Nicolas Larrousse – Risc – CNRS UMS 3332

Journée "Sciences Cognitives & Informatique"

Quels outils informatiques pour

les Sciences Cognitives ?

Formations Outils

informatique & modélisation

Rencontres et échanges Forum des Sciences Cognitives Foire aux logiciels Animation du Réseau COGITER

Diffusion d'information Annonces générales

Séminaires … Bases de données

Laboratoires Formations en sciences cognitives

Bibliothèque spécialisée Vidéothèque

Collecte et diffusion petite réalisation

Nouveau site dynamique, fils RSS, envois automatisés

… Activités traditionnelles

Activités nouvelles Annuaires

Hébergement lourd ou léger

Portail

http://www.risc.cnrs.fr

Le réseau Cogiter a pour but de favoriser les contacts entre ingénieurs, techniciens et chercheurs, permettant à chacun de proposer ses savoir-faire et en retour de trouver du soutien et des réponses à ses questions.

http://cogiter.risc.cnrs.fr

Formations

Liste de diffusion & site

Journées Thématiques Occulomotricité

Statistiques

Synchronisation de signaux

CNIL et expérimentation humaine

COGITER Un réseau d’ingénierie pour les Sciences Cognitives

La recherche en Sciences Cognitives

Stimulus (expérience)

Recueil des données

Traitement des données & Analyse

Modélisation

Simulation

Contraintes liées aux Sciences Cognitives

Diversité des dispositifs de recueil de données

Données liées à l’expérience (stimulus)

Questionnaires Images Sons Vidéos Données sites Web TMS …

Données physiologiques & comportement

Occulomètre (eye-tracker) EEG MEG IRM NIRS

Contraintes liées aux Sciences Cognitives

Temporalité importante

Synchronisation des signaux

Temps de réaction

Stimulis et Créations d’expériences

Développements spécifiques python – Matlab …

Expériences en ligne Éventuellement associées au « Mechanical Turk » d’Amazon

Outils dédiés SPOT - EPrime

Récupération et traitement des données

Librairies génériques EEGLAB Développements spécifiques

Brain Storm (Matlab)

Intégré de l’expérience au résultat E-Prime

Interfaces « universelles » LabView

Récupération et traitement des données Synchronisation de signaux

Logiciel Open Electrophy par Samuel Garcia

Mixte RTMap (intempora)

Plateforme d’acquisition de données de tous types, d’enregistrement et de traitement, en temps réel Outil de mesure multicapteur Programmation graphique …

Dispositif intégré Poste animal d'enregistrement des signaux comportementaux et electrophysiologiques Par Roméo Salemme

Modélisation

Réseaux de neurones

Génériques en Java DynNet & GynNet Loria

Système auditif

Brian (python) par Romain Brette

from brian import *# Neuron model parametersVr = -70*mVVt = -55*mVtaum = 10*mstaupsp = 0.325*msweight = 4.86 * mV

Modélisation Bayésienne du cortex visuel

Analyse et Visualisation

Traitement Visualisation

Matlab Python Perl …

Statistiques

R Statview Excel …

Traitements avancés

Prox par Bruno Gaume Visualisation, recherche etc … dans des Bigraphes …

Ressources complémentaires Corpus normalisés

Lexique CRDO

Ressources orales (modalités accès + projets archivage)

Les mots du Français (méta données + outils)

OB3D

Objets 3D

Des logiciels « à tout-faire » A la découverte du Cerveau : le

« Cerveaurium » Du « bio feed-Back » dans l’Art

Un Eye-Tracker pour le diagnostic de la maladie de Parkinson

Quelques références

Modélisation & Traitements avancés

Brian : http://www.briansimulator.org Prox : http://erss.irit.fr:8080/graph DynNet et GINNet : http://ginnet.gforge.inria.fr/

Traitement

BrainVisa & Anatomist : http://www.brainvisa.info/ BrainStorm : http://neuroimage.usc.edu/brainstorm/ DynNet et GINNet : http://ginnet.gforge.inria.fr/ EEGLAB : http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ SPM : http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ OpenElectrophy : http://neuralensemble.org/trac/OpenElectrophy

Ressources

Lexique : http://www.lexique.org OB3D : http://ob3d.risc.cnrs.fr CRDO: http://crdo.risc.cnrs.fr

Divers

LUTIN : http://www.lutin-userlab.org Réseau COGITER : http://cogiter.risc.cnrs.fr

Autres liens (plus commerciaux)

Eprime : http://www.pstnet.com/eprime.cfm

LabView : http://www.ni.com/labview/f/

NeurObs : http://www.neurobs.com/

BrainAmp : http://www.brainproducts.com/productdetails.php?id=5&tab=1

RT_maps (intempora) : http://www.intempora.fr/maps/

Eye-Brain http://www.eye-brain.com