Information scientifique BICH 4033 Séminaire avancé en biochimie 2009 1 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

Information scientifique

BICH 4033

Séminaire avancé en biochimie

2009

12009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

Recherche bibliographique

Trouver l'information permettant de comprendre et rédiger le travail


STRATEGIE SUGGEREE

Prendre connaissance du sujeto

Manuel de courso

Article de vulgarisation (“review”)

• Scientific American, La Recherche, etc.oS

ites web

info de base pour comprendre le sujet

figures (introduction séminaire ou travail écrit)

mots clé (pour faire la recherche bibliographique)


STRATEGIE SUGGEREE - suite

Approfondir le sujetoA

rticles de synthèse • Annual Rev. Biochem

• Trends Biochem Science

➔ info pour aller plus en profondeur

➔ comprendre articles originaux (primaires)

➔ mots clé


STRATEGIE SUGGEREE - suite

Repérer les références originales (primaires)o

Notées lors des phases précédenteso

Recherche dans les banques de données• SciRUs, Pubmed

➔ info servant à rédiger le travail et présentation

➔ figures ( Googles - image)

2009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique 5

Références originales (primaires)

o définition

• Article de recherche ou une idée, une observation, un fait, etc. a été mentionné pour la première fois = référence originale

o importance

• Permettre au lecteur de retracer et évaluer l’info et son origine

• Souligner la contribution du/des auteur/s


BANQUES DE DONNEES

o Sources

• générales

• journaux spécifiques

• éditeurs de journaux spécifiques

oBanques informatisées

• Documents physiques (écrit, CD, etc.)

• Web <= plus faciles à employer et à consulter


BANQUES DE DONNEES INFORMATISEES - suite

o Recherche

• sujet (sans/avec combinaison)

• auteur

• institution

• journal

• restriction: années, langue


Banques plus employées: SCIRUS

SCI R USo

http://www.scirus.com/o

combine 3 principaux: Pubmed + Science Direct (Elsevier) +

o


http://www.scirus.com/























SCIRUS: recherche simple

o choix des sources (journaux scient vs web vs sites scient. spécialisés)

o sujet, auteur,o expression (guillemets), AND, ORo triage par date ou pertinenceo "refine”o "save result"


SCIRUS: recherche avancée

o sujet (sans/avec combinaison)

o auteur

o journal

o années


SCIRUS: documents repérés

o Article scientifique

o Pubmed ou science direct

o pdf

o enregistrer image


Recherche d’articles de synthèse

oSources• Annual Review of…

• Trends in…

• Certains journaux primaires (JBC, Cell,….)

oRepérage• Site de la revue elle-même (Ann. Rev.)

• Science Direct (Trends in…,


Plagiat

oVoir le réglement de l’Université

o“copier-coller”

oSimple traduction intégrale


Citation

oNécessité de citation

oCitation intégrale vs mention

oLimites

oconcensus scientifique


Citation: aspect légal et moral

droits d'auteur et copyright © (C)

"fair use"

universités et institutions de "haut savoir" => recherche et enseignement

libertés non accessibles aux institutions commerciales ou privées (but lucratif ou non)

pas de distribution à l'extérieur ou pour des fins commerciales


o Usage individuel• non commercial

• académique

opermissions


Emploi d’une illustration

tableau,image, photo d'un article scientifique "non commercial" (électronique ou papier) => mention

tableau ou image d'une source sans copyright © => mention

tableau ou image d'une source publique avec mention de © => mention

tableau ou image d'une source privée avec © commercial => permission (avec/sans $$$)


Citations et références

o les faits doivent être appuyés par la littérature: références primaires (publication dans des revues arbitrées)

oau fur et à mesure

oles citations doivent se rapporter à la section référence

opas de notes infrapaginales (“footnotes”)



TypesoI

ntégrale: le texte est cité tel quel• Facile à identifier

taille et styles des caractères, marges

• Peu employée en sciences fondamentales

Vs

oparaphrase



Citation intégrale – exemple

D’après Scaggs et al

“The association of TPR with some RNAs is promoted by its

interaction with the mRNA-binding protein Nab2P.”

Ce type de régulation s’est cependant révélé restreint à certains types cellulaires transformés en culture.


Citation intégrale vs périphrase

Autre exempleLa principale objection de Garawick est qu’

" Il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionel dans l'analyse cette forme hautement complexe du comporement socio-affectif »

Garawick 2004

Ceci a toujours poussé les chercheurs vers un paradigme de type structural, d'autant plus...

=========Puisqu'il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionnel

(Garawick, 2004), les chercheurs ont surtout employé un paradigme de type structural dans l'analyse du comportement socio-affectif…..


Citation et références

Liste des référencesoL

iste de références non pas une bibliographieor

éférences originales (primaires)on

om de la revue: employer les abréviations correctesof

ormat consistantof

aire les citations dans le texte


Format numérique

oavantage: simple à faire, peu de place

oinconvénient: il faut tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute

ocitation dams le texte


Format numérique - exemple

Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (3) et possèdent deux sous-unités identiques (3,4).

Référence dans la liste :1) K. Zolber (1995)……….

2) U. Premolli, G. von Rastapovitch et T. Kwan (2004)…

3) P. Delbert et A. Schulz (2002)......

4) A Schulz et A Capp (2007)…

5) Z. Alberts, P. Minard, Z. Palmer et K. Zolber (1999)…


Format alphabétique

oavantage: pas besoin de tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute

oinconvénient: un peu plus complexe à faire, plus de place• 1 auteur: citer auteur + année

• 2 auteurs: cite les deux auteurs avec " ... & ... " (+ année)

• 3 et plus: cite premier auteur + " et al."


Format alphabétique - exemple

Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (Delbert et Schulz (1992) et possèdent deux sous-unités identiques (Delbert et Schulz, 2002; Schulz et Capp, 2000)

Liste des références:Z. Alberts, P. Minard et K. Zolber (1999)….

B. Bernard, D. Delbert et E. Emilio (2003)…

P. Delbert et A. Schulz (2002)......

A Schulz et A Capp (1990)…


Format alpha numérique

oavantage: peu de place, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute,

oinconvénient: un peu plus complexe à faire, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute


Format alpha-numérique (exemple)

Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (5) et possèdent deux sous-unités identiques (5,23)

Liste des références:4).....

5) P. Delbert et A. Schulz (1992)...

22)……..

23) A Schulz et A Capp (1990)…

24).......


Citation et références dans ce cours

o Tous les auteurs, titre complet de l'article, pages inclusives

o Dans le format suivant:JA Sumner, KPS Turner, J Walker (2005) Effect of

trimethylammonium on puromycin-induced dissociation of rat brain ribosomes, J. Biochem. 78:7895-99.
