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Rapport annuel d'activité, année 2015

Laboratoire National de Référence

Insectes, acariens phytoparasites et auxiliaires sur toutes matrices

Nom du responsable du LNR

Philippe REYNAUD

Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les

noms des unités associées au LNR

Unité entomologie et plantes invasives

Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les

noms des laboratoires associés au LNR

Laboratoire de la Santé des Végétaux

Nombre de laboratoires agréés et/ou reconnus dans le réseau

0

Précisez la catégorisation du danger (en SA) sinon la justification de l'existence du

LNR (SA, SV et SSA)

Le mandat de LNR est précisé dans l’arrêté du 18 décembre 2014 modifiant l’arrêté du 29

décembre 2009 désignant les laboratoires nationaux de référence dans le domaine de la

santé publique vétérinaire et phytosanitaire.

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Les faits marquants de l'année

L’équipe s’est investie en 2015 dans la technique du barcoding au travers d’une

participation au ring test Euphresco barcoding ainsi que dans la réalisation d’un stage

barcoding de longue durée à l’Université de Guelph (Ontario, Canada) pour son ingénieur

en charge de cette technique.

Elle participe activement à des appuis scientifiques et techniques par le biais de

participations à des GT Anses (GT Rastrococcus invadens et GT Ophraella communa). Elle

a aussi réalisée des investigations épidémiologiques à la demande de la tutelle sur Xylella

fastidiosa en Corse.

L’équipe est très présente au niveau national et international. Elle a pris part, par exemple,

au séminaire diagnostic RFSV (Paris), à la réunion du panel entomologie OEPP (Rome), ou

à une mission de récolte du coléoptère Epitrix en Californie (USA) via le projet Euphresco.

Elle est intervenue à la Testa- EPPO Conference on diagnostics for plant pests (Angers). En

tant que LNR sur les auxiliaires naturels, elle est intervenue au Workshop on the Evaluation

and Regulation of the use of Biological Control Agents in the EPPO Region – Budapest

(Hongrie)

Enfin, elle s’investit particulièrement sur l’épidémiosurveillance en étant membre du CAPE :

Comité d’Animation et de Programmation en Epidémiologie

1. Méthodes développées ou révisées

Nombre de méthodes développées ou révisées proposées à l’autorité compétente

0

Nombre de méthodes développées ou révisées qui sont susceptibles d’être prêtes

pour être proposées à l’autorité compétente au cours de l’année 2016

0

2. Matériels biologiques ou chimiques, échantillons et souches

d'intérêt

Information disponible auprès du LNR

3

3. Activités d'analyse

3.1. Analyses officielles de première intention

Nombre d'analyses officielles de première intention réalisées dans l'année (de

biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...)

723

Détaillez ici par type d'analyse de première intention

Dans le détail, 28 pour identification de Bemisia tabaci et 24 Trialeurodes vaporarium, 1

pour identification de Diabrotica virgifera virgifera et 670 pour identification autres

arthropodes. Le laboratoire existe depuis 19 ans. Depuis 2010, le nombre d’analyses est en

diminution et cette tendance se confirme en 2015. Cette décroissance s’explique par une

diminution du nombre d’échantillons envoyés par certains SRAL. Les causes de cette

diminution ne sont pas précisément connues, mais pourraient correspondre à une baisse de

la quantité de végétaux ou produits végétaux importés et donc contrôlés par le SIVEP en

France ces dernières années (peut être un effet de la crise économique) conjuguées à une

absence de crise phytosanitaire en cours impliquant des arthropodes. La tendance pourrait

s’inverser à partir de 2016, avec la crise Xylella qui implique des vecteurs Hemiptera.

3.2. Analyses officielles de confirmation

Nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées dans l'année (de

biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...)

0

Détaillez ici par type d'analyse de confirmation

En l’absence de laboratoires agréés, l’unité ne réalise pas d’analyses de confirmation et

assure la totalité des analyses officielles françaises.

Taux de confirmations par type d'analyse (= nombre de résultats confirmés / nombre

d'analyses officielles de seconde intention réalisées)

Sans objet

4

3.3. Autres analyses

Nombre estimé d'autres analyses (non officielles) réalisées dans l'année en lien avec

le mandat de LNR

1052

Détaillez ici par type d'autres analyses

Tendance à la baisse sur cinq années. Explication multi factorielle : éloignement progressif,

suite au passage à l’Anses du laboratoire, de ses partenaires historiques demandeurs de

diagnostics généraux (les SRAL et instituts techniques), augmentation des tâches

administratives au dépend des activités analytiques, diminution de l’activité traditionnelle de

faunistique générale au profit d’activités de recherche ciblées sur des espèces ou groupes

d’espèces restreints.

4. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence

et de réactifs biologiques

Le LNR produit-il et fournit-il des réactifs ?

Non

Le LNR fournit-il des matériaux de référence ?

Non

Le LNR réalise-t-il des contrôles de réactifs commerciaux ?

Non

5

5. Activités d'expertise scientifique et technique

5.1. Demandes d’expertise scientifique et technique du ministère

(chargé de l’agriculture, santé, etc…) ou d’instances

communautaires et internationales qui concernent votre domaine

de compétence

Nombre de rapports d'EST rendus dans l'année

3

Détaillez ici les demandes d'EST et les noms des mandataires

Trois EST ont été réalisées en 2015, une à la demande du FERA et 2 à la demande de

l’unité ERB du LSV. Elles portaient sur :

• La répartion en France de Dryocosmus kuriphilus

• Le risque de transmission de Xylella fastidiosa sur Clémentine de Corse par un insecte

vecteur Philaenus spumarius

• La présence de certaines cochenilles Coccoidea dans les DOM

Plusieurs notes d’alerte ou de signalement ont été émises en 2015 dans le cadre de

l’activité de veille du laboratoire. Elles ont concerné :

• Toumeyella parvicornis : Nouvelle cochenille invasive préjudiciable aux Pinus spp.

présente en Italie

• Aceria kuko : Confirmation de la présence de Aceria kuko (acarien) en France

• Dacus frontalis : présence Dacus frontalis en Tunisie. Elle se développe sur de

nombreuses plantes d’intérêt agronomique de la famille des Cucurbitaceae.

• Zaprionus indianus : 1ère détection en Guyane

• Scrobipalposis solanivora : Premier signalement de Scrobipalposis en Europe occidentale

(Espagne)

Le laboratoire apporte régulièrement son expertise pour l’examen de documents régionaux

ou internationaux (OEPP/IPPC).

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5.2. Autres expertises

Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise (internes:

CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de commissions de

normalisation (Afnor...). Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est

consacré.

Le laboratoire participe des activités d’expertise en tant que membre des Groupes de

Travail «Rastrococcus invadens» et « Ophraella communa » en lien avec le CES Anses en

santé des végétaux (2+5 jours), en tant que membre du Panel OEPP sur le diagnostic en

entomologie (3 jours en 2015).

Le laboratoire a également participé à une mission d’investigation épidémiologique en Corse

suite à la crise phytosanitaire Xylella (7 jours).

Le laboratoire participe à des instances nationales comme par exemple le GT DGAL Epiphyt

(application de gestion de données d’épidémiosurveillance), GT Anses « Vecteurs » ou

CAPE (Comité d’Animation et de Programmation en Epidémiologie).

L’équipe entomologie (conjointement avec l’équipe plantes invasives) participe au GdR

Invasions biologiques. Ce Groupement de Recherche porte sur les thématiques de biologie

des invasions. Il regroupe environ 40 participants qui souhaitent se fédérer autour de ce

domaine de recherche. Notre participation vise à favoriser notre insertion dans les réseaux

de recherche sur ce thème porteur. Le rôle principal des GdR est en effet de susciter des

rencontres entre les scientifiques qui sont intéressés par un thème en plein développement,

afin de multiplier les liens entre membres de ces communautés et de faciliter l’intégration

des jeunes, doctorants ou jeunes docteurs.

Des audits de confinement sont réalisés pour le compte de la DGAL. Nous donnons un avis

sur le niveau de confinement après visite sur place pour que les centres de recherche

demandeurs puissent obtenir leur agrément préfectoral au titre de la directive 2008/61/CE.

Deux audits ont été réalisés en 2015.

Des audits documentaires dans le cadre de la loi du 30 janvier 2012 relatif aux conditions

d’autorisation d’entrée sur le territoire de macro-organismes sont réalisés pour le compte de

la DGAL. Nous donnons un avis sur la capacité du demandeur à accueillir des macro-

organismes dans leurs structures. Quatre audits documentaires ont été réalisés en 2015.

5.3. Dossiers de demande d'agrément

Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année

0

7

5.4. Activités de conseil aux professionnels

Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré

Les membres du laboratoire participent à deux grand types d’actions de formation: i) des

formations générales à l’entomologie organisées par le CIRAD, L’INFOMA, le SIVEP, la

DGAL ; ii) des formations à la demande liées aux spécialités taxonomique des agents

(Tephritidae, mouches des cultures, cochenille). En 2015, les agents du laboratoire ont

formés une cinquantaine de personnes au travers de 5 actions de formation, représentant

environ 10 jours de travail.

6. Animation du réseau de laboratoires agréés ou reconnus

6.1. Organisation d'EILA

Précisez ici le nombre d'EILA organisés par le LNR au cours de l’année

0

Nom (s) et nombre(s) d'EILA que vous prévoyez d'organiser au cours de l’année 2016

0

Précisez le nombre d'EIL (hors EILA - dont EILV en lien avec méthodes en cours de

validation telles que précisées dans le paragraphe 1) organisés par le LNR au cours

de l’année

0

Détaillez ici le nombre de laboratoires ayant participé pour chaque EIL (hors EILA)

Précisez le nombre d'EIL (hors EILA) que vous prévoyez d'organiser au cours de

l’année 2016

0

8

6.2. Formation, organisation d'ateliers, accueil de stagiaires

Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires agréés

du réseau, organisées dans l'année

1

Détaillez ici ces activités et indiquez le nombre de participants par journée

journée d’échange LNR/laboratoires agréés (38 participants)

Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux

méthodes utilisées pour les contrôles officiels, organisées dans l'année

0

Détaillez ici ces activités et indiquez la durée moyenne des sessions et le nombre de

participants par session

6.3. EILA auxquels le LNR a participé dans l'année

Détaillez les EILA auxquels le LNR a participé dans l'année, dans le cadre : National;

UE ( EILA organisé par le LRUE); International

- National : néant

- UE (EILA organisé par le LRUE) : néant

- International : néant

7. Participation aux activités de surveillance

7.1 PS/PC

Existe-t-il un ou plusieurs PS/PC élaboré(s) par l'autorité sanitaire dans le champ du

LNR?

Oui. Le laboratoire intervient dans le cadre de 10 plans de contrôle et surveillance.

NS : DGAL/SDQPV/N2005-8138 : TYLCV et Bemisia tabaci

NS : DGAL/SDQPV/N2005-8189 : Plan de surveillance phytosanitaire des pépinières et

jardineries vis-à-vis de la teigne du bananier (Opogona sacchari)

9

NS : DGAL/SDQPV/N2009-8051 : Plan de contrôle phytosanitaire de la pomme de terre

destinée à la plantation ; Conditions de délivrance du Passeport Phytosanitaire Européen

(PPE)

NS : DGAL/SDQPV/N2011-8141 : Mise en œuvre de l'arrêté national du 22 novembre 2010

relatif à la lutte contre du cynips du châtaignier (Dryocosmus kuriphilus)

NS : DGAL/SDQPV/N2011-8148 : Plan de surveillance Rhagoletis completa Cresson et

mesures de lutte pour l'été 2011 dans le Sud-Est de la France (territoires couverts par la

DRAAF/SRAL Rhône alpes et zones de production en continuité avec le bassin Rhône Alpin

et gérés par la DRAAF/SRAL Rhône Alpes)

NS : DGAL/SDQPV/N2011-8149 : Plan de surveillance Rhagoletis completa Cresson 2011

et mesures de lutte (toutes régions sauf Rhône Alpes et zones de production en continuité

avec le bassin Rhône Alpin)

NS : DGAL/SDQPV/N2012-8071 : Mise en œuvre du dispositif expérimental concernant

l'injection dans le cadre de la lutte obligatoire contre le charançon rouge du palmier.

NS : DGAL/SDQPV/N2012-04002 : Surveillance des pommes de terre autre que pommes

de terre de semence vis-à-vis d’Epitrix sp.

NS : DGAL/SDQPV/N2013-8086 du 15 mai 2013 Réseau de surveillance biologique du

territoire dans le cadre de l'axe 5 du plan Ecophyto pour l'année 2013

NS : DGAL/SDQPV/N2014-XXXX du XX XX 2014 Plan annuel de surveillance relatif aux

escargots aquatiques du genre Pomacea en France.

7.2 Activités de surveillance hors PS/PC

7.2.1 Dispositif(s) hors PS/PC

Indiquer si le LNR est intégré à un (ou des) dispositif(s) de surveillance (hors PS/PC) ?

Oui

En dehors du dispositif PS/PC de la DGAl préciser si le LNR est intégré à un autre

dispositif (Résapath, Salmonella, Resabeille, ...)

Surveillance biologique du territoire (SBT)

7.2.2 Gestionnaire du dispositif

Indiquer qui est le gestionnaire de ce dispositif de surveillance

DGAL / SDQPV

10

7.2.3 unités intégrées dans le dispositif

Préciser si d'autres unités/entités de l'agence sont intégrées dans ce dispositif à vos

cotés

Non

7.2.4 Les partenaires et acteurs de ce dispositif de surveillance

Sont acteurs ou partenaires de ce dispositif (plusieurs réponses possibles) :

Un réseau d'acteurs professionnels

7.2.5 Modalités de surveillance

Préciser si ce dispositif repose (plusieurs réponses possibles) :

Sur des modalités de surveillance programmées (active)

8. Activités de recherche en lien avec l’activité de référence

8.1. Recherches méthodologiques pour la référence

Détaillez ici les recherches méthodologiques que vous avez réalisées dans l'année :

objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre d'appels à

projets...

Protocole OEPP PM7/124(1) Spodoptera littoralis, Spodoptera litura, Spodoptera frugiperda,

Spodoptera eridania, publié à la fin de l’année 2015 (Bulletin OEPP/EPPO bulletin 45(3),

410-444) ;

Protocole OEPP PM 7/36(1) Diabrotica virgifera virgifera (Coleoptera : Chrysomelidae) mis à

jour en 2015, doit être publié en 2016.

Projet EUPHRESCO EPITRIX Méthode de détection et étude du cycle biologique d’Epitrix :

l’équipe entomologie a obtenu les résultats suivants : Mise au point d’une clé d’identification

morphologique des espèces d’Epitrix se développant sur pomme de terre en y incorporant

les espèces natives d’Europe de l’ouest pouvant se rencontrer lors des plans de

surveillance et de contrôle. Les espèces présentes dans l’est du Bassin méditerranéen

seront également prises ne compte. Ce travail permettra de mettre à jour la méthode

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d’indentification morphologique (OEPP) existante. Création d’une collection de référence

des espèces d’Epitrix (natives et non-natives dont les espèces préjudiciables à la pomme de

terre), collection qui sera disponible pour les ONPVs de l’UE.

8.2. Recherches associées

Détaillez ici les recherches associées auxquelles vous avez participé dans l'année:

participations à des études cliniques, études d'incidences, modèles d'infections

expérimentales, études toxicologiques, essais vaccinaux...

BIOTHRIPIDAE Mise au point d’un kit de détection des Thysanoptera nuisibles aux cultures

ornementales ou de quarantaine : le laboratoire a été financée par l’INRA de Sophia

Antipolis pour caractériser morphologiquement la faune thysanoptérologique des Agro-

Ecosystèmes étudiés par l’INRA et mettre en œuvre les techniques de laboratoire

nécessaires pour lever les éventuels verrous taxonomiques concernant des espèces ou des

formes cryptiques. Certaines espèces rarement capturées ont été identifiées lors de l’étude.

9. Relations avec le CNR

Existence d'un CNR

Non

10. Autres mandats

Le LNR détient-il d'autres mandats de référence dans le même domaine de

compétences

Non

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Annexes

PUBLICATIONS DESTINÉES AUX PROFESSIONNELS

Germain, J. F., Laplace, D., Devarieux, A., Boavida, C., Gachet, E., Goergen, G., et al. (2015). Rastrococcus invadens Williams découvre l'Amérique. Phytoma.

Martinez, M., Germain, J. F., & Streito, J. C. (2015). Touristes involontaires et inattendus:

les insectes exogènes ravageurs. Jardins de France, 633, 9-11.

PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES INTERNATIONALES

Baker, R., Eyre, D., Brunel, S., Dupin, M., Reynaud, P., & Jarosik, V. (2015). Mapping Endangered Areas for Pest Risk Analysis In R.C.Venette (Ed.), Pest risk modelling and mapping for invasive alien species (pp. 18-34): CABI.

Bout, A., Ziegler, M., Disdier, M., Reynaud, P., Robert, F., Crochard, D., et al. (2015). Improving knowledge on thrips diversity and ecology in French greenhouses: inputs of barcoding approaches for a better pest management. Acta Horticulturae, 1104, 395-400.

Germain, J. F., Laplace, D., Devarieux, A., & Boavida, C. (2015a). First records of the mealybug Rastrococcus invadens Williams (Hemiptera: Pseudococcidae) in French Guiana and the Americas. Zootaxa, 3905(3), 447-450.

Germain, J. F., Matile-Ferrero, D., Kaydan, B., Malausa, T., & Williams, D. J. (2015c). A new species of Dysmicoccus damaging lavender in French Provence (Hemiptera, Sternorrhyncha, Pseudococcidae). Zootaxa, 3980 (4), 575-583.

Halima-Kamel, M. B., Germain, J. F., & Mdellel, L. (2015). First records of two mealybugs, Maconellicoccus hirsutus (Green) and Phenacoccus peruvianus Granara de Willink, in Tunisia and the North of Africa. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 45(1), 139-143.

Telfer, A. C., Young, M. R., Quinn, J., Perez, K., Sobel, C. N., Sones, J. E., Mouttet, R.et al. (2015). Biodiversity inventories in high gear: DNA barcoding facilitates a rapid biotic survey of a temperate nature reserve. Biodiversity Data Journal(3), e6313, doi:10.3897/BDJ.3.e6313.

COMMUNICATIONS NATIONALES

Balmès, V. (2015). Les mouches: un défi pour la production fruitière. Salon des techniques bio et alternatives, Bourg lès Valence, France, 2015/09/23/

Bout, A., Marchand, A., Disdier, M., Crochard, D., Ziegler, M., Reynaud, P., et al. (2015). Approches de type DNA-Barcoding sur les populations de thrips au sein des cultures ornementales sous serre Angers, France. , 2015

COMMUNICATIONS INTERNATIONALES

Balmès, V., & Mouttet, R. (2015). Quick identification on commonly intercepted Tephritidae in Europe : How does molecular identification help the morphology? OEPP conference on diagnostics for plant pests, Angers France, 2015/01/12/

Martin, P., Ryckwaert, P., Tayeh, C., Reynaud, P., Quilici, S., De Meyer, M., et al. (2015). Risk ranking of importation pathways using fruit flies hierarchy - Reunion Island case study. Paper presented at the XVIII. International Plant Protection Congress, Berlin, Germany,

CONFÉRENCES SUR INVITATION

Reynaud, P. (2014). Invasive Thysanoptera in Qatar : is there a risk for plants or human health ? Doha, Qatar, Friends of the Environment Centre. 1st Congress of Insects in Qatar.