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Développement et optimisation de services WebGIS interactifs et communautaires pour l’analyse intégrée de données spatiales environnementales et moléculaires. LtzS BÖHM Alexander EV MARÉCHAL Cyril. PU Christophe CLARAMUNT. Dr. Stéphane JOOST. Problématique. - PowerPoint PPT Presentation
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1
Développement et optimisationde services WebGIS interactifs et
communautairespour l’analyse intégrée
de données spatiales environnementales et moléculaires
LtzS BÖHM AlexanderEV MARÉCHAL Cyril
11/8/2013
Dr. Stéphane JOOSTPU Christophe CLARAMUNT
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 211/8/2013
Déveloper des services WebGIS interactifs et communautairespour chercheurs en écologie moléculaire et décideurs publics:
quels enjeux, quelles solutions?
Problématique
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3
PlanIntroduction
1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs 1. Analyse des besoins en écologie moléculaire
2. Démarche scientifique
3. Évaluation IHM des solutions
2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME1. Interface de GENOMAP
2. Système d’utilisateurs de GENOMAP
3. Visualisation des données environnementales et génétiques dans GEOME
4. Interface de GEOME
3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale 1. Avantages des l’interfaces intégrées de GENOMAP de GEOME
2. Deux plateformes collaboratives au service de la biodiversité
Conclusion, Limites
Références
11/8/2013
Plan
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 4
Introduction1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs
2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME
3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale
Conclusion
Références
11/8/2013
Introduction
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 5
Introduction
LASIG, EPFL, Lausanne, SUI EN, Lanvéoc-Poulmic, FRA
11/8/2013
Introduction
Figure 1 : GC D2 415 Figure 2 : Campus de l’École Navale
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 6
École Navale et PFE
11/8/2013
Introduction
• FHM• D&I• Éthique• GEOPOL• EPMS• Stages Leadership
• FMM• NAV, ASTRO, Voile, BIM• Corvette: BIN, BE
• SCI• TC: SSA, STIC, STM, MTI• VA: GM, GE, EM, ASM, SIM• PFE
• 46 binômes• 21 projets à l’étranger + 2 outre-mer• 13 pays
Figure 3 : Vue depuis la passerrelle d’un BE devant Dunkerque avec une mer 3
Figure 4 : Cours dispenses le semestre de VA.
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 7
Introduction
1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs 1. Analyse des besoins en écologie moléculaire
2. Démarche scientifique
3. Évaluation IHM des solutions2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME
3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale
Conclusions, Limites
Références
11/8/2013
1. Situation
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 811/8/2013
Définition des contextes d’utilisations
1. Situation
Figure 5 : Schéma de extraction et du séquençage d’ADN. [1]
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 9
Démarche scientifique
11/8/2013
1. Situation
“Développement centré utilisateur”
Fig. 7 : UCD @ GENOMAP
Fig. 6 : Workflow
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 10
Évaluation ergonomique
Fig. 8 : GENOMAP Index Fig. 9 : GEOME Homepage
11/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 11
GENOMAP USE CASES
11/8/2013
1. Situation
GENOMAP USE CASES:Mode “Public”
Fig.10: GENOMAP use case diagram 1
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 12
GENOMAP USE CASES
11/8/2013
1. Situation
GENOMAP USE CASES:Mode “Public”Mode “Private”
Fig. 11: GENOMAP use case diagram 2
Plus d’options de personnalisation
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 13
Introduction
1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs
2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME1. Interface de GENOMAP
2. Système d’utilisateurs de GENOMAP
3. Visualisation des données environnementales et génétiques dans GEOME
4. Interface de GEOME3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale
Conclusion, Limites
Références
11/8/2013
2. Mission
14
Interface de GENOMAP
11/8/2013 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL
2. Mission
• Carte Openlayers
• Accès libre
• Affichages des études accessibles
• Système d’utilisateur: études «privées»
• Génération d’url d’accès aux études privées
• Sélection de couleur prédéfinies
• Affichage de trois légendes et de Landmark sur la carte
• Tutorial
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 15
Système d’utilisateurs de GENOMAP
• Inscription libre• Sélection du statut privée/public• Palettes de couleurs personnalisable• Mise à jour de l’étude• Réinitialisation du mot de passe• Administrateur
11/8/2013
2. Mission
2. Mission
1611/8/2013 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL
2. Mission
Visualisation des données environnementales et génétiques dans GEOME
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 1711/8/2013
• Fichier JSON limité à 1 degré autour de l’étude
• Chaque fichier contient les valeurs des 12 mois et annuelle
2. Mission
Visualisation des données environnementales et génétiques dans GEOME
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 1811/8/2013
2. Mission
Visualisation des données environnementales et génétiques dans GEOME
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 1911/8/2013
Interface de GEOME
2. Mission
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 21
Introduction
1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs
2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME
3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale 1. Avantages des l’interfaces intégrées de GENOMAP et de GEOME
2. Deux plateformes collaboratives au service de la biodiversitéConclusion, Limites
Références
11/8/2013
3. Execution
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Avantages des l’interfaces intégrées de GENOMAP et de GEOME
• L'interface de visualisation de GEOME et de GENOMAP• offre l'exploration des données statistiques et binaires géoréférencées;• offre un fort degré d'interactivité avec les éléments représentés;
• Cette interactivité permet notamment : • de sélectionner des individus ou populations;• d'interroger des surfaces de la couche des données environnementales;• d'appeler des informations dérivées;• d'appliquer des analyses statistiques ou spatiales;
• Les concepts principaux qui régissent l’interface sont:• Réduire la charge cognitive ;• Mettre le contrôle entre les mains de l'utilisateur. [2]
11/8/2013 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL
3. Résultats
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Avantages des l’interfaces intégrées de GENOMAP et de GEOME
• La dynamique assure la cohérence • entre les différentes représentations;• entre la carte et les tableaux de bords;
• « Le concept de tableau de bord repose sur l'intégration au sein d'une même interface d'éléments de représentation graphique complémentaires »[2] , tels que :
• Compteur d’individus• Position (LAT, LON)• Valeurs précises des paramètres environnementaux
• « L'utilisateur doit pouvoir obtenir directement les éléments nécessaires au suivi des valeurs et à une prise de décision éclairée et rapide ».
11/8/2013 LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL
3. Résultats
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 24
Introduction
1. Situation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs
2. Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOME
3. Execution: Synthèse entre modèles interactionnels universels et cohérence spatiale
Conclusion, LimitesRéférences
11/8/2013
Conclusion, Limites
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 25
Limites
11/8/2013
Conclusion, Limites
• GENOMAP• Basemap après chargement de données (Gmaps…)• RETEX
• GEOME• Grandes études: optimisation des JSON• Lecture du nom d’individu dans le JSON• Affichage precipitation: limites des valeurs• Inscription doit passer par un administrateur.• Lenteur d’affichage pour les études couvrant une grande surface
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 26
Intérêt• Visualiser des données difficiles à se représenter• Faibles connaissance techniques nécessaires• Accessibilité optimale• Ne nécessite pas d’installation de logiciel• Outils de calculs performant pour GEOME: Sambada (S.Stucki)
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Conclusion, Limites
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 27
• Présentation PFE - CF KESSLER 27 06 2013, http://cours.ecole-navale.fr/mod/resource/view.php?id=2522 (30.07.2013, 13h00)
• [1] http://wwz.ifremer.fr/lareunion/Medias-Ifremer/Medias-Lareunion/CAMP-SOOI/Sequencage-ADN (08.11.2013, 08h21)
• [2]Pointet, A., Solution de cartographie statistique distribuée mapIntera™, PPT, juin 2009
11/8/2013
RéférencesRéférences
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 28
Merci pour votre attention!-
Thank you for having paid attention to our presentation!
Questions
11/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 2911/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3011/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3111/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3211/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3311/8/2013
LtzS BÖHM, EV MARÉCHAL 3411/8/2013
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Futur travaux• Améliorer interface: separer fenêtres (+ sobre)
• Database information on demande
• Color selection and creation in popups
• Generate URL to share in popup
• Evaluate logs : traductions dans d’autres langues
• Transfert technologique (?): • futur OpenLayers 3.0• Django & GEOME
• Téléchargement des données• Extraction d’images annotées• Visualisation de graphes
• études de diversité génétique • = projet Semestre d’une étudiante d’ici • et qui utilisera notre service
19/09/2013 EV2 Böhm, Maréchal