24
L’intérêt et l’apport de la caracté- risation génétique des populations de l’abeille domestique afin de contribuer au développement d’une apiculture durable. David G. BIRON, UMR CNRS 6023

risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

L’intérêt et l’apport de la caracté-risation génétique des populations de l’abeille domestique afin de contribuer au développement d’une apiculture durable.

David G. BIRON, UMR CNRS 6023

Page 2: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Apis mellifera, une

longue histoire évolutive

Premiers ancêtres (140 Ma)

Divergence dont sont issus les groupes actuels (≈ 0,7 – 1,3 Ma)

4 grands lignées : M, 0, C et A

Page 3: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

La variabilité morphologique et génétique d’A. mellifera

26 sous-espèces réparties en 4 lignées évolutives (Ruttner, 1988)

Page 4: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

L’abeille et sa « domestication »

* Jusqu’au début du 20ième siècle l’apiculteur est essentiellement un cueilleur

* Depuis l’invention de la ruche moderne: Développement de nouvelles pratiques apicoles -Transhumance des colonies et importations de reines

Grande influence potentielle sur

la diversité génétique de l’espèce

* Elevage de reines: (de plus en plus pratiqué )

* Insémination artificielle: (ponctuelle)

Véritable domestication

(influence le système de

reproduction)

Page 5: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Les conséquences des pratiques apicoles actuelles

Introduction

de caractères

non adaptatifs

Homogénéisation

Dispersion

des maladiesRéduction de

variabilité

Perte de

caractères

adaptatifs

Acarioses, Nosémoses…

Importations de reines ; Transhumances

Mouvements

de coloniesSélection

Choix de sous-espèces possédant des

caractéristiques recherchées

Page 6: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Situation en Europe de l’Ouest

Taux d’introgression en 2006

Page 7: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Outils pour caractériser la génétique des populations

de l’abeille domestique

Séquençage à haut débit Polymorphisme d'un seul nucléotide (SNP)

D’après David Eccles (Gringer)

Page 8: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Quels marqueurs génétiques ?

Où les trouver? 2- le noyau des cellules

(ADN nucléaire)

1- la mitochondrie: (ADN mitochondrial)

Dans les cellules

Page 9: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Quels marqueurs génétiques ?

1-ADN mitochondrial (origine maternelle de la colonie)

Amplification de la région par PCR

Page 10: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Quels marqueurs génétiques ?

2-ADN nucléaire (microsatellites caractérisant

les sous-espèces, origine paternelle)

Page 11: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Intérêts de la caractérisation génétique

Hôte Parasite Dialogue moléculaire et course à l’armement :

(i) Hôte (résistance versus tolérance)

(ii) Parasite (Virulence)

- Génome

- Transcriptome

- Protéome

- Génome

- Transcriptome

- Protéome

Abeille

domestique Microsporidie

Est-ce que des sous-espèces d’A. mellifera vivants dans un même environnement répondre différemment à l’infection par N. ceranae?

Page 12: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Fontbonne et al. , 2013. Inf. Gen. Evol. 17: 188–194.

Hôtes Parasite

Page 13: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Evaluation de la virulence de N. ceranae en mesurant des paramètres liés à la valeur adaptative (fitness) de l’hôte et du parasite

Mortalité de l’hôte Consommation de sucre par l’hôte

Succès du dévelop-pement du parasite

Page 14: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Mortalité cummulée de l’hôte à 10 j post-infection

Page 15: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Consommation cummulée de l’hôte à 10 j post-infection

Page 16: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Succès de développement du parasite à 10 j post-infection

Page 17: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Course à l’armement entre A. mellifera et ses pathogènes

Page 18: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Adaptation locale de populations d’A. mellifera

Page 19: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Préservation de patrimoine génétique

Page 20: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Préservation de patrimoine génétique

Page 21: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

CANEC: Auvergne

-Créé en 2015 ~ 40 municipalités impliquées

Page 22: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

FEDCAN: France

En 2016, 11 centres de préservation de l’abeille noire ont fondée une fédération européenne (FEDCAN)

Page 23: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

Merci de votre attention !

Page 24: risation génétique des populations - Anses - Agence ... · L’intérêt et l’apport de la araté-risation génétique des populations de l’aeille domestique afin de contribuer

-Histoire Evolutive de l’abeille domestique. -L’abeille et sa domestication. -conséquences d’introgression -Outils pour caractériser la génétique des populations de l’abeilles -Séquencage -ADNmitochondrial + Microsatellite sur ADN nucélaire -SNP -Intérêts de la caractérisation génétique -Cours à l’armement résistance versus tolérance -Adaptation locale de populations d’abeilles -Préservation de patrimoine génétique