Vers le remplacement des antibiotiques facteurs de croissance chez le poulet:

approche par méta-analyse

Amal Rouissi, Ph.D.

05-06-2018

PhD (2017-2020)

Direction : Marie-Pierre Létourneau Montminy

Codirection: M. Boulianne

Projet: Chaire UL + Mitacs + Agri-marché

Équipe:

Antibiorésistance(Bywater,2006 ; Sorum et

Sunde,2001 ; Perry et Wright,2013)

• Plusieurs études ont démontré la présence de bactéries résistantes aux

antibiotiques (E. coli, Campylobacter, Salmonella, Enterococcus spp, C.

perfringens) chez les volailles canadiennes (Diarrassouba et al., 2007; Diarra et

al., 2010 ; Slavic et al., 2011)

• Taux de résistance des bactéries a augmenté au cours de ces dernières

années (MAPAQ, 2016)

• Interdiction des antibiotiques facteurs de croissance par l’Union Européenne

en 2006 (Règlement [CE] 1831/2003)

• le retrait des antibiotiques dans les élevages de poulets de chair a été

associé à la résurgence d’entérite nécrotique

C’est un phénomène

naturel de défense

des bactéries vis-à-vis

de l’action exercée

par l’antibiotique.

Mise en contexte

Retirer les antibiotiques actuellement utilisés comme

facteurs de croissance sur toute la phase sans

diminuer les performance de croissance des

animaux

Objectifs

• Impact du retrait des antibiotiques sur les

performances de croissance

• Facteurs de succès du retrait des antibiotiques

sans pertes des performances

• Identifications des alternatives les plus

prometteuses

est une méthode pertinente pour résumer et quantifier les

connaissances acquises dans le cadre de recherches publiées

précédemment.

utile pour identifier les facteurs de modulation et les

éléments clés pour développer une stratégie efficace.

28

(Sauvant et al., 2005)

Méthodologie

La méta-analyse: Création des bases de données:

Méthodologie

(Sauvant et al., 2005)

Les bonnes pratiques de méta-analyse comprennent

plusieurs étapes.

Méthodologie

Diverses classes d'alternatives aux antibiotiques disponibles pour la production

avicole (Gadde et al. 2017)

Étapes du travail

1. Étude base de données acides organiques

2. Étude base de données probiotiques

3. Étude base de données prébiotiques

4. Étude base de données huiles essentielles

5. Étude base de données avec et sans antibiotiques

6. Comparaison des alternatives

13

Construction en

parallèle de la base de

données avec

et sans

antiobiotiques

Méthodologie

Premiers résultats

Résultats• Dates des publications dans les BDD : 2000-2017

Nombre de publication, expérience, essaie par base de donnée

Base de donnée nombre de publications nombre des essais traitements

Acides organiques 11 32 75

Probiotiques 35 76 212

Prébiotiques 38 105 230

Huiles essentiels 49 138 290

C+/C- 59 171 343

contributions de chaque alternative dans la BDD C+/C-

AO 6 10,17 %

Probiotiques 17 28,81 %

Prébiotiques 15 25,42 %

Huiles essentiels 21 35,59 %

02468

1012141618

2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016

Nb

r p

ub

lica

tio

ns

années

Nombre de publications sur les

prébiotiques /année

02468

1012141618

2003 2005 2007 2009 2011 2013 2015 2017

Nb

r p

ub

lica

tio

ns

années

Nombre de publications sur les

probiotiques /année

02468

101214161820

2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016

Nb

r p

ub

lica

tio

ns

années

Nombre de publications sur les

huiles essentiels /année

02468

1012141618

2005 2007 2009 2011 2013 2015 2017

Nb

r p

ub

lica

tio

ns

années

Nombre de publications sur les

acides organiques /année

Résultats

50%

17%

13%

20%

acide

butyrique(C4)

mélange AO(dont

formique)

autres mélanges

autres AO

Classifications des acides organiques utilisés

Résultats

55%

9%

9%

11%

16%MOS

inuline

FOS

polysaccharides

Autres

Classifications des prébiotiques utilisés

Résultats

Classifications des probiotiques utilisés

Résultats

15%

6%

35%

16%

28%

oregano EO

thyme EO

autres EO

mélange EO with

oregano

mélange EO without

oregano

Classifications des huiles essentiels utilisés

Résultats

Nature d’expérience

Résultats

% des challange avec des bactéries dans les BDD

BDD Nbr essaie Nbr Essaie avec challange % challange

AO 32 10 31,25

Probiotiques 76 46 60,53

Prébiotiques 105 65 61,90

Huiles essentiels 138 76 55,07

Total 351 197 56,13 %

% de bactéries/essaie:

Bactéries Nbr essaie %

Clostridium Perfringens 82 23,36

Salmonella 54 15,38

E. Coli 34 9,69

Emiria 27 7,69

Variables X

Fixe

• Teneur en énergie (% aliment et vs besoin)

• Teneur en protéine (% aliment et vs besoin)

• Différence performances par rapport témoin

• Types alternatives

• Lignée

• Challenge

Continue

• Dose

Résultats

Variables Y

• Gain

• Consommation

• IC

• Effet gain (% vs témoin)

• Effet consomation (% vs témoin)

• Effet IC (% vs témoin)

• Autres indicateurs moins présents (cryptes, villosités,

qualité de litière, bactéries, dosage des acides

organiques…)

Résultats

RésultatsAcides organiques

Effect Estimate Standard Error DF t Value Pr > |t|

Intercept 9.0259 1.5336 6 5.89 0.0011

challenged 0.04330 0.1883 42 0.23 0.8193

Duree -0.00071 0.002944 42 -0.24 0.8098

pct_Energie -0.07718 0.01456 42 -5.30 <.0001

Dose_AO_tot -0.2223 0.5870 42 -0.38 0.7069

Dose_Butyrique_pct 0.7211 0.6387 42 1.13 0.2653

Acides organiquesRésultats

1,60

1,70

1,80

1,90

2,00

2,10

2,20

0,00 0,10 0,20 0,30 0,40 0,50

IC

Dose AO, %

%Ebesoin=99

%Ebesoin=97

%Ebesoin=95

Effet de 3% aux doses

recommandées

Acides organiquesRésultats

RésultatsAcides organiques

Contrasts

Label Num DF Den DF F Value Pr > F

Ac.org1 vs Ac.org2 1 42 2.14 0.1507

Ac.org1 vs Ac.org3 1 42 0.17 0.6822

Ac.org1 vs Ac.org4 1 42 1.66 0.2052

Ac.org2 vs Ac.org3 1 42 0.11 0.7400

Ac.org2 vs Ac.org4 1 42 0.00 0.9584

Ac.org3 vs Ac.org4 1 42 0.22 0.6432

1,68771,9341 1,8272 1,9438

0

0,5

1

1,5

2

2,5

3

Catégorie 1

CLASSES ACIDES ORGANIQUES

C4 autres AO mélange commercial C3 + C1

a bC C

C+ vs C-Résultats

Effet DLL num. DLL den. Valeur F Pr > F

challenged 1 273 0.09 0.7651

Duree 1 273 2.37 0.1245

PB_donnee_PB_besoin 1 273 0.18 0.6682

EM_donnee_EM_besoin 1 273 0.30 0.5842

Famille_Antibio 12 273 2.15 0.0144

dose_antibio 1 273 0.82 0.3646

C+ vs C-Résultats

Famille_Antibio Groupe

Sulfamides(sulfadiazine) A

Cyclines ((chlorotétracycline) ABC

Glycolipidique(flavomycin) ABC

Polymyxine(colistin) BCD

Streptogamines(virginiamycin) BCD

Phosphoglycolipid

(flavophospholipol)

BCD

Orthosomycin (avimycin) BCD

Ionophores (salinomycin) BCD

Polypeptides (BMD) BCD

Tétracycline (Neoxyval) D

Regroupement des familles des antibiotiques selon la méthode statistique:

RésultatsC+ vs C-

ProbiotiquesRésultats