLUSIEURS CARBONES (TPP, COENZYME A).
3. COENZYME DES AMINOTRANSFERASES (LE
PYRIDOXAL PHOSPHATE)
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M1 Biochimie appliquée
Structure de la protéine enzymatique
Structure primaire
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M1 Biochimie appliquée
Structure de la protéine enzymatique
Structure secondaire
feuillet bêta β plissé
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Structure de la protéine enzymatique
Structure tertiaire
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M1 Biochimie appliquée
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Cours enzymologie appliquée/
M1 Biochimie appliquée
Structure de la protéine enzymatique
Structure quaternaire, protéines oligomériques
Exemple: LDH (4ss-unités)
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M1 Biochimie appliquée
ATcase
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enzymologie appliquée/ M1 Biochimie
appliquée
Isoenzymes (Exemple: LDH)
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Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
Nomenclature et classification des
enzymes
1. Ancienne Nomenclature
• Selon la nature du substrat:
lipide………………..lipase
amidon……………...amylase
protéine……………protéase
• Selon type réaction:
Décarboxylation………….décarboxylase
Transamination……………..transaminase
Oxydoréduction…………..oxydoréductase Dr. DASSAMIOUR/Univ-Batna 2
Cours enzymologie appliquée
M1 Biochimie appliquée
2. Nomenclature officielle des
enzymes
EC X1.X2.X3.X4
X1 : type de réaction, il définit sa classe.
X2 : groupement donneur, celui du
substrat sur lequel l'enzyme agit.
X3 : groupement accepteur, la molécule
qui recevra les protons/électrons.
X4 : nature du substrat
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M1 Biochimie appliquée
Nomenclature officielle des enzymes
1 : Oxydoréductases (Exemple: peroxydases)
2 : Transférases (Exemple : aminotransférases)
3 : Hydrolases (Exemple : nucléases)
4 : Lyases (Exemple : adénylate cyclase)
5 : Isomérases (Exemple : glucose-6-phosphate
isomérase
6 : Ligases ou synthétases (Exemple : ADN
ligase)
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M1 Biochimie appliquée