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Le titre, les tableaux et les graphiques

Professeur François Kohler Septembre 2007

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Le titre

• Une gageure avec une apparente contradiction :– Court– Simple– Complet

• Pour relever le défi :– Pas de bois mort– Position forte respectée

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Un bon titre

• Commence par les mots importants

• Contient (uniquement) les mots indispensables

• Dit l’essentiel=> Choisir les mots clés

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Exemple

• Devenir des femmes fistuleuses. Notre expérience sénégalaise.

• Suivi sur 5 ans d’une cohorte de 250 femmes fistuleuses sénégalaises.

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Exemple

• Les bandelettes urinaires dans le diagnostic de l’infection du liquide d’ascite

• Caractéristiques diagnostiques de la bandelette urinaire par rapport à l’examen cytobactériologique dans l’infection du liquide d’ascite. Etude cas témoins sur 200 sujets.

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Présentation des résultats : Tableaux et paramètres

• Les distributions de fréquences• Les paramètres statistiques

– Une moyenne, un pourcentage seul ne veulent rien dire.

– Ils doivent être accompagnés :• De l’effectif • D’un paramètre de variabilité

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Distribution Distribution des 200 poids observés

Poids (kg) Effectif FréquenceEffectifCumulé

FréquenceCumulée

52 1 0,01 1 0,01

53 5 0,03 6 0,03

54 8 0,04 14 0,07

55 10 0,05 24 0,12

57 12 0,06 36 0,18

58 15 0,08 51 0,26

59 18 0,09 69 0,35

60 22 0,11 91 0,46

61 25 0,13 116 0,58

63 21 0,11 137 0,69

64 18 0,09 155 0,78

65 16 0,08 171 0,86

67 10 0,05 181 0,91

68 8 0,04 189 0,95

69 5 0,03 194 0,97

70 3 0,02 197 0,99

71 2 0,01 199 1,00

72 1 0,01 200 1,00

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Table de contingence

• Ethylisme et tabac

  Cancer du

poumon + Cancer du

poumon - Total

Ethylisme +

73

927 1 000

Ethylisme -

37

963 1 000

Total

110 1

890 2 000

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Table de contingence

• Pour une case– Effectif de chaque case– Pourcentage en ligne– Pourcentage en colonne– Fréquence

• Notion d’indépendance• Reproductibilité/Indépendance

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Table de contingence

• Fréquences relatives– Cancer chez les éthyliques : R1 = 73/1000– Cancer chez les non éthyliques: R0 = 37/1000

• Risque relatif – RR = R1/R0 = 0,073/0,037 =1,97

• Cote (Odds) (cf course de chevaux)– Chez les éthyliques R1/(1-R1) = 0,79– Chez les non éthyliques R0/(1-R0) = 0,038

• Odds ratio ou rapport de cotes– OR = 0,79/0,038 = 2,05

• L’OR est souvent utilisé en épidémiologie. Si la fréquence de la maladie est faible, les valeurs de OR et de RR sont très proches.

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Table de contingence  Les effectifs sont donnés

dans chaque caseCancer dupoumon +

Cancer dupoumon - Total

Tabagisme +

 

Ethylisme +

70

630 700

Ethylisme -

30

270 300

Total

100

900 1 000

Tabagisme -

 

Ethylisme +

3

297 300

Ethylisme -

7

693 700

Total

10

990 1 000

Total  

10 1 890 2 000

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Table de contingence• Chez les fumeurs, la fréquence du cancer est de 100/1000 = 0,1 contre 10/1000

= 0,01; RR = 10– Le tabagisme est un facteur de risque pour le cancer du poumon, car les fumeurs ont 10

fois plus de risque de développer un cancer du poumon que les non-fumeurs.

• Quel est le RR d'être alcoolique pour les fumeurs par rapport aux non fumeurs ?RR = 700/1000 / 300/1000 = 2,3

– Il existe une association entre le tabagisme et l'éthylisme. Les fumeurs ont 2,3 fois plus de chance d'être alcooliques que les non-fumeurs.

• Le tabagisme est un facteur de confusion dans cette étude, les données doivent être analysées en tenant compte de cette variable.

• Calculer le RR (éthylisme) dans chaque strate ?Tabagisme+ RR = 70/700 / 30/300 = 1Tabagisme - RR = 3/300 / 7/700 = 1

• L'association entre éthylisme et cancer du poumon dans les données brutes (RR = 1,97) est le produit d'un biais de confusion. Car à l'intérieur des différentes strates du "tabagisme" il n'existe aucune association entre éthylisme et le cancer du poumon : RR = 1.

Intérêt des études multivariées

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Les paramètres• De position

– Moyenne arithmétique– Médiane– Quartiles et percentiles– Fréquence (relative) : pourcentage

• De dispersion– Amplitude– Variance et écart type (es, sd)– Ecart type de la moyenne– Coefficient de variation– Ecart type de la moyenne (esm, sdm)

• L’intervalle de confiance

• RR et OR

• Dans le paragraphe matériel et méthodes on précise ce qui est fourni :– « Les moyennes sont accompagnées de l’écart type de la moyenne »

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Les tableaux de paramètres

• Résument les résultats• Vérifier que pour chaque

paramètre – Les effectifs sont fournis. Attention au

pb des valeurs manquantes s’ils ne sont pas égaux

– Les moyennes sont accompagnées d’un paramètre de dispersion

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P : degré de signification

• Risque alpha (1ére) et beta (2ième espèce)

• p• Puissance d’un

test

Réalité

= #

Test =

Beta

#

Alpha

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Tableau de paramètres

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Tableau de paramètres

Facteurs de risque significativement associés au décès en analyse multivariées

Eléments de comparaison OR* IC 95%** p

Age (années) 1,14 1,06-1,22 0,0001

Sexe masculin 3,62 1,40-9,33 0,0070

Escarre (présence) 2,96 1,17-7,40 0,0200

Sonde à demeure (présence) 3,44 1,00-11,8 0,0500

Préalbumine (mg/L) 1,42 0,71-2,32 0,0600

Comorbidités 1,60 1,00-2,23 0,0500

SAMR 6,14 1,69-10,3 0,0020

* Odds Ratio ajusté sur l'ensemble des facteurs présents dans le modèle

** Intervalle de confiance à 95%

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Graphiques

• Histogramme• Diagramme sectoriel• Nuage de points• Courbe de survie• Box plot• Pareto courbe ABC• …

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Histogramme

• Variable quantitative mise en classe• Rectangle dont la surface est

proportionnelle à l’effectif (ou l’effectif cumulé ou la fréquence ou la fréquence cumulée de la classe)– => La hauteur est proportionnelle à ni/i

• Excel® ne fait pas d’histogramme si les classes ne sont pas de même amplitude

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HistogrammeClasse Effectifs Densité (*10)

[140-160[ 10 5

[160-165[ 20 40

[165-170[ 30 60

[170-175[ 45 90

[175-180[ 40 80

[180-185[ 35 70

[185-190[ 15 30

[190-200[ 5 5140 160 170 180 190

010

20

3040

50

60

7080

90

200

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Diagramme sectoriel

Groupe EffectifsA 35B 9O 40AB 16

A

BO

AB

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Quel objectif ?

• Un tableau

0 + ++ Total

Groupe A

20

10

5

35

Groupe B

10

5

40

55

Total

30

15

45

90

Intensités des cuti réactions dans chaque groupe (effectifs)

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Une représentation

0+++

Groupe A

0+++

Groupe BGroupe A Groupe B

0 + ++

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Une autre

0 + ++0

10

20

30

40

50

Groupe AGoupe B

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Une dernière

0 + ++0

100

200

300

400

500

600

700

800

900

1000

0

50

100

Goupe BGroupe A

Où est le piége

Valeur

Gou

pe B

Gro

upe

A

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Nuage de points

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Nuages de points/Régression-corrélation

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Courbes de survie

Kapla – Meier. Les intervalles de confiance à 95% sont indiqués par les barres verticales

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Box Plot / Moyenne et IC

71 210 268 342 741

A B C D

mg/L

100

50

0

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Courbe ABC et Pareto

Effectif % de anomaliesDossier comportant des piéces non "signées" 180 39,74%Délai de la lettre de sortie noin respecté 150 33,11%Absence d'une piéce réglementaire 80 17,66%Doosier ne permettant pas de retrouver la démarche clinique 30 6,62%Dossier comportant des piéces sans identification du patient 10 2,21%Dossiers non retrouvés 3 0,66%Total 453 100,00%

0,00%

10,00%

20,00%

30,00%

40,00%

50,00%

60,00%

70,00%

80,00%

90,00%

100,00%

Dossiercomportant des

piéces non"signées"

Délai de la lettrede sortie noin

respecté

Absence d'unepiéce

réglementaire

Doosier nepermettant pasde retrouver la

démarcheclinique

Dossiercomportant des

piéces sansidentification du

patient

Dossiers nonretrouvés

Anomalies rencontrées lors du contrôle de qualité des dossiers médicauxNombre de dossiers analysés = 200, Nombre d’anomalies trouvées = 453

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Recommandations générales

• Tableaux et figures– Doivent être compréhensibles indépendamment du

texte (titre, légendes, unités,…)– Ne doivent pas dupliquer l’information fournie dans

le texte– Ne doivent pas se dupliquer les uns les autres– Doivent apparaître au bon moment– Doivent être appelés dans le texte– Doivent respecter les règles de mise en forme

(alignement décimal, NA ou DM,…)– Doivent respecter les règles usuelles de présentation

• En colonne Malades/Non Malades, en ligne Test +/ Test – ou facteur d’exposition + et - …