Prlvements gnitaux et IST bactriennesDES Bactriologie 16/03/2009

Nathalie Harb Florence Boulez Tuteur: Dr S. Tigaud1

Objectifs Identifier les germes pathognes parmi les commensaux de la flore vaginale normale Diagnostiquer les infections du tractus gnital et la vaginose dveloppe partir de la flore commensale Diagnostiquer les IST Prvenir chez la femme enceinte les infections maternofoetales Bilan dinfertilit Aide au traitement antibiotique Suivi du traitement et contrle de la gurison Epidmiologie2

Infections uro-gnitales

3

Circonstances de dcouverte des Infections gnitales bassesHomme Ecoulement Brlures urtrales Balanite Balanoposthite Femme Leucorrhe Prurit Douleurs Spontanes Dyspareunies Cervicite 2 Sexes Ulcrations gnitales Adnopathies Anorectite Vgtations vnriennes

Signes vocateurs

4

Chez la femme

5

Flore vaginale normale Femme adulte en ge de procrer: 108 109 germes/ml de scrtion vaginale Lactobacilles (95%) Prdominance anarobies (2 5 fois plus que arobies) Peptostreptococcus, Prevotella spp, Bacteroides spp, Eubacterium spp 5 10 autres espces bactriennes en faible quantitG. vaginalis, U. urealyticum, M. hominis, S. epidermidis, S. aureus, Streptocoques D, Streptocoques bta hmolytiques, entrobactries, levures...

Modification fonction de: Age Imprgnation hormonale, contraception Etat de gravidit Activit sexuelle, conditions hyginiques, facteurs iatrognes, stress...6

Flore vaginaleGroupe 1 Groupe 2 Groupe 3

Flore bactrienne de Flore digestive Flore oropharynge portage vaginal colonisant souvent le (isole de la flore vaginale chez < 2% habituel (dominante) vagin des femmes)Lactobacilles (1 4 espces / femme) S. agalactiae, entrocoques, entrobactries, BGN non fermentants, staphylocoques, anarobies, G. vaginalis, A. vaginae, mycoplasmes, S. viridans, C. albicans H. influenzae et parainfluenzae, S. pyogenes, S. pneumoniae, Mningocoque et autres Neisseria, Branhamella

Examen direct des prlvements vaginaux pH: 3,8 4,5 Cytologie

Quelques cellules pithliales

: trouble de la trophicit vaginale

Leucocytes: < 5/champ (x100) :Phase prmenstruelle Inflammation IST: gonocoque, Chlamydia, T. vaginalis Infection Streptocoques, Staphylocoques, Colibacilles en culture prdominante mycoses ou vaginoses8

Normaux ou peu

Pathologies rencontres Vaginose Vaginite Cervicite Salpingite, endomtrite Pritonite

9

VaginoseDsquilibre de la flore vaginale normale (quasi disparition des lactobacilles et prolifration de G. vaginalis, anarobies, M. hominis, Atopobium vaginae...)

iagnostic: 3/4 critresPrsence de scrtions homognes gristres o Test la potasse o pH > 4,5 o clue-cellso

iagnostic de vaginose en pratique

=> Score de NugentKrohn- HillierCulture inutile

Absence dinfluence sur le traitement10

Score de Nugent-Krohn- Hillier

11

Vaginose Vaginose et pathologies o Augmentation du risque d'infections gnitales hautes o Vaginose et augmentation transmission sexuelle HIV, HSV2, N. gonorrhoeae, C. trachomatis o Association significative: vaginose et infection HPV o Complications obsttricales

Traitement: efficacit 48 85% o Mtronidazole: per os ou intravaginal o ou clindamycine intravaginal o Lactobacilles en intravaginal: en cas de vaginose rcurrente (restaure une flore normale), ou en traitement prophylactique12

VaginiteVaginite non spcifique Germes Leucorrhes Germe banal Abondante +/- ftide Vaginite Trichomonas vaginalis Verdtre ftide Vaginite Candida spp Epaisse blanchtre grumeleuse Prurit dyspareunie

Signes associs

Douleurs spontanes, Inconfort++ Dyspareunies, +/dyspareunie brlures urinaires, Prurit prurit

13

Tableau clinique

Agent trs frquentGardnerella vaginalis Mobiluncus spp. Mycoplasma hominis Atopobium vaginae Candida albicans Trichomonas vaginalis Chlamydia trachomatis (srovar D K) Neisseria gonorrhoeae

Agent moins frquent

Vaginose

Vaginite Cervicite

N. gonorrhoeae

Mycoplasma genitalium Entrobactrie N gonorrhoeae Pneumocoque S aureus Anarobies 14 M hominis, M genitalium?

Salpingite

Chlamydia trachomatis

Principaux micro-organismes des voies gnitales fminines

15

La femme enceinte

16

Femme enceinte Infections NN: 1-4/1000 naissances Recherches systmatiques Treponema pallidum srologie au 1er trimestre Streptococcus agalactiae (34-38 SA) Columbia ANC; Granada

Recherche du portage de Streptococcus agalactiae: 8 20% des femmes enceintes Plvt sans spculum, du tiers vaginal infrieur lors de la dernire consultation avant la date prvue de laccouchement (34e-35e semaine). Antibiothrapie prventive pendant laccouchement Evaluation semi-quantitative de 1+ 4+ Tests rapides: non conseills actuellement

Infections bactriennes chez la femme enceinte Vaginose, vulvo-vaginite, endocervicite RPM MAP Chorioamniotite MFIU, RCIU Infection ftale ou nonatale Endomtrite post- partum, sepsis maternel

Si ATCD daccouchement prmatur Recherche vaginose bactrienne en dbut de grossesse afin de la traiter X 2 du risque dAP

Recherches dans PV et P endocol18

Infections bactriennes chez la femme enceinte Les bactries recherches germes haut risque infectieux pour le nouveau-n S. agalactiae, E. coli K1, H. influenzae,(L. monocytogenes) Germes banals (idem femme non enceinte) Plus rarement: S pneumoniae, N menigitidis, S aureus, S pyogenes Germes des IST: C trachomatis, N gonorrhoeae , syphilis

Chez lhomme

20

Tableaux cliniques Urtrite:o

coulement matique (svt matinal), brlures mictionnelles SFU, syndrome infectieux, douleurs pelviennes, prostate douloureuse et augmente de volume Syndrome infectieux, douleurs scrotales intenses, signes inflammatoires locaux

Prostatite:o

Orchi-pididymite:o

Anite Ulcres anognitaux

21

Micro-organismes impliqusUlcrations Urtrites Prostatites OrchipididymitesN. gonorrhoeae C. trachomatis Mycoplasmes ? E. coliRarement: M.

T. pallidum H. ducreyi C. trachomatis L K. granulomatis HSV

N. gonorrhoeae C. trachomatis 60% E. coli ou autres germes M. genitalium sphre digestive Ureaplasma spp (70%) T. vaginalis Autre: C. trachomatis, streptocoques, Haemophilus spp, G. Mycoplasmes? vaginalis

N. gonorrhoeae

tuberculosis, Brucella, virus ourlien22

Principaux germes des IST( lexception de la syphilis)

23

Gnralits Recrudescence gnrale des IST 250 millions de cas par an dans le monde Homme+++

Modification des comportements sexuels risque Recrudescence de la LGV Recrudescence de la syphilis Progression des infections gonocoque Augmentation de leur rsistance aux ATB24

Neisseria gonorrhoeae 2me cause durtrite aprs C. trachomatis 10/100 000 habitants/an en Europe chez les femmes ( +264 % ) < hommes Progression des rsistances aux ATB Pnicillinase plasmidique (PPNG) Afrique, Asie SE : 35-50 % France : 7 10 % (CNR), mais > 30 % sur population cible des dispensaires antivnriens (RENAGO)

Ttracycline (transposon) : 18 % en France Fluoroquinolone: 45 %25

Neisseria gonorrhoeae

26

Neisseria gonorrhoeae

27

Neisseria gonorrhoeaeHomme Femme

Urtrite aigue 90% o Asymptomatique 5% o Rectite o Complications: Epididymite, orchite, prostatite, rtrcissement urtralo

Cervicite asymptomatique 70% o vulvo-vaginite, urtrite o Complications: Endomtrite, salpingite 1020%, GEU, infertilit, Pelvi-pritonite, FHCo

Autres formes cliniques :o o o

Anorectales:10 % des femmes, 25 % des hommes homosexuels Pharynge 5 %, conjonctivales: adultes et NN Gonococcmie : s. cutans et/ou articulaires, gonococcie fbrile28

Neisseria gonorrhoeae Prlvements 2 couvillons / site Homme : mat et urtre Scrtions prostatiques aprs massage Femme : urtre, endocol et orifices glandulaires Pharynx et anus

ED :

Valeur uniquement chez l'homme Prsence de Neisseria spp l'tat commensal chez la femme

o o o

Culture sur milieu riche en prsence de CO2 Recherche bta lactamase PCR 40 60% des infections sont mixtes: Chlamydia, mycoplasmes, Trichomonas29

Chlamydia trachomatis Agent des IST le plus frquent 100/100 000 hab/an en europe

60 % des UNG

Diagnostic : femme > homme, PCR (90%) de la proportion des formes asymptomatiques Dpistage opportuniste des LGV rectales en Ile de France Homosexuels masculins (VIH+): gnovar L2b

30

Chlamydia trachomatisSrovars D KHommenfection gnitale basse rtrite subaigu 50% aigu 3-10 % goutte matinale 20 % Infection gnitale haute symptomatique 20 % Epididymite, prostatite

FemmeInfection gnitale basse Asymptomatique++ ervicite leucorrhe sanguinolente Infection gnitale haute Endomtrite, salpingite

Complications Infertilit, GEU, douleurs pelviennes Arthrites ractionnelles, Fiessinger Leroy Reiter, Fitz Hugh Curtis31

Chlamydia trachomatisSrovars L1 L3

LGV= Maladie de Nicolas-Favre Femme et homme Ulcration gnitale vsiculeuse Bubon se fistulisant en "pomme d'arrosoir" Adnite inguinale Trouble du drainage lymphatique

Homme Ulcration rectale, rectocolite hmorragique32

Nombre de cas de LGV rectale, France 2002 - 2007Nombre de cas300 250 200 150 100 50 0 2002 2003 2004 2005 2006 2007

75 67 51 25 104 118 139 171

LGV

Ct non-LGV

Donnes CNR chlamydia pour confirmation du srovar Rseau clinique : CIDDIST consultations hospitalires - MG

Chlamydia trachomatisPrlvement cellulaire la curette H : urtre pr-matique F : urtre et endocol 2 sexes : anus, pharynx

Culture (cell. McCoy irradies) technique de rfrence IFD (subjectif), ELISA (faux positifs) Bio mol. : hybridation mol. ou PCR (urine du 1er jet): + Se et + Sp Variant sudois de Chlamydia trachomatis Dltion de 377 pb sur plasmide, appartient au srovar E

Srotypage ou gnotypage Srologies : IFI (IgM, IgG, IgA) ou EIA Valeur dans infections hautes Aide au diagnostic des LGV34

Traitement antibiotique probabiliste des urtrites et cervicites non compliques (afssaps 2008)Cfixime PO 400 mg dose unique Refus ou dimpossibilit dadministrer ttt par voie parentrale Spectinomycine IM 2g (allergie btalact) Doxycycline PO 100 mg x 2/J 7 j

N. gonorrhoeae

Traitement minute: Ceftriaxone IM ou IV 500 mg

C. trachomatis

Traitement minute: Azithromycine PO 1g

Ne pas oublier de dpister et traiter le partenaire! Rapports sexuels protgs jusqu gurison Dpistage des autres IST

Mycoplasmes gnitaux 5 espces isoles du tractus gnitalo o o o

M. hominis Ureaplasma spp ( U urealyticum et U parvum) M. genitalium M. fermentans, M. penetrans: trs rare et pouvoir pathogne inconnu

Prsents l'tat commensal dans les voies gnitales basses +++ Apprciation du pouvoir pathogne ?? Colonisation varie avec: ge, niveau socio-conomique, activit sexuelle, race, contraceptifs oraux

Transmission sexuelle possible mais le plus souvent trouble de l'cosystme vaginal sans notion d'IST Absence de paroi (rsistance aux B lactamines, non colorables au Gram)

M. hominis M. hominis: retrouv chez 20% femmes en faible quantit (commensal) Responsable d'infections gyncologiques, souvent en association avec d'autres bactries: o abcs de la glande de Bartholin o endomtrites o salpingites (10% environ: pathogne primaire ou agent de surinfection?) Souvent prsent en grande quantit ( 104 UCC/ml) dans les vaginoses bactriennes. Non impliqu dans les cervicites Pathognicit mal connue chez les hommes

Ureaplasma spp. Chez l'homme o Agent d'urtrites non gonococciques (15 20% des UNG) o Prostatites subaigus. Chez la femme o Prsence d'Ureaplasma spp. dans un prlvement cervicovaginal: difficile interprter car portage asymptomatique chez 40 80 % des femmes jeunes! o Rle discut dans les urtrites et les endomtrites o Pas de rle dans les cervicites, salpingites ni dans la vaginose Rle dans pathologie de la grossesse et strilit

Mycoplasmes gnitaux et pathologie de la grossesse et du post-partum Portage plus frquent pendant la grossesse: MH et surtout UU Peuvent tre responsables de o chorioamniotites o avortements spontans o endomtrites o fivre du post-partum ou post-abortum o hypotrophie nonatale o infections nonatales (septicmies, mningites, infections respiratoires): rares, survenant chez prmaturs fortement hypotrophiques Rle controvers dans la strilit: o squelle de salpingite pour MH o rle plus direct dans l'infertilit masculine pour UU (altration de la mobilit des spermatozodes)

M. genitalium Plus petit gnome bactrien connu (580 kb), isol en 1981 Rle pathogne encore mal connu o urtrites non gonococciques chez l'homme (2me agent des UNG): subaigu ou chronique o endomtrites o cervicites o salpingites Doit tre recherch en 2nde intention chez l'homme devant une urtrite rsistante au traitement! Culture trs lente et difficile, diagnostic par PCR

Mycoplasmes gnitaux

Mycoplasmes gnitaux: diagnostic biologique Diagnostic direct exclusivement (pas de srologie) Prlvements: cellules +++ (mycoplasmes adhrent aux cellules) urtre, endocol, vagin, urines (1er jet), sperme... Ureaplasma spp et M. hominis: culture o technique classique: milieux spcifiques liquides ou gloss o kits prts l'emploi (ex: Mycoplasma Duo, Biorad): o Hydrolyse de l'arginine (MH) ou de l'ure (UU) avec libration d'ammoniac o Virage du jaune au rouge de l'indicateur de pH (rouge de phnol) frquence des infections mixtes: recherche des autres micro-organismes pouvant tre impliqus dans les infections gnitales indispensable!

Mycoplasmes: interprtationMise en vidence de Ureaplasma spp. ou de M. hominis partir de prlvements normalement striles Isolement partir de prlvements o ils peuvent tre prsents ltat commensal Interprtation difficile

Significatif

Evaluation quantitative: aide l'interprtation, exprime en unit de changement de couleur (UCC) Critres proposs pour UNG: 104 UCC/ml pour un prlvement urtral 103 UCC/ml pour le 1er jet durines

Pour MH: > 104UCC/ml: voque vaginose ou infection gnitale haute

MH et UU: antibiogramme et traitement Antibiogramme ncessaire car rsistances acquises possibles concernant les trois classes utilises en thrapeutique ttracyclines (5%) macrolides fluoroquinolones Rsistances naturelles M. hominis: macrolides 14 ou 15 chanons (rythromycine, azithromycine) et ktolides S: Josamycine Ureaplasma spp: lincosamides Traitement uniquement si patient(e) symptomatique (+/- recherche et traitement du partenaire si rcidives) Dure et voie d'administration du traitement: fonction de la localisation de l'infection (au moins 7 jours)

Haemophilus ducreyi Frquence en augmentation : voyage tropicaux, VIH Incubation de 1 5 jours 2 3 mois Clinique: chancre de Ducrey Papule , pustule, ulcration superficielle bords dchiquets, unique ou multiples, base souple,bords inflammatoires, non indure Douloureuse (+++) Scrtions purulentes et hmorragiques Adnopathie inguinale inflammatoire (bubon) fluctuante, se fistulisant spontanment

Traitement Ceftriaxone : 250 mg, en 1 seule IM Azithromycine 1g une dose ou rythro 500*3 7j ou cipro 500*2 3j Ponctions itratives du bubon (tous les jours jusqu son affaissement)

Critres de gurison: cicatrisation de lulcration (vers J 10)45

Haemophilus ducreyi Modalits de prlvement:o o

Eliminer les srosits du fond de lulcre avec un tampon imbib deau physiologique Ecouvillonnage ralis sur la base ou les bords du chancre

Autre prlvement: biopsies ou ponctions du bubon satellite Coloration MGG ou au bleu de mthylne ED: petits bacilles de coloration bipolaireo Regroupement en banc de poisson ou chane de bicyclette Se=50%

Culture trs difficile (milieux riches slectifs): examen de rfrenceo Exigence en facteur X

Faible sensibilit de l'ED et de la culture 75% PCR disponible mais non pratique46

Donovanose K. granulomatis Milieu tropicalClinique ncubation : 1 semaine 6 mois lcration unique ou multiple, indolore, hmorragique dadnopathie satellite Grattage s/cutans, Prlvements ranulomes ou biopsie confluents en pseudo-bubons volution vers la mutilation des OGE et stase lymphatique Diagnostic ED + culture difficile Traitement Cotrimoxazol Forte : 2 cp / jours x 21 jours Doxycycline 100mg 2*/j 3 sem Erythromycine, azithromycine, ciprofloxacine Rechute possible 6-18 mois aprs ttt effectif47

Diagnostic bactriologiqueComparaison des sites

48

Prlvements Idalement: effectus au laboratoire Noter laspect des lsionso Aspect et odeur de la leucorrhe peuvent tre vocateur dune vaginose ou dun candidose

Recueil par couvillonnage dun maximum de srosit et de celluleso o o

Ecouvillon sans inhibiteurs de croissance et damplification gnique et placs dans un milieu de transport : Chlamydia spp., Neisseria gonorrhoeae Dg dune infection haute, viter contamination par le bas appareil Recherche des bactries anarobies dans PV: pas d'intrt en gnral

Chlamydia spp. et de Mycoplasma spp. peuvent seffectuer sur les urines du 1er jet, sur le sperme et sur tous les chantillons obtenus par couvillonnage des muqueuses.49

Prlvements Dans les deux sexes Ulcration anognitale Nettoyer l'ulcration au srum physiologique strile Prlever le fond du chancre ou sous ses bords dcolls laide dune curette ou dun couvillon

Pustules Recueil du contenu : seringue ou couvillon

Granulome Grattage des tissus sous la couche pithliale50

Ulcrations gnitales

En cas de suspicion de syphilis

La recherche de trponme / examen microscopique au fond noir Aucun dlai, examen extemporan

En cas de suspicion de chancre mou

Srosit ensemence immdiatement sur un milieu spcial Sinon, dcharger dans du srum de lapin,humain ou veau foetal Dcharg dans un milieu de transport pour Chlamydia

En cas de suspicion de LGV

Toujours penser la possibilit dun herps associ

51

Prlvements Tractus gnital chez la femme (enceinte ou non) sous spculum sans lubrifianto

o

o

o

Leucorrhe ou vulvovaginite Ecouvillonnage de la moiti infrieure du vagin jusquau vestibule et la vulve couvillon alginate + milieu de transport (non indispensable si transport immdiat). couvillon pour examen microscopique Cervicite: recherche dune IST Ecouvillonnage du col Auto-prlvement pour Chlamydia Endomtrite Endocol, voir aspiration transcervicale par cathter Strilet52

Prlvement endocervical Asepsie pour viter contamination par les germes du bas appareilo

Eliminer scretion de l'exocol chlorhexidine 1 2 ' rinage eau physiologique

Prlevement du canal endocervical : couvillono o

Alginate: bactries "banales" + gonocoque Sur prescription spcifique : 2me couvillon dacron : chlamydia 3me couvillon dacron : mycoplasmes

Pour la recherche de gonocoque et de chlamydia: en +o Prlvement urtral: pus d'coulement spontan ou aprs massage rtrosymphysaire La recherche de gonocoque et de Chlamydia trachomatis peut seffectuer sur prlvement vaginal chez la petite fille. 53

Prlvements Chez la femme enceinte 1/3 infrieur du vagin jusquau vestibuleo o

Recherche de S agalactiae Antcdents daccouchement prmatur, MAP, RPM

Endocol aprs nettoyage de lexocolo

Suspicion chorio-amniotique ascendante

54

Prlvements Chez lhommeo

Urtrite, pididymite, prostatite Pus urtral Ecouvillonnage sur 3-4 cm de luretre 1er jet durine Sperme Orchite Prlvement dabcs la seringue Sperme55

o

PrlvementsChez lhomme

SpermeIdalement : abstinence de 3 jours Recueil aprs miction et dsinfection du gland ( antiseptique + rinage )

Prlvement urtralRecueillir l'coulement urtral Le matin avant toute mission d'urines Prescription explicite pour recherche de mycoplasmes et chlamydia Grattage endourtral l'aide d'un couvillon ( cellules)

56

Prlvements

Transport Milieu de transport appropri dans les 2h environ 20Co o o

N. gonorrhoeae Chlamydia spp. Mycoplasma spp.

Conservation 20C ou 4C selon milieu de transport Horodatage du prlvement ou du recueil, de lacheminent et de la rception laboratoire Identification de toutes les personnes qui accomplissent ces tches sont essentiels58

Examen microscopiqueIntrt T. vaginalis Mobilit mobiluncus REMIC CBE CBN CHLS

Lame/ lamelle

+

-

+

+

Micro fond noir

T. pallidum

+

-

exceptionnel

?

Gram

Score NugentKrohn-Hillier PNN, clue-cells C. Albicans Flore PNN, clue-cells H. ducreyi K. granulomatis

+

Quantification PNN, C pithliales, lactobacillus clue cells+ flore bacterienne

PNN, C pithliales, clue cells, flore bactrienne

PNN, C pithliales, clue cells, flore bactrienne

MGG

+/-

Abcs

-

59

CulturesIntrtPV, gnitaux sur couvillon

CBEGnitaux divers mat et urtraux

CBNPlvt urtraux

CHLSCol utrin et urtraux

Sperme

PV et endocol

PV

Sperme

Choc + PVX Choc+ PVX+V CN /VCAT Sang Col +ANC Lactos Sabouraud S. agalacti ae

+ Flore arobie N. gonorrhoeae N. meningitidis

+

+

+

+

+

+

Demande sp N. gonorrhoeae, H. ducreyi (3-5j) Selon contexte

+

+

+

+

S. agalactiae S. aureus Gram+ Gram Levures (Chromogne) 34-38 SA Quantification en +

+ +

+

+

+ + + uri4 +

+

+

+

Granada Columbia+ANC

Granada

Sg+ANC60

Incubation 35 pendant 24 et 48h C

Sur prescription expliciteCBE N. gonorrhoeae C. trachomatis M. hominis Ureaplasma spp VCAT PCR PCR Mycoplasma duo (Biorad) + - (envoi CBN) + Si absence de culture et demande clinicien. Envoi CBN + CBN + + (multiplex Abbott) + (ou rarement PCR) CHLS + + (maison) +

M. genitalium

PCR

+

-

H. ducreyi

Milieux riches

+

+

H. ducreyi obtenu dans bouillon SVF 33C, sature en humidit sous CO2. Absence de culture 35C en aerobiose.61

Dtails des techniques: biologie molculaire PCR Chlamydia trachomatis et Neisseria gonorrhoeae:o

CBN: PCR en temps rel sur m 2000 (Abbott): multiplexe (3 couples damorces: CT, NG, CI)

Si CT + dans prlvement anal: envoie Bordeaux pour typage (PCR+RFLP): recherche srotypes responsables de LGVo

CHLS: PCRrt maison CT sur Light cycler (sondes FRET, CI), pas de PCR gono Uniquement au CBN: PCRrt maison (cible: gne adhsine, sonde Taqman) CBN: PCR classique, rvlation sur gel dagarose. Utilise pour prlvements spciaux: liquides pritonaux, liquides amniotiques

PCR M. genitaliumo

PCR MH et UU:o

62

Interprtation Fonction de la nature des bactries et du contexte clinique Difficile chez la femme du fait de labondance et de la varit de la flore commensale du bas appareil gnitalo

Espces considres comme pathogne si En quantit importante En flore unique, notamment en labsence de lactobacilles dans le cas de vaginites PN augments63

AntibiogrammeRemic Infections endocervicales du haut appareil gnital Bactries pathognes Gonocoque MycoplasmeM hominis si > 104 48h Systmatique selon les recommandations du CA-SFM

CBE

CBN

CHLS

Sur avis du clinicien Streptocoque A

+

+

+ Cfinase (ou ATBg sur demande) + CNR MH: si > 104 UCC/ml en 24 ou 48H UU: si > 104 UCC/ml en 24H

+

Cefinase +(CNR)

+

Seulement si demand quelque soit la quantit (fonction du biologiste) Flore dominante Obsttrique: Listeria, Haemophilus, E.coli, Strepto bta hmolytique Si demand64

Bactries colonisant le bas appareil gnital

Bactrie dominante Streptocoque A Hemophilus cefinase > 104 mono microbien

Si bactrie dominante

Sperme

Rendu des rsultatsPrlvement vaginaux

CBE Semi quantitatif Identification desStreptocoques -hmolytiques , S. aureus, S. pneumoniae, Gardnerella, C. albicans ou C non albicans P. aeruginosa et entrobactries si culture abondante et majoritaire Si germes non pathognes: absence de culture significative Si culture strile : aucune bactrie arobie

CBN Semi quantitatif Identification

Germes pathognes: Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pyogenes, Candida albicans Si culture pure : Entrobactries, Staph aureus, Haemophilus, Streptococcus pneumoniae, G. vaginalis Flore banale: germes numrs

65

Rendu des rsultatsCHLSo Prlvement gyncologique Signalement des flores dominantes et des bactries pathognes strictes Flore banale: pas de flore pathogne avre En maternit: signalement de Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Listeria, Haemophilus influenzae, E. coli K1, S. aureus, P. aeruginosa

66

Rendu des rsultatsPrlvements du haut appareil gnital ou urtraux

CBE Semi quantitatif Identification de tous les germes Simplifie pour les SCN Si une seule espce pour les anarobies Groupage du K1 en obsttrique

CBN ( urtraux ) ermes pathognes Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis

utres germes: uniquement si culture pure en grande quantit

67

Rendu des rsultatsSpermeCBE 105 ufc/ml de flore cutano muqueuse> 105 ufc/ml de flore fcale

Mycoplasmes : 104

NABMScrtion , exsudats ano gnitaux femme Scrtion , exsudats ano gnitaux homme Sperme Chlamydia, recherche par culture Chlamydia, recherche directe isole et exclusive par mthode immunologique Chlamydia, recherche par PCR B140 B120 B90 B90 B30 8,10 37,80 32,40 24,30

B60

16,20 10,80

Mycoplasmes : cultures sur milieux B40 spciaux, numration, caractrisation Antibiogramme bactrie arobie B40, CMI:B50 Antibiogramme des mycoplasmes hors nomenclature

69

GBEA PV

70

71

de culture pathogne rendre : Absence de flore pathogne avre 72

GBEA Demandes spcifiques N. gonorrhoeae Ensemencement sur Chocolat + PVX Chocolat + PVX + VCAT

PCR seulement si Demande de chlamydia PCR multiplex Dlai de transport non respect

73

GBEA Demandes spcifiques N. gonorrhoeae Ensemencement sur Chocolat + PVX Chocolat + PVX + VCAT

PCR seulement si Demande de chlamydia PCR multiplex Dlai de transport non respect

C. trachomatis PCR74

Comparaison des mthodes de diagnostic direct de C. trachomatis

MthodeCulture cellulaire

Temps de rendu Avantages du rsultat72 H Sp quasi 100% Isolement de la souche Sensibilit aux ATB simple Automatis Faible cot Automatisation Se > 95% Sp 99%

LimitesSe: 80-85% Technique complexe

IFD (dtection dAg) EIA (dtection dAg) Test rapide

45 min 4H 30 min

Se: 75-80% Lecture subjective Se: 75-80% Faible sp (test de confirmation ncessaire) Se et Sp = EIA Contamination Cot

Hybridation simple 2 H RT PCR, NASBA, TMA 2-4 H

Avantages et inconvnients des diffrents prlvements pour la recherche de C. trachomatisSexe Homme Homme Prlvement urtral Urine (1er jet) Avantages Se +++ Non invasif, auto prlvement Non invasif, auto prlvement Se +++ Non invasif, auto prlvement Non invasif, auto prlvement Peu Se Inconvnients invasif Techniques utilisables toutes Bio mol (PCR) +/- EIA Biomol (PCR)

Homme

Mat (coulement) Cervical +/urtral Urine (1er jet)

Femme Femme

invasif Peu Se

toutes Bio mol (PCR)

Femme

vaginal

Bio mol (PCR)

GBEA Demandes spcifiques N. gonorrhoeae Ensemencement sur Chocolat + PVX Chocolat + PVX + VCAT

PCR seulement si Demande de chlamydia PCR multiplex Dlai de transport non respect

M hominis et Ureaplasma spp Kit Rendu > 104 UCC/mL ATBg sur demande du clinicien M. genitalium en 2me intention PCR

C. trachomatis PCR77