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Homo neanderthalensis
The Audacity Of Dream… Dream it… Do it!
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CVD
Interactions Gènes & Environnement etconséquence sur la santé humaine
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Effet environnemental
Composante génétique
Les mutations ponctuelles
Les anomalies chromosomiquesConstitutionnelles et acquises
LES ALTÉRATIONS DU GÉNOME
« Finished » sequence April 1953-April 2003
February 2001
First genome revolution: the human genome sequence
Second genome revolution:Next Generation Sequencing
6
1. “First Human Genome”
$3,000,000,000 + 15 years
2. Celera genome (a.k.a. J. Craig Venter)
$100,000,000 + 0.75 years (9 months)
3. Jim Watson’s genome
$900,000 + 0.17 years (2 months)
4. 1000 $ genome
$1,000 + 0.0002 years (0.1 day)
5. "next next-generation" machines
•Helicos Biosystems machine can sequence human genome in 1 hour (2009).
•Pacific Biosciences machine can sequence human genome in 30 minutes (2010).
Mathématiques Statistique
InformatiqueSéquences et données biologiques
Bio-informatique
Les compétences en informatique pour les biologistes et en biologie pour les
informaticiens?
Oxford Nanopore Technologies (MinIon and GridIon)Disposable « flashdrive » machine>$900 – sequence human genome in 15 minutesNo DNA preparation
Les avancées technologiques continuent!
Ken McElreavey, 2012, Genomedika
La Médecine 4P
fumeur, agent d’assurance,
75% de risque d’avoir un Alzheimer
C’est un
garçon
GENOMEDIKA?
Reinforcing IPT capacities in Genomic Medicine and Non Communicable Diseases Investigation and International Cooperation
Start Date: December 1st, 2011Project duration: 30 months.Grant Agreement N°: 295097
FP7 INCO 2011-6.2
WP 1 : Management & Coordination
WP5 : Développement du Business Plan de l’IPT
WP4 : Communication
WP3 : Projets Pilotes
WP2 : Développement de modules de formation
• Equipe multidisciplinaire,
• Expérience reconnue dans le domaine des maladies non transmissibles
• Opérant Activement à l’échelle nationale et régionale à travers un vaste réseau de collaborateurs
Forces
Faiblesses
Opportunités
Menaces
Analyse SWOT de GENOMEDIKA
• Capacité insuffisante (infrastructures et compétences) aux besoins de la génomique, bioinformatique et biostatistique
• Ascension de la génomique biomédicale
• Demande croissante, à l’échelle mondiale, du diagnostic génétique
• Instabilité et dispersion des ressources
>80 Participants (46 IPT)
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GENOMEDIKA-CSE 5th April 2013
20
Bioinformatic training and consortium meeting 03/13
6+3 Participants IPT
Business Unit : Diagnostic
Business Unit :Bioinformatique
Business Unit :Support au montage de projet (RDI / ONG)
Business Unit: Formation
Création de nouveaux emplois
Business Plan de Genomedika
SMART
Capitalisation
Team work
Networking
Proactive
By Genomedika™
Le matériel pédagogique de la classe
JS Kim et al. Nature 000, 1-6 (2014) doi:10.1038/nature13240
EyeWire combines crowd and artificial intelligence.
“Scientifiques citoyens”
Together, we will make it happen!Merci pour votre attention
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The Audacity Of Dream… Dream it… Do it!