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L’eau Propriétés physiques, chimiques et biologiques Damien Laage UMR CNRS-ENS-UPMC 8640 “PASTEUR” Ecole Normale Supérieure, Paris [email protected]

L’eau - · PDF fileLa structure de l’eau se réorganise ! à l’échelle picoseconde (10-12 s) 2005. Eau biologique ? L’eau de nos cellules est-elle spéciale ?

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Focus / L’eauwww.cnrs.fr

L’eau!Propriétés physiques,

chimiques et biologiques

Damien Laage!UMR CNRS-ENS-UPMC 8640 “PASTEUR”

Ecole Normale Supérieure, Paris [email protected]

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Lavoisier Cavendish Monge Watt

Etudiée par les chimistes depuis deux siècles

La longue histoire de l’eau

... que reste-t-il de mystérieux ?Que sait-on ?

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La molécule d’eau

δ+ δ+

2δ-

Molécule polaire: excellent solvant pour espèces chargées four micro-ondes

Transparent dans le visible: vie sous-marine Absorbe dans l’infrarouge: effet de serre

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L’eau liquide

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La liaison hydrogèneliaison hydrogène !• faible!• un peu covalente, un peu électrostatique!• chaque molécule donne 2 liaisons ! reçoit 2 liaisons!• durée de vie 10-12 s

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DynamiqueRéactivité chimique

Biochimie

cf réactions SN2, acido-basiques

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Théorie et modélisation• simulations numériques • modèles théoriques

boîte simulation

Boîte à outilsEtudes structurales

• neutrons • rayons X ILL

Grenoble

Etudes dynamiques• RMN • spectroscopie ultrarapide

laser femtoseconde

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Modèle prédictif• hydrophile ou hydrophobe ?!• interface concave ou convexe ?

Comment bougent les molécules d’eau ?Diffusion ?

très petits pas aléatoires

Reactant Transition state Product

time (ps)

Dist

ance

(Å)

Angl

e (°)

0-1-2 +1

a

b

réactif état de transition produit

Sauts ?suggestion basée sur étude par simulation numérique

Laage & Hynes Science 2006confirmation expérimentaleJi et al. Science 2010

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Quelques questions et débats actuels

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Mémoire de l’eau12. Bozano, L., Carter, S., Scott, J., Malliaras, G. & Brock, P. Temperature- and field-dependent electron

and hole mobilities in polymer light-emitting diodes. Appl. Phys. Lett. 74, 1132–1134 (1999).

13. Ho, P. K.H. et al.Molecular-scale interface engineering for polymer light-emitting diodes.Nature 404,

481–484 (2000).

14. Nagasawa, Y. et al.The study of the thermal oxide films on siliconwafers by Fourier transform infrared

attenuated total reflection spectroscopy. J. Appl. Phys. 68, 1429–1434 (1990).

15. Dugas, V. & Chevalier, Y. Surface hydroxylation and silane grafting on fumed and thermal silica.

J. Colloid Interf. Sci. 264, 354–361 (2003).

16. Perry, C. C. & Li, X. Structural studies of gel phases. J. Chem. Soc. Faraday Trans. 87, 3857–3862 (1991).

17. Tardif, F., Chabli, A., Kanel, A., Rochat, N. & Veillerot, M. Thermal evolution of chemical oxides and

(100) silicon at 300 8C in ambient air as seen by attenuated total reflection infrared spectroscopy.

J. Electrochem. Soc. 150, G333–G338 (2003).

18. Nicollian, E. H., Berglund, C. N., Schmidt, P. F. & Andrews, J. M. Electrochemical charging of thermal

SiO2 films by injected electron currents. J. Appl. Phys. 42, 5654–5664 (1971).

19. Hartstein, A. & Young, D. R. Identification of electron traps in thermal silicon dioxide films. Appl.

Phys. Lett. 38, 631–633 (1981).

20. Malenfant, P. R. L. et al.N-type organic thin-film transistor with high field-effect mobility based on a

N-N 0 -dialkyl-3,4,9,10-perylene tetracarboxylic diimide derivative. Appl. Phys. Lett. 80, 2517–2519

(2002).

21. Salleo, A., Chabinyc, M. L., Yang, M. S. & Street, R. A. Polymer thin-film transistors with chemically

modified dielectric interfaces. Appl. Phys. Lett. 81, 4383–4385 (2002).

22. Angst, D. L. & Simmons, G. W. Moisture absorption characteristics of organosiloxane self-assembled

monolayers. Langmuir 7, 2236–2242 (1991).

23. Wasserman, S. R., Tao, Y. T. & Whitesides, G. M. Structure and reactivity of alkylsiloxane monolayers

formed by reaction of alkyltrichlorosilanes on silicon substrates. Langmuir 5, 1074–1087 (1989).

24. Sirringhaus, H. et al. Two-dimensional charge transport in self-organised, high-mobility conjugated

polymers. Nature 401, 685–688 (1999).

25. Wilson, R. J. Polymer Field-effect Transistors from Polyfluorene-based Conjugated Polymers. PhD thesis,

Univ. Cambridge (2002).

Supplementary Information accompanies the paper on www.nature.com/nature.

Acknowledgements We thank A. Achen for providing the BCB material, which is commerciallyavailable as Dow Cyclotene, and Merck KGaA for P3HT. L-L.C. and J-F.C. thank the EPSRCCarbon-Based Electronics programme for support, and J.Z. thanks the Gates Cambridge Trust forsupport. P.K-H.H. thanks St John’s College for a research fellowship, the National University ofSingapore for research support, and S. J. Chua for technical discussions, support and access tolaboratory facilities. We also thank C.-C. Chum for technical support.

Competing interests statement The authors declare competing financial interests: detailsaccompany the paper on www.nature.com.

Correspondence and requests for materials should be addressed to P.K.-H.H.([email protected]) and R.H.F. ([email protected]).

..............................................................

Ultrafast memory loss and energyredistribution in the hydrogenbond network of liquid H2OM. L. Cowan1*, B. D. Bruner1*, N. Huse2*, J. R. Dwyer1, B. Chugh1,E. T. J. Nibbering2, T. Elsaesser2 & R. J. D. Miller1

1Departments of Chemistry and Physics, University of Toronto, 80 St GeorgeStreet, Toronto, Ontario, Canada M5S3H62Max-Born-Institut fur Nichtlineare Optik und Kurzzeitspektroskopie,Max-Born-Strasse 2A, D-12489 Berlin, Germany

* These authors contributed equally to this work

.............................................................................................................................................................................

Many of the unusual properties of liquid water are attributed toits unique structure, comprised of a random and fluctuatingthree-dimensional network of hydrogen bonds that link thehighly polar water molecules1,2. One of the most direct probesof the dynamics of this network is the infrared spectrum of theOH stretching vibration3–11, which reflects the distribution ofhydrogen-bonded structures and the intermolecular forces con-trolling the structural dynamics of the liquid. Indeed, waterdynamics has been studied in detail5–14, most recently usingmulti-dimensional nonlinear infrared spectroscopy15,16

for acquiring structural and dynamical information on femtose-cond timescales. But owing to technical difficulties, only OH

stretching vibrations in D2O or OD vibrations in H2O could bemonitored. Here we show that using a specially designed, ultra-thin sample cell allows us to observe OH stretching vibrations inH2O.Under these fully resonant conditions, we observe hydrogenbond network dynamicsmore than one order ofmagnitude fasterthan seen in earlier studies that include an extremely fast sweepin the OH frequencies on a 50-fs timescale and an equally fastdisappearance of the initial inhomogeneous distribution of sites.Our results highlight the efficiency of energy redistributionwithin the hydrogen-bonded network, and that liquid wateressentially loses the memory of persistent correlations in itsstructure within 50 fs.The high optical density of the OH stretching mode in pure H2O

and parasitic window signals in conventional samples have so far

Figure 1 Experimental set-up. a, Nanofluidic sample cell: Each Si3N4 window has a

2mm £ 2mm clear aperture and is 800 nm thick, which provides the necessary

structural support for a stable sample, yet is thin enough to give a negligible non-resonant

window signal. The windows were also coated with a 10-nm SiO2 layer to ensure that their

surfaces are sufficiently hydrophilic to allow effective capillary flow of the water into the

cell and uniform distribution of the water once inside. b, Schematic of two-dimensionalinfrared experiment: The 70-fs pulse from a mid-IR Optical Parametric Amplifier is split

into two at a beam splitter (BS), and one is given a variable delay t 13 using a retroreflector

on a translation stage. The two beams are focused onto a reflective diffractive optic at a

small angle to each other, using an off-axis parabolic mirror. The diffractive optic is

optimized to diffract 70% of the intensity of each beam into the^1 diffraction orders. The

resulting four beams lie at the corners of a square, forming a ‘boxcar’ pattern. Using the

second translation stage, the bottom two beams are then delayed by a time t. This results

in the pulse sequence shown, with the two pump beams (k1, k2) separated by thecoherence time t and the second pump and probe beam (k2, k3) separated by thepopulation time T. The fourth beam in the boxcar pattern is the weak reference pulse kref,which is attenuated by the neutral density (ND) filter and passed through the sample cell

before the excitation pulses (k1, k2, k3). The 1-mJ pulses are then focused to a 150-mmspot in the sample, and the signal is heterodyne detected, using the fourth beam as a local

oscillator. Under these conditions, the temperature rise in the sample measured using a

thermal imaging camera was less than 8 K above room temperature.

letters to nature

NATURE |VOL 434 | 10 MARCH 2005 | www.nature.com/nature 199© 2005 Nature Publishing Group

La structure de l’eau se réorganise !à l’échelle picoseconde (10-12 s)

2005

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Eau biologique ?

L’eau de nos cellules est-elle spéciale ?

cytoplasme: forte concentration en sels, sucres, phospholipides, protéines …

eau “biologique” visqueuse ?L’eau autour d’une protéine, d’un ADN, dans nos cellules!

n’est que modérément ralentie par rapport à l’eau pureRMN + simulations

Facteur 3 autour protéine diluée, facteur 15 pour 15% de l’eau de E. Coli

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Rôle de l’eau pour le vivantL’eau lubrifiant du vivant ?

Catalyse enzymatique

Kurkal et al Biophys J 2005

hydratation

activ

ité

Quel rôle moléculaire, quelles propriétés clés ?polarité ? rapidité de réorganisation ? petite taille ?

liaison hydrogène ? effets quantiques ?

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Reconnaissance moléculaire

• pas purement entropique • pas purement enthalpique

Quelles structure et dynamique de l’eau dans site et autour ligand ?

Drug design

Rôle de l’eau !

effet hydrophobe

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Stockage de l’énergieDéfis énergétiques

• sources d’énergie • stockage d’énergie

Stanford

Quels catalyseurs pour la dissociation de l’eau ?• production de O2: oxydes de Ru, Mn • production de H2: Pt bien mais cher, Co, Ni, hydrogénases

H2O H2 + 1/2 O2

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Conclusions• L’eau, une molécule petite mais complexe!

• Comportement mieux compris grâce techniques modernes!

• Mais certaines propriétés encore mal cernées!

• Rôle central dans grands défis pour énergie et vivant

Eau et catalyse enzymatique Dynamique d’hydratation des protéines et de l’ADN

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