Parcours Master 2 « Microbiologie, Environnement, Santé (MES) » Université Pierre et Marie Curie – Master « Biologie Moléculaire et Cellulaire », spécialité « Microbiologie »

Muséum National d’Histoire Naturelle – Master « Evolution, patrimoine naturel et société », spécialité « Mécanismes du vivant et Environnement »

http://mes.obs-banyuls.fr

L’étude des microorganismes de l’environnement, leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes, leur impact en santé humaine et leur potentiel de valorisation biotechnologique est plus que jamais d’actualité. Le parcours de Master 2 « Microbiologie, Environnement, Santé (MES) » vise à répondre aux demandes grandissantes des laboratoires académiques et des entreprises dans des domaines variés comme la recherche fondamentale, la valorisation des microorganismes dans l’industrie, les écotechnologies, l’évaluation du risque sanitaire dans l’environnement en général et dans les milieux aquatiques en particulier, le diagnostic environnemental, l’analyse de l’anthropisation des milieux … Le parcours s’appuie sur des connaissances et des compétences dispensées en écologie microbienne, en écotoxicologie, en biochimie, en biologie moléculaire, en bioinformatique et en chimie. Le parcours MES bénéficie : q  d’une complémentarité de compétences des enseignants chercheurs de l’UPMC et du Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris dans le domaine

de la microbiologie (incluant les microorganismes eucaryotes), de sa diversité, de son impact sur les écosystèmes (eau et sol principalement), q  de l’utilisation de plateformes analytiques performantes de l’Observatoire Océanologique de Banyuls et du MNHN, q  de l’intervention de professionnels dans le domaine de la valorisation de biomolécules microbiennes et l’évaluation du risque sanitaire dans

l’environnement.

OBJECTIFS

DÉBOUCHÉS

PRÉREQUIS

ENSEIGNEMENTS ENSEIGNEMENT EN MASTER 2 MES MNHN-UPMC (60 ECTS)

Tronc commun (24 ECTS)

n  Biodiversité et écologie fonctionnelle des micro-organismes (MNHN, Paris) - UE Analyse scientifique (6 ECTS)

n  Caractérisation, rôle et valorisation des molécules microbiennes(MNHN, Paris) - UE de spécialisation (6 ECTS)

n  Qualité des milieux aquatiques et risques microbiologiques (UPMC, Banyuls) UE de spécialisation (6 ECTS)

n  Génomique environnementale et applications biotechnologiques (UPMC, Banyuls) - UE projet (6 ECTS)

n  Stage en laboratoire/entreprise (30 ECTS): 22 semaines

ORGANISATION

CONTACTS

Cette formation s’ouvre vers des postes de cadre en R&D ou en recherche fondamentale, mais également vers des activités de management ou de conseil dans des structures publiques ou des entreprises qui ont une activité en relation avec la santé et/ou l’environnement et dans lesquelles la microbiologie occupe une place importante. q  Les secteurs de l’enseignement supérieur et de la recherche : Universités, CNRS, CEA, INRA, IFREMER, ANSES, INERIS, CIRAD, IRD. q  Les secteurs économiques privés et publics : Industries pharmaceutiques et technologies de la santé, de l’environnement, INERIS, DDASS, DIREN, agences de

l’eau …

Le premier semestre est composé de 4 unités d’enseignement obligatoires de 6 ECTS chacune, se déroulant au MNHN de Paris et à l’Observatoire Océanologique de Banyuls (UPMC). A ces UE obligatoires s’ajoutent 6 ECTS d’UE d’ouverture à choisir dans une liste d’UE conseillées selon le projet professionnel de chaque étudiant. Les stages du second semestre se déroulent sur une durée minimum de 22 semaines dans un laboratoire de recherche ou de R&D d’établissements publics à caractère scientifique et technologique (ex. CNRS, INRA, IRSTEA, Universités), d’établissements publics à caractère administratif (ex. ANSES, ONEMA) ou d’entreprises (ex. Veolia, Suez-Environnement, EDF).

UE d’ouverture conseillées (6 ECTS)

n  Ecotoxicologie (6 ECTS MNHN, Paris) n  Valorisation des travaux de recherche & technologiques du vivant (3 ECTS, MNHN, Paris) n  Physiologie intégrative des microorganismes (6 ECTS, UPMC, Banyuls) n  Principes de bio-informatique appliqués à l’écologie microbienne (3 ECTS, UPMC, Banyuls) n  Ecologie microbienne des sols (3 ECTS, UPMC, Paris) n  Risques microbiologiques naturels ou provoqués ( 6 ECTS, UPMC, Paris) n  Production de protéines recombinantes (3 ECTS, UPMC, Paris) n  Valorisation de la recherche – Application à l’industrie et la recherche (3 ECTS, UPMC, Paris) n  Atelier - Transferts de gènes in vivo (3 ECTS, MNHN, Paris) n  Atelier - Isolement et analyse structurale de biomolécules (3 ECTS, MNHN, Paris) n  Atelier - Acquisition et traitement d’images (3 ECTS, MNHN, Paris)

Etudiants justifiant des compétences nécessaires et des crédits correspondants qui pourront intégrer la formation au niveau Master 2. Les formations privilégiées menant au Master 2 MES sont le Master 1 « Mécanismes du Vivant et Environnement » du MNHN (www.mnhn.fr/fr/enseignement-formation) et le Master 1 « Biologie Moléculaire et Cellulaire » de l’UPMC (www.master.bmc.upmc.fr). Les étudiants provenant du Master 1 de la mention « Biologie Moléculaire et Cellulaire » de l’UPMC sont encouragés à suivre au moins deux des UE d’orientation suivantes : Ecologie microbienne (4V117, 6ECTS), Microorganismes de l’environnement (4V268, 6ECTS), Biotechnologie microbienne appliquée à l’environnement (4V128, 6ECTS). La sélection sera effectuée par les membres du comité pédagogique sur dossier.

Secrétariat pédagogique :�Lydie Feron (UPMC) - lydie.feron@upmc.fr Partricia Maroleau (MNHN) - maroleau@mnhn.fr

Responsables pédagogiques :�Dr. Fabien Joux (UPMC) - joux@obs-banyuls.fr Pr. Cécile Bernard (MNHN) - cbernard@mnhn.fr