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Licence Biologie-Biochimie - Troisième année Parcours Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes (BOPE) Livret de l’étudiant 2013-2014

Licence Biologie-Biochimie - Troisième année Biologie-Biochimie... · aborder le monde vivant, par ses aspects physiologiques, cellulaires et moléculaires. Ce parcours permettra

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Licence Biologie-Biochimie -Troisième année

Parcours Biologie des Organismes, desPopulations et des Ecosystèmes (BOPE)

Livret de l’étudiant

2013-2014

Licence Biologie-Biochimie

Informations générales

OlivierRichard

[email protected]

(Secrétariat)+33238417099

Directeur des étudesDans le cadre de l'harmonisation européenne des cur-

sus universitaires (réforme LMD Licence-Master-Doctorat), les

mentions de Licence sont constituées de 6 semestres.

Parcours et objectifs

La licence mention � Biologie � Biochimie � a pour

objectifs de :

- former un public étudiant à toutes les disciplines de la

biologie : biologie générale animale et végétale, biologie cellulaire et moléculaire, génétique formelle

et des populations, physiologie animale et physiologie végétale, biotechnologies, écologie, biologie

des organismes et des populations.

- lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3

dans tous les secteurs techniques et scienti�ques des Sciences de la Vie, ces connaissances étant

indispensables à une poursuite d'études vers les Masters Recherches et Professionnels ou à l'inté-

gration dans le monde professionnel dans ce domaine.

- préparer au concours du CAPES Sciences de la Vie et de la Terre, via une insertion dans un

Master de préparation au concours du CAPES (exemple le Master MED-SVT d'Orléans)

- préparer au concours pour le Professorat des écoles, via une insertion dans un Master

de préparation au concours (exemple le Master MEEFA ESPE d'Orléans) mettre à disposition

les savoirs et les connaissances existants à l'Université d'Orléans dans le domaine des Sciences

biologiques.

La licence mention � Biologie � Biochimie � est organisée en 5 parcours :

� Le parcours � Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes � (BOPE)

s'intègre dans le contexte actuel de l'essor des disciplines de l'écologie de la biodiversité et

de l'étude de l'environnement. Ce parcours permet aux étudiants d'approfondir leurs con-

naissances sur les inter-relations des êtres vivants, animaux ou végétaux, ainsi que les liens

avec leur environnement. Les mécanismes adaptatifs, évolutifs, physiologiques et génétiques

seront abordés au niveau des organismes et des populations. Pour ce faire, au-delà des con-

naissances théoriques, des études sur le terrain et en laboratoire, intégrant les outils modernes

de la biologie moléculaire sont proposées.

� Le parcours � Biologie Moléculaire et Cellulaire � (BMC) est destiné aux étudiants voulant

1

aborder le monde vivant, par ses aspects physiologiques, cellulaires et moléculaires. Ce

parcours permettra aux étudiants d'acquérir des connaissances en biologie moléculaire, en

biochimie structurale, en génétique, en biochimie, en biophysique en physiologie humaine et

animale et en immunologie. Les aspects pratiques permettront aux étudiants d'acquérir une

initiation au travail en laboratoire dans ces di�érents domaines. Un choix d'option de chimie

en semestre 6 peut aussi permettre à l'étudiant d'acquérir des connaissances spéci�ques à la

chimie bioorganique.

� Le parcours � Biologie et Biochimie du Végétal � (BBV) est spécialement conçu pour les

étudiants intéressés par le monde végétal et souhaitant se former de façon large aux disciplines

de la physiologie végétale, de la biologie moléculaire et des biotechnologies végétales, ainsi

qu'à l'écologie. Il recouvre ainsi partiellement les parcours BOPE et BMC. Ce parcours qui a

été ouvert aux étudiants durant le contrat précédent a montré qu'il correspondait parfaitement

aux attentes des étudiants � végétalistes �. Il permet par le jeu de la mutualisation des unités

de biologie végétale et de biochimie d'o�rir une formation originale dans ce domaine.

� Le parcours � Biologie Générale et Sciences de la Terre � (BGST) permet aux étudiants

d'approfondir leurs connaissances dans les domaines de la biologie et de la géologie pour être

en adéquation avec les programmes du concours CAPES-SVT. Le programme du CAPES

étant très vaste, ce parcours apportera une partie des connaissances nécessaires à l'étudiant,

le complément étant traité durant la première année du Master � enseignement � proposé à

Orléans.

� Le parcours � Pluridisciplinaire � (PLURI) s'adresse aux étudiants souhaitant obtenir un

niveau Bac+3 a�n de postuler aux concours de la fonction publique d'une part, mais surtout

intégrer les Master préparant au concours de professorat des écoles (comme celui proposé

par l'ESPE d'Orléans-Tours). Pour ce faire, des enseignements scienti�ques seront complétés

par des unités de mathématiques, de français et d'anglais et des enseignements proposés par

l'ESPE.

Conditions d'admission

Semestre 5 : Pour les étudiants inscrits dans le cursus, avoir obtenu au moins un des semestres

de première année de licence.

Pour les étudiants provenant d'autres cursus (Prépa, classes BTS, IUT. . . .) : Après examen des

dossiers par la commission d'équivalence.

Orientation et réorientation

L e choix du parcours en L3 se fera lors de la réunion de pré rentrée ou dans les jours qui

suivent cette réunion. L'étudiant pourra être aidé dans son choix par les directeurs des études.

Un changement de parcours reste possible entre les semestres 5 et 6. Toutefois la dénomination

d'un parcours ne pourra être inscrite sur le supplément au diplôme si les semestres 5 et 6 obtenus

par l'étudiant n'appartiennent pas au dit parcours. L'étudiant obtiendra donc la Licence mention

Biologie-Biochimie (sans spécialité ou parcours précisé)

Glossaire

Unités d'enseignement :

Ensemble d'enseignements comprenant des cours, TD, TP ou autres travaux personnels. Chaque

unité est a�ectée d'ECTS et fait l'objet d'un contrôle de connaissances.

Unités d'ossature : unités d'enseignement obligatoires correspondant à la formation de l'étudi-

ant dans la licence pour le parcours choisi.

Unités optionnelles : unités à choisir dans une sélection d'unités proposées pour personnaliser

son parcours.

Unités libres : UE permettant à l'étudiant de compléter sa formation (culture générale,

méthodologie universitaire, éléments de professionnalisation, stages, compléments de langue,

utilisation des ressources documentaires. . . ). Unités à choisir dans le livret des UE libres de

l'ensemble des composantes de l'Université.

Crédits ECTS (European Credits Transfer System = Système Européen de

Crédits de Transfert)

� A chaque unité d'enseignement (UE) est a�ectée une valeur en crédits qui correspond au

volume du horaire de l'unité. Les crédits sont attribués quand l'unité est validée (note > ou

= à 10/20).

� Chaque semestre validé correspond à 30 crédits. Une licence correspond donc à 180 crédits

(6 semestres).

� Ces crédits représentent une monnaie d'échange et sont :

� Transférables dans toute autre université européenne ;

� Capitalisables c'est-à-dire dé�nitivement acquis quelle que soit la durée du parcours de

l'étudiant.

Grade :

Les grades universitaires sanctionnent les divers niveaux de l'enseignement supérieur. Depuis le

décret du 8 avril 2002 ce sont : le baccalauréat, la licence, le master et le doctorat.

Diplôme :

A chaque grade correspond un titre ou un diplôme. Sont conservées les possibilités de délivrer

deux diplômes intermédiaires, ne correspondant pas à un des grades précédents :

� celui de maîtrise (correspondant aux 60 crédits ECTS des semestres 1 et 2 de master) �

(article 9 de l'arrêté du 25 avril 2002 relatif au diplôme de master),

� celui de DEUG (correspondant aux 120 crédits ECTS des semestres 1, 2, 3 et 4 de licence)

� (article 2 de l'arrêté du 23 avril 2002 relatif aux études universitaires conduisant au grade

de licence).

Ces deux derniers diplômes sont délivrés dans la mention retenue sans indication de

parcours ou de spécialité, mais accompagnés d'un � supplément au diplôme �.

Supplément au diplôme

(décret du 8 avril 2002 portant application au système français d'enseignement supérieur de la

construction de l'Espace européen de l'enseignement supérieur. Art. 2). C'est une annexe descriptive

au diplôme, destinée à assurer la lisibilité des connaissances et aptitudes acquises dans le cadre de

la mobilité internationale.

Equipe de formation :

Chaque mention de licence ou master est pilotée par une équipe de formation qui veille à

l'adéquation de l'organisation des études avec les objectifs �xés, organise l'évaluation générale des

formations et élabore un bilan annuel de la formation.

Conseil de Perfectionnement :

Equipe de formation élargie à des représentants étudiants élus et des personnalités du monde de

la recherche académique, du monde de l'entreprise et des enseignants en lycée (classes du secondaire

et de BTS). Réuni une fois par an, ce conseil, à la lecture des évaluations de la formation, fait évoluer

la licence pour l'adapter au monde socio-économique, de la recherche et aux formations antérieures.

Directeur des études :

En contact direct avec les étudiants et la scolarité de l'UFR, il anime l'équipe pédagogique.

Jury :

Constitué pour chaque semestre et présidé par le Directeur des études, il a en charge le recueil

des notes, l'établissement des moyennes et la validation du semestre. Un jury d'année réuni après

chaque session a en charge la délivrance de l'année et pour la L3 la délivrance �nale du diplôme.

Compensations :

� Pour chaque semestre, si la note globale moyenne est supérieure ou égale à 10/20, le semestre

est validé et lui sont associés 30 ECTS.

� La compensation annuelle s'organise dès la première session entre les deux semestres consé-

cutifs d'une même année universitaire : soit le semestre 5 avec le semestre 6.

Notes éliminatoires :

Pas de note éliminatoire en licence

Le semestre 5

Maquette des enseignements

Parcours Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes

Intitulé ECTS CM TD CTD TP

Ossature

23ECTS

Biodiversité 5 4 4 40

Ecologie Fonctionelle 4 14 8 14

Evolution et adaptation

des angiospermes4 16 10 10

Lois de probabilités et estimation de

paramètres usuels3 24

Insertion professionelle 1 10 9

Bases anatomiques des grandes

fonctions animales3 14 10

Anglais 5 3 24

Di�erenciation

7ECTS

Croissance et développement des

végétaux4 24 12

Entomologie générale 4 14 10 12

Télédetection et cartographie végé-

tale3 2 10 12

Génétique quantitative 3 12 12 24

Maths prépa concours 1 3 24

UEL 3 20

Détail des enseignements

SOL5BO01 BiodiversitéDurée�i1 48 h

Cours à 4 hTD à 4 hTP à 40 h

Semestre 5Objectifs+ Permettre à

l’étudiant dedécouvrir desmilieux naturels denotre région,participer àl’inventaire de lafaune et de la florepar la réalisationd’un herbierpersonnel et d’uneboite de référenced’insectes.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV / BGST

Responsables Christiane Depierreux å [email protected]éraldine Roux å [email protected]

Pré-requis Bases en systématique des arthropodes, en écologie des peuplements et enmorphologie et reproduction des plantes.

Contenu

– Inventaire et diversité taxonomique des principaux groupes d’animaux. Floristique etsystématique du monde végétal. Clefs pour la détermination des taxons rencontrés.Mesure des indices de diversité.

– Observations sur le terrain (un groupe TP terrain encadré par deux enseignants) etanalyses en laboratoire (TP)

Évaluation5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(Animal/Végétal) + CT (oral végétal/écrit

1h + oral Animal)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Oral

Calcul de la note finale :à Première session : 50% CC + 50% CTà Session de rattrapage : 50% Animal + 50% Végétal

SOL5BO02 Ecologie fonctionnelleDurée�i1 36 h

Cours à 14 hTD à 8 hTP à 14 h

Semestre 5Objectifs+ Appréhension

théorique etpratique dufonctionnement desécosystèmes et del’impact desactivitésanthropiques sur lecycle du carbone etl’effet de serre.

Langue(s)

Français

Responsable Aurélien Sallé å [email protected]

Pré-requis Notions d’écologie générale.

Contenu

– Le fonctionnement des écosystèmes ; modalités des transferts de matières et d’énergie(puits, sources, zones de stockage), au travers des réseaux trophiques ; quelques dys-fonctionnements et leurs remèdes ; analyse d’un milieu en liaison avec une perturbation ;notion de pédologie.

– Un groupe de TP terrain encadré par deux enseignants

Évaluation4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CM(CT) + TP/TD (CT oral) 2h+20 minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CM(CT) + TP/TD (CT oral) 2h+20 min

Calcul de la note finale :à Première session : 60% CM + 40% TD+TPà Session de rattrapage : 60% CM + 40% TD+TP

1

SOL5BO03 Evolution et adaptation des angiospermesDurée�i1 36 h

Cours à 16 hTD à 10 hTP à 10 h

Semestre 5Objectifs+ Acquérir les

connaissances surl’évolution etl’adaptation desplantes aux milieux.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV / BGST

Responsable Christiane Depierreux å [email protected]

Pré-requis Notions d’organisation, d’anatomie et de reproduction des embryophytes.

ContenuEvolution et adaptation des végétaux au milieu : Compléments sur la reproduction et l’évo-lution de l’appareil reproducteur des angiospermes. Notions de classification. Adaptationsmorphologiques et anatomiques des végétaux aux différentes contraintes environnemen-tales. Perception des signaux de contrainte : lumière, température, gravité...Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : Ecrit (CT) 2h + TP (CC+CT) 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit (CT) 1h30 + TP (CT) 1h30

Calcul de la note finale :à Première session : 66% Ecrit + 33% TPà Session de rattrapage : 66% Ecrit + 33% TP

SOL5BO04 Lois de probabilités et estimations de paramètres usuelsDurée�i1 24 h

CTD à 24 hSemestre 5

Objectifs+ Acquisition de

connaissances debases en statistique.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BMC / BBV

Responsable Franck Brignolas å [email protected]

ContenuNotion de variable aléatoire (VA) ; VA qualitatives, VA quantitatives discrètes et contin-ues ; principales lois de probabilité et leur utilisation en biologie ; estimation de paramètreset intervalles de confiance.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (Ecrit) 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Oral) 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : 100% CTà Session de rattrapage : 100% CT

2

SOL5BO05 Bases anatomiques des grandes fonctions animalesDurée�i1 24 h

Cours à 14 hTP à 10 h

Semestre 5Objectifs+ Acquisition de

l’anatomie et del’histologie desgrandes fonctionsavantd’appréhender laphysiologie.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE/ BMC / BGST

Responsable Valérie Altemayer å [email protected]

Pré-requis Avoir de bonnes bases en biologie cellulaire.

Contenu

– Cours : Organisation des tissus : tissus épithéliaux – conjonctifs – musculaires. De-scription anatomique et histologique des appareils : circulatoire – respiratoire – digestifexcréteur.

– TP illustration du cours à partir de préparations et de coupes histologiques – Etude del’organisation de tous les appareils présentés en cours chez une souris. Les TP pourrontêtre enseignés en anglais.

Évaluation3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (Ecrit) 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Oral) 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : 100%à Session de rattrapage : 100%

3

SOL5IP01 Insertion professionnelleDurée�i1 19 h

Cours à 10 hTD à 9 h

Semestre 5Objectifs+ Rendre actif la

démarche étudiantepour une insertionaprès la Licence(emploi, formationcomplémentaire,Master).Connaissance dutissu économiquedans le domaine desSciences de la Vie.Réflexion del’étudiant sur sonprojet personnel.Elaboration d’unCV niveau L, d’unedemande de stageniveau L.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BMC / BBV

Responsable Olivier Richard å [email protected]

Contenu

– (4h par des intervenants du domaine) Découverte de l’entreprise privée (dans le do-maine des Sciences de la Vie) : rôle économique, organisation, fonctionnement, typesde métiers, modes de recrutement, droit du travail (4h par des intervenants du do-maine) Découverte de l’entreprise publique (dans le domaine des Sciences de la vie :CNRS/INRA/Université etc ...) : statuts, buts, organisation hiérarchiques et carrières,modes de financement, modes de recrutement.

– Travail en groupe (TD groupe de 20) Initiation à la rédaction d’un CV, d’une lettre demotivation dans le cadre d’une demande de stage ou d’inscription en Master. Premièreapproche de la situation de l’entretien de recrutement (niveau L, objectif le stage oul’insertion en M1). Sensibilisation aux moyens pour rechercher l’information sur lesstages et les emplois (secteur privé). Utilisation des ressources en ligne sur les métiersde la fonction publique.

Évaluation1Coefficient 1ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit / Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT(Ecrit) 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(Ecrit) 1h / CT (Oral) 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : 100% CTà Session de rattrapage : 50% Ecrit + 50% Oral

4

SOL5AG35 Anglais 5Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 5

Objectifs+ Comprendre

l’informationexprimée dans desmessages complexessur le domaine desSciences etTechnologies ets’exprimer sur cemême domaine àl’écrit dans unregistre de langueapproprié.

Langue(s)

FrançaisAnglais

Parcours BOPE / BMC/ BBV / BGST / PLURI

Responsable Hervé Perreau å [email protected]

Pré-requis Avoir suivi Anglais 3 + 4 ou environ 500 heures de formation équivalente.

ContenuTravail de compréhension et d’expression à partir de documents authentiques longs et/oucomplexes, portant sur des innovations technologiques, des découvertes ou avancées sci-entifiques.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC 3h ; RSE : CT 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h30

Calcul de la note finale :à Première session : 100%à Session de rattrapage : 100%

SOL5BO06 Croissance et développement des végétauxDurée�i1 36 h

Cours à 24 hTP à 12 h

Semestre 5Objectifs+ Acquisition des

connaissances debase de laphysiologie dudéveloppement desplantes.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV / BGST

Responsable Daniel Hagège å [email protected]

ContenuLes phytohormones (les principales familles, biosynthèse et dégradation, transport, rôlesphysiologiques, utilisations pratiques) - La graine : de la mise en réserve à la mobilisation -La germination - La floraison (vernalisation, photopériodisme, thermopériodisme, théoriesde la floraison, morphogenèse florale)Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : Ecrit CT 2h / TP CC ; RSE : Ecrit CT 2h / TP CT 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit/TP CT 2h/1h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 66% + TP 33%à Session de rattrapage : Ecrit 66% + TP 33%

Références

Heller et al.-T1 et 2 (Dunod) ; Mazliak et al. (Hermann) ; Laval-Martin et Mazliak (Her-mann) ; Guignard- Biochimie végétale (Dunod 2000) ; Luttge, Kluge et Bauer, Botanique(Tec et Doc 1996) ; Anderson-Beardall : Molecular activities of plant cells. (Blackwell Sci-entific Pub.) ; Campbell : Biologie (De Boeck Université) ; Nultsch : Botanique générale(De Boeck Université) ; Taiz and Zeiger : Plant physiology (Sinauer) ; Buchanan, Gruissemand Jones, Biochemistry and molecular biology (Amer. Soc. Plant Physiol.)

5

SOL5BO07 Entomologie généraleDurée�i1 36 h

Cours à 14 hTD à 10 hTP à 12 h

Semestre 5Objectifs+ Connaître la

systématique desInsectes jusqu’àl’Ordre etsous-Ordre, lescaractèresmorphologiques etles grandesfonctions, et laplace des insectesdans le mondeanimal.

Langue(s)

Français

Responsable StéphanieBankhead-Dronnet

å [email protected]

Pré-requis Caractères généraux des Euarthropodes.

ContenuMorphologie, anatomie et physiologie de l’insecte : appareil digestif et digestion, tissuadipeux, appareil excréteur et osmorégulation, appareil circulatoire, système trachéen etrespiration, systèmes sensoriels et nerveux, appareils reproducteurs. Développement post-embryonnaire, mue et métamorphoses. Physiologie du développement : diapause, contrôleendocrine. Systématique générale ; Eusocialité des insectes ; Insectes parasites.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : Ecrit CT 2h / TP CC ; RSE : Ecrit CT 2h / TP CT 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(Ecrit+Oral) 2h+15min

Calcul de la note finale :à Première session : 75% Ecrit + 25% TPà Session de rattrapage : 60% Ecrit + 40% TP

SOL5BO08 Télédétection et cartographie végétaleDurée�i1 24 h

Cours à 2 hTD à 10 hTP à 12 h

Semestre 5Objectifs+ Utiliser les outils

de télédétectionpour leprétraitement,traitement d’imageset extraction del’information àpartir de donnéesde télédétection.

Langue(s)

Français

Responsable Cécile Vincent å [email protected]

Pré-requis Notions écologie, télédétection, botanique.

ContenuAcquérir des connaissances de base sur le mode d’organisation, la création, la gestionet l’analyse d’une base de données à références spatiales (Systèmes d’Informations Géo-graphiques). Comprendre les principes de base de la télédétection et les potentialitésoffertes par cette technique pour des applications environnementales. Application à uneétude de cas sur le terrain avec relevé floristique et mesures des variables environnemen-tales.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT Oral (E+TP) 15min+20minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Oral 20min

Calcul de la note finale :à Première session : 50% + 50%à Session de rattrapage : 100%

6

SOL5BO09 Génétique quantitativeDurée�i1 24 h

Cours à 12 hTD à 12 h

Semestre 5Objectifs+ Montrer comment

l’analyse formellechez un organismene se limite pas auxcaractèresqualitatifs.

Langue(s)

Français

Responsable Arnaud Menuet å [email protected]

Pré-requis Génétique formelle de première année de Licence.

ContenuEtude de la transmission des caractères quantitatifs. Notions d’héritabilité. Illustration del’analyse des caractères quantitatifs chez l’homme. La sélection artificielle et les nouveauxoutils moléculaires. De la sélection naturelle à la dérive génétique.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC(TD) / CT(Ecrit+Oral) 1h+15min ; RSE :

CT(Ecrit+Oral) 1h+15minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(Ecrit+Oral) 1h+15min

Calcul de la note finale :à Première session : RNE : 33% + 33% + 33% (TD+Ecrit+Oral) ; RSE : 50% +

50% (Ecrit+Oral)à Session de rattrapage : 50% + 50% (Ecrit+Oral)

SOL5MT16 Maths prépa concours 1Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 5

Objectifs+ Permettre à des

étudiants d’acquérirdes connaissancesutiles pour passerles concours d’accèsaux écolesnationalesvétérinaires(concours ENV-voie B), lesconcoursd’ingénieurs agro(concours ENSAvoie B) maiségalement certainsconcoursadministratifs.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BMC / BBV - UE pouvant être prise au semestre 3.

Responsable Athanassios Batakis å [email protected]

Pré-requis Maths niveau BAC S, forte motivation.

ContenuAnalyse : étude des suites et fonctions. Intégration et fonctions différentielles.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : CT 2hà Session de rattrapage : CT 2h

7

Le semestre 6

Maquette des enseignements

Parcours Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes

Intitulé ECTS CM TD CTD TPOssature

19ECTS

Biologie des populations 5 24 12 12

Biologie évolutive et moléculaire 5 28 12 8

Anglais 6 3 24

Tranduction du signal chez les

plantes3 12 4 8

Tests statistiques 3 24

Di�erenciation

11ECTS(1

seulstageterrain

possible)

Fixation de l'azote et agroéconomie

végétale5 24 4 20

Physiologie humaine et comparée 5 34 14

Culture végétale in vitro 3 4 20

Microbiologiée appliquée 3 16 20

Neurosciences et physiologie expéri-

mentale3 6 6 24

Maths prépa concours 2 3 20

Stage Labo 3

Stage terrain : Diversité des algues

marines3 24

Stage terrain : Ecologie du terrain et

faune marine3 24

Détail des enseignements

SOL6BO01 Biologie des populationsDurée�i1 48 h

Cours à 24 hTD à 12 hTP à 12 h

Semestre 6Objectifs+ Appréhender les

modèles de base endynamique etgénétique despopulations.Comprendre lesproblèmes inhérentsà la conservation etaux invasionsd’espèces animaleset végétales.Compétencesvisées : capacité àlire et à comprendreles publications desrevuesinternationales,consacrées auxaspectsfondamentaux etappliqués de labiologie despopulations.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV

Responsable Géraldine Roux å [email protected]

Pré-requis Ecologie générale ; Bases de la génétique formelle.

ContenuDynamique, génétique et évolution de populations d’animaux et de plantes. Applicationsaux domaines de l’exploitation (espèces non domestiques), du contrôle (espèces jugéesnuisibles, invasions) et de la conservation (espèces menacées d’extinction).Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1h

Calcul de la note finale :à Première session : E 66% + TP 33%à Session de rattrapage : E 66% + TP 33%

1

SOL6BO02 Biologie évolutive et moléculaireDurée�i1 48 h

Cours à 28 hTD à 12 hTP à 8 h

Semestre 6Objectifs+ Appréhender les

contraintesphylogénétiquesdans laclassificationévolutive desespèces. Maîtriserles principalesméthodes dereconstructionutilisées enphylogéniemoléculaire.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BGST

Responsables Géraldine Roux å [email protected] Legrand å [email protected]

Pré-requis connaissance des plans d’organisations des animaux et végétaux.

ContenuLa réalité de l’évolution. Caractéristiques et mécanismes biologiques de l’évolution deslignées. Classification et phylogénèse : méthodes (cladistique, phénétique) et principes dela reconstruction phylogénétique (utilisation des logiciels PAUP, Mega). Notions d’évo-lution des génomes, d’horloge moléculaire, de duplication et pertes de gènes, élémentsmobiles (transposons), transferts horizontaux de gènes. Techniques de biologie molécu-laire liées à l’étude des génomes.Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1h

Calcul de la note finale :à Première session : E 75% + TP 25%à Session de rattrapage : E 75% + TP 25%

SOL6AG36 Anglais 6Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 6

Objectifs+ Comprendre

l’informationexprimée dans desmessages complexessur le domaine desSciences etTechnologies ets’exprimer sur cemême domaine àl’oral avec un degréde spontanéité etde fluidité (niveaueuropéen B2).

Langue(s)

Français

Parcours BMC / BOPE / BGST / BBV / PLURI

Responsable Hervé Perreau å [email protected]

Pré-requis Avoir suivi Anglais 5 ou environ 500 heures de formation équivalente.

ContenuTravail de compréhension et d’expression à partir de documents authentiques longs et/oucomplexes, portant sur des innovations technologiques, des découvertes ou avancées sci-entifiques.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC 2h (écrit/oral) / RSE : CT (écrit) 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (écrit) 1h

Calcul de la note finale :à Première session : 100%à Session de rattrapage : 100%

2

SOL6BO03 Transduction des signaux chez les plantesDurée�i1 24 h

Cours à 12 hTD à 4 hTP à 8 h

Semestre 6Objectifs+ Connaissances

générales enagronomie.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV

Responsable Daniel Hagège å [email protected]

ContenuPerception de l’environnement par les plantes (généralités)- Les récepteurs impliqués dansla perception ; Rôle des régulateurs à phosphorelais : les récepteurs à l’éthylène, les ré-cepteurs aux cytokinines, Rôle des LeucineRichRepeat Récepteur Kinases. Acteurs de latransduction et messagers secondaires : les protéines G hétérotrimériques, les petites pro-téines G, les protéines kinases, les phosphatases, les phospholipases, le calcium, l’AMPc,l’adénosine-diphosphate-ribose cyclique. Le système ubiquitine/protéasome.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : Ecrit 1h + TP 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Ecrit 1h + TP 1h

Calcul de la note finale :à Première session : E 66% + TP 33%à Session de rattrapage : E 66% + TP 33%

SOL6BO04 Tests statistiquesDurée�i1 24 h

CTD à 24 hSemestre 6

Objectifs+ Autonomie dans

l’analyse desdonnées.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BMC

Responsable Franck Brignolas å [email protected]

Pré-requis UE Lois de probabilités et estimation de paramètres usuels (semestre 5).

ContenuUtilisation des outils statistiques classiques pour l’interprétation des résultats expérimen-taux et la conception d’expériences dans le domaine des sciences de la vie (écologie,physiologie, génétique, agronomie, médecine, etc.). Décisions statistiques relatives auxproportions, aux espérances et aux variances ; tests d’indépendance, d’homogénéité et d’a-justement ; tests non paramétriques ; plans d’expérience ; corrélation et régression linéairesimple.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : Ecrit 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Oral 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : 100%à Session de rattrapage : 100%

3

SOL6BO05 Fixation de l’azote et agroéconomie végétaleDurée�i1 48 h

Cours à 24 hTD à 4 hTP à 20 h

Semestre 6Objectifs+ Acquisition des

connaissances debase de laphysiologievégétales.

Langue(s)

Français

Parcours BGST / BBV

Responsable Daniel Hagège å [email protected]

ContenuMétabolisme azoté et fixation symbiotique. Du blé au pain- De la vigne au vin. Sor-ties : utilisation des farines boulangères ; laboratoire de recherche sur la qualité des blés ;entreprise vinicole.Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CT (Ecrit) 2h + CC (TP) ; RSE : CT (Ecrit 2h + TP

1h)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Ecrit 2h + TP 1h)

Calcul de la note finale :à Première session : E 66% + TP 33%à Session de rattrapage : E 66% + TP 33%

SOL6BO06 Physiologie humaine et comparéeDurée�i1 48 h

Cours à 34 hTP à 14 h

Semestre 6Objectifs+ Ce module

présente les notionsde base enphysiologie animaleet humainenécessaires pourune compréhensiondes mécanismesphysiologiques chezl’humain.

Langue(s)

FrançaisAnglais

Parcours BOPE / BGST

Responsables Olivier Richard å [email protected] Gomez å [email protected]

Pré-requis Bases anatomiques des grandes fonctions animales (semestre 5)

ContenuCompartiments liquidiens de l’organisme. Hématologie, bases d’immunologie. Physiolo-gie du système respiratoire : aspects anatomo-fonctionnels et régulations. Fonction-nement du système digestif, cheminement de l’aliment de la bouche à l’absorption in-testinale. Physiologie du néphron. Physiologie osseuse et de l’ossification. Introductionaux neurosciences : organisation du cerveau, activités du système nerveux central et pé-riphérique, bases de physiologie sensorielle. Introduction à l’endocrinologie : organisationd’une glande, physiologie hormonale. Physiologie de la reproduction : de la productiondes gamètes à la naissance ; liens entre système hypothamo-hypophysaire et gonades.Les travaux pratiques illustreront le cours sous formes d’ateliers expérimentaux, cer-taines des activités proposées pourront être enseignées en anglais. L’organisation généraleanatomique de l’animal, nécessaire pour la compréhension des aspects physiologiques, seraillustrée à l’aide du modèle murin.Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h (CM+TP)+ Oral 15 minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Ecrit 2h (CM+TP)

Calcul de la note finale :à Première session : E 66% + Oral 33%à Session de rattrapage : 100%

4

SOL6BO07 Stage terrain : écologie du littoral-faune marineDurée�i1 24 h

TP à 24 hSemestre 6

Objectifs+ Apprentissage de

la reconnaissanced’organismesanimaux en rapportavec la diversité etl’écologie des sitesrencontrés lors dustage. Formation etpréparation auxcarrières del’enseignement.Préparation auxmétiers del’environnement età la gestion desécosystèmes.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BGST

Responsable Géraldine Roux å [email protected]

Pré-requis Connaissance des groupes taxonomiques du règne animal.

ContenuTrois journées en Normandie consacrées aux organismes animaux de la zone intertidale,suivies d’analyses et de démonstrations au laboratoire. Ces études se font sur la based’excursions sur différents biotopes représentatifs du milieu (observation des organismeset de l’environnement, prélèvements d’échantillons) et sont axées essentiellement surla faune marine, les insectes et les oiseaux. Elles permettent la mise en relation entrebiodiversité et conditions du milieu. Les séances en laboratoire sont des démonstrations(systématique, dissection, morphologie comparée, etc...) à partir des échantillons récoltés.D’autres études sont réalisées in situ afin de déterminer la diversité, la répartition etla quantification des organismes représentatifs des variations du milieu (salinité, duréed’immersion ou d’émersion, nature du substrat...).Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 30 min (sur site)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Oral 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : 100%à Session de rattrapage : 100%

SOL6BO08 Stage terrain : diversité des algues marinesDurée�i1 24 h

TP à 24 hSemestre 6

Objectifs+ Identifier les

principales alguesdes cotes françaises.Réaliser un alguier.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BBV

Responsable Christiane Depierreux å [email protected]

Pré-requis Connaissance des cycles biologiques des algues.

ContenuEtude sur le terrain (3 jours) des macroalgues benthiques. Observation des algues dansleur milieu naturel, identification des échantillons récoltés par analyse en laboratoire.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :CC + rapport + oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(2) + CT Oral 30 minà Session de rattrapage : RNE et RSE : Pas de session de rattrapage pour le terrain

Calcul de la note finale :à Première session : CC 50% + CT 50%

5

SOL6ST03 Stage laboratoireSemestre 6

Objectifs+ Initiation au travail

de recherche enlaboratoire.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE / BMC / BBV

Responsables Géraldine Roux å [email protected] Brulé å [email protected]

ContenuStage en laboratoire académique ou industriel dans le domaine du parcours envisagé. Ladurée est de 4 à 6 semaines (détails de l’organisation fourni durant le semestre 5, avecsignature d‘une convention de stage.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Oral/Poster

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT Oral 20 min / CC Poster Appréciation / CC

Maître de Stage (MS)à Session de rattrapage : RNE et RSE : Pas de session de rattrapage pour les stages

Calcul de la note finale :à Première session : Soutenance 50% + Poster 35% + MS 15%

SOL6MT11 Maths prépa-concours 2Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 6

Objectifs+ Permettre à des

étudiants d’acquérirdes connaissancesutiles pour passerles concours d’accèsaux écolesnationalesvétérinaires(concours ENV-voie B), lesconcoursd’ingénieurs agro(concours ENSAvoie B) maiségalement certainsconcoursadministratifs.

Langue(s)

Français

Parcours BOPE/ BBV / BMC - UE pouvant être prise au semestre 4.

Responsable Athanassios Batakis å [email protected]

Pré-requis Module maths prépa-concours 1, forte motivation

ContenuAlgèbre linéaire : applications linéaires, matrices, diagonalisation, probabilités.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : CT 2hà Session de rattrapage : CT 2h

6

SOL6BO24 Culture végétale in vitroDurée�i1 24 h

TD à 4 hTP à 20 h

Semestre 6Objectifs+ Connaître les bases

de la culture invitro ; Savoirmanipuler enconditionsd’asepsie ; Maîtriserla technique ; Savoirl’utiliser comme unoutil d’étude desprocessus decroissance et dedéveloppement desvégétaux ; Etrecapable de l’adapterà des problèmesposés par lesprofessionnels de laproduction et del’amélioration.

Langue(s)

Français

Parcours BBV / BOPE

Responsable Stéphane Maury å [email protected]

ContenuDécouvrir cette technologie en s’appuyant sur des bases historiques et physiologiques(totipotence cellulaire ; aptitude à la dédifférenciation/redifférenciation ; propriétés desphytohormones) ; connaître les caractéristiques principales (de l’explant ; de la composi-tion du milieu de culture ; des effets de l’atmosphère gazeuse ; de l’asepsie). Pratiquer defaçon réfléchie la culture in vitro (élaborationd e milieu de culture, introduction de matérielvégétal in vitro ; régénération). Découvrir au travers d’applications pratiques l’utilisationde cette technologie aussi bien pour l’étude des processus développementaux chez lesplantes, que pour la production végétale ou l’amélioration (de la recherche à l’applicationindustrielle) et cela sur quelques exemples choisis parmi la micropropagation, l’embryo-genèse somatique, l’amélioration sanitaire et génétique, la variation soma-clonale ou laproduction de métabolites secondaires.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CT(E) 1h + CC(TP) ; RSE : CT(E+TP) 1h+30minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E+TP) 1h+30min

Calcul de la note finale :à Première session : E 66% + TP 33%à Session de rattrapage : E 66% + TP 33%

SOL6BH07 Microbiologie appliquéeDurée�i1 36 h

Cours à 16 hTP à 20 h

Semestre 6Objectifs+ Donner un aperçu

des différentesutilisationspotentielles desmicro-organismes,de connaître lesdémarches et desavoir effectuer descontrôlesbactériologiques del’eau et enagro-alimentaire

Langue(s)

Français

Parcours BMC / BBV / BOPE

Responsable Maryvonne Ardourel å [email protected]

ContenuInteractions entre micro-organismes : Associations synergiques et antagonistes, commen-salisme, mutualisme, parasitisme. Microbiologie du sol et de l’eau : Les grands cycles(Carbone, Azote, Soufre) ; auto-épuration et biodégradation (ex : xénobiotiques, lixiviats,résidus industriels). Techniques d’analyse des eaux et du sol. Microbiologie médicale :Virus et bactéries pathogènes (habitat, épidémiologie, pouvoir pathogène, diagnostic,traitement). Microbiologie industrielle : Fermentations d’intérêts économiques.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CT(E) 2h + CC(TP) ; RSE : CT (E 2h + TP 1h)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT : Ecrit 2h + Ecrit TP 1h

Calcul de la note finale :à Première session : E 50% + TP 50%à Session de rattrapage : E 50% + TP 50%

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SOL6BO25 Neurosciences et physiologie expérimentalesDurée�i1 36 h

Cours à 6 hTD à 6 hTP à 24 h

Semestre 6Objectifs+ Techniques de

culture cellulaireanimale. Techniquesde chirurgie etd’expérimentationanimale.Pharmacologiecomportementaledu rongeur.Dosages demolécules naturelleschez l’animal.

Langue(s)

Français

Parcours BMC / BOPE

Responsable Stéphane Mortaud å [email protected]

Pré-requis Connaissances de physiologie animale (niveau L2)

ContenuCe module est destiné à apporter à l’étudiant des compétences dans les différentes tech-niques expérimentales appliquées à l’étude des fonctions physiologiques et cérébrales chezl’animal. Ce module principalement pratique abordera entre autres la culture de cellulesnerveuses et leur utilisation, la technique d’immunohistochimie cérébrale ainsi que lesméthodes d’exploration comportementale chez le rongeur. Une approche de l’écotoxicolo-gie illustrera les perturbations induites par l’environnement sur le système nerveux.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/TP

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CT(CM/TP) 2h + CC(TP) ; RSE : CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : RNE : E 50% + TP 50% ; RSE : E 100 %à Session de rattrapage : E 100%

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