Rapportage annuel 2015 de l’Unité de Biogéochimie et … · 2020. 3. 31. · Direction scientifique – Juillet 2015 1 Réf. DS/MHTV 1417 Rapportage annuel 2015 de l’Unité

Direction scientifique – Juillet 2015 1 Réf. DS/MHTV 1417

Rapportage annuel 2015 de l’Unité de Biogéochimie e t d’Ecotoxicologie (BE)

Département de Ressources Biologiques et Environnem ent (RBE)

Ifremer

Introduction L’unité BE mène des activités de recherche, d’observation afin de produire des connaissances nouvelles et une expertise sur le transfert et les effets biologiques des contaminants chimiques dans l’écosystème marin. Cette mission nationale combinant recherche-observation-expertise sur les contaminants chimiques , les effets biologiques et le risque d’exposition place l’unité BE parmi les acteurs de la recherche nationale spécialisés sur l’étude de la Biogéochimie et l’Ecotoxicologie marine. Positionnée dans le département RBE, l’unité BE répond à la mission suivante :

- Mener des projets de recherche finalisée sur la biogéochimie des contaminants chimiques et leur toxicité sur les organismes et les populations des écosystèmes côtiers ;

- Fournir les bases d’informations et les outils scientifiques nécessaires aux évaluations d’impact et de risques écologiques liés à la contamination chimique, afin de promouvoir une gestion durable et intégrée des zones côtières ;

- Apporter un soutien et une expertise en matière de stratégie de surveillance des contaminants chimiques , notamment pour la mise en œuvre de la Directive Cadre sur l’eau (DCE) , la surveillance sanitaire (DGAL) et la Directive Cadre Stratégie Milieu Marin (DCSMM) ;

- Coordonner et valoriser le Réseau d’Observation sur la Contamination CHimique (ROCCH) ;

- Contribuer à l’analyse du risque chimique en milieu marin, tâche confiée à la cellule mixte Ineris-Ifremer (Arc) ;

- Apporter son soutien thématique aux laboratoires Environnement Littoral (LER) de l’Ifremer, ainsi qu’aux administrations de tutelle et aux diverses instances nationales, européennes et internationales ;

- Contribuer à la diffusion des connaissances en biogéochimie et écotoxicologie marines par diverses modes de communications et d’interactions (publications scientifiques, rapports d’expertises, membre du labex Cote et de l’OSUNA, membre du GDR d’écotoxicologie aquatique conduit par l’Irstea, diffusion grand public et formation par la recherche).

Les objectifs de l’unité BE sont inscrits dans un projet qui a été évalué A par l’AERES en 2012. Ils se déclinent suivant 3 axes complémentaires :

1- Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin 2- Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de

vie des organismes

3- Observation et expertise :


a. Développement méthodologique et prospective scientifique b. Réseau d’observation des contaminants chimiques (Rocch) c. Cellule d’analyse du risque chimique (Arc)

Axes de recherche

Axe 1: Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin

Axe 2: Devenir des contaminants à l’échelle de l’individuet effets biologiques sur le cycle de vie des organismes

Volet opérationnel

Action 1: Développement méthodologique et prospective scientifique

Action 2: Réseau d’observation des contaminants chimiques (Rocch)

Action 3: Cellule d’analyse du risque chimique (Arc)

Titre: « Comportements biogéochimiques des contaminantschimiques dans les écosystèmes marins, de leur transfert dans les réseaux trophiques et de leurs effets biologiques »

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Figure 1 : Structuration du projet de l’unité BE suivant deux axes de recherche et un volet d’observation et expertise qui est composé d’actions d’expertise en appui aux politiques publiques. Le lien entre les deux volets recherche et expertise est un élément important de cette structurationcar il permet d’enrichir et de valoriser les

deux volets de manière conjointe.

1) Moyens et effectifs

1.1 Organisation de l’unité

L’unité BE est composée de trois équipes de recherche (biogéochimie des contaminants métalliques, biogéochimie des contaminants organiques et écotoxicologie) et de deux cellules d’expertise pour la surveillance chimique (le réseau d’observation de la contamination chimique, Rocch) et la cellule mixte Ineris-Ifremer d’analyse des risques chimiques (Arc). 33 agents sont affectés à l’unité BE. Parmi les personnels permanents, 19 cadres, 11 techniciens et 1 administratif sont répartis suivant 11 cadres femmes et 8 cadres hommes, 5 techniciens et 6 techniciennes.

Deux cadres de l’Ineris (ingénieur femme) et de l’Inra (chercheur homme) travaillent au sein de l’unité BE. Le personnel affecté à l’unité représente 1,8 ETP cadres.


LB-CM (Nantes/Toulon)

C. Brach-Papa (C)J Knoery (C)T. Chevoulon (C) J.L. Gonzalez (C) (Toulon)

D. Auger (T, 32 h) S. Crochet (T) B. Thomas (T)E. Rozuel (T, 80 %)S.Bruzac (T, 80 %)A. Thibault (Thèse)N. Brian (Post Doc)C. Berthou (Apprenti BTS)

LB-CO (Nantes/Brest)

C. Tixier (C) (80%)V. Loizeau (C) (Brest)

C. Munschy (C)E. Mamaca (C, 32h) (Brest)

C. Pollono (C)N.Bely (T, 32 h)K. Héas-Moisan (T)X. Philipon (T) (Brest)

N. Olivier (T)M. Chambosse (Thèse)

LEX (Nantes/L’Houmeau)

F. Akcha (C)R. Sussarellu (C) L. Haugarreau (C, 32h)S. Stachowski-Haberkorn (C)X. Cousin (C) (Inra, L’Houmeau)D. Ménard (T, 32 h)J. Rouxel (T)V. Dupraz(Thèse) D. Berhens (Thèse)R. Rondo (Thèse)N. Coquillé (Thèse)

Direction et services communs

T. Burgeot (C) (Responsable)C. Tixier (C) (Adjointe 20%)M.J. Thébaud (Secrétaire ) (32 h)J. Tronczynski (C)A. Padiollo (CDD)

ROCCH (Nantes)J.F. Chiffoleau (C)

A. Grouhel (I)

Cellule ARC (Nantes)M. Dallet (C) (Ineris)I. Amouroux (C)

Figure 2 : Organigramme de l’unité BE. LBCM : Laboratoire de Biogéochimie des Contaminants Métalliques,

LBCO : Laboratoire de Biogéochimie des Contaminants Organiques, LEX : Laboratoire d’Ecotoxicologie, ROCCH : Réseau d’Observation de la Contamination CHimique et Arc : Cellule d’Analyse du Risque chimique. Les noms soulignés désignent les responsables des laboratoires, de l’unité ou des cellules d’expertise. Les noms en bleu désignent les départs en retraite en 2015 et violet le personnel détaché de l’Inra et en poste détaché de

l’Ineris, (T :Technicien ; C :Cadre). Les villes entre parenthèses identifient les personnels en poste dans les trois antennes de l’unité BE à Brest, Toulon (La Seyne / mer) et l’Houmeau (La Rochelle).

Le caractère transverse de la thématique des contaminants chimiques place l’expertise scientifique et technique de l’unité BE dans le volet environnement du département Ressources Biologiques et Environnement (RBE) (Fig 3). L’unité BE apporte ainsi sa contribution aux axes 2 sur la « Biodiversité marine », axe 4 sur les « Pêche aquaculture et changement global » et l’axe 6 sur le « Bon état écologique de l’écosystème ». Ces axes inscrits dans le plan stratégique Ifremer favorisent une collaboration étroite avec le département ODE via principalement la coordination du réseau d’Observation de la Contamination Chimique du Rocch par l’unité BE.


Figure 3 : Positionnement de l’unité BE dans l’ organigramme RBE.


1.2 Effectifs

- Tableau 1 de synthèse des personnels de l’unité

Personnel permanent* (dont 0 % en UMR) Scientifique et technologique - animation scientifique et technique - chercheurs (4 HDR) - ingénieurs recherche et développement Soutien à la recherche - ingénieur - technicien - appui opérationnel Fonctions support - gestionnaire - direction

en ETP 5 8,8 2,2 10,4 0,9

Personnel non permanent* (dont 0 % en UMR) - CDD, alternance - Doctorants (dont 1 étrangers) - Post-doctorants (dont étrangers) - Chercheurs étrangers invités

en ETP 2 8

* présents à la date du rapport

- Tableau 2 de l'évolution des effectifs

Nom date départ date arrivée raison du mouvement

catégorie Poste (Libellé)

Thomas B. Juil-15 Juin- 15 CSS TA Technicien chimie

Berthou C. Sept-15 Cont. app. TA Technicien chimie

Grouhel A.

déc.-15 MI CADRE

Ingénieur en chimie de l'environnement (H/F)

Mamaca E.

mai-15 MI CADRE

Chercheur

Claisse D. mars-15 Retraite CADRE Responsable RNO

- Tableau 3 : Liste nominative par catégorie o 3 a - Personnel permanent Ifremer

Burgeot Thierry Responsable d'unité scientifique Akcha Farida Resp. de laboratoire/de service/de groupe Tixier Céline Resp. de laboratoire/de service/de groupe Brach-Papa Christophe Resp. de laboratoire/de service/de groupe Chiffoleau Jean-François Pilote de projet Tronczynski Jacek Chercheur en biogéochimie Munschy Catherine Chercheur en biogéochimie Loizeau Véronique Chercheur en biogéochimie Knoery Joël Chercheur en biogéochimie


Mamaca Emina Chercheur en biogéochimie Sussarellu Rossana Chercheur en physiologie Stachowski-Haberkorn Sabine Chercheur en ecotoxicologie Chouvelon Tiphaine Chercheur en biogéochimie Thébaud Marie-Josèphe Assistant(e) de Direction Haugarreau Larissa Ingénieur en environnement Amouroux Isabelle Ingénieur en chimie/géochimie Pollono Charles Ingénieur en chimie/géochimie Ménard Dominique Technicien(ne) biochimie Auger Dominique Technicien(ne) chimie Héas-Moisan Karine Technicien(ne) chimie Rozuel Emmanuelle Technicien(ne) chimie Philippon Xavier Technicien(ne) chimie Thomas Bastien Technicien(ne) chimie Crochet Sylvette Technicien(ne) chimie Bely Nadège Technicien(ne) chimie Olivier Nathalie Technicien(ne) chimie Rouxel Julien Technicien(ne) biologie Bruzac Sandrine Technicien(ne) chimie

o 3 b - Personnel temporaire Ifremer en CDD, hors post-doc

Rondon Sallan Rodolfo

Aide financière à la formation recherche

Behrens Daphne Aide financière à la formation recherche

Sire Alizée SR - surcroît d'activité avec recette Berthou Calvin Contrat d'apprentissage Padioleau Antonin Contrat d’apprentissage

o 3 c - Accueil de personnels d’autres organismes

Cousin Xavier INRA Dallet Mélissa Ineris


1.3 Equipements, moyens matériels 1.3.a. Les principaux équipements de l’Unité sont listés ci-dessous :

• Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un détecteur par capture d'électron

(GC-ECD), - Double injection – Agilent 7890B (site de Brest) (2014) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un spectromètre de masse (GC-

NCI-MS), Agilent 7890-5975-PAL. (2009). • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un spectromètre de masse haute

résolution (GC-HRMS), Waters Micromass Autospec-PAL (2004) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un spectromètre de masse (GC-

MS), Agilent 6890-5973 (site de Brest) (2002) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un détecteur par capture d'électron

(GC-ECD), Varian CP 3800-PAL. Injecteur grand volume (2002) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un spectromètre de masse (GC-

NCI-MS), Agilent 6890-5973-Focus. (2001) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un détecteur par capture d'électron

(GC-ECD), Agilent 5973 (site de Brest) (2001) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un détecteur par capture d'électron

(GC-ECD), Varian CP 3800 (2001) • Appareillage de chromatographie gazeuse couplé à un spectromètre de masse (GC-IE-

MS), Agilent 6890-5973. (2000) • Fluorimètre microplaques TECAN (2003) • Cytomètre de flux + passeur plaques, Accuri (2011) • Analyseur semi-automatique de Hg total dans des échantillons solides (AMA-254,

ALTEC, 2001) et dans les échantillons liquides (AMA-254, 2014) • Spectromètre d’absorption atomique « flamme » (Varian, spectra AA-55B, 2009) • Système de digestion par bloc chauffant pour la préparation des échantillons du type

sédiments (DigiPREP MS, SCP Science, 2008) • Photobioréacteur compatible métaux traces et gaz pour cultures en continu de

phytoplancton (Juin, 2008) • Minéralisateur par micro-ondes pour la préparation des échantillons d’organismes marins

(CEM-Mars 5, 2005) • Deux spectromètres de masse couplé à un plasma inductif (ICP-MS Série X (2004) et

iCAP-Q (2014), ThermoFisher), UPLC et GC pour couplage avec les ICP-MS • Spectrophotomètres de fluorescence atomique (Tekran 2500, Brooks Rand) et chaînes

automatisées pour la spéciation du Hg (CREAutomatisme, 2001) • Appareillage de chromatographie liquide (Acquity I-Class) couplé à un spectromètre

de masse en tandem (Xevo TQS-µ) avec option chromatographie gazeuse (APGC) (Waters-2015)

1.3.b. Nouvelles acquisitions 1 bioanalyseur : Dans le cadre d’un achat groupé entre plusieurs laboratoires de l’Institut, le Laboratoire d’écotoxicologie a fait l’acquisition d’un bioanalyseur (Bioanalyzer 2100, Agilent) permettant de mesurer la qualité d’extraits d’ADN, d’ARN et de protéines. Cet outil permettra entre autres d’optimiser les mesures d’expression de gènes par QPCR. 1 Hotte à flux laminaire : Dans le cadre du processus P6 (mise en sécurité des équipements), le laboratoire a pu acquérir une nouvelle hotte à flux laminaire PSMII en remplacement de l’ancienne hotte utilisée pour la culture cellulaire, défectueuse. La mise en service a lieu le 11 janvier 2016.


1 chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem : Depuis quelques années, l’Unité BE a entrepris un programme de jouvence de son instrumentation analytique (8-12 ans en moyenne pour ses principaux équipements). Le LBCO a ainsi obtenu un cofinancement de la part de la Région Pays de la Loire (programme Renforcement des équipements de laboratoires) pour l’acquisition d’un appareil de type chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem. La mise en service de cette nouvelle instrumentation fin 2015 va permettre au laboratoire d’élargir son champ d’expertise vers des composés émergents plus polaires et thermolabiles (les perfluorés, les retardateurs de flamme autres que les PBDE (HBCDD, phosphorés), les produits d’hygiène). Cette acquisition permettra au LBCO d’être en adéquation à la fois avec les nouveaux défis scientifiques environnementaux et avec l’évolution de la réglementation européenne dans le cadre des deux directives cadre sur l’eau et le milieu marin (DCE et DCSMM). 4 hottes d’extraction : Dans le cadre du processus P6 (mise en sécurité des équipements), le LBCO à Brest, a pu remplacer 3 hottes et en acquérir une 4ème afin de réaliser la majorité des manipulations impliquant l’utilisation de solvant ou acide sous hotte. Par ailleurs, le P6 a également pris en charge une partie du coût d’investissement pour l’acquisition d’un nouvel extracteur (Speed-Extractor - Buchi). Le reste du financement a été obtenu auprès du Département du Finistère (AO CG-29 ; Aide à l’acquisition d’équipements de recherche par les laboratoires du Finistère). Le Centre Atalantique a également pris à sa charge la rénovation d’une partie des locaux du LBCM. Le laboratoire dispose maintenant d’une laverie équipée de nouvelles hottes aspirantes parfaitement adaptées à ses activités.


1.4 Moyens financiers et humains affectés aux proje ts (le cas échéant)

Détail des dépenses par action :

Fonctionnement Investissement

A051102A-RS2E -OSUNA CAMELIA 12 500 A051103-Analyse du risque chimique en milieu marin 2 695 2 219 A051104D-ANR GIMPEC 29 741 2 400 A051104-Effets des contaminants chimiques sur les populations 46 A051105A-LABEX COTE-IMPACT 9 330 A051105B-LABEX COTE-MONBAZAR 8 023 5 959 A051105C-LABEX COTE PhytoCOTE 46 A051105-LABEX COTE 235 A051106-INSEV 3I 3 040 A051107-SETAC 2016 (COLLOQUE) 742 A051108-Lab on Ship (ANR) 2 380 A051111-CONTABEL 1 283 A990111-Animation/Coordination unité BE 64 085 335 385

Total Unité BE 134 146 345 963 A060501B RECONSOLE A0503 Rocch A060531 Fish N Pops A050302B Polluants émergents A050602 Onema A60532 Germon A050605 Aquaref A051603 Perseus contamination chimique A050303 DCE (Guyane, Mayotte, Martinique) A050307 Gmos – FP7 A11010 DCSMM A051609 Mermex A050304 Rinbio A0220502B Marsite A050303O Stelar A051608 Mermaid

18 843 176 896 24 452 41 686 7 453 9 456 20 786 73 862 70 699 8 721 7 776 504 1 035 96 8 326 94

5 782

Total hors Unité BE 470 685 5 782

Total général 604 831 351 745

Tableau 4 : Budget par actions menées dans le cadre du projet DECC (Devenir et Effets des Contaminants Chimiques) de l’unité BE (en gras) et hors de l’unité BE (en italique).


Détail du temps en homme mois par action :

Libellé du projet Total (h/mois) A060531 Fish’N’POPs 35,9 A051104D ANR GIMPEC 28,0 A0503 ROCCH 28,0 A051102A RS2E / CAMELIA 27,6 A990111 Animation/Coordination unité BE 24,5 A051104 Effets des contaminants chimiques sur les populations 20,6 A050302B Polluants émergents 15,0 A05062 Onema 11,4 A00050 Préparation des réponses aux appels à projets UE, ANR, Autres 10,1 A070211F Réponses immunitaire aux facteurs biologiques 10,0 A051105A LABEX COTE-IMPACT 7,1 A060532 Germon 6,4 A050605 Aquaref 5,5 A051603 Perseus contamination chimique 5,5 A0503 DCE (Guyane, Mayotte, Martinique) 5,5 A051103 Analyse du risque chimique en milieu marin 5,1 A050307 Gmos – FP7 3,1 A500101 Prospective et stratégie scientifique 2,8 A051105B LABEX COTE-MONBAZAR 2,6 A051111 CONTABEL 2,6 A1101 DCSMM 2,6 A060501B RECONSOLE 2,1 A220502B Marsite 1,8 A051402 Alteo 1,7 A051609 Mermex 1,7 A051104B Meeddm - Tophypac 1,6 A051110 Expertise PNUE 1,4 A050304 Rinbio 1,3 A500502 Soutien aux montages des projets 1,3 A990124 Audit qualité 1,3 A051105C LABEX COTE PhytoCOTE 1,2 A051105 LABEX COTE 1,1 A070806 Soutien, avis et expertise 1,0 A051107 SETAC 2016 (COLLOQUE) 0,9 A050303O Stelar 0,9 A050803F Valise SBSE 0,8 A050308 Ecume 0,5 A051108 Lab on Ship (ANR) 0,4 A0500602 Ospar, Helcom, Méditerranée 0,4 A051106 INSEV 3I 0,3 A050303 Etudes chimiques locales 0,3 A051219A Retromed Canyons 0,3 A050110QS Rephy – Qualité Laboratoire 17025 0,2 A050302 Prospectives et expertises thématiques 0,2 A050803 Echantillonneurs passifs 0,2 A060303C Campagne à la mer DCR 0,2 A050303M Talin 0,2 A050504 IGA-Paluel 0,1 A051608 Mermaid 0,1

Tableau 5 : Temps homme mois par actions menées au sein et en dehors du projet de l’unité BE (DECC).


2) Résultats obtenus au cours de l’année N

Les résultats de l’année 2015 sont présentés par équipe suivant les trois axes structurant le projet de l’unité BE :

1- Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin 2- Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de

vie des organismes 3- Observation et expertise :

a. Développement méthodologique et prospective scientifique b. Réseau d’observation des contaminants chimiques (Rocch) c. Cellule d’analyse du risque chimique (Arc)

En quelques chiffres, l’unité BE a contribué à la rédaction de 36 articles de rang A, 46 communications orales et posters et 15 rapports d’expertise nationale et internationale. Certains projets sont menés en commun par plusieurs équipes BE. Une dizaine de thématiques enrichissent et structurent les trois axes de recherche et surveillance du projet d’unité BE pour un budget de fonctionnement sur recettes de 604 831 € et de 351 745 € en investissment. L’interactivité et la complémentarité des compétences dans l’unité BE est la base de cette forte activité de recherche et expertise. Thématiques de recherche et surveillance

Chercheurs (es) Projets et (guichets)

Transferts trophiques des contaminants métalliques et organiques/Bioaccumulation

V. Loizeau, C. Munschy, C. Tixier, T. Chouvelon, J. Tronczynski, J. Knoery

CONTABEL (AELB), MONBAZAR (Labex Cote), PERSEUS (7 éme PCRD)

Interface eau atmosphère J. Knoery GMOS (7ème PCRD) Echantillonneurs Passifs (EP) C. Tixier, JL Gonzalez, C.

Brach-Papa Dévelopements méthodologiques des EP et expertises (Aquaref, ONEMA, Agences de l’eau, Cd-Bages)

Contamination des grands prédateurs trophiques

C. Munschy, C. Brach-Papa, J. Knoery, T. Chouvelon

GERMON (Fonds européen de la pêche)

Devenir et effets biologiques C. Munschy, V. Loizeau, F. Akcha, S. Stachowski, R. Sussarellu, T. Burgeot

GIMEPEC (ANR), Fish’N’POPs (ANR), GANESH et COMPACT (EC2CO), MYPHYTOS (Politique de sites Ifremer), ADELMIS (Fondation Rovaltain)

Contaminants émergents organiques (Muscs synthétiques, filtres UV, PBDE, HBCDD, PFC)

C. Tixier, C. Munschy Dévelopements méthodologiques (ONEMA-Aquaref, VeillePop Onema, L’Oréal, Ospar)

Continuum estuarien C. Brach-Papa, J. Knoery, S. Stachowski, V. Loizeau, T. Chouvelon, J. Chiffoleau

IMPACT, PHYTOCOTE (Labex Cote) et MOMBAZAR et CAMELIA, RS2E, Pollusols, ERCULE, CONTROL (OSUNA)

Surveillance (Rocch/DCE/DGAL),

JF Chiffoleau, A Grouhel, T. Burgeot, I. Amouroux, M.

Programme de surveillance chimique (Agence de l’eau


développement méthodologique-risque chimique

Dallet , C. Tixier, JL Gonzalez, C. Munschy, C. Brach-Papa et J. Knoery

AESN et BPDL, DGAL, Aquaref), Lab on ship (ANR), DCE NQE (Onema), Susbtances dangeureuses Comité Experts Priorisation national et Norman Europe (Aquaref), , expertise rejet accidentel (VALE), Plan POLMAR, Guide prélèvements (Aquaref), expertise boues rouges (ALTEO), IGA

DCSMM JF Chiffoleau, T. Burgeot, J. Tronczynski

GT BEE JRC (MEDDE)

CIEM/Ospar /Barcelone JF Chiffoleau, T. Burgeot, C. Tixier, M. Dallet

Groupes effets biologiques, Contaminants chimiques, contamination des sédiments, MIME, HASEC (MEDDE)

Tableau 6 : Compétences et complémentarités des chercheurs au sein du projet de l’unité BE suivant les thématiques de recherche et les guichets d’AO.

2.1. Laboratoire d’Ecotoxicologie (BE/LEX) Le LEX contribue aux activités de recherche et surveillance de l’unité BE suivant les deux axes 2 et 3 du projet de l’unité.

Les travaux entrepris par le laboratoire d’écotoxicologie en 2015 sont menés dans l’axe 2. Ils ont permis de poursuivre les recherches dédiées à l’étude des conséquences biologiques pour la descendance d’une exposition parentale à des polluants chimiques. Ce travail a été réalisé chez l’huître creuse après exposition à l’herbicide diuron mais également chez le poisson zèbre après exposition à un mélange de PCB et de PBDE. Sur le modèle phytoplancton, les recherches ont toutes porté sur la toxicité de pesticides, avec le souci de mieux intégrer la complexité environnementale en s’intéressant notamment à la problématique des mélanges chimiques d’origine antropique. Quel que soit le modèle biologique, les effets ont été étudiés du niveau moléculaire au niveau physiologique via l’utilisation de techniques variées, avec la volonté de progresser dans la compréhension des mécanismes moléculaires responsables des effets toxiques observés. Les collaborations existantes avec le LPTC (UMR EPOC) du Labex Cote, nous ont permis d’accroître nos connaissances quant à la biotransformation de l’herbicide diuron chez l’huître ou au rôle que pourrait jouer la matière organique dissoute dans la biodisponibilité et la toxicité des pesticides pour le phytoplancton marin.

2.1.1. Axe 2. Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de vie des organismes

2.1.1.1. Biotransformation de l’herbicide diuron chez l’huître creuse Crassostrea gigas et

identification de mécanismes de toxicité 2.1.1.1.a. Biotransformation du diuron chez l’huître creuse Dans le cadre de la thèse de Daphné Behrens, les capacités de métabolisation de l’herbicide diuron ont été étudiées chez l’huître creuse à différents stades de son cycle de vie (gamètes mâles et femelles, larves trocophores entières, adultes : glande digestive). Après incubations


microsomales, l’analyse des métabolites produits in vitro a été réalisée par UPLC MS-MS grâce à la collaboration établie depuis plusieurs années avec le Dr H. Budzinski du LPTC (UMR EPOC, Bordeaux). Les résultats obtenus ont montré la capacité de l’huître à métaboliser le diuron en DCPMU et DCPU de la même manière que chez les vertébrés supérieurs. Le DCPMU est le premier métabolite formé après déméthylation et est détecté en quantité plus importante que le DCPU. Le sperme et les ovocytes d’huître ont également la capacité enzymatique à biotransformer le diuron. Par ordre décroissant d’activité métabolique, on retrouve la glande digestive = larve trocophore > ovocytes > sperme (Behrens et al., en préparation). 2.1.1.1.b. Rôle de la biotransformation et de la production d’oxyradicaux dans la toxicité du

diuron Le rôle que peuvent jouer la biotransformation et la production d’oxyradicaux (ou espèces réactives de l’oxygène : ERO) dans la toxicité du diuron a également été étudié cette année en considérant la génotoxicité et l’embryotoxicité comme critères de toxicité (thèse D. Behrens). Les effets génotoxiques et embryotoxiques du diuron et de chacun de ses métabolites connus (DCPMU, DCPU, 3,4-DCA) ont ainsi été comparés grâce à l’application respective du test des comètes et du test embryo-larvaire (Behrens et al., soumis). L’implication de la production d’oxyradicaux dans la toxicité des molécules testées a par la suite été étudiée par la modulation des effets toxiques observés lors de la réalisation d’expositions en présence de piégeurs d’oxyradicaux. Dans le cas du diuron, la production d’ERO a également été directement mesurée par cytométrie en flux grâce à l’utilisation du 2',7'-dichlorodihydrofluoresceine diacetate (H2DCF-DA). Lorsqu’il rentre dans la cellule, ce fluorochrome est converti par des estérases intracellulaires en 2’,7’-dichlorodihydrofluoresceine (H2DCF) dépourvue de fluorescence. Au contact d’ERO, cette dernière est finalement convertie en 2’,7’-dichlorofluoresceine (DCF) dont l’intensité fluorescente est directement dépendante de la quantité d’ERO présente dans la cellule. Les résultats obtenus ont montré la génotoxicité et l’embryotoxicité du diuron et de ses métabolites pour les stades de développement précoces de l’huître creuse. Pour des concentrations testées de 0.05 à 0.5 µgL-1, le diuron apparaît comme étant plus embryotoxique que le DCPMU et le DCPU (p < 0.001) et ceci dès la concentration de 0.05 µgL-1 (diuron ≥ DCPMU = DCPU). Dans ce cas, la biotransformation semble constituer un vrai mécanisme de détoxication du diuron chez l’huître dans la mesure où elle diminue la toxicité de la molécule parent. Néanmoins, lorsqu’une gamme de concentrations environnementales est testée (0.002 to 0.050 µgL-1), le diuron présente une embryotoxicité comparable à celle de ses métabolites. À noter que le 3,4-DCA est le seul métabolite à ne présenter aucune embryotoxicité même pour des concentrations allant jusqu’à 5 µg.L-1. En ce qui concerne la génotoxicité, le diuron et l’ensemble de ses métabolites induisent le même niveau de dommages à l’ADN à partir d’une concentration de 0.05 µgL-1. La toxicité du diuron et de ses métabolites semble être liée à la production d’ERO comme démontré par la diminution voire l’annulation des effets toxiques observés en la présence d’acide ascorbique aux propriétés antioxydantes. 2.1.1.1.c. Identification des mécanismes moléculaires d’embryotoxicité Les anomalies de développement provoquées par l’exposition au diuron pourraient être liées à la formation de dommages aux macromolécules embryonnaires telles que l’ADN. Parallèlement aux études réalisées en génotoxicité, il est donc apparu pertinent d’étudier comment le diuron pouvait moduler l’expression de certains gènes impliqués dans l’ontogenèse chez l’huître creuse. Des résultats préliminaires ont montré que l'exposition au diuron semble modifier l'expression de certains gènes (HOX1, LOX5) dans les premières phases du développement embryonnaire. Ces résultats ont servi de base à la soumission d’un projet novateur en génomique fonctionnelle en réponse à l’appel d’offre EC2CO. En


collaboration avec l’UMR BOREA, le projet GANEsH (« Étude fonctionnelle des Gènes impliqués dans les ANomalies Embryo-larvaires chez l'Huître creuse Crassostrea Gigas ») a pour ambition d’identifier des mécanismes moléculaires responsables des anomalies de développement provoquées par l’exposition à des herbicides chez l’huître creuse. Parmi les actions identifiées, la modulation de l'expression de gènes cibles impliqués dans l’embryogenèse, la formation de la coquille (biominéralisation) et la réponse au stress sera mesurée par RT-QPCR. Pour les gènes cibles les plus intéressants, des approches innovantes en génomique fonctionnelle (CRISPR/CAS9) seront mises en place dans le but de confirmer l’identification de ces gènes comme des cibles moléculaires pour les effets toxiques du diuron. 2.1.1.1.d. Effets génétiques et épigénétiques d’une exposition parentale au diuron : Fin du projet ANR GIMEPEC coordonné par le laboratoire La thèse d’Audrey Barranger « Étude chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, des anomalies génomiques provoquées par l'exposition à des concentrations environnementales de diuron : caractérisation des atteintes, étude de leur héritabilité et conséquences pour la survie et la croissance des naissains » financée par l’ANR dans le cadre du projet GIMEPEC « Génotoxicité, IMmunotoxicité et rEprotoxicité des PEsticides chez Crassostrea gigas » a été soutenue le 24 avril 2015 (Figure 4). Cette thèse a permis une avancée remarquable dans l’étude des conséquences des effets génotoxiques des polluants chimiques chez un bivalve marin (cf rapport d’activité 2014). La qualité des recherches entreprises dans cette thèse a été soulignée lors de la soutenance (Félicitations du jury), ainsi que l’effort de valorisation scientifique avec 4 publications scientifiques de rang A dont 3 en premier auteur (Barranger et al., 2014, 2015a, 2015b) et 2 communications orales internationales. À cela, s’ajoutent, pour le projet les résultats prometteurs obtenus en génomique et en épigénétique dans le cadre de la thèse de Rodolfo Rondon « Effets de l’exposition parentale au diuron sur le méthylome et le transcriptome de l’huître creuse Crassostrea gigas » soutenue le 11 décembre 2015. Les analyses transcriptomiques réalisées par RNA-seq ont montré que la transcription de 838 gènes était modulée suite à une exposition parentale à l’herbicide avec 341 gènes sur-exprimés et 497 gènes sous-exprimés (Rondon Sallan et al, soumis). Parmi les résultats obtenus, une analyse d'enrichissement a clairement montré la sur-représentation de transcrits correspondant à des voies moléculaires telles que le réarrangement du cytosquelette, la traduction des protéines et l’activité de la chaîne respiratoire. L'augmentation de la transcription des gènes impliqués dans la production d'énergie, la traduction des protéines et la prolifération cellulaire pourrait ainsi permettre aux naissains issus des géniteurs exposés de maintenir ces fonctions cellulaires en compensant les effets délétères de l'exposition parentale au diuron. Dans le cadre du projet GIMEPEC, il a en effet été démontré que ces naissains présentaient des anomalies morphologiques au stade de larve D et une croissance retardée non seulement pendant la phase de développement embryo-larvaire mais également jusqu’au stade de naissain à l’âge de 3 mois (taille et poids réduits) (Bachère et al., en préparation).


Transmission verticale des atteintes au génome induites par les herbicides

chez l’huître: quel impact sur les performances physiologiques ?

Géniteurs en période de

gamétogenèse

Dommage à l’ADN

• cellules somatiquess

• cellules germinales

• cellules reproductives

Naissain

• Cassures de chromosomes, perte ou

gain de fragments de chromosomes

entiers (dont chr 4, 5 et 10)

• Effet ciblé sur le méthylome

Larves

Naissain

• Cassures de chromosomes, perte ou

gain de fragments de chromosomes

entiers (dont chr 4, 5 et 10)

• Effet ciblé sur le méthylome

Larves

2 pulses d’exposition de 7 jours à une

concentration environnementale de

diuron (0.2-0.3 µgL-1)

TRANSMISSION A LA GENERATION SUIVANTE DE

MATERIEL GENETIQUE MODIFIE

(tests génotoxicité, CMF, FISH, comet-FISH, HPLC, BS-Seq)

IMPACT NEGATIF SUR

LA « FITNESS » DES

DESCENDANTS

Perte de poids

• Anomalies de développement

• Diminution du taux d’éclosion

• Métamorphose retardée

• Diminution croissance


• Résistance moindre aux mortalités

?MODIFICATIONS DU

TRANSCRIPTOME

(RNA-seq)

? TRANSMISSION A LA GENERATION SUIVANTE DE

MATERIEL GENETIQUE MODIFIE

(tests génotoxicité, CMF, FISH, comet-FISH, HPLC, BS-Seq)

IMPACT NEGATIF SUR

LA « FITNESS » DES

DESCENDANTS

Perte de poids







Perte de poids







?MODIFICATIONS DU

TRANSCRIPTOME

(RNA-seq)

?

Figure 4 : Synthèse des résultats phares du projet GIMEPEC. L’étude du méthylome réalisée dans le cadre de cette thèse par l’approche BS-seq a montré que le pourcentage de méthylation des cytosines dans le contexte CpG est de 16,56% chez Crassostrea gigas (Rondon Sallan et al., en préparation). Concernant la méthylation des cytosines totales dans le génome, nous avons constaté que le pourcentage de méthylation est de 2,00%. Ces résultats sont concordants avec les mesures faites par HPLC dans le cadre du projet GIMEPEC (Bachère et al., en préparation) et lors d’études précédentes qui ont montré un pourcentage de méthylation dans le contexte CpG de 15% et un pourcentage de méthylation total autour de 2% pour les branchies et le manteau de C. gigas (Gavery and Roberts, 20131; Wang et al., 20142). Suite à l’exposition parentale au diuron, un différentiel de méthylation a été observé dans 1967 régions de 500 paires de bases chacune. Parmi elles, 1060 régions sont hyperméthylées et 907 hypométhylées. Néanmoins, seulement 236 régions présentent un différentiel de méthylation dans l’ensemble des répliquats analytiques. Ces régions ciblées par l’exposition parentale au diuron (121 hyperméthylées et 115 hypométhylées) sont localisées dans les régions intra-géniques du génome, les exons (38,31%) et les introns (34,92%), mais également dans les régions inter-géniques sans gènes annotés (26,44%). Seulement 0,34% d’entre elles sont localisées dans les régions promotrices. En considérant ces régions, 170 gènes ont pu être identifiés dont 83 sont hyperméthylés (processus métaboliques de l'ADN ; régulation de l'initiation de la traduction ; biogénèse des complexes ribonucleoprotéiques ; organisation de la machinerie de séparation des chromosomes lors de la mitose ; voie de signalisation Toll, réponse aux virus) et 87 sont hypométhylés (régulation des modifications des histones ; régulation positive de la

1 Gavery, M. R., Roberts, S. B., 2013. Predominant intragenic methylation is associated with gene expression characteristics in a bivalve mollusc. PeerJ. 1, e215. 2 Wang, X., et al., 2014b. Genome-wide and single-base resolution DNA methylomes of the Pacific oyster Crassostrea gigas provide insight into the evolution of invertebrate CpG methylation. BMC Genomics. 15, 1119.


transcription ; réparation de l'ADN ; développement du système immunitaire ; réponse aux cytokines). Parmi ces gènes, on trouve notamment une hyperméthylation du gène codant la protéine de choc thermique HSP 70 B2 et deux gènes codant des protéines de réparation de l'ADN. Parmi les gènes hypométhylés, nous avons identifié des gènes codant des protéines impliquées dans les modifications post-traductionnelles des histones et un gène codant la protéine méthylcytosine dioxygenase tet1 impliquée dans les premières étapes de la déméthylation de l'ADN. Des études sont toujours en cours pour préciser l’effet épigénétique de cette exposition parentale au diuron et dans le but de mieux confronter les données du RNA-seq à celles du BS-seq. 2.1.1.2. Effets combinés des pesticides et du virus OHV1 chez l’huître Dans le cadre de la thèse de Pierrick Moreau co-encadrée par T. Renault et T. Burgeot, l’étude des interactions entre infection à OsHV-1, l’immunité, l’autophagie et les pesticides a été conduite chez l’huitre creuse, Crassostrea gigas. Les mortalités observées chez cette espèce, tout particulièrement en période estivale, peuvent laisser suspecter un rôle important joué par les pesticides d’utilisation saisonnière, associés à des arrivées d’eau douce dans les zones d’élevage. Dans ce contexte, les effets de certains pesticides préalablement choisis sur la base de leur présence dans le milieu et de leur nature ont été évalués pour leur capacité à moduler les capacités de défense de l’huître creuse, C. gigas, et d’influer sur le développement de l’infection à virus OsHV-1. Les expérience menées n’ont pas révélé de dégradation du virus OsHV1 par les pesticides. Cependant , des huîtres préalablement contaminées par un mélange de pesticides sont plus sensibles à l’infection virale (Moreau P. et al., 2015a et 2015b). 2.1.1.3. Devenir et effets de polluants organiques persistants sur la reproduction des poissons, le développement et la survie de la descendance Dans le cadre du projet ANR Fish’N’POPs (coord RBE/HGS/LRHLR), des expositions et des analyses ont été réalisées à la Plate-forme Ecophysiologie des Poissons (PEP, L'Houmeau). Les objectifs étaient (1) l’analyse de la répartition corporelle des PCB et PBDE, (2) leur transfert aux œufs, et (3) l’étude de leurs effets sur la reproduction des poissons, le développement, la survie et les performances de la descendance, avec un objectif de modélisation. Chez le poisson zèbre, plusieurs séries d’expositions à un mélange de congénères de PCB et de PBDE présents dans l’estuaire de la Seine ont été réalisés en 2015. Elles montrent que les poissons contaminés ne présentent pas de ralentissement de la croissance significatif mais qu’ils sont en revanche moins rapidement matures et qu’ils pondent en moindre quantité. L’analyse de la survie larvaire montre une mortalité plus précoce chez les larves issues de parents contaminés ce qui suggère que leurs réserves vitellines s’épuisent plus rapidement que celles des larves témoins ou qu’elles sont de moindre qualité. Ces premiers résultats suggèrent que de telles expositions sont susceptibles d’altérer la reproduction et la survie des juvéniles, deux facteurs clefs de la pérennité des populations naturelles. Au niveau individuel, des analyses portant sur le comportement ont permis de mettre en évidence des altérations significatives chez les larves et juvéniles F1 issus de parents exposés (F0) de même que chez leur descendance (F2). Ces altérations pourraient être reliées au niveau moléculaire à des modifications de l'expression de gènes impliqués notamment dans la méthylation de l'ADN (DNA methylases, dnmt) et la neurogenèse.

Le LEX (L’Houmeau) et le Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne participe à la tâche 7 (modélisation et effets sur les populations) de ce projet ANR. Le LBCO intervient quant à lui en tant que responsable de la tâche 6 (devenir des POP).

En 2015, le LBCO a mis l'accent sur l’étude des cinétiques de contamination et sur le transfert maternel des contaminants chez le poisson zèbre. Les cinétiques ont été étudiées sur des individus mâles et femelles sur un pas de temps de 12 mois, et les pontes ont été récoltées par


couples, permettant ainsi d’étudier le transfert maternel à l'échelle individuelle. L'interprétation des résultats est en cours et devrait permettre, conjointement aux résultats obtenus chez la sole, une valorisation en 2017. Les 1ers résultats montrent un transfert des PBDE et des PCB globalement faible de la femelle vers ses œufs (rapport concentration oeuf / femelle de 8-25% pour la majorité des congénères), dépendant du congénère et en particulier de son caractère hydrophobe (log Kow) . Les cinétiques d'accumulation montrent des résultats différents pour les deux familles de contaminants étudiés, vraisemblablement en lien avec leur caractère hydrophobe et également avec la capacité du poisson zèbre à métaboliser les PBDE. Pour ces derniers, des expositions de poissons zèbre à des congénères individuels ont permis de mettre en évidence une métabolisation importante et des voies de métabolisation liées à l'espèce et différentes de celles déterminées auparavant chez la sole (projet Solebémol).

2.1.1.4. Effets toxiques aigus et chroniques des herbicides seuls ou en mélange sur le phytoplancton marin

2.1.1.4.a. Rôle de la matière organique dissoute dans la biodisponibilité et la toxicité des herbicides pour le phytoplancton marin et d’eau douce : Dans le cadre des projets IMPACT (Influence de la qualité de la Matière organique dissoute (MOD) sur la toxicité des Pesticides vis-à-vis des micro-Algues le long d'un ConTinuum eau douce – eau marine, thèse Nathalie Coquillé, LabEX COTE) et COMPACT (COmmunautés micro-algales : effets de la Matière organique dissoute et des Pesticides sur l’Activité photosynthétique et la Composition Taxonomique, EC2CO), la toxicité d’herbicides, seuls et en mélange, a été étudiée sur des micro-algues d’eau douce et d’eau marine (cultures monospécifiques et communautés naturelles), en présence ou non de matière organique dissoute (MOD) naturelle (Figure 5). Les expérimentations IMPACT menées en 2015 ont montré des effets significatifs de l’irgarol à 0.5 µg/L et du mélange (irgarol 0.5 µg/L, diuron 0.5 µg/L et S-métolachlore 5 µg/L) sur quatre espèces de micro-algues (deux espèces d’eau douce et deux marines), au niveau de différents paramètres physiologiques (temps de génération, efficacité de photosynthèse, contenu relatif en lipides, contenu relatif en espèces réactives de l’oxygène). En présence de la MOD naturelle, les effets des herbicides ont été atténués sur trois espèces (les deux espèces d’eau douce et la diatomée marine) alors qu’ils ont été amplifiés sur la chlorophyte marine. Les analyses chimiques sont en cours pour caractériser les niveaux d’exposition réels aux herbicides et les interactions MOD/herbicides. L’influence de la MOD sur la toxicité des herbicides peut s’expliquer notamment par une modification de la biodisponibilité des herbicides (piégeage/adsorption des molécules en présence de MOD) mais également par la capacité de certaines micro-algues à mettre en place de la mixotrophie voire de l’hétérotrophie. Les résultats concernant les communautés (COMPACT) sont encore en cours d’analyse.


Pompage de l’eau de mer (A : Bassin d’Arcachon), tamisage des communautés naturelles de phytoplancton (B), concentration des communautés (C) et mise en place d’une expérimentation COMPACT (D)

A B C D

Figure 5 : Echantillonnage de phytoplancton (A,B,C) et experiémentation en laboratoire (D)

dans le projet COMPACT. 2.1.1.4.b. Adaptation des micro-algues marines au stress chimique induit par l’exposition à des herbicides Dans le cadre du projet MIPHYTOS (Phytosanitaires et producteurs primaires : effets sur les micro-algues benthiques et planctoniques et sur le comportement de consommateurs exposés par voie trophique, DS Ifremer, Politique de site), des expositions à des herbicides (mêmes molécules que pour IMPACT) ont été réalisées sur deux souches de Skeletonema marinoï isolées du milieu naturel au niveau de deux sites de la Baie de Bourgneuf, différemment exposés aux pollutions anthropiques (La Coupelasse, site « exposé » et Les Moutiers, site « de référence »). Les différentes expositions réalisées avec les herbicides seuls et en mélange ont permis de montrer une sensibilité plus importante de la souche isolée des Moutiers par rapport à la souche de La Coupelasse, reflétant un potentiel d’acclimatation au stress chimique différent pour deux souches d’une même espèce mais originaires de sites distincts.

Par ailleurs, des travaux ont été entrepris au laboratoire dans le but d’identifier chez Tetraselmis sueccica les mécanismes moléculaires impliqués dans la résistance au diuron (Dupraz et al., soumis). En effet, après exposition chronique à l’herbicide pendant plusieurs générations, une résistance a été développée par la micro-algue marine jusqu’à annuler complètement les effets toxiques observés jusqu’à présent dans nos conditions de laboratoire. Les analyses réalisées sur l’ADN de la souche résistante ont ainsi permis d’identifier une mutation du gène codant pour la protéine D1 et qui pourrait être responsable de la résistance à l’herbicide. Avec la différence de niveau de méthylation de l’ADN déjà observée entre la souche sauvage et la souche mutée, ces résultats montrent les effets génétiques et épigénétiques du diuron sur le phytoplancton marin, effets observés de façon similaire chez l’huître creuse. Un projet, ADELMIS « Mécanismes moléculaires de l’Adaptation de la microalgue marine TetrasELMIS Suecica au diuron : conséquences sur sa sensibilité à un mélange complexe de pesticides » a été soumis cette année à l’AO du Programme de Recherche en Toxicologie Environnementale et Ecotoxicologie de la Fondation Rovaltain pour poursuivre ces investigations.

2.1.1.4.c. Développement d’un test en microplaques pour l’étude de la toxicité de mélanges complexes d’herbicides chez les micro-algues marines Avec l’acceptation par le LabEX COTE et la Région Aquitaine du projet PHYTOCOTE (« Les phytosanitaires dans le LabEx COTE : utilisation dans les agrosystèmes, transferts et impacts sur les écosystèmes"), c’est une autre thèse qui a démarré cette année au laboratoire grâce à l’obtention d’une bourse au mérite de l’ED VENAM pour Valentin Dupraz. Cette thèse a pour sujet « Utilisation d’extraits d’échantillonneurs passifs de type POCIS pour l’étude des


effets toxiques de pesticides sur micro-algues et bivalves, de leur transfert trophique et des effets associés ». Elle a pour objectif (1) de caractériser le transfert de pesticides de parcelles agricoles jusqu’aux eaux estuariennes via l’utilisation d’échantillonneurs passifs de type POCIS, (2) d’étudier au laboratoire le potentiel toxique des extraits de POCIS sur des micro-algues et la larve d’huître creuse et (3) d’évaluer chez l’huître les effets indirects de pesticides, seuls ou en mélange, suite à une contamination d’huîtres juvéniles par voie trophique. En 2015, Les travaux de thèse ont démarré par la mise au point d’un test en microplaques comme outil de screening de la toxicité de plusieurs pesticides utilisés au niveau du bassin versant du Blayais à dominante viticole.

2.1.2. Axe 3 : Observation et expertise Le LEX contribue au développement méthodologique des biomarqueurs et bioessais en surveillance pour des applications Ospar et DCSMM. Une demande de campagne a été rédigée pour organiser sur l’Europe, la campagne SELIMED au large de Marseille. Cette campagne fait partie du dispositif des campagnes dédiées pour l’acqusistion de données nouvelles dans le cadre du plan de surveillance de la DCSMM. Le LEX a également contribué à la valorisation du programme international de surveillance intégrée de la contamination chimique et effets biologiques. Cela constitue une avancé unique en écotoxicologie pour l’interprétation des biomarqueurs et bioessais. 3 ublications de rang A ont été produites et seront insérées dans un numéro spécial de a revue Marine Environement Reearch (Ketil et al., 2015, Martinez-Gomez et al., 2015, Vethaack et al., 2015) 2.2.Laboratoire de Biogéochimie des Contaminants Or ganiques (BE/LBCO)

Le LBCO contribue aux activités de recherche et surveillance de l’unité BE suivant les trois axes du projet de l’unité.

2.2.1. Axe 1 : Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin 2.2.1.1. MOdélisation Mécaniste de la BioAccumulation des contaminants organiques dans le réseau trophique de la Sole Solea solea dans l’estuAiRe de la Gironde : Action Mombasar . L’année 2015 correspond à la première année de ce projet financé pour 3 ans par le LabEx Cote. Ce projet collaboratif associe trois unités du Labex COTE (LPTC-EPOC, UR EPBX – Irstea et Unité BE-Ifremer) travaillant sur deux champs disciplinaires : l’écodynamique des micropolluants organiques et l’écologie des populations halieutiques estuariennes. Dans ce cadre, le LBCO s’intéresse au développement d’un modèle mécaniste à base physiologique et décrivant les processus de bioaccumulation de contaminants organiques émergents acides perfluorés (PFC) et des polychlorobiphényles (PCB) dans le réseau trophique de la sole en estuaire de Gironde. Florence Mounier, doctorante au LBCO depuis fin 2014 (cofinancement Ifremer-Irstea ; co-encadrement par J. Lobry (Irstea-Bordeaux) et V. Loizeau (BE/LBCO) est directement impliquée dans ce projet, et une partie du travail de modélisation repose sur son travail de thèse.

Ce projet de thèse se propose de décrire, au moyen de la modélisation mécaniste, les processus de bioaccumulation de deux familles de contaminants organiques halogénés, toutes deux persistantes, toxiques et bioaccumulables, mais dont les propriétés physico-chimiques sont contrastées : les polychlorobiphényles (PCB) sont des composés historiques fortement lipophiles dont les processus de bioaccumulation ont déjà été beaucoup étudiés, contrairement


aux PFC amphiphiles qui sont des composés émergents encore peu étudiés. Ces travaux sont focalisés sur les juvéniles de sole Solea solea de l'estuaire de la Gironde puisque cette espèce, d’intérêt halieutique majeur pour les pêcheries du Golfe de Gascogne, utilise cette zone comme nourricerie durant ses premiers stades de vie.

Le cadre de modélisation retenu consiste à forcer un modèle classique de cinétique des contaminants à l'échelle de l'individu avec diverses sorties d'un modèle de processus (DEB : Dynamic Energy Budget), permettant de caractériser l'état énergétique d'un organisme ainsi que de quantifier ses principales fonctions physiologiques (ingestion, respiration, croissance, reproduction,...). En effet, les mécanismes d'entrée et de sortie des contaminants dans la sole sont dépendants de ces caractéristiques physiologiques, et leur prise en compte permettra de mieux décrire la dynamique de bioaccumulation à partir de l'environnement biotique et abiotique des poissons.

Cette approche devrait apporter des éléments de prédiction et de comparaison (1) de la dynamique des deux familles de contaminants à partir des proies de la sole (2) de leur devenir et distribution dans la sole. In fine, les prédictions des niveaux de contamination des soles de l'estuaire de la Gironde en fonction de divers scenarios environnementaux (température et niveau de contamination des proies de la sole, du sédiment et de l'eau) pourront être reliées à des effets sur les fonctions physiologiques de la sole, et à leurs impacts sur l'état de santé et la dynamique des populations de soles. Dans la continuité des travaux de post-doctorat de Marie Eichinger, (projet Solebemol) et Heidi Pethybridge (Projet Costas), Florence Mounier étudiante en thèse, a ainsi réalisée une nouvelle paramétrisation du modèle DEB de croissance de la sole sous environnement R (Mounier et al. 2015). Ainsi, l’intégralité du cycle de vie de la sole est maintenant pris en compte en distinguant les mâles des femelles. A titre d’exemple, la figure 6 présente la comparaison des simulations du modèle (données en taille) avec les biométries des soles obtenues en conditions expérimentales pendant 6 ans. La variabilité individuelle peut en grande partie être expliquée par un accès de +/- 50 % à la nourriture.

Figure 6 : Comparaison des courbes de croissance de la sole obtenues à partir de données expérimentales ou

simulées (en considérant une ingestion de +/- 50 % à la nourriture).


2.2.2. Axe 2 : Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de vie des organismes

2.2.2.1 Devenir et effets de polluants organiques persistants (PCB, PBDE) sur la reproduction des poissons, le développement et la survie de la descendance : Projet Fish’N’POPs (2013-2016).

Le LBCO intervient dans ce projet en tant que responsable de la tâche 6 (devenir des POP) et participe avec LEX (L’Houmeau) et le Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne à la tâche 7 (modélisation et effets sur les populations). Description activités du LBCO : cf détails 2.1.1.2 2.2.2.2. Structure génétique et migration du thon germon : Action GERMON (GEnetic stRucture and Migration Of albacore tuNa) Le LBCM et le LBCO ont contribué en 2014-2015 au projet GERMON dans le but d’étudier la contamination des prédateurs supérieurs vivant en zone hauturière. Le projet, financé par le Fond Européen de la Pêche était placé sous la responsabilité de J. Bourjea, DOI La Réunion. Il a démarré en janvier 2014 et s'est terminé en juin 2015 avec la remise du rapport final.

Le projet GERMON s'intéresse à une espèce de thon qui se situe au 4ème rang des captures commerciales mondiales et qui constitue la 2ème espèce la plus péchée par les palangriers réunionnais, le thon germon (Thunnus alalunga). Il s'agit de l’espèce de grand pélagique la moins étudiée dans l’océan Indien.

Le LBCO et le LBCM interviennent au sein de l'une des 5 actions du projet (Étude préliminaire de la structure du germon en fonction de son habitat) en étudiant certains contaminants organiques et métalliques pouvant être utilisés en tant que traceurs chimiques. Concernant les contaminants organiques analysés par le LBCO, l'étude de la contamination des thons germons de la partie sud de l'Océan Indien, combinée à un premier examen des lipides totaux chez les mêmes individus, a permis de mettre en évidence des différences de niveaux et de profils de contamination entre les deux zones étudiées (Ile de La Réunion - zone A et Sud de l'Afrique du Sud - zone C). Ainsi, les individus issus de la zone A, bien que plus âgés, montrent des niveaux de contamination inférieurs à ceux de la zone C, ce qui est en partie expliqué par leurs taux de lipides totaux plus faibles (Figure 7).

Figure 7 : Analyse en composantes principales pour les contaminants organiques dans les thons

collectés sur l’île de La Réunion ou au sud de l’Afrique du sud.

Globalement, les poissons prélevés dans la zone C montrent une plus grande homogénéité de leurs niveaux et profils de contamination que ceux de la zone A. L'âge plus important de ces derniers pourrait expliquer cette plus grande variabilité. En zone A, des différences ont également été mises en évidence entre sexes. La plus grande variabilité des niveaux et profils de contamination observée en particulier chez les femelles de la zone A pourrait être liée à des différences de leur état physiologique vis à vis de la reproduction.


Les thons étudiés montrent des niveaux de contamination faibles par rapport aux données de la littérature chez différentes espèces de thon au niveau mondial. Ces niveaux sont bien en deçà des normes sanitaires fixées pour les PCB dans les denrées alimentaires. Cette étude fait apparaître une contamination liée aux pesticides (insecticides - DDT) plus importante que celle liée aux apports industriels sur les deux zones étudiées.

L'identification de ces contaminants dans tous les échantillons analysés confirme la contamination de ces prédateurs supérieurs dans des zones éloignées des sources principales -historiques ou contemporaines de ces contaminants et souligne la dispersion de la contamination à un niveau global. L'ensemble de ces résultats a fait l’objet d’un rapport (Nikolic et al. 2015) et une action de valorisation est en cours conjointement avec les traceurs trophiques (isotopes stables, contenus stomacaux) des poissons.

2.2.2.3. Contaminants chimiques chez le Bar en Estuaire de Loire : transfert trophique et biomarqueurs d'exposition : Action CONTABEL Cette année marque le démarrage d’un nouveau projet CONTABEL (CONTAminants chimiques chez le Bar en Estuaire de Loire : transfert trophique et biomarqueurs d'exposition) qui vise à réaliser, pour une large sélection de contaminants métalliques et organiques (réglementaires ou émergents), un état des lieux de la contamination chimique des sédiments de l'estuaire de la Loire et à étudier le transfert trophique de ces contaminants vers une espèce d'intérêt halieutique, le bar commun (Dicentrarchus labrax). Ce projet s'intéresse aux juvéniles de poissons au cours des premières années de leur vie, en prenant en compte également leur proie privilégiée, la crevette grise (Crangon crangon). Ce projet, en collaboration avec divers partenaires à l’interne (BE/LBCM et LEX) et à l’externe (MMS – Nantes, LIENS – La Rochelle, Univ. Rennes 1 EA 7316, Museum National Histoire Naturelle UMR 7208 BOREA CRESCO - Dinard) permettra de renforcer une collaboration naissante avec l’équipe ECO- MMS de l’Université de Nantes. Une première phase pilote d’un an a été acceptée pour financement par l’Agence de l’Eau Loire Bretagne visant à une première évaluation de la contamination du bar.

Une campagne de pêche a ainsi été organisée en novembre 2015 conjointement à la campagne du suivi ichtyologique des masses d’eau de transition menée en estuaire de Loire (campagne DCE sous la responsabilité des équipes CRESCO – Dinard et EA 7316 – Rennes). L’échantillonnage a porté sur des crevettes et des juvéniles de bar essentiellement de classe d’âge 1+ (7-14 cm) et 2+ (14-21 cm). Une fois pêchés, les organismes ont été transportés vivants au laboratoire pour les étapes de dissection.

Des prélèvements de sédiments de surface (3 premiers cm) ont également été réalisés sur une quinzaine de sites. Le périmètre d’étude choisi correspond à l’estuaire moyen, entre Cordemais et les pointes de Chémoulin et Saint-Gildas (zones méso- et poly-halines), ainsi qu'en amont et en aval de la ville de Nantes. Les sites choisis couvrent équitablement les rives nord et sud de l’estuaire et correspondent à la zone intertidale.

L'évaluation de potentiels dysfonctionnements biologiques sur les juvéniles de bar par une approche multi-marqueurs de stress oxydant, de neurotoxicité et de génotoxicité fera l’objet d’une seconde phase du projet pour laquelle une prolongation de financement sera demandée en 2016.

2.2.3. Axe 3 : Observation et risque chimique

2.2.3.1 Développement méthodologique

2.2.3.1.a. Action Projet Veille-POP (Veille sur les nouveaux polluants organiques persistants dans les mollusques marins)


Ce projet, mené au titre d’une convention annuelle Onema-Ifremer renouvelée chaque année depuis 2010, a pour objectif de déterminer les niveaux et les empreintes de contamination de l’environnement marin côtier par des contaminants organiques persistants, bioaccumulables et toxiques. Les contaminants recherchés, considérés comme substances émergentes, sont des retardateurs de flamme bromés (RFB) : PBDE (polybromodiphényléthers) et leurs composés de remplacement BTBPE (1,2-bis(2,4,6-tribromophenoxy)ethane) et DBDPE (decabromodiphényl éthane), ainsi que des RFB historiques, HBB (hexabromobenzene) et BB-153 (2,2’,4,4’,5,5’-hexabromobiphényle). Cette étude permet également de faire un état des lieux de la contamination du littoral par les muscs synthétiques sur dix stations. La distribution géographique de la contamination par ces substances est étudiée sur les trois façades maritimes métropolitaines dans des mollusques filtreurs (moules et huîtres) utilisés comme espèces intégratrices de la contamination.

Pour l'année 2013, les concentrations en BDE-47, congénère majoritaire dans les échantillons, sont comprises entre 0.10 ng g-1 ps dans la baie de l'Hérault et 1.31 ng g-1 ps dans l'estuaire de la Seine. Les nouveaux RFB, BTBPE et DBDPE, montrent quant à eux des niveaux 14 à 18 fois inférieurs à ceux du BDE-47, avec des valeurs comprises entre 8.9 pg g-1 ps dans l'estuaire de la Nivelle (Atlantique) et 140.0 pg g-1 ps en estuaire de Seine (Manche) et entre entre 7.0 pg g-1 ps dans la baie de l'Hérault (Méditerranée) et 7568.5 pg g-1 ps dans la baie d'Arcachon (Atlantique), respectivement. Les RFB historiques présentent des niveaux 7 fois plus faibles que ceux des nouveaux RFB pour le BB-153, et 2 fois plus faibles pour l’HBB. La fréquence de détection des RFB non PBDE à des niveaux quantifiables est de 100% pour l'HBB, de 85% pour le DBDPE et de 65% pour le BTBPE et le BB-153.

Les résultats obtenus indiquent que les échantillons provenant des sites de la façade Méditerranéenne et de la Manche présentent des niveaux de contamination (valeurs médianes) les plus élevés pour la totalité des RFB étudiés. En Manche, l’estuaire de la Seine reste un site particulièrement contaminé.

Les empreintes moyennes de la contamination en PBDE sont dominées par les congénères tétra- et penta-bromés BDE-47, BDE-99, et BDE-100. Ces résultats concordent avec les empreintes déterminées dans les mollusques de diverses régions du monde. Le BDE-49 (penta-bromé) est également détecté de façon non négligeable dans les échantillons. Globalement, les concentrations en PBDE déterminées dans les échantillons prélevés en 2013 montrent des valeurs assez similaires à celles déterminées dans les échantillons prélevés aux mêmes sites entre 2010 et 2012. Les niveaux de contamination des RFB autres que PBDE ne montrent pas d'évolution temporelle marquée entre 2012 et 2013. L'augmentation des concentrations en HBB observée entre 2011 et 2012 est confirmée en 2013.

Les deux muscs polycycliques, galaxolide (HHCB) et tonalide (AHTN) sont les composés majoritairement identifiés dans tous les échantillons à des concentrations pouvant atteindre respectivement en Baie de Seine des concentrations de 54 et 9 ng g-1 ps (valeur médiane : 4 et 0.8 ng g-1 ps). Les niveaux de contamination observés pour les deux muscs nitrés étudiés (musc xylène et musc cétone - valeur médiane : 0.04 et 0.09 ng g-1 ps ) sont nettement inférieurs à ceux observés pour les muscs polycycliques (Fig 8). Les concentrations observées sur le littoral sont très hétérogènes : la Baie de Seine apparaît comme le site le plus impacté par les muscs synthétiques.


0

3

6

9

12

15

Antifer(2013)

Est. Seine(2013)

Est.Vilaine(2013)

Est. Loire(2013)

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Figure 8 : Concentrations en muscs polycycliques (HHCB : galaxolide et AHTN : tonalide) en ng g-1 poids sec

dans les échantillons de mollusques intertidaux du littoral métropolitain prélevés au mois de novembre en 2013. < : inférieur à la limite de quantification.

L'ensemble des résultats a fait l'objet d'un rapport dans le cadre de la convention Onema-Ifremer (Munschy et al. 2015). Par ailleurs, un premier bilan des études réalisées dans le cadre de cette convention depuis plusieurs années a été présenté au « 15th International Conference on Chemistry and the Environment (ICCE) » à Leipzig (sept. 2015) (Tixier et al. 2015). Ces travaux seront poursuivis par le LBCO dans le cadre de la convention Onema 2016-2018, avec toutefois une activité réduite en 2016 (réduction budgétaire conduisant à un nombre de sites étudiés restreint).

2.2.3.2. Développement méthodologique et prospective scientifique 2.2.3.2.a. Transfert vers les opérationnels d‘une méthode d’analyse de muscs synthétiques dans le biote marin par GC-MS Menée dans le cadre de la convention Onema-Aquaref, cette action avait pour objectif d’optimiser et de valider une méthode d’analyse de muscs synthétiques, dans le biote marin, par GC-MS. Cette méthode porte sur l’analyse du musc xylène (MX), du musc cétone (MK), du galaxolide® (HHCB) et du tonalide® (AHTN). Des premiers développements avaient déjà été initiés en 2014 dans le cadre de l’action Veille-POP (convention Ifremer-Onema) portant sur la contamination des mollusques intertidaux du littoral métropolitain par des polluants organiques émergents persistants. De nouveaux développements ont été réalisés afin d’améliorer les performances de la méthode existante au LBCO pour l’analyse des muscs dans le biote en terme de sensibilité, de spécificité et de contamination du blanc d’analyse. L’optimisation de différents paramètres chromatographiques et spectrométriques ont permis d’améliorer la spécificité des signaux étudiés et de gagner en sensibilité pour certains composés. Une étude des sources de contamination au cours du processus analytique a été réalisée, ce qui a permis d’établir des précautions particulières à suivre lors de l’analyse de ces composés. Une fiche méthode Aquaref présentant les performances de la méthode et tous les paramètres de validation est en cours de finalisation. 2.2.3.2.b. Action Développement des systèmes d’échantillonnage passif Dans le cadre de la convention Onema-Aquaref, le LBCO et le LBCM ont poursuivi leurs actions en lien avec les autres partenaires du consortium : i) contribution à la valorisation des conclusions de l’atelier Norman –Aquaref organisé fin 2014 sur cette thématique par la rédaction d’une publication dans Trends in Analytical Environmental Chemistry (Miege et al. 2015) ; réflexion pour l’élaboration d’un cahier des charges pour organiser une exposition


d’échantillonneurs passifs in situ à large échelle en vue de répondre à certains objectifs opérationnels (choix molécules, échantillonneurs, sites, …). Ce travail sera poursuivi en 2016 conjointement avec les Agences de l’eau. 2.3. Laboratoire de Biogéochimie des Contaminants M étalliques (BE/LBCM) Le LBCM contribue aux activités de recherche et surveillance de l’unité BE suivant trois axes du projet de l’unité. Les activités de recherche sont présentés suivant différentes actions menées dans les deux axes de recherche : Axe 1 : Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin et axe 2 : Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de vie des organismes)

2.3.1. Axe 1 : Cycles biogéochimiques dans l’écosystème marin 2.3.1.1. Etude du fonctionnement biogéochimique et la mobilité des contaminants anthropiques dans l’estuaire de la Loire : Action RS2E-CAMELIA Le projet RS2E (Réseau de surveillance et suivi environnemental) porté par l’Observatoire des Sciences de l’Univers de Nantes Atlantique est une action de 5 ans financée par la Région Pays de la Loire. Il constitue la réponse commune de plus d’une dizaine de partenaires scientifiques et institutionnels (Région Pays de la Loire, Universités, CNRS, BRGM, IFSTTAR, IFREMER…) fédérés autour d’une même thématique : Mettre en place un réseau de surveillance, étudier le fonctionnement biogéochimique et la mobilité des contaminants anthropiques dans l’estuaire de la Loire. Les zones estuariennes constituent le réceptacle final des apports de contaminants d’un bassin versant. Ces derniers, issus des sources agricoles, urbaines et industrielles, rejoignent ce réceptacle sous la forme d’apports directs à l’hydrosphère (rejets d’effluents urbains ou industriels) et d’apports indirects (eaux de ruissellement ou de dépôts atmosphériques). La spéciation, la mobilité et le comportement de la charge contaminante, qui transite par l’estuaire avant de rejoindre le milieu marin, sont dictés par les processus biogéochimiques qui définissent le fonctionnement de l’estuaire. Ils dépendent de nombreux paramètres qui sont dépendants du cycle hydrologique de la zone de transition (hydrodynamique, turbidité, salinité…). La contamination et le fonctionnement biogéochimique de l’estuaire de la Loire sont assez peu connus. Même si la Loire ne fait pas partie des grands fleuves identifiés comme particulièrement contaminés, quelques études ont par exemple mis en évidence une contamination par le plomb pour lequel des rejets conséquents ont été effectués jusqu’au début des années 90. Elles ont également mis en évidence la nécessité de s’intéresser au comportement des contaminants dans la zone estuarienne, notamment en fonction du cycle hydrologique. Enfin, au cours de ces dernières décennies, les pressions anthropiques sur la Loire et son estuaire se sont accrues (augmentation de la densité de population, travaux d’aménagement, changement des pratiques agricoles…). Elles modifient la nature et les sources de contaminants. Leurs conséquences sur la charge, le comportement des contaminants et le fonctionnement de l’estuaire sont donc méconnues. L’action CAMELIA (Contamination Métallique de la Loire dans sa partie Aval) s’inscrit au sein du volet 2.2 « Qualité du milieu et transferts de contaminants » de l’axe « Fonctionnement biogéochimique de l’estuaire de la Loire » (Axe 2). Son objectif général consiste à étudier le fonctionnement biogéochimique de l’estuaire de la Loire ainsi que la mobilité des substances toxiques afin de mieux appréhender les effets des pressions anthropiques. Dans ce contexte le LBCM s’intéresse à la biogéochimie et à la mobilité des contaminants de l’estuaire de la Loire. Il porte une attention toute particulière sur les nouvelles formes de contaminations métalliques et leurs marqueurs anthropiques permettant d’assurer leur suivi et l’identification


de leurs sources. Ceci se traduit par des analyses multi-élémentaires et isotopiques des éléments lourds par ICP-MS. Cette étude permet d’appréhender les effets des pressions anthropiques (augmentation de la densité de population, travaux d’aménagement, utilisations de ces éléments par les activités humaines qui modifient les sources et les apports…) sur la charge, la distribution et la mobilité des contaminants. Une partie des travaux est réalisée dans le cadre de recherches doctorales co-dirigées avec le LPGN de l’Université de Nantes. Ces recherches sont basées en grande partie sur l’expertise du LBCM et sa capacité à déterminer les teneurs en métaux traces et métalloïdes associées aux différentes phases constitutives d’un hydrosystème incluant le milieu marin à des niveaux proches des « backgrounds » géochimiques. Les travaux du LBCM s’appuient sur 4 campagnes de prélèvements qui permettent de fournir les échantillons environnementaux indispensables à la caractérisation de la zone d’étude, à l’évaluation de la contamination anthropique et à l’étude du fonctionnement biogéochimique de l’estuaire depuis la zone de faible salinité jusqu’aux limites du grand estuaire. Afin de considérer les effets des variations saisonnières sur les conditions environnementales, il est nécessaire de reproduire ces prélèvements au cours des différentes phases du cycle hydrologique de l’estuaire. Les résultats de ces travaux permettront à terme de (i) élaborer un bilan de la contamination de l’estuaire (ii) définir et mettre en place des traceurs pour le suivi des sources anthropiques de contamination (iii) identifier les processus biogéochimiques clés qui gouvernent le fonctionnement de l’estuaire. Le bilan de la contamination de la Loire se construit au fil des campagnes et la 4ème campagne (CAMELIA 4, 30 sept. - 09 oct. 2015) va permettre de clore ce volet. Les échantillons collectés sont actuellement en cours d’analyse au LBCM ainsi que chez nos partenaires en charge de travaux complémentaires (LER MPL pour les sels nutritifs, EPOC/ECOBIO pour les analyses C/N et Subatech pour certains radionucléides). Les résultats obtenus viendront compléter le bilan de la contamination de l’estuaire ainsi que le schéma de distribution des contaminants. Une première interprétation des résultats permet de constater l’évolution de la contamination par les éléments traces métalliques (Fig 9). L’utilisation de certains contaminants en tant que traceurs anthropiques a déjà permis de mettre en évidence la relation entre la modification des niveaux de contamination dans le milieu, l’évolution des sources (industrielles vers urbaines/agricoles) et les conséquences de l'évolution des réglementations, comme l’interdiction de l’utilisation d’additifs au Pb dans les carburants au début des années 2000. Le laboratoire s’attache aujourd’hui à développer cette approche en s’intéressant à d’autres contaminants comme le Cu ou encore l’Ag. L’utilisation de l’Ag comme traceur en milieu estuarien à fait l’objet de premiers travaux réalisés dans le cadre d’un stage de Master 2 co-financé par le Labex COTE (J. Hervault, 21-01 au 24-06-2015). Le projet RS2E arrive maintenant dans sa dernière phase. En 2016, le LBCM se focalisera sur son dernier objectif axé sur l’étude des processus biogéochimiques qui contrôlent les transferts des contaminants métalliques au sein des différents compartiments de l’estuaire.


Figure 9 : Bilan de la contamination de l’estuaire de la Loire (colloque CNFC, 11-12 juin 2015, Talence). 2.3.1.2. Caractérisation et hiérarchisation des sources de contamination par le cuivre (Cu) de l’estuaire de la Loire ErCuLe (Etude des rejets du Cuivre en Loire) ErCule (2014-2015) est une étude exploratoire issue d’un co-financement « Politique de site » Ifremer et de l’ « AO interne » de l’OSUNA impliquant les équipes IFREMER BE/LBCM et REM/GM ainsi que les partenaires OSUNA. Il vise à caractériser et hiérarchiser les sources de contamination par le cuivre (Cu) de l’estuaire de la Loire. Il propose notamment de i) développer une méthodologie adaptée à l’analyse de δ65Cu pour des échantillons environnementaux et ii) évaluer l’utilisation des signatures isotopiques du Cu comme traceur de la contamination depuis les termes sources (apports agricoles, industriels et urbains) jusqu’aux cibles (organismes marins) (Fig 10). Cette étude exploratoire a permis de démontrer tout l’intérêt de cette approche et de développer un partenariat afin de poursuivre cette thématique dans le cadre du programme régional PolluSols. Ce nouveau volet examinera le terme transfert du Cu au sein des différents compartiments de l’estuaire de la Loire (eau et matières en suspension), puis vers les maillons du réseau trophique qu’il abrite (terme effets).


Figure 10 : Application de l’analyse isotopique du Cu à différents types d’échantillons de l’estuaire de la Loire.

2.3.1.3. Echanges biogéochimique de mercure à l’interface océan/atmosphère : Action GMOS Le programme GMOS (Global Mercury Observation System) est un programme de 5 ans financé jusque fin 2015 dans le cadre du 7e PCRD dont le coordinateur est N. Pirrone (CNR-IIA, Italie). GMOS est la contribution majeure de l’UE à la GEO Task HE-02-C1 ''Tracking Pollutants''. Ce programme vise à établir un modèle de premier système global d’observation du mercure atmosphérique. Les stations au sol réparties sur la surface du globe et les mesures par avion sont complétées par des mesures de la colonne d’eau, vu l’importance des échanges de mercure à l’interface océan/atmosphère (Fig 11). Dans le cadre de ce programme, l’accès aux moyens d’investigation du milieu marin sur lesquels nous avons mis l’accent a été subordonné à la fourniture de mesures atmosphériques et de précipitation. Pendant GMOS, le LBCM, en partenariat étroit avec le LER/PAC, a mis en oeuvre une station à La Seyne sur Mer et a participé à des campagnes océanographiques sur des N/O italiens. Les résultats sont la fourniture, en temps réel grâce à l’infrastructure de données de GMOS et l’utilisation d’appareils standardisés, de données horaires de concentration en Hg élémentaire gazeux à La Seyne. Celles-ci sont archivées et traitées au CNR afin d’être intégrées à celles du réseau des autres stations mondiales. Une première série de données a été publiée (Marusczak et al., sous presse) et d’autres sont en cours de publication (Knoery et al., in prep.).

Premiers résultats

(Signatures isotopiques – application à des échantillons environnementaux)

Fractionnement

sources,

physiologie?

δ65Cu = un nouveau traceur isotopique?⇒ Evolution des sources/voies d’exposition

/mécanismes bioaccumulation

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Cu

Huîtres ( Baie de Bourgneuf) Moules (Pointe Chemoulin) Sols viticoles

δ65Cu : application à différentes matrices de l’estuaire de la Loire

Premiers résultats

(Signatures isotopiques – application à des échantillons environnementaux)

Fractionnement

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physiologie?

δ65Cu = un nouveau traceur isotopique?⇒ Evolution des sources/voies d’exposition

/mécanismes bioaccumulation

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δ65Cu : application à différentes matrices de l’estuaire de la Loire


Figure 11 : Variation horaire des teneurs en mercure atmosphérique gazeux à la station Ifremer de La Seyne sur Mer. L’influence des saisons est apparente sur le niveau moyen et sur l’ampleur des variations, indiquant la

contribution de sources de mercure anthropiques locales et régionales.

2.3.2. Axe 2 : Devenir des contaminants à l’échelle de l’individu et effets biologiques sur le cycle de vie des organismes

2.3.2.1. Action GERMON : Comme cité précédemment pour les activités du LBCO (2.2.2.2), le LBCM et le LBCO ont contribué en 2014-2015 au projet GERMON (GEnetic stRucture and Migration Of albacore tuNa / Structure génétique et migration du thon germon) dans le but d’étudier la contamination des prédateurs supérieurs vivant en zone hauturière. L’action du LBCM s’est inscrite dans le cadre du « Étude préliminaire de la structure du germon en fonction de son habitat » de ce projet. Elle avait comme objectif de : i) de déterminer les niveaux et profils de contamination en certains contaminants organiques et métalliques chez des individus de thon germon capturés dans différentes zones et/ou à différentes saisons (i.e., les différents lots exploitant différents réseaux trophiques présentent-ils des profils de contamination différents ?) ; ii) d’étudier la possibilité d’utiliser ces contaminants comme traceurs chimiques des populations et/ou des différents habitats utilisés par le thon germon dans l’Océan Indien. Pour cela, des échantillons de muscle de 451 individus (mâles et femelles) prélevés sur trois zones (La Réunion, les Seychelles et l’Afrique du Sud) et au cours de deux saisons (La Réunion et Afrique du Sud) et/ou années (Seychelles) ont été analysés part ICP-MS. L’étude a permis de mettre en évidence des différences significatives de niveaux (ETM considérés séparément) et de profils de contamination (ETM considérés ensemble) entre les individus capturés dans les différentes zones (La Réunion, les Seychelles et l’Afrique du Sud). Au sein d’une même zone, des différences entre saisons ont également pu être observées, en revanche les différences entre sexes se sont révélées peu significatives. D’une façon générale et au regard des objectifs du projet, l’ensemble de résultats obtenus pour les ETM a donc montré une bonne discrimination par ces traceurs chimiques des individus capturés à l’île de la Réunion et aux Seychelles d’une part, et en Afrique du Sud d’autre part, suggérant des flux d’individus très limités entre le sud-ouest de l’Océan Indien et le sud de l’Atlantique (Fig. 12); du moins, à l’échelle de temps d’intégration représentée par l’étude de la bioaccumulation des ETM dans le muscle de thon. Par ailleurs, la plupart des individus analysés présentaient des teneurs en ETM inférieurs au seuil sanitaire autorisé pour le Hg, le Pb et le Cd (métaux non


essentiels et présentant de ce fait un risque de toxicité), exceptés pour le Cd en Afrique du Sud où environ 34% des individus montraient tout de même des teneurs supérieures aux normes sanitaires. Ces résultats concernant les ETM ont également été mis en relation avec les paramètres biométriques et l’écologie trophique (contenus stomacaux, traceurs trophiques/isotopie C et N) des thons analysés, et sont en accord avec les résultats concernant les contaminants organiques. L'ensemble de ces résultats a fait l’objet d’un rapport (Nikolic et al. 2015). La valorisation de ces travaux sous forme de publication entre les différents partenaires est actuellement en cours.

Fig. 12 : Résultats de l’analyse en composantes principales effectuée sur les individus de thons germon prélevés sur trois zones, au cours de deux saisons et/ou années, et analysés pour leurs teneurs dans le muscle en mercure

(Hg), cadmium (Cd), plomb (Pb), Cuivre (Cu), zinc (Zn), nickel (Ni) et chrome (Cr) dans le cadre du projet GERMON.

2.3.2.2. Transfert des CONtaminants métalliques dans les réseaux TROphiques de l’estuaire de la Loire : action CONTROL (AO interne OSUNA ) Ce projet a été réalisé en collaboration avec le partenaire MMS (Mer, Molécules, Santé) de l’Osuna. Il a été financé par un appel d’offre interne 2014 de l’Osuna et les résultats ont été restitués en 2015. Dans le prolongement logique du projet RS2E-Osuna (2012-2016) dans lequel le LBCM était impliqué pour l’étude du comportement biogéochimique de certains éléments traces métalliques (ETM) en estuaire de la Loire, ce projet s’est intéressé au transfert de ces ETM dans quelques compartiments clefs des réseaux trophiques de la Loire. Une dizaine d’espèces (incluant poissons, crustacés et mollusques bivalves) ont ainsi été analysées pour leurs ratios en isotopes stables du carbone (C) et de l’azote (N) dans le muscle (en tant que traceurs trophiques), leurs teneurs en ETM dans différents tissus et leurs concentrations en métallothionéines (biomarqueurs d’exposition aux ETM) dans les organes de détoxification. En estuaire de la Loire, jusqu’à présent bien moins étudié que d’autres grands estuaires français tels que la Seine ou la Gironde, cette étude a permis de mettre en évidence que les isotopes stables C et N constituaient des paramètres auxiliaires puissants et indispensables pour inférer l’origine de la matière organique soutenant les différentes espèces du réseau trophique, leur dépendance vis-à-vis de l’estuaire, leur niveau trophique, et ainsi appréhender et comprendre la contamination métallique et ses effets sur les différentes espèces (aux


capacités de bioaccumulation différentes) du réseau trophique ligérien. Par ailleurs, les résultats de ce projet et les échantillons déjà caractérisés sont tout à fait en lien et serviront d’autres projets récemment commencés au sein de l’unité, à savoir les projets CONTABEL et Pollusols.

2.3.3. Axe 3 : Observation et risque chimique

2.3.3.1. Développement méthodologique et prospective scientifique

2.3.3.1.a. Action Développement des systèmes d’échantillonnage passif Le LBCM a poursuivi ses travaux autour de l’utilisation des systèmes d’échantillonnage passif pour la période 2013-2015 soutenus par Aquaref. En effet, les possibilités d'utilisation de ces outils innovants pour l'évaluation de la contamination chimique des eaux ont été testées par l'unité BE depuis 2006. Par la suite, dans le cadre d'une utilisation potentielle dans le cadre de la DCE, l'opérationnalité de ces systèmes a été évaluée à "grande échelle", dans différents environnements (mer ouverte, lagons, étangs, marinas, zones portuaires, récifs...) et dans différentes conditions de terrain, notamment en terme de facilité de mise en œuvre par du personnel préalablement formé. L'évaluation des trois types d'échantillonneurs passifs (DGT pour les métaux traces, SBSE pour les composés organiques hydrophobes, POCIS pour les composés organiques hydrophiles), a été réalisée dans le cadre de différents projets soutenus par des organismes publics (Agences de l'eau , DEAL's, Onema, Aquaref). Parallèlement à cette utilisation "standard", l'automatisation et la "marinisation" de certaines de ces techniques ont permis des développements technologiques originaux : la station benthique FRAME (Fig 13) (permettant d'évaluer l'influence d’événements météorologiques violents sur la contamination du milieu) ainsi que les modules automatisés SBSE. En 2015, le LBCM a notamment contribué à la validation de ces dispositifs en comparant les mesures par échantillonnage passif aux données disponibles pour les matrices environnementales habituellement utilisés par les programmes de surveillance (eaux et biote) dans le cadre de plusieurs actions impulsées par Aquaref et les Agences de l’eau. Le laboratoire a notamment poursuivit l'application des techniques d'EP dans le cadre de la surveillance chimique des eaux littorales des DOM (La Réunion, Mayotte, Guyane, Martinique). Ces travaux alimentent la réflexion engagée au sein d’un groupe de travail Aquaref pour l’applicabilité de ces outils à la DCE/DCSMM ainsi que leur transfert vers les opérateurs de la surveillance (action 2013-2015 Aquaref/ONEMA, groupe d’experts « transferts des techniques EP dans le cadre de la DCE) . Enfin, le laboratoire développe actuellement de nouveaux outils basés sur l’automatisation de la technique SBSE afin de considérer de nouvelles substances comme les composés du tributylétain et du mercure (Gonzalez et al, 2015 Rapport d'avancement).


Figure 13 : Application et développements de systèmes automatisés portables permettant d'échantillonner et de concentrer in situ (par les techniques SBSE et DGT) dans différents milieux aquatiques,

les contaminants organiques et métalliques. 2.3.3.1.b. Développement d’un système analytique automatisé permettant une mesure précise, rapide et sensible sur site de trois métaux toxiques réglementaires : Lab on ship (ANR 14-CE04-0004) Le projet « Lab on ship » co-financé par l’ANR (2015-2019) implique un consortium composé du LCE (U. Aix-Marseille), du MAPIEM (U. Toulon) et du LBCM (Ifremer). Il a pour objectif le développement d’un système analytique automatisé permettant une mesure précise, rapide et sensible sur site de trois métaux toxiques réglementaires (cadmium, mercure et plomb) à l’aide d’un dispositif facilement transportable. Plus précisément, ce dispositif sera développé sous la forme d’un système « lab-on-valve », permettant la quantification des 3 métaux de manière séquentielle (Fig 14). Le défi primordial est de répondre aux besoins en sélectivité et sensibilité requis pour l’analyse des métaux traces dans l’environnement afin de répondre aux attentes des politiques de gestion du milieu marin (DCE et DCSMM). Pour ce faire, le système d’analyse sera basé sur une étape d’extraction des métaux sur une phase solide sélective (SPE), suivie d’une détection de chaque métal par absorptiométrie ou fluorescence après dérivation à l’aide d’un réactif spécifiquement formulé pour chacun. Le système lab-on-valve devra donc intégrer différents modules pour le pré-traitement de l’échantillon (photo-oxydation), la préconcentration des métaux cibles, la dérivation de ces métaux et la détection des complexes métalliques formés. Le système sera conçu en partie à l’aide d’outils de prototypage rapide par impression 3D. La première année du projet a été consacrée au choix des composants du système automatisé, ainsi qu’à la sélection des ligands et des voies de synthèse pour l’élaboration des matériaux à empreintes ioniques. La prochaine phase du projet s’attachera à la synthèse et à l’étude des performances des matériaux pour l’extraction des métaux ciblés.

Figure14 : Schéma du dispositif « lab-on-valve » envisagé (http://lce.univ-amu.fr/lab-on-ship/).


2.3.3.1.c. Réseau d’Observation de la Contamination Chimique (ROCCH)

Le LBCM contribue à l’effort de surveillance dans le cadre de sa participation aux travaux du projet ROCCH (Réseau d’Observation de la Contamination Chimique : http://envlit.ifremer.fr/). Pour y parvenir, le LBCM a formalisé ses procédures et sa maîtrise technique a été formellement reconnue sous la forme d’une accréditation de ses activités analytiques par le COFRAC (analyses des métaux dans les sédiments et les organismes marins par ICP-MS, accréditation N°1-2392 – portée et annexe technique disponible sur www.cofrac.fr) et d’un agrément de la DGAL pour la recherche des métaux lourds réglementés dans les coquillages (classement des zones de production conchylicole). Cette reconnaissance est unique pour un laboratoire de recherche sur l’environnement marin, démontrant la capacité technique du LBCM. En 2015, le laboratoire a traité plus de 300 échantillons (biote et sédiments) suivant 4 méthodes différentes dans le cadre de son accréditation, principalement pour les réseaux de surveillance ROCCH (environnement et sanitaire) et RINBIO .

2.3.4. Contribution de l’unité BE au système d’assurance qualité de l’Ifremer L’unité BE est titulaire d’une accréditation par le COFRAC pour l’ensemble des travaux opérés pour le Réseau d’Observation de la Contamination Chimique du milieu marin (accréditation N°1-2392 – portée et annexe technique disponible sur www.cofrac.fr. L’unité dispose également d’un agrément de la part de la DGAL pour la recherche des métaux lourds réglementés dans les coquillages (classement des zones de production conchylicole).

En 2015, l’unité BE a été évaluée par le COFRAC afin de renouveler son accréditation en portée flexible étendue pour un nouveau cycle. L’unité est également impliquée dans la démarche ISO 9001 de l’Institut et contribue au groupe de travail chargé de la convergence des systèmes qualité ISO 9001 et 17025. Le système qualité de l’unité est d’ailleurs actuellement en pleine évolution afin de permettre la convergence des deux systèmes.

2.4 Recherche et coordination d’actions scientifiques en biogéochimie des contaminants en Méditerranée. Une action spécifique de recherche et coordination de programmes nationaux et internationaux sur les pressions et impacts chimiques en Méditerranée est ménée par Jacek Tronczynski.

2.4.1. Projet Européen PERSEUS FP7

Dans le cadre du projet européen FP7 « PERSEUS - Policy-oriented marine Environmental Research in the Southern EUropean Seas – SES » les études des impacts de la pollution sur les écosystèmes côtiers de SES ont été conduites sur les 18 zones pilotes en Méditerranée et la mer Noire (Fig 15).


Figure 15 : Stations d’échantillonnage en Méditerranée, Adriatic et Mer de Marama.

Ces activités coordonnées par Ifremer incluent l’étude de la pollution chimique. Cette dernière action a été organisée autour des activités suivantes :

• Etude sur les relations entre les pressions chimiques et leurs impacts : - « Points sensibles – hot spots » urbains et modélisation de la dispersion des contaminants - Impacts de contaminants sur les communautés benthiques - toxicité des sédiments marins ;

• Etude de la bioaccumulation et bioamplification de contaminants dans les réseaux trophiques pélagiques et côtiers :

• Cartographie des niveaux des contaminants • Bioamplification des contaminants dans des réseaux trophiques courts.

Une description complète des thématiques abordées et des résultats obtenus ont été présentés à la Commission Européenne dans le rapport final « Impact of pollution on coastal ecosystems in the SES » et dans un document d’orientation des politiques environnementales « Policy

briefs» ainsi qu’à la conférence scientifique du projet.


2.4.2. Programme national MERMEX /Chantier Mistral - Mediterranean Integrated Studies at Regional And Local Scales

La première phase du projet MERMEX se termine avec un rapport de synthèse en cours de conclusion et un atelier de restitution organisé en avril 2015. Cette première phase du projet a démarrée en 2010 avec une revue scientifique publiée dans Progress in Oceanography intitulée “Marine ecosystems’ responses to climatic and anthropogenic forcings in the Mediterranean”. Notre implication dans la première phase de MERMEX était caractérisée par une contribution dans le projet ANR/COSTAS (avec des équipes LBCO/LBCM) suivant deux actions du programme : i) Interactions between the biogeochemistry and the food web et ii) Interactions between the continent and the ocean and their impact on marine ecosystems.

Le document de cadrage de prospective 2016-2020 de l’axe MERMEX-côtier – met en avant la thématique de la contamination chimique des écosystèmes marins en Méditerranée, dans une approche effectivement pluridisciplinaire (impliquant des équipes de biologistes, physiciens et chimistes marins) dans le cadre du projet désormais intitulé MERITE « Marine Ecosystem Response to the Input of Contaminants in the Coastal Zone” Trois actions proposées dans ce cadre impliquent des équipes de l’Institut (RBE/BE, ODE/LERPAC, ODE/DHYSED et RBE/MARBEC): i) urbanized /anthropized bays – hot spots ii) fishing grounds in the NW Med. Sea. iii) from river particles deposit area to canyons and open sea.

Ces actions recouvrent une caractérisation des zones de pêche en Méditerranée occidentale en termes d'environnements trophiques, d'habitats et de contamination des chaînes trophiques. Le projet fournit aussi des bases scientifiques pour le développement des indicateurs du bon état écologique qui prennent en compte le fonctionnement des écosystèmes en utilisant les critères et indicateurs de la DCSMM. Cette action côtière de MERMEX contribuera à consolider les partenariats existant en Méditerranée dans le domaine de l'océanographie côtière (Ifremer/IRD/INSU/CNRS…). Le projet offre également l’opportunité de valoriser les acquis et l'expertise de l’Ifremer dans le domaine de la caractérisation des pressions et impacts anthropiques dans le Golfe du Lion, de l'observation de la mer côtière en s'inscrivant dans la perspective du développement d'observatoires intégrés et enfin de la modélisation couplée hydrodynamique - hydrosédimentaire - biogéochimie. 2.5 Cellule d’Analyse du Risque Chimique (ARC)

La cellule ARC intervient dans l’axe 3 du projet d’unité BE et mène une activité d’expertise. Le périmètre d’action de la cellule Arc est défini selon deux actions. Action1) Soutien Institutionnel » regroupant les travaux réalisés dans le cadre de financements publics tels que les fiches actions Aquaref ou Onema et action 2) « Etudes du risque chimique en milieu marin » regroupant les différentes analyses de risque chimique en milieu marin réalisées pour le compte d’industries privées ou des instances gouvernementales ministère.


2.5.1. Action 1 : Soutien Institutionnel

2.5.1.1. Méthodologie et construction de valeurs de référence pour les substances chimiques vis-à-vis des risques pour les écosystèmes

La Directive Cadre sur l’Eau (DCE, 2000/60/CE) impose aux Etats membres l’atteinte, d’ici 2015, du « bon état chimique et écologique » des eaux (eaux de surface, eaux littorales et eaux souterraines). Pour cela, la DCE demande l’établissement de NQE pour les substances polluantes prioritaires au niveau européen mais aussi national. Une NQE correspond à la concentration seuil d’un polluant (ou groupe de polluants) à ne pas dépasser dans l’eau, les sédiments et le biote afin de protéger l’environnement et la santé humaine (par la consommation de produits de la pêche ou d’eau de boisson). Dans le cadre de cette action en lien avec l’Onema, la Cellule Arc a été chargée de : poursuivre son action d’élaboration de VGE NQE ainsi que l’amélioration des VGE existantes. Une fois validées ces valeurs sont publiées sur le Portail Substances Chimiques de l’Ineris. Il s’agit ici d’une action pérenne de la cellule ARC.

2.5.1.2. Détermination de Valeur Guide Environnementales (VGE) mollusques alternatives aux Normes de Qualité Environnementales (NQE) définies dans l’eau

Dans le contexte de la mise en œuvre de la DCE, l'établissement de relations entre l'eau et les mollusques comme supports d'analyses pour les substances prioritaires est un enjeu particulièrement important, notamment en regard de l'objectif de vérification de la conformité des résultats de la surveillance vis-à-vis de normes de qualités environnementale (i.e. qualification de l'état au sens DCE). Ceci est particulièrement vrai pour les substances hydrophobes qui sont difficilement quantifiables dans l'eau, mais également pour les métaux traces au niveau des eaux littorales. Dans ce cas, les propriétés intégratrices des mollusques (bioconcentration, bioaccumulation et bioamplification) peuvent être utilisées pour inférer des concentrations dans l'eau pour ces substances.

L’étude conduite en 2015 a pour objectif d’évaluer d’une manière pragmatique des facteurs de bioconcentration (BCF) eau-mollusque et par extension de proposer des VGE mollusques à partir des NQE eau pour 25 substances (23 composés organiques et 2 métaux) de la DCE identifiées comme hydrophobes et bioaccumulables. Cela se traduit dans un premier temps par un état de l’existant sur les données acquises dans l’eau (résultats de la recherche ; synthèse bibliographique) et les données du ROCCH (données sur les mollusques moules et huîtres) et dans un second temps par la mise en perspective des 2 séries de données pour évaluer des BCF opérationnels et des NQE mollusques. La cellule ARC accueille depuis mai 2015 Alizée Sire, Ingénieur CDD, qui contribue à cette étude.

Dans un premier temps, un bilan des connaissances sur les relations existantes entre les concentrations en contaminants dans l’eau et dans les mollusques (moules) sur les côtes françaises métropolitaines permettant ainsi de faire le point sur les facteurs de conversions qui seront utilisés pour le passage des NQE eau aux VGE mollusques : facteur de bioconcentration (BCF) et facteur de bioaccumulation (BAF). Un point méthodologique permet de préciser les différentes modalités d’acquisition de ces facteurs, notamment le recours aux données mesurées sur le terrain, aux protocoles expérimentaux suivant des normes spécifiques, à la modélisation ou aux modèles mathématiques Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR). Dans un second temps, une déclinaison pratique de cet aspect méthodologique est réalisée pour les 25 substances sélectionnées, ce qui permet déterminer des valeurs de BAF et de BCF fiables. La dernière partie de cette étude permet de lister et de comparer les résultats de BAF et de BCF obtenus suivant les différentes méthodes employées. A l’issue de cette étude, 23 substances disposent d’au moins une valeur de BAF ou de BCF : 6 substances possèdent un BAF terrain, 4 substances disposent de valeurs de BCF expérimentaux et 20 substances disposent de BCF calculés par les QSAR. La détermination de


VGE mollusques a donc été possible pour ces 23 substances chimiques. Sur la base du travail réalisé, aucune donnée n’est disponible pour le DEHP et la cyperméthrine, pour les pesticides cyclodiennes aucune valeur n’a été déterminée pour 2 des 4 substances (aldrine et isodrine).

De cette étude il ressort deux aspects importants : l’absence de méthodologie définie pour la détermination de BAF et le faible nombre de données disponibles permettant de rapprocher les données de concentrations des contaminants dans l’eau et dans les moules.

Rapport : Détermination de Valeur Guide Environnementales (VGE) mollusques alternatives aux Normes de Qualité Environnementales (NQE) définies dans l’eau. Référence : RBE/BE-ARC-16.01 – en cours de validation

2.5.1.3. Sensibilité des organismes marins La Directive Cadre sur l’Eau (DCE) 2000/60/CE préconise l’établissement de Normes de Qualités Environnementales (NQE). Ces NQE sont calculées à partir de données d’écotoxicité issues d’essais réalisés en laboratoire sur lesquelles un facteur d’extrapolation (ou d’incertitude) est appliqué. Un facteur d’extrapolation additionnel est notamment appliqué par défaut en l’absence d’un jeu de donnée d’écotoxicité sur espèces marines suffisant pour couvrir la sous-représentation des espèces marines (EM) par rapport aux espèces d’eau douce (ED). En 2015 un travail de réflexion sur la sensibilité des organismes marins et plus particulièrement sur la pertinence du facteur d’incertitude appliqué par défaut a été mené selon deux axes : 1/ quels résultats d’essais sur ces groupes taxonomiques additionnels marins peuvent être utilisés pour la détermination des normes de qualité pour le milieu marin et comment évaluer leur validité et 2/ évaluer s’il existe une réelle différence de sensibilité entre les espèces marines et dulçaquicoles. Les recherches effectuées ont permis pour 1/ d’identifier plusieurs lignes directrices encadrant des bio-essais sur des espèces appartenant à ces taxons additionnels marins. Les critères à respecter pour qu’un essai soit considéré comme valide ont donc pu être identifiés. Et pour 2/ de définir une tendance générale concernant les différences de sensibilités des organismes marins vs d’eau douce vis-à-vis des substances chimiques. Hélène Leca, stagiaire master 2 présente de mars à aout 2015 à la cellule ARC, a contribuée à ce travail.

2.5.1.4. Contribution à la priorisation des substances et à la prise en compte des données chimiques du milieu marin dans les exercices de priorisation L’Ifremer et l’Ineris suivent les travaux de plusieurs groupes impliqués dans la priorisation des substances émergentes (ex. Comité d’Expert Priorisation (CEP, national), NORMAN (Européen)). De façon complémentaire, dans le cadre de la contribution à la priorisation des substances, il avait été identifié la nécessité de prendre en compte les données des contaminants chimiques acquises en milieu marin dans les exercices de priorisation menées par le réseau Norman au niveau Européen et l’Ineris en lien avec le CEP (Comité Expert Priorisation) au niveau Français. La méthodologie de priorisation des substances émergentes définie est appliquée aux données bancarisées dans une base de données européenne (Empodat). En 2015, sur la base des paramètres intéressants Empodat (740 numéros CAS), les données bancarisées dans Quadrige² (données qualifiées à bon ou non qualifiées) pour les matrices eau et biote ont été extraites (174 numéros CAS concernés) et transmises au format demandé pour leur intégration dans la base de Empodat.

Une seconde action, de transfert des données bancarisées dans Quadrige² vers le Portail des Substances Chimiques, géré par l’Ineris avait été identifiée. Cette action vise à faciliter l’accès aux données des contaminants chimiques sur les eaux littorales et à permettre de fournir une visibilité sur les données existantes par substance sur les données acquises dans les différentes


matrices. En 2015, la demande initiale de l’Ineris a été revue, ainsi les éléments proposés par Ifremer n’ont pas été retenus. Ainsi, pour répondre à la nouvelle demande de l’Ineris, un travail sera à poursuivre en 2016. Quelques pistes ont été proposées visant à faire mieux connaître et de façon réciproque les sites internet du PSC de l’Ineris (site de référence Français sur les informations sur les substances chimiques) et SURVAL site de mise à disposition de données de la surveillance accessible depuis le site Envlit de l’Ifremer.

2.5.1.5. Expertise susbtances danageureus dans le cadre de la convention Ospar La Cellule Arc assure le suivi des travaux en lien avec la thématique substances dangereuses traitée dans le cadre du Comité HASEC « Hazardous Substances and Eutrophication Committee » d’Ospar. La Cellule participe également à « l’Informal Group of Experts » (sous groupe du comité HASEC, chargé de la sélection/désélection des substances prioritaires Ospar). Ce suivi est réalisé dans le cadre du Programme 181 d'appui aux pouvoirs publics (MEDDE). En 2015, la réunion annuelle du comité HASEC présidée par M. Reinier Goud (Pays Bas) s’est tenue à Amsterdam aux Pays-Bas du 23 au 27 mars 2015 . Lors du travail préparatoire à cette réunion, une feuille de route présentant la position française a été rédigée par le MEDDE (experts-DEB/LM-DGPR) en collaboration avec les experts français en charges des nombreuses thématiques abordées lors de cette semaine de réunion telles que : la surveillance du milieu marin et l’eutrophisation suivis par l’Ifremer, les substances dangereuses par l’Ineris (M. DALLET). Que ce soit au niveau de l’Ineris ou de l’Ifremer, la cellule ARC assure le transfert d’information en lien avec cette thématique substance dangereuse d’OSPAR. Une note relatant les faits marquants 2015 en lien avec la thématique substance dangereuse dans le cadre du comité HASEC d’OSPAR a également été rédigée. En complément d’information et pour rappel, une note de présentation des substances prioritaires d’OSPAR avec notamment la présentation des différentes listes existantes, du mode de sélection/désélection des substances, des mesures appliquées, des travaux en cours ou à venir a été mise en annexe de ce document.

2.5.1.6. AQUAREF 2.5.1.6.a. Guide prélèvement en milieu marin

Pour 2015, la cellule ARC avait en charge une fiche action Aquaref intitulée : « guide prélèvement en milieu marin ». Cette fiche a été proposée en réponse à une forte demande d’Aquaref. Elle consiste en une adaptation au format Aquaref des guides méthodologiques existant pour le milieu marin, élaboré par Ifremer, notamment pour 2015 le guide de prélèvement en milieu marin. Dans le cadre de la surveillance chimique du milieu marin (OSPAR, Barcelone, RNO, ROCCH, DCE...) l'Ifremer a acquis une longue expérience du prélèvement destiné à l'analyse de contaminants à l'état de traces. Des protocoles et documents de prescription ont été élaborés pour les matrices "eau, sédiment, biote". Ce guide technique basé sur les documents existants a été complété, remis à jour notamment sur la base des documents OSPAR et sur la base des attendus de document Aquaref. 2.5.1.6.b. Plan POLMAR

Les plans POLMAR constituent des plans d’intervention en cas de pollution accidentelle des milieux marins, permettant la mobilisation et la coordination des moyens de lutte préalablement identifiées. Le plan POLMAR/MER est confié aux préfets maritimes ; le plan POLMAR/TERRE sur la frange côtière, est confié aux préfets des départements concernés, qui en assurent la mise en œuvre, sous l’autorité du Ministre de l’Intérieur. La préparation matérielle du plan, c’est-à-dire la mise en place des moyens techniques et financiers ainsi que


la qualification du personnel, en ce qui le concerne, est du ressort du Ministère de l’Equipement, des Transports et du Logement.

La DDTM (Direction du Transport Maritime, des Ports et du Littoral), a pour mission d’organiser les moyens de lutte contre ces pollutions et de développer des actions de prévention en ce qui concerne le plan POMAR –Terre (extrait de : http://www.polmar.com/).

En 2015, l’ARC a été contacté via le LER/Normandie par la DDTM de Seine-Maritime pour contribuer à la révision du plan POLMAR de Seine Maritime élaboré en 2005 concernant l’annexe 11- Gestion des pêches et salubrité des zones de production Marine.

Le document revu a été transmis : Etat des lieux et suivi environnemental en milieu marin et sanitaire.

Prélèvement et analyse de mollusques bivalves vivants pour état initial et suivi des contaminants chimiques (ref : Ifremer-15.11- I Amouroux et JF Chiffoleau - Protocole prélèvement analyses moules – plan Polmar Seine Normandie. 13/10/2015 – 4 p.)

2.5.1.6.c. Etude microplastiques en tant que support de contaminants chimiques L’étude bibliographique menée en 2015 par Léa Roclin, dans le cadre de son stage de Master 2 (6 mois), réalise un bilan des connaissances actuelles sur les microplastiques comme support de contaminants chimiques dans le milieu marin. 121 documents ont été pris en compte dans ce rapport dont 53 sur la thématique « microplastiques, contaminants et milieu marin ». Les capacités d’adsorption/désorption des contaminants sur les microplastiques dépendent du contaminant, du support microplastique, et de facteurs externes (salinité, matière organique et interaction avec les autres contaminants). Quelle que soit la matrice échantillonnée (eau et sable) et la zone géographique considérée, les résultats mettent en évidence la présence de contaminants chimiques sur les microplastiques, que ce soit des polluants organiques persistants (POP) présent dans l’eau (PCB, HAP, pesticides) ou des additifs du plastique (PBDE, bisphénol A, alkylphénols). Une grande variabilité des concentrations est observée en fonction des lieux, des supports et entre chaque microplastique. Les différentes méthodes d’acquisition des données ne permettent pas la comparaison des études entre elles. Au niveau des organismes, la désorption des contaminants sur les microplastiques est favorisée en présence d’agents tensioactifs. Il a ainsi été démontré qu’une fois ingérés, les microplastiques peuvent transférer certains contaminants aux organismes. L’exposition de poissons à des microplastiques avec du pyrène, présente des effets différents par rapport aux poissons exposés au pyrène seul. Les microplastiques concentrent les polluants, les transportent et augmentent leur persistance dans l’environnement marin. Ils augmentent l’exposition des organismes aux contaminants chimiques et modifient leur risque de contamination et les effets des contaminants. Le rôle des microplastiques dans la charge totale en contaminants dans les organismes marins n’est pas encore bien défini, la difficulté étant de savoir si ces contaminants viennent de l’environnement ou des microplastiques. L’accumulation et la bioamplification des contaminants dans les organismes via les microplastiques restent à étudier.

Un bilan des différents projets d’études au sein d’Ifremer et de l’INERIS a été fait. Si l’Ifremer compte plusieurs projets d’étude, et le pilotage du descripteur 10 sur la thématique déchets marins incluant la thématique microplastique de la DCSMM (François Galgani - Ifremer /LER/PAC)), l’INERIS n’a pas d’étude ni de projet d’étude en cours.

2.5.2. Action 2 : Analyse du risque chimique en milieu marin

2.5.2.1. Expertise VALE Nouvelle-Calédonie (NC)

VALE (NC), anciennement Goro Nickel est une entreprise d’extraction de minerai et de production de nickel et de cobalt, située dans le sud de la Nouvelle-Calédonie.


En 2013, suite à la découverte de la rupture accidentelle de l’émissaire en mer de l’usine VALE NC, une mission d’expertise Ifremer (cellule ARC) – Ineris sur les conséquences environnementales potentielles avait été conduite en urgence fin novembre 2013, donnant lieu à un rapport d’expertise Ineris-Ifremer. A la suite de cette mission et des recommandations préconisées (rapport Ineris-Ifremer), une étude plus approfondie a été demandée et financée par VALE NC portant sur ‘l’optimisation du plan de surveillance du milieu marin d’un opérateur industriel / minier / portuaire VALE Nouvelle Calédonie, par retour d’expérience de 5 années de suivi d’un plan de suivi réalisé dans un cadre réglementaire et conventionnelle» [10]. L’INERIS a sollicité l’Ifremer et la cellule ARC pour fournir des avis techniques en vue de l’optimisation de cette surveillance. Ce travail a été réalisé dans le cadre d’un contrat de sous-traitance. L’Ifremer est intervenu sur les aspects techniques concernant les paramètres chimiques, physico-chimiques, la bancarisation et le traitement des données. Cette étude s’est traduite par l’élaboration d’avis techniques et s’est déroulée avec le concours de nombreux experts Ifremer de la surveillance hydrologique, chimique, des contaminants métalliques et organiques, de la Nouvelle Calédonie, de la bancarisation et du traitement de données : ROCCH, LBCM, LBCO, DYNECO Pelagos, VIGIES, Quadrige², LEAD.

Sur la base de l’étude des documents et des données fournies par l’INERIS, cinq livrables ont été fournis à l’INERIS le 02/07/2015.

• Livrables 1 et 2 : Suivi des paramètres physico-chimique et contaminants chimiques (eau, sédiment et biote) et qualité des données acquises. Commentaires et recommandations.

• Livrable 3 : Traitement des données et format de restitution - suivi physico-chimique et contaminants chimiques. Commentaires et recommandations.

• Livrable 4 : Analyse de risque chimique (rapprochement des données d’exposition et des seuils d’effets).

• Livrable 5 : Commentaires et recommandations pour la bancarisation des données (données des suivis physico-chimique, contaminants chimiques et écologiques).

A noter que pour le livrable n°4, a été pris en charge par INERIS, unité ETES.

2.5.2.2. Expertise CNES

La loi spatiale (loi n°2008-518) demande que l’opérateur spatial puisse démonter l’absence de risque inacceptable pour les personnes, les biens, la santé publique ou l'environnement causé par les éléments atteignant la surface de la Terre. Dans ce contexte, en 2012, une méthodologie d’évaluation des risques a été développée pour aider l’opérateur à démontrer que le satellite lancé dans l’espace n’engendrera pas de risque inacceptable pour l’environnement et l’homme via l’environnement lors de sa retombée contrôlée ou non sur Terre. Le CNES a souhaité que les efforts entamés pour d’affiner la méthodologie proposée en 2012 se poursuivent. Dans le cadre de l’étude menée en 2015 le CNES un certain nombre de données validées concernant des paramètres nécessaires à la réalisation de l’évaluation des risques pour l’environnement liés aux retombées de satellites ont été transmis au CNES.

2.5.2.3. Expertise ALTEO

Altéo, anciennement Péchiney, est le premier producteur mondial d’alumines non-métallurgiques. Alteo, souhaitant pouvoir continuer à rejeter ses déchets (sous forme liquide et non plus solide), a sollicité une nouvelle concession de 30 ans au-delà de celle arrivant à


échéance en 2015. C’est dans ce contexte que Ségolène Royal a adressé une saisine au PDG Ifremer, sollicitant l’expertise Ifremer concernant la « Contamination significative historique en milieu marin en Méditerranée, en particulier par des métaux toxiques tels que le mercure et l’arsenic, dont une partie peut être liée au rejet de boues rouges en mer». En 2015, la cellule ARC avec l’appui des experts a ainsi réalisé une note d’expertise sur le sujet. Note Ifremer –annexe du courrier PDG/2015-014 du 23/01/2015 : Expertise Ifremer sur la « contamination significative historique du milieu marin en Méditerranée, en particulier par des métaux toxiques tels que le mercure et l’arsenic, dont une partie peut être liée au rejet de boues rouges en mer ». I. Amouroux (Coord.), J.-L. Gonzalez, J. Knoery, B. Andral, J.F. Chiffoleau, C. Brach-Papa, D. Claisse, T. Burgeot, L. Dreves. 12 p.

2.5.2.4. Agence de l’Eau Seine-Normandie (AESN)

« Révision du guide pratique des substances toxiques » en réponse à la consultation de marché BOAMP n°14-129811 publiée le 26/08/2014. Mise à jour des fiches substances existantes et rédaction des nouvelles fiches (nouvelles substances inclues dans le guide).

2.5.2.5. IGA – Impact Grands Aménagement

L’Ifremer intervient pour EDF dans le cadre de la surveillance des zones de rejet en mer de cinq centrales nucléaires via le réseau IGA (Impact des grands Aménagements). Sur sollicitation du coordinateur IGA, la cellule ARC est intervenue pour fournir des éléments de réponse sur l’analyse dans l’eau de mer de l’hydrazine, l’éthanolamine et la morpholine. 2.6. Surveillance Chimique Cette cellule met en œuvre l’observatoire de la contamination chimique ROCCH dans l’axe 3 observatoire et surveillance du projet d’unité BE. Elle participe au pilotage de la DCSMM et à l’élaboration de normes de qualité pour la DCE avec la cellule ARC. A ce titre, elle participe aussi à l’expertise internationale dans le cadre de la convention OSPAR.

2.6.1. Coordination du ROCCH Les actions de surveillance chimiques ( Fig 1 Axe3/action 3b du projet d’unité BE) sont conduites par le ROCCH et la cellule Arc en lien avec l’expertise apportée par les chercheurs des laboratoires thématiques du LBCM, LBCO et LEX. Le ROCCH est un observatoire national de la contamination chimique qui fournit d’une part, une base de données pour les programmes de recherche et d’autre part, des données en appui aux politiques publiques que ce soit dans le domaine environnemental (Directive Cadre sur l’eau DCE, convention des mers régionales OSPAR) ou sanitaire (Direction Générale de l’alimentation DGAL). Dans cet objectif, la coordination organise les campagnes de prélèvements, passe commande des analyses, traite les données et les bancarise. De plus, en collaboration avec le LBCM, elle bancarise les échantillons prélevés dans la Mytilothèque. Actions remarquables en 2015 :

- Coordination des campagnes d’acquisition de données de surveillance dans les mollusques (février et novembre 2015).

- Campagne d’échantillonnage de sédiments côtiers ROCCHSED 15 en Bretagne Nord (juin 2015)


- Qualification de plusieurs dizaines de milliers de données de surveillance dans la base QUADRIGE 2.

- Participation au comité de pilotage de la surveillance sanitaire de la DGAL (janvier 2015).

- Présentation des résultats locaux à l’agence de l’eau Loire-Bretagne (décembre 2015). - Présentation de la Mytilothèque au colloque IESB à Nancy (juin 2015).

Parmi les résultats marquants de 2015, le coordonnateur du ROCCH a aussi participé au projet de refonte des réseaux de surveillance en accord avec le contrat d’objectif 2014-2018 (élaboration d’une proposition de mutualisation de l’effort de surveillance environnemental et sanitaire), en collaboration d’une part avec la DS, et d’autre part avec la DGAL. Dans cet objectif, un document de refonte de la surveillance chimique à fins sanitaires, élaboré en collaboration avec les LERs de l’IFREMER, a été proposé à la DGAL en décembre 21015.

2.6.2. Pilotage de la DCSMM

Le coordonnateur du ROCCH est aussi chef de file du descripteur 8 (contaminants chimiques) de la DCSMM et responsable de la mise en place du Programme de surveillance (PdS). A ce titre, il a participé à plusieurs réunions et GT de la Direction de l’Eau et de la Biodiversité (DEB) et finalisé la mise en place du PdS. L’année 2015 aura été sur un plan organisationnel, une année de transition marquée par un déficit de temps agent pour la coordination du D8 DCSMM. L’équipe mobilisée au sein de BE avec J.F. Chiffoleau (chef de file D8) et les experts J. Tronczynski et T. Burgeot, a permis de gérer cette période difficile dans l’attente d’un poste de coordinateur D8 qui était prévu en 2015 mais qui ne sera effectif qu’au premier semestre 2016.

J. Tronczynski a été nommé expert pour le 6ème rapport sur l'avenir de l'environnement mondial « Global Environnemental Outlook » - GEO-6 UNEP/PNUE. Coordination des travaux en tant que CLA (« coordinating lead author ») sur les chapitres « Coastal, Marine, Oceans » et « Freshwater » (Europe, Assessment) actuellement dans la phase de revision (« peer –review » et gouvernements). Contribution en tant que « lead author » aux chapitres : « Chemical and Waste » ; « Environemental policies, goals and objectives : a review of policy responses and options » ;

J. Tronczynski et T. Burgeot ont contribué aux travaux du réseau d’experts européens dans le cadre de DCSMM portant principalement sur la révision de la décision européen 2010/477/EU « Review of Commission Decision 2010/477/EU concerning MSFD criteria for assessing good environmental status ; Descriptor 8 ; Concentrations of contaminants are at levels not giving rise to pollution effects ». Dans ce cadre contribution à la définition de la position française pour le MEDDE et la cellule DCSMM/ IFREMER ; autres activités connexes (CIEM, CMR…).

2.6.3. Expertise internationale pour les conventions de mers régionales L’expertise française au groupe de travail de surveillance OSPAR « MIME » a été représenté par le coordonnateur du ROCCH (JF Chiffoleau) pour le volet chimie et par le chef d’unité BE (T. Burgeot) pour le volet effets biologiques des contaminants. Le groupe de travail MIME s’est déroulé en novembre à Copenhague, pour travailler en particulier sur l’harmonisation de la DCSMM au sein de cette convention de mer régionale et avancer sur des indicateurs communs afin d’ assister la DEB dans la prise de décision. Lors du MIME 2015, la France a coordonné le groupe d'évaluation des effets biologiques des contaminants chimiques et a produit un rapport. La France a aussi exposé le projet de refonte de la surveillance nationale qui implique un changement de période des prélèvements français pour le compte d’OSPAR.


Cette nouvelle stratégie est maintenant en accord avec les guidelines les plus récents d’OSPAR et plus ne rien ne s’oppose à la mutualisation prévue des campagnes environnementales et sanitaires.

3) Animation de l’unité BE Le comité d’organisation de l’unité BE (COBE) s’est réuni toutes les trois semaines afin d’informer régulièrement les responsables de laboratoires et de cellules BE des évolutions administratives internes, du budget, des processus d’assurance qualité ISO 9001, des séminaires et activités marquantes de l’unité etdes CODIR du centre Ifremer Atlantique de Nantes. Des séminaires d’animation scientifique internes à BE ont été organisés par C. Tixier tous les deux mois autour des travaux de recherche menés dans les laboratoires et cellules BE sur la base de communications données à l’extérieur et des travaux d’étudiants stagiaires ou thésards.

4) Perspectives de l'année n+1

4.1. Vie de l’unité BE Les perspectives de l’année 2016 doivent intégrer quatre mouvements de personnels avec (1) la mobilité d’un chercheur qui assurait les fonctions de responsable du LBCM et RAQ ainsi que (2) le départ à la retraite d’un technicien chimiste du LBCM. Une demande de remplacement a été effectuée pour le recrutement d’un technicien chimiste et d’un chercheur au LBCM en 2016. L’enjeu sera de maintenir une compétence recherche et analyse biogéochimique des contaminants métalliques historiques et émergents ainsi que l’accréditation Cofrac. Le maintien d’une telle compétence sur les contaminants métalliques est essentiel à la conduite du projet recherche de l’unité mais également pour assurer l’expertise biogéochimie des métaux qui a été réduite de 80 % depuis 4 ans. Sans ces deux remplacements, le LBCM sera en situation critique. L’année 2016 sera également l’année d’accueil (3) d’un nouveau pilote scientifique du descripteur 8 qui sera recruté lors du premier semestre 2016. La venue d’un nouveau pilote permettra de dynamiser la coordination scientifique du D8. Une réorganisation du volet observation et expertise sera menée au sein de BE pour la mise en place d’une cellule d’expertise et surveillance mutualisant les compétences de l’unité. L’objectif est de répondre à la demande d’appui aux politiques publiques en cohérence avec le COB Ifremer pour la coordination de la surveillance chimique et le pilotage de la DCSMM. Une nouvelle structure regroupant la coordination DCSMM, du ROCCH et de la cellule Arc sera proposée. En effet la coordination de la surveillance chimique dépasse aujourd’hui la seule coordination du ROCCH. Elle doit intégrer les perspectives d’évolution du volet intégrant chimie et effets biologiques de la DCE, de la DCSMM et des conventions des mers régionales. 4.2. Rayonnement de l’unité L’unité BE organise avec le service de la communication DISCOMRI du centre de Nantes, l’un des plus grand colloque international sur la contaminantion chimique et la toxicologie environenmentale, du 22 au 26 mai 2016 à la cité des congrès de Nantes. Cet événement local est d’une importance majeure car il permettra d’exposer à la communauté intrenationale


l’expertise de la communauté française d’écotoxicologie et chimie environnementale. Nous sommes pour cela soutenu par le Labex Cote. Le SETAC Nantes représente un moment particulier de reconnaissance pour la thématique d’écotoxicologie qui a été créée au centre Ifremer de Nantes, il y a vingt cinq ans et pour l’expertise thématique en biogéochimie des contaminants chimiques initiée il y a plus de trente cinq ans. Ce congrès international portera sur la thématique de la pollution chimique du continuum terre mer. Il réunira deux mille personnes et plus de soixante nationalités.

4.3. Projets scientifiques Le projet scientifique de l’unité est construit sur la base des deux axes de recherche et d’un axe opérationnel de surveillance-observation et expertise. L’objectif 2016 est de consolider une démarche intégrée de biogéochimie et écotoxicologie réunissant les équipes autour d’un projet commun et structurant. Les activités de recherche seront menées dans le cadre d’un partenariat national avec le labEx Cote et l’OSUNA. Un nouveau GDR d’écotoxicologie aquatique piloté par l’Irstea sera créé durant le premier semestre 2016. Une animation scientifique interne sera menée sur un sujet d’intérêt commun qui concerne le développement d’échantillonneurs passifs. Il fait l’objet d’une forte demande tant en matière de recherche que d’application en surveillance. Les échantillonneurs passifs feront partie intégrante du projet Polar Pod pour la collecte de données chimiques. Le transfert des contaminants chimiques dans la chaîne trophique et les effets biologiques sur le cycle de vie des organismes constituent l’axe fédérateur du projet d’unité BE. Des perspectives originales seront menées sur la spéciation et bioaccumulation des contaminants historiques ainsi que les contaminants émergents organiques et organo-métalliques, l’approche épigénétique des effets biologiques chez les bivalves et les effets des mélanges chimiques sur le phytoplancton. Ces recherches seront conduites dans le cadre d’une pression combinée du changement climatique et des polluants chimiques sur l’écosystème.

4.4. Nouveaux projets de recherche Les nouveaux projets construits dans la continiuté d’acquisition de connaissances et d’expertise sur la biogéochimie et l’écotoxicologie sont présentés suivant les perspectives proposées par équipes :

4.4.1. Laboratoire d’écotoxicologie LEX L’année 2016 sera marquée par le démarrage du projet GANEsH avec de premières expérimentations visant à étudier par RT-QPCR l'expression de gènes cibles impliqués dans l’embryogenèse et la biominéralisation des larves de C.gigas exposées à des pesticides. Les travaux en épigénétique seront également poursuivis chez l'huître creuse dans le cadre d’un master 2 co-encadré avec l’UMR IHPE. Il s’agira de poursuivre le travail de la thèse de Rodolfo Rondon par la détermination des changements de méthylation induits par l’exposition parentale au diuron. Le bilan du projet ANR GIMEPEC sera établi lors d’un séminaire ouvert aux équipes RBE et partenaires nationaux travaillant sur l’huître creuse en écotoxicologie et aquaculture. Ce séminaire aura pour objectif de proposer un nouveau projet ANR dans la continuité des résultats encourageants obtenus en épigénétiques .

Les effets de mélanges chimiques sur le phytoplancton seront étudiés dans le cadre du projet PHYTOCOTE afin de déterminer les CE50 pour les substances les plus toxiques chez les deux espèces de phytoplancton sélectionnées (T-iso et Skeletonema costatum). Celles-ci seront


testées en mélange selon le modèle de Concentration-Addition afin de déterminer la nature des interactions toxiques entre molécules (additivité, synergie ou antagonisme). La préparation et l’analyse d’extraits de POCIS déployés dans le Blayais, à différentes périodes du printemps et de l’été permettront de mesurer le potentiel toxique de mélanges de pesticides sur les micro-algues et de déterminer ainsi les fenêtres à risque pour les producteurs primaires. Dans le cadre des projets IMPACT et COMPACT soutenus par le LabEx Cote, la mise à disposition des données de chimie permettra de compléter l’interprétation des résultats de toxicité et de planifier de nouvelles expérimentations. Enfin, le laboratoire d’Ecotoxicologie sera fortement mobilisé pour participer à l’organisation du prochain congrès du RTP d’Ecotoxicologie Microbienne et le congrès de la SETAC (Society of Environmental Ecotoxicology and Chemistry) Europe en mai 2016 . L’ensemble des membres du laboratoire participera à l’événement qui devrait permettre la représentation du laboratoire également sous la forme de deux communications orales et d’un poster.

4.4.2. Laboratoire de biogéochimie des contaminants organiques (LBCO) Le LBCO poursuivra ses travaux sur le devenir et les transferts des contaminants organiques persistants dans l’écosystème marin (projets Fish’N’POP, CONTABEL, Veille-POP) ainsi que sur la modélisation de la bioaccumulation de ces contaminants (projet MOMBASAR). Par ailleurs, le LBCO s’intéressera à de nouvelles espèces telles que les grands prédateurs (projet Swordfich) et les espèces de l’environnement profond (Total). Il étendra également son champ d’investigation à d’autres familles de contaminants (filtres UV- projet UV2M ; composés perfluorés et HBCDD –projets CONTABEL et VEILLE-POP) et aux plastiques- microplastiques en tant que vecteurs de contaminants organiques (projet PVC et projet d’institut Microplastiques). Le LBCO sera particulièrement investi dans le projet d’institut MERLIN avec la coordination du projet microplastiques et l’action de porteur scientifique de Polar Pod. Le LBCO valorisera ses acquis dans le domaine de l’échantillonnage passif de contaminants organiques persistents par l’acquisition de nouvelles données sur la contamination du milieu marin dans les zones de prospection et d’exploitation pétrolière (Total), dans les mers australes (Polar Pod) ou pour de nouveaux contaminants (UV2M avec la société L’Oréal). De nouveaux projets seront également initiés : Le Projet Swordfish (2016-2018) : s'inscrit dans la thématique de recherche de l'unité BE portant sur le transfert des contaminants persistants dans les écosystèmes marins en se plaçant au niveau des grands prédateurs. Il répond à une sollicitation de l'IRD (Nathalie Bodin, UMR MARBEC) et de la SFA (Seychelles Fishing Authority), il bénéficie d'un financement sur fonds européens (European Maritime and Fisheries Fund - EMFF). Les prédateurs supérieurs constituent des espèces d'intérêt écologique, commercial et sanitaire très élevé qui sont fragilisées voir menacées par la pression de pêche exercée sur elles. De par leur position trophique élevée et leur cycle de vie long, ce sont des espèces particulièrement exposées aux contaminants bioaccumulables et bioamplifiables tels que les Polluants Organiques Persistants (POP), substances reconnues comme toxiques en particulier pour le système endocrinien, la reproduction, la fonction immunitaire, le système nerveux. Les composés bioaccumulables et persistants constituent une menace à la fois écologique, économique et sociétale à prendre en compte dans une optique de gestion durable des écosystèmes marins exploités (DCE, DCSMM, Ospar, Barcelone). De plus, les prédateurs supérieurs peuvent être utilisées en tant qu'espèces indicatrices de la contamination au niveau global (espèces migratrices à distribution géographique large), et sont espèces cibles du descripteur 8 de la DCSMM.

Les objectifs du projet sont de :

1) Déterminer la variabilité de la contamination de différentes espèces de prédateurs supérieurs (thonidés, espadon) par les Polluants Organiques Persistants (POP) à l'échelle de l'ouest de l'Océan Indien. Plusieurs zones seront explorées : les Seychelles, le canal du Mozambique et La Réunion. Les POP sélectionnés seront des contaminants historiques


(PCB - Polychlorinated biphenyls, OCP -pesticides organochlorés) et émergents (PBDE - polybrominated diphenyléthers, HBCDD -hexabromocyclododécane, PFC -composés perfluorés). A titre exploratoire, les muscs synthétiques seront également recherchés.

2) Evaluer la variabilité de la contamination au sein de la population d'espadons en fonction

de paramètres biologiques et trophiques tels que taille, âge, sexe, alimentation, statut reproducteur.

3) Chez l'espadon, contribuer à évaluer la variabilité de la contamination au sein d'un

individu (la contamination est-elle homogène dans le muscle dorsal, ventral, frontal, caudal ?). Etudier le lien avec la composition biochimique (protéines, lipides, acides gras, vitamines), paramètres acquis par le partenaire IRD.

Le projet Total : Suite à une première réunion d’échanges avec des représentants du département Exploration et Production de la société Total coordonnée par la DDVPE (Romain Charraudeau) fin 2015, le LBCO va proposer en 2016 un projet autour du devenir et du transfert des contaminants organiques dans les zones de prospection et d’exploitation pétrolière. Ce projet visera à une meilleure caractérisation de la contamination chimique autour des zones de forage pétrolier. Une comparaison de différents type d’environnement pourra être réalisée (profond/côtier ; in shore/offshore ; type de forage…). Ce projet reposera sur l’étude combinée de trois matrices : biote (espèces présentes et représentatives de la zone d’étude ; collaboration directe avec Daniella Zeppilli du laboratoire « Environnement profond » pour l’étude des nématodes marins) ; sédiments ; échantillonneurs passifs. La comparaison de ces trois matrices permettra d’une part d’estimer le taux d’exposition du biote aux contaminants chimiques et d’appréhender les processus de biodisponibilité et bioaccumulation. Le choix des contaminants ciblés se fera en concertation avec l’équipe Total et en considérant la probabilité de présence. Dans un objectif de mise en place d’outils de surveillance pour la DCSMM en zone offshore et pour le suivi à long terme d’exposition chronique, cette étude permettra de « calibrer » et valider l’utilisation de capteurs passifs pour différentes familles de contaminants. Ce projet est en cours d’élaboration et de montage, il sera affiné lors d’une prochaine réunion avec les collègues du département REM de l’Ifremer, et les représentants du groupe Total au cours du 1er trimestre 2016. Le projet d’institut MERLIN « Plastiques –Microplastiques » : En lien avec la mise en place du projet de l’Institut sur les Plastiques –Microplastiques, le LBCO va orienter en 2016 ses activités vers l’étude du rôle des plastiques comme vecteurs de contaminants organiques. Un projet PVC (Les Plastiques (macro et/ou micro) Vecteur de Contaminants chimiques ?) a ainsi été soumis à l’appel à projets Ifremer Politique de site Brest en collaboration avec l’équipe de l'Observatoire du Domaine Côtier (ODC) de l'Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM, FR CNRS 2195). Ce projet porte sur la caractérisation chimique et biologique de câbles électriques en Polychlorure de Vinyle (PVC) rejetés en rade de Brest. Leur présence a été signalée par plusieurs équipes scientifiques de la région et avérée de façon conséquente depuis plusieurs années. Cette étude préliminaire porte sur une évaluation de l’impact de ces câbles en PVC en rade de Brest tout d’abord d’un point de vue chimique, comme vecteur potentiel de contaminants de par leur composition initiale mais aussi de par leur capacité de « sorption » des molécules organiques persistantes. Les contaminants ciblés appartiennent à quatre familles de composés organohalogénés (PCB, pesticides organochlorés, BFR incluant PBDE et composés de remplacement HBCDD et PFC). Par ailleurs, il s’agira d’évaluer le rôle de ces câbles comme support d’une activité biologique, e.g substrat préférentiel pour des communautés particulières situées à la base de la chaîne trophique. Ces deux volets seront menés sur des câbles ayant séjourné plus ou moins longtemps dans la Rade afin de prendre en compte leur devenir sous l’effet de l’environnement (activité mécanique, biologique, photodégradation,…).


Par ailleurs, le LBCO sera impliqué dans la coordination scientifique du projet de l’institut sur les Plastiques –Microplastiques. Ce projet, en cours d’élaboration, a pour objectif de mettre en lumière le rôle de l’Ifremer au travers d’actions concrètes visant à l’obtention de résultats « marquants », à la fois en terme de progrès de la connaissance, et aussi de leur impact en termes de public outreach. Le projet sera décliné en 5 actions principales visant : i) à l’optimisation de l’échantillonnage et de la caractérisation du devenir et de l’impact des microplastiques -MP (en particulier pour les particules les plus fines) dans la chaîne trophique ; ii) en l’étude de ce nouvel habitat pour le microbiote ; iii) en la valorisation des échantillons archivés du ROCCH pour des suivis temporels de la contamination par les MP ; iv) en l’étude de leur présence dans les grands fonds marins ; v) au développement d’actions de science participative en milieu littoral et côtier.

Le projet UV2M (Echantillonnage passif pour le suivi de filtres UV en Milieu Marin) . En réponse à une sollicitation de l’entreprise L’Oréal , le LBCO s’intéressera également en 2016 à la mise au point d’une méthode opérationnelle de suivi de filtres UV organiques dans l’environnement. Les filtres UV font ainsi partie de la liste de contaminants émergents d’intérêt selon le réseau européen NORMAN et deux substances ont récemment été considérées comme « pertinentes à surveiller » selon le Comité Experts Priorisation (CEP) (structure d’expertise nationale mise en place en 2010 par l’Ineris et l’Onema). Ce projet comprend deux phases principales : i) étude bibliographique sur l’échantillonnage passif et le suivi des filtres UV organiques dans l’environnement marin couplée à une étude de faisabilité pour une sélection d'une dizaine de molécules développées par L’Oréal et ii) mise au point pour les molécules sélectionnées d’une méthode opérationnelle basée sur l’échantillonnage passif (sélection de la phase réceptrice de l’échantillonneur, calibration en conditions contrôlées de laboratoire, essais sur le terrain sur divers sites d’intérêt).

Le projet Polar Pod : Le LBCM et le LBCO vont contribuer au projet d’Institut Polar Pod en soutien au projet de plateforme navigante de recherche scientifique du même nom mené par Jean-Louis Etienne. La plateforme expérimentale Polar Pod sera utilisée comme point de mouillage de choix pour des dispositifs d'échantillonneurs in situ (passifs ou automatisés) afin d'obtenir des données sur les niveaux de contamination des mers australes. La première phase de ce travail correspond à la mise au point par RDT, en collaboration étroite avec les équipes de BE impliquées et les équipes du Polar Pod d'un dispositif permettant l'exposition/récupération des échantillonneurs passifs en conditions optimales et en tenant compte des contraintes liées à la structure/conception de la plateforme. Le LBCO sera via C. Tixier , un des porteurs scientifiques.

4.4.3. Laboratoire de biogéochimie des contaminants métalliques (LBCM) Le LBCM poursuivra ses travaux visant à améliorer la connaissance du comportement biogéochimique des contaminants métalliques qui gouvernent leurs échanges entre les différents compartiments des écosystèmes marins et estuariens (du milieu vers les compartiments du vivant). Ces orientations seront poursuivies notamment au travers des projets en cours tels que RS2E et Lab-on-ship. Elles seront également traitées dans le cadre de nouveaux projets tels que PolluSols. Le projet Pollusols (2015-2019) : C’est un projet de « dynamique scientifique » par la région Pays de Loire pour lequel Ifremer/LBCM est un des 6 membres principaux. Ce projet intégré traite de la contamination métallique et de ses différents transferts dans le continuum du bassin versant de la Loire estuarienne, jusqu’aux impacts sur cet écosystème et son patrimoine humain (Fig 16) . Dans ce cadre thématique général, le LBCM se focalise sur l’étude estuarienne de contaminants métalliques "types", les émergents (EGP), les historiques (Cu), ou


les réglementaires (Hg). Ces recherches se développent dans le cadre d’actions qui débutent en 2016 (Hg) ou dont la demande de cofinancement est soumise fin 2015 (pour EGP, Cu).

Estuary

Biotic

transfer, (isotopy and

speciation)

Biotic


speciation)

Direct transfer to

estuary (Speciation,

isotopy)

Direct transfer to


isotopy)Influx to estuary(isotopy, speciation)

Influx to estuary(isotopy, speciation)

Export

fluxes : isotopy and

speciation to

the ocean

Export


speciation to

the ocean

Ocean

Estuaire = Réceptacle ultime, bioaccumulation

PolluSols = Connaissances, gestion, valorisation

Estuary

Biotic


speciation)

Biotic


speciation)

Direct transfer to


isotopy)

Direct transfer to


isotopy)Influx to estuary(isotopy, speciation)

Influx to estuary(isotopy, speciation)

Export


speciation to

the ocean

Export


speciation to

the ocean

Ocean

Estuaire = Réceptacle ultime, bioaccumulation

PolluSols = Connaissances, gestion, valorisation

Figure 16 : Schéma des flux de polluants chimiques en zone estuarienne.

Programme MERMEX : De nouvelles actions sont également en cours d’élaboration sous la forme d’une contribution au volet MERITE du programme MERMEX (2016-2020). La démarche suivie et les méthodologies mises en oeuvre lors du précédent volet, focalisé sur la remobilisation et les transferts des contaminants depuis le compartiment sédimentaire, seront appliquées à d'autres contaminants historiques (ex. Hg/MeHg, TBT, PCB) également stockés dans les sédiments de la Rade de Toulon. Le LBCM abordera également la thématique de la contamination par les microplastiques (MP). Les travaux proposés auront pour objectif d'évaluer l’importance des MP en tant que source de contamination pour les eaux marines. Ces travaux, co-financés par l’Agence de l’Eau Rhône-Méditérranée-Corse, pourront être traités dans le cadre d’une thèse (demande soumise). Expertise et appui aux politiques publiques : le laboratoire poursuivra ses activités en soutien aux politiques de gestion du milieu marins. Il contribuera à la mise en oeuvre opérationnelle du Réseau d’Observation de la Contamination Chimique du milieu marin (ROCCH) au travers de ses activités analytiques conduites sous accréditation. Le LBCM poursuivra également ses travaux soutenus par Aquaref autour de l’utilisation des systèmes d’échantillonnage passif (DGT, SBSE...) en alternative aux méthodologies classiques de surveillance chimique. Il poursuivra le développement de nouveaux outils, par exemple basés sur l’automatisation de la technique SBSE, afin d’une part de simplifier les procédures d’analyse et d’autre part considérer de nouvelles substances.

4.4.4. Cellule d’analyse du risque chimique ARC 4.4.4.1. Vie de la cellule Arc La convention Ineris et Ifremer sera signée en 2016 lors de la réunion annuelle d’activité. La cellule d’analyse du risque chimique ARC poursuivra ces actions sur :

- Détermination de VGE mollusques et réflexions visant à améliorer la méthodologie de détermination de VGE existante.

- Contribution à la priorisation des substances et à la prise en compte des données chimiques du milieu marin dans les exercices de priorisation.

- Suivi de la thématique substances dangereuses d’OSPAR.


4.4.5. Cellule de coordination du Rocch 4.4.5.1. Vie de la cellule Rocch : L’année 2016 sera une année de transition importante pour la cellule ROCCH avec l’accueil à temps plein d’un nouveau coordinateur du ROCCH, Anne Grouhel Pellouin qui assurera également una activité d’animation dans le comité scientifique et technique Aquaref. 4.4.5.2. Stratégie d’échantillonnage et cycle de prélèvement La refonte des campagnes d’échantillonnage ROCCH du biote sera finalisée. L’objectif est double : (1) mutualiser les 2 campagnes pour une campagne unique dès février 2017 ; (2) rationnaliser le plan d’échantillonnage sanitaire. Dans le cadre des cycles de prélèvement du sédiment par façades, la cellule Rocch organisera une campagne de prélèvement de sédiment pour le ROCCH (ROCCHSED) en Méditerranée.

4.4.6. Coordination DCSMM Un nouveau pilote scientifique du D8 sera recruté pour mettre en place une nouvelle organisation de fonctionnement de la surveillance chimique avec l’ingénieur de coordination du programme D8 de DYNECO VIGIES, le coordinateur du ROCCH et la cellule Arc. Le nouveau pilote du D8 aura en charge la mise en place des indicateurs, l’appui aux maîtres d’ouvrage des dispositifs de surveillance et aux autres pilotes scientifiques, l’organisation d’atelier avec les structures de recherche compétentes et la contribution aux groupes internationaux et communaitaires du BEE. Il contribuera aux groupes de travail MIME Ospar et HASEC en appui technique au MEDDE. L’accueil du pilote scientifique représente une implication forte de l’expertise BE dans la mission d’appui aux politiques publiques et il illustre l’aboutissement d’un effort de recherche mené depuis une terntaine d’ années au centre de Nantes. C’est également un enjeu scientifique important qui ancre l’unité BE dans une mission alliant recherche-surveillance-expertise.


ANNEXES

Annexe 1: Production scientifique et technologique (année du reporting) Indicateurs Nombre Publications dans des revues avec comité de lecture (de rang A) 31 Publications parues dans d’autres revues et dans des ouvrages scientifiques et technologiques

IF moyen des publications 2.8 Rapports liés à: - réseaux de surveillance/observation - projets

13

Articles de vulgarisation 1 Avis et expertises (et ETP associés) - de commande publique - de commande privée

14

Ouvrages / chapitres d'ouvrages 4 Communications dans des colloques et congrès, posters 14 Brevets Licences

Publications indexées dans le WOS Akcha F., Barranger A., Bachère E., Heude Berthelin C., Piquemal D., Alonso P., Rondon Sallan R.,

Dimastrogiovanni G., Porte C., Menard D., Szczybelski A., Benabdelmouna A., Auffret M., Rouxel J., Burgeot T. (2015). Effects of an environmentally relevant concentration of diuron on oyster genitors during gametogenesis: responses of early molecular and cellular markers and physiological impacts. Environ. Sci. Poll. Res., acceptée.

Armesto Paula, Cousin Xavier, Salas-Leiton Emilio, Asensio Esther, Manchado Manuel, Infante Carlos (2015). Molecular characterization and transcriptional regulation of the renin–angiotensin system genes in Senegalese sole (Solea senegalensis Kaup, 1858): Differential gene regulation by salinity. Comparative Biochemistry And Physiology A-molecular & Integrative Physiology, 184, 6-19. http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpa.2015.01.021

Armesto Paula, Infante Carlos, Cousin Xavier, Ponce Marian, Manchado Manuel (2015). Molecular and functional characterization of seven Na+/K+-ATPase β subunit paralogs in Senegalese sole (Solea senegalensis Kaup, 1858). Comparative Biochemistry And Physiology B-biochemistry & Molecular Biology, 182, 14-26. http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpb.2014.11.011

Barranger Audrey, Benabdelmouna Abdellah, Degremont Lionel, Burgeot Thierry, Akcha Farida (2015a). Parental exposure to environmental concentrations of diuron leads to aneuploidy in embryos of the Pacific oyster, as evidenced by fluorescent in situ hybridization . Aquatic Toxicology, 159, 36-43. Publisher's official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.aquatox.2014.11.011 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00238/34911/

Barranger A., Heude-Berthelin C., Rouxel J., Adeline B., Benabdelmouna A., Burgeot T., Akcha F. (2015b). Parental exposure to the herbicide diuron resulted in oxidative DNA damage in germinal cells of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Comp. Biochem. Physiol., 180: 23-30.

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Tiano M., J. Tronczynski, M. Harmelin-Vivien, C. Tixier, O. Radakovitch, F. Carlotti (2015). Seasonal variation of PCB concentrations in plankton in Marseille bay during one year (September 2010 – October 2011). MERMEX 2015 Workshop. 7-10 Apr 2015 Marseille, France.

Tronczynski J., F. Carlotti, O. Radakovitch, N. Bodin. (2015) Contaminants dans le système trophique : phytoplancton, zooplancton, anchois, sardine. MERMEX 2015 Workshop. 7-10 Apr 2015 Marseille, France.

Tronczyǹski Jacek and François Carlotti (2015). Contaminants in the trophic system: phytoplankton,zooplankton, anchovy and sardine : why does chemical contamination persist in the marine environment? - marine plankton, a key to the understanding of the chemical contamination of biological resources in the Gulf of Lion. Conférence International MISTRAL, Mediterranean Integrated STudies at Regional And Local Scales 20-22 Octobre 2015, Marseille, France.

Vignet C., Le Menach K., Larcher T., Davail B., Joassard L., Lyphout L., Leguay D., Budzinski H., Bégout M. –L., Cousin X. and whole ConPhyPoP consortium. Multi-generational assessment of environmental PAHs mixtures toxicity. Colloque de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, 30 juin-1er juillet , Bordeaux.


Vignet Caroline, Le Menach Karine, Larcher Thibaut, Davail Blandine, Joassard Lucette, Lyphout Laura, Leguay Didier, Budzinski Helene, Begout Marie-Laure, Cousin Xavier (2015). Multi ‐generational assessment of environmental PAHs mixtures toxicity. Colloque 2015 SEFA - Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée. 30 juin-1 juillet 2015, Bordeaux.

Communications sans actes Akcha F., Barranger A., Perez-Garcia M. C., Benabdelmouna A., Heude Berthelin C., Adeline B., Rouxel J.,

Burgeot T. (2015). Parental exposure to diuron resulted in the vertical transmission of DNA damage and epigenetic modification in the oyster. 18th PRIMO, 24-27 mai, Trondheim, Norway.

Akcha F., Barranger A., Wessel N., Rouxel J., Perez-Garcia C., Budzinski H., Burgeot T. (2015). Genotoxicity of chemical pollutants in marine organisms: Characterization of structural DNA lesions and study of their long term consequences on animal physiology. International Conference on Ocean, Environment and Ecotoxicology, 20–24 October, Malang, Indonesia.

Alfonso S., Blanc M., Vignet C., Joassard L., Vouillarmet A., Trenkel V., Le Menach K., Budzinski H., Bricca G., Begout M.-L., Cousin X. (2015). Neurobehavioral disruption after exposure to persistent organic pollutants. 4th International Symposium: Effect-related evaluation of anthropogenic trace substances - concepts for genotoxicity, neurotoxicity and endocrine effects. 22nd/23rd October 2015, Aachen, Germany.

Alfonso Sebastien, Blanc Melanie, Vignet Caroline, Joassard Lucette, Vouillarmet Annick, Trenkel Verena, Le Menach Karine, Budzinski Helene, Bricca Giampero, Begout Marie-Laure, Cousin Xavier (2015). Neurobehavioral disruption after exposure to persistent organic pollutants. 4th International Symposium: Effect-related evaluation of anthropogenic trace substances - concepts for genotoxicity, neurotoxicity and endocrine effects. 22nd/23rd October 2015, Aachen, Germany.

Behrens D., Tapie N., Pardon P., Budzinski H., Rouxel J., Burgeot T., Akcha F. (2015). Relationship between diuron biotransformation assessed by UPLC MS-MS and its embryo- and genotoxic effects in the Japanese oyster. SETAC, 3-7 mai, Barcelone, Espagne.

Botta F., Abarnou A., Bocquené G., Champin M., Durand G., Gonzalez J-L., Masson J-C., Priou P., Tixier C., Le Moigne M . Tapie N., Lestremau F., Andres S., Devier M-H, Labadie P., Vuillet E., Amouroux D., Monperrus M., Budzinski H. and Dulio V. (accepté) Marine monitoring campaign in France and French overseas departments: more than 10000 data from grab and passive sampling. SETAC, 2015.

Brach-Papa C., Auger D., Bretaudeau J., Bruzac S., Chiffoleau J.-F., Chouvelon T., Crochet S., Knoery J., Rozuel E., Thomas B. CAMELIA : ContAmination Métallique de l’Estuaire de la LoIre dans sa partie Aval, 3èmes journées de la Flotte océanographique française - Colloque Flotte côtière, 11 et 12 juin 2015 (Bordeaux, France).

Carlotti François, Cédric Granier and Jacek Tronczynski (2015). Prospective: MERMEX-COASTAL; Chemical Contaminants Impact on Coastal Ecosystem. Conférence International MISTRAL, Mediterranean Integrated STudies at Regional And Local Scales, 20-22 Octobre 2015, Marseille, France.

Chouvelon Tiphaine, Cresson Pierre, Brach-Papa Christophe, Knoery Joel, Thomas Bastien, Marco-Miralles Francoise, Andral Bruno, Bouchoucha Marc, Fabri Marie-Claire, Bustamante Paco (2015). Hg bioaccumulation in deep-sea fauna: investigation of the influence of the trophic functioning at the base of food webs. 12th International Conference on Mercury as a Global Pollutant - ICMGP, 14th-19th June 2015, Jeju, Korea.

Chouvelon Tiphaine, Schaal Gauthier, Grall Jacques, Pernet Fabrice, A-Pernet Eve Julie, Le Bris Hervé (2015). Gradients côte-large dans la composition isotopique et en acides gras des différents compartiments de l’écosystème benthique : influences respectives des processus côtiers et hauturiers sur le fonctionnement du réseau trophique. 3èmes journées de la Flotte océanographique française - Colloque Flotte côtière, 11 et 12 juin 2015 (Bordeaux, France).

Coquillé N., Dupraz V., Ménard D., Morin S., Parlanti E., Stachowski-Haberkorn S. Impact de deux antifouling, l’irgarol 1051 et le diuron sur la physiologie d’une diatomée marine Chaetoceros calcitrans (2015). 34ème colloque de l’ADLAF, septembre, Bordeaux.

Coquillé N., Dupraz V., Ménard D., Sussarellu R., Haugarreau L., Morin S., Parlanti E., Stachowski-Haberkorn S. Impact de deux antifouling, l’irgarol 1051 et le diuron sur la physiologie de deux souches de la micro-algue marine Tetraselmis suecica (2015). SEFA, juillet, Bordeaux.

Cousin X., Vignet C., Le Menach K., Larcher T., Davail B., Joassard L., Lyphout L., Leguay D., Budzinski H. and Bégout M. (2015) Reproduction and offspring defects after exposure to PAHs mixtures. 25th International Symposium on Polynuclear Aromatic Hydrocarbons (ISPAC), 13-17 September 2015, Bordeaux, France.

Cousin Xavier, Vignet Caroline, Le Menach Karine, Larcher Thibaut, Davail Blandine, Joassard Lucette, Lyphout Laura, Leguay Didier, Budzinski Helene, Begout Marie-Laure (2015). Reproduction and offspring defects after exposure to pahs Mixtures. ISPAC 2015 - International Symposium on Polycyclic Aromatic Compounds conference. September 13-17, 2015, Bordeaux.


Cresson Pierre, Bouchoucha Marc, Marco-Miralles Francoise, Mahe Kelig, Morat Fabien, Chavanon Fabienne, Brach Papa Christophe, Knoery Joel, Fabri Marie-Claire, Cossa Daniel (2015). Un niveau de contamination chimique mesuré dans un poisson est-il toujours le reflet du niveau de contamination environnementale ? Colloque Qualité et Sécurité des Produits Alimentaires de l'ANSES, 17-19 Juin, Boulogne-sur-Mer.

Gonzalez J-L., Foan L., Montero N.; Belzunce-Segarra M-J. (2015) "Large scale" application of the passive sampling techniques: Evaluation of DGT technique as a monitoring tool for the assessment of the chemical status of water bodies. DGT Conference 2015 “From DGT Research to Environmental Assessment”, 28th September to 1st October - Donostia-San Sebastián (Spain).

Knoery Joel, Brach-Papa Christophe, Thomas Bastien, Auger Dominique, Chouvelon Tiphaine, Crochet Sylvette, Rozuel Emmanuelle, Chiffoleau Jean-Francois (2015). Decadal trends of mercury levels, behavior and speciation in a macrotidal estuary : the Loire River (France). 13th International Symposium on Estuarine Biogeochemistry.

Knoery Joel, Brach-Papa Christophe, Thomas Bastien, Auger Dominique, Chouvelon Tiphaine, Crochet Sylvette, Rozuel Emmanuelle, Sanjuan Jane, Chiffoleau Jean-Francois (2015). Behavior and decadal trends of mercury levels and speciation in a macrotidal estuary : the Loire River (France). International Conference on Mercury as a Global Pollutant (ICMGP 2015), June 14-19 2015, Jeju, Korea.

Knoery Joel, Thomas Bastien, Geli Louis, Henry Pierre, Pirrone Nicola, Ruffine Livio (2015). Mercury species and distribution in the Marmara Sea, and their relationship with sub-seafloor processes. International Conference on Mercury as a Global Pollutant (ICMGP 2015), June 14-19 2015, Jeju, Korea.

Millot Sandie, Joassard Lucette, Cousin Xavier, Begout Marie-Laure (2015). Une exposition embryolarvaire à un stress modifie l'ontogénie des comportements et l'expression de certains gènes chez le poisson zèbre. SFECA 2015 -Colloque national de la Société Française pour l'Etude du Comportement Animal. 21-23 avril 2015, Strasbourg.

Montero N., Belzunce-Segarra M-J., Gonzalez J-L., Garmendia J-M., Menchaca I. and Franco, J. (2015) The integration of passive samplers and bioassays to evaluate the water quality of an estuary affect by an effluent plume: case study in the Oiartzun estuary (southeastern Bay of Biscay). SETAC Europe 25th Annual Meeting, 3-7 May 2015, Barcelona, Spain.

Montero N., Gonzalez J-L., Belzunce-Segarra M-J., Marco-Miralles F. (2015) Advances in the use of Diffusive Gradients in Thin-films (DGTs) for the measurement of Hg within the Water Framework Directive: laboratory and field experiments. DGT Conference 2015 “From DGT Research to Environmental Assessment”, 28th September to 1st October - Donostia-San Sebastián (Spain).

Munschy Catherine (2015). Persistent Organic Pollutants-- POPs --in marine resources, 1st Seychelles Seafood Quality Workshop, 18-19 Novembre 2015,Victoria, Les Seychelles.

Richir J., Lepoint G., Donnay A., Lejeune P., Gonzalez J-L, Bouchoucha M., Chiffoleau J-F, Andral B. and Gobert S. (2015) Trace metal speciation ? An essential aspect of biomonitoring to avoid hasardous conclusions. DGT Conference 2015 “From DGT Research to Environmental Assessment”, 28th September to 1st October - Donostia-San Sebastián (Spain).

Rondon Sallan R., Grunau C., Cosseau C., Montagnani C., Akcha F., Bachère E. (2015). Modifications GENétiques et EPIgénétiques d'une exposition au diuron chez l‘huître creuse, Crassostrea gigas-GENEPIH . Séminaire EC2CO, 2 septembre, Paris, France .

Stachowski-Haberkorn S., Coquillé N., Morin S., Parlanti E. (2015). IMPACT: Influence of dissolved organic matter on the toxicity of pesticides on microalgae along a freshwater - marine water continuum. Assemblée Générale du LabEx COTE, 4 décembre, Bordeaux.

Stachowski-Haberkorn S., Guesdon S., Béchemin C., Haugarreau L., Ménard D., Rouxel J., Duchemin A., Coquillé N., Khélifi C., Hubert M., Vérité C., Charpentier G., Seugnet J.-L., Grizon J., Chabirand J. -M., Brach-Papa C., Chiffoleau J.-F., Auger D., Rozuel E., Lambert C., Soudant P., Le Grand F., Quiniou L., Beker B., Jadas-Hécart A., Communal P. –Y. (2015). Effects of copper and herbicide mixtures on phytoplankton community from the Charente river estuary. SETAC, 3-7 mai, Barcelone, France.

Tixier C., Olivier N., Héas-Moisan K., Pollono C., Veyrand B., Marchand P., Munschy C. (2015). Contamination levels of selected emerging halogenated organic contaminants in marine shellfish along French coasts, 15th International Conference on Chemistry and the Environment (ICCE 2015), 20-24 septembre 2015 Leipzig, Allemagne.

Tronczyński J. et F. Carlotti (2015). Bilan du projet : contaminants dans le système trophique phytoplancton, zooplancton, anchois, sardine – projet ANR COSTAS. Colloque Flotte Océanographique Côtière - Bordeaux- 11 - 12 juin 2015.

Tronczyński J., Kuspilič G., Carlotti F., Vorkamp K., Solič M., Cadiou JF., Andral B. and Milun V (2015). Accumulation and trophic transfer of POPs in plankton and small pelagic fish in the Western Mediterranean and Adriatic Sea. Final Scientific Conference; PERSEUS, Brussels December 2015.

Tronczyński Jacek, Céline Tixier, Mireille Harmelin-Vivien, and François Carlotti (2015). Accumulation and trophic transfer of POPs in plankton in the Gulf of Lion, Western Mediterranean. SETAC, 3-7 mai, Barcelone, France.

Verrez-Bagnis Veronique, Seesao Yuwalee, Thebault Anne, Gay Melanie, Aliouat-Denis Cecile-Marie, Le Fur Bruno, Cuzzucoli Diane, Cos Isabelle, Jerome Marc, Kolypczuk Laetitia, Bruzac Sandrine, Audebert


Christophe, Dei-Cas Eduardo, Viscogliosi Eric, Fish-Parasites Consortium (2015). Prevalence of nematodes (Anisakidae) in fish species most consumed in France. TAFT 2015 - 5th Trans-Atlantic Fisheries Technology conference (45th WEFTA meeting). 12-15 octobre 2015, Nantes, France.

Ouvrages Babut Marc, Henri Persat, Marc Desmet, Christelle Lopes, Brice Mourier, Jacek Tronczynski (2016) Chapitre 13

dans « PCB, environnement et santé » Edition Lavoisier Tec&Doc 738p. Charbonnier E., Ronceux A., Carpentier A.-S., Soubelet H., Barriuso E., Coordinateurs. Stachowski-Haberkorn

Sabine : contributeur de la partie 2 « Effets des pesticides et réduction des impacts sur les organismes et les écosystèmes ». Pesticides : des impacts aux changements de pratiques, 2015, Quae Editions, 400p.

Gonzalez J-L. (2015) Evaluation des concentrations en métaux traces dans l'eau par une technique d'échantillonnage passif (DGT) in "Etude de la contamination par les éléments traces en Méditerranée à l'aide d'organismes bio-intégrateurs" (Coordinateurs: Kantin R., Pergent G. et Pergent-Martin C.), Union des Océanographes de France, Paris 2015. ISBN 978-2-9510625-2-8. p 39-53.

Kantin R., Pergent G. et Pergent-Martin C., Gonzalez J-L., Baino R. et Barghigiani C. (2015) Objectifs du programme sur l'utilisation des bio-intégarteurs et argumentaire sur les contaminants pris en compte. Compartiments, lieux de prélèvements et protocoles d'analyse in "Etude de la contamination par les éléments traces en Méditerranée à l'aide d'organismes bio-intégrateurs" (Coordinateurs: Kantin R., Pergent G. et Pergent-Martin C.), Union des Océanographes de France, Paris 2015. ISBN 978-2-9510625-2-8. p 11-38.

Divers Barriuso E., Carpentier A.-S., Charbonnier E., Soubelet H., Coordinateurs. Stachowski-Haberkorn Sabine :

contributeur. Évaluation des risques liés aux pesticides pour les écosystèmes aquatiques – Recommandations issues du programme Pesticides (2015). « Le point sur », publication du Commissariat Général au Développement Durable, Ministère de l’Écologie, n°218, décembre 2015, 6p.

Vulgarisation Arzul G., Quiniou F., Stachowski-Haberkorn S. (2015). Café des Sciences « Des pesticides dans l’Océan »,

animé par Nicolas Guillas, journaliste scientifique pour la revue Sciences Ouest. Rennes, octobre. Parution d’un article « Elles étudient les pesticides en mer » dans le numéro 336 de novembre.

Participation de D. Ménard au Forum des Sciences du Pole Nantais Science et Environnement SEQUOIA. Participation de D. Ménard et D. Behrens à la Fête de la Science au Muséum d'Histoire Naturelle.


Annexe 2: Nouveaux projets soumis et acceptés (anné e du reporting)

Lister les projets de recherche soumis et acceptés, les contrats de recettes en précisant le financement (ANR, H2020, LEFE, EC2CO, agences de l'eau etc) et si Ifremer est coordinateur. Nom du projet Origine financement Durée Porteur Ifremer Coordination

Ifremer (O/N)

Swordfish Seychelles Fishing Authority 30 mois C. Munschy N

Microplastiques Projet Merlin - Ifremer 36 mois E. Mamaca O

Polar Pod Projet Merlin - Ifremer - M. Nokin O

UV2M (Filtres UV

milieu marin) Entreprise L’Oréal C. Tixier O

ECODOGS (European response capacities for combating deep-sea oil and gas spills)

H2020 BG7 – Phase 2 48 mois E. Mamaca N – non accepté

PVC (Plastiques,

vecteurs contaminants) AO Politique de site - Ifremer 24 mois E. Mamaca O – en attente

CHACHA(Channel

of Changes) AO INTERREG 5 France-Manche-Angleterre

48 mois P. Marchal O - non accepté

TROCOCO EC2CO 24 mois J. Knoery O

ROMICO (devenir

et de la biodisponibilité des contaminants chimiques associés aux microplastiques)

AERMC / Ifremer 36 mois J. Gonzalez O

Projets soumis en 2015 dont LEX est porteur : GANEsH « Étude fonctionnelle des Gènes impliqués dans les ANomalies Embryo-larvaires chez l'Huître creuse Crassostrea Gigas », AO EC2CO (Rossana Sussarellu). En attente d’une réponse. ADELMIS « Mécanismes moléculaires de l’Adaptation de la microalgue marine TetrasELMIS Suecica au diuron : conséquences sur sa sensibilité à un mélange complexe de pesticides », AO Programme de Recherche en Toxicologie Environnementale et Ecotoxicologie, Fondation Rovaltain (Sabine Stachowski). Non retenu. EPOTOX « Utilisation d’Extraits de POCIS pour la caractérisation du potentiel TOXique lié à la présence de pesticides dans les étangs de Thau et de l’Or », Convention cadre Ifremer/ Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse (Farida Akcha). Non retenu.


SELIMED « Mise en place du programme de surveillance de la DCSMM: Surveillance des Effets bioLogiques des contamInants en MEDiterranée », Convention cadre Ifremer/ Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse (Farida Akcha). Non retenu. Projets soumis en 2015 dont LEX n’est pas porteur : PHYTOCOTE « Toxicité d’extraits de POCIS pour le phytoplancton marin et l’huître creuse -transfert trophique et toxicité des pesticides », AO Labex COTE. Retenu pour financement avec l’obtention en prime d’une bourse de thèse de l’école doctorale VENAM pour Valentin Dupraz. Portage du projet par l’IRSTEA de Bordeaux. MIPLAQUA « Approche combinée terrain/laboratoire pour l’évaluation de l’impact des microplastiques sur des organismes aquatiques d’intérêt socio-économique (moules, huîtres) », AO Paris scientifiques régionaux. Retenu pour financement. Portage du projet par l’Université Catholique de l’Ouest. « Détermination du taux d'hybridation des moules analysées par le Rocch », AO ONEMA. Retenu pour financement. Portage du projet par l’Unité Ifremer BE.

EpiSAVMEN « Etude des effets seuls et combinés du diuron et des UV sur le méthylome et la stabilité génomique d'une algue marine », AO Dynamique scientifique Région Pays de la Loire. Non retenu. Autres projets soumis impliquant le LBCM en 2015 : TENTATHYO : Transfers of bENthic production and associated meTAllic contamination within macrotidal estuarine food webs and across adjacent ecosystems: the role played by ichTHYOfauna , AO Labex COTE, Irstea EABX, EPOC, LBCM. Non retenu


Annexe 3: Implication dans la formation (par la rec herche)

- Formations données

Non de l’agent Organisme Niveau Sujet Durée

(en h.) Akcha F. Univ. Bretagne Sud

Lorient Master 1 Environnement marin et

biotechnologie 4 h

Burgeot T. Univ. Le Havre Master 2 Ecotoxicologie et surveillance du milieu marin

8 h

Burgeot T. Univ. Angers Master 2 Ecotoxicologie et surveillance du milieu marin

4h

Burgeot T. Univ Bretagne Sud Lorient Master 2 Ecotoxicologie et surveillance du milieu marin

8h

Gonzalez J-L. ENSTA 2eme année Spéciation-Modélisation 4h

Knoery J. Intechmer Cherbourg Bac + 2 Biogéochimie marine 12 h

Knoery J. UNAM / U. Caen Master 2 Le mercure dans l’environnement

4h

Mamaca E. Intechmer Bac + 2 Contaminants organiques 12 h Stachowski S. IUT Quimper Licence pro

Aquaval Le phytoplancton dans tous ses états

6 h

Chiffoleau J.F. AgroParisTech BAC + 5 Biosurveillance 2 h Loizeau V. IUEM Brest. Universités

d'été "Océan & Société : Nourrir les hommes"

Co-responsable Parcours 1 :"Entre valeur nutritionnelle et pollution : La qualité de l’environnement et des ressources alimentaires marines en question"

24-27 août 2015


- Participation à un jury de thèse ou HDR

Membre du jury de thèse

Nom de l’étudiant Titre de la thèse Ecole doctorale

F. Akcha (Co-directrice de thèse)

T. Burgeot (Rapporteur)

Rodolfo Rondon Sallan (11/12/15)

Effets de l’exposition parentale au diuron sur le méthylome et le transcriptome de l’huître creuse Crassostrea gigas

Université de Montpellier

F. Akcha Julien Vignier (23/01/15) Evaluation de la toxicité du pétrole libéré lors de la marée noire Deepwater Horizon et du dispersant Corexit 9500A sur les jeunes stades de développement de l’huître américaine, Crassostrea virginica

Université de Brest et de Floride

F. Akcha (Co-dir these) T. Burgeot (Dir de these)

Audrey Barranger (24/04/2015)

Etude chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, des anomalies génomiques provoquées par l'exposition à des concentrations environnementales d'herbicides: caractérisation des atteintes, étude de leur héritabilité et conséquences pour la survie et la croissance des naissains

ED VENAM

C. Tixier (invitée) Suzie Zita Zendong (4/12/2015)

"Développement de Méthodes de Spectrométrie de Masse Haute Résolution pour le Criblage de Phycotoxines dans les Echantillons Biologiques et Environnementaux »

Université de Nantes


- Accueil et encadrement de stagiaires - Accueil et encadrement d’apprentis en alternance - Accueil et encadrement de post-doctorants

Période Nom Sujet Responsable Cofinancement Ecole(s) Doctorale(s) de rattachement

Stagiaires

Master 2 05/01/15 au 30/06/15

Valentin Dupraz Impact d’herbicides sur 4 souches de micro-algues et sur des hermelles (MIPHYTOS)

S. Stachowski Ifremer (DS) UBO

Licence 3 01/06/15 au 19/06/15

Jérémy Wicquart Impact d’herbicides sur Tetraselmis suecica sauvage et résistante au diuron

S. Stachowski non rémunéré Université de Nantes

Master 2 2/03/15 au 28/08/15

Léa Roclin Etude bibliographique sur les microplastiques en tant que support de contaminants chimiques en milieu marin

I. Amouroux Ifremer Université du Maine

Master 1 21/01/15 au 19/07/15

Josselin Hervault Le comportement biogéochimique de l’Ag en milieu estuarien, application à la Loire

C. Brach-Papa

J.F. Chiffoleau

Ifremer Université de Bordeaux 1

Master 1 5/01/15 au 24/02/15

Clément Tanvet L’analyse du MeHg dans des échantillons biologiques J. Knoery Ifremer UBO

Master 1 19/01/15 au 19/06/15

Héréiti Tavère l’étude de la contamination métallique du bar en Loire T. Chouvelon LabEx Cote Université de Toulon

Master 2 1/02/15 au 31/07/15

Roulet Logan Bilan de la contamination chimique du milieu marin côtier Breton à travers la mesure dans la chair de mollusque bivalve

J.F. Chiffoleau LabEx Cote Université d’Aix-Marseille

Master 2 2/03/15 au 31/08/15

Hélène Leca Détermination de normes de qualité environnementale et développements méthodologiques associés

M. Dallet Ineris Université de Lille


Licence Pro 23/02/15 au 24/07/15

Jérémy Palacios Détermination et quantification de 22 congénères de PCB dans des échantillons de poissions zèbres maintenus en contions expérimentales contrôlées

V. Loizeau Ifremer IUT de Sète

Apprentis

BTS chimiste 2/09/13 au 31/08/15

Antonin Padioleau

C. Tixier Ifremer CFA St Félix-La Salle, Nantes

BTS Chimiste pour 2 ans

3/09/15 Calvin Berthou C. Brach-Papa Ifremer CFA ST Félix-La Salle, Nantes

Accueil

2/04/15 au 5/06/15

Koffi Yao Etude comparative de la bioaccumulation du mercure et du methylmercure and les poissons estuariens de l’Ouest Africain, et de leur implication pour le risque humain

J. Knoery Contrat C2D – AMRUGE-CI Centre de recherches océanographiques

(Abidjan, Cote d'Ivoire)

- Accueil et encadrement de doctorants

Début de thèse (JJ/MM/AA)

Date de soutenance (JJ/MM/AA)

Sujets Etudiants accueillis Ecoles Doctorales d'inscription -N° de l'ED -Libellé de l'ED -Université de rattachement -Académie

Encadrements scientifiques (*) Dir. Thèse: Prénom, Nom (organisme) Co-encadrant: Prénom, Nom (organisme)

Structures d'accueil Libellé(s) + Localisation(s)

Convention CIFRE (oui/non)

Sources de financement

Email du doctorant

Nom Prénom

Nationalité

7/10/13 Identification des capacités métaboliques de l'huître creuse ainsi que des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans les effets embryotoxiques d'un herbicide, le diuron

Behrens Daphné

Française ED VENAM Dir. Thèse : Farida, Akcha (Ifremer)

Ifremer Nantes Non Ifremer [email protected]


3/01/11 Influence de la qualité de la matière organique dissoute (MOD) sur la toxicité des pesticides vis-à-vis des micro-algues le long d’un continuum eau douce-eau marine.

Coquillé Nathalie

Française ED Chimie, Bordeaux

Dir. Thése : Sabine Stachowski (Ifremer)

Ifremer Nantes Non LaBex Cote [email protected]

1/02/12 24/04/15 Etude chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, des anomalies génomiques provoquées par l'exposition à des concentrations environnementales d'herbicides: caractérisation des atteintes, étude de leur héritabilité et conséquences pour la survie et la croissance des naissains

Barranger Audrey

Française ED VENAM Dir. Thèse : Farida Akcha et Thierry Burgeot (Ifremer)

Ifremer Nantes Non Ifremer

Novembre 2014

Modélisation de la bioaccumulation des contaminants organiques dans le réseau trophique de la Sole Solea solea dans l’estuaire de la Gironde

Mounier Florence

Française ED 304 Sciences et Environnements, Université Bordeaux

Dir. Thèse Irstea – Bordeaux : Jérémy Lobry (Irstea) Co-encadrants Véronique Loizeau (Ifremer)

Irstea- Bordeaux : UR « Ecosystèmes Estuariens et Poissons Migrateurs Amphihalins (EPBX) », Ifremer Brest RBE/BE/LBCO

Non IRSTEA-Bordeaux – Ifremer

[email protected]

Novembre 2012

Devenir des Polybromodiphényléthers (PBDE) et des Polychlorobiphényles (PCB) chez la sole commune (Solea Solea) au cours du cycle de reproduction

Chambosse Mélanie

Française ED 497 Normande bio intégrative, Santé, Environnement

Dir. Thèse : Pr. Christophe Minier (Univ. Havre ; ONEMA) Co-encadrants Catherine Munschy/ Véronique Loizeau (Ifremer)

Univ. Havre : Laboratoire d’Ecotoxicologie – Milieux Aquatiques (LEMA), EA 3222 Ifremer Nantes RBE/BE/LBCO

Non Ifremer / Région Haute-Normandie


1/10/12 Dynamique saisonnière des

éléments traces, des nutriments et de la méiofaune benthique d'une vasière intertidale de l'estuaire de la Loire

Thibault Aubin

Française ED VENAM Dir. Thèse : Joël Knoery (Ifremer) Co-directeur : E. Gelin et E. Metzger (BIAF, Université Angers – Lemans)

Ifremer Nantes Non UNAM/OSUNA

01/10/15 Utilisation d’extraits d’échantillonneurs passifs de type POCIS pour l’étude des effets toxiques de pesticides sur micro-algues et bivalves, de leur transfert trophique et des effets associés

Dupraz Valentin

Française ED VENAM Directeur de thèse : Farida Akcha (Ifremer BE/EX) et Hélène Budzinski (EPOC/LPTC) Co-directeur de thèse : Sabine Stachowski (Ifremer RBE/BE/EX)

Ifremer Nantes + LPTC-EPOC (Bordeaux)

Non Bourse MRT Université de Nantes

[email protected]

11/12/15 Effets de l’exposition parentale au diuron sur le méthylome et le transcriptome de l’huître creuse Crassostrea gigas

Rondon Sallan

Rodolfo

Française ED Systèmes Intégrées en Biologie, Agronomie, Géosciences, Hydrosciences et Environnement (SIBAGHE)

Directrice de thèse : Caroline Montgnani (Ifremer) Co-directrice de thèse : Farida Akcha

Université de Montpellier

Non

01/12/2011 Polyaromatic hydrocarbons in marine environment: sources, distribution and effect on living organisms

Jelena Mandic

Croatie Université de Spilt

Directrice de thèse : Prof. Maja Pavela-Vrančić ; Co-direction de thèse : J. Tronczynski

Univesité de Spilt, Faculty for Marine sciences

s/o CDD/IOF [email protected]

(*) Un salarié Ifremer doit figurer dans l'équipe encadrante et dans les documents officiels de l'école doctorale d'inscription. Si ce n'est pas le cas, il doit encadrer le doctorant au quotidien et signer les publications dans le cadre des travaux menés.


Annexe 4: Partenariats

Collaborations extérieures, nationales, européennes et internationales, formalisées − scientifiques − socio-économiques.

L’unité BE est partenaire du LabEx Cote à Bordeaux et de l’IUML à Nantes. Avec le démarrage du projet PHYTOCOTE, des collaborations ont été établies avec deux partenaires bordelais, l’UMR EPOC et l’IRSTEA. Depuis 2012, le LBCM a développé une politique partenariale en lien avec ses implantations géographiques. Le laboratoire s’adosse ainsi à des comme l’Observatoire des Sciences de l’Univers de Nantes Atlantiques (OSUNA, www.osuna.univ-nantes.fr) ou des programmes fédératifs comme le programme MERMEX (http://mermex.pytheas.univ-amu.fr/). Ainsi le LBCM est directement adossé à un réseau académique plus proche des guichets de financement régionaux. Il contribue ainsi à la constitution de pôles environnementaux axés sur le continuum Terre/Mer. Cette initiative est notamment à l’origine des projets financés par la Région Pays de la Loire tels que RS2E (2012-2016) ou PolluSols (2015-2019). Dans une même dynamique, le LBCO a intégré l’OSUNA comme partenaire cette année afin de mieux ancrer ses activités et compétences au niveau régional et de valoriser au mieux ses équipements spécialisés. Une première collaboration avec les partenaires OSUNA (MMS – Université de Nantes) s’est organisée autour du projet CONTABEL financé par l’Agence de l’Eau Loire Bretagne.

L’unité BE sera rrattaché à l’ED et au déparetment Mer et Littoral de l’université Bretagene Pays de Loire.

Annexe 5: Valorisation

Rien à signaler

Annexe 6 : Fonctions de représentation assurées dan s les instances régionales, nationales, européennes ou internationa les

Comité de direction :

C. Brach-Papa : membre du comité de Direction de l’OSUNA.

Comités scientifiques :

F. Akcha : membre du Conseil Scientifique EC2CO-ECODYN.

T. Burgeot : membre du comité scientifique de l'action thématique DRIL/EC2CO

C. Brach-Papa : membre du Conseil Scientifique EC2CO-DRIL.

V. Loizeau: membre du Conseil Scientifique de l'action thématique EC2CO-ECODYN.

S. Stachowski : membre du Comité Scientifique du Groupe d’Ecotoxicoloige Microbienne (organisation d’un colloque et construction d’un RTP).

S. Stachowski : membre du Conseil Scientifique du programme Pesticides du Ministère de l’Ecologie, du Développement Durable et de l’Energie (évaluation et suivi de projets).


J. Knoery : membre du Comité Scientifique de l’Observatoire des Sciences de l’Univers Nantes-Atlantique

Groupes de travail DCSMM – OSPAR – CIEM-UNEP :

J.F. Chiffoleau : chef de file D8 DCSMM.

J. Tronczynski : membre de MSFD Expert Network on Contaminants (D8/D9).

T. Burgeot : membre du groupe Ospar sur la surveillance MIME.

T. Burgeot : membre du groupe de travail du CIEM sur les effets biologiques des contaminants chimiques (WGBEC).

J.F. Chiffoleau : membre du groupe Ospar sur la surveillance MIME.

Particiation JF Chifloeau au GT DCSMM comme pilote du D8

C. Tixier : co-présidence du groupe de travail du CIEM sur les sédiments marins (WGMS).

J. Tronczynski : European Community of Practice GEO-6 CoP, European Regional Assessment (UNEP/PNEU).

Commission Nationale de la Flotte Côtière (CNFC) :

J. Knoery : expert auprès de la Commission Nationale de la Flotte Côtière (CNFC).

J. Tronczynski : expert suppléant auprès de la Commission Nationale de la Flotte Côtière (CNFC).

Animation de Réseaux :

S. Stachowski-Haberkorn : membre du groupe d’animation scientifique du LabEx Cote (Bordeaux).

T. Burgeot : COPIL labEx Cote.

I. Amouroux : Correspondante chimie Aquaref Ifremer.

J. Knoery : membre du conseil scientifique de l’OSUNA.

E. Rozuel : membre du Conseil de l’OSUNA.

J. Tronczynski : Coordinating lead author GEO-6 Europe UNEP/PNUE.

J. Tronczynski : Coordination de la tache ST234 PERSEUS . Pollution by persistent organic pollutants and toxic metals in SES (12 partenaires / 31 scientifiques).

Comités éditoriaux :

T. Burgeot : membre du comité éditorial Environmental Science and Pollution Research.

T. Burgeot : membre du comité éditorial Xenobiotics.

T. Burgeot : membre du comité éditorial ISTE pour la rédaction d’un ouvrage en écotoxicologie.

J. Tronczynski : membre des comités éditoriaux Chemosphère et Oceanologia.


+ autres annexes en fonction de l’activité : Base d e données océanographiques

- Moyens techniques et développement technologique - Campagnes océanographiques - Activités des réseaux de surveillance - etc.

Campagnes océanographiques : CAMELIA 4 (30/09/15 – 09/10/15, la Loire et son estuaire) La campagne océanographique CAMELIA 4 (30 sept - 09 oct 2015) est venue clore le volet « caractérisation physico-chimique » du projet RS2E-OSUNA. Les 4 campagnes CAMELIA ont ainsi permis de fournir aux équipes scientifiques du consortium (IFREMER, BRGM, IFSTTAR, Universités de Nantes et d’Angers) les échantillons indispensables à la caractérisation de la zone d’étude et à l’évaluation de la contamination de l’estuaire de la Loire. La dernière phase du projet se focalise maintenant sur l’étude des processus biogéochimiques qui contrôlent les transferts des contaminants métalliques au sein des différents compartiments de l’estuaire. ROCCHSED 2015 (6/06/15 au 16/06/15) Les campagnes ROCCHSED sont rattachées au projet ROCCH (Réseau d’Observation de la Contamination CHimique) dans le cadre de la surveillance chimique du littoral (DCE, OSPAR…).

Documents

Rapportage annuel 2015 de l’Unité de Biogéochimie et … · 2020. 3. 31. · Direction scientifique – Juillet 2015 1 Réf. DS/MHTV 1417 Rapportage annuel 2015 de l’Unité