Sciences des Productions Végétales

Licence 3 Sciences, Technologies, Santé

2021-2022

Sciences de la vie et de la terre

Sciencesdes

ProductionsVégétales

L3 SPV

SOMMAIRE

Contacts de la formation 02Calendrier 2021-2022 05 Présentation de la formation 07Volumes horaires et évaluations 09Contenu des enseignementsSemestre 5 13Semestre 6 17

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CONTACTS DE LA FORMATION

Assesseure à la PédagogieSandrine [email protected]

Responsable pédagogique et Président du JuryJérémy LOTHIERBureau Maison de la Recherche en végé[email protected]

Gestion de la scolarité et des examensCatherine GARREAUTél. : 02 41 73 54 [email protected]

Scolarité - ExamensBâtiment A, Rez-de-chaussée, Bureau A001 Horaires d’ouvertureLundi au vendredi 8h30 - 12h3013h30 - 17h00

PAGE 2 l CONTACTS

Directeur des études portail SVTBenjamin BARRÉ[email protected]

mailto:sandrine.travier%40univ-angers.fr?subject=

mailto:jeremy.lothier%40univ-angers.fr?subject=

mailto:catherine.garreau%40univ-angers.fr?subject=

mailto:benjamin.barre%40univ-angers.fr?subject=

CALENDRIER

Calendrier 2021 - 2022

PAGE 5 l CALENDRIER

> Dates d’examen indiquées à titre indicatif. > Les cours pourront reprendre plus tôt si la durée des examens est inférieure à celle mentionnée.

Semestre 5

Semestre 6

Rentrée et début des cours Vendredi 03 septembre 2021

Vacances d’automne Samedi 23 octobre 2021 au Lundi 01 novembre 2021

Fin des cours Mardi 07 décembre 2021

Révisions Mercredi 08 décembre 2021 au dimanche 12 décembre 2021

Examens Semestre 5 l Session 1 Lundi 13 décembre 2021 auVendredi 17 décembre 2021

Vacances de fin d’année Samedi 18 décembre 2021 au dimanche 02 janvier 2022

Jury Semestre 5 l Session 1 Vendredi 28 janvier 2022

Examens Semestre 5 l Session 2 Lundi 20 juin 2022 au vendredi 24 juin 2022

Début des cours Lundi 03 janvier 2022

Vacances d’hiver Samedi 12 février 2022 audimanche 20 février 2022

Fin des cours Vendredi 15 avril 2022

Vacances de printemps Samedi 16 avril 2022 au dimanche 24 avril 2022

Examens Semestre 6 l Session 1 Mercredi 27 avril 2022 aumardi 03 mai 2022

Jury Semestre 6 l Session 1 Jeudi 02 juin 2022

Examens Semestre 6 l Session 2 Lundi 27 juin 2022 au vendredi 01 juillet 2022

Jury Semestre 6 l Session 2 Lundi 18 juillet 2022

Présentation de la

formation

La licence 3 SPV comprend des enseignements fondamentaux parmi lesquels la Biolo-gie du développement et reproduction des plantes, la Biochimie et Biologie Cellulaire, la Génétique et la Bioinformatique. Ces enseignements donnent aux étudiants de so-lides connaissances du fonctionnement du végétal et son adaptation à l’environne-ment, du niveau cellulaire jusqu’au niveau de la plante entière. Ces enseignements préparent également à la poursuite des études au niveau Master, notamment le Master Biologie Végétal.La formation s’appuie sur les thématiques et les compétences développées dans les laboratoires de recherche impliqués dans la formation. Elle a également pour objectif de permettre aux étudiants de profiter des compétences locales dans le domaine du végétal (Pôle de compétitivité Végépolys).

Vous serez capable de mobiliser les compétences suivantes :

Compétences organisationnelles― Travailler en autonomie (élaborer un projet personnel de formation, établir des prio-rités, gérer son temps).― Effectuer une recherche documentaire en utilisant les technologies de l’information et de la communication.― Mettre en oeuvre un projet : définir les objectifs et le contexte, réaliser et évaluer l’action.

Compétences relationnelles― Communiquer : rédiger clairement, préparer des supports de communication adap-tés, prendre la parole en public et savoir présenter des supports, s’exprimer correcte-ment, notamment en anglais (niveau B1).― Travailler en équipe : s’intégrer, se positionner, collaborer.― S’intégrer dans un milieu professionnel (initiation).

Compétences scientifiques générales― Réaliser une étude : poser une problématique, construire et développer une argu-mentation, interpréter des résultats, élaborer une synthèse en faisant preuve d’esprit d’abstraction, proposer des prolongements.― Mettre en oeuvre une démarche expérimentale : utiliser les appareils et techniques de mesure les plus courants, identifier les sources d’erreur, analyser des données ex-périmentales et envisager leur modélisation, valider un modèle par comparaison de ses prévisions aux résultats expérimentaux.― Utiliser des logiciels d’acquisition et d’analyse de données― Utiliser des outils mathématiques et statistiques― Adopter une approche pluridisciplinaire pour résoudre des questions complexes.

Et aprèsLe Master, mention Biologie Végétal.

PAGE 7 l PRÉSENTATION DE LA FORMATION

VOLUMES HORAIRESÉVALUATION

SEMESTRE 5

PAGE 9 l VOLUMES HORAIRES - ÉVALUATION

* Report TP si > ou = à 10/20CT = Contrôle TerminalCC = Contrôle ContinuDA = Dispensé d’Assiduité

SSEEMMEESSTTRREE 55 3300 EECCTTSS

U.E. Matières

ECTS

Coe

ff. Volumes horaires Contrôle des connaissances

Tot. CM TD TP 1re session 2e Durée

Assidus D.A. session CT

PPAARRCCOOUURRSS SSPPVV--AA

UUEE11 SS55 ccoommmmuunn Anglais 3 0,3 18 0 0 18 CC CT CT 1h Mathématiques appliquées aux SVT 3 0,4 22 8 4 10 CC CT CT 1h30

UUEE22--BBIIOO Bio informatique Bioinformatique 2 0,4 13,4 6,7 6,7 0 CC CT CT 2h

UUEE33--BBCCMMPP//SSPPVV--AA Génétique

Structure, plasticité et intégrité du génome

4 0,6 40 20 12 8 0,7 CT

+ 0,3 TP

0,7 CC +

0,3 TP

0,7 CC +

0,3 TP 2h

UUEE44--BBCCMMPP//SSPPVV--AA Biochimie métabolique

Biochimie métabolique 6 1 54 24 12 18

0,7 CC +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP CT 2h

UUEE55--BBCCMMPP//SSPPVV--AA Physiologie des plantes

Physiologie du développement et de la reproduction des plantes

6 1 56 28 14 14 0,7 CT

+ 0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP* 2h

UUEE66--BBCCMMPP//SSPPVV--AA Mycologie et biologie des angiospermes

Mycologie 3 0,5 28 12 8 8 0,8 CT

+ 0,2 TP

0,5 CT +

0,5 TP CT 2h

Biologie des angiospermes

3 0,5 28 14 4 10 0,5 CT

+ 0,5 TP

0,5 CT +

0,5 TP

0,5 CT +

0,5 TP* 1h

PARCOURS SPV-B

UUEE11 SS55 ccoommmmuunn Anglais 3 0,3 18 0 0 18 CC CT CT 1h UE2-SPV-B Physiologie végétale

Physiologie végétale 6 0,9 51 23 12 16

0,8 CT +

0,2 TP

0,8 CT +

0,2 TP

0,8 CT +

0,2 TP* 2h

UE3-SPV-B Génétique Génétique 6 0,9 51 23 16 12

0,75 CT +

0,25 TP

0,75 CT +

0,25 TP

0,75 CT +

0,25 TP* 2h

UE4-SPV-B Microbiologie Microbiologie 5 0,9 51 23 4 24 CT CT CT 2h

UE5-SPV-B Biologie végétale

Biologie cellulaire végétale

5 0,9 51 24,3 4 22,7 0,5 CT

+ 0,5 TP

0,5 CT +

0,5 TP CT 2h

UE6-SPV-B Bioinformatique - Biostatistique - Isotopie

Bioinformatique- Biostatistiques 3 0,6 27 13 14 0 CC CT CT 2h

Isotopes stables en biologie 2 0,2 15 15 0 CC CT CT 1h

PAGE 10 l VOLUMES HORAIRES - ÉVALUATION

SEMESTRE 6

Attention : En seconde session, des oraux pourront remplacer les épreuves écrites lorsque l’effectif, la pédagogie ou la matière peuvent le justifier.

SSEEMMEESSTTRREE 66 3300 EECCTTSS

U.E. Matières

ECTS

Coe

ff. Volumes horaires Contrôle des connaissances

Tot. CM TD TP 1re session 2e Durée

Assidus D.A. session CT

UUEE11 SS66 ccoommmmuunn

Anglais 2 0,3 18 0 0 18 CC CT CT 1h Communication scientifique et orale

2 0,3 20 0 0 20 CC ORAL

ORAL 0h20

TER 2 0,5 0 0 0 0 CC

0,3 CT +

0,7 ORAL

0,3 CT +

0,7 ORAL poster

PARCOURS SPV

UE2-SPV Élaboration de la biomasse végétale

Facteurs physiologiques de l’élaboration de la biomasse

6 1 56 28 12 16 0,7 CT

+ 0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3TP* 2h

UE3-SPV Maladies et résistances des plantes

Maladies des plantes 3 0,5 26,7 10,7 4 12

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP* 1h

Génétique des résistances 3 0,5 29,3 13,3 12 4

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP* 1h

UE4-SPV Biologie cellulaire et génétique

Biologie cellulaire végétale approfondie

3 0,5 28 12 12 4 0,8 CC

+ 0,2 TP

0,8 CT +

0,2 TP

0,8 CT +

0,2 TP* 2h

Génétique des populations

3 0,5 28 4 16 8 CC CT CT 2h

UE5-SPV Physiologie de l’adaptation des plantes

Physiologie de l’adaptation des plantes

6 1 56 28 12 16 0,7 CT

+ 0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP

0,7 CT +

0,3 TP* 2h

* Report TP si > ou = à 10/20CT = Contrôle TerminalCC = Contrôle ContinuDA = Dispensé d’Assiduité

UUEE Stage en milieu professionnel

CONTENU DES

ENSEIGNEMENTS

SEMESTRE 5

Anglais

Responsable Sabrina SebtiIntervenants Sabrina Sebti, Romain Laudier, Virginie Picquet, Johanna Thomas

Contenu de l’enseignement Le cours d’anglais a d’abord pour objectif de permettre aux étudiant.es de continuer à travailler cinq des compétences traditionnelles en langue - compréhension écrite et orale, expression écrite et orale, et interaction orale - à travers des supports authen-tiques (articles, documentaires, documents audio et vidéo d’internet, graphiques…) et des activités variées (exercices de compréhension, d’expression écrite, jeux de rôle, débats, présentations orales…). Les étudiant.es sont également amené.es à étoffer leur vocabulaire, à améliorer leur prononciation, et à revoir certains points de langue le cas échéant.

PAGE 13 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Ue 1

Ue 1

Ue 2

Mathématiques appliquées aux SVTBiostatistics

Responsable Jean SecondiIntervenants Jean Secondi, Olivier Pays-Volard, Pierre-Cyril Renaud

Contenu de l’enseignement Le module vise à acquérir les bases de l’analyse de données par des approches sta-tistiques. La première partie vise à apprendre à construire un plan expérimental et à utiliser les méthodes d’exploration graphiques. La seconde partie aborde les principes généraux des tests d’hypothèse et la procédure de sélection d’une approche statistique paramétrique ou non paramétrique. La troisième partie détaille les principaux tests paramétriques et leur pendant non paramétriques utilisés en biologie et géosciences. La dernière partie porte sur les bases du calcul matriciel et son application dans les analyses statistiques multivariées.

BioinformatiqueBioinformatics

Responsable Claudine LandèsIntervenants Claudine Landès, Emmanuel Jaspard

Contenu de l’enseignement L’objectif de ce module est de donner aux étudiants des notions de programmation en python afin qu’ils puissent lire un code écrit en python et biopython (avec l’aide d’un tutorial) et de le modifier pour l’adapter à leur propre besoin (changement de format de fichier de données, extractions d’informations d’un fichier tabulé....). Les notions vues en cours seront mises en pratique en TD en salle informatique et par des exercices mis à disposition en distanciel.

>Parcours SPV-A


BCMP l SPV-AGénétique : Structure et plasticité des génomes

Responsable Marie-Christine Le Paven

Contenu de l’enseignement ― Structure des génomes. Génome des procaryotes (notion d’opéron), génome nu-cléaire des eucaryotes (différentes classes d’ADN), génomes cytoplasmiques (struc-ture, transmission et expression ; théorie endosymbiotique). Génomique. Expansion des génomes (polyploïdie, duplication de gènes, éléments transposables). Epigéné-tique.― Etude approfondie de la réplication. Différents mécanismes de réparation de l’ADN. ― Méthodes d’analyse de l’ADN (PCR, PCR quantitative, clonage, banque et criblage, séquençage). Polymorphisme et marqueurs moléculaires. Les différents champs d’ap-plication.

Ue 3

Ue 4

BCMP l SPV-ABiochimie métaboliqueMetabolic biochemistry

Responsable Benjamin Barré

Contenu de l’enseignement Cet enseignement permet d’appréhender à la fois l’universalité et la diversité du méta-bolisme énergétique d’une cellule eucaryote animale et végétale (la glycolyse, la neo-glucogénèse, le cycle de l’urée, le cycle des pentoses phosphates, chaine respiratoire, phosphorylations oxydantes les interactions de C/N, le cycle de krebs, l’autophagie, les transporteurs navettes, les espèces réactives de O/N), et de se familiariser avec les grands modes de régulations métaboliques en réponse aux changements de l’environ-nement (Flexibilité du métabolisme et adaptations).

Ue 5

SPV-APhysiologie du Développement et de la Reproduction des Plantes

Responsable Claire Campion

Contenu de l’enseignement Le module traite des grands mécanismes qui régissent le développement et repro-duction des plantes, et en particulier des mécanismes permettant la détection et la réponse aux signaux environnementaux, que ce soit dans l’environnement naturel ou dans un contexte agronomique. L’objectif est d’acquérir une bonne compréhension des aspects physiologiques et moléculaires de la photomorphogénèse, de la floraison, du développement des semences et des fruits sont abordés. Une partie de l’enseignement pourra être dispensée en anglais.

SPV-ABiologie des angiospermes et mycologie

Biologie des angiospermesResponsable Alain Vian

Contenu de l’enseignement Connaître la morphologie des fleurs et des inflorescences, ainsi que les modalités des sporulations et de mise en place des gamétophytes. Connaître les modalités de la

Ue 6


Ue 2

Ue 3

pollinisation, les mécanismes d’auto-incompatibilité ainsi que le mécanisme de double fécondation. Connaître les différentes formes d’apomixie, ainsi que la typologie des graines et des fruits.

Mycologie Responsable Thomas Guillemette

Contenu de l’enseignement Ce module permet d’acquérir des connaissances générales sur les mycètes en consi-dérant notamment leurs structures et organisations, leurs modes de vie et leurs rôles dans l’écosystème. Le contenu des enseignements magistraux est illustré lors des séances de TP qui consistent principalement en l’isolement et l’observation d’un grand nombre de mycètes et en l’analyse de leur croissance.

>Parcours SPV-B

Anglais



Ue 1

SPV-BPhysiologie végétale


Contenu de l’enseignement Le module traite des concepts fondamentaux de la physiologie végétale : nutritions hydrique, minérale et carbonée ; métabolisme carboné et transduction de l’énergie (photosynthèse et respiration) ; développement (germination, floraison) et sa régu-lation (photomorphogénèse, régulateurs de croissance). L’impact de l’environnement (sol, climat, atmosphère) sur le fonctionnement des plantes est abordé.

SPV-BGénétiqueGenetics

Responsable Catherine Aubry

Contenu de l’enseignement ― Transmission de l’information génétique : Historique. Génétique et divisions cellu-laires. Monohybridisme, dihybridisme, indépendance, interactions géniques et liaison

génétique. Etablissement de cartes génétiques. Hérédité liée au sexe.― Flux de l’information génétique : Rappels de la structure et des propriétés des acides nucléiques. Mécanisme de réplication. Structure et fonction des gènes: méca-nismes de transcription et de traduction. Techniques d’analyse de l’ADN (PCR, clonage, séquençage,…) et de l’expression des gènes (RT-PCR, Q-RT-PCR, puces à ADN, wes-tern-blot,..). Les différents types de mutations et leurs conséquences sur l’expression des gènes.― Structure des génomes : Organisation du génome nucléaire des eucaryotes. Les différentes classes d’ADN. Structure et expression des génomes cytoplasmiques. Théo-rie endosymbiotique. Génomique. Expansion des génomes (polyploïdie, duplication de gènes, éléments transposables). Epigénétique.

SPV-BMicrobiologieMicrobiology

Responsable Thomas Guillemette

Contenu de l’enseignement L’organisation cellulaire, la place dans le monde vivant, les modes trophiques, ainsi que les grands groupes taxonomiques des principaux microorganismes (bactéries, champi-gnons) seront présentés.

Au niveau pratique, les étudiants pourront se familiariser avec les techniques fonda-mentales de la microbiologie : cultures de bactéries et champignons sur milieu synthé-tique, respect et mise en œuvre des conditions d’asepsie et de stérilité, mise en œuvre de critères morphologiques et biochimiques dans un but d’identification.

Ue 4

SPV-BBiologie végétale

Responsables Nathalie Leduc, Alain Vian

Contenu de l’enseignement Connaître les caractéristiques histologiques des principaux tissus végétaux et leurs fonctions ainsi que l’anatomie des organes végétatifs des Angiospermes. Savoir in-terpréter les caractères histologiques d’un organe végétal en lien avec son âge, ses fonctions physiologiques, ainsi que l’environnement de la plante. Connaître les carac-téristiques de la reproduction (multiplication végétative et reproduction sexuée) des différents phylums végétaux.

Ue 5


SPV-BBioinformatique – Biostatistique - IsotopieBioinformatics – Biostatistics - Isotopy

Responsables Claudine Landès l Benjamin Barré l Anis Limami

Contenu de l’enseignement En s’appuyant sur la lecture d’articles proposés par l’enseignant et par les étudiants, une réflexion sera menée en groupe sur le végétal en tant qu’être vivant en interaction avec d’autres vivants dans son écosystème et sur le végétal dans un système de pro-duction où il devient un produit, une marchandise ou encore une usine de production de molécules.

Ue 6


SEMESTRE 6

Anglais



Ue 1

Communication scientifique et orale & TERScientific oral communication - Scientific writing and communication

Responsable Anis Limami

Communication scientifique et oraleContenu de l’enseignement Les étudiants sont entrainés à communiquer des résultats scientifiques oralement en s’aidant d’un support iconographique (Power Point) ou à l’aide d’affiche (Poster). L’ob-jectif est d’apprendre à structurer un message et à le présenter avec rigueur et conci-sion. Cette formation est utilisée par les étudiants pour présenter oralement leur travail de TER.

Travail Encadré de RechercheContenu de l’enseignement Les étudiants sont encadrés par un tuteur qui les initient à la recherche bibliogra-phique. Dans cet exercice les étudient participent à la définition des contours de leur sujet de recherche. Ils compulsent la bibliographie, en extraient l’information utile à leur thématique et rédigent un mémoire d’une dizaine de pages. Ce travail est présenté oralement en une dizaine de minutes.

Ue 1

Facteurs Physiologiques de l’Elaboration de la Biomasse Végétale


Contenu de l’enseignement Comprendre comment les processus physiologiques (du niveau cellulaire/moléculaire à celui de la plante entière), et les interactions avec des facteurs externes (abiotiques : sol, climat) et biotiques (symbiotes et pathogènes) agissent sur l’élaboration de la biomasse végétale, dans le contexte agronomique, par exemple pour la production de biocarburants.

Ue 2


Maladies des plantes, génétique et résistance

Responsable Romain Berruyer

Contenu de l’enseignement ― Fondements de la phytopathologie : symptômes, dégâts, diagnostic, épidémio-sur-veillance et méthodes de lutte. Présentation des grands groupes d’agents pathogènes. Types de résistance des plantes aux maladies.― Cartographie génétique : descendances et marqueurs moléculaires.― Génétique quantitative : valeur phénotypique, valeur génotypique, interaction géno-type-milieu, valeur allélique. La notion de QTL est abordée de façon simplifiée.

Ue 3

SPV-BOPBiologie Cellulaire Approfondie et Génétique des populationsCell Biology and population genetics

Biologie Cellulaire ApprofondieResponsable David Macherel

Contenu de l’enseignement Acquérir des connaissances sur l’adressage des protéines dans les cellules végétales et sur les approches actuelles en biologie cellulaire des plantes. Réaliser des observa-tions de la dynamique des organites et s’initier à l’analyse d’image en microscopie à fluorescence.

Génétique des populationsResponsable Romain Berruyer

Contenu de l’enseignement Fondements de la génétique des populations. L’équilibre de Hardy-wainberg, la consan-guinité. La dérive, une marche aléatoire. Étude de la dérive en termes de consanguini-té, étude de la dérive en termes de diversité. Les mutations. Intégration de la dérive et des mutations : la théorie neutraliste de l’évolution moléculaire. Migrations, sélection.

Ue 4

Physiologie de l’adaptation des plantesPlant Physiological Adaptations

Responsable David Macherel

Contenu de l’enseignement Acquérir une solide compréhension des mécanismes d’adaptation photosynthétiques et de réponse des plantes aux stress abiotiques, ainsi que de leur importance en matière de productivité des cultures.Développer un sens critique et amorcer une capacité d’innovation pour aborder des questions relatives à la physiologie et à l’adaptation des plantes.

Ue 5

Impr

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Administration ı Scolarité ı Enseignement (Amphi A à E)Biologie végétale ı Physiologie végétale ı Travaux pratiques biologieTravaux pratiques biologieTravaux pratiques chimieDépartement de Géologie ı Recherche environnement (LETG -LEESA) ı Recherche géologie (LPGN-BIAF)Travaux pratiques physiqueEnseignement ı Travaux pratiques physiqueDépartement de Physique ı Recherche physique (LPHIA)Travaux pratiques biologieDépartement de Biologie ı Recherche neurophysiologie (SIFCIR) ı Travaux pratiques biologie, géologieDépartement Informatique ı Recherche Informatique (LERIA) ı Travaux pratiques géologieDépartement Mathématiques ı Recherche Mathématiques (LAREMA)Chimie enseignement ı Travaux pratiquesDépartement de Chimie ı Recherche Chimie (MOLTECH Anjou)Espace multimédia ı Enseignement (Amphi L001 à L006) ı Salle d’examen rez-de-jardin

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ParkingPersonnels

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2 Boulevardde Lavoisier

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Entrée et sortieVéhicules

Entrée et sortieVéhicules

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2, Boulevard Lavoisier49045 ANGERS CEDEX 01T.0241735353www.univ-angers.fr

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