Medline: PubMed et Ovid - bibliothequeduchum.ca · uniques / Accès / Portail documentaire: quelques précisions) Medline – en quelques mots Medline (Ovid et PubMed) Réputation

Medline: PubMed et Ovid

Daniela Ziegler

Bibliothécaire – Informationniste

Centre de documentation du CHUM

Centre de documentation du CHUM (Sources électroniques / Documents

uniques / Accès / Portail documentaire: quelques précisions)

Medline – en quelques mots

Medline (Ovid et PubMed)

Réputation et accès

Interface de recherche

Contenu et mise-à-jour du contenu

Recherche par mots-clés

Recherche par descripteurs MeSH

Combinaisons des énoncés de recherche

Exportation de références

Conservation de recherches

Caractéristiques

Atouts

Exercices

Période de questions

Centre de documentation, 2012

Plan de la présentation













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Les ressources électroniques Centre de documentation CHUM


Portail documentaire CHUM pour les documents disponibles en versions électroniques

Catalogue pour localiser les monographies et les périodiques en

format imprimé sur les rayons du réseau des points de services du Centre de documentation du CHUM

banques de données

Manuels(textbook, handbook), vidéos, etc.

Périodiques électroniques

La collection papier et numérique

en chiffres


120 000 livres;

564 périodiques en papier ou microforme documents

audiovisuels;

344 abonnements disponibles à distance grâce à notre

partenariat avec le Réseau universitaire intégré de santé de

l’Université de Montréal (RUIS de l'UdeM).

Documents uniques Centre de documentation du CHUM

Liste non exhaustive

Périodiques électroniques

Cerebrovascular diseases (plus récent 1 an et non disponible UdeM)

Clinical neurosurgery

Journal of marriage and family (plus récent 1 an et non disponible UdeM)

Journal of neurotrauma (plus récent 1an et non disponible UdeM)

Journal of knee surgery

Journal of vascular and interventional radiology

Methods of information in medicine

ORL : journal for oto-rhino-laryngology and its related specialitie

Seminars in nephrology

Stereotactic and functional neurosurgery (plus récent 1an=non disponible UdeM)

Thrombosis and haemostais

Tissue engineering A + B + C (plus récent 1an=non disponible UdeM)





Exemple de

périodique

électronique

Périodiques imprimés

Actualités néphrologiques Jean Hamburger, Hôpital Necker

Auto-apprentissage

Clinical EEG and neuroscience

Frontiers of radiation therapy and oncology (monographie?)

Genetic counseling (UdeM online après 3 mois, pas papier)

Lymphology

Neurosurgery clinics of north America

Revue de laryngologie, otologie, rhinologie

Seminars in thrombosis and hemostasis (et online)




Périodiques imprimés

Clinical EEG and neuroscience




Exemple de

périodique

imprimé


Pour avoir accès aux ressources, il faut s’identifier:

Pour s’identifier au Portail du CHUM, vous avez besoin

du code p et

du mot de passe.



p0123456

***********



p0123456

***********


Raccourci vers la CINHAL qui est une banque de

données bibliographiques répertoriant plus de 2 900

périodiques dédiés aux disciplines des sciences

infirmières et des sciences paramédicales.

Raccourci vers le Portail documentaire du CHUM

Raccourci vers Medline qui est une banque de données

internationale en sciences de la santé et sciences

biomédicales.

Raccourci vers UpToDate qui est une banque de

données probantes actuelles.

Quelques raccourcis du Portail Intranet du CHUM

Centre de documentation, 2012 Le portail documentaire:

www.bibliothequeduchum.ca

Document non disponible Quoi faire?


Faites une demande

de PEB

(prêt entre bibliothèques)!




Le GeoWeb – la liste des résultats


Le GeoWeb – la notice complète













Caractéristiques

Atouts

Exercices





MEDLINE = Medical Literature Analysis and

Retrieval System Online

est une banque de données bibliographiques regroupant la

littérature relative aux sciences biologiques et biomédicales;

contient plus de 19 millions d'articles, référencés provenant

de plus de 5 000 sources différentes;

les 5600 (et +) journaux y indexés sont choisis par un comité

d'experts appelé Literature Selection Technical Review

Committee en fonction de critères de qualité et de portée.


http://www.nlm.nih.gov/bsd/lstrc/lstrc.html










Medline Ovid et PubMed


Ovid Medline : National Library of Medicine (NLM), avec

l’interface de recherche fournie par OVID Technologies

PubMed: National Library of Medicine (NLM), avec

l’interface de recherche fournie par National Center for

Biotechnology Information (NCBI)













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Medline Ovid: réputation


Depuis 20 ans, Ovid offre à sa clientèle médicale, scientifique et

universitaire des services et des produits de qualité.

Ovid fait partie du groupe Wolters Kluwer Health, fournisseur

leader mondial de l'information pour les professionnels et les

étudiants en médecine, soins infirmiers, paramédicaux et de la

pharmacie.

Source: Innovative Online Research Solutions. Ovid. [En ligne]

http://www.ovid.com/site/pdf/capabilities_brochure/cababilities_brochure_en_0809.pdf


Medline Ovid: accès


L’accès est possible à partir de la page d’accueil du Portail

documentaire.

PubMed Réputation

Outil développé par la NLM (US National Library of Medicine) qui indexe la

littérature biomédicale depuis 1879 afin de fournir aux professionnels de la

santé l'accès aux informations nécessaires pour la recherche en soins de

santé et pour l'éducation.

l'Index Medicus regroupait les tables des matières des principales revues

biomédicales et de médecine, américaines et internationales mais depuis

2004 il est devenu une banque de données connue sous le nom de

MEDLINE.

La version MEDLINE disponible gratuitement sur Internet est offerte par le

NCBI (National Center for Biotechnology Information) et elle peut être

consultée à travers l’interface proposée par PubMed.


Medline: PubMed Accès: les portes d’entrées


Adresse URL de PubMed:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Adresse URL de PubMed avec le profil spécifique de l’UdeM:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=icaumtlib&myncbis

hare=umontreal&dr=citation

Adresse URL de PubMed avec le profil spécifique du CHUM

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=pqccdmlib

Pourquoi utiliser les profils spécifiques?

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=icaumtlib&myncbishare=umontreal&dr=citation

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=icaumtlib&myncbishare=umontreal&dr=citation




Medline: PubMed Accès: Le profil spécifique CHUM et UdeM

Les filtres préétablis permettent de raffiner la

recherche.

Cette option n’est pas disponible lorsqu’on

fait une recherche avec inscription (My

NCBI).

Medline: PubMed Accès: le profil spécifique CHUM et UdeM


Des boutons d’accès rapide pour obtenir :

1. les documents en format numérique

(Collection électronique du CD CHUM)

2. les documents en format papier

(Collection imprimée du CD CHUM)



Le bouton d’accès rapide pour

repérer les documents en format

papier.


Le bouton d’accès rapide pour obtenir

les documents en format

électronique.



Sources électroniques / Documents uniques

Accès

Portail documentaire: quelques précisions



Producteurs de contenu







Conservation de recherche

Caractéristiques

Atouts

Exercices




Medline Ovid: interface de recherche


Medline PubMed: interface de recherche














Caractéristiques

Atouts

Exercices




Medline Ovid et PubMed: contenu

Ovid:

+ l’accès à 14 autres banques de données (Centre de documentation du

CHUM): Embase, Cochrane, Health Technology Assessment , etc.

PubMed:

ayant la même couverture temporelle on y trouve des articles indexés, ceux en

traitement et ceux non retenus, publiés dans des revues indexées sélectivement,

+ de nombreuses banques de données sont disponibles sur le site du NCBI

(National Center for Biotechnology Information): BLAST, Entrez, GenBank,

Molecular Modeling Databanque,OMIM, etc.


Medline Ovid et PubMed: mise-à-jour du contenu

Ovid: MEDLINE In-Process mis à jour quotidiennement

MEDLINE Daily Update mis à jour quotidiennement

MEDLINE mis à jour chaque semaine

Délai minimum de 3 semaines entre la publication des articles et leur disponibilité dans

MEDLINE

Suspension des mises à jour en décembre de chaque année pour une révision globale

PubMed: Nouvelles références versées tous les jours, mais temporairement sans descripteurs

Délai minimum de 1 semaine entre la publication des articles et leur disponibilité

Lors de la révision annuelle, reprise des mises à jour plus rapide que sur Ovid


Source: MEDLINE: comparaison des interfaces Ovid Medline et PubMed. Bibliothèques de science de la santé. Université de

Montréal. 2011. [En ligne]. http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm

http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid: La recherche permet d'inclure les related terms. Par default, les résultats sont

affichés par pertinence. Il est possible également de trier les résultats par pertinence, par année

de publication, par sujet, par auteur, par journal, par type de publication, etc.

La recherche permet de repérer les expressions entières, ex.: gestational

diabetes lorsque la case est cochée. On doit enlever le crochet si on

veut élargir la recherche et faire une recherche par mots-clés.

PubMed: Permet de faire une recherche par mots-clés et par descripteurs MeSH dans la même

opération, à partir de l'écran principal. Le champ Search details indique de quelle façon la

question a été traitée.


Medline Ovid et PubMed: recherche par mots-clés


Medline Ovid: recherche simple par mots-clés


Medline Ovid: recherche simple par mots-clés


Medline Ovid: recherche avancée par mots-clés

0

Gestational diabetes


PubMed Recherche simple

Hpv vaccine and cervical cancer


On remarque que PubMed a fait une

correspondance entre les termes de

recherche et les descripteurs MeSH.

PubMed Recherche simple


PubMed Les caractéristiques de la recherche simple

permet de retrouver les documents qui ne sont pas encore indexés

ne permet pas l’inclusion des termes spécifiques (reliés à un MeSH

générique) ou des expressions lorsque la troncature est utilisée (*) ex: cardiomyopath* pour cardiomyopathies, cardiomyopathy, etc.

impose les guillemets pour chercher une expression exacte

ex: "tuberculosis vaccines" [All Fields]

Si les guillemets sont omis, l’expression sera interprétée: "tuberculosis vaccines"[MeSH Terms] OR ("tuberculosis"[All Fields] AND

"vaccines"[All Fields]) OR "tuberculosis vaccines"[All Fields]

970 résultats

18065 résultats

Recherche effectuée dans PubMed, le 9 mai 2012


PubMed Recherche avancée

Ce type de recherche

permet d’utiliser les

MeSH sans passer par

la MeSH Databanque.

Dans ce cas, il n’y a

pas d’accès à la

définition, ni à

l’arborescence des

MeSH.

Démonstration

Show index List

affiche en ordre

alphabétique

les termes

disponibles

dans la catégorie

choisie

recherche_avancee_pubmed.mp4













Caractéristiques

Atouts

Exercices





MeSH est l'acronyme de «Medical Subject Headings»

Les MeSH sont des descripteurs (termes décrivant les sujets d’un article)

employés par la NLM (National Library of Medicine – É.-U.) pour

indexer les articles dans la banque de données Medline

Les MeSH sont une caractéristique distinctive de MEDLINE

Les MeSH imposent l'uniformité et la cohérence d’indexation de la

littérature biomédicales.

Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH


Les MeSH peuvent englober une seule notion ou plusieurs à la fois:

Un MeSH simple : Infarction

Un MeSH composé: Myocardial Infarction

Les termes MeSH sont organisés hiérarchiquement, classés dans

MeSH Tree Structures et ils sont mis à jour annuellement

Les MeSH sont exclusivement en anglais

Pour la traduction en anglais des MeSH, on peut utiliser le Portail de

terminologie de santé (CiSMeF): http://pts.chu-rouen.fr/index.html


http://pts.chu-rouen.fr/index.html




La recherche par MeSH à partir du menu

déroulant principal est la plus usuelle.



L’accès est possible également par l’onglet

Resources Literature MeSH Databanque.



PubMed: Utilisation des MeSH dans la recherche simple H Pylori – agent causal des cancers gastriques

On peut restreindre la recherche en choisissant un ou

plusieurs qualificatifs ( Subheadings).

Permet de repêcher les articles traitant

le sujet de façon centrale.

Permet d’exclure les termes

spécifiques qui sont inclus par défaut.


MeSH

Définition

Qualificatifs

Synonymes

Indexation antérieure

1984 – 1990

Deuxième arborescence

Première arborescence

Medline PubMed: descripteurs MeSH – la structure


On ajoute le terme trouvé au

PubMed search builder en

cliquant sur Add to search

builder et on fait la recherche

du deuxième terme.



1

2

3

Stomach Neoplasms



permet de retrouver seulement les documents qui sont

indexés dans la banque de données Medline

permet de préciser la recherche en utilisant les termes

qui sont liés à un descripteur MeSH (les termes

spécifiques et les termes génériques



Medline - PubMed Faire une recherche par MeSH à partir d’un document précis

1. Faire la recherche à partir d’un document

connu, considéré pertinent

2. Chercher la description complète du

document: résumé, descripteurs MeSH,

etc.

3. Cliquer sur le MeSH désiré

4. Choisir Add to Search

5. Refaire l’opération avec le deuxième

terme

6. Cliquer sur Search

Ovid:

Propose des descripteurs MeSH lorsque la case est

cochée dans la recherche avancée. Ensuite, on peut choisir soit Focus si on

veut restreindre la recherche au sujet principal, soit Explode pour inclure les

termes spécifiques.

PubMed:

On fait la recherche dans le MeSH Databanque pour trouver des descripteurs.

Les termes spécifiques sont automatiquement inclus - Explode. Si on veut

restreindre la recherche aux sujets principaux, on doit cocher la case Restrict to

MeSH Major Topic . Il est aussi possible de faire ce type de recherche sous

l'option Advanced.


Medline Ovid et PubMed: recherche par descripteurs MeSH


Medline Ovid: recherche par descripteurs MeSH



















Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid: Les énoncés de recherche peuvent être combinés à partir de la page principale de recherche,

en choisissant Search History. On utilise les opérateurs AND ou OR pour la combinaison.

Cette fonction est indépendante du type de recherche choisi.


Medline Ovid: combinaison des énoncés de recherche

PubMed: Il est possible de combiner les énoncés dans le mode recherche avancée.

Les recherches effectuées en mode recherche simple seront conservées dans l’historique de

recherche et elles pourront être combinées par la suite.


Medline PubMed: combinaison des énoncés de recherche













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid:

Maximum de 500 références. Importation

directe vers EndNote ou Zotero avec l'option

Export.

Les notices sélectionnées peuvent être

envoyées par courriel.


Medline Ovid: exportation des références


Medline PubMed: exportation des références

Avec le navigateur

Firefox on peut

télécharger les

références directement

dans Zotero.

Maximum de 500

références par courriel.

Pas de limite pour la

sauvegarde dans un

fichier texte.

Il faut utiliser un filtre

pour importer les

notices dans EndNote.













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid:

Si le on se débranche de la banque de données, les

recherches restent conservées pour 15 minutes.

PubMed:

Si le on se débranche de la banque de données, les

recherches restent conservées pour 8 heures.


Medline Ovid et PubMed: conservation des recherches

Source: MEDLINE: comparaison des interfaces Ovid Medline et PubMed. Bibliothèques de science de la santé. Université de

Montréal. 2011. [En ligne]. http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm

http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid:

Il est possible d'utiliser la même interface de recherche pour plusieurs banques

de données répondant à un sujet de recherche (ex. Medline et Embase).

Les résultats de recherche sont plus précis avec Ovid Medline qu'avec PubMed

car Ovid Medline permet une utilisation simple des options de précision des

résultats (focus, qualificatifs, etc.)

PubMed:

La fonction Single Citation Matcher est très intuitive et permet de repérer

facilement un article sans avoir toutes les informations.

On peut créer des limites permanentes s'appliquant à toutes les recherches

ultérieures en utilisant la fonction My NCBI – filtres.

Le système fait un recherche simultanée par descripteurs MeSH et en

vocabulaire libre .


Medline Ovid et PubMed: caractéristiques


PubMed Éléments de référence bibliographique

Single Citation Matcher

Single Citation

Matcher

C’est un outil qui

permet de

retrouver la

référence

bibliographique

d’un article précis.


Aucun champ n’est obligatoire mais en ajoutant

plus d’informations on a plus des chances à

retrouver l’article qui nous intéresse.

PubMed Éléments de référence bibliographique

Single Citation Matcher













Caractéristiques

Atouts

Exercices




Ovid:

La recherche par descripteurs MeSH est plus efficace que le système PubMed et

elle est très facile à utiliser ayant un résultat de recherche très précis.

L’historique de recherche est visible peu importe le type de recherche choisi.

Le tri par pertinence lors de la recherche simple est très apprécié.

L’exportation directe vers les logiciels bibliographiques (Zotero et EndNotes) est

possible avec le navigateur Internet Explorer.

PubMed:

L’utilisation de profils spécifiques (collection CHUM ou UdeM)

La recherche par mots-clés est plus intuitive car elle utilise un algorithme de

recherche perfectionné.

Les nouveaux articles sont disponibles plus rapidement que dans Ovid.

Gratuit, donc accessible quand on veut consulter à l’extérieur de l’hôpital.


Medline Ovid et PubMed: atouts


Citation Sensor est une fonctionnalité de

recherche de PubMed.

Elle associe une requête avec une référence

bibliographique précise. Le système suggère

les références qui répondent mieux à notre

recherche et il les place dans un rectangle

bleu avant les autres résultats.

PubMed Intuitivité: Éléments de référence bibliographique

Citation Sensor


PubMed Recherche d’informations cliniques

Clinical Queries est un outil qui

propose trois filtres afin de

repérer les publications

pertinentes de haute qualité





Les études cliniques,Clinical Study Category, comprennent les catégories

suivantes: étiologie

diagnostique

thérapie

pronostic

guide de prédiction clinique

Le niveau de précision peut être choisi aussi : spécifique ou sensitif

Les revues systématiques, Systematic Reviews, contiennent: des articles de revues systématiques

des méta-analyses,

des revues d’essais cliniques

des données probantes

des consensus

des guides de pratique clinique

Les filtres Medical Genetics Searches sont développés en collaboration avec

l’équipe GeneReviews: Genetic Disease Online Reviews at GeneTests,

University of Washington, Seattle.













Caractéristiques

Atouts

Exercices





PubMed Exercices

Trouvez le terme anglais correspondant pour encéphalopathies

métaboliques congénitales.

Solution proposée:

Cherchez dans le Portail terminologique de santé du CHU de

Rouen afin de trouver le terme accepté par PubMed.


PubMed Exercices

Trouvez le terme anglais correspondant pour encéphalopathies

métaboliques congénitales.

Résultat PubMed: 36628 références


PubMed Exercices

Peaufinez la recherche en choisissant les documents publiés en

2011 et en 2012, en anglais et en français et seulement ceux qui

sont en accès libre et gratuit.

Résultat PubMed:


PubMed Exercices

Quelle est la date de publication du dernier article écrit par Dr

Fernand Turgeon (Turgeon F) ?

Résultat PubMed:


PubMed Exercices

Combien d’articles a écrit Dr Jean-Claude Tardif (le cardiologue)

dans le Journal canadien de cardiologie?

Résultat PubMed:


PubMed Exercices

Trouvez les articles qui portent sur la fièvre jaune en excluant

ceux qui portent sur le vaccin contre la fièvre jaune.

Résultat PubMed:


Des questions?

Daniela Ziegler

Bibliothécaire-informationniste


514 890-8000, poste 34772


Merci de votre

attention et

à bientôt!


PubMed Bibliographie

Creative commons. [Site Web]. http://creativecommons.org/licenses/ ,

consulté le 12 mai 2012

Guide de la banque de données PubMed. Bibliothèques des sciences de la

santé de l’Université de Montréal. 2011. [En Ligne].

http://www.bib.umontreal.ca/SA/guide-pubmed.htm, consulté le 13 mai

2012.

NLM Training: PubMed. National Library of Medicine of USA. 2011. [En

Ligne]. http://www.nlm.nih.gov/pubs/manuals/pm_workbook.pdf , consulté

le 13 mai 2012

Portail Terminologique de Santé. CHU de Rouen. France. [Site Web].

http://pts.chu-rouen.fr/ , consulté le 12 mai 2012

Ovid. Innovative Online Research Solutions. [En ligne]

http://www.ovid.com/site/pdf/capabilities_brochure/cababilities_brochure_en

_0809.pdf

http://creativecommons.org/licenses/

http://www.bib.umontreal.ca/SA/guide-pubmed.htm



http://www.nlm.nih.gov/pubs/manuals/pm_workbook.pdf

http://pts.chu-rouen.fr/




