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Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 1 Année universitaire : 2016-2017
REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE
MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
HARMONISATION
OFFRE DE FORMATION MASTER
ACADEMIQUE
Etablissement Faculté / Institut Département
Université Mohamed
Khider-Biskra
Faculté des Sciences Exactes et des
Sciences de la Nature et de la Vie
Sciences de la Nature et de la Vie
Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie Filière : Sciences biologiques Spécialité : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Année universitaire : 2016-2017
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 2 Année universitaire : 2016-2017
الجمهورية الجزائرية الـديمقراطيـة الـشعبيــة
وزارة التعليــم العالــي والبحــث العلمــي
مواءمة
عرض تكوين ماستر
أكاديمي
القسم المعهد الكلية/ المؤسسة
بسكرة -جامعة محمد خيضر
العلوم الدقيقة وعلوم الطبيعة والحياة
علوم الطبيعة والحياة
علوم الطبيعة والحياة الميدان:
علوم بيولوجية الشعبة :
تثمين النباتبيوتكنولوجيا و التخصص:
2017-2016 :السنة الجامعية
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 3 Année universitaire : 2016-2017
SOMMAIRE
I - Fiche d’identité du Master ------------------------------------------------------------------
1 - Localisation de la formation ------------------------------------------------------------------
2 - Partenaires de la formation---------------------------------------------------------------
3 - Contexte et objectifs de la formation----------------------------------------------------------
A - Conditions d’accès ------------------------------------------------------------------
B - Objectifs de la formation ---------------------------------------------------------
C - Profils et compétences visées ------------------------------------------------
D - Potentialités régionales et nationales d’employabilité ----------------------
E - Passerelles vers les autres spécialités ---------------------------------------
F - Indicateurs de suivi de la formation ------------------------------------------------
G – Capacités d’encadrement-------------------------------------------------------------
4 - Moyens humains disponibles-------------------------------------------------------------------
A - Enseignants intervenant dans la spécialité---------------------------------------
B - Encadrement Externe -----------------------------------------------------------------
5 - Moyens matériels spécifiques disponibles---------------------------------------------------
A - Laboratoires Pédagogiques et Equipements -------------------------------
B- Terrains de stage et formations en entreprise -------------------------------
C - Laboratoires de recherche de soutien au master--------------------------------
D - Projets de recherche de soutien au master----------------------------------------
E - Espaces de travaux personnels et TIC ----------------------------------------
II - Fiche d’organisation semestrielle des enseignement---------------------------
1- Semestre 1 -----------------------------------------------------------------------------------
2- Semestre 2 -----------------------------------------------------------------------------------
3- Semestre 3 -----------------------------------------------------------------------------------
4- Semestre 4 -----------------------------------------------------------------------------------
5- Récapitulatif global de la formation --------------------------------------------------------
III - Programme détaillé par matière --------------------------------------------------------
IV – Accords / conventions ------------------------------------------------------------------
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 4 Année universitaire : 2016-2017
I – Fiche d’identité du Master
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 5 Année universitaire : 2016-2017
1 - Localisation de la formation : Faculté : des Sciences Exacte et Sciences des Sciences de la Nature et de la Vie. Département : Sciences de la Nature et de la Vie.
2- Partenaires de la formation :
- Autres établissements universitaires :
- Entreprises et autres partenaires socio économiques :
CRSTRA, ITDAS, INRAA Biskra, ITAF, ITAS, INPV Biskra, conservation des forets biskra,
DSA, Parc national de Belezma,
Laboratoire hospitalier de Biskra, laboratoire d’hygiène de Biskra, abattoirs communaux et
privés, vétérinaires praticiens, responsables des parcs zoologiques, direction des forêts,
direction des services agricoles, éleveurs d’animaux domestiques, animaleries privées,
institut Pasteur d’Alger.
- Partenaires internationaux :
Agence Universitaire de la Francophonie,
Vaasa University of applied sciences FINLAND
Université Las Palmas (Iles Canaries, Espagne)
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 6 Année universitaire : 2016-2017
3 – Contexte et objectifs de la formation
A – Conditions d’accès En 1ère année M1 est limité pour un nombre de 50 étudiants Entrée sur titre en semestre 1 pour les titulaires de licence,
- en biochimie. - En écologie - en microbiologie. - En biologie et physiologie végétale - en biologie et physiologie animale - en parasitologie - en génétique - en toxicologie - en immunologie - en biologie moléculaire - en biotechnologie - ou autre licence équivalente à cette spécialité
Entrée sur équivalence de crédits et matières après avis de la commission pédagogique. En 2ème année : M2 L’accès à la 2ème année est ouvert aux étudiants ayant validé
- Par capitalisation les deux semestres de la 1ère année 60 crédits (2 semestres) - Par compensation s’il valide au moins 50% des crédits de la 1ère Année, dont au
moins 1/3 dans un semestre. Il est alors tenu de se réinscrire aux matières non acquises des UE non acquises de la 1ère Année.
B - Objectifs de la formation
Cette spécialité harmonisée a pour ambition d'assurer une formation supérieure dans les
différents champs de la Biologie Végétale. Etude des espèces végétales autochtones, en
particulier aromatiques, insecticides et colorantes, développement des technologies
d'extraction. Maîtriser les technologies vertes de transformation des ressources végétales
utilisées dans les industries cosmétiques, pharmaceutiques, agroalimentaires et de la
filière datte. Dans le volet biotechnologie, l’un des objectifs majeurs de cette formation est
la valorisation du palmier dattier, la culture dominante dans la région des Zibans, par la
transformation des dattes de différentes variétés et les sous produits du dattier.
Sachant que les plantes sont les sources majeures des substances bioactives, un autre
objectifs majeur est visé, c'est la formation des spécialistes en biotechnologie
pharmaceutique, ce domaine qui connait une évolution importante au niveau nationale,
surtout avec le développement de l’industrie pharmaceutique. La région est aussi riche par
les produits de terroir, connus traditionnellement, et qui occupent une part importante des
produits alimentaire du marché local et national. L’amélioration des ces produits par la
biotechnologie alimentaire et l’un des objectifs de cette formation. Il s’agit de porter à la
connaissance des étudiants les différentes stratégies d’amélioration des ressources
végétales. La maîtrise des méthodes conventionnelles et classiques, conduit à la création
et à la sélection variétale assistée par marqueurs et à l’intégration dans la plante d’un
gène sélectionné ou gène d’intérêt
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 7 Année universitaire : 2016-2017
C – Profils et compétences métiers visés
Ce parcours de master concerne des champs disciplinaires où notre établissement possède beaucoup d’atouts avec notamment un fort potentiel de formation (le tiers des enseignants de notre département possèdent un diplôme ou en relation directe avec la biologie, la physiologie et la biotechnologie végétale) et une assise de recherche avec la création du premier laboratoire de recherche. De plus, notre établissement est installé dans une région a particularité géographique entant qu'une région transitoire entre l'aride et le semi aride. La zone de Biskra est limitée par le Sahara septentrional, le massif de l'Aurès et la steppe. Ces étages bioclimatiques sont caractérisés par une richesse floristique exceptionnelle, il existe des espèces des climats continentaux (dans les montagnes), des espèces des steppes et des espèces typiquement sahariennes. Il faut ajouter l'existence de quelques zones humides comme les Chotts et les barrages. Dans ces zones, il existe une grande diversité floristique surtout les halophytes. Le palmier dattier est l'ossature de l'agriculture saharienne, c'est une filière stratégique. Cette culture nécessite beaucoup de recherche et de développement.
D- Potentialités régionales et nationales d’employabilité des diplômés Ce Master forme des spécialistes dans plusieurs disciplines :
La biotechnologie végétale et alimentaire, la biologie végétale, le développement des
plantes, la phytochimie, les métabolites secondaires et les activités biologiques, la
biotechnologie végétale, génétique et génomique végétale, la pathologie végétale et
l’étude des interactions plantes bioagresseurs
Le Master de recherche proposé vise à préparer des futurs chercheurs par rapport à la
disponibilité et la demande croissante de plusieurs secteurs régionaux et nationaux :
l’université de Biskra ou autres universités nationales (Ouargla , El oued , Batna , ….) qui
intègrent ultérieurement des équipes de recherche universitaires ;
Des enseignants au lycée
Des chercheurs dans des laboratoires et centres de recherche (CRSTRA, INRAA, Centre
de Recherche en Biotechnologie.. etc.). pour des postes doctorant ou post-doc
Des experts dans les centres et les laboratoires de recherche, et les bureaux d’études
régionaux, dans tous les secteurs (commerce, industrie, services...).
E – Passerelles vers d’autres spécialités
Passerelles avec tous les parcours de master en Biologie végétale, en Biodiversité,
biotechnologie végétale et en Ecologie et environnement.
Accès à la préparation de doctorat en Biologie végétale, en Biodiversité
biotechnologie végétale et en Ecologie et environnement.
F – Indicateurs de suivi de la formation
Evaluation continue des connaissances et exposés devant des commissions (des
parties du travail global) sanctionnée par une soutenance devant un jury.
G – Capacité d’encadrement: 40 étudiants
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 8 Année universitaire : 2016-2017
4 – Moyens humains disponibles
A : Enseignants de l’établissement intervenant dans la spécialité :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 9 Année universitaire : 2016-2017
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 10 Année universitaire : 2016-2017
B : Encadrement Externe : Etablissement de rattachement :
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
ABEKHTI Abdelkader microbiologie Biotechnologie alimentaire M.C.A. Encadrement de mémoire + stage
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
Belambri Sahra Amel Immunologie M.C.A. Encadrement de mémoire + stage
Etablissement de rattachement : Université de Constantine
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
Hamidchi Abdelhafidh Pr. Encadrement de
stage
Etablissement de rattachement : Centre universitaire de Mila
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
BOUBENDIR Abd El Hafid
Microbiologie Microbiologie alimentaire M.C.A. Cours +
Encadrement de mémoire + stage
Etablissement de rattachement : Université de Batna
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 11 Année universitaire : 2016-2017
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
Bouras Mourad M.C.A. Cours +
Encadrement de mémoire + stage
Etablissement de rattachement : Université d'Evry France
Nom, prénom Diplôme graduation
+ Spécialité Diplôme Post graduation
+ Spécialité Grade
Type d’intervention
Emargement
Seghir Abdelghani Métagénomique Pr. Conférences
Audio-visuelles
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5 – Moyens matériels spécifiques disponibles
A- Laboratoires Pédagogiques et Equipements : Fiche des équipements
pédagogiques existants pour les TP de la formation envisagée
Intitulé du laboratoire : laboratoire1 : Biologie et Physiologie Animale
N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 STEREOMICROSCOPE 04 Fonctionnel
2 CONDUCTIMETRE DE PAILLASSE 01 Fonctionnel
3 SOURCE DE LUMIERE FROIDE 02 Fonctionnel
4 STEREOMICROSCOPE TRIN OCULAIRE 01 Fonctionnel
5 MICROSCOPE TRINOCULAIRE 01 Fonctionnel 6 MICROTOME 02 Fonctionnel 7 BOITE A COLORATION DE 8 LAMES EN VERRE 10 Fonctionnel 8 BOUSSOLE 01 Fonctionnel 9 THERMOMETRE MERCURE, 22C +95/+103°C 10 Fonctionnel 10 THERMOMETRE CONTROLE MERCURE, 0 A +50°C 10 Fonctionnel 11 THERMOMETRE FLACON ALCOOL, -25 A -5°C 10 Fonctionnel 12 CELLULE SIMPLE QUADR. MALASSEZ 05 Fonctionnel
13 CELLULE SIMPLE QUADR. NAGEOTTE 05 Fonctionnel
14 ROTAVAPOR R210/V VERTICAL P+G 01 Fonctionnel 15 ETUVE UNIVERSELLE TYPE UM 400 01 Fonctionnel 16 CELLULE SIMPLE QUADR. THOMA 05 Fonctionnel 17 BOITE DE RANGEMENT DES LAMES 04 Fonctionnel 18 BOITE DE DISSECTION 10 Fonctionnel
19 BOITE COLORATION PORTOIR DES LAMES POUR 10 LAMES 02 Fonctionnel 20 EPINGLES ENTOMOLOGIQUE 15 Fonctionnel 21 BOITE ENTOMOLOGIQUE 10 Fonctionnel 22 MICROSCOPES 20 Fonctionnel
Intitulé du laboratoire : laboratoire2 : Biologie et Physiologie Végétale N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 AGITATEUR TUBE VORTEX 1 Fonctionnel
2 BALANCE DE PRECISION 1 Fonctionnel
3 FOUR DE CALCINATION 15L 1100C PROG 1 Fonctionnel
4 REFRACTOMETRE 1 Fonctionnel
5 PHOTOMETRE DE FLAMME STANDARD 1 Fonctionnel
6 ROTAVAPEUR 1 Fonctionnel
7 BAIN MARIE AGITATEUR 2 Fonctionnel
8 BOITE COLORATION PORTOIR DES LAMES POUR 10 LAMES 2 Fonctionnel
9 SPECTROPHOTOMETRE 2 Fonctionnel
10 BAIN-MARIE 2 Fonctionnel
11 MICROTOME 2 Fonctionnel
12 THERMOMETRES POUR LE SOL 2 Fonctionnel
13 DESSICCATEURS 3 Fonctionnel
14 REFRIGERATEUR 3 Fonctionnel
15 BOITE DE RANGEMENT DES LAMES 4 Fonctionnel
16 PLACARDS DE RANGEMENT DES MILIEUX ET APPAREILS 8 Fonctionnel
17 MICROPIPETTES 10 Fonctionnel
18 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 10 Fonctionnel
19 THERMOMETRE MERCURE, 22C +95/+103°C 10 Fonctionnel
20 STEREOMICROSCOPE 24 Fonctionnel
21 MICROSCOPE BINOCULAIRE 20 Fonctionnel
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Intitulé du laboratoire : laboratoire3 : Microbiologie I et II
N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 HOTTE MICROBIOLOGIQUE 1 Fonctionnel
2 AGITATEUR AVEC CHAMBRE D’INCUBATION 4 Fonctionnel
3 AGITATEUR TUBE VORTEX 1 Fonctionnel
4 BAIN MARIE AGITATEUR 2 Fonctionnel
5 BALANCE DE PRECISION 1 Fonctionnel
6 CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE 1 Fonctionnel
7 MICROPIPETTES 10 Fonctionnel
8 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 10 Fonctionnel
9 THERMOMETRE MERCURE, 22C +95/+103°C 10 Fonctionnel
10 CELLULE SIMPLE QUADR. MALASSEZ 5 Fonctionnel
11 CELLULE SIMPLE QUADR. NAGEOTTE 5 Fonctionnel
12 CELLULE SIMPLE QUADR. THOMA 5 Fonctionnel
13 BOITE DE RANGEMENT DES LAMES 4 Fonctionnel
14 BOITE COLORATION PORTOIR DES LAMES POUR 10 LAMES
2 Fonctionnel
15 SPECTROPHOTOMETRE 1 Fonctionnel
16 ETUVE BACTERIOLOGIQUE 3 Fonctionnel
17 FOUR DE PASTEUR 1 Fonctionnel
18 AUTOCLAVE 2 Fonctionnel
19 DISTILLATEUR 1 Fonctionnel
20 BAIN-MARIE 2 Fonctionnel
21 BECS BUNSEN 20 Fonctionnel
21 MICROSCOPES 30 Fonctionnel
21 COMPTEUR DE COLONIES 2 Fonctionnel
Intitulé du laboratoire : laboratoire4 : Biochimie et Immunologie
N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 AGITATEUR AVEC CHAMBRE D’INCUBATION 4 Fonctionnel
2 AGITATEUR TUBE VORTEX 1 Fonctionnel
3 BAIN MARIE AGITATEUR 2 Fonctionnel
4 BALANCE DE PRECISION 1 Fonctionnel
5 CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE 1 Fonctionnel
6 MICROPIPETTES 10 Fonctionnel
7 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 10 Fonctionnel
8 THERMOMETRE MERCURE, 22C +95/+103°C 10 Fonctionnel
9 SPECTROPHOTOMETRE 2 Fonctionnel
10 FOUR DE PASTEUR 1 Fonctionnel
11 DISTILLATEUR 1 Fonctionnel
12 BAIN-MARIE 2 Fonctionnel
13 AGITATEUR 8 Fonctionnel 14 HOTTE CHIMIQUE 1 Fonctionnel 15 CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE VENTILEE 1 Fonctionnel 16 BALANCE ANALYTIQUE 1 Fonctionnel 17 LAVEUR DE MICROPLAQUE 10 Fonctionnel 18 LECTEUR DE MICROPLAQUE 1 Fonctionnel 19 SYSTEME CHROMATOGRAPHIE COUCHE MINCE 10 Fonctionnel 20 SYSTEME CHROMATOGRAPHIE LIQUIDE SUR COLONNE 5 Fonctionnel 21 SYSTEME ELECTROPHORESE 5 Fonctionnel 22 CONDUCTIMETRE DE PAILLASSE 1 Fonctionnel
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 14 Année universitaire : 2016-2017
Intitulé du laboratoire : laboratoire5 : Biologie Moléculaire
N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 AGITATEUR AVEC CHAMBRE D’INCUBATION 1 Fonctionnel
2 AGITATEUR TUBE VORTEX 1 Fonctionnel
3 BAIN MARIE AGITATEUR 2 Fonctionnel
4 BALANCE DE PRECISION 1 Fonctionnel
5 CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE 1 Fonctionnel
6 MICROPIPETTES 20 Fonctionnel
7 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 10 Fonctionnel
8 THERMOMETRE MERCURE, 22C +95/+103°C 10 Fonctionnel
9 SPECTROPHOTOMETRE 1 Fonctionnel
10 HOTTE CHIMIQUE 1 Fonctionnel
11 CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE VENTILEE 1 Fonctionnel
12 BALANCE ANALYTIQUE 1 Fonctionnel
13 SYSTEME ELECTROPHORESE 3 Fonctionnel
14 ETUVE 2 Fonctionnel
15 AUTOCLAVE 1 Fonctionnel
16 BECS BUNSEN 8 Fonctionnel
17 THERMOMETRE CONTROLE MERCURE, 0 A +50°C 10 Fonctionnel
18 THERMOMETRE FLACON ALCOOL, -25 A -5°C 10 Fonctionnel
19 PLACARDS DE RANGEMENT DES MILIEUX ET APPAREILS 8 Fonctionnel
20 PLAQUE CHAUFFANTE 2 Fonctionnel
21 CHAMBRES FROIDES 2 Fonctionnel
22 THERMOCYCLEUR (PCR) 1 Fonctionnel
Intitulé du laboratoire : laboratoire6 : Botanique
N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 BAIN MARIE AGITATEUR 1 Fonctionnel
2 BALANCE 1 Fonctionnel
3 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 1 Fonctionnel
4 ETUVE 1 Fonctionnel
5 BECS BUNSEN 8 Fonctionnel
6 MICROSCOPE BINOCULAIRE 20 Fonctionnel 7 MICROSCOPE TRIN OCULAIRE 1 Fonctionnel
Intitulé du laboratoire : laboratoire7 : Zoologie N° Intitulé de l’équipement Nombre Observations
1 BAIN MARIE AGITATEUR 1 Fonctionnel
2 BALANCE 1 Fonctionnel
3 PLAQUE D’AGITATION CHAUFFANTE 1 Fonctionnel
4 ETUVE 1 Fonctionnel
5 MICROSCOPE TRIN OCULAIRE 1 Fonctionnel 6 MICROSCOPE BINOCULAIRE 20 Fonctionnel
7 LOUPES BINOCULAIRE 10 Fonctionnel
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 15 Année universitaire : 2016-2017
B- Terrains de stage et formation en entreprise :
Lieu du stage Nombre d’étudiants Durée du stage
Laboratoire d'hygiène 15 15 jours
Hôpitaux 30 15 jours
Vétérinaires privés 15 15 jours
Parcs zoologiques 15 15 jours
Clinique expérimentale du D.S.N.V (installation prévue)
15 15 jours
Unités de collecte et de transformation du lait
15 15 jours
Direction des Forêts (faune sauvage)
15 15 jours
Abattoirs communaux et privés 15 15 jours
Fermes d’élevage d’animaux domestiques
30 15 jours
Laboratoires d’analyses médicales privés
10 07 jours
Institut technique du développement de l’agronomie
saharienne 10 15 jours
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 16 Année universitaire : 2016-2017
C- Laboratoire(s) de recherche de soutien au master :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 17 Année universitaire : 2016-2017
D- Projet(s) de recherche de soutien au master :
Intitulé du projet de recherche
Code du projet Date du début
du projet Date de fin du
projet Biodiversité,conservation
et valorisation des végétaux d’intérêt
agronomique et médicale
F01420140014 2014 2018
Etude phytochimique et activité biologique des extraits de quelques plantes médicinales dans la région de Biskra.
F01420140020 2014 2018
Scorpions et
Scorpionisme soumis 2015 -
Projet : E-cost Belgium soumis 2016 -
DAAD En préparation 2016 -
E- Espaces de travaux personnels et TIC : Le département est couverte à 90% par une zone wifi Le pôle universitaire est connecté à la fibre optique 2 salles de lecture avec un espace Wifi 2 salles d'informatique (15 postes) Salle d'internet (25 postes).
Au niveau de la faculté
Salle de lecture de la bibliothèque Salle d'internet
Au niveau de l'université La bibliothèque centrale compte deux grandes salles de lecture d’une capacité
de 1200 places pour étudiants, deux salles de références qui comptaient tous les titres dont l’utilisateur peut accéder directement et consulter le document avant la demande d’emprunt, d’une sale de lecture pour enseignants ,d’un magasin central et de différents bureaux de traînent documentaire du livre depuis l’analyse de la demande a la diffusion du document Centre Audio visioconférences
Centre Audio-visuel
Laboratoire: Microscope électronique à Balayage
Laboratoire: Rayon X
Laboratoires de langues et de communication (3 salles de 25 étudiants)
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 18 Année universitaire : 2016-2017
II – Fiche d’organisation semestrielle des enseignements
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantes Page 19 Année universitaire : 2016-2017
1- Semestre 1 :
Unité d’Enseignement
VHS V.H hebdomadaire
Coeff Crédits
Mode d'évaluation
15 sem C TD TP Trav
Pers Continu Examen
Unités d'Enseignement fondamentales (UF) 202.5 6 3 4.5 247.5 9 18
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF11)
Matière UEF111: Physiologie Cellulaire et Moléculaire Végétale 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF112: Biochimie et Physico-chimie Alimentaires 67.5 1.5 1.5 1.5 82.5 3 6 40% 60%
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF22)
Matière UEF211 : Pharmacologie 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF212 : Toxicologie 45 1.5 1.5 - 55 2 4 40% 60%
Unité d'Enseignement Méthodologique (UEM12) 105 3 0 4 120 4 9
Matière UEM111: Outils et Méthodologie de la Biologie Moléculaire 67.5 1.5 - 3 75 3 6 40% 60%
Matière UEM112: Génétique Moléculaire 37.5 1.5 - 1 45 2 3 40% 60%
Unité d'Enseignement Découverte (UED11) 45 1.5 0 1.5 5 2 2
Matière UED111 : Biogéographie, Changements Climatiques et Biodiversité 45 1.5 - 1.5 5 2 2 40% 60%
Unité d'Enseignement Transversale (UET11) 22.5 1.5 0 0 2.5 1 1
Matière UET111: Communication 22.5 1.5 - - 2.5 1 1 - 100%
Total Semestre 3 375 12 3 10 375 16 30
- Enseignement présentiel : théorique : 225 h
- Enseignement présentiel : travaux pratiques : 150 h
- Enseignement non présentiel : travail personnel : 375 h
2- Semestre 2 :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 20 Année universitaire : 2016-2017
Unité d’Enseignement
VHS V.H hebdomadaire
Coeff Crédits
Mode d'évaluation
15 sem C TD TP Trav
Pers Continu Examen
Unités d'Enseignement fondamentales (UF) 202.5 6 3 4.5 247.5 9 18
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF12)
Matière UEF121: Biologie des Plantes 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF122: Taxonomie des Angiospermes 67.5 1.5 1.5 1.5 82.5 3 6 40% 60%
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF22)
Matière UEF221 : Ressources Phytogénitiques et Conservation 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF222 : Techniques de Production et Culture Biologique 45 1.5 1.5 - 55 2 4 40% 60%
Unité d'Enseignement Méthodologique (UEM12) 105 3 0 4 120 4 9
Matière UEM121: Techniques d’Echantillonnage 67.5 1.5 - 3 75 3 6 40% 60%
Matière UEM122: Biostatistique 37.5 1.5 - 1 45 2 3 40% 60%
Unité d'Enseignement Découverte (UED12) 45 1.5 0 1.5 5 2 2
Matière UED121 : Bioinformatique 45 1.5 - 1.5 5 2 2 40% 60%
Unité d'Enseignement Transversale (UET12) 22.5 1.5 0 0 2.5 1 1
Matière UET121: Législation 22.5 1.5 - - 2.5 1 1 - 100%
Total Semestre 3 375 12 3 10 375 16 30
- Enseignement présentiel : théorique : 225 h
- Enseignement présentiel : travaux pratiques : 150 h
- Enseignement non présentiel : travail personnel : 375 h
3- Semestre 3 :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 21 Année universitaire : 2016-2017
Unité d’Enseignement
VHS V.H hebdomadaire
Coeff Crédits
Mode d'évaluation
15 sem C TD TP Trav
Pers Continu Examen
Unités d'Enseignement fondamentales (UF) 202.5 6 3 4.5 247.5 9 18
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF13)
Matière UEF131: Transgénèse Végétale 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF132: Valorisat ion des Produits du Palmier Datt ier 67.5 1.5 1.5 1.5 82.5 3 6 40% 60%
Unité d'Enseignement fondamentale (UEF23)
Matière UEF231 : Valorisation des Microorganismes Photosynthétiques 45 1.5 - 1.5 55 2 4 40% 60%
Matière UEF232 : Phytochimie et Valorisation des Biomolécules 45 1.5 1.5 - 55 2 4 40% 60%
Unité d'Enseignement Méthodologique (UEM13) 105 3 0 4 120 4 9
Matière UEM131: Méthodologie de la Recherche Scient if ique 67.5 1.5 - 3 75 3 6 40% 60%
Matière UEM132: Ecosystème Oasien 37.5 1.5 - 1 45 2 3 40% 60%
Unité d'Enseignement Découverte (UED3) 45 1.5 0 1.5 5 2 2
Matière UED131 : Anglais scientifique II 45 1.5 - 1.5 5 2 2 40% 60%
Unité d'Enseignement Transversale (UET13) 22.5 1.5 0 0 2.5 1 1
Matière UET131: Entreprenariat 22.5 1.5 - - 2.5 1 1 - 100%
Total Semestre 3 375 12 3 10 375 16 30
- Enseignement présentiel : théorique : 225 h
- Enseignement présentiel : travaux pratiques : 150 h
- Enseignement non présentiel : travail personnel : 375 h
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4- Semestre 4 :
Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie Filière : Sciences biologiques Spécialité : Biotechnologie et Valorisation des plantes Stage dans un laboratoire, une station expérimentale ou entreprise sanctionné par un mémoire et une soutenance.
VHS Coeff Crédits
Unité d'Enseignement Fondamentale
(UEF14)
Travail Personnel
Mémoire (manuscrit)
400 6 12
Mémoire (soutenance)
50 3 6
Unité d'Enseignement Méthodologique (UEM14)
Stage en laboratoire, entreprise ...etc.
Présentation d'un rapport de stage
(écrit)
225 4 9
Unité d'Enseignement Découverte (UED14)
Séminaires et/ou jours master
50 2 2
Unité d'Enseignement Transversale (UET14)
Travail d'équipe dans le département SNV de Biskra
- manifestation scientifique - magazine scientifique
- exposé scientifique
25 1 1
Total Semestre 4 745 16 30
5- Récapitulatif global de la formation :
UE VH
UEF UEM UED UET Total
Cours 270 135 67.5 67.5 540
TD 135 0 0 0 135
TP 202.5 180 67.5 0 450
Travail personnel 742.5 360 15 7.5 1125
Semestre 4 450 225 50 25 750
Total 1800 900 200 100 3000
Crédits 72 36 8 4 120
% en crédits pour chaque UE 60 30 6.7 3.3 100
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 23 Année universitaire : 2016-2017
III - Programme détaillé par matière (1 fiche détaillée par matière)
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Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEF11: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF111 : Physiologie Cellulaire et Moléculaire Végétale PCMV-MV11 Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Cet enseignement permet aux étudiants de :
- Apprendre l’ultrastructure des différents organites des cellules végétales.
- Comprendre les différents phénomènes physiologiques des plantes au niveau
cellulaire.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
En présentiel :
INTRODUCTION : Présentation de la Cellule Végétale
1. La paroi :
Introduction : Rôle de la paroi dans la cellule végétale
1.1. Les constituants de base
1.1.1. Squelette microfibrillaire
1.1.2. Texture et architecture moléculaire (parois en croissance et consolidée)
1.1.3. Matrice
1.1.4. Flux exocytaire et assemblage
1.1.5. Extension (plasticité-élasticité)
1.2. Autres constituants
1.2.1. Lignines (tissus concernés - lieu de synthèse)
1.2.2. Cutine (tissus concernés - lieu de synthèse)
1.2.3. Subérine (tissus concernés - lieu de synthèse)
1.2.4. Minéralisation (tissus concernés - lieu de synthèse)
Conclusion : Intérêts économiques
2. Le noyau et le cycle cellulaire (Immunocytochimie-immunomarquage)
2.1. Dérèglement : - Agents antimitotiques
- Agents mitoclasiques
- Agents chromato-classiques
3. Le système membranaire (Structure, fonction et transport)
3.1. Membrane plasmique 3.2. Réticulum endoplasmique
3.3. Appareil de Golgi 3.4. Peroxysome
3.5. Cytosquelette 3.6. Reconnaissance cellulaire
4. Le vacuome (Structure, fonction et transport)
5. Le Chloroplaste
5.1. Origine et différenciation des plastes
5.2. Le chloroplaste (Structure, composition biochimique, rôle et intervention dans les
transports)
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 25 Année universitaire : 2016-2017
5.2.1. Enveloppe 5.2.2. Thylacoïde 5.2.3. Stroma
5.2.4. Génome 5.2.5. Coopération inter génome
6. La mitochondrie 6.1. Origine de la mitochondrie 6.2. Structure, composition biochimique, rôle et intervention dans les transports - membrane externe - membrane interne - matrice - génome - coopération 7. Le peroxysome : - structure - fonction - cycle glyoxilique et glycolique
Travaux pratiques : 1. Microscopie 1.1. Photonique - constitution cellulaire
- paroi mise en évidence 1.2. Electronique (théorie + photo)
- transmission : chloroplaste - mitochondrie –la paroi - balayage de la paroi
2. Centrifugations - à froid; organites (ultracentrifugation: mito et ses membranes) 3. Exploration fonctionnelle in-situ
- cytochimie et extractions sélectives - cytoenzymologie : - phosphatases - peroxydases - immunocytochimie - autoradiographie
4. Radiobiologie 4.1. Eléments de radioprotection 4.2. Marqueurs radio-actifs
- autoradio - scintillation liquide
Travail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur une partie du cours. Ce travail doit être présenté en TP. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel (recherche bibliographique et présentation)) Références
- Mazliak, P. 1974. Physiologie végétale : Nutrition et métabolisme
- Hopking, W.G. 2003. physiologie végétale. De Boeck Supérieur, 532 pages.
- René Heller, Robert Esnault, Claude Lance. 2004. Physiologie végétale : Nutrition.
Dunod, 323 pages.
- Reé Heller. 1981. Physiologie végétale : Nutrition. Masson, 244 pages.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEF11: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF112 : Biochimie et Physico-chimie Alimentaires BPCA-MB12
Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement : Cette matière a pour but de fournir aux étudiants une
formation théorique et pratique portant sur les bases fondamentales Biochimie et Physico-
chimie Alimentaires.
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Connaissances préalables recommandées Immunologie, biologie moléculaire, microbiologie, Contenu de la matière : En présentiel :
Partie I : Les Groupes d’aliments
I. LES CONSTITUANTS DES ALIMENTS ET LEURS PROPRIETES. 1
. les constituants des aliments. (Apport nutritionnels).
2. propriétés sensorielles des aliments.
3. modification des caractères organoleptiques.
II. BIOCHIMIE DES PRINCIPAUX ALIMENTS.
1. les aliments d’origine animale.
1. 1 groupe protéique musculaire.
1. 2. l’œuf, système protéique complexe.
2. les aliments d’origine végétale.
2. 1. Les céréales- le pain.
2. 2. Légumineuses protéines végétales
3. les corps gras. Introduction . Traitement de modification :
4. additifs. Définition. Additifs technologiques. Additifs sensoriels. Additif à finalité
nutritionnelle.
Partie II :
Les altérations d’aliments
1. Altérations des aliments et moyens de lutte
1.1. Altérations chimiques.
1.1.1. Oxydations des lipides.
1.1.2. Brunissement non enzymatiques .BNE.
1.1.3. Brunissement enzymatique. BE.
1.2. Altération biologiques.
1.2.1. Altération des aliments.
1.2.2. Facteurs influençant les altérations.
Travaux dirigés TD :
Des explications détaillées sur quelques schémas
Travaux pratiques TP : -Extraction et fractionnement de protéines par modification de leur solubilité: action du
pH , addition de sulfate d'ammonium.
- Méthodes de dosage des sucres par réductimétrie.
- Méthodes de dosage des sucres par polarimétrie. - Méthodes de dosage des sucres
par colorimétrie
-Détermination des indices d'acide, de saponification et d'iode d'un corps gras.
-Panification.
Travail personnel : Chaque étudiant doit analyser un article scientifique récent sur une technique immunitaire et faire une petite synthèse et la présenter en TD (durée 10 mn max.), ou sur les vaccins antiparasitaires Mode d’évaluation : 60% examen final,
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 27 Année universitaire : 2016-2017
40% continue (20% sous forme d'interrogations, compte rendus des TP...etc + 20 % sur le travail personnel (exposé orale seulement)) Références : - Fardet, A., Souchon, I., & Dupont, D. (2013). Structure des aliments et effets nutritionnels. Editions Quae. - Croguennec, T., Jeantet, R., & Brulé, G. (2008). Fondements physicochimiques de la technologie laitière.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEF21: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF211 : Pharmacologie PHAR-MB13
Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
En pharmacologie,
Comprendre l’organisation de l’industrie pharmaceutique et du marché du médicament,
- les caractéristiques physiques et chimiques qui conduisent à leurs différentes propriétés,
que ce soit pour ce qui concerne la formulation des médicaments ou leur devenir chez
l'animal et dans l'environnement, leur toxicité et/ou activité pharmacologique,
- les principes de la détermination des schémas posologiques, de leurs ajustements ainsi
que de l'extrapolation interspécifique,
- le cadre juridique leur permettant de détenir, prescrire, délivrer les médicaments
vétérinaires et déclarer des effets indésirables,
Connaissances préalables recommandées Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
Comprendre les modes d'entrée et mécanismes d'action des substances
pharmacologiques. Identifier les groupes de médicaments et leurs propriétés
pharmacodynamiques. Neuropharmacologie périphérique et centrale. Pharmacologie
humorale. Mécanismes d'action des médicaments. Chimiothérapie.
En présentiel
1ére partie : Pharmacologie I. INTRODUCTION - Généralités sur les médicaments - Origine et nature des médicaments II. Principaux groupes des substances actives III. Pharmacocinétique IV. Pharmacodynamique
Travaux pratiques : Sur les différentes techniques suivantes (au choix), l'enseignant responsable peut proposer d'autres protocoles réalisables.
- Dosage des nitrites methode au reactif de zambelli, dosage des ions sulfates, dosage des ions nitrates
- Determination de l’activite cholinesterasique
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 28 Année universitaire : 2016-2017
- mesure des concentrations des médicaments et monitoring thérapeutique - Détermination des paramètres pharmacocinétiques de Phénol Sulfonephthalein
(PSP) - Détermination de la DL50 - Influence du pH sur le taux d'absorption - Effet anticoagulant des médicaments in vitro - Les effets des médicaments sur la pression sanguine artérielle de lapin anesthésie
Travail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur les médicaments utilisés pour le traitement des parasitoses (leurs modes d'action, efficacité, nouveauté...etc.), la présentation se fait au cours des TD. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations ou examen de TP, compte rendus des TP...etc + 20 % sur le travail personnel (recherche bibliographique)) Références
- Isabelle Claverie-Morin, Isabelle Claverie, Hélène Hedde. 2008. Pharmacologie générale, toxicologie: mécanismes fondamentaux. Wolters Kluwer France, 100 pages.
- Pascal Kintz. 1998. Toxicologie et pharmacologie médicolégales. Elsevier Masson, 719 pages
- Turner, R. A. (2013). Screening methods in pharmacology. Elsevier.
- Pour les TP : un document est disponible au niveau du département
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEF21: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF212 : Toxicologie TOXI-MB14
Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
En toxicologie, les étudiants seront capables d’expliquer :
- les principaux mécanismes d’action des toxiques,
- les principes et les objectifs des méthodes d’étude expérimentale de la toxicité,
- l’évaluation de la sécurité chimique des aliments à partir de l’exemple des résidus des
médicaments vétérinaires. Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
Comprendre les modes d'entrée et mécanismes d'action des substances toxiques
Principes de la toxicologie et applications au domaine des médicaments. Nature et
ampleur de la toxicologie. Toxicocinétique : absorption, métabolisme et élimination.
Modulation de la toxicité. Classes de substances toxiques.
En présentiel
2éme partie : Toxicologie I. Données générales sur la Toxicologie - Notion d'hygiène et sécurité alimentaire - Normes et législation
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 29 Année universitaire : 2016-2017
II. Nature des différents groupes toxiques III. Mécanismes d'action des toxiques IV. Etude toxicologique V. Principes types d'intoxications VI. Mutagénèse, carcinogénèse et tératogénèse Travaux dirigés TD : Des séries d'exercices, schémas, méthodes expliquant des parties du cours Présentation des travaux personnels Travail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur les les toxines élaborées au cours des parasitoses (leurs modes d'action, physiologie ...etc), la présentation se fait au cours des TD. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations ou examen de TP, compte rendus des TP...etc + 20 % sur le travail personnel (recherche bibliographique)) Références
- Isabelle Claverie-Morin, Isabelle Claverie, Hélène Hedde. 2008. Pharmacologie
- générale, toxicologie: mécanismes fondamentaux. Wolters Kluwer France, 100 pages.
- Pascal Kintz. 1998. Toxicologie et pharmacologie médicolégales. Elsevier Masson, 719
pages
- Turner, R. A. (2013). Screening methods in pharmacology. Elsevier.
- Pour les TP : un document est disponible au niveau du département
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEM11: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM111 : Outils et Méthodologie de Biologie Moléculaire OMBM-MB15 Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement
Cette matière a pour but de fournir aux étudiants une formation pratique portant sur les
techniques fondamentales de Biologie Moléculaire utilisées dans la purification des acides
nucléiques. Une large place est donnée aux outils de biologie moléculaire ainsi que les
techniques de génie génétique.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire
Contenu de la matière
En présentiel :
Chapitre 1 : Outils de la Biologie moléculaire 1. Enzymes : Les enzymes de restriction : origine, nomenclature et modes de
restriction 2. Vecteurs de clonage 3. Banques d’ADN (préparation d’ADNc, génomique)
Chapitre 2 : Méthodes de la biologie moléculaire
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 30 Année universitaire : 2016-2017
1. Extraction et purification des acides nucléiques 2. Stratégie de PCR 3. Séquençage 4. Clonage 5. Hybridation moléculaire 6. Electrophorèse des acides nucléique 7. Southern et northern Blot 8. Western- blotting pour les protéines 9. ELISA
Travaux pratiques
- PCR - Electrophorèse des acides nucléique - et il faut proposer d'autres techniques réalisables au niveau des laboratoires du département.
Travail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur une technique récente en biologie moléculaire, et proposer un protocole expérimental par cette technique dans le domaine de la parasitologie. ce travail doit être présenté en courte présentation (de 10 mn en cours ou au TP. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel (la présentation seulement)
Références - Denis Tagu, Christian Moussard. 2003. Principes des techniques de biologie
moléculaire. Editions Quae, 176 pages - Gérard Coutouly, Emile Klein, Eric Barbieri, Mostafa Kriat. 2006. Travaux dirigés de
biochimie, biologie moléculaire et bioinformatique. Wolters Kluwer France. 346 pages - Émile Biémont.2008. Spectroscopie moléculaire: Structures moléculaires et analyse
spectrale De Boeck Supérieur 428 pages
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UEM11: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM112 : Génétique Moléculaire GEMO-MV16 Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Cet enseignement vise à apprendre aux étudiants quelques techniques de la génétique
moléculaire pratiqué pour l’amélioration des plantes
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Parasitologie,
mycologie, algologie.
Contenu de la matière
En présentiel:
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 31 Année universitaire : 2016-2017
. les marqueurs moléculaires.
2. génomique et biodiversité végétale.
3. génomique, caractérisation des gènes marqueurs et QTL.
4. évolutions moléculaires et variation de gène candidats.
5. le blé, céréale modèle pour la sélection et de synthèses en biologie végétale.
Travaux dirigés : des exercices sur les enzymes...etc. si nécessaire, transformés en TP de courtes durée, pour faire des manipulations
Travaux pratiques
- selon disponibilté des équipement, si possible de réaliser un TP ou réaliser des sorties sur terrain ou visite des laboratoires spécialisés dans la réalisation de ce type de TP Travail personnel : Des rapport sur les visites réalisées, ce travail doit être présenté en TP. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations en TD + compte rendus des TP de courte durée (...etc ) + 20 % sur le travail personnel)
- Références
Marie-Hélène Farce. 2000. Génétique moléculaire : principes et application aux
populations animales. Editions Quae, 264 pages.
- Frank Samouelian, Valérie Gaudin, Martine Boccara. 2009. Génétique moléculaire des
plantes. Editions Quae, 230 pages.
- Annie Chartier. 1991. Glossaire de génétique moléculaire et génie génétique. Editions
Quae, 48 pages.
- Jean-François Morot-Gaudry, Jean-François Briat. 2004. La Génomique en biologie
végétale. Editions Quae, 582 pages
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UED11: Découverte (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UED111 : Biogéographie, Changements Climatiques et Biodiversité BCCB-MV17 Crédits : 2
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
- Connaître les caractéristiques des zones arides et semi arides surtout en Algérie
- Comprendre les effets du climat sur la végétation. - Dans un premier temps, l’Enseignement permettra d'approfondir les
critères de définition et de distinction des variantes des différents types de bioclimats méditerranéens ; ce qui permettra de décrire les principales formations végétales méditerranéennes, qu'il s'agisse des forêts feuillues
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 32 Année universitaire : 2016-2017
et résineuses, des "matorrals" (maquis, garrigues), des pelouses et prairies (causses, bords des oueds…).
- Etre informé des changement climatique et connaitre l’impact sur la biodiversité surtout en Algérie
- Les objectifs généraux sont triples : comprendre les origines, les impacts et les implications majeures des changements climatiques
- investir autour du sujet des changements climatiques dans des secteurs d'activité variés.
Connaissances préalables recommandées Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie moléculaire Contenu de la matière En présentiel :
Première partie : MILIEUX ARIDES ET SEMI-ARIDES
1ère Partie : Caractérisation de l’Aridité 1°) Définition de l’aridité 2°) Mesures de l’aridité 3°) Typologie des déserts * Déserts zonaux * Déserts côtiers * Déserts d’Abri * Déserts continentaux 4°) Histoire des déserts * Variation climatique * Problème de sècheresse * Action anthropique
2ème Partie : Les Modelés 1°) Les modelés rocheux 2°) Les modelés dunaires 3°) Le réseau hydrographique
3ème Partie : Adaptation du vivant 1°) Adaptation physiologique (Végétation...) 2°) Adaptation humaine * Exploitation traditionnelle (problème des Nappes fossiles...) * Tentatives d’Aménagement (Nouvelles technologies, Epuisement des nappes..)
Deuxième partie : BIOGÉOGRAPHIE DE L’SPACES MÉDITERRANÉEN
Définition et distinction des variantes des différents types de bioclimats méditerranéens
- les principales formations végétales méditerranéennes, qu'il s'agisse des forêts feuillues et résineuses, des "matorrals" (maquis, garrigues), des pelouses et prairies (causses, bords des oueds…).
- Les milieux naturels - Les milieux anthropisés
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 33 Année universitaire : 2016-2017
- Effets de climat méditerranéen sur les systèmes hydriques, sols, végétations, agriculture II. changements climatiques et Biodiversité
1. Introduction 2. La biodiversité :
2 . 1 . la faune (généralités) 2 . 2 . la flore (détaillée) 2 . 2 . 1 . dans le monde 2 . 2 . 2 . en Algérie
Dans les différents étages bioclimatiques
3 . les changements climatiques 3 . 1 . définition 3 . 2 . les principales causes des changements climatiques
1 .causes géologiques 2 . causes astronomiques 3 . causes liées à l’humanité La pollution,
4 . l’effet de serre 5 . L’impact des changements climatiques dur la biodiversité végétale
5 . 1 . présentation des cas dans le mondes (abrégé) 5 . 1 . impact de ces changements en Algérie 5 . 1 . 1 . dans les différents étages bioclimatiques
Impact sur la végétation spontannée A . humides B . sub humide C . continentale D . semi aride E . aride et saharien
6 . les changements climatiques et la phoeniciculture 6 . 1 . effets sur la diversité variétale 6 . 2 . effets sur les pathologies 6 . 3 . effets sur le cycle biologique
7. Méthodes d’évaluation et de mesure de la diversité : 7.1. Concept, définitions et expression de la diversité génétique 7.2. -Contrôle du flux de gènes et ressources génétiques 7.3. -Approche synthétique de la biodiversité 7.4. -Prospection 7.5 -Classification supra et interspécifique 7.6 -Structure génétique et différenciation intra et inter population 7.7. -Flux de gènes et distribution écogéographiques de la diversité 7.8 -Indices de similitudes, identité et distances génétiques
7.9 -Génétique quantitative et population expérimentale Travail personnel : Les sorties proposées :
1- Octobre – Novembre : circuit Biskra – Arris – Chelia - Batna – El Kantra – Biskra (l’objectif est l’observation des effets sur la végétation de différents étages : steppiques, montagneux (exposition sud et nord)).
2- Janvier – février : visite de la région d’Elhadjeb et Ain benNaoui : observation de la végétation des sols sableneux
3- mars : visite de la pleine de l’Outaya et le barrage de la fontaine des gazelle)
La sortie est évaluée après rédaction d’un rapport (travail personnel)Mode d’évaluation :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 34 Année universitaire : 2016-2017
60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel (exposé + manuscrit) Références
- Chauvet, Michel et Olivier, Louis, 1993. La biodiversité, enjeu planétaire. Sang de la terre, 416 p. - Arnould Paul et Simon Laurent, 2008. Géographie de l'environnement. Belin, 307 p. - Blandin Patrick, 2009. De la protection de la nature au pilotage de la biodiversité. Quae, 120 p.
- Quezel Pierre et Medail Frédéric, 2004. Ecologie et biogéographie des forêts du bassin méditerranéen. Elsevier, 572 p.
- A. Riedacker. 1993. Physiologie Des Arbres Et Arbustes en Zones Arides Et Semi-arides : Séminaire, Paris-Nancy, 20 Mars-6 Avril 1990. John Libbey Eurotext, 489 pages.
- Adolphe Laurent Joanne. Géographie de l’Algérie. C. Lacour, 170 pages.
- Eric Roose, Jean Albergel, Georges De Noni, Abdellah Laouina, Mohammed Sabir. 2008. Efficacité de la gestion de l'eau et de la fertilité des sols en milieux semi-arides : actes de la session VII. IRD Editions, 402 pages.
- Francisco López Bermúdez. 1996. Erosion hydrique, désertification et aménagement dans l'environnement Méditerranéen semi-aride. EDITUM, 257 pages
- Dajoz, Roger. 2008. La biodiversité : l'avenir de la planète et de l'homme. Ellipses, 2008 - 275 pages.
- Isabelle Roussel, Helga-Jane Scarwell . 2010. Le changement climatique: Quand le climat nous pousse à changer d'ère. Presses Univ. Septentrion, 358 pages
- Jean Louis Fellous, Catherine Gautier. 2007. Comprendre le changement climatique. Odile acob, 297 pages.
- Robert Barbault. 1997. Biodiversité: Introduction à la biologie de la conservation. Hachette, 159 pages
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UET11: Transversale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UET111 : Communication COMM-MB18 Crédits : 1
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement
Analyser les objectifs de la communication interne et externe et présenter les méthodologies nécessaires pour conduire les principales actions de communication
Donner confiance pour aborder l'anglais scientifique écrit, dans ses diverses formes et genres. Donner confiance pour s'exprimer à l'oral en anglais, en particulier dans la spécialité de la mention choisie. Eveiller à certains aspects linguistiques et phonologiques de l'anglais scientifique. Présenter les outils élémentaires de la communication scientifique en anglais.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie moléculaire. Langue et Les bases linguistiques Contenu de la matière
En présentiel :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 35 Année universitaire : 2016-2017
I. Renforcement des compétences linguistiques
Terminology COMMON PREFIXES AND SUFFIXES Useful Biological Prefixes and Suffixes Suffixes et préfixes dans les mots scientifiques Example.
• Prefixe : PER- • 1-throughout: perennial • Exp : perennial plant • Having a life cycle lasting more than two years • Synonyms :
perdurable; constant, incessant, continual. imperishable, undying, eternal, immortal • 2. Thoroughly; completely; intensely: • Exp : perfuse. • 3.in Surgery (the art, practice, or work of treating diseases, injuries, or deformities by
manual or operative procedures.) • Verb, perfused, perfusing: to diffuse (a liquid, color, etc.) through or over something.
to pass (fluid) through blood vessels or the lymphatic system • in Chemistry. • Containing an element in its highest oxidation state: perchloric acid. • Containing a large or the largest possible proportion of an element: peroxide.
Containing the peroxy group: peracid ... et continue avec la même méthode Donner les différents sens du mot (différente meanings of the word) avec l'utilisation des schémas et photo pour faciliter la compréhension. Donner une partie d'un cours déjà fait en français mais cette fois en Anglais. Présentation de quelques expériences du laboratoire (travaux pratiques) en anglais : Pour présenter le matériel utilisé dans les laboratoires de biologie. II. Les méthodes de la Communication . III. Communication interne et externe. IV. Techniques de réunion. V. Communication orale et écrite
Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 100% examen final, Références
1. Martin, B., et Tony, D. E., 1983, Nucleus English for science and technology
(General Science part II). Longman.
2. Thomson, A. J., et Martinet, A.V., 1993, A practical English Grammar. Low
Priced edition.
3. Michael, S., 1984, Practical English Usage. Oxford University Press.
4. Kristine, B., et Susan, H., 2003, Writing matters. Cambridge.
5. http://www.dictionary.com/
6. www.bbclearningenglish.com
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Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEF12: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF122 : Biologie des Plantes BIPL-MV21 Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
- Comprendre les facteurs influençant le cycle et qui affectent le rendement.
Appliquer ces connaissances pour la biologie du palmier dattier. Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
En présentiel
types biologiques des plantes
Chapitre 1 : les différents type biologiques des végétaux
- Phanérophytes.
- Chaméphytes.
- Hémicryptophytes
- Cryptophytes
- Thyrophytes
Chapitre 2 : les cycles biologiques chez les plantes cultivées
1. Plantes annuelles
- Etat végétatif :
- Etat reproducteur
2. Plantes pérennes
- Etat végétatif :
- Etat reproducteur
Chapitre 3- La morphogenèse végétale et l'établissement du phénotype - Croissance et ramification chez les végétaux - Influence des facteurs de l’environnement sur la morphogenèse végétale - La croissance cellulaire et son contrôle chez les végétaux - Le port d’un végétal, résultat d’interactions multiples - Quelques exemples de l’influence des facteurs internes et externes sur le développement
végétal
Chapitre 4- La diversité morphologique des végétaux - Rôle des hormones et de l’environnement dans le développement du végétal - Rôle des méristèmes dans la morphogenèse végétale
Chapitre 5- fonctionnement et rendement
1 déterminisme du rendement
- caractères biologiques
2 - fonctionnement de la plante
Travaux pratiques
- La variabilité morphologique des végétaux - Suivie du cycle biologique de quelques plantes annuelles soit cultivée in vitro
ou en pots au laboratoire
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- Suivie sur champs du cycle biologique des plantes spontanées dans le jardin
du département
Sorties proposées :
- Une sortie à El Hadjeb pour voire les différentes formes biologiques.
Une sortie sera proposée par semaine ou par quinzaine, avec partage de l’effectif global des étudiants : cette sortie sera réalisée au niveau des palmeraie très proche du département (El Hadjeb ou L’ITEDAS) pour suivre le cycle du palmier dattier dès la récolte des dattes (en Octobre/novembre), passant par la stade de fructification (sa permet aux étudiants de voire les pratique culturales de pollinisation et quels sont les facteurs influençant le rendement) jusqu’à la fin du semestre qui coïncide probablement avec un stade avancé du fruit. Chaque étudiant est obligé de préparer un rapport de sortieTravail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur les sortie Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations en TD + examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel (présentation seulement))
Références
- Robert Chodat. 2010. La biologie des plantes. BiblioBazaar, 2010. 358 pages.
- Robert Gorenflot. 1990. Biologie végétale : plantes superieures, appareil végétatif.
Masson, 247 pages.
- D. Robert, Jean Claude Roland. 1989. Biologie végétale : caractéristiques et stratégie évolutive des plantes, Volume 1. Doin, 265 pages.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEF12: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF122 : Taxonomie des Angiospermes, TAXA-MV22 Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement
- Savoir les grandes familles des angiospermes
- Connaître les clés d’identification des plantes à fleures
- Avoir une idée sur les nouvelles techniques moléculaires de classification
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
En présentiel
1. Historuque des plantes à fleures
2. La diversité du monde angiospermien
3. Les caractéristiques des fleurs sont un critère essentiel de la
classification des angiospermes.
3.1 L’organisation des pièes florales
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4. La répartition du sexe chez les plantes à fleurs
5. Les monocotylédones
5.1. Cycles de vie
5.2. La graine
5.3. le fruits
5.4. classification
- Les alimatidées
- Les arécidées,
- Les lilidées
- Les commélinidées
- Les zingibéridées
6. les dicotylédones
6.1. Cycles de vie
6.2. La graine
6.3. Le fruits
6.4. Classification
- Les dicotylédones Apétales
- Les Dicotylédones Dialypétales
- Les Dicotylédones Gamopétales
7. classification par les techniques moléculaires
- Groupe de phylogénie d'angiosperme ou APG :
Le système est basé sur deux gènes de chloraplastes et un codage de gène pour des
ribosomes
- 1. Eudicots et Eudicotyledons
- 2. Monocotyledons ou monocots
3. Rosids
Travaux pratiques
- Anatomie des fleures de quelques espèces de différentes familles
TD : Des exercices sur le métabolisme microbien, les grands cycles métaboliques
Travail personnel : Chaque étudiant doit réaliser une étude bibliographique sur le métabolisme d'un type trophique ou type respiratoire d'un microorganisme et doit être présenté en TD. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations en TD + examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel (présentation seulement))
Références
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 39 Année universitaire : 2016-2017
Ozanda, P. 2004. Flore et végétation du Sahara. CNRS, Paris, 662 p.
- MAIRE R., 1952 - Flore de l'Afrique Du Nord - Volume 1. Paul le Chevalier, Paris, 371p.
- QUEZEL, P. et S. Santa. 1962. NOUVELLE FLORE DE L'ALGÉRIE ET DES RÉGIONS
DÉSERTIQUES MÉRIDIONALES. Centre national de la Recherche scientifique, Paris.
1170p.
- SPICHIGER. R-E. 2002. Botanique systématique des plantes à fleurs : une
approche phylogénétique nouvelle des Angiospermes des régions tempérées et
tropicales. Presse technique et universitaires Romande, Paris. 404 p.
- Soltis, D. E. et alii. 2000. Angiosperm phylogeny inferred from 18S rDNA, rbcL, and atpB
sequences.Bot. J. Linn. Soc. 133 : 381-461.
- Sporne, K. R. 1965. The Morphology of Gymnosperms. Hutchinson.
- Takhtajan, A. 1997. Diversity and Classification of Flowering Plants. Columbia Univ.
Press.
- Cronquist, A. 1981. An Integrated System of Classification of Flowering Plants.
Columbia Univ. Press
- - Groupe de phylogénie d'angiosperme (2003). Une mise à jour de la classification de
groupe de phylogénie d'angiosperme pour les ordres et les familles des usines
fleurissantes : APG II. Journal botanique de la société de Linnean 141: 399-436
- Le groupe de phylogénie d'angiosperme. (1998) Une classification ordinale pour les
familles des usines fleurissantes. Annales du jardin botanique du Missouri.
- Haston, E. ; Richardson, J. E. ; Stevens, P. F. ; Chasse, M. W. ; Harris, D. J. (2007). Un
ordre linéaire des familles du groupe II de phylogénie d'angiosperme. Taxon 56 (1) : 7-
12.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEF22: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : Matière UEF221 : Ressources Phytogénitiques et Conservation RPHC-MV23 Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
- Connaître l’état des lieux de la biodiversité phylogénétique en Algérie d’une façon
générale.
- Connaître les moyens de conservation des ces ressources surtout par l’utilisation es
techniques ressente de génie génétique
Savoir la diversité génétiques du palmier dattier et les meilleurs moyens de conservation de ces ressources. Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Contenu de la matière
En présentiel
1- Biodiversité :
2- Evaluation et mesure de la diversité génétique :
3- Stratégie en amélioration des plantes :
4- Conservation :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 40 Année universitaire : 2016-2017
5- Multiplication végétative et culture in vitro :
6- Obtention d'haploïdes par culture in vitro :
7- Les semences futures :
8-Ressources phylogénétiques du palmier dattier
8.1. Les variétés femelles (Nekhla)
- Les variétés abondantes (toujours cultivées)
- Les variétés rares (en voie d’extinction)
*dans la région d’oued Righi
*dans la région des Ziban
*dans les palmeraies des montagnes
- Méthodes de préservation des ressources du dattier :
* les pratiques culturales conventionnelles
* la génie génétique (culture in vitro)
8.2. les variétés males (Dhokkar)
Travaux pratiques TP : Si la réalisation des TP est diffcile, des séences de TD seront programmée pour expliquer en détail des ^parties du cours
Sorties proposées : aux choix (réalisable)
- Visite des palmeraies des Zibans ouest (Tolga / Foughala)
- Visite d’une collection variétale se l’ITEDAS à Feliach
- Visite de la palmeraie de Mchounech (palmeraie des montagne)
La sortie est évaluée après rédaction d’un rapport (travail personnel) Travail personnel : Laisser la décision à l'enseignant et discuter au comité pédagogique Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations en TD + examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel. Références
- Léveque, Ch, 2008. La biodiversité au quotidien-Le développement durable à l'épreuve
des faits.quae, Paris. 304p.
- Dajoz, Roger. 2008. La biodiversité : l'avenir de la planète et de l'homme.. 275p.
Munier, P. 1973. Le palmier dattier. G.-P. Maisonneuve et Larose, Paris. 217p. Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEF22: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : Matière UEF222 : Techniques de Production et Culture Biologique TPCB-MV24 Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
- Apprendre les techniques de productions végétale surtout celles biologiques.
- Savoir l’état actuel de l’agriculture biologique
- Comme finalité : l’étudiant connaître la nécessité de retourner vers les technique
biologiques pour préserver leur environnement
Connaissances préalables recommandées
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 41 Année universitaire : 2016-2017
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale.
Contenu de la matière
En présentiel
Partie 1 : technique de culture
1- Amélioration par les techniques agronomiques
1-1-choix des zones de culture (zone et vocation)
1-2-choix des espèces (C3-C4-CAM)
1-3-choix des semences (variétés)
1-4-choix du porte-greffe
1-5- calendrier cultural
1-6- dos de semis
1-7- mode de conduite
1-8-engrais (fertilisation)
1-9- taille
1-10-travail du sol
1-11Désherbage
2- Irrigation et drainage
3- Biologie florale
*Autogamie
*Allogamie
*Caractères floraux de type économiques intéressant (légumineuses, graminées,…..)
4- La défense des cultures
5- Contraintes hydrique et production
6- Rotation – assolement, bilan hydrique et production
7- Technique de culture des tissus végétaux.
Partie 2 : cultures biologiques :
- Introduction
- Biosemences
- Techniques de laboratoire
- Production biologique en champs
Culture biologique du palmier dattier et Production de dattes biologique Travaux Dirigés TD :
- Un TP sur la mesure des besoins des plantes en eau
Sortie proposée :
- Visite d’une unité de démonstration production de dattes biologiques (dans le cadre de
la coopération avec l’INRAA)
- sorties réalisées au niveau des pépinières pour qu’ils puissent voir de près les
techniques agronomiques.
Travail personnel : Laisser la décision à l'enseignant et discuter au comité pédagogique Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations en TD + examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel.
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 42 Année universitaire : 2016-2017
Références
- Claude Vallée, Gilbert Bilodeau, Cégep Joliette-De Lanaudière . 1999. Les Techniques
de Culture en Multicellules. Presses Université Laval, 394 pages
- Roger Jean Gautheret. 1942 - Manuel technique de culture des tissus végétaux .
Masson et Cie, 172 pages
- Laurence Amand, Nathalie Langlois. 2009. Agriculture biologique : Les grands
principes de production et l'environnement professionnel. Educagri Editions. 235p.
- Gabriel guet. 2003. Mémento d'agriculture biologique : Guide pratique à usage
professionnel. France Agricole Editions. 416p.
- Nathalie Langlois, Vincent GAUCHARD, Nathalie LANGLOIS. 2010. Agriculture
biologique: Maîtriser la conversion et ses conséquences. Educagri Editions. 106 p.
- King. F. H. 2007. Irrigation and Drainage Principles And Practice Of There Cultural
Phases. Goldberg Press. 536 p.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEM12: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM121 : Techniques d’Echantillonnage TEEC-MV25 Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement
Cette matière a pour but de fournir aux étudiants une formation pratique sur les techniques d'échantillonnage dans les écosystèmes, les zones humides, les forêts, les montagnes. Ainsi, l’échantillonnage adaptées pour chaque situation Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire
Contenu de la matière
En présentiel :
Chapitre 1 : Structure des peuplements
Richesse
Abondance
Densité
Diversité
Chapitre 2 : Choix et contrainte de l’échantillonnage
Le prémodèle
Descripteurs écologiques
Echelle de perception
Chapitre 3 : Plans d’échantillonnage
Echantillonnage aléatoire
Echantillonnage stratifié
Echantillonnage systématique
Qualité d’échantillonnage
Chapitre 4 : Echantillonnage en champs cultivés
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 43 Année universitaire : 2016-2017
1- dans la partie biotique
Des plantes (différentes cultures)
Des ravageurs (microorganismes, insectes)
2- dans la partie abiotique (sol, aire, conduites et bassin d’irrigation)
Des ravageurs (microorganismes, insectes, animaux)
Chapitre 5 : Echantillonnage en milieux naturelles (végétation spontanées)
1- dans la partie biotique
Des plantes
Des ravageurs (microorganismes, insectes, animaux)
2- dans la partie abiotique (sol, aire, eau)
Des ravageurs (microorganismes, insectes, animaux)
Stage en sorties de terrain :
- Sortie en champs cultivés de différentes cultures (les plus proches)
- Sortie (mars. avril) en milieux naturels dans une zone riche en végétation
- Sortie dans une zone humide.
Travaux pratiques : Une sortie : visite du centre de culture cellulaire de la pomme de terre à Guedjal (Sétif) Travail personnel : Chaque étudiant doit préparer un petit exposé sur une sortie réalisée (le travail doit être exposé au laboratoire) Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, compte rendus des TP ou sorties...etc ) + 20 % sur le travail personnel (exposition)
Références - Adolphe, M., Barlovatz-Meimon, G., Guillouzo, C., & Ronot, X. (1988). Culture de
cellules animales: méthodologies, applications. Techniques en...
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UEM12: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM122 : Biostatistique BSTA-MB26 Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Ce module permettra à l’étudiant de compléter sa maîtrise de l’outil statistique nécessaire
aux analyses numériques des relevés.
Cette matière servira à faire apprendre à l’étudiant comment utiliser les logiciels des
analyses multi-variées (ACP, AFC) qu’il aurait besoin pour préparer son mémoire de fin de
cycle, comment organiser ses données et les traiter plus tard statistiquement afin
d’hiérarchiser les facteurs analysés. Des exemples sont donnés en salle d’informatique
autant que des exercices. Aussi, elle vise à apprendre à l’étudiant comment conserver les
différentes données récoltées lors d’une recherche, ou des institutions (le nombre de cas
déclarés d’une maladie donnée sur plusieurs mois ou années), afin de les utiliser au
moment propice.
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 44 Année universitaire : 2016-2017
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire, maths, statistiques et informatique
Contenu de la matière
En présentiel :
1. Statistique descriptive
Paramètres de position
- les moyennes
- la médiane
- les percentiles
- mode ou dominante
- comparaison de différents paramètres de position
Paramètres de dispersion
- écart moyen arithmétique
- variance/écart-type
2. Statistique interférentielle
- Introduction aux lois de distribution : loi normale
- Principe des tests : test de conformité
- Comparaison de plusieurs moyennes : analyse de la variance à un facteur
- Analyse de la variance à 2 facteurs ANOVA2
- Analyse de la variance à 2 facteurs avec répétition
3. Corrélation de deux variables
- Régression à une variable explicative
- Détermination du coefficient de corrélation
- Détermination de la pente de la droite
- Tests statistiques
- Cas de 2 échantillons indépendants
* Test de MANN-WHITNCY
* Test des médianes
- Cas des échantillons appariés
* Test de WILCOXON
* Test des signes
- Cas de plusieurs échantillons :
- Test de KRUSKALL-WALLIS
- Test de FRIEDMANN
- Test de SPEARMANN (corrélation)
- Test de χ2
5. Analyse des données multivariables
- Analyse en composantes principales
- Analyse factorielle des correspondances
- Régression linéaire multiple
- Analyses discriminantes
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- Classification hiérarchique
Travaux pratiques : Des applications sur des logiciels d’analyse en biostatistique au niveau de la salle d’informatique Il faut choisir des exemples en biologie animale, écologie animale, parasitologie ...etc. Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, 20% Participation, manipulation et compte rendus des TP) Références - Amazallag E., Piccioli N., et Bry F., (1978). Introduction à la statistique. Ed. Hermann,
Paris ? 339p.
- Bernier, J. (2000). Statistique pour l'environnement : traitement bayésien de
l'incertitude, Tec et Doc.
- Chauvat, G. (2002). Statistiques descriptives : résumés des cours, 85 exercices
corrigés, 40 problèmes, Armand Colin.
- Falissard, B. (1998). Comprendre et utiliser les statistiques dans les sciences de la vie,
Masson.
- Grais, B., (2003), Méthodes statistiques, Dunod.
- Huguier M, Flahault A., (2003). Biostatistiques au quotidien. Ed. Elsevier, Paris, 206p.
- Lecoutre, J-P., (2006), Statistique et probabilités : manuel et exercices corrigés, Dunod
- Milhaud, X (2001). Statistique. Ed. Belin
- Schwartz D., (1992). Méthodes statistiques à l’usage des médecins et biologistes.
Flammarion, Paris, 306p.
- Valleron A. Z. et Lazard P., (1995). Exercices programmés de statistiques à l’usage des médecins et biologistes. Flammarion, Paris, 247p.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UED12: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UED121 : Bioinformatique BINF-MB27 Crédits : 2
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Ce module permettra à l’étudiant de compléter sa maîtrise de l’outil statistique nécessaire
aux analyses numériques des relevés.
Cette matière servira à faire apprendre à l’étudiant comment utiliser les logiciels des
analyses multi-variées (ACP, AFC) qu’il aurait besoin pour préparer son mémoire de fin de
cycle, comment organiser ses données et les traiter plus tard statistiquement afin
d’hiérarchiser les facteurs analysés. Des exemples sont donnés en salle d’informatique
autant que des exercices. Aussi, elle vise à apprendre à l’étudiant comment conserver les
différentes données récoltées lors d’une recherche, ou des institutions (le nombre de cas
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 46 Année universitaire : 2016-2017
déclarés d’une maladie donnée sur plusieurs mois ou années), afin de les utiliser au
moment propice.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire, maths, statistiques et informatique
Contenu de la matière
En présentiel :
.application de l'outil informatique sur les techniques génotypiques Sont des techniques qui se basent directement sur des caractères de l’ADN chromosomique ou extra-chomosomique
A. METHOD BASÉES SUR LA NON AMPLIFICATION DE L’ACIDE NUCLÉIQUE - Plasmide Analysis : L’analyse plasmidique - Ribotyping : Le ribotypage - MEE (Multilocus Enzyme Electrophoresis) L’analyse des isoenzymes - PFGE (Pulsed Field Gel Electrophoresis): électrophorèse sur gel en
champ pulsé - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism): polymorphisme de
longueur des fragments de restriction - REA (Restriction Enzyme Analysis): analyse des enzymes de restriction
B. MÉTHODES BASÉES SUR L’AMPLIFICATION DE L’ACIDE NUCLÉIQUE - PCR (polymerase chain reaction) : réaction en chaine par polymérase - RAPD (random-amplified polymorphic DNA) : amplification aléatoire d’AND
polymorphe - Rep-PCR (repetitive element-based PCR) - MLST (multilocus-sequence Typing) : typage des séquences multilocus.
D- Les outils de la bioinformatique
- Banques de séquences biologiques.
- Recherche et similitudes entre séquences (système de scores) les
algorithmes et les programmes de comparaison de séquences,
comparaison avec les banques.
Travaux pratiques : Des applications sur des logiciels d’analyse en bioinformatique au niveau de la salle d’informatique Il faut choisir des exemples en biologie animale, écologie animale, parasitologie ...etc. Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, 20% Participation, manipulation et compte rendus des TP) Références
- Frédéric Laurent. 1997. Identification et typage moléculaire des bactéries appartenant
au genre Nocardia. 208 pages
- André Eyquem, Joseph Alouf, Luc Montagnier . 2000. Traité de microbiologie
clinique: deuxièmes mises à jour et complément.PICCIN, 2000 - 238 pages
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 47 Année universitaire : 2016-2017
- H.LECLERC, 1999, Microbiologie générale, édition Doin, Paris
- T.HART, 1997, Microbiologie, édition Flammarion Paris
- G.TORTORA, 03, Introduction à la microbiologie, Erpi Editions, Québec
- P.BERCHE, 1991, Bactériologie, Flammarion, Paris
- J.GASSIER, 2000, Biologie microbiologie. Travaux dirigés, Masson, Paris.
- D. Hachez, Pavel A. Pevzner. 2007. Bio-informatique moléculaire: Une approche
algorithmique. Springer, 329 pages
- Frédéric Dardel, François Képès. 2002. Bioinformatique: génomique et post-
génomique. Editions Ecole Polytechnique, 246 pages.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : UET12: Transversale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UET121 : Législation LEGI-MB28 Crédits : 1
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement
Initier l’apprenant aux notions réglementaire, les définitions et origines des textes de loi et les connaissances des conséquences pénales. Connaissances préalables recommandées
Ensembles des contenus de la formation Contenu de la matière
En présentiel :
Partie I
Notions générales sur le droit (introduction au droit, droit pénal).
Présentation de législation algérienne (www.joradp.dz, références des textes).
Règlementation générale (loi sur la protection du consommateur, hygiène,
étiquetage et information, additifs alimentaires, emballage, marque, innocuité,
conservation).
Règlementation spécifique (travail personnel, exposés).
Organismes de contrôle (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML).
Normalisation et accréditation (IANOR, ALGERAC).
Normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR)
Partie II
Généralités sur Principes de bonne pratique en laboratoire et standards éthiques de la
profession.
I. Place de l’expérimentation dans la société 1. Légitimité de l’expérimentation animale 2. Protection des animaux 3. Conception de procédures expérimentales et de projets II. Ethique en expérimentation animale 1. Raisons d’utilisation des animaux en expérimentation 2. Règle des 3 R 3. Comité d’éthique 4. Devoirs des utilisateurs d’animaux
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 48 Année universitaire : 2016-2017
III. La Sécurité sanitaire des aliments. Analyse et maîtrise des dangers. Analyse quantitative des risques. Aspects réglementaires et normatifs. Aspects psycho-sociologiques de la sécurité alimentaire, confiance et crise
IV. Les principaux textes en matière de radioprotection Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 100% examen final, Références - Bondolfi, A. (1995). L'homme et l'animal: dimensions éthiques de leur relation. Saint-
Paul. - Marguénaud, J. P. (2011). L'expérimentation animale: entre droit et liberté. Editions
Quæ. - ED Olfert, BM Cross, AA McWilliam. 1993. MANUEL SUR LE SOIN ET L'UTILISATION
DES ANIMAUX D'EXPÉRIMENTATION. ccac.ca
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEF13: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF131 : Transgénèse Végétale TRVE-MV31
Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement : Comprendre et évaluer la pertinence des systèmes
d'amélioration végétale en fonction des contraintes de développement et potentialités des
plantes cultivées (système reproducteur, cycle de développement) et de l'évolution des
technologies disponibles (génétique mendélienne, quantitative, moléculaire, transgenèse,
étude des populations, génomique, protéomique) afin de proposer des cultures
génétiquement adaptées aux besoins de l'humanité (alimentation, environnement,
industrie, médecine)
Connaissances préalables recommandées Immunologie et vaccinologie, microbiologie, parasitologie, microbiologie alimentaire. Contenu de la matière : En présentiel :
I. Historique et place de la transgénèse dans le contexte scientifique et
agronomique.
II. Principes de base de l’amélioration génétique chez les Plantes
a. caractéristiques recherchées
b. générer de la variation : mutagénèse, croisements
III. Biotechnologie végétale
a. Méthodes de culture in vitro
Culture de méristèmes, micropropagation, culture de protoplastes, production
d’haploïdes, culture d’embryons, embryons somatiques
c. Transgénèse végétale Indirecte (utilisation d’Agrobacterium tumefasciens) et
Directe (micro-injection, fusion somatique et technique des liposomes, biolistique)
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 49 Année universitaire : 2016-2017
IV : Enjeux éthiques
Production et commercialisation de plantes comestibles transgéniques
a. Impacts environnementaux
b. Impacts sur la santé humaine
c. Impacts sociaux
d. Implications éthiques
V- le clonage de gène
Méthodologies de base / Gènes chimériques de première et de seconde génération /
Vecteurs de clonage.
VI- Techniques de transfert et d'obtention de plantes transgéniques
VII- Repérage des cellules transformées et contrôle de l'expression des transgènes
Recherche de la présence du T-DNA et du nombre de copies (PCR, Southern) /
Contrôle de l'expression des transgènes sur systèmes fractionnés et in situ.
VIII- Réalisations actuelles, perspectives et réglementation du génie génétique
Modèles transgéniques déjà créés / Évaluation des risques / Réglementation et problèmes
posés par la détection des O.G.M.
Travaux pratiques :
Méthodes de culture in vitro : essai de réalisation d’une ou deux techniques :
Culture de méristèmes, micropropagation, culture de protoplastes, production
d’haploïdes, culture d’embryons, embryons somatiques
Travail personnel : Chaque étudiant doit préparer un exposé Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations, compte rendus des TP...etc + 20 % sur le travail personnel (exposé)) Références :
- Claudine Franche, Émile Duhoux. 2001. La transgénèse végétale. Elsevier, 191
pages
- Frank Samouelian,Valérie Gaudin,Martine Boccara. 2009. Génétique moléculaire
des plantes. Editions Quae, 230 pages
- Alain Esterle, Laurence Schaffar . 1994. Organisation de la recherche et conformisme scientifique. Presses universitaires de France, 325 pages
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEF13: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF132 : Valorisation des Produits du Palmier Datt ier
VSPD-MV32
Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement :
Le palmier dattier est un arbre rustique s’adaptant aux régions les plus arides du monde. C’est un monocotylédone arborescente, de la famille des palmacées ou phoenicicacées sous famille des coryphinées, du genre phoenix et de l’espèce phoenix dactylifera L.. Il constitue la principale source de vie de la population saharienne. En Algérie, la culture du
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 50 Année universitaire : 2016-2017
palmier dattier est essentiellement localisée dans les wilayates sahariennes. On estime le nombre à 10 millions de palmiers dattiers dont 76 % productifs donnant une production annuelle d 270000 tonnes de dattes dont 45 % de Deglet Nours.
Connaissances préalables recommandées
Microbiologie, parasitologie, biostatistiques, méthodologie de la recherche, biologie moléculaire.
Contenu de la matière : En présentiel: Ce contenu doit être développé et enrichie le palmier dattier, offre une large gamme de sous produits exploités par la population saharienne, à savoir : - le vinaigre, l’alcool et les levures, par fermentation microbiologiques des dattes communes; - farine de dattes utilisées dans la panification; - jus de dattes, par extraction, utilisé comme sucrerie; - tronc d’arbre, utilisé dans l’ébénisterie traditionnelle, bois de chauffage et charpentes de bâtiments; - palmes sèches, utilisées comme clôtures, brises vent, dans la confection de couffins, de chapeau, etc., ils peuvent même servir en industrie de papier - les régimes de dattes, comme balais traditionnels, et comme combustibles; - le liffe pour la confection des semelles de sandales; - le lacmi, boisson très recherchée par la population locale, représentant la sève qui s’écoule du stipe. L’utilisation des sous produits du palmier dattier dans l’alimentation du bétail est, depuis longtemps, pratiqué par les éleveurs locaux d’une façon traditionnelle. Les sous-produits les plus utilisés sont, principalement, les déchets de dattes, puis viennent, à un degré moindre, les pédicelles de dattes et les palmes sèches. Travaux dirigés :
TD Ou des Tp
Travail personnel : Préparer des exposés - visite d'une foire spéciales pour les sous produits du palmier dattier organiosée annuellement au niveau de la chambre de l'artisanat de la wilaya de Biskra Le travail personnel sera sur des parties de Td ou de TP Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations, la présentation des exposés au cour des scéances de TD...etc + 20 % sur le travail personnel, le manuscrit)) Références :
- Aberlenc-Bertossi, F. (2010). Biotechnologies du palmier dattier. IRD Editions.
- El Hadrami, I., El Bellaj, M., El Idrissi, A., J’Aiti, F., El Jaafari, S., & Daayf, F. (1999).
Biotechnologies végétales et amelioration du Palmier dattier (Phoenix dactylifera L.), pivot de
l’agriculture oasienne marocaine. Cahiers Agricultures,7(6), 463-0.
- Chehma, A., & Longo, H. F. (2001). Valorisation des sous-produits du palmier dattier en vue de
leur utilisation en alimentation du bétail. Rev. Energ. Ren.: Production et Valorisation-Biomasse, 59-64.
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 51 Année universitaire : 2016-2017
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEF23: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF231 : Valorisation des Microorganismes Photosynthétiques
VMPH-MV33
Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement :
Développement de produits innovants, issus des micro-algues et de la biotechnologie, dans les domaine cosmétique, nutraceutique, et pharmaceutique. • Notre motivation est l’actuelle tendance de substituer les composants synthétiques par des produits naturels. • Cette tendance s’explique d’une part, par l'augmentation de la demande du consommateur pour des produits naturels pour des impératifs sanitaires, écologiques et environnementaux et d’autre part, par l'évolution de la législation qui vise à favoriser les produits naturels par rapport à ceux de synthèse.
Connaissances préalables recommandées Microbiologie, parasitologie, biostatistiques, méthodologie de la recherche, biologie moléculaire.
Contenu de la matière : En présentiel: Micro-organismes photosynthétiques Cyanophycées Les macroalgues croissent en mer peu profonde ou en zone lagunaire. Leur production intentionnelle est peu adaptée aux rivages méditerranéens qui ne disposent pas des plateaux continentaux nécessaires à leur fixation. Par contre, les « malaïgues » (anoxie du milieu par excès de productivité photosynthétique) des étangs sont causées par la prolifération de macroalgues dont le prélèvement contrôlé constitue une source de matière valorisable pour la chimie et la production de biogaz par méthanisation. Les microalgues quand elles, prolifèrent dans tous les milieux aqueux, doux ou salés, pour autant qu’elles aient accès à de la lumière, du CO2 et des nutriments à consommer. Cette ressource, en général non visible à l’œil nu mais pourtant bien présente, constitue un formidable capteur solaire capable de convertir du CO2 en matière à haute valeur énergétique et alimentaire avec des rendements bien supérieurs à ceux des plantes terrestres. Mais leur culture à grande échelle n’en est qu’à ses balbutiements et leur exploitation encore essentiellement centrée sur des usages cosmétiques et nutraceutiques. Cependant les microalgues sont riches en composés pouvant être utilisés comme :
carburant (30 à 40 % d’huiles), nourriture pour l’aquaculture (protéines), synthons pour la chimie, matière de base pour la pharmacie et la cosmétique (oméga-3, béta-carotènes…)
Travaux Pratique :
Sur quelques exemples d'algues bleu vertes
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Algues thalophytes Travail personnel : Chaque étudiant doit préparer un petit exposé Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'interrogations, la présentation des exposés au cour des scéances de TD...etc + 20 % sur le travail personnel, le manuscrit de l'exposé)) Références : - Zubia Arrieta, M. (2003). La valorisation industrielle des algues brunes invasives (fucales) de Polynésie française: étude prospective pour lutter contre leur prolifération et contribuer à la gestion durable de l'environnement récifal(Doctoral dissertation, Université de Polynésie française). - Arzel, P. (1994). L'exploitation des algues en Bretagne. Études rurales, 113-126. - Delepine, R., Gaillard, R., & Morand, P. (1988). Valorisation des algues et autres végétaux aquatiques.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEF23: Fondamentale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEF232 : Phytochimie et Valorisation des Biomolécules PHVB-MB34 Crédits : 4
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Connaître les principales familles structurales des métabolites secondaires d’origine
naturelle, leur biogenèse et les relations structure-activité majeures associées à ces
dernières.
Appréhender les principales méthodes qui permettent de repérer et de valider les
propriétés de ces molécules bioactives (intérêt pharmaceutique, cosmétique ou
agronomique).
Présenter quelques exemples précis de ces molécules, de leurs sources (algues, lichens,
champignons, plantes médicinales, cultures cellulaires…) et de leurs applications.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire
Contenu de la matière
En présentiel :
Utilisation traditionnelle des plantes
- en médecine
- en cosmétique
- en agroalimentaire
Métabolisme secondaire :
o Définition, les différentes voies biosynthétiques, les grandes familles structurales de
produits naturels…
o Métabolisme et régulation
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 53 Année universitaire : 2016-2017
o Organisation spatiale et compartimentation du métabolisme.
o Ingénierie métabolique.
Métabolites secondaire d’intérêt pharmaceutique ou cosmétique :
o Criblage biologique : Choix/définition des cibles thérapeutiques et du matériel
végétal, méthodologie d’évaluation…
o Identification des produits naturels : Application des différents outils de l’analyse
spectroscopique (IR, UV, RMN, SM…) à la caractérisation structurale des
métabolites secondaires.
o Exemples de molécules bioactives isolées de quelques espèces végétales en
Algérie
Travaux pratiques
Les travaux pratique proposés (aux choix de l’enseignant):
Procédé d’extraction des huiles essentielles par hydro distillation.
Procédé d’extraction par solvants organique
Identification de la composition par CCM Travail personnel : Préparation des exposés sur les plantes médicinale, médecine traditionndelle, phytotérapie, métabolisme secondaire, activité biologiques des substances d’origine végétale…etc Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, compte rendus des TP...etc ) + 20 % sur le travail personnel
Références
- Juen Bruneton, 9009. Pharmacognosie Phytochimie, Plantes médicinales. Tec & Doc
Lavoisier, 1269 pages.
- Jean-Jacques Macheix,Annie Fleuriet,Christian Jay-Allemand. 2005. Les composés
phénoliques des végétaux:Un exemple de métabolites secondaires d'importance
économiquePPUR presses polytechniques, 192 pages.
- Abayomi Sofowora. 2010. Plantes médicinales et médecine traditionnelle d'Afrique.
KARTHALA Editions, 378 pages.
- Bernard Boullard. 2001. Plantes médicinales du monde: croyances et réalités. De
Boeck Secundair, 660 pages.
- Jacques Fleurentin, Jean-Claude Hayon. 2008. Plantes médicinales: Traditions et
thérapeutique. Ouest-France, 189 pages.
- Guy Gilly. 1997. Les plantes à parfum et huiles essentielles à Grasse: botanique, culture, chimie, production et marché. Editions L'Harmattan, 428 pages
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 54 Année universitaire : 2016-2017
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEM13: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM131 : Méthodologie de la Recherche Scientif ique MRSC-MB35 Crédits : 6
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement
Cette matière s’adresse permet aux étudiants d’avoir une première idée de ce que peut
être un travail de recherche. Cette matière permet aux étudiants de se familiariser au
milieu de la recherche, de la pratique de laboratoire (élaboration d'un protocole,
compétences techniques, analyse de résultats) à l'étude bibliographique (recherche,
analyse, synthèse). En outre, la formation leur permettra d'aborder de manière autonome
la présentation des travaux de recherche sous forme de mémoire écrit et de présentation
orale structurée.
Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire, statistiques et informatique, anglais
Contenu de la matière
En présentiel :
Mise en place des groupes par les enseignants, choix et distribution des articles, les groupes devront à partir d’un article publié environ 5 ans auparavant :
-Mener une étude bibliographique permettant de replacer le sujet "historiquement" c’est à dire retrouver les articles antérieurs sur le sujet
- Faire des recherches bibliographiques pour comprendre le rationnel des méthodes et stratégies employées dans l’article,
- Rechercher les suites données à cet article dans la littérature (confirmation ?, infirmation?)
-Les groupes devront commencer à préparer leur présentation orale, qui aura lieu sous la forme d’une présentation de 20 minutes suivie de questions posées par les enseignants et les autres étudiants.
- Choix d’un thème de recherche qui sera le sujet de mémoire de fin d’étude du dernier semestre. -Définition de la stratégie expérimentale.
Travaux pratiques : L'étude des exemples pratique de travaux de recherche. La conception d'un dispositif expérimentale A cette fin les étudiants seront regroupés par trois ou quatre afin d’appréhender la notion de travail d’équipe. Travail personnel : Présentation d'un travail de recherche sous forme d'un petit document (10 page max.) et une présentation orale structurée. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, 20% travail personnel) Références
- Galiana, D. (2002). L'approche expérimentale en biologie: améliorer sa pratique d'enseignant. Educagri Editions.
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 55 Année universitaire : 2016-2017
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UEM13: Méthodologique (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UEM132 : Ecosystème Oasien ECOA-MV36 Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
- Découverte de l’écosystème oasien : par des visites des oasis de la région soit de
Biskra (Ziban) ou d’autres régions phoenicicoles
- Découverte de la végétation et les variétés des dattes, la faune, les facteurs et les
interactions, le savoir et le savoir faire, les techniques d’irrigation et de production…)
L’étudiant peut après cette découverte synthétiser un travail personnel ou de
groupe (rapport).
Connaissances préalables recommandées
Cytologie, histologie, biochimie et immunologie, Biochimie, biophysique, microbiologie,
immunologie, chimie organique et minérale, immunologie, biologie cellulaire, biologie
animale et biologie végétale. Génétique, Biologie moléculaire
Contenu de la matière
En présentiel :
- Découverte de l’écosystème oasien :
- La végétation dans les oasis (cultivée ou spontanée)
- La faune dans les oasis (insectes animaux et autres)
- Les interactions à l’intérieur de cette communauté
- Les facteurs qui influencent sur ce système
Facteurs biotiques
Facteurs abiotiques
- Les techniques culturales pratiquées dans les oasis
Traditionnelles
Moderne
- Le savoir et le savoir faire des population dans les oasis (production, stockage,
transformation …) Les sous produits de palmier dattier
En alimentations
En menuiserie
- Le rôle de l’homme dans ce système
- La valeur historique et économique et sociale de l’oasis
Pour cela : l’étudiant doit visiter les oasis soit à titre individuel ou en groupe dans des sorties
organisées et il doit préparer un travail personnel (individuel ou de groupe)
Sortie de terrain : dans les régions phoenicicoles de différents aspects (les oasis des montagnes, oasis sahariennes Ziban, Oued Righ et Oued Mizab. Le but est de voire in situ le fonctionnement des oasis surtout traditionnelles Travaux pratiques :
- Hématocrite et caractéristiques physiologique du plasma
- Colorations et mise en évidence des éléments figurés
- Diversité érythrocytaires et leucocytaire chez les animaux
- Variation des paramètres sanguins suite à une parasitose.
- Et d'autres techniques
Travail personnel :
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 56 Année universitaire : 2016-2017
Un travail personnel est demandé sur les sujets abordés dans le cours ou dans les TP, la nature de ce travail et le mode doivent être discuté dans la première réunion du commité pédagogique au début de semestre. Mode d’évaluation : 60% examen final, 40% continue (20% sous forme d'examen de TP, 20% travail personnel) Références
- DUBOST, Daniel. 2002. Ecologie, aménagement et développement agricole des oasis
algérienes. Edition CRSTRA, Alérie. 423 p.
- Munier, P. 1973. Le palmier dattier. G.-P. Maisonneuve et Larose, Paris. 217p.
- PEYRON, Gilles. 2000. Cultiver le palmier dattier. Editions Quae. 112p.
- RHOUMA, Abdelamjid. 2005 Le Palmier Dattier en Tunisie: I. Le patrimoine génétique -
Volume 2. IPGRI. 2580p.
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : UED13: Découverte (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UED131 : Anglais Scientifique II ANG2-MB37 Crédits : 2
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
Cette matière donne aux étudiants les outils nécessaire pour l'analyse et la compréhension des articles scientifiques en sciences biologiques surtout en biologie animale et parasitologie. Connaissances préalables recommandées
Biochimie, biophysique, microbiologie, immunologie, chimie organique et minérale,
immunologie, biologie cellulaire, biologie animale et biologie végétale. Génétique, Biologie
moléculaire. langue
Contenu de la matière
En présentiel :
I. ETUDE DE TEXTES SCIENTIFIQUES REDIGES EN ANGLAIS IL est recommandé de choisir des textes types surtout les articles scientifiques répondant aux différentes spécialités des sciences biologiques Et de préférence des différentes matières enseignées au cours de ce master II. TRADUCTION DE TEXTES SCIENTIFIQUES DU FRANCAIS A L’ANGLAIS III. UTILISATION DE L’OUTIL INFORMATIQUE POUR LA TRADUCTION (LE WEB) Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 100% examen final, Références
- Cargill, M., & O'Connor, P. (2013). Writing scientific research articles: Strategy and
steps. John Wiley & Sons.
- Svensson, C. J. (2001). Doing Science Design, Analysis and Communication of
Scientific Research. Pacific Conservation Biology, 7(3), 219-219.
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 57 Année universitaire : 2016-2017
- Martin, B., et Tony, D. E., 1983, Nucleus English for science and technology
(General Science part II). Longman.
- Thomson, A. J., et Martinet, A.V., 1993, A practical English Grammar. Low Priced
edition.
- Michael, S., 1984, Practical English Usage. Oxford University Press.
- Kristine, B., et Susan, H., 2003, Writing matters. Cambridge.
- http://www.dictionary.com/
- www.bbclearningenglish.com
Intitulé du Master : Biotechnologie et Valorisation des plantes
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : UET13: Transverale (Obligatoire)
Intitulé de la matière : UET131 : Entreprenariat ENTR-MB38 Crédits : 1
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement
Sensibiliser des biologistes au monde de l'entreprise en leur apportant de solides connaissances en gestion, marketing et communication. Cette matière comporte un projet tuteuré baptisé projet " Cyber " qui consiste à créer une entreprise virtuelle dans le domaine de la biologie (végétale, animale, santé humaine, agroalimentaire). Le projet réalisé est soutenu devant un jury d'universitaires et d'industriels. Initier l’apprenant au montage de projet, son lancement, son suivi et sa réalisation. Connaissances préalables recommandées
Notions en sciences biologique, maths, statistiques et informatique et Ensembles des contenus de la formation Compétences visées :
o Compréhension de l’organisation et de fonctionnement d’une entreprise o Capacité à monter un projet de création d’entreprise o lancer et à gérer un projet o Capacité à travailler méthodiquement o Capacité à planifier et de respecter les délais o Capacité à travailler en équipe o Capacité d’être réactif et proactif
Contenu de la matière
En présentiel :
Partie I
1. L’entreprise et gestion d’entreprise o Définition de l’entreprise o L’organisation d’entreprise o Gestion des approvisionnements :
- Gestion des achats, - Gestion des stocks - Organisation des magasins
o Gestion de la production : - Mode de production, - Politique de production
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 58 Année universitaire : 2016-2017
o Gestion commerciale et Marketing : - Politique de produits, - Politique de prix, - Publicité, - Techniques et équipe de vente
2. Montage de projet de création d’entreprise o Définition d’un projet o Cahier des charges de projet o Les modes de financement de projet o Les différentes phases de réalisation de projet o Le pilotage de projet o La gestion des délais o La gestion de la qualité o La gestion des coûts o La gestion des tâches
Partie II Fonctionnement de l’entreprise innovante 1. Création d'entreprise (" entrepreneurship ") Les bases de la création d'entreprise, le parcours du créateur, l'approche du marché, le marketing selon MacKenna, les obstacles psychologiques, le montage juridique et financier, témoignages de créateurs sous forme de conférences 2. Gestion Savoir lire un bilan, un compte d'exploitation à travers des études de cas, quelques bases de comptabilité
3. Marketing stratégique et opérationnel Démystifier le marketing, les différentes formes de marketing accompagnées d'études de cas dans les domaines de l'agrochimie et de la semence 4. Management de l'innovation L’entreprise innovante, l'importance du brevet, le transfert de savoir-faire, la valorisation de la recherche 5. Communication scientifique Vulgarisation de l'information, veille technologique et concurrentielle, formation 6. Gestion des ressources humaines et sociologie de l'entreprise Les différents types de management, la culture d'entreprise, le recrutement et l'évolution de carrière, la PME opposée à la multinationale
1. Quels sont les enjeux de la qualité ? 2. La qualité et le management 3. Communication et ressources humaines Le management des hommes L'invention du management La motivation positive et négative au travail Le pouvoir et les formes de leadership Qu'est-ce que la gestion des ressources humaines ? Le développement des ressources humaines Le recrutement
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 59 Année universitaire : 2016-2017
La gestion des carrières L'évaluation La formation et le « coaching » La gestion prévisionnelle des emplois et des compétences Les rémunérations Le temps de travail Les risques professionnels L’amélioration des conditions de travail, les relations sociales et syndicales
4. Gestion d'entreprise
Les différentes fonctions de gestion dans l’entreprise 11. gestion de projet
Travail personnel : Pour cette matière et vue les charges importantes sur l'étudiant, il est recommandé de laisser la décision au cours de la première réunion du comité pédagogique et discuter s'il est nécessaire de demander et d'évaluer un travail personnel de l'étudiant ? Mode d’évaluation : 100% examen final, Références - Caroline Andréani. 2007. Comment créer son entreprise. Editions l'Etudiant, 219 pages - . Francois Cazalas. 2011. Diriger une entreprise innovante: Joies et tribulations du
métier d'entrepreneur. Eyrolles, 7 juil.122 pages - Dominique Pialot. 2006. Créer son entreprise. Groupe Express Editions, 1 janv. 127
pages - Séverine Le Loarne, Sylvie Blanco. 2012. Management de l'innovation. Pearson
Education France, 410 pages
Etablissement : Université Mohamed Khider-Biskra Intitulé du master : Biotechnologie et Valorisation des plantesPage 60 Année universitaire : 2016-2017
V- Accords ou conventions
Oui