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TR | Technicien en technologies de biomolécules profil n° : TR10-CEPIA-11
emploi-type n°: B4X21
Rennes concours : TRB04
Lieu du concours (Centre Organisateur): Rennes
::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL || Concours Externes INRA 2010 :::::::::::::::::::::::::::::
Le technicien en technologie de biomolécules réalise des expériences, des analyses ou des préparations courantes selon un protocole défini.
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n°BAP : B | Sciences chimiques & sciences des matériaux
Département : Dpt Caractérisation Élabo Prod Issus Agricult
unité n° 1253 STLO | Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf
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personne(s) à contacter : Said BOUHALLAB 223485742 [email protected]
Joëlle LEONIL 223485340 [email protected]
Environnement :
L'activité s'exercera dans une Unité Mixte de Recherche (UMR) INRA, Agrocampus Ouest "Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf", au sein de l'équipe Interactions, Structures, Fonctionnalités des Protéines et Lipides composée de 6 chercheurs, 2 enseignants-chercheurs, 3 ingénieurs et 4 doctorants. Les missions du(de la) technicien(ne) incluront : 1- la réalisation d'expériences en biochimie des protéines, 2- la mise en forme des résultats obtenus, 3- dans le cadre de l'Assurance Qualité, de veiller à la bonne marche des expériences et au bon fonctionnement des appareils utilisés (chromatographie, calorimétrie, microscopies, spectrophotomètres), 4- le réglage et l'étalonnage de ces équipements, 5- la tenue d'un cahier de laboratoire en veillant au respect des règles hygiène et sécurité, 6- le travail en équipe (chercheurs, doctorants).
Activités :
Conduire une expérience de laboratoire dans le domaine de l'analyse ou de la préparation de biomolécules. Contrôler la bonne marche des expériences, le réglage des appareils et/ou la conduite des mesures. Préparer des produits de base par les techniques usuelles de laboratoire (distillation, cristallisation,....) Collecter les résultats, les mettre en forme. Tenir un cahier de laboratoire - élaborer les différentes fiches de préparation des réactifs et solutions" Installer les différents postes de travail, effectuer les montages de l'appareillage. Entretenir les petits appareils collectifs, tester les manipulations. Effectuer les approvisionnements et la gestion des stocks de produits chimiques, de petit matériel, de fluide ou gaz. Effectuer les réglages, étalonnages et la maintenance de premier niveau. Gérer le planning d'utilisation des appareils et des salles d'expériences. Travailler en équipe avec les enseignants-chercheurs, les chercheurs et les étudiants Veiller au respect des règles d'hygiène et de sécurité"
Compétences :
Notions de base dans les principaux domaines des biomolécules Notions de base de certains outils mathématiques nécessaires à l'analyse des résultats Notions de base sur les bonnes pratiques de laboratoire appliquées aux techniques d'analyse des biomolécules. Notions de base sur les techniques courantes de synthèse et de caractérisation des biomolécules Connaître la communauté scientifique et technologique de son établissement Maîtriser, dans le cadre des analyses de routine, les techniques de préparation des échantillons. Maîtriser la mise en oeuvre des appareils associés (spectromètre, chromatographe) Maîtriser les techniques courantes de synthèse des biomolécules Rédiger les fiches de préparation de réactifs, de solution. Maîtriser l'utilisation des logiciels courants Collaborer avec les autres intervenants Comprendre l'anglais oral et écrit Notions de base sur les technologies mises en oeuvre Notion de base en électricité Connaître l'organisation et le fonctionnement de son établissement Connaître les risques liés à l'utilisation des produits et des techniques Connaître la réglementation en hygiène et sécurité Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité en situation de travail
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17/09/2010http://www.inra.fr/drh/ce2010/bdd/profil.php?numprofil=TR10-CEPIA-11
2010 | conception et réalisation : DRH - DSI
Prévenir les risques liés à l'utilisation des produits et des techniques Rédiger les commandes et les tableaux d'inventaire Effectuer les gestes de base du travail du verre.
Capacités personnelles :
Baccalauréat, BP, BT Biologie, chimie ou biochimie. Autonomie. Organisation. Savoir travailler en équipe. Savoir manipuler des logiciels et outils informatiques.
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Institut National de la Recherche Agronomique Centre de Recherches de Rennes
CONCOURS EXTERNES 2010
Concours TRB04 BAP B Sciences chimiques et sciences des matériaux 1 poste de technicien en technologie des biomolécules
Centre organisateur : RENNES
Epreuve écrite d’admission : Mercredi 16 juin 2010 (14 h)
durée 3 heures ; coefficient 3
Epreuve écrite : Technicien de Recherche INRA : TRB04 Epreuve sur 70 points Partie 1 : questionnaire à choix multiple 17 points Partie 2 : questions à réponse courte et exercices 30 points Partie 3 : réflexion et expression écrite 20 points La clarté et la concision des réponses seront notées positivement ; L’expression écrite et l’orthographe seront notées sur 3 points. Recommandation générale :
Partie 1 : questionnaire à choix multiple
Instructions : répondre directement en entourant la ou les cases correspondant à la réponse Barème : Absence de réponse : 0 point
Bonne réponse : + 0.5 point Réponse fausse : - 0.5 point
1. Le nombre de personnes qui travaillent à l’INRA est d’environ
a) 1 000 b) 10 000 c) 30 000
2. Que veut dire le sigle EPST ?
a) Etablissement publique à caractère scientifique et technologique b) Entreprise publique de sciences et technologie c) Environnement protégé sous tutelle
3. Quels sont les deux ministères dont dépend l’INRA
a) Agriculture b) Industrie c) Ecologie, développement et aménagement durable d) Recherche e) Budget et Fonction publique f) Culture
4. Parmi les produits suivants, lequel ne nécessite pas une manipulation sous une
sorbonne ? a) éthanolamine b) chloroforme c) éthanol d) méthanol e) acide sulfurique concentré
5. Lequel de ces produits peut être jeté à l’évier :
a) méthanol 30% b) acrylamide c) NaCl 0.9% d) acide iodoacétique 0.5M
6. Vous avez exécuté une expérience qui n'a pas fonctionné et dont le résultat est négatif.
Consignerez-vous cette expérience dans un cahier de laboratoire? a) oui, y compris le résultat même négatif b) non, inutile l'expérience a échoué c) oui mais sans mentionner le résultat puisque négatif d) non, sauf si j'ai du temps
7. Votre collègue manipule des solvants et de l’acide chlorhydrique concentré dans une ampoule à décanter. Soudain, le récipient explose et votre collègue reçoit des projections du liquide le contenant. Quelle est la première chose à faire ?
a) Vous prévenez les secrétaires qu’un accident s’est produit b) Vous téléphonez au 15 c) Vous appelez le 18 d) Vous placez votre collègue sous une douche et l’actionnez e) Vous cherchez un collègue et lui demandez quoi faire f) Vous demandez de l’aide à un collègue qui possède son brevet de secouriste. g) Vous aidez votre collègue à se déshabiller et à se placer sous une douche
8. La variance est
a) le carré de l'écart type b) la racine carrée de l'écart type c) la racine carrée de la moyenne
9. Quel coefficient de corrélation représente le lien le plus élevé entre 2 variables ?
a) - 0.86 b) + 0.09 c) – 0.10 d) + 0.66
10. Pour diluer au 10eme, vous mettez
a) 1 ml de solution et 10 ml de diluant b) 1 ml de solution et 9,9 ml de diluant c) 0,5 ml de solution et 4,5 ml de diluant d) 10 ml de solution et 1 ml de diluant
11. Entourer la bonne réponse
a) 1000 m2 = 1 ha b) 150 mg/µl = 0,15 mg/ml c) 5000 μg = 5 × 10-3 g
12. Quelle est la mauvaise définition du pH ?
a) pH = - log[H3O+] b) pH = - log[OH-] c) [H3O+] = 10-pH
13. Quel est le pH d'une solution HCl à la concentration de 5.10-5 M ?
a) pH 3.3 b) pH 4.3 c) pH 5.3 d) pH 6.3
14. Quel est le pH d'une solution NaOH à la concentration de 5.10-2 M ?
a) pH 1.3 b) pH 10 c) pH 12.7 d) pH 14
15. Vous devez centrifuger 3 tubes de même poids dans un rotor à 6 positions. Comment disposez-vous les tubes ?
a) Avec un tube supplémentaire de même poids
b)
c)
d) Avec un tube vide supplémentaire
16. Combien pèsent 50 microlitres d’eau
a) 5 µg b) 50 µg c) 500 µg d) 5 mg e) 50 mg
17. Une protéine contient des … ?
a) acides gras b) acides aminés c) acides nucléiques d) acides forts e) acides faibles
18. Pour concentrer une protéine de PM 10 000 daltons par ultrafiltration j’utilise une
membrane de seuil de coupure a) 3 kDa b) 12 kDa c) 30 kDa d) 0.2 µm
19. Parmi ces acides aminés lequel est aromatique
a) Valine b) Isoleucine c) Phénylalanine d) Arginine
20. Vous voulez préparer 150 ml de tampon 20 mM à partir d’une solution stock à 0.1 M. Vous mélangez
a) 30 ml de solution stock + 120 ml H2O b) 15 ml de solution stock + 135 ml H2O c) 3 ml de solution stock + 147 ml H2O d) 75 ml de solution stock + 75 ml d’eau
21. Une chromatographie d’échanges d’ions permet de séparer les protéines en fonction de
a) leur poids moléculaire b) leur charge c) leur hydrophobie d) leur affinité pour la matrice
22. On veut effectuer une analyse quantitative sur un mélange inconnu qui donne ce
chromatogramme avec un détecteur UV.
En première approximation il est possible d'affirmer que : a) les concentrations de A et B sont voisines b) les concentrations de A et B sont différentes c) on ne peut rien dire sur les concentrations de A et B
23. A son point isoélectrique, une protéine placée dans un champ électrique
a) migre vers l'anode b) migre vers la cathode c) ne migre pas
24. Vous voulez purifier une protéine par chromatographie d’échanges d’anions. La protéine
à un pKa égal à 4.6. A quel pH devez vous travailler pour que la protéine interagisse avec la résine d’échange d’anions ?
a) pH 3 b) pH 8 c) pH 4.6 d) cela n’a pas d’importance
25. Quel est le rôle de l’EDTA dans un tampon :
a) réduire les ponts disulfures b) chélater le calcium c) neutraliser les charges de la protéine
26. Pour mesurer la densité optique d’une protéine à 280 nm vous devez prendre une cuve
a) en verre b) en polystyrène c) en quartz d) de 10 mm de trajet optique
27. Les caséines sont les protéines majeures
a) des grains de blé b) du lait c) des graines de soja d) des muscles
28. Une structure en feuillet bêta est une caractéristique de la structure protéique a) primaire b) secondaire c) tertiaire d) quaternaire
29. Parmi ces techniques laquelle ne peut pas être utilisée pour calculer le poids moléculaire
d’une protéine : a) électrophorèse b) dosage de Bradford c) spectrométrie de masse d) gel filtration
30. Une électrophorèse SDS-PAGE permet de séparer les protéines selon
a) leur charge b) leur masse c) leur hydrophobie
31. Parmi les détecteurs listés ci-dessous quel est celui qui est utilisé en chromatographie en
phase liquide ? a) catharomètre b) capture d’électron c) réfractomètre d) ionisation de flamme
32. Dans un protocole en anglais, vous lisez : "discard the supernatant and resuspend the
pellet". a) vous gardez le surnageant et jetez le culot b) vous jetez le surnageant et vous remettez le culot en suspension c) vous dissolvez le culot dans le surnageant d) vous reprenez le surnageant dans un tube propre
Partie 2 : questions à réponse courte et exercices
Instructions : répondre directement sur ce document, avec concision et précision. Développez vos calculs à chaque fois qu'il y en a. Barème : total 30 points (voir le barème détaillé avec les questions) 1. Citer 2 à 3 domaines dans lesquels l’INRA développe ses recherches scientifiques (1
point). 2. Que signifie le terme de traçabilité dans un laboratoire de recherche ? (1 point) 3. Citez deux pratiques qui relèvent de l'assurance qualité dans un laboratoire de recherche
(1 point) 4. Donner la formule de la moyenne, de la variance, de l’écart-type et du coefficient de
variation ? (1 point) 5. Mettez la lettre correspondante à la bonne définition des termes ci-dessous dans le
tableau (2 points)
a) Justesse b) Sensibilité c) Robustesse d) Répétabilité e) Reproductibilité
Lettre correspondante Définition Aptitude d'un instrument de mesure à donner des indications très
voisines lors de la répétition des mesures dans des conditions différentes
Aptitude d'un instrument de mesure à être peu sensible aux conditions d'utilisation
Aptitude d'un instrument de mesure à donner des indications exemptes d'erreur systématique
Aptitude d'un instrument à mesurer de faibles écarts
Aptitude d'un instrument de mesure à donner des indications très voisines lors de la répétition des mesures dans les mêmes conditions
6. Quelles sont les significations des pictogrammes suivants ? (1 point)
7. Qu'est ce que la lyophilisation (1 point) 8. Donner les composants principaux du lait (1 point)
9. La teneur en lipides d’un lait demi-écrémé est 15,5 g par litre. Le lait est une excellente source de calcium, il en contient de 100 à 120 mg pour 100 ml. Calculer le pourcentage de lipides dans le lait demi-écrémé sachant qu’un litre de lait pèse en moyenne 1,032 kg. L’apport nutritionnel conseillé en calcium pour un adolescent de 16 à 19 ans est de 1200 mg par jour. Quel est l’apport de calcium d’un bol de lait de 250 ml ? Exprimer en pourcentage cet apport par rapport à l’apport quotidien recommandé. (1 point)
10. Quelles vérifications faites-vous avant d’utiliser une balance de laboratoire ? (1 point) 11. Compléter le tableau suivant (1 point)
10-6 g 10 nmol 10 µmol 50 g/mol 3.5 M
….. ng ….. pmol ….. mol ….. mg/µmol ….. µmol/ml
On donne mol = mole g = gramme M = mole/litre m = milli µ = micro n = nano p = pico 12. Décrivez brièvement le principe de la chromatographie liquide (1 point)
13. Parmi la liste de techniques suivante, indiquer par une croix une ou deux techniques permettant d’avoir accès aux informations sur : (1,5 points)
la structure
secondaire des protéines
la structure tertiaire des protéines
les interactions entre protéines
Résonnance magnétique nucléaire
Cristallographie aux rayons X
Spectroscopie infra rouge
Dichroïsme circulaire Calorimétrie à titration isotherme
Spectroscopie de fluorescence
Résonance plasmonique de surface
Spectrométrie de masse
Chromatographie d’exclusion stérique
14. Compréhension d'un protocole en anglais Preparation of the 105,000 g Supernatant from Catfish Liver Individual catfish were collected from the Salado river (Argentina). Livers were extracted, washed with ice-cold saline (150 mM NaCl) and stored at -20°C. All the remaining steps were performed at 4°C. Livers were cut into small pieces, suspended in 40 mM phosphate (pH 7.4), 150 mM KCl, 1 mM EDTA, 4 mM dithiothreitol, and passed through a glass Teflon homogenizer. The homogenate was centrifuged at 20,000 g for 10 min. The resulting supernatant was further centrifuged at 105,000 g for 90 min. The 105,000 g supernatant (4-5 ml) was loaded onto a Sephadex G-75 column (2.5 × 40 cm) equilibrated with 30 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, 1 mM dithiothreitol, pH 8.5. Elution was performed at 4°C with the same buffer at a flow rate of 16 ml/hr. Fractions containing Fatty acid binding-protein, FABP (elution volume: 115-130 ml) were pooled and applied directly to a DEAE cellulose column (1.0 × 11 cm) previously equilibrated with 30 mM Tris-HCl (pH 8.5). The unbound material was collected, concentrated by using a Centriprep ® concentrator, and further purified by reverse-phase HPLC on a Brownlee TM Aquapore RP 300 C 4 column, which had been equilibrated with 0.1% (v/v) TFA in water (solvent A). The column was developed at a flow rate of 0.2 ml/min with a combination of linear gradients of solvent B (80% [v/v] isopropanol, 0.08% [v/v] TFA). Purified protein was characterised using mass spectrometry.
A. Quelles sont les principales étapes de cette purification ? (1 point) B. Y a-t-il une ou plusieurs précautions à prendre ? (1 point) C. Combien d’étapes chromatographiques sont nécessaires ? indiquer leur nature (1 point)
15. Vous disposez de 4 heures pour réaliser un maximum des taches suivantes. Le temps nécessaire pour effectuer chaque tâche est indiqué en gras. (2 points)
1. réceptionner et ranger une commande de verrerie (45 min) 2. au vu de la verrerie reçue en 1), établir une liste de verrerie à commander (30 min) 3. analyser le spectre d'un produit enregistré précédemment (20 min) 4. effectuer une synthèse d'un composé. Cette réaction dure 110 minutes et ne nécessite aucune attention particulière. Il faut néanmoins en plus procéder aux opérations suivantes :
4a. lancement de l'expérience (30 min) 4b. traitement et isolation du produit synthétisé (60 min)
5. nettoyer le matériel utilisé dans la synthèse ci-dessus (30 min) 6. faire une "pause café" (15 min)
Dans quel ordre allez-vous procéder pour effectuer le maximum de ces tâches (exemple : 1 puis 2 puis 4a etc…) ?
16. L'ensemble des chercheurs de votre laboratoire utilisent 22,5 g d'un produit X chaque
semaine. Vous êtes chargé de tenir et d'approvisionner ce produit en ayant 6 mois d'avance. Ce produit est vendu en flacon de 100 g au prix de 179 euros l'unité. Combien de flacons devrez-vous commander et quel est le montant de la facture ? (1 point)
17. Vous disposez d'un flacon d'acide chlorhydrique concentré avec les indications
suivantes : PM : 36.46 g/mol ; Densité : 1.2 kg/L ; HCl : 37%. Quelles sont la normalité et la molarité de l'acide chlorhydrique dans ce flacon ? (1 point)
Comment réalisez-vous 200 ml de solution à 0.1 N ? Décrivez la verrerie à utiliser (1 point)
Quelles précautions prenez-vous pour réaliser cette solution ? (1 point)
18. Un échantillon de 150 g de viande de porc contient 75% d’eau et 6,2 g de lipides. On
extrait les lipides de cet échantillon. Après analyse, la teneur en phopholipides des lipides totaux s’avère être de 22%. Quelle est la teneur en phopholipide dans l’échantillon de départ exprimée en g pour 100 g d’échantillon ? (1 point)
19. Une solution de lysozyme (0.2 g.L-1) est placée dans une cuve de spectrophotomètre de
trajet optique 1 cm. A la longueur d’onde de 280 nm, l’absorbance de la solution est de 0.528. Quel est le coefficient d’extinction molaire du lysozyme à 280 nm (préciser les unités)? (1 point)
20. Pour réaliser une expérience, il est nécessaire de disposer d'au moins 1 ml de solutions
10-6 M, 10-7 M, et 10-8 M d'un composé de masse molaire 531. Décrivez les étapes de vos manipulations qui vont permettre d'obtenir ces solutions. (2 points)
21. On se propose de séparer par chromatographie liquide en phase inverse 2 composés A et
B. Conditions opératoires : Phase stationnaire apolaire Débit de la phase mobile : 1.7 ml/min Détection à une longueur d'onde de 260 nm pour les 2 composés Données : temps de rétention composé A : 2.24 min composé B : 5.17 min Quel est le composé le plus polaire dans ces conditions ? (0,5 point) La phase mobile est-elle polaire ou apolaire ? (0,5 point) Quel est le type de détecteur utilisé et dans quel domaine spectral travaille-t-on ? (0,5 point) Rappeler l'équation de Beer-Lambert en précisant les unités utilisées (0,5 point) Comment varient les temps de rétention des composés A et B si le débit de la phase mobile est fixé à 1 ml/min ? (0,5 point)
Partie 3 : réflexion et expression écrite
Instructions : répondre sur des feuilles séparées, en précisant bien le numéro de la question Barème : total 20 points (5 points par question) 1. Votre laboratoire vient d'acquérir un nouveau chromatographe en phase gazeuse dont
vous êtes responsable. Cet équipement sera également accessible à des utilisateurs que vous aurez formés au préalable. Quels documents d'assurance qualité mettriez-vous en place dans le cadre de vos fonctions ?
2. Un stagiaire a préparé lundi une solution dont le pH est de 5,0. Vendredi, il vous dit avoir
voulu utiliser la solution et avoir mesuré un pH = 4,2. Quelles questions lui posez-vous et quels conseils lui donnez-vous ?
3. Comment imaginez-vous vos activités au sein du laboratoire ? (10 lignes maximum) 4. Vous obtenez des résultats analytiques aberrants. Que faites vous ? (10 lignes maximum)
CONCOURS EXTERNE 2010
TRB04
TECHNICIEN DE LA RECHERCHE TECHNICIEN EN TECHNOLOGIE DES BIOMOLECULES
EPREUVE ORALE D’ADMISSION
Durée 25 min – Coefficient 3 Temps de préparation 15 min
Question à préparer : Décrivez en quoi votre parcours est en adéquation avec le profil du poste sur lequel vous vous présentez. Temps de l’exposé devant le jury 5 minutes (inclus dans les 25 minutes)
