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Liste des analyses sous-traitées Page A1/A14 L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date 09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017 Mis à jour 28.08.2017 RL Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire Adénovirus Autre que selles PCR OUI LS1 Adénovirus (respiratoire) Sérum Sérologie STOP NB : Pas utile pour le diagnostic Amibes (Acanthamoeba spp) Biopsie, grattage (eau physiol. stérile) Verre de contact, liquide de lentille Examen direct Culture OUI BE1 Amibes (cf E.histolytica-dispar) Selles native OUI BS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous) « Anthrax » B.anthracis Souche isolée (ou matériel) PCR NANT cf. Responsable Antibiotiques Résistances Souche Confirmation Selon type (LS4) cf. Responsable Antibiotiques rares Souche CMI Selon disponibilité cf. Responsable Antipneumolysines Sérum Sérologie LS4 Antistaphylolysines Sérum Sérologie STOP Plus disponible au CHUV Arbovirus Sérum Sérologie NANT En fonction du virus cf. Responsable Ascaridiose Sérum Sérologie NON BE4 Cf dépistages ASLO Sérum Sérologie OUI SRNJTS sauf si demandes pneumolysines Aspergillus invasif Dosage galactomannane Sérum +LBA Sérologie OUI LS3 Aspergillose invasive diagnostic et suivi du traitement Aspergillus invasif Dosage 1.3-beta-d-glucan Sérum +LBA Sérologie OUI LS3 Aspergillose invasive chez immunocompromis cf candidose invasive Aspergillus et autres (poumon du fermier) Sérum Précipitine GE4 Babesia spp Sang, plasma,… Moléculaire Unine ETUDE MTT Cf Responsable Bactéries Champignons Souche Identification classique OUI ZH1 Bactéries Champignons Souche Séquençage OUI LS1 Envoyer une gélose avec les colonies - par coursier Bartonella henselae (B.quintana) Biopsies, Pus, coupe histologique PCR OUI LS1 envoi par coursier BK polyomavirus (greffés rénaux) Urine, plasma EDTA PCR OUI BS2 Envoi par express nuit Bordetella pertussis Bordetella parapertussis Nez, gorge Frottis ou aspiration PCR OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous) Borrelia miyamotoi Fièvre récurrente Sang LCR PCR SION Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

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Liste des analyses sous-traitées Page A1/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Adénovirus

Autre que selles PCR OUI LS1

Adénovirus (respiratoire)

Sérum Sérologie STOP NB : Pas utile pour le diagnostic

Amibes (Acanthamoeba spp)

Biopsie, grattage (eau physiol. stérile)

Verre de contact, liquide de lentille

Examen direct Culture

OUI BE1

Amibes (cf E.histolytica-dispar)

Selles native OUI BS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

« Anthrax » B.anthracis

Souche isolée (ou matériel)

PCR NANT cf. Responsable

Antibiotiques Résistances

Souche Confirmation Selon type (LS4)

cf. Responsable

Antibiotiques rares Souche CMI Selon disponibilité

cf. Responsable

Antipneumolysines Sérum Sérologie LS4

Antistaphylolysines Sérum Sérologie STOP Plus disponible au CHUV

Arbovirus

Sérum Sérologie NANT En fonction du virus cf. Responsable

Ascaridiose Sérum Sérologie NON BE4 Cf dépistages

ASLO Sérum Sérologie OUI SRNJTS sauf si demandes pneumolysines

Aspergillus invasif Dosage

galactomannane

Sérum +LBA

Sérologie OUI LS3 Aspergillose invasive diagnostic et suivi du traitement

Aspergillus invasif Dosage

1.3-beta-d-glucan

Sérum +LBA

Sérologie OUI LS3 Aspergillose invasive chez immunocompromis cf candidose invasive

Aspergillus et autres (poumon du fermier)

Sérum Précipitine GE4

Babesia spp Sang, plasma,… Moléculaire Unine

ETUDE MTT Cf Responsable

Bactéries Champignons

Souche Identification classique

OUI ZH1

Bactéries Champignons

Souche Séquençage OUI LS1

Envoyer une gélose avec les colonies - par coursier

Bartonella henselae (B.quintana)

Biopsies, Pus, coupe histologique

PCR OUI LS1 envoi par coursier

BK polyomavirus (greffés rénaux)

Urine, plasma EDTA

PCR OUI BS2

Envoi par express nuit

Bordetella pertussis Bordetella

parapertussis

Nez, gorge Frottis ou aspiration

PCR OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Borrelia miyamotoi Fièvre récurrente

Sang LCR PCR SION Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

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Liste des analyses sous-traitées Page A2/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Botulisme intoxication

Selles, sérum Nouveau-né et cas chronique

adultes

Toxine PASTEUR Selles:< 15 sem

Brucella spp Souche Typage BE2 Déclarer au Responsable

Campylobacter spp Souche Identification NENT

Campylobacter spp Sérum Fixation complément

OUI SION

Candida spp Souche Antifongigramme

Cf responsable

Candida invasif Dosage

1.3-beta-d-glucan

Sérum +LBA

Sérologie OUI LS3 candidose invasive chez patients des SI risquant la fungémie cf Aspergillose invasive

Candida spp Mannane et anti

mannane

STOP STOP STOP STOP Jugé mauvais et insatisfaisant

Chlam. pneumoniae Prélèvements respiratoires PCR OUI LS1

Aussi M.pneumoniae Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Chlam psitacci sérologie ZLM

C.trachomatis typages+

Sérovar LGV

Génital PCR OUI LS1

Champignon Prélèvements bactériens PanFungal OUI ZH1

Champignon Identification Séquençage LS1 Envoyer une gélose avec les colonies - MNS

Clostridium perfringens

(Détection de la toxine)

Souche PCR Cf responsable

Coccidioides immitis Sérum Sérologie ZH1 Dépistage avec Histoplasma et Paraccoccidioides

Coronavirus SRAS-SARS

Prélèvement respiratoire protocole OFSP !!

PCR NON GE1 Seulement si critères remplis !! Cf Responsable

Coxiella burnetti (fièvre Q)

LBA, Asp B, plasma Biopsie, liquide biologique

PCR confirmation et contrôle

SION1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Creutzfeld-Jakob prion protéine 14-3-3

LCR réfrigéré ZH4 Remplir avec informations cliniques sur leur feuille spécifique!

Cysticercose Sérum Sérologie OUI BE4

Cytomégalovirus (CMV)

Sérum Avidité IgG OUI LS3

Cytomégalovirus (CMV)

LCR (immunocompromis) LBA

Biopsie Urine du nouveau né <10j

PCR OUI LS1 HIV, immunosupprimés 0.5ml LCR natif Indiquer: tél. + nom du médecin!!

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Liste des analyses sous-traitées Page A3/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

CMV Virémie Plasma

PCR

OUI GE1

Plasma > 1ml courrier A

CMV Virémie (rare) Sang EDTA complet

PCR

OUI LS1

Cas suivi au CHUV Sang EDTA >4 ml courrier A

Dermatophytes Souche Identification et séquençage

OUI ZH1

Diphtérie contrôle vaccination

Sérum Sérologie OUI GE3

Echinococcus spp

Sérum Sérologie OUI BE4

EHEC (VTEC) EIEC EPEC (gènes)

Souches à confirmer selon OFSP

Identification Confirmation

NENT Bouillon GN, gélose Mac Délai réponse= env. 2 sem

EHEC (VTEC) EIEC EPEC (gènes)

Selles à analyser selon demande PCR IMD Réponse dans les 48h

Encéphalite japonaise LCR Sang EDTA

PCR OUI ZLM LCR 0,5 ml

Encéphalite japonaise

Sérologie OUI ZLM

Entamoeba histolytica Selles, biopsie, ponction

Identification OUI BS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Entamoeba histolytica Sérum URGENT Sérologie OUI BS1

Enterovirus Biopsies, sang, LCR PCR GE1 LCR Biofire ou GenXpert

Enterovirus (Echo-, Coxsackie,

Polio-)

Biopsies, liquide péricardique, sang,

Séquençage si PCR positive

GE1 Recherche

spéciale virus

cf responsable. Péricardite envoi du sang EDTA pour virémie et identification (tél12.12.14)

Epstein-Barr virus (EBV)

≥0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du

médecin!!

PCR OUI LS1

Si immuno-compromis

Epstein-Barr virus (EBV) chez les

hémodialysés, gréffés

Plasma Virémie PCR OUI GE1

Eubacterial PCR PCR eubactérienne

Gène 16S direct (prélèvements

stériles)

Biopsie, ponctions stériles

PCR + séquençage

OUI LS1 Si culture stérile contaminations !!

Fièvres hémorragiques

Sérum 1-2 ml .

Sérologie NON (CRIV) GE1

cf. Responsable Téléphoner auparavant ! Indiquer: Région de séjour, Date des 1ers symptômes, Retour du malade, Date du prélèvement, Etat civil Renseignements cliniques: Symptômes, traitement etc

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L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

FSME LCR, sérum, plasma PCR SION1 Cas particulier ETUDES

Galactomannane cf Aspergillus invasif

Sérum Sérologie Suivi et risque Immunodéprimé

Grippe Aviaire (H5N1)

Seulement si les critères remplis !!

PCR multiplex OUI

(CRIV) GE1 Tél au labo !

Cf Responsable

Haemophilus ducreyi

Avec T.pallidum PCR duplex IMD

Haemophilus influenzae

Souche des hémocultures et LCR

Typage OUI BE1

Délai de >2-3 mois !

H. influenzae (type B) LCR PCR multiplex

LS1

H. influenzae typeB (contrôle vaccination)

Sérum Sérologie OUI GE3

Hantavirus (Puumala)

Sérum Sérologie OUI ZLM

Helicobacter pylori Biopsie PCR IMD

Helminthiases tissulaires

Sérum Sérologie BS1 Dépistage

Hépatite A virémie Plasma PCR BE CTS

Hépatite B Plasma 1ml Résistances OUI LS1 Information génotypage donné avec résistances + Feuille LS1B

Hépatite B Plasma 1ml Génotypage OUI LS1 notant virémie obtenue

Hépatite B Plasma Virémie OUI GE1

HCV virémie

1.3 ml plasma

PCR quantitative

OUI GE1C

Back-up du Genxpert si erreur

Hépatite C génotypage

Plasma 1ml

PCR et hybridation

OUI GE1

Sérum aussi OK ! notant virémie obtenue

Hépatite C résistances Plasma EDTA PCR NON GE1B

Hépatites A, B, C

Sérum Sérologie OUI SRNJTS

Hépatites D, E Sérum Sérologie OUI GE1

Hépatite D virémie

Plasma PCR OUI LS1 + Feuille LS1B

Hépatite E virémie

Plasma PCR OUI LS1

Herpes simplex (HSV) 0.5ml LCR natif Frottis dans milieu transport

PCR OUI LS1

Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

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L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Herpes simplex Sang EDTA Virémie OUI BS2

HHV6 Sérum Sérologie OUI GE1

HHV6 LCR PCR et q PCR ? LS1 ou GE1

Info reçu du HUG Manuel Schibler et K.Jaton

HHV8 Sérum Sérologie OUI BS 2

HHV8 Sang EDTA, LCR PCR OUI LS1 (ou BS2)

Histoplasma capsulatum

Sérum Sérologie ZH1 Dépistage avec Coccidioides et Paraccoccidioides

HIV virémie

1.3 ml plasma

PCR quantitative

OUI GE1C

Back-up du Genxpert si erreur

HIV spécialités HIV2 virémie

2 ml plasma tube en sérothèque!!

Virémie NON ZH2

HIV pédiatrie Etude CH

Plasma et sérum selon disponibilité

OUI ZH2B

Tout envoyer

HIV résistances 2 ml plasma garder un tube en sérothèque!!

PCR OUI GE1C

Selon demande aussi CHUV

HIV1, 2: dépistage Sérum Noter si facturation HJB

Sérologie OUI SRNJTS

HIV1,2 AG p24 Sérum Sérologie OUI ZH2

HTLV Sérum (dépistage + WB) Sérologie

OUI GE1

HTLV Sang EDTA (PCR) PCR NON ZH2

IgE totaux Sérum sérologie GE4m

Influenza virus Confirmation PCR OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

JC polyomavirus Urine, (plasma ou sang EDTA)

congelé express nuit

PCR OUI BS2

chez greffés rénaux

JC polyomavirus (LCR)

0.5ml LCR natif indiquer: tél. + nom du

médecin!!

PCR OUI LS1

Cf Responsable !

Kingella kingae Gorge (dépistage) Ponction, sang EDTA

PCR GE2 Si dépistage négatif inf. peu probable VPN élevée

Legionella Souche sérotypage OUI TI

Legionella Expectoration, LBA, Aspiration bronchique, (Urine)

PCR OUI LS1

Toujours cultures !

Leishmania spp

Sérum Sérologie OUI BS1

Leishmania spp Moëlle, biopsies, se garde à 4°C

Express de nuit ! !

Culture OUI BS1 cf. Responsable Avertir BS1

Leptospire Sérum EIA ZLM

Post aiguë référence= Microagglutination

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L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Leptospire Sang EDTA et Urine PCR OUI ZLM Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Listeria monocytogenes

Souche bactérienne Typage Identification

NENT1

Listeria monocytogenes

LCR Liquide amniotique

PCR multiplex

OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Mannane et anti mannane

STOP STOP STOP STOP Jugé mauvais et insatisfaisant

Méningite bactérienne

LCR PCR multiplex

OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

MERS-CoV Cf Virus spéciaux

OUI GE1 Feuille info en annexe Cf responsable

Microsporidies Selles fixées SAF Identification OUI BE1

MRSA Etude CH

Souche

Typage LS6 Envois réguliers cf. Responsable

Mycobactéries MTBC

Biopsie, LCR, par coursier Aspi Bronchique (pas LBA)

PCR OUI LS1 Si PCR pas faite chez nous

MOTT rechercher et identifier

Souche PCR OUI ZH1

Mycobactéries Souche

Typage Antibiogram

me.

OUI ZH1

Mycoplasma pneumoniae

Prélèvement respiratoire, LCR

PCR OUI LS1 Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Neisseria meningitidis

Souche bactérienne Antibiogramme

Typage

GE2B

Neisseria meningitidis

LCR

PCR Multiplex

OUI LS1 .

Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Neoehrlichia mikurensis

LCR Autres

PCR SION Analyse en évaluation chez nous 2014-2016

Oreillons Sérum IgM OUI BE1

Oreillons LCR congelé par express de nuit.

PCR OUI ZLM cf. Responsable

Oreillons Frottis de sténon, gorge, salive, urine

MTV par courrier A

Culture GE1

Rarement !

Papilloma Virus (HPV) Typage

Cas spéciaux PCR OUI LS1

Cf responsable

Parainfluenza 1, 2, 3 Sécrétions naso-pharyngées ou frottis

milieu de transport;

PCR OUI LS1

Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Parasites

Selles, biopsies, ponctions. Sérum

Confirmation Sérologie

OUI BS1

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Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Parvovirus B19 Sang EDTA, sg cordon, courrier A

Moelle osseuse, Synovie, Liquide amniotique, par express de nuit

PCR OUI ZLM cf. Responsable ! Sans code OFAS

Pathogènes émergents

Sérologie, PCR

CNRR Voir avec responsable

Plasmodium spp Frottis sanguin fixé et goutte épaisse ou sang sur EDTA

Confirmation PCR

OUI BS1

Plasmodium spp

Sérum Sérologie OUI BS1

Pneumocoque Contrôle vaccination

Sérum Sérologie OUI GE3

Pneumocoque invasif Souche isolée Typage

BE3

Surveillance en CH (OFSP)

Str. pneumoniae LCR

PCR multiplex

OUI LS1

Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Pneumocystis jirovecii

Biopsie, Expectoration Asp.Bronch, LBA

PCR OUI LS1

Poliomyélite (contrôle de vaccination)

Sérum Sérologie Ne se fait plus Cf Responsable

Poliomyélite Suspicion clinique

2x selles délai 24-48h Culture (PCR?)

BS3 Centre de contrôle de circulation du virus Cf feuille

Rage Dosage IgG vaccination antirabique

Sérum Sérologie OUI BE5

Résistances aux Antibiotiques

BGN: Souche Carba R, ESBL, AmpC, …

CGP: Van-R, Tei-R, Dapto-R Strepto Peni-R

Identification NON NARA Cf liste

Rickettsiose Sérum Sérologie OUI SION1

Rickettsiose

Biopsie,… PCR OUI SION1

Rougeole

Sténon, gorge PCR OUI GE1 Urgence faite le samedi si envoi express nuit et tél. Dr Cherpillot (virologie)

Rougeole IgM confirmation Sérologie ? GE1 Stop Berne sur Liaison !

Rubéole Sérum Avidité IgG OUI DL

Rubéole Liquide amniotique 10 ml; LCR garder réfrigéré

(le lendemain: congeler à -80°C)

PCR OUI ZLM Questions à Dianalabs Genève Dr Sticker

Salmonella spp Souche Identification NENT

Salmonelles WIDAL Sérologie BE1

Séquençage

Souche LS1

Shigella spp Souche Identification NENT

TB SPOT sérologie BE1 Feuille BE6

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Liste des analyses sous-traitées Page A8/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Tétanos contrôle de vaccination

Sérum Sérologie OUI GE3

Toscana Virus

Sérum, Plasma Sérologie, PCR

Pasteur Paris Marseille

Cf Responsable

Toxines de Staphylocoque

(ex: Panton Valentin)

Etude CHUV-Romandie Souche LS6

Toxocara canis

Sérum Sérologie OUI BE4

Toxoplasma gondii Sérum ISAGA IgM, IgA

IF IgM, IgG Aggl. IgG

Avidité

OUI LS3

Tous cas pathologiques

Toxoplasma gondii Sérum de la mère et celui du bébé en même temps

ELIFA OUI LS3

Toxoplasma gondii Liquide amniotique ou LCR ou LBA natif par courrier A –

coursier

PCR OUI LS1

NB: Pas de placenta !

Treponema pallidum Ulcère. Sang, LCR pour confirmation

PCR Oui Chez nous (Contrôle ZH5)

Dermato ZH P.Bossard pour H.ducreyi IMD

Treponema pallidum Neurosyphilis Sérum et LCR

Sérologie Oui ZH5 Production intrathécale

Trichomonas vaginalis PCR IMD

Tropheryma whipplei Salive, selles (dépistage) par courrier A

Sang complet EDTA (pas plasma) et LCR Biopsie,

synovie, ponction moelle sur EDTA express de nuit

PCR OUI ZH1

Cf feuille annexe information de Marseille Whipple digestif, endocardite, Whipple neurologique Sans code OFAS

Trypanosomiases

Sérum Sérologie OUI BS1

Typage MRSA Souche 1/patient moléculaire LS6 Surveillance CH romande

Varicelle zoster Sérum IgA

OUI BE1

Varicelle 0.5ml LCR natif par coursier ou courrier A

tél. + nom du médecin!!

PCR OUI LS1

Laboratoire référent (analyse faite chez nous)

Vibrio spp Souche Confirmation NENT

Virus respiratoires Asp naso-pharyngé, LBA, Asp bronchique, brossage expecto

PCR semi-quantitatificati

on

OUI LS1 Sur demande lors de dépistage positif chez nous

VIRUS spéciaux LCR généralement et Sang PCR Sérologie

GE1

Cf Responsable Sans code OFAS

West Nile Virus Sérum Pas de PCR

Sérologie OUI GE1

Whipple (Maladie de) Cf T.whipplei

Yersinia spp Sérum sérologie OUI BE1 Arthrite

Yersinia spp Souche Sérotype NENT

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Liste des analyses sous-traitées Page A9/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Analyses Prélèvements Méthode Accrédité Sous-traitant Commentaire

Zika virus Urines, plasma ou sang EDTA PCR GE1

Remarques:

1) La répartition des envois ne doit pas être strictement appliquée; il arrive que pour des raisons d'économie du matériel nous devions envoyer l'échantillon au même laboratoire!

2) Le coursier Futurlab est un transporteur privé qui, en accord avec nous, amène les

prélèvements au CHUV et au HUG vers 15h00-16h00 du lundi au vendredi. Monter les prélèvements avant 10h au Labo du 3ème (ou téléphoner si plus tard).

3) Pour les envois par la poste après le passage du coursier MNS, veuillez attendre les

prélèvements de l’après midi avant de les amener au courrier (16h30 pour les paquets). Les formats lettres (<5cm épaisseur) peuvent être envoyés à 18h00 lors de l’envoi du courrier du secrétariat (les lettres de résultats)

Code Adresse Contact

BE1 Institut de Microbiologie Clinique Université de Berne Friedbühlstrasse 51 Postfach 61 3010 Berne

Tél: 031 /632.32.65 Fax: 031/632 49.66 Dr Gorgievski (sérologie et virologie) www.ifik.unibe.ch [email protected]

BE2 Institut de Bactériologie Vétérinaire Länggass-strasse 122 Case Postale 8466 3001 Berne

Tél: 031/631.24.35 Fax: 031/631.26.34 www.vbi.unibe.ch

BE3

Centre National des Pneumocoques Institut de Microbiologie Clinique 3010 Berne

Tél: 031/632.32.65 http://www.ifik.unibe.c h

BE4 Institut Vétérinaire de Parasitologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 8466 3001 Berne

Tél: 031/631.24.18 Prof B.Gottstein www.vetmed.unibe.ch/ipa/

BE5 Intitut Vétérinaire de Virologie Länggass-Strasse 122 Case Postale 3001 Berne

Tél: 031/631.23.78 Fax: 031/631.25.34 Prof E.Peterhans www.cx.unibe.ch/ivv/

BE CTS Service de transfusion sanguine CRS Berne SA Laboratoire diagnostic Murtenstrasse 133 3008 Berne

Tél: 031/384.23.00 Fax: 031./384.23.01 [email protected]

BS1 Institut Tropical Suisse Case Postale 4002 Bâle

Tél: 061/284.82.56 Fax: 061/284.81.18 Dr Marti

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Liste des analyses sous-traitées Page A10/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Code Adresse Contact

BS2 (même feuille que BS1 mais adresse différente)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Labo PCR Petersplatz 10 4003 Bâle

Tél: 061/ 267.32.62 Fax: 061/267.32.98

BS3 CNRR

Institut für Medizinische Mikrobiologie Petersplatz 10 4003 Bâle Centre National de Référence des Rickettsioses UMR 6020 Faculté de Médecine 27, boulevard Jean Moulin 13385 MARSEILLE Cedex 5 FRANCE

Tél: 061/ 267. 32.79 Fax: 061/267.32.98 [email protected] Tél : 00 33 4 91.32.43.75 Fax : 00 33 4 91.38.77.72 Prof D.Raoult

CNRT Coxiella Labo de Microbiologie CHUV Bugnon 48 1011 Lausanne

Tél: 021/ 314.41.11 Fax 021314.40.60 K.Jaton 021/314.40.76 Prof. PD Gilbert Greub

NANT Labo Spiez Austrasse 3700 Spiez

Tél: 033/228.14.01 Fax:033/228.14.02 [email protected] www.labor-spiez.ch

NENT Centre National des Bactéries Entéropathogènes: NENT Institut Für Lebensmittelsicherheit Universität Zürich Winterthurerstrtasse 272 8057 ZÜRICH

Tél : 044/635 86 71 Fax: 044/635.89.08 Dr H Haechler [email protected]

DL Dianalab Rue de la Colline 6 1205 Genève

Tél : 022/807.12.40 Fax: 022/807.12.44 Dr Stricker

GE1 GE1B GE1C

DMGL/Centre d'accueil des prélèvements BAT Lab local 8D-0-850.1 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14

Tél: 022/372.49.80 Fax: 022/ 372.18.35 www.hug-ge.ch/feuille-de-demande

GE2 (Bactériologie) GE2B (méningo)

DMGL/Centre d'accueil des prélèvements BAT C, niveau 5, local 7A-5-759 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14

Tél: 022/372.73.10 (bacté) Tél: 022/372.92.52 (méningo)

GE3 Laboratoire de Vaccinologie Bâtiment des laboratoires 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14

Tél: 079/553.46.70 Barbara.lemaî[email protected]

GE4 HUG, Service d'immunologie et d'allergologie Bâtiment A1, local 8D-4-876 4, rue Gabrielle-Perret-Gentil 1211 Genève 14

Tél: 022/372.93.73

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Liste des analyses sous-traitées Page A11/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Code Adresse Contact

IMD (ZH) Institut für medizinische und molekulare Diagnostik AG Falkenstrasse 14 8024 Zürich

Tél: 044/250.50.50 Fax: 044/250.50.51

LS1 (Diagn. Moléc.) LS1B

Labo de Diagnostic Moléculaire CHUV, Institut de Microbiologie DPML BH18-100 1011 Lausanne

Tél : 021/314.40.48 Fax: 021/314.40.60 K.Jaton 021/314.40.76 www.hospvd.ch/chuv/dml

LS2 (IAL)

Division d'Immunologie et Allergie CHUV DPML BH18-100 1011 Lausanne

Tél : 021/314.08.05 Fax:021/314.08.01

LS3 (Sérologie)

Labo de Sérologie CHUV, Institut de Microbiologie DPML BH18-100 1011 Lausanne

Tél. 021/314.40.69 ou 40.70 Dr Meylan 021/314.40.98

LS4 Service de biomédecine CHUV BH18-100 1011 Lausanne

Tél: 021/314.42.71 Fax: 021.314.80.98

LS6 (HH)

Hygiène hospitalière et épidémiologie Institut de Microbiologie Bugnon 44 1011 Lausanne

Tél 021/314.11.11 Dr Dominique Blanc .hpci.ch/hh_home/hh_dam_accueil.htm

NARA (dés mars 2017)

NARA (CNR des Résistances antibiotiques) Microbiologie Médicale et Moléculaire, Université de Fribourg, Rue Albert-Gockel 3, 1700 Fribourg

Prof P. Nordmann Labo: 026 300 95 83 Mail : [email protected]

PASTEUR

Institut Pasteur CNR Anaérobie et botulisme 28, Rue Du Dr Roux 75724 Paris cedex 15

Tél: 0033 1 45 68 83 10 http://www.pasteur.fr/externe

SION1 (sérologie) SION2 (bactério.)

ICHV Avenue Grand-Champsec 86 1951 Sion

Tél: 027/603.48.62

Dr Alexis Dumoulin www.ichv.ch

SRNJTS (CTS)

Service Régional Neuchâtelois et Jurassien de Transfusion Sanguine

Tél interne: 72044 (labo) Amira Saraj 72035

TI (CRL)

Centre de Référence des Légionelles Institut de Bactériologie Via Mirasole 22 6500 Bellinzona

Tél: 091/814.60.41 – 11 Fax: 091/814.60.29

ZH1 (IMMV)

Institut für Medizinische Mikrobiologie Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich

Tél: 044/ 634.27.00 Fax: 044/ 634.49.06 www.imm.unizh.ch/

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Liste des analyses sous-traitées Page A12/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Code Adresse Contact

ZH2 (Rétrovirus) ZH2B (pédiatrie)

Centre National pour les Rétrovirus Winterthurerstrasse 190 8057 Zürich

Tél :044/634.38.08 Fax: 044/634.26.83 www.imm.unizh.ch/

ZH3 Institut für Medizinische Virologie Gloriastrasse 30/32 8006 Zürich

Tél :044/635.85.01 Fax:044/635.89.07 [email protected] http://www.unizh.ch/paras

ZH4 Institut für Neuropathologie Schmelzbergstrasse 12 8091 Zürich

Tél 044 255 2105 Fax 044 255 4402 www.neuropathologie.usz.ch

ZH5 Laboratorium Dermatologische Klinik UniversitätsSpital Zürich Gloriastrasse 31 8091 Zürich

Tél 044 255 3972 Fax 044 255 4418 [email protected] Dr Philipp Bosshard FAMH Syphilis et Dermatophyte

ZLM (ancien IKMI) (sérol.) ZLM1 (PCR)

Zentrum für Labormedizin Frohbergstrasse 3 9001 St. Gallen

Tél:071/494.37.00 Fax: 071/494.37.85 www.zlmsg.ch

Page 13: Liste des analyses sous-traitées Page A1/A · 2017. 9. 1. · Liste des analyses sous-traitées Page A2/A 14 L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Liste des analyses sous-traitées Page A13/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Questions aux laboratoires sous-traitants:

1. Le laboratoire communique, sur demande, les résultats du CQE à ADMED Microbiologie

2. Un contrôle interne est ajouté régulièrement à tous les paramètres, si indiqué 3. Les cas urgents ou considérés comme tels, sont communiqués par téléphone ou par fax 4. Les changements des méthodes, intervalle de référence, unités, sont déclarés avant leur

introduction dans la routine 5. Un Vademecum est disponible 6. Le laboratoire est accrédité ou en cours d'accréditation: N°STS... 7. Le laboratoire suit une démarche qualité documentée

Laboratoires: 1 2 3 4 5 6 7

Institut für Parasitologie-

Universität Bern (BE4)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 175 OUI

Institut für Veterinär-

Virologie (BE5) OUI OUI OUI OUI NON en cours

STS 215 OUI

Institut Tropical et de Santé

Publique Suisse- Bâle (BS1)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 426 OUI

Institut für Medizinische

Mikrobiologie-Bâle (BS2)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI STS 219

OUI

Service Régional Neuchâtelois et

Jurassien de Transfusion

Sanguine (CTS)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 373 OUI

DIANALAB (DL)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI STS 281

OUI

HUG-Laboratoire de virologie (GE1)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 553 OUI

Laboratoire de Vaccinologie-HUG (GE3)

NON OUI OUI OUI OUI OUI STS 553

OUI

Page 14: Liste des analyses sous-traitées Page A1/A · 2017. 9. 1. · Liste des analyses sous-traitées Page A2/A 14 L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Liste des analyses sous-traitées Page A14/A14

L_Sous-traitance_V2 0_08.docx Accord Mis en vigueur Mis hors vigueur

Fait le Visa Visa Date Visa Date Visa Date

09.02.2017 LVA AJA 09.02.2017 RLI 09.02.2017

Mis à jour 28.08.2017 RL

Institut de Microbiologie

CHUV- Laboratoire de

biologie moléculaire

(LS1)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 328 OUI

Institut de Microbiologie-Laboratoire de

sérologie CHUV (LS3)

OUI OUI OUI NON OUI OUI STS 328

OUI

ICHV-SION (SION1) OUI OUI OUI OUI OUI

OUI STS 296 OUI

Centre de Référence des Légionelles-Institut de

Bactériologie (TI)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 324 OUI

Institut für Medizinische Mikrobiologie

(ZH1)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI OUI

Institut für Medizinische

Virologie-Nationales

Zentrum für Retroviren

(ZH2)

OUI OUI OUI OUI OUI OUI

STS 263 OUI

Zentrum für LaborMedizin-St-Gall (ZLM)

OUI OUI OUI NON OUI OUI STS 155

OUI