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TIMC-Année 2 RAGTIME Laurent Desbat TIMC-IMAG 17 janvier 2002

TIMC-Année 2 RAGTIME

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TIMC-Année 2 RAGTIME. Laurent Desbat TIMC-IMAG 17 janvier 2002. Participants de TIMC. TIMC Responsable du projet : Laurent Desbat, Pr. UJF. Participants : Yohan Payan, CR CNRS. Anne Bilgot, thésarde 3ième année (sur l’identification d’organes osseux à partir de projections radiographique) - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: TIMC-Année 2 RAGTIME

TIMC-Année 2RAGTIME

Laurent Desbat

TIMC-IMAG

17 janvier 2002

Page 2: TIMC-Année 2 RAGTIME

Participants de TIMC

• TIMC– Responsable du projet : Laurent Desbat, Pr. UJF.– Participants : Yohan Payan, CR CNRS.– Anne Bilgot, thésarde 3ième année (sur l’identification d’organes

osseux à partir de projections radiographique)– Nicolas Capit, ingénieur (CCD du projet CIMENT GRID)– Cecile Amblard, MdC, UPMF (co-encarde Florent Chatelain)

• PRAXIM : – Stéphane Lavallée PDG,– Antoine Leroy (suivi du projet MI3 et du projet RAGTIME),

interface avec la station surgetics de PRAXIM pour la navigation dans un modèle géométrique d’organe (identifié à partir d’images radiologiques en salle d’opération)

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Travail réalisé

• A1 [Statistique de forme] : pas d’ADR = faible avancement mais bourse obtenue dans le cadre des allocations doctorales prospectives (candidat perdu car résultat fin octobre mais mais nouveau candidat, Mr Aramouni, Liban, a débuté le travail (mais en attente d’une carte de séjour).

• A2 [Fusion SPECT/CT] : pas d’ADR mais une publication en collaboration avec l’IN2P3 (pour la simulation du diffusé par Monte Carlo).

• Travaux sur l’échantillonnage en tomographie hélicoïdale + en tomographie dynamique (plusieurs publications).

• Contribution à CiGri (lien avec RAGTIME) : mise en place de la grille CiGri par Nicolas Capit

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Publications• Journaux

– [RI 19] L. Desbat, S. Roux, P. Grangeat, and A. Koenig. Sampling conditions of 3D Parallel and Fan-Beam X-ray CT with application to helical tomography. Phys. Med. Biol., 49(11), 2377-2390, 2004.

– [RI 18] S. Roux, L. Desbat, A. Koenig, and P. Grangeat. Exact reconstruction in 2D dynamic CT: compensation of time-dependent affine deformations Phys. Med. Biol., 49(11):2169-82, 2004.

• Conférences– [CCLDRA 34] L. Desbat Sampling conditions and ecient schemes in helical tomography, In Abstracts of papers

presented to the AMS, Vol. 26(1) Issue 139, 1003-65-1512, pages 172, 2005.– [CCLDRA 33] F. Chatelain, L. Desbat, J.-F. Moreira, C. Amblard, V. Breton. SPECT/CT Registration with the

DCC and MC Simulations for SPECT Imaging, In IEEE, MIC conference proceedings, M9- 223, 2004– [CCLDRA 32] A. Bilgot, V. Perrier, L. Desbat Wavelets, Local Tomography and Interventional X-Ray

Imaging, In IEEE, MIC conference proceedings, paper M9-183, 2004– [CCLDRA 31] V. PERRIER, O. LE-CADET, A .BILGOT, L. DESBAT Ondelettes et Imagerie Médicale, In

CANUM 04, pages 3241, 2004.– [CCLDRA 30] L. Desbat, S. Roux, P. Grangeat and A. Koennig. Echantillonnage de la transformée en rayons-

X 3D, applications à la géométrie hélicoïdale In CANUM 04 , pages 138, 2004.– [CCLDRA 29] A. Bilgot, V. Perrier and L. Desbat. Inversion locale de la transformée de Radon par ondelettes.

In CANUM 04 , pages114, 2004.– [CCLDRA 28] S. Roux, L. Desbat, A Koenig and P. Grangeat. Méthodes analytiques de compensation des

déformations en tomographie dynamique. In CANUM 04 , pages 195, 2004.– [CCLDRA 27] P. GRANGEAT, A. KOENIG, S. BONNET, P.HUGONNARD, S. ROUX, J. KIMDON and L.

DESBAT. La compensation du mouvement en tomographie X dynamique. In CANUM 04 , pages 6263, 2004.• Thèse

– Sébastien Roux Modèles dynamiques en tomographie. Application à l’imagerie cardiaque.thèse de Maths applis, UJF Grenoble 1, le 14 octobre 2004.

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Perspectives année 3

• SPECT / CT et correction du diffusé– Collaboration V. Breton IN2P3 avec un étudiant Mr

Aoun (demande de bourse CNRS BDE).

• Modèle déformable : la thèse de Mr. Amarouni (bourse Région Prospective) vient de débuter (officieusement car attente de carte de séjour).

• Tomo dynamique : généralisation à des déformations non-affines en cours (conférence orale à 3D05, Salt Lake City, Desbat, Roux, Grangeat).

Page 6: TIMC-Année 2 RAGTIME

Tomographie dynamique : applications cardiaques

Enjeu des études cardiaques : diagnostic précoce

•Études cinétiques et fonctionnelles

•Études non invasives des coronaires

Avantages des scanners X en cardiologie:•Facilité d’accès en milieu hospitalier et usage accepté

•Pas de contre-indication /patient ( IRM)

•Non invasif ( usage catheter)

•Forte résolution spatiale (études cardiovasculaires)

www.imp.uni-erlangen.de/

Page 7: TIMC-Année 2 RAGTIME

Tomographie par rayons X : dispositif d’acquisition

RX

Page 8: TIMC-Année 2 RAGTIME

Tomographie X : dispositif d’acquisition

RX

Page 9: TIMC-Année 2 RAGTIME

Tomographie X : dispositif d’acquisition

RX

Page 10: TIMC-Année 2 RAGTIME

Rotation continue : tomographie dynamique

IMAGERIE D’UN VOLUME DYNAMIQUE : RECONSTRUCTION 4D

Evolution des scanners:

- augmentation du nombre de coupes acquises simultanément 64

- augmentation de la vitesse de rotation 0.4s

temps

t1

t2t3

t4

O

Page 11: TIMC-Année 2 RAGTIME

Modélisation du problème de reconstruction

x

0

z

0

O x1

x2

rayon(,) ou

Géométrie 2D éventail

rayon

Géométrie 3D conique

plan de détection

Géométrie 2D parallèle

O x1

x2

rayon(,s)s

)(

)(a

)(a

),(

),(

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Opérateur de déformation

f(t0)S(t1))

S(t2)) S(t3))

acquisition réelle à t=t1

Géométrie virtuelle d’acquisition (temps de référence t0)

(t1) (t3)(t2)

S(t1) f(t1) f(t2) f(t3)

S(t2) S(t3)

acquisition réelle à t=t2 acquisition réelle à t=t3

Trajectoire de la source

Trajectoire virtuelle de la source

))(()( 0 xfxf tt

Page 13: TIMC-Année 2 RAGTIME

Propriété des déformations affines

O x

y

a(

n

trajectoire réelle

O x

yA

Tn

a(

objet de référence f0O x

y

O

s

objet dynamique f

ns

O x

y

s’ nbAss

.' 1O

même mesure

)(a

source path

zxy

))(()(0 aa

x

0

z

0y0

A

même mesure

même mesure

objet de référence f0

objet de référence f0

objet dynamique f

objet dynamique f

trajectoire virtuelle

trajectoire réelle

trajectoire virtuelle

)(

)(

)()(

)()()(

2

1

2221

12110 tb

tbx

tata

tataBxAxx tttttt

Page 14: TIMC-Année 2 RAGTIME

Test sur un mouvement respiratoire

)(

0

)(0

0)()(

20

22

110

b

xa

axx

a

b

0,7

0,8

0,9

1

1,1

1,2

1,3

0 90 180 270 360

0,7

0,8

0,9

1

1,1

1,2

1,3

0 90 180 270 360

-15

-10

-5

0

5

10

15

0 90 180 270 360

a

Page 15: TIMC-Année 2 RAGTIME

a) b)

d)c)

Résultats (=300°)

a) exactb) short scanc) méthode de Crawfordd) avss

Page 16: TIMC-Année 2 RAGTIME

SPECT/CT registration with the DCC and MC simulations for

SPECT imaging

F.Chatelain1, J.F.Moreira2, C.Amblard3, L. Desbat1 , V. Breton2

1TIMC-IMAG, UMR CNRS 5525, IAB, Faculté de Médecine, UJF, 38706 La Tronche (Grenoble FRANCE)

2LPC, CNRS/IN2P3, Campus des Cézeaux 63177 Aubière Cédex 1, FRANCE.3LabSAD, UPMF, BP 47, 38040 Grenoble Cédex 9, FRANCE.

Page 17: TIMC-Année 2 RAGTIME

Results of the DCC 3D optimization

True activityActivity after DCC optimization

Activity without DCC optimization

True attenuationInitial attenuation Attenuation after

DCC optimization

Page 18: TIMC-Année 2 RAGTIME

DCC and MC methods cooperation

DCCoptimization

Diffusion correctionwith MC

Data d ; diffusion data estimation dd model 0 ; initial estimation T, such that x=0(Tx)

g=d-ddActivity f estimation(Novikov)

(x)=0(Tx)g,T f

T opt

g=d-dd

dd

d