Janvier 2012URFIST - SCD U.Rennes 1 1 Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Maîtrise de l'information scientifique en doctorat

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Gérer ses références bibliographiquesavec Zotero

Maîtrise de l'information scientifique en doctorat


PLAN

Gérer ses références avec Zotero

1/ Les logiciels de bibliographie personnelle : une introduction

2/ Démarrer avec Zotero : installation, interface, importation

3/ Gérer ses références avec Zotero : manipuler, classer, organiser

4/ Produire la bibliographie, exporter et partager avec Zotero


Les outils de gestion bibliographique

Utilité des logiciels de gestion des références bibliographiques

• Pouvoir importer automatiquement des références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web)

• Pouvoir exploiter facilement de gros corpus de références

• Pouvoir récupérer des références lors de l’écriture d’un texte et pour établir sa bibliographie

• Pouvoir formater automatiquement des références selon les normes d’écriture et conventions en vigueur

• Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction du produit souhaité



Typologies des logiciels de gestion de références :

– Libres ou propriétaires– Gratuits ou commerciaux– En ligne ou à installer en local– Outils individuels ou de partage– Outils à forte intégration web ou outils à orientation plus

bibliographique– Outils professionnels ou plus basiques



Logiciel Accès Contenu principal

Bibsonomy http://www.bibsonomy.org/ Connotea http://www.connotea.org/

Mendeley http://www.mendeley.com/

CiteUlike http://fr.citeulike.org/

JabRef http://jabref.sourceforge.net/

Zotero http://www.zotero.org/

Outils gratuits Plateformes de partage de signets

+ références

Outils gratuits

Gestion de références

bibliographiquesEndNote http://www.endnote.com/ EndNote Web (en ligne)Reference Manager http://www.refman.com/

RefWorks http://www.refworks.com

Outils payants

Quelques logiciels de bibliographie personnelle


Qu’est-ce que Zotero ?

Version courante stable : Version 2.1.10– Annonce du 24/08/2011 :

• « Zotero Standalone »Première version beta de Zotero 3: application

indépendante du navigateur / système de connecteurs pour Safari et Chrome

– Une extension (plugin) de Firefox – Pour PC et Mac– Open source : logiciel libre et gratuit

– Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université George Mason (USA)

– Soutenu par divers organismes, dont la Andrew W. Mellon Foundation

Un outil de gestion de références et de signets http://www.zotero.org

Blog francophone : http://zotero.hypotheses.org

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Que peut-on faire avec Zotero ?

… Etc.

Bibliographie

1__________2__________3__________4__________5__________

Article avec citations et bibliographie

Pages web

Base Zotero de références et pdf

biblio en ligne, groupes


Installer Zotero pour Firefox

• Deux étapes :1. Installation du module principal

• A partir de la page http://www.zotero.org

2. Module d’intégration au traitement de texte :• Installation complémentaire du module d’interfaçage avec le traitement

de texte (Word et Open Office)

• Après l’installation de Zotero : redémarrer Firefox– Affichage de l’icône Zotero en bas à droite de l’écran (réduire ou développer)

+ Menu Outils > Zotero


Installer Zotero

• Menu « Outils > Modules complémentaires » de Firefox• Activation / désactivation• Désinstallation• Options : accès aux

préférences


Installer / activer Zotero

• Si vous utilisez simultanément deux logiciels bibliographiques :

– Utiliser les Préférences > Générales

– Décocher « Utiliser Zotero… »

– Cliquer sur « Mettre à jour maintenant »

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Récupérer et créer des références

1. Import automatique direct

2. Récupération des références d’un pdf

3. Récupération des références à partir d’un identifiant

4. Création d’une référence à partir d’une page web (signet)

5. Création manuelle d’une référence

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Récupérer et créer des références : import automatique direct

Récupération de références

• soit notice par notice• soit par lot

Exemple : Google Scholar


Récupérer et créer des références :Import automatique direct

• Récupération de lots de références


Récupérer et créer des références:Import automatique direct

• Récupération de références

Références récupérées dans Zotero


Récupérer et créer des références:Importer des références

Sites « Zotero compatibles » :

• voir http://www.zotero.org/translators • ex : ScienceDirect, Wiley, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon,

Citeseer, ACS, SUDOC …• Plateformes de partage de références comme CiteUlike• Icone dans la barre d’adresse

– Sites partiellement compatibles (ex : HAL)

– Récupération sur les sites compatibles• de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans barre

d’adresse)

• référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)Source des images :

Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier


Récupérer et créer des références :Importer des références

Exemple : Importer des références depuis JSTOR

Enregistrer un lot de références dans Zotero

Sélectionner les références à importer

Références importées

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Le cas de ScienceDirect

Selon les possibilités :

soit récupérer un ensemble de références

soit récupérer référence par référence

soit récupérer un ensemble de références par le bouton export citations sur la page de résultats



Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée


1- Glisser déposer le fichier pdf dans Zotero

2- Clic droit sur le fichier une fois dans Zotero

3- Récupérer les métadonnées du pdf

Récupérer et créer des références:Importer un fichier pdf avec ses références

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Récupérer et créer des références:Importer un fichier pdf avec ses références

Si le document comporte des métadonnées, les informations sont importées automatiquement.

Si les données sont incomplètes ou introuvables :1- saisir manuellement2- associer le pdf


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Récupérer et créer des références:à partir d’un identifiant

1- Copier le DOI

2- Ajouter un document par son identifiant


Récupérer et créer des références:Création à partir d’une page web

• Références de pages web– Import automatique OU– Création d’un élément à

partir de la page web courante (métadonnées)

– Capture d’écran– Lien vers page courante

• Choisir la collection adéquate

• Compléter les données


Récupérer et créer des références:Création à partir d’une page web

– Capturer la page courante : page figée

– Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page

– Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero

– Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)



• Créer manuellement une nouvelle référence



Entrée manuelle de nouveaux éléments et modification des éléments importés



• Modifier une référence

Modification d’un champ

Ajout de données supplémentaires



Problèmes d’import :– Pas d’icône d’import par lot dans la barre d’adresse

•Solution :– Import référence par référence

•Problème :– En cas d’échec de l’enregistrement

Ex : Dans SpringerLink (ebooks)

•Solution : – Exporter les résultats sous forme d’un fichier au format RIS, EndNote ou BibTeX– Importer ensuite le fichier dans Zotero (Action / Importer)– Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/ Refer

téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero



Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels

– Ex : formats RIS, bibteX

– Utiliser le menu Actions > Import, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique


L’interface de travail

1- Bibliothèque et ses collections

2- Liste des signets / références3- Une référence

Les tags ou marqueurs

• L’interface de Zotero : en 3 panneaux• La barre d’outils

La barre d’outils



La barre d’outils (1)

– Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)– Créer un nouveau groupe– Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie,gérer les préférences …

– Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral

– Créer un nouvel élément à partir de la page couranteà partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une

capture d’écran est liée à la notice

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Créer une référence à partir de l’identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID)

Créer une noteIndépendanteLiée à une référence

JoindreLa capture de la page couranteLe lien vers la page couranteLa copie d’un fichierLe lien vers le fichier

Localisation du document

Recherche dans la base • Recherche avancée• Boîte de recherche simple

Synchronisation des données avec le serveur Zotero

Passage en mode plein écran

Fermeture de l’interface Zotero

La barre d’outils (2)



Actions > Préférences dans la barre d’outils

1er onglet : Préférences générales



Actions >

Préférences dans la barre d’outils


Gérer ses références : classer, organiser

• Gestion de la base personnelle

– Modification de références– Gestion du texte intégral– Recherche dans la base– Tri des notices– Ajout de notes de lecture– Ajout de tags (marqueurs)– Export de la bibliothèque de références– Lien de deux notices


Gérer ses références

Onglet info = une référence complète

Onglet Notes = pour annoterla référence

Onglets Marqueurs =apposer des mots cléssur une référence

Onglet Connexe =faire un lien entre 2 éléments(référence, notes)



• Les types de référence– Menu déroulant– 34 types de

références



• Ensemble de champs pour chaque type de référence



Fonction LocaliserAfficherAfficher / Localiser le document selon son statut :

PDF, capture, lien vers la page en ligne, vers un catalogue de bibliothèque…

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• Ma bibliothèqueContient toutes les références

• Gestion des collections de la bibliothèque – Créer une collection / des

sous-collections – Nouvelle sous-collection– Renommer la collection– Supprimer la collection– Exporter la collection– Classer les références

Clic droit



Enrichir ses références : annoter ses collections de références

Afficher les tags et rechercher par

tag Ajouter un tag

Ajouter une note



Recherche dans la bibliothèque de références

Fenêtre de recherche avancée,

accessible par la barre d’outils

Possibilité d’enregistrer la

recherche


Produire une bibliographie

• Création d’une bibliographie– À partir d’une collection donnée– Formatage dans un style donné (styles par défaut +

page Repository pour les styles : http://www.zotero.org/styles )

• Passerelle avec les traitements de texte– Avec Word et Open Office– Choix d’un style – Insertion de citations– Création d’une bibliographie



Générer automatiquement une bibliographie

En utilisant le menu contextuelà partir de la collection souhaitée



Formater sa bibliographie– Utilisation des styles fournis par Zotero

Enregistrer en format RTF ou HTML

Voir dans les préférences le style par défaut





Pour chercher d’autres styles dans le répertoire de styles Zotero

Pour récupérer un style stocké en local

Choisir un style : le Gestionnaire de styles



Styles Zotero

– 15 choix de styles par défaut dans l’interface

– Voir aussi http://www.zotero.org/styles • Possibilité d’installer d’autres styles• Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien

– Pas d’interface graphique de modification ou de création de style

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Utiliser le répertoire de styles de Zotero


Produire un rapport


Utiliser Zotero dans Word ou Open Office

• Plugin spécifique pour installer la barre d’outils Zotero dans le traitement de texte

• Lié aux versions du traitement de texte



• Citer dans un traitement de texte depuis Zotero

Barre d’outils Zotero dans Word

ou OO

Editer une référence

Insérer une référence

Créer la bibliographie

Editer la bibliographie

Modifier les préférences du document

Rafraîchir l’affichage des références

Supprimer les codes



Après avoir défini les Préférences du Document …

1. Cliquer sur l’icône d’insertion2. Sélectionner la référence pour insérer la citation

1

2




Création de la bibliographie

- Pour générer la 1ère référence bibliographique correspondant à la citation- Les références suivantes sont automatiquement insérées à la suite de la citation





Utiliser Zotero en ligne

Création d’un compte sur le serveur Zotero• Accès à My Library• Groupes• Zotero People

Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero• Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte

utilisateur zotero• Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav /

ZoteroFonctions collaboratives : Zotero 2.0

• Création de groupes



Bouton de synchronisation




• Synchronisation des données

Paramétrage de la synchronisation


La bibliothèque en ligne

– Gratuit jusqu’à 100mb

– Attention : problème des PDF partagés en public




Création de groupes




• Paramétrage du groupe– Public ou privé

• Définition du groupe :– Nom et description– Statut– Disciplines concernées– Logo, image, Page web– Commentaires

• Gestion des membres• Options pour la gestion de la

bibliothèque



Un exemple : la bibliothèque du groupe Boîte à outils (pour les historiens)




Groupes Zotero




– Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis

– Réseaux de personnes

– Suivi de bibliothèques publiques par flux RSS• Ex : http://www.zotero.org/groups/non-

collaborative_research/items

Ressources Form@doct

Guide Form@doct sur Zotero :http://guides-formadoct.ueb.eu/zotero

Guide Form@doct sur les logiciels de gestion de références bibliographiques

http://guides-formadoct.ueb.eu/logiciels-gestion-references

Documents

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