labo de Microbiologie 2017 - mysite.science.uottawa.ca devoirs 20… · labo de Microbiologie 2017 Rubrique de correction pour les tableaux (Chaque cellule vaut 0.25 point) Présentation

labo de Microbiologie 2017

Devoirs Directives Générales

La première page doit inclure les informations suivantes :

Le numéro du devoir

Cote de cours : BIO3526

Votre nom ou vos noms

Votre numéro de groupe

La date

Les devoirs peuvent être faits et remis individuellement ou en groupe de deux (vous et votre partenaire). Les devoirs doivent être dactylographiés sauf pour les calculs qui peuvent être faits à la main. Les tableaux et les graphiques doivent être générés à l'ordinateur, être clairs et concis. Les tableaux et les graphiques doivent avoir un titre approprié et une légende si appropriée. Seulement que des copies papier des devoirs seront acceptées. NE PAS envoyer les devoirs par courriel. La remise des devoirs doit être faite à l'aide enseignant approprié à la date indiquée AVANT que vous ne quittiez le labo. Une pénalité de 10% par jour sera imposée sur les devoirs remis en retard (les weekends seront comptés comme une journée). Si une raison valide est donnée, telle que des raisons médicales, une exemption pour la remise de ce devoir sera accordée. Présentations PowerPoint: Utiliser le gabarit noir et blanc suivant pour vos présentations PPT. Les photos doivent être en couleur. Sauvegarder comme un fichier PDF avec une diapositive par page. Soumettre par courriel à l'adresse suivante : [email protected] Le sujet du message doit indiquer : Devoir (Numéro) Ne pas utiliser cette adresse pour d'autres messages. Ceux-ci ne seront ni lus ni répondus.

mailto:[email protected]


Rubrique de correction pour les tableaux (Chaque cellule vaut 0.25 point)

Présentation Tableau 1 Tableau 2 Tableau 3 Tableau 4

Légende, entêtes des colonnes, et des rangées sont présents

Données appropriées sont incluses

Tableau généré à l’ordinateur

Les espaces et/ou les lignes sont utilisés judicieusement pour regrouper les données ou séparer les composantes du tableau

Lecture du tableau (indépendant, texte non redondant, clair et simple)

Légende

Débute avec le numéro du graphique

La première phrase est un titre spécifique et complet

Tous les symboles et les abréviations non standards sont expliqués dans la légende

Totaux /2.0 /2.0 /2.0 /2.0

Notes converties d’après les points attribués sur les devoirs respectifs

Rubrique de correction pour les graphiques

(Chaque cellule vaut 0.25 point)

Présentation Fig 1 Fig 2 Fig 3

Le bon type de graphique

Les variables appropriées sont présentées

Le graphique est fait à l’aide d’ordinateur

Mise en page appropriée – le graphique remplit 1/2 à 2/3 de la page et fait à l’échelle afin d’utiliser l’espace disponible

La légende occupe le tiers de la page qui reste sous le graphique

Données

Les unités des axes et les échelles (l’intervalle pour l’abscisse et pour l’ordonnée englobe l’étendue des données)

Identification des axes (appropriée pour les variables choisies)

Type d’ajustement de la courbe (meilleure tendance est illustrée)

Légende

Débute avec le numéro du graphique

La première phrase est un titre spécifique et complet

Totaux /2.5 /2.5 /2.5



Rubrique de correction pour les images microscopiques (Chaque cellule vaut 0.25 point)

Présentation

Le format exigé est respecté et le bon nombre d’images est fourni

Une diapo avec le titre est incluse et contient toute l’information requise

Données: Qualité des images

Images claires (In focus)

Bon frottis uniforme

Coloration uniforme (couleur)

Bonne coloration (couleur)

Légende

Débute avec le numéro de la figure

Fournis un titre spécifique et complet

Type de coloration et le colorant utilise si approprié

Forme cellulaire

Agrégation

Grossissement

Totaux /3.0



Devoir 1 Partie 1: Problèmes. Résoudre les problèmes suivants. Vous n'avez pas à montrer vos calculs. Soumettre seulement vos réponses finales. Indiquer vos réponses à deux chiffres après la virgule. Notez : NE PAS arrondir les résultats de vos calculs jusqu’à la réponse finale. (3 points/question) 1. Quelle est la molarité d'une solution de chlorure d'ammonium préparé en diluant 175.0 mL

d'une solution de 3.0 M NH4Cl à 2.5 L?

2. Un étudiant prend un échantillon d'une solution de 3.1 M KOH et le dilue en ajoutant 100.0 mL d'eau. Ensuite, l’étudiant dilue cette solution 3X et détermine que la concentration de la solution finale est 0.025 M KOH. Quel était le volume original de l'échantillon?

3. Un microbiologiste désire préparer une solution stock de H2SO4 pour que des échantillons de 10.0 mL génèrent des solutions de 0.50 M quand ils sont ajoutés à 200.0 mL d'eau. Quelle devrait être la molarité de la solution stock?

4. Quel volume d'eau devrait être ajouté à 10.0 mL d'une solution d'acide acétique de 9.0 M

afin d'obtenir une concentration finale de 2.0 M d'acide acétique?

5. Trois solutions "A"', "B" et "C" sont mélangés pour obtenir le rapport suivant : A:B:C = 1:2:8. Quels sont les facteurs de dilutions pour chacun des composés?

6. Un microbiologiste possède trois cultures microbiennes: E. coli à une densité de 2 X 108 cellules/mL, B. subtilis à une densité de 2 X 109 cellules/mL, et P. notatum à une densité de 1 x 109 cellules/mL. De celles-ci, il désire préparer un seul mélange contenant 5 X 106 cellules/mL d'E. coli, 1.25 x 108 cellules/mL de B. subtilis, et 1 X 107 cellules/mL de P. notatum dans un volume final de 10 mL de milieu de culture. Quel volume du milieu de culture et de chacune des cultures d'origine devrait être utilisé pour atteindre cet objectif?

7. Le microbiologiste mentionné dans la question précédente réalise qu'il n'a que 5 mL de milieu de croissance. Étant donné cette information, quel est le volume maximal du mélange microbien décrit précédemment qui peut être préparé?

8. 3 parties d'eau sont ajoutées à 1 partie d'une solution de 2.5 M FeSO4 et 3 parties d’une solution de 1.0M FeSO4. Quelle est la molarité de la solution diluée?

9. Un microbiologiste prépare 150 mL d'une solution de 3.5 M K2Cr2O7 dans de l'eau. Une semaine plus tard, 30 mL de l'eau se sont évaporés. Combien d’eau est-ce que le microbiologiste doit-il ajouter à la solution évaporée afin d’obtenir une molarité finale de 0.5M K2Cr2O7?

10. Un test chimique a permis de déterminer que 100 mL d'une solution d'une substance inconnue est à une concentration de 5.0 M. La solution est évaporée en totalité laissant 55 g de cristaux du soluté inconnu. Quelle est la masse molaire de la substance inconnue?

11. Combien de millilitres d'une solution de chloramphénicol à 10 mg/mL sont nécessaires pour une dose de 400 µg?


12. Un pharmacien vous remet une bouteille de 1.0 L d'une solution de NaCl à 10.8% (m/v) et vous demande de la mélanger avec de l'eau stérile pour faire autant d'une solution de 0.1 M que possible. Quelle quantité d'eau stérile utiliseriez-vous? (MM de NaCl 58g/mole)

13. Les dilutions suivantes ont été réalisées pour déterminer la concentration de bactéries dans une culture. Quelle était la concentration de bactéries dans la solution stock?

2 mL 1 mL 5 mL 10 mL stock 6 mL 8 mL 20 mL 10 mL 14. Il y a eu une fuite de 50mL du poison le cyanure de sodium d'une bouteille, qui contenait à

l'origine 100 mL, dans un seau d'eau contenant 300mL d'eau. La concentration du poison dans le seau a été jugée d'être 0.10 M après la fuite. Si le poids moléculaire du cyanure de sodium est 60g/mole, combien de grammes de cyanure de sodium restent-ils dans la bouteille?

15. L'acide chlorhydrique concentré a une concentration de 37.7% (m/m). Quelle est sa concentration molaire? (La densité de la solution est de 1.19 g/mL et la MM de HCL: 36g/mole)

16. Quel volume d’eau est requis pour préparer une solution qui contient 300 grammes d’un composé (M.M. : 55g/mole; densité 1.5gémL) à une concentration final de 3.0 M?

Pour les problèmes qui suivent, présumez que le volume de solvant est égal au volume de solution.

Le diagramme ci-dessous représente deux solutions (A et B) séparées par une membrane perméable à l’eau, mais pas aux solutés. Utiliser ceci comme condition de départ pour répondre aux questions 17-20.

17. Quelles sont les osmolarités des solutions A et B dans la condition originale? 18. Quelle est la relation osmotique de la solution A relativement à la solution B?

19. Une fois que l’osmose est complétée, quelle sera l’osmolarité dans le compartiment A? 20. Quel volume d’eau c’est déplacé dans ou hors du compartiment A?

0.1 mL 150 colonies

A.

500 osmoles

10 litres

B.

300 osmoles

6 litres


21. Calculer l’osmolarité des solutions suivantes: (Notez, tous les solutés sont imperméables sauf pour l’urée)

0.25 M Na2CO3 + 1M urée 0.02 M Al(NO3)3 0.14 M LiBr 0.15 M glucose (C6H12O6) + 0.2M NaCl

22. L’osmolarité du des cellules sanguines 0.28 osmol. Indiquer si le sang est isotonique,

hypotonique, ou hypertonique comparativement à chacune des solutions indiquées dans la question 21.

23. Qu’est qui arriverait à des globules rouges placés dans chacune des solutions indiquées à la question 21? (Crénation, hémolyse, ou rien)

24. Combien de grammes de KCl est-ce que vous devez dissoudre dans 1 L d’eau afin

d’obtenir une solution qui est isotonique au plasma? (M.M. du KCl 74.55 g/mole)

25. Quelle est la relation en termes d’osmolarité et de tonicité d’une cellule avec une osmolarité de 300 mOsm comparativement aux solutions suivantes :

La cellule est osmotique et tonique relativement à 300mM NaCl. La cellule est osmotique et tonique relativement à 300mM d’urée. *Notez : l’urée est perméable.


Partie 2 : Données expérimentales et leurs interprétations (4 points/question) EXERCICE 1.0 : GÉNÉRER UNE COURBE ÉTALON ET DÉTERMINATION D’UNE CONCENTRATION INCONNUE DE BLEU DE MÉTHYLÈNE 1. Montrez votre calcul qui démontre comment 5mL d’une solution de 0.4mM de bleu de

méthylène ont été préparés à partir d’une solution mère de 0.26% (m/v). 2. Compléter le tableau suivant :

Solution

Volume de bleu de

méthylène (mL)

Volume d’eau (mL)

Volume total (mL)

Facteur de

dilution final

Abs

550nm

Concentration finale de bleu de

méthylène (% m/v)

No1

No2

No3

No4

No5

No6

INC 1

INC 2

3. Soumettre une courbe étalon générée avec Excel qui représente la relation entre la

concentration du bleu de méthylène (% m/v) et l’absorbance à 550nm. Présenter la meilleure droite. Indiquer l’équation de la ligne et le coefficient R2.


EXERCICE 1.1 : DIFFUSION, OSMOSE ET TONICITÉ CHEZ LES GLOBULES ROUGES 4. Compléter le tableau suivant :

Sucrose

Molarité (M)

Osmolarité (OsM)

Hémolyse (+/-)

NaCl

Glycérol

5. D’après vos résultats, quelle est l’osmolarité interne approximative des globules rouges?

Justifier votre réponse. 6. D’après vos résultats, quel soluté est probablement perméable à la membrane cellulaire?

Expliquer comment vous êtes arrivé à cette conclusion.

7. Brièvement définir le terme crénation en relation à l’osmose (1 point)


Devoir 2 Partie 1 : Problèmes et questions théoriques. Vous n'avez pas à montrer vos calculs. Soumettre seulement vos réponses finales. Indiquer vos réponses à deux chiffres après la virgule. Notez : NE PAS arrondir les résultats de vos calculs jusqu’à la réponse finale. (5 points/question) 1. Pour évaluer le nombre de bactéries dans la viande hachée, un échantillon de 10 g de

viande est homogénéisé dans 75 mL d'eau résultant en un volume total de 85 mL. Un échantillon de 3 mL de la suspension de viande est ensuite dilué par un facteur de 104X. 1 mL de la dilution finale est ensuite ajouté à 2 mL de solution saline. 0.1 mL de cette dernière solution a été étalé. Si 100 colonies ont été observées sur la gélose, quel était le nombre initial de bactéries/g de bœuf haché?

2. Vous faites les dilutions en séries suivantes : 1/12, 1/2.5, et 1:4. Quels sont votre dilution finale et votre facteur de dilution final?

3. Considérez le schéma de dilution suivant :

a. Indiquez le nombre total d'UFC dans la totalité (100 mL) de l'échantillon original d'eau de lac. (TNTC=Trop nombreux pour être compté.)

b. Vous attendriez-vous à une différence dans la réponse du problème ci-dessus si la première dilution était faite en ajoutant un millilitre de l'échantillon à 9 mL de diluant? Pourquoi ou pourquoi pas?

4. Une marque de yogourt probiotique prétend contenir approximativement 1012 bactéries

dans 100 mL. Vous désirez vérifier cette affirmation en faisant un compte viable. Si vous aviez seulement deux géloses à votre disposition, 0.1 mL de quelles dilutions étaleriez-vous?


5. Vous préparez un essai de NPP afin de déterminer le nombre de bactéries par gramme de fromage Camembert. Pour ce faire, 10 g de fromage sont homogénéisés dans un volume final de 100 mL. La suspension est ensuite utilisée pour faire l'essai de NPP à trois tubes. Vous obtenez les résultats indiqués dans le tableau ci-dessous.

Dilution 10-2 10-3 10-4 10-5 10-6 10-7

No de tubes positifs 3 3 1 2 1 0

Vous faites aussi un compte viable de la même suspension. Quelle dilution de cette suspension devriez-vous étaler afin de confirmer le résultat du NPP, présumant que vous étalez 0.1 mL? Indiquer la dilution et le nombre de colonies attendues.

6. Un millilitre d'E.coli est mélangé avec 4 mL de colorant. Une goutte (approximativement 0.1 mL)de cette dilution est déposée sur la cellule de comptage d'une lame d'hématimètre. Trois grands carrés (carré jaune dans l'image ci-dessous) sont comptés et donnent les résultats suivant : 46, 50, et 58 bactéries. Combien de bactéries est-ce qu'il y a par millilitre dans l'échantillon original?

7. Un compte viable d'une culture bactérienne des bactéries indiquées dans cette image a été fait de deux manières différentes. Dans le premier cas, 0.1 mL d'une dilution 10-6 a été étalé et a donné 115 UFC. Dans le second cas, la culture a été traitée d'abord dans un homogénéisateur puis 0.1 mL d'une dilution 10-7 a été étalé. Dans ce cas, 102 UFC ont été observées. Expliquer brièvement la différence dans les comptes viables obtenus.

8. Quel objectif fournit le plus grand champ de vision?

100X

40X 10X La grandeur du champ de vision est le même avec tous les objectifs.


9. Un spécimen est visualisé au microscope avec un oculaire de 4X et un objectif de10X. Une mesure du spécimen dans le champ de vision était de 0.01 mm. Quelle est la grandeur originale du spécimen?

10. Quels sont un avantage et un désavantage de la PCR comparativement au compte viable

pour évaluer la présence d’un microorganisme donné?

Partie 2 : Données expérimentales et leurs interprétations EXERCICE 2.0 DÉTECTION DE COLIFORMES PAR PCR 1. Soumettre une figure de votre électrophorèse sur gel d’agarose de vos réactions de PCR.

La figure doit inclure une légende et être étiquetée de façon appropriée.

EXERCICE 2.2 : COMPTES MICROBIENS DANS LE SOL

2. Soumettre la démarche qui démontre le calcul du nombre de bactéries par gramme de sol. 3. Soumettre la démarche qui démontre le calcul du nombre d’actinomycètes par gramme de

sol. 4. Soumettre la démarche qui démontre le calcul du nombre de fungi par gramme de sol.

EXERCICE 2.5 : STRIES POUR COLONIES SIMPLES

5. Avant de remettre ce devoir, demander à un aide enseignant d’évaluer vos stries pour

colonies simples. (Pleins points pour des colonies simples pour les deux géloses) EXERCICE 3.0 : NPP DES COLIFORMES 6. Remplir le tableau suivant. Sous le tableau, indiquer la combinaison utilisée pour

déterminer l’indice NPP. Soumettre la démarche qui démontre le calcul du NPP par millilitre.

Dilution Croissance : Tube

1 2 3

7. Comparer et discuter les résultats obtenus avec les méthodes de PCR et du NPP. Quels

sont un avantage et un désavantage de la PCR comparativement au NPP pour évaluer la présence de coliformes dans un échantillon. Est-ce que les limites de détections sont semblables?


EXERCICE 3.1 : COMPTE DIRECT D’UNE SUSPENSION DE LEVURE 8. Soumettre la démarche qui démontre le calcul du nombre de cellules de levure par millilitre

dans la suspension originale. Assurez-vous d’inclure les informations suivantes : Dimensions des carrés desquels les comptes ont été obtenus, les trois comptes, et le nombre moyen de cellules par carré.

EXERCICE 3.3 : MICROSCOPIE (10 points) 9. Soumettre une présentation PPT de vos colorations simples tel qu’indiqué dans les

directives générales.


Devoir 3 Partie 1 : Problèmes et questions théoriques. Vous n'avez pas à montrer vos calculs. Soumettre seulement vos réponses finales. Indiquer vos réponses à deux chiffres après la virgule. (5 points/question) 1. De quelle couleur est-ce que des bactéries des genres Bacillus et Salmonella seraient si

l’étape du lavage à l’éthanol n’était pas faite lors de la coloration de Gram? Mauve et rouge respectivement Rouge et mauve respectivement Bleu et rouge respectivement Les deux seraient rouges Les deux seraient mauves

2. Supposons que pour une période prolongée votre alimentation est déficiente en niacine, une vitamine essentielle que le corps humain ne peut pas fabriquer. Quel serait l’effet direct de cette carence sur chacun des sentiers métaboliques suivants? (Une diminution de l’activité, une augmentation de l’activité ou aucun effet)

La glycolyse Le cycle de Kreb La chaîne de transport d’électrons 3. Une culture bactérienne est échantillonnée à deux points dans le temps, à un intervalle de

1h et 10 minutes. 3.2 x 106 cellules/mL étaient présentes dans le premier échantillon et 5.12 x 107 cellules/mL dans le deuxième échantillon. Combien de fois est-ce que la population a doublé dans le laps de temps examiné?

4. Des cultures à partir des tissus d’un patient avec la syphilis sont faites sur des prélèvements faits à une semaine d'intervalle. Le premier échantillon a 5000 UFC, tandis que le second échantillon a 32000 UFC. Quatre jours plus tard, un troisième échantillon a 58000 UFC. La population est-elle en croissance exponentielle?

5. Un biologiste étudie une espèce nouvellement découverte de bactéries. Au temps t = 0 h, il introduit une centaine de bactéries dans un milieu favorable. Six heures plus tard, il compte 450 bactéries. En supposant une croissance exponentielle, quel est le taux de croissance (µ) de ces bactéries?

6. Une population bactérienne double toutes les 3 heures. Étant donné qu'initialement il y avait environ 100 bactéries, combien de bactéries est-ce qu'il y aurait après un jour et demi?

7. Un échantillon de lait contient 108 cellules/mL de B. cereus, qui possède une valeur D à 75oC de 30 secondes, et 109 cellules/mL de S. sonnei, qui possède une valeur D à 75oC de 15 secondes. Afin de faire la pasteurisation du lait, vous désirez réduire le compte bactérien à 106 bactéries/mL. D’après ces informations, quelle devrait être le temps d’exposition minimum à 75oC pour atteindre ce but?

8. Un échantillon de poulet qui contenait initialement 107 cellules de S. typhimurium avait 10 cellules après un traitement de 1 heure à 90oC. D’après ces informations, quelle est la valeur D de Salmonella à 90oC?


9. Un rince-bouche affirme réduire la population bactérienne dans la bouche par 99.99%. L’utilisation recommandée, stipule que les individus doivent se rincer la bouche pour 2 minutes. Présumant un charge bactérienne moyenne de 108 cellules/mL, combien de temps serait requis pour que le rince-bouche réduisent la population bactérienne par un log?

10. Considérez l’information présentée dans la question précédente. 0.1 mL d’une dilution de quel facteur de dix devriez-vous étaler afin de vérifier les affirmations de ce rince-bouche?

Partie 2 : Données expérimentales et leurs interprétations (5 points/question) EXERCICE 5.0 : COURBE DE CROISSANCE D’E.COLI 11. Soumettre un graphique avec deux courbes de croissance (température de la pièce et

37oC) qui se conforment aux critères suivants : o Changement de la densité optique en fonction du temps o Chaque courbe doit avoir 32 points qui représentent l’intervalle T0 – T16h o Considérer que les cultures inoculées à 10h = T0, celles inoculées à 11h =T1h,

celles inoculées à 12h = T2h et celles inoculées à 1h = T2h

12. Déterminer à partir de vos profils le temps de génération et le taux de croissance des deux cultures.

EXERCICE 5.1 : BIOESSAI DE FERMENTATION PAR LA LEVURE

13. Soumettre un graphique avec 4 courbes qui démontrent la production de moles d’éthanol en

fonction du temps avec chacune des quantités de glucose.

14. Soumettre un tableau avec les taux de productions d’éthanol (moles/min.) et les rendements finaux après une heure en fonction de grammes de glucose (moles d’éthanol/g de glucose).

15. Soumettre un graphique avec 4 courbes qui démontrent la production de moles d’éthanol en fonction du temps pour chacun des volumes de la boisson qui vous a été assigné.

16. Soumettre un tableau avec les taux de productions d’éthanol (moles/min.) et les rendements finaux après une heure en fonction du volume de la boisson assigné.

17. D’après vos résultats, quelle est la quantité approximative de sucre dans la boisson qui vous a été assignée? Expliquer brièvement comment vous êtes arrivé à votre conclusion.

EXERCICE 5.2 : LES COLORANTS DIFFÉRENTIELS ET LA STÉRILISATION 18. Soumettre un tableau avec l’information suivante: Durée d’exposition aux microondes,

Nombre de cellules viables/mL, % de cellules viables et % de réduction de la viabilité.

19. Soumettre un graphique du log du nombre de cellules viables/mL en fonction du temps d’exposition aux microondes. Présenter la meilleure droite.

20. Utiliser la formule suivante pour déterminer la valeur D sous les conditions testées. (D = t/(logNo – logN)). D’après cette valeur D, combien de temps serait requis pour réduire la population à 10-6 cellules/mL?


Devoir 4 Partie 1 : Problèmes et questions théoriques. Vous n'avez pas à montrer vos calculs. Soumettre seulement vos réponses finales. Indiquer vos réponses à deux chiffres après la virgule. (5 points/question) 1. D’après l’essai de Kirby Bauer illustré, quels antibiotiques possèdent le CMI le plus élevé et

le CMI le plus faible?

2. D’après l’E-test illustré, quelle bande sur l’E-test correspond à l’antibiotique « E » sur l’essai de Kirby Bauer?

3. D’après l’E-test illustré, quelle est la concentration de l’antibiotique testé au point indiqué par la flèche? Si cette information ne peut pas être déterminée, indiquez-le.

4. Le plus élevée , le meilleur est l’antibiotique.

A. L’indice thérapeutique B. La dose toxique C. La dose thérapeutique D. La toxicité sélective E. Le spectre d’action

1

2

4

3

6

5


5. Un antibiotique qui cible laquelle des composantes suivantes serait attendu d’avoir la toxicité sélective la plus faible?

A. La synthèse de l’ADN bactérien B. La synthèse de l’ARN bactérien C. La synthèse des parois bactériennes D. La membrane plasmique bactérienne E. Les ribosomes bactériens

6. Lequel des composés suivants est un antibiotique naturel avec un anneau de bêta-

lacatmine? A. Céphalosporine B. Pénicilline C. Tétracycline D. Chloramphénicol E. Streptomycine

7. Quelle drogue antibactérienne n’inhibe pas la synthèse protéique? A. Un aminoglycoside B. La tétracycline C. L’ampicilline D. Le chloramphénicol E. L’érythromycine

8. Les antibiotiques qui agissent sur la paroi cellulaire sont seulement efficaces contre quel

type de cellules? A. Gram négative B. En dormance C. En croissance active D. Qui forme des endospores E. Gram positives

9. Quel antibiotique serait efficace pour traiter une infection par la levure? A. La céphalosporine B. La tétracycline C. Le chloramphénicol D. La streptomycine E. Aucun d’entre eux.

10. Quel antibiotique dépend de la pression osmotique pour tuer les cellules? A. La céphalosporine B. La tétracycline C. Le chloramphénicol D. La streptomycine E. Aucun d’entre eux.

11. Quel antibiotique possède la toxicité sélective la plus élevée? A. La céphalosporine B. La tétracycline C. Le chloramphénicol D. La streptomycine E. Le cyanure.


12. Le lysozyme et la pénicilline sont des composés antimicrobiens qui agissent sur la paroi cellulaire. Ces deux composés seraient efficaces contre quel type de cellules?

A. Gram négative B. En dormance C. En croissance active D. Qui forme des endospores E. Gram positives Partie 2 : Données expérimentales et leurs interprétations (10 points/question) EXERCICE 6.0 : ESSAI DE KIRBY-BAUER

Obtenir les diamètres des zones d’inhibitions pour chacune des bactéries testées et chacun des antibiotiques.

1. Compléter les tableaux suivants :

Antibiotiques Diamètres d’inhibitions (mm)

S. aureus S. faecalis E. coli

Antibiotiques Sensibilité

S. aureus S. faecalis E. coli

R = résistant, RI = résistance intermédiaire, S = sensible 2. Répondre aux questions suivantes d’après les données présentées ci-dessus :

a. Quel antibiotique possède le spectre d’action le plus étroit? Justifier votre réponse. b. Quel antibiotique possède le spectre d’action le plus large? Justifier votre réponse. c. Quel type de bactérie, Gram positive ou négative, est le moins susceptible à

l’antibiothérapie? Justifier votre réponse. d. Quelle bactérie est plus susceptible aux macrolides? Justifier votre réponse.


EXERCICE 6.2 : DÉTERMINATION DES CMI Afin de compléter le tableau qui suit :

Déterminer le pourcentage de réduction de la croissance de chaque espèce bactérienne obtenue à chacune des concentrations de chacun des antibiotiques. ((D.O. sans antibiotique – D.O. avec antibiotique) /D.O. sans antibiotique) X 100).

Déterminer le CMI (µg/mL) de chacun des antibiotiques pour chacune des espèces bactériennes (la plus faible concentration qui cause une réduction d’au moins 99%).

Déterminer les indices thérapeutiques pour chacun des antibiotiques pour chaque espèce bactérienne. (CMI /dose toxique)

Déterminer si chacune des bactéries était sensible, résistante ou de résistance intermédiaire à chacun des antibiotiques

Antibiotique Cmax et Cmin (µg/mL) DL50 (µg/mL)

Ampicilline 34 – 1.8 530

Kanamycine 12 – 2 400

Acide naladixique 4.5 – 0.2 204

Érythromycine 8.3 – 2.7 460

3. Compléter le tableau suivant :

Antibiotique CMI (µg/mL) Indices thérapeutiques

S. aureus S. faecalis E.coli S. aureus S. faecalis E.coli

Ampicilline

Kanamycine

Acide naladixique

Érythromycine

4. D’après les données présentées ci-dessus, indiquer quel (s) antibiotique (s) serait (ent)

recommandé (s) pour traiter une infection par chacune des bactéries. Justifier votre réponse.


Devoir 5 Partie 1 : Problèmes et questions théoriques. Vous n'avez pas à montrer vos calculs. Soumettre seulement vos réponses finales. Indiquer vos réponses à deux chiffres après la virgule. (2.5 points/question) 1. Lequel des énoncés suivants à propos des bactéries retrouvées dans l’environnement est

faux? A. Un gramme de sol peut contenir un milliard de cellules bactériennes. B. Il n’y a pas de bactéries sur la peau humaine à moins d’une infection. C. Il y a toujours des bactéries dans votre bouche même si vous vous brossez les dents

régulièrement. D. Les bactéries retrouvées sur les surfaces externes du corps humain sont

majoritairement Gram positives.

2. Lorsque Staphylococcus epidermidis est inoculé sur une gélose d’Agar de Phénoléthanol, les cellules individuelles génèrent des colonies visibles. Tandis que quand Esherichia coli est inoculé sur ce milieu, elle meurt. L’Agar de phénoléthanol est un exemple d’un milieu: A. Un milieu à usage général B. Un milieu différentiel C. Un milieu sélectif D. Un milieu complexe

3. Qu’est que l’Agar?

A. Un polymère de polysaccharides dérivé d’une algue. B. Une source d’azote dans les milieux solides. C. Un polymère d’acides aminés dérivé des tendons. D. Un polymère qui peut être dégradé par la majorité des bactéries d’importance médicale.

4. Quel (s) composé (s) peut (peuvent) être utilisé (s) comme source de carbone et d’azote

dans le bouillon de phénol rouge sucrose? A. Le sucrose. B. Le sucrose et le glucose. C. Des acides aminés. D. Des acides aminés et le sulfate d’ammonium.

5. Quel énoncé décrit possiblement la fermentation d’un hydrate de carbone dans le bouillon

de phénol rouge? A. Le milieu est limpide et a viré au jaune. B. Le milieu est turbide et a viré au rouge foncé. C. L’indicateur de pH a changé à une couleur qui indique la présence d’un produit alcalin. D. Le milieu est turbide et démontre l’accumulation d’un gaz dans la fiole inverse.

6. Lequel des énoncés suivants à propos de l’utilisation d’acides aminés dans les milieux de

culture est vrai? A. Les acides aminés peuvent être utilisés comme source de carbone. B. Les acides aminés peuvent être utilisés comme source d’azote. C. Les acides aminés peuvent être utilisés comme source d’électrons. D. Tous les énoncés (A – C) sont vrais. E. Les énoncés A et B sont vrais, mais pas C.


7. Vous faites croître deux bactéries sur des géloses avec de l’amidon comme source de carbone unique et observez les résultats suivants:

Quelle conclusion est valide? A. Les bactéries A et B sécrètent de l’amylase. B. Les bactéries A et B peuvent utiliser le glucose comme source de carbone. C. La bactérie A dégrade l’Agar. D. La bactérie B sécrète de l’amylase, mais pas la bactérie A. 8. Quelle (s) caractéristique est (sont) commune (s) au bouillon de phénol rouge, la pente

d’urée et la pente TSI? A. Ces milieux contiennent du phénol rouge. B. Ce sont des milieux qui permettent de déceler la fermentation. C. Ce sont des milieux qui permettent de déceler la production d’acides. D. Ce sont des milieux qui permettent de déterminer la source d’azote utilisée.

9 – 12 Jumeler la réponse appropriée à chacun des énoncés. Certaines réponses peuvent être utilisées plus d'une fois, d'autres ne sont pas utilisés du tout. A. Phénol rouge sucrose B. Gélose de lait C. Pente de citrate de Simmon D. Pente d’Agar de phénylalanine E. SIM 9. Utiliser pour vérifier la dégradation du tryptophane.

10. Utiliser pour vérifier la production de l’acide phénylpyruvique.

11. Utiliser pour vérifier la sécrétion d’enzyme extracellulaire.

12. Utiliser pour vérifier la dégradation de la cystéine.

13 – 16 Jumeler chacun des réactifs, ingrédient ou compose avec son bût approprié. Certaines réponses peuvent être utilisées plus d'une fois, d'autres ne sont pas utilisés du tout. A. Réactif de Kovacs B. Sulfate ferreux C. Huile minérale stérile D. Iode E. Extrait de levure 13. Utiliser pour déceler la présence d’H2S.

14. Utiliser pour réduire la disponibilité d’oxygène. 15. Utiliser comme source de vitamines, d‘acides aminés et d’autres nutriments.

A B A B


16. Utiliser pour déceler la présence de l’amidon. 17 – 20 Jumeler chacun des tests bactériologiques avec les observations pour un test positif. Certaines réponses peuvent être utilisées plus d'une fois, d'autres ne sont pas utilisés du tout. Apparence d’un résultat positif

A. Zone claire après l’ajout d’un réactif chimique.

B. Zone d’éclaircissement autour de la croissance bactérienne.

C. Le milieu devient bleu.

D. Le réactif vire au rouge suite à son ajout. 17. Test d’amylase.

18. Test d’hémolyse. 19. Test d’indole. 20. Test d’utilisation du citrate. Partie 2 : Données expérimentales et leurs interprétations (4 points/question; a moins d’indications contraires) EXERCICE 7.2 et 8.0 : DÉGRADATION DE SOURCES DE CARBONES COMPLEXES 1. Indiquer dans le tableau ci-dessous la présence (+) ou l’absence (-) de l’enzyme

exocellulaire étant testée pour chacune des bactéries ainsi que le produit de la dégradation du polymère par l’enzyme.

Bactérie Gélose de lait Gélose d’amidon Gélose Spirit Blue Gélose d’ADN

+/- Produit +/- Produit +/- Produit +/- Produit

B. cereus

B. subtilis

E. coli


EXERCICE 7.3 et 8.1: MÉTABOLISME EN MILIEU DE PHÉNOL ROUGE 2. Indiquer dans le tableau ci-dessous la couleur du milieu, la présence (+) ou l’absence (-)

d’acide, et le métabolisme (O : oxydatif ou F : fermentatif) pour chacune des bactéries.

Bactérie Glucose Lactose Sucrose

Couleur Gaz Métabolisme Couleur Gaz Métabolisme Couleur Gaz Métabolisme

P. miribalis

P. aeruginosa

E. coli

E. aerogenes

EXERCICE 7.4 et 8.2: CROISSANCE EN MILIEU TSI 3. Indiquer dans le tableau ci-dessous la couleur du milieu, la présence (+) ou l’absence (-)

d’acide, et le métabolisme (O : oxydatif ou F : fermentatif) pour chacune des bactéries.

Bactérie Pente Bout

Couleur Métabolisme Couleur Gaz Métabolisme

P. miribalis

P. aeruginosa

E. coli

EXERCICE 8.3 TEST DE MÉTHYL-ROUGE-VOGUES-PROSKAUER 4. Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions

appropriées.

E. coli E. aerogenes


EXERCICE 7.3 et 8.4 CROISSANCE SUR PENTE DE CITRATE DE SIMMON 5. Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions

appropriées.

E. coli E. aerogenes EXERCICE 7.6 et 8.5: CROISSANCE SUR PENTE D’URÉE 6. Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions

appropriées.

E. coli P. mirabilis EXERCICE 7.7 et 8.6 : ESSAIS DÉCARBOXYLASES ET DÉSAMINASES Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions appropriées. 7. E. coli

Bouillon de décarboxylase avec ornithine Pente d’Agar de phénylalanine Pente d’Agar de lysine avec fer 8. P. mirabilis

Bouillon de décarboxylase avec ornithine Pente d’Agar de phénylalanine Pente d’Agar de lysine avec fer


9. E. aerogenes

Bouillon de décarboxylase avec ornithine Pente d’Agar de phénylalanine Pente d’Agar de lysine avec fer EXERCICE 7.8 et 8.7: TEST SIM 10. Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions

appropriées. E. coli P. mirabilis E. aerogenes EXERCICE 7.8 et 8.8: ESSAI DE RÉDUCTION DU NITRATE 11. Indiquer pour chacune des bactéries les observations enregistrées et les conclusions

appropriées. E. coli P. aeruginosa P. mirabilis


EXERCICE 7.10 et 8.9 : TEST ENTEROPLURI 12. Compléter le tableau suivant :

Groupe 1 Groupe 2 Groupe 3 Groupe 4 Groupe 5

Test 4 2 1 4 2 1 4 2 1 4 2 1 4 2 1

Code de positivité

Résultat

Somme des codes

Code numérique

Microorganisme:

EXERCICE 8.10 – 8.11 : TESTS DIFFÉRENTIELS POUR L’IDENTIFICATION DES COCCI GRAM POSITIFS (2 points) 13. Numéro de votre inconnu : Réaction de la catalase : Identité de l’inconnu :

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