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MDD 1700 – Méthodologie en recherche dentaire

Marie-Claude Laferrière

Bibliothécaire-conseil en sciences de la santé

29 janvier et 5 février 2018

La recherche d’articles et l’utilisation des bases de données

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Revue de littérature et présentation d’un journal

en médecine dentaire• Faire une revue de la littérature à partir d’un article de revue

systématique (ou méta-analyse) dont le sujet est relié au domaine de la médecine dentaire.

» Vous devez utiliser comme références uniquement des articles provenant de la littérature scientifique et de volumes

• Chaque équipe doit choisir et présenter une revue (journal) scientifique spécialisée en médecine dentaire.

» La revue scientifique retenue doit posséder un facteur d’impact.

» La revue scientifique retenue n’a pas à être en lien avec le sujet de la revue de littérature (exemple de choix possibles: Journal of Prosthodontics et revue de littérature sur la carie de la petite enfance).

• Présentation en classe du travail d’équipe

Travail d’équipe

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Plan de la présentation

• Accès aux ressources électroniques

• C’est quoi une base de données (BD)

» Types de bases de données.

» BD pour trouver des articles en médecine dentaire.

» BD pour trouver de l’information sur les périodiques.

• PubMed

» Recherche vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet) > MeSH.

» Recherche vocabulaire libre (mots-clés).

» Autres fonctionnalités de PubMed.

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Accès aux ressources électroniques

Modalités et conditions d'accès• Une fois la session activée, vous pouvez consulter

toutes les ressources électroniques désirées. • La session expire à la fermeture du navigateur

Web ou après 60 minutes d'inactivité.

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C’est quoi une base de données

• Sur le site Web de la Bibliothèque, vous pouvez consulter l’une des multiples bases de données disponibles. (Pour consulter la liste complète)

Outil qui organise et structure l'information dans le but d'en faciliter le repérage.

Permet de repérer :

• Articles de périodiques ou de journaux

• Textes de conférences

• Comptes rendus de livres

• Chapitres de livres

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Types de bases de données disponibles

• Bibliographique : accès uniquement aux références des documents.

» PubMed, Embase, etc.

• Textuelle : accès au texte complet des documents.

» AccessMedicine, Dynamed, Lexicomp, etc.

• Hybride : accès, dans certains cas aux références bibliographiques, dans d'autres cas au texte complet des documents.

» CINAHL Plus with Full Text, Cochrane, etc.

• Numérique : accès à des informations numériques telles que : des données de recensement, des données démographiques, des données géophysiques, etc.

» CANSIM, Institut de la statistique du Québec (ISQ), etc.

• Image : accès à des images, des photographies, des illustrations, des icônes, etc.

» Images from the History of Medicine (IHM), The Flickr Commons, etc.

» https://www.bibl.ulaval.ca/web/medecine/banques-images

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Bases de données utiles en médecine dentaire

•Les bases de données utiles en dentisterie sont répertoriées dans Explorer par discipline -Médecine dentaire.

•Disponibles dans les onglets :

»Article (bases de données bibliographiques et hybrides)

»Livres électroniques (bases de données textuelles)

http://www.bibl.ulaval.ca/web/medecine-dentaire

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Bases de données sur les périodiques

• BD utiles pour trouver de l'information sur les périodiques, tels que le prix, la fréquence de publication, dans quelles bases de données le périodique est indexé, etc.

»ISI Journal Citation Reports (Impact Factor)

»Ulrich's International Periodicals Directory (Consultation limitée à 5 usagers simultanés)

»PubMed Journal Database

• Disponibles sur la page Formations et tutoriels dans Explorer par discipline -Médecine dentaire http://www.bibl.ulaval.ca/web/medecine-dentaire/formations

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Exercice

Quel est son facteur d’impact

en 2016?

19.864

Quelle est sa fréquence de publication?

Mensuel

Trouvez les informations suivantes sur le « Lancet Infectious Diseases»

Utilisez « Journal Citation Report » Utilisez « Ulrich’s»

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Méthodes de

recherche d’articles

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Interroger une base de données

La recherche à l’intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l’aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent:

Vocabulaire libre (mots-clés)

Vocabulaire contrôlé

(thésaurus ou sujet)

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• Méthode de recherche vocabulaire libre

» Recherche simple et avancée (Advanced)

• Méthode de recherche vocabulaire contrôlé

» Recherche MeSH

Recherche dans PubMed

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Vocabulaire libre (mots-clés)

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La recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Généralités

Le vocabulaire libre est la méthode de recherche la plus utilisée.

Utilisation de ses propres mots, afin de repérer des documents sur le sujet d’intérêt.

Le choix et l’orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche.

Recherche dans toute la notice (mais pas dans le texte de l’article). • Le champ à privilégier pour plus de précision dans PubMed est [Title/Abstract].

Astuce : utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chaque concept afin de maximiser le repérage.

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Recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Vos termes de recherche

Les termes utilisés par l’auteur

OlysioLes articles qui mentionnent

l’Olysio directement

Pas nécessairement ceux qui parlent de Simeprevir

ou de Galexos

?

Exemple : Je m'intéresse aux traitements de l’hépatite C chronique chez l’adulte

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Exemple

1. Traduction

Consultation de HeTOP (CisMeF)

Obésité > Obesity

2. Avec le vocabulaire libre, vous devez chercher une combinaison de synonymes ou de variantes orthographiques, si vous voulez trouver tous les articles sur le sujet.

Obesity OR obesities OR obese OR overweight OR over weight OR over eat OR over eating OR weight gain OR body fat OR body mass index OR BMI OR ....

Je cherche des articles qui portent sur l’obésité

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Outils – Traduire les termes de recherche

• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)• Traduit le MeSH de Medline

• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)

• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)

Dictionnaires gratuits en ligne

• Notes de cours, manuels, articles scientifiques et vous!

Autres sources

Disponibles : Explorer par discipline > médecine dentaire > Atlas, dictionnaires et encyclopédies Dictionnaire et ressources sélectionnés > Sélection de dictionnaires et autres ressources > Dictionnaires, grammaires et encyclopédies en ligne

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Trouvez trois synonymes anglophones

pour les caries dentaires.

Dental caries

Dental decay

White spots/ White spot (dental)

Utilisez le HeTOP - Portail Terminologique de Santé du CISMeF.

Exercice – HeTOP

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Outils - Les symboles

Troncature : placée à la fin d’un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme.

Child* permet de repêcher child, children, childhood.

Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d’apparition.

"Mouth protector" ou "Mouth guard" permet de repêcher ces mots tels qu’ils apparaissent dans le texte.

Pour gagner du temps et de la précision

$ * ? | +

""*

Voir le tableau Astuces et syntaxe – Bases de données en sciences de la santé

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Exercices - Recherche simple

Combien trouvez-vous d’articles sur le

diabète insulino-dépendant (Type 1)?

diabetes type 1 > 68 303 résultats

type 1 diabetes > 74 572 résultats

"type 1 diabetes" > 29 627 résultats

diabetes mellitus type 1 > 68 382 résultats

Combien trouvez-vous d’articles de

l’auteur Kevin J. Donly?

Donly, Kevin J[Author] > 55 résultats

Donly, Kevin[Author] > 63 résultats

Donly KJ[Author] > 127 résultats

Donly KJ[Author] OR Donly, Kevin J[Author] OR Donly, Kevin[Author] > 135 résultats

Utilisez la recherche simple. Utilisez la recherche Advanced.

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Vocabulaire

contrôlé (thésaurus ou sujet)

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Méthode de recherche faite à partir de termes normalisés

Le langage propre utilisé par une base de données pour décrire le contenu des articles scientifiques qu’elle indexe.

Pour utiliser cette méthode, on doit d’abord valider notre terme dans le dictionnaire de la base de données, appelé « thésaurus ».

Recherche uniquement dans les mots ou les expressions inscrits dans le champ sujet de la notice.

• Le champ sujet dans PubMed est le MeSH (Medical Subject Headings) • ex: "Disabled Persons"[Mesh]

Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)

Généralités

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Thésaurus

• Listes de termes normalisés:

» Utilisés uniquement dans un domaine particulier.

» Classés par ordre sémantique et hiérarchique.

• Plusieurs termes sont attribués à chaque référence.

Ils permettent de décrire de la manière la plus

précise possible le contenu de l’article.

Par conséquent, les articles sont indexés uniformément, peu importe le vocabulaire utilisé par l’auteur.

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Recherche en vocabulaire contrôlé

(thésaurus ou sujet)

• Avantage: supprime l'ambiguïté du langage naturel (synonymes / variantes orthographiques)

• Permet de regrouper et de repérer tous les documents sur un sujet donné.

Dental Caries

Dental Decay

Dental White SpotCarious Dentin

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Thésaurus en santé

La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent celui-ci est intégré au logiciel de la base.

PubMed

MeSH

(Medical SubjectHeadings)

Embase

Emtree

CINAHL

Descripteurs CINAHL

Cochrane

MeSH

(même que PubMed)

PsyINFO

Thesaurus

(sous l’onglet « Term Finder »)

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Accès au MeSH - PubMed

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Exemple

• Avec le vocabulaire libre, vous devez chercher une combinaison de synonymes ou de variantes orthographiques, si vous voulez trouver tous les articles sur le sujet :

• Avec le vocabulaire contrôlé dans la base de données PubMed, vous devez utiliser uniquement le MeSH: MeSH = Patient compliance

Je cherche des articles qui parlent de l’adhésion des patients à un traitement.

« Patient cooperation » OR « patient adherence » OR « patient nonadherence », « patient non-adherence » OR « patient compliance » OR « patient noncompliance » OR « patient non-compliance » OR ...

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MeSHDéfinition

Subdivisions (qualifier un MeSH)

Transformation du MeSHen concept majeur

Explosion du MeSH par défaut

Synonymes

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MeSH

Concepts plus généraux Ne sont pas recherchés avec le MeSH

Concepts spécifiques > Termes spécifiques recherchés automatiquement

dans PubMed. Pour l'empêcher, sélectionner Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.

Suggestions de MeSH connexes Ne sont pas recherchés avec le MeSH

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Quel est le MeSH pour la mauvaise haleine?

Halitosis

Quel est le MeSH pour le fil dentaire?

Dental devices, home care

Utilisez le MeSH Database ou le HeTOP.

Exercices - MeSH

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Recherche avec les MeSH

Je cherche des articles, dont le sujet principal est l’immunologie de la muqueuse de la bouche.

Exemple

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Résultats de la recherche avec MeSH

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Notice

détaillée

Recherche uniquement dans la section MeSH Terms

MeSH suivi d’un astérisque -> Concept majeur

Terme suivant une barre oblique après un MeSH -> subdivision

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Notice

détaillée

PMID Unique à chaque référence de PubMed

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Exercices MeSH

Combien trouvez-vous d’articles dont le sujet majeur est les complications du bruxisme du sommeil?

"Sleep Bruxism/complications"[Majr]

> 46 résultats

Utilisez la recherche MeSH.

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Autres fonctionnalités

dans PubMed

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Les filtres de recherche (limites)

À partir de la fenêtre des résultats

Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication, journal catégorie, etc.)

Les filtres sont des termes issus du vocabulaire contrôlé (MeSH).

Attention! Show = affichage et non sélection.

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Exercices - Limites

Combien trouvez-vous d’articles qui portent sur la gingivite chez les adolescents?

"Gingivitis"[Mesh]

(Filters: Adolescent: 13-18 years)

> 2296 résultats

Combien trouvez-vous d’articles sur le diabète insulino-dépendant (Type 1) publiés dans un

journal en médecine dentaire?

"Diabetes Mellitus, Type 1"[Mesh]

(Filters: Dental journals)

> 494 résultats

Utilisez la recherche MeSH et les Filters.

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Les opérateurs booléens

Caries

ET/AND OU/OR SAUF/NOT

Boissons sucrées

Boissons sucrées

Boissons gazeuses

AdultesPersonnes

âgées

Limite la recherche à l’intersection des concepts

Additionne les concepts Exclus un concept indésirable (précise la recherche, mais ATTENTION!)

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Combiner des recherches dans PubMed

Dans Advanced, vous pouvez utiliser l’historique de recherche pour combiner plusieurs recherches (AND, OR, NOT).

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Combiner des MeSH

Vous pouvez également utiliser les opérateurs booléens du Builder dans le MeSH Databasepour combiner uniquement des MeSH.

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Combiner des MeSH

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Exercices MeSH

Combien trouvez-vous d’articles sur les effets négatifs des boissons(jus, boissons gazeuses, alcool, etc.) sur l’érosion dentaire?

"Beverages/adverse effects"[Mesh] AND "Tooth Erosion"[Mesh]

> 481 résultats

Utilisez la recherche MeSH.

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Exemple de stratégie de recherche systématiqueQuestion : Est-ce que l’utilisation de la soie dentaire prévient les maladies parodontales?

Vocabulaire libre + vocabulaire contrôlé = Requête systématique

Combinaison des

deux concepts

9. 4 AND 10 = 705 résultats

1. (floss* OR 'dental tape*'):ab,ti = 1 362 résultats

2. (clean* NEAR/4 (interdental OR 'inter dental' OR interproximal OR 'inter proximal')):ab,ti= 212 résultats

3. 'dental floss'/de = 4 167 résultats

Concept 1Soie dentaire

4. 1 OR 2 OR 3 = 5 529 résultats

5. periodont*:ab,ti = 65 784 résultats

6. gingiv*:ab,ti = 45 465 résultats

7. ((gum OR gums) AND (blood* OR bleed* OR inflamm* )):ti,ab = 3 016 résultats

8. ((blood OR bleed*) NEAR/4 prob*):ab,ti = 14 330 résultats

9. 'periodontal disease'/exp = 94 909 résultats

Concept 2Maladies parodontales

10. 5 OR 6 OR 7 OR 8 OR 9 = 143 397 résultats

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Obtenir le texte de l’article

• Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à l’Université Laval.

• Ce dernier est visible si vous:

1. Sélectionnez le Format : Abstract

2. Cliquez sur le titre de la notice.

Vous pouvez configurer Google Scholar pour afficher un lien vers Obtenir@Ulaval

> Paramètres > Lien vers ses Bibliothèques et ajouter les liens et cliquer sur le bouton Enregistrer.

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Si l’article est disponible en version électronique, un ou des hyperliens apparaissent. Cliquez sur le lien vers le

catalogue Ariane 2.0 qui vous permet de vérifier si le document est disponible en version papier.

Cliquer sur Plus d’options, pour vérifier si l’article est disponible gratuitement sur le Web en cliquant sur Google Scholar.

La dernière option est de cliquer sur Colombo pour commander l’article au service du Prêt entre bibliothèques (PEB) • Attention ! Des frais de 5$

par article sont exigés.

Obtenir le texte d’un articleSinon, faites les étapes suivantes pour obtenir l’article.

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Gestion des résultats

• Send to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:

» File : enregistrer les notices sélectionnées» E-mail : envoyer les notices par courriel» Clipboard : permets de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu’à 500

notices (effacées après 8 heures d’inactivité).

Les options sont aussi disponibles dans le Clipboard.

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Création d’un compte NCBI

• Sauvegarder des stratégies de recherche.

• Obtenir des alertes par courriel.

• Personnaliser l’interface de PubMed.

• Service simple et gratuit, mais nécessité de s’inscrire.

Vous permet de :

Créez votre compte My NCBI

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Pour plus d’information!

• PubMed

» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm

» Guide d’utilisation :

• PubMed : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline.pdf

• MeSH : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh.pdf

» PubMed help – http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start

• Plan de concept

» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Plan_concepts_Nursing/Plan_concepts_Nursing.htm

» Word: http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/physiotherapie/planconcepts.docx

• Astuces et syntaxe – Bases de données en santé http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf

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Marie-Claude LaferrièreBibliothécaire-conseilBibliothèque, pavillon Alexandre-VachonBureau 1018-C418 656-2131, poste 7948marie-claude.laferriere@bibl.ulaval.ca

> Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité.

Service de clavardage

Offert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche (Techniciennes à la documentation) documentation)

Obtenir de l’aide