INFORMATION ET DONNEE

COURS 2

ACTIVITE HUMAINE

Recherche scientifique

Médecine Informatique

OBSERVATIONMesures

Rassemblement de données de

patients

Introduction de données

RAISONNEMENTRédaction de la

théorieEtablissement de

diagnosticTraitement de données

ACTION ExpérimentationDéveloppement de

la thérapieAcquisition de résultats

1. L’OBSERVATION / RASSEMBLEMENT DES DONNÉES DE PATIENTS:

SOURCES

L’histoire de le patient

Les données physiologique ou de biochimie

L’enregistrement des signales biologiques

DIFFICULTES

Des réponses incomplètes ou incorrectes

Des erreurs dans les analyses de biochimie; des bruits

pendant l’enregistrement des bio signalés

L’impossibilité d’obtenir les données par procédures non

invasives

Les procèdes analysées sont instables ou en évolution

PRÉCISION Le rassemblement des données en usant des plusieurs différent sources

Le rôle de I.M.: Assiste le

docteur pour obtenir les données

nécessaires et fournie des

méthodes de décision pour optimiser ce

procès; il garde la qualité de fait médical, mais il

réduit les inconvénients

pour le patient.

2. RAISONNEMENT / DIAGNOSTIC

L’UTILITE DE L’ORDINATEUR: l’établissement de cette partie de diagnostic qui nous pouvons structurer et généraliser avec des méthodes scientifiques et précises; l’identification des informations de littérature concernant des situations similaires et des listes avec des suggestions possible.

Le docteur a l’entière responsabilité pour son diagnostic.

3. ACTION / THÉRAPIE

L’UTILITE DE L’ORDINATEUR :

dans quelque domaines: la surveillance de la thérapie: le contrôle

d’administration des médicaments la surveillance des patients dans les

sections de thérapie intensive l’administration de radiothérapie

l’analyse des quantités étendues des données provenant de les patients, avec l’objet d’obtenir des données nouvelles par induction („DATA MINING”): épidémiologie, l’assistance de la décision, recherche médicale.

INFORMATION ET COMMUNICATION

Chacun procède de transmission des données médicales nécessite l’existence d’une source / émetteur (le patient), d’un récepteur (le docteur) et d’un canal de transmission entre ceux-ci.

EMETTEUR RECEPTEURCANAL DE

TRANSMISSION

BRUIT / DISTORSIONS

Des exemples de procédés de communication:

Les ultra-sons;L’imagerie médicale;La transmission wireless;La transmission par langage naturel;Les signaux biologiques.

LA NOTION D’INFORMATION

3 aspects

SYNTAXIQUE

- La grammaire et la syntaxe nécessaire pour la description, le stockage et la transmission des messages.

- L’aspect syntaxique de l’information est dépendant de son porteur – le langage spécifique, l’image ou le signal biologique

- L’aspect pur syntaxique de l’information = DONNEE

SEMANTIQUE Le sens du message – ne dépend pas du mode de captage de l’information ou de syntaxe utilisée.

PRAGMATIQUE

- Les actions qui suivent le procédé d’interprétation de l’information et l’objet de l’interprétation – dans médecine : l’effet de l’information sur la thérapie ordonnée.

Généralisation: Quand nous travaillons avec n événements avec les probabilités d’apparition pi, ou , I =

La définition mathématique d’information –

CLAUDE E. SHANNON (1916):

Le contenu d’information d’un message qui affirme que un événement fait son apparition avec une probabilité p est I = -log2p, ou 0 <=p<=1 (I exprimait dans bytes).

.

1 ip ii pp 2log

L.M. BRILLOIUN:

N. WIENER:

L’information est une fonction pour la relation entre les réponses possible avant et après la réception d’un message.

L’information est un nom pour le contenu qui est change avec le monde quand nous faisons des modifications et profiterons de ces modifications.

LA NOTION DE DONNEE

LES PRINCIPAUX TYPES DE DONNÉES:

ENTIER• Des nombres avec des valeurs

discrètes

REEL• Des variables mesurables

CODES• Douleur, diagnostic, médicaments

TEXTE – LANGAGE NATURELL’histoire du patient, le traitement recommandé, des procédures de chirurgie, crise, la description des événements pendant la surveillance du patient

DIFFICULTE: LA CODIFICATION DE L’ INFORMATION – les codes utilisés pour un médicament, une maladie ou une thérapie sont défini intégral par le docteur et sont choisi après des critères subjectifs et non universels. La codification des observations personnelles (des sensations, la douleur) est très difficile et très subjective ou totalement impossible – dans certaines situations le texte est la seul modalité d’enregistrement de l’information.

LES CARACTÉRISTIQUES DES DONNÉES:

COMPLETUDE:

EXACTITUDE:

LES DONNÉES INCOMPLÈTES peuvent conduire à des situations d’incertitude. Dans les dossiers médicaux n’est pas toujours évident LA RAISON des données manquantes : pas pertinent, manquant ou normal (et ne sont enregistrées que des anomalies). Le docteur qui enregistre les données habituellement connait cette raison.

EXACTITUDE:

RESPECT:

La mesure du taux d’erreurs d’un ensemble de données

3 types d’erreurs de mesure :• Erreurs systématiques: du processus par lequel la mesure est effectuée;• Erreurs statistiques: un processus dynamique qui est mesurée dans son développement;• Erreurs dans la lecture: ont également des caractéristiques systématique et statistique.

L’établissement de normes ou de systèmes de classification pour l’enregistrement des données et automatiquement l’obligation de suivre les règles et les définitions spécifiques pour choisir le code correct.

PRECISION:

CODAGE:

LANGAGE NATUREL:

LES CARACTÉRISTIQUES DES DONNÉES :

Le niveau de raffinerie utilisé pour exprimer une mesure.

L’utilisateur doit d’abord interpréter les données, puis associer un code – l’apparition des erreurs d’interprétation est inhérente.

Il limite automatiquement le domaine de valeurs des données – AVANTAGE

Il demande la normalisation de la terminologie - Transférabilité

la plus grande liberté dans l’expression de détails

inhérente non-standard - traitement informatique difficilemal structuré - de multiples interprétations - peut conduire à

des erreurs d’interprétation (qui ne peuvent pas être détectées par l’ordinateur)

L’interprétation humaine devrait être évitée autant que possible dans l’exercice de la documentation sur un patient.

TRAITEMENT DES DONNÉES3 ETAPES: mesure et entrée traitement; générer des résultats.

Par la suite, les résultats sont interprétés par le médecin et sont transformés en informations.

CLASSIFICATION ET CODIFICATION DES DONNEESLa condition essentielle pour assurer la compatibilité des données est qu’elles sont enregistrées d’une manière cohérente et normalisée.

Classification des données

Les expressions obtenues à partir des dossiers des patients sont introduits dans un système bien défini de classes construites sur la base de critères strictes. La profondeur et la structure du système de classification dépend du but pour lequel il a été conçu. Il fera appel à une terminologie standard:

ISO – International Standards CommissionIEC – International Electrotechnical CommissionCONDITIONS requises pour obtenir un classification:

• Exhaustivité du domaine;• Catégories mutuellement exclusives;• Le classement doit être adapté à son objet;• Classement homogène (chaque niveau, en partie);• Des critères précis pour caractériser les bords des

classes;• Définition d’un ensemble complet et sans ambiguïté des

règles d’application;• Utilisation d’un niveau approprié de détails.

CODIFICATION DES

DONNEES

C’est le processus d’introduction d’un objet ou d’un cas individuel dans une classe ou un système de classes. La codification est l’interprétation des propriétés d’un objet. Les codes peuvent être constitués de chiffres, de lettres ou les deux.

TYPES DE CODES:

Codes numériques

- Assigné séquentiel ou aléatoire;

- Nous pouvons réserver des séries de nombres

Codes mnémotechnique

s

- Constitué d’un ou plusieurs caractères correspondants aux classes d’adhésion;- Utilisé quand il y a un nombre limité de classes

Codes avec une hiérarchie

- Obtenu en prolongeant le code existant par un ou plusieurs caractères pour chaque niveau de détail supplémentaire

Codes de juxtaposition

- Codes complexes composée de segments, chaque segment est associé à la classe caractéristique

Codes de combinaison

- La classification des actes médicaux utilisant un principe d’ordre: l’action, l’équipement, la fonction anatomique, l’emplacement

Codes pour ajouter de

valeurs

- Pour représenter une classe sont utilisées seulement les puissances de 2. Au lieu de segments, pour chaque caractéristique est utilisée un numéro.

Codes numériques

Sexe: 1 – male2 – femelle

Antécédents personnels pathologiques:1 – maladies cardio-vasculaires2 – maladies respiratoires3 – maladies intestinaux4 – maladies du foie5 – maladies du rein6 – maladies urologiques7 – maladies des organes génitaux8 – maladies ostéo-articulaire9 – maladies métaboliques

Codes mnémotechniqu

es

Antécédents personnels pathologiques:CV – maladies cardio-vasculairesRES – maladies respiratoiresINT – maladies intestinauxFO – maladies du foieRE – maladies du reinURO – maladies urologiquesOG – maladies des organes génitauxOA – maladies ostéo-articulaireMET – maladies métaboliques

Codes avec une hiérarchie

K70) Maladies alcooliques du foie (K70.0) Cirrhoses alcoolique graisseuse(K70.1) Hépatite alcoolique (K70.2) Fibrose et sclérose alcooliques(K70.3) Cirrhose alcoolique(K70.4) Insuffisance hépatique alcoolique (K70.9) Maladie alcoolique, sans précision

Codes de juxtaposition

ICD

Chap

Codes Titre

I A00-B99Certaines maladies infectieuses et parasitaires

II C00-D48 Tumeurs

III D50-D89Maladies du sang et des organes hématopoïétiques et certains troubles du système immunitaire

IV E00-E90Maladies endocriniennes, nutritionnelles et métaboliques

V F00-F99 Troubles mentaux et du comportement

VI G00-G99 Maladies du système nerveux

Codes pour ajouter de

valeurs

Nous codifions la présence / absence de quelque facteurs de risque pour une maladie: café, alcool, tabac, drogues, facteurs environnementaux:

20= 1 - consommateur de café / 0 – ne consume pas21 = 2 - consommateur d’alcool / 0 – ne consume pas22 = 4 - consommateur de tabac / 0 – ne consume pas23 = 8 - consommateur de drogues / 0 – ne consume pas24= 16 – facteurs environnementaux

présentes / 0 – absents

Nous faisons l’addition de ces valeurs, résultant dans des codes numériques pour chaque combinaison possible des 5 facteurs de risque:1 + 0 + 0 + 0 + 0 = 1: consommateur de café 1 + 0 + 4 + 0 + 0 = 5: consommateur de café et de tabac1 + 2 + 0 + 8 + 0 = 11: consommateur de café, d’alcool et de drogues

Taxonomie (LINNAEU): Science qui traite de l’étude théorique de classification, y compris ses principes fondamentaux, règles et procédures – LA SCIENCE DE CLASSIFICATION.

Nosologie: La science de classification des maladies (ou la taxonomie des termes de diagnostic).

Nosographie: La science de description des maladies.

1. ICD – International Classification of Diseases

2. ICPC – International Classification of Primary Care

3. DSM – Diagnostic and Statistical Manual for Mental Disorders

4. SNOMED – Systematized Nomenclature of Human and Veterinary Medicine

5. ICD - O – International Classification of Diseases for Oncology

6. CPT – Current Procedural Terminology

7. ICPM – International Classification of Procedures in Medicine

8. RCC – Read Clinical Classification 9. ATC – Anatomic Therapeutic Chemical Code

10. MeSH – Medical Subject Headings 11. DRG – Diagnosis Related Groups

SYSTEMES DE CLASSIFICATION :