Master chimie 2014

RECHERCHE BIBLIOGRAPHIQUE EN MASTER CHIMIE

BU St-Jérôme

Septembre 2014

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Plan du cours

• Rechercher l’information

• Evaluer l’information

• Présenter l’information

Recherche bibliographique en Master Chimie >Plan du cours

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Rechercher l’information

• Définir son sujet

Objectif 1 :Déterminer le contexte général de sa recherche et la situer dans son champ disciplinaire, chronologique…

Objectif 2 : Trouver les « mots clés » les plus pertinents. Pour les mots-clés en anglais : Termsciences portail terminologique scientifique multilingue développé par l’Inist(http://www.termsciences.fr/)

Objectif 3 :Savoir adapter ses mots clés aux différents outils documentaires (moteurs de recherche, catalogues, bases de données bibliographiques)

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information

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• Classement des mots-clés du + général au + spécialisé :

Atome de fluor = fluorine atom

Réactifs de fluoration = fluorination reagents

Réaction de fluoration nucléophile = nucleophilic fluorination


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• Les différents outils d’une recherche bibliographique :

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Je veux : J’utilise :

Préciser des notions, vocabulaire…

Dictionnaires, encyclopédies, bases de données factuelles.

M’approprier le sujet, Faire la synthèse des connaissances…

Encyclopédies spécialisées, handbooks.

Creuser une problématique, Vérifier des hypothèses…

Articles originaux, thèses, actes de congrès.

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Quelques outils généralistes en sciences

Le Grand dictionnaire terminologique : dictionnaire de définitions (Accès libre)TermSciences : dictionnaire de traduction en 3 langues (Accès libre)Les Techniques de l’Ingénieur : encyclopédie en langue française spécialisée en sciences et techniques, base documentaire « Sciences fondamentales » (Accès réservé AMU)

Quelques outils généralistes en chimieCRC Handbook of chemistry and physicsChemspider, base de données sur les substances chimiques hébergée par RSC (Accès libre)La base CAS Registry de SciFinder (Accès réservé AMU)

Des outils spécialisés en chimieMatières dangereuses : Fiches toxicologiques de l’INRS (Accès libre); Toxnet(Accès libre)Atlas de spectres : Spectral data of organic compounds (Accès libre)Réactions : Organic chemistry portal (Accès libre) ; CASReact de SciFinder(Accès réservé AMU) ; Reaxys (Accès réservé AMU)


Rechercher l’informationPour vous aider dans vos recherches, vous pouvez vous reporter :

-Aux cours des BU AMU sur la recherche documentaire, disponibles sur la plateforme pédagogique d’AMU, Ametice (accessible via l’ENT > Pédagogie > Ametice> Tous les cours > catégorie Bibliothèques)

-Aux guides des BU AMU en chimie (+ guides sur les bases Reaxys et Scifinder)

http://bu.univ-amu.libguides.com/

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• Sélectionner les outils pour chercher l’information

- Grandes familles d’outils :

les catalogues

les bases de données

les plates-formes de revues

outils complémentaires : brevets et archives ouvertes

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Rechercher l’information dans les catalogues

Le catalogue Koha commun aux 72 bibliothèques d’Aix-Marseille (il recense 1,4 millions de documents) est accessible via le site web de la BU : http://bu.univ-amu.fr/ou sur l’adresse : http://catalogue.univ-aix-marseille.fr/

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les catalogues Septembre 2014


Accès possible aussi via l’ENT : onglet « BU » > « Compte lecteur »+ accès à son compte lecteur (pour voir ses documents en prêt, dates de retour, retards ; prolonger un prêt soi-même ; voir l’historique de ses recherches; créer des listes; réserver un document).- faire des suggestions d’achat.

• .

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Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les catalogues

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• Recherche avancée sur Koha:Elle permet de croiser des arguments de recherche dans tous les index de la recherche simple (par les opérateurs booléens OU, ET et NON)

Filtres :- par année de publication, langue du texte, type de publication (livres,

périodiques, ressources électroniques, thèses), localisation (limiter sa recherche àune bibliothèque ou à un groupe de bibliothèques par domaine : ex. sciences)

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Accès aux ressources imprimées

• Liste des résultats d’une recherche

Pour trouver physiquement votre document, il faut lire les données d’« exemplaires », qui vous indiqueront:

- Le type de prêt- La localisation- La cote- La disponibilité- Particularité pour les périodiques : onglet « Etat de collection », indiquant l’étendue de

l’abonnement

Attention ! Un catalogue ne fournit que des titres de périodiques et non des articles.

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Rechercher l’information dans les cataloguesLe classement par cote, qui répartit les connaissances en catégories, permet de localiser le document dans la BU.

La cote est établie en fonction du sujet abordé.

540 Chimie541 Chimie Théorique-Chimie quantique

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les catalogues Septembre 2014

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• Sudoc, catalogue commun de toutes les bibliothèques universitaires françaises (10 millions de notices)

Il permet de :- Trouver un document sur un sujet donné- Localiser ce document dans une bibliothèque universitaire- Obtenir le prêt du document ou sa reproduction

http://www.sudoc.abes.fr/

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Accès aux ressources en ligne• Accès aux ressources en ligne via le site web de la BU. Si vous êtes hors campus, pensez à saisir vos identifiants pour avoir accès à nos ressources accessibles via un abonnement.

• Ou accès aux ressources en ligne via l’ENT (onglet BU> site web BU > Documentation> Liste des ressources électroniques)• Contactez le service de questions-réponses en ligne Azimut si vous constatez des problèmes d’accès.

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Accès aux ressources en ligne• Accès à des dizaines de milliers de revues et livres en plein texte à partir de

Bento, répertoire des ressources en ligne (Recherche par Articles & Revues). Possibilité de recherche par articles dans Google Scholar, par titre de revues, ou par sujet.

• Onglet Ressources électroniques : accès aux bases de données par leurs noms ou par la discipline (ex. chimie)

Recherche bibliographique en Master Chimie

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Les titres signalés sur cette liste sont tous accessibles aux membres de l’AMU, soit sur abonnement, soit en accès libre. Cette liste est mise à jour en fonction des abonnements.

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Les règles de base de l’accès aux ressources en ligne

Les usages communément admis sont la consultation, l'impression, l'envoi par mél, l'enregistrement sur support fixe (disque dur) ou mobile (clé USB) d'une partie raisonnable des contenus proposés.

Les usages généralement interdits sont la diffusion des contenus à des tiers (non membres de l'université), gratuite ou commerciale, la reproduction ou mise à disposition sur un site web ou autre sans demande d'autorisation préalable, la copie ou le téléchargement massif de contenus, etc...

Recherche bibliographique en Master Chimie > Rechercher l’information en ligne

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Rechercher l’information dans les bases de données

• Définition :

Les bases de données sont produites par des éditeurs spécialisés et sont généralement payantes. Elles rassemblent des données structurées, interrogeables par leur contenu et peuvent être :

• Factuelles : Elles proposent une réponse directe à une question, commeles bases de données de résultats d’expériences.

• Bibliographiques : elles permettent de retrouver des références de documents, majoritairement des articles de périodiques, mais aussi des séries, des actes de congrès. Elles contiennent essentiellement du texte, fournissent des notices bibliographiques (fiches signalétiques propres à un document), et les informations qu’elle proposent sont structurées, exhaustives dans un domaine. Les références contiennent le titre de l’article, son auteur, la source (la revue dont est issu l’article) des mots-clés et un résumé.

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Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les bases de données

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• Scifinder Web/Chemical Abstract Service (CAS)

Le (CAS) indexe la littérature chimique depuis 1907.

Champs couverts par Scifinder Scholar/ Chemical Abstracts :

Chimie inorganique et organique, chimie physique, ingénierie et chimie

appliquée, génie chimique, biochimie qui représente à elle seule 34% des

notices bibliographiques.

Références bibliographiques : 62% d’articles de journéux, le reste étant

composé de brevets et communications aux congrès.

Libguide BU AMU Scifinder : http://bu.univ-amu.libguides.com/content.php?pid=584968&sid=4820874

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Rechercher l’information dans les bases de données• Accès Scifinder Web/ Chemical Abstracts :

L’accès est possible sur la version web en s’enregistrant à partir du portail de la bibliothèque :

- Créer un compte utilisateur personnel en s’enregistrant sur un ordinateur de la BU (avec une adresse e-mail valide se terminant par etu.univ-amu.fr).- Le nom d’utilisateur doit comprendre entre 5 et 15 caractères dont au moins une lettre,

et le mot de passe entre 7 et 15 caractères, dont des chiffres, lettres et caractères non alphanumériques (@,#,%,&).- Attendre de recevoir le mail de confirmation à votre adresse e-mail indiquée lors de

l’enregistrement.- Cliquer sur le lien contenu dans le mail pour activer son enregistrement (délai max de 48

heures). - Se connecter avec les identifiants créés (nom d’utilisateur et mot de passe).

La session s’interrompt après 15 mn d’inactivité.

Comme il y a un identifiant de session dès l'accès à https://scifinder.cas.org/ et qu'il faut entrer ensuite un login/mot de passe, il faut plutôt passer par l'adresse suivante pour la connexion en accès distant : https://scifinder.cas.org.lama.univ-amu.fr


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• Les sous-bases contenues dans Scifinder / Chemical Abstracts :

CAplus (base bibliographique) : >37 M références bibliographiques depuis le début des années 1800 ; >10 000 revues dépouillées; Brevets issus de 61 offices de brevets; Articles cités depuis 1997(322 M de citations à ce jour); Mise à jour quotidienne.

CAS Registry (base des substances) : >76 M petites molécules; >63 M séquences (nomenclatures, propriétés expérimentales et calculées); Substances signalées dans la littérature depuis 1957; mise àjour quotidienne.

CASReact (base des réactions) : 56 M réactions extraites de la littérature depuis 1840, conditions de réaction depuis 2003, mise à jour hebdomadaire.

Chemcat : >68 M composés disponibles commercialement; >1119 fournisseurs; Mise à jour à chaque publication ou révision de catalogue, mise à jour à chaque publication de catalogue.

ChemList: informations réglementaires issues de plus de 100 inventaires mondiaux.

Marpat : Plus de 975 000 formules génériques de Markush depuis 1961; 380 000 brevets.

Medline : 22 Millions références bibliographiques biomédicales depuis 1946; 3900 revues biomédicales; mise à jour 4 fois par semaine

CAPADOC, représentant du CAS en France : http://www.capadoc.com/scifinder.html


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• Explore

- Ouverture par défaut de la base bibliographique Caplus et de la recherche par sujets.

- Accès aux bases factuelles Casregistry (substances)Casreact (réactions)

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• Recherche bibliographique : Explore references

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les bases de données Septembre 2014

• Recherche par phrases de mots-clés, synonymes et abréviations en utilisant des prépositions et des conjonctions.

• Recherche automatique de l’orthographe anglaise ou américaine, des singuliers et des pluriels.

• Troncature automatique

• Recherche avancée : par année de publication, type de document, nom d’auteur, de compagnie ou d’organisation.

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• Sur la page intermédiaire d’affichage des résultats, les notices sont regroupées par lot, par nombre de concepts décroissant.


« as entered » = adjacence stricte des termes

« closely associated withone another » = termes dans le même champ de la référence

Termes présents dans la référence mais dans des champs différents

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• Traitement des résultats

Getsubstances/reactionsListe des substances/réactions décrites dans les références cochées

Get relatedLien vers les références citées ou citantes

Get full textLe lien vers le plein texte fonctionne si l’université a payé les droits d’accès du document.Tous les articles ne sont pas accessibles en ligne: consultez les catalogues Sudoc et Koha pour localiser les périodiques imprimés.

ToolsSuppression de doublons avec Medline, combinaison de résultats de recherche, ajout de tag

Send to SciplannerEspace de travail interactif identifiant les options de synthèse

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• Affiner la recherche :

- Analyze : création d’histogrammes sur ≠critères (auteur…)

- Refine : affiner sa requête en ajoutant des critères

- Categorize : analyse détaillée par l’index CAS


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Rechercher l’information dans les bases de données• Save : la fonction de sauvegarde

On peut sauvegarder un lot de références avec « Save », ou pour sauvegarder des lots de substances et de réactions.

Lors de la connexion suivante, cliquez sur « Saved searches » > « Answer sets » pour réactiver le lot de références. Des ensembles de résultats (réaction+ substance) peuvent être combinés.


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La section du plan de classement de la version papier ChemicalAbstract

Identification de la notice biblio dans CAplus

Identification du document dont est issu l’article

• Détail d’une référence


Références de l’article

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On peut exporter les références sélectionnées au format RIS vers son logiciel de gestion de références bibliographiques

• L’export de références


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Rechercher l’information dans les bases de données• La fonction Veille

La fonction de veille Keep me posted permet de sauvegarder une équation de recherche sur le serveur de CAS.

Les mises à jour s’effectuent une fois par semaine et les nouveaux résultats s’affichent àla connexion dans Keep me posted Results.

Par défaut la sauvegarde est mise en place pendant un an.


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Les modes de recherche :

Chemical Structure(par dessin de structure)Markush (par structure Markush)Molecular Formula(par formule brute)Property (propriétés expérimentales)Substance Identifier(register number, nom commun)

Advanced Search : possibilitéd’affiner la recherche

L’option Studies permet de limiter la sélection des substances à celles pour lesquelles existent des notices bibliographiques portant sur l’analyse, la préparation etc…

• Recherche par substances : base Cas registry


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• Recherche par Chemical structure : on peut dessiner ou importer le dessin d’une substance.

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Rechercher l’information dans les bases de données• Recherche par identifiant de substance, Substance identifier : on peut

rentrer jusqu’à 25 substances différentes (une par ligne).


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Rechercher l’information dans les bases de données• La page d’affichage des résultats


Le clic sur le Registry Numberpermet d’afficher le détail des propriétés des substances

Liens vers :

- les références bibliographiques

- les réactions

- Les catalogues commerciaux

- La réglementation en vigueur (nom de la substance et référencement dans les registres nationaux

Liens hypertexte indiquent la disponibilité de spectres (Spectra) et de propriétés expérimentales (Experimental Properties) sur la fiche détaillée de la substance.

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Rechercher l’information dans les bases de données• Accès à la base CAS react : Explore reactions

Recherche de réactions par dessin de molécules chimiques, « Reaction structure ».


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Advanced Search : possibilité d’affiner la recherche

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Rechercher l’information dans les bases de données• Explore Reactions : on peut chercher toutes les réactions où la structure

sélectionnée apparaît comme produit ou réactif, ou dessiner une réaction complète.


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La flèche symbolise les étapes : ce qui se présente àgauche de la flèche prend la fonction de réactif (reactant)

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Rechercher l’information dans les bases de données• Affichage des résultats


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-Références bibliographiques

- Possibilitéde tri par rendement, année de publication etc…

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• Reaxys

Reaxys est une base de donnée en chimie spécialisée en chimie organique, organométallique et inorganique.

La plateforme Reaxys permet l’interrogation simultanée de 3 bases couvrant plus de 200 périodiques :- CrossFire Beilstein (11 M de composés organiques, 23 M réactions, 2 M références)- CrossFire Gmelin ( 2,6 M composés minéraux et organométalliques, 2 M réactions, 1,3 M références)- Crossfire Patent Chemistry Database (5 M composés organiques, organométalliques, minéraux, 4 M de réactions, issus de 460000 brevets en chimie organique et en sciences de la vie)

Depuis 2012, la base PubChem, issue du National Center for BiotechnologyInformation, a été intégrée à Reaxys, et donne des informations sur les activités biologiques des molécules.Depuis 2013 la base eMolecules a été intégrée donnant accès aux catalogues commerciaux de 150 fournisseurs.

Guide d’utilisation : http://cdn.elsevier.com/assets/pdf_file/0004/128182/Reaxys_QUG_March2013.pdf


Rechercher l’information dans les bases de données« Ask Reaxys» : interrogation en langage libre, permet d’identifier les concepts et le type de recherche demandé (par Structures&Réactions, Identifiants&Formules, références bibliographiques, données).

Possibilité de recherche par données de réaction (réactifs, produits…), données physiques (point d’ébullition…), spectres, activité biologique des molécules, « natural products »(isolation de substances à partir de produits naturels).

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• Recherche de réactionsPermet de faire la recherche de réactions du composé. Vous pouvez soit dessiner la structure, ou saisir le nom du composé pour générer la structure (Create Structure template from name) en spécifiant les alliages, le rôle des substances etc avec « Add to query »….


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• Affichage des résultats d’une recherche de réactions :Limiter les résultats par filtres réactionnels ou bibliographiques (Type de documents, date de publication etc…)


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Open Analysis View : analyse par histogramme des résultats (par rendement, réactifs…)


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• Recherche par substanceRecherche de substance et ses propriétés soit en dessinant la structure (Add to query > Structure), soit en utilisant son identifiant (Identification).


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Rechercher l’information dans les bases de données• Affichage des résultats d’une recherche par substance

Interrogation simultanée dans PubChem et eMolecules

Propriétés expérimentales

Informations sur les fournisseurs

Interrogation pubChem et eMolecules

Information sur catalogues commerciaux des fournisseurs

Zoom sur la structure en vision 3D


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• Synthesize = Informations sur la synthèse. Transfert automatique vers un plan de synthèse (Autoplan), accessible aussi via l’onglet « Synthesis Plans »


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Rechercher l’information dans les bases de données• Recherche par références dans l’onglet Literature, par

auteur/mots-clés :Vous pouvez utiliser les opérateurs booléens AND et NOT, ainsi que les troncatures * (pour remplacer plusieurs caractères) ou ? (un seul caractère). Pensez aux différentes façons d’écrire un nom d’auteur.


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• Recherche par auteur/mots-clés : création d’alertes (en créant un compte utilisateur via l’onglet Register ) et export de références vers des logiciels de gestion de références (Output).



• Recherche par index ou Reaxys tree : ce type de recherche par classification permet de cibler d’emblée les éléments pour sa recherche.


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• Comparaison Scifinder / Reaxys : les deux bases sont complémentaires !

SCIFINDER REAXYS

Points +

- Mise à jour quotidienne

- Plus performant pour recherche par auteurs, mots-clefs que Reaxys

- Couverture plus large que Reaxys (littérature récente, brevets)

- Editeur de structure intégré(donc mises à jour du plugin JAVA non nécessaire)

- Outil plus performant pour la recherche d'équations chimiques

- Base de données factuelles majeure en chimie organique, minérale et organométallique

- Pas besoin de se créer un compte utilisateur pour la 1ère utilisation.

Points -

- Moins performant pour la recherche d’équations chimiques

- Mise à jour moins fréquente (2x / semaine pour les brevets et 1x / mois pour les autres sources

COUPERIN- Réseau de négociation et d’expertise des ressources documentaires électroniques :Groupe de veille thématique-Reaxys: http://www.couperin.org/dossier-de-veille-thematiques/bilans-dactivites-couperin/144-bilans-dactivites-couperin/785-reaxysGroupe de veille thématique-SciFinder: http://www.couperin.org/dossier-de-veille-thematiques/bilans-dactivites-couperin/144-bilans-dactivites-couperin/820-scifinder


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Notre abonnement au Web of Science comprend Medline + CurrentContents Connect + Web of Science Core collection

- Web of Science Core Collection, une base bibliographique de plus de 12 000 revues en sciences, sciences sociales, lettres et sciences humaines (Science et Social Science citation index), depuis 1975.

Elle permet également d'interroger :- Conference Proceedings Citation Index couvrant près de 150 000 conférences (depuis 2000).

- Index Chemicus, base de données en chimie (depuis 1993)

- Mise à jour : hebdomadaire

Compléments : Journal Citation Report et Researcher ID

Tutoriel en ligne : http://www.youtube.com/watch?v=D9hPIvp4j0MTutoriel en ligne : Critères de sélection des revues : http://thomsonreuters.com/content/science/pdf/ssr/journal_selection_essay-french.pdf

Web of Science


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Web of Science• Recherche générale

Sélectionnez AND, OR, NOT pour modifier la relation entre les pavés de recherche

Modifiez les paramètres de recherche :l’étendue du

fichier, sélection des index

Sélection du critère de recherche : topic, author,

publication name, funding agency…


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Web of Science

• Troncature

* = Zéro ou plusieurs caractères Ex : gene* (gene, genetics, generation) Ex : *oxide (peroxide, sulfoxide, zinc oxide)

$ = Zéro ou un seul caractère Ex : lap$roscopic (laproscopic, laparoscopic)

? = Un caractère Ex : en?oblast (entoblast, endoblast)

• Opérateurs de proximité

Recherche par phrase exacte (« ») Ex : « stem cell »

SAME = L’opérateur SAME permet de retrouver des termes dans une même phrase, dans n’importe quel ordre

Ex : forest SAME fire, dans le champ « topic »

NEAR/x = permet de retrouver des termes rapprochés. Le nombre de mots qui les séparent peut être précisé. Par défaut la requête s’effectue sur un écart maximum de 15 mots entre les termes recherchés.

Ex : Salmon NEAR virus = Salmon NEAR/15 virus


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Web of Science

• Gestion des résultats : tri par défaut par date de publication. Alerte sur la recherche (seulement pour une recherche dans Web

of Science Core Collection), sauvegarde et export des résultats (impression, courriel, marked list, export vers des logiciels de gestion bibliographique).

Accès au plein texte pour les revues auxquelles la BU est abonnée

Visualiser les citations et leur distribution dans le temps pour un ensemble de résultats (fonctionnalitéinaccessible au-delà de 10 000 notices)


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Web of Science

• Gestion des résultats:

Affinage des résultats par

- ajout d’un mot-clé, - catégorie WOS, - type de document, - sujet (+large que catégorie WOS), -Organisme d’affiliation-Revues en open access…


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Web of Science• Détail d’un résultat :

View Journal Information : données du Journal Citation Reports, ISSN…Related Records, liste des références en lien avec cet article ; Citation Map : cartographie du réseau de citations de l’article


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Rechercher l’information dans les plateformes de revues

• Définition

L’ensemble des revues d’un éditeur est présentée dans la même interface.

Intérêt :

- Cibler ses recherches sur un éditeur, parfois spécialisé dans la discipline- Avoir accès au texte intégral si la bibliothèque est abonnée- Ne pas manquer les revues confidentielles d’un éditeur

Ces plateformes peuvent être spécialisées (ACS, RSC) ou pluridisciplinaires (ScienceDirect, Wiley, Springer).

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les plates-formes de revues

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• L’American Chemical Society (ACS)Fondée en 1876, son format bibliographique fait référence pour les publications de chimie


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Rechercher l’information dans les plateformes de revues• Publications A-Z et recherche simple :Liste des revues, livres de l’ACS.Classement par ordre alphabétique ou par CAS section

Critères de la recherche simple :

-Opérateurs booléens « AND » & « OR »

-1 expression exacte se recherche entre guillemets: « »

-Le signe de troncature est le *

-Subject search = CAS section


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• Recherche par CAS section


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• Affichage des résultats


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• Royal Society of Chemistry (RSC)La Royal society of chemistry, est une société savante qui a succédé à la ChemicalSociety of London (créée en 1841), dont le but est l’avancement des sciences chimiques, notamment par le biais de publications de journaux scientifiques.

La bibliothèque est abonnée à 23 de ces titres. • Accès aux archives de 76 titres de revues RSC, depuis les origines jusqu’à 2010,

dans le cadre du projet ISTEX.RSC a développé une base de données gratuite Chemspider (29 M structures)

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les plates-formes de revues Septembre 2014

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• Recherche par titre de journaux ou par sujet


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• Recherche avancée

- Opérateurs booléens:AND (ou « + ») OR, NOT (ou « - »)

- Date de publication : à partir de 1841


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Rechercher l’information dans les plateformes de revues• Affichage des résultats


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• Wiley Online libraryCet éditeur donne accès à plus de 1000 revues multidisciplinaires.

Parmi elles :- Angewandte Chemie international edition- Chemistry : a European journal- Journal of Polymer Science- Advanced materials

• Recherche par publication ou par sujet


Science Direct

ScienceDirect : répertoire de périodiques, séries et encyclopédies scientifiques multidisciplinaires de l’éditeur Elsevier (2500 revues et 20000 ebooks). Les archives de + de 2200 titres de revues scientifiques publiées par Elsevier depuis les origines (1823) jusqu'en 2001, sont disponibles dans le cadre du projet ISTEX.

La bibliothèque n’est pas abonnée à l’intégralité du catalogue de cet éditeur : les 12 millions d’articles de SD ne sont pas tous en texte intégral.

Mise à jour quotidienne

Tutoriel en ligne :

http://help.sciencedirect.com/Content/tutorials/sd_menu.html66


Springer Link

Plateforme de revues électroniques de l’éditeur Springer.

Ebrary

Plateforme pluridisciplinaire d’ebooks. Possibilité de télécharger:- au format pdf 36 pages max. - ou l’intégralité du document mais pour 14 jours.

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Annuaire d’entreprises

Kompass : annuaire d’entreprises françaises et européennes.

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Outils complémentaires : les bases de données de brevets

• Espacenet

L’Office européen des brevets a développé la base Esp@cenet qui recense 70 millions de brevets, de 1836 à nos jours.

Espacenet donne accès à la base française de l’INPI et à 3 bases internationales :- la base EP (European Patents) recense les demandes de brevets EP publiées par l'Office européen des brevets au cours des 24 derniers mois.- la base de l’OMPI (WIPO) rassemble les demandes déposées au niveau mondial selon la procédure PCT.- la base Worldwide recense les données sur des brevets provenant de 85 pays.

Il y a plusieurs accès possibles à cette base de brevets :http://worldwide.espacenet.com : accès à la base mondiale.http://fr.espacenet.com/:accès à l'antenne française, via l'INPI.

Philippe Eyraud, « La base de données des brevets : Esp@cenet », Ecole Centrale de Lyon, 2010 : http://bibli.ec-lyon.fr/sites/bibli.ec-lyon.fr/files/supports/2010-utiliser-espacenet.pdf

Guide d’utilisation Espacenet en français : http://documents.epo.org/projects/babylon/eponet.nsf/0/4e8744eb66e8f944c12577d600598eef/$FILE/espacenet_brochure_fr.pdf


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Outils complémentaires : les archives ouvertes

• HAL- Hyper Articles en Ligne

L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, créée en 2006, sous la responsabilité du CNRS, est destinée au dépôt et à la diffusion d'articles scientifiques de niveau recherche, publiés ou non.

Elle regroupe plusieurs sous-bases comme TEL pour les thèses ou CEL pour les cours.

Il s’agit d’une démarche volontaire permettant une réappropriation gratuite par les chercheurs de l’information qu’ils produisent eux-mêmes.

AMU a un dépôt dans HAL : http://hal.archives-ouvertes.fr/UNIV-AMU/fr/

A noter, DUMAS est une archive ouverte de travaux d'étudiants de niveaux bac+4 et bac+5 .

Recherche bibliographique en Master Chimie >Rechercher l’information dans les archives ouvertes

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Evaluer l’information

• Sites identifiésInstitutions, industrie, associations, etc. Identification de l’organisation, nature et statut, objet, public visé, date de création, notoriété.Exemple : site de l’INRS http://www.inrs.fr/accueil

• Outils spécialisésAnnuaires, signets (d’une bibliothèque, d’un laboratoire) : sources sélectionnées et déjà évaluées.Exemple : sélection de lien sur le site du labo ISM2 http://www.ism2.univ-cezanne.fr/pages-bleues/liens_pro.htm ou Netvibes d’un chercheur : http://www.netvibes.com/gaellechou#Accueil

• Moteurs de recherche spécialisésGoogle Scholar, etc.

Recherche bibliographique en Master Chimie >Evaluer l’information

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• Évaluation

- Evaluation de la source, de l’auteur :Fiabilité de l’organisation, degré de compétence dans le domaine, notoriété de l’auteur (réseau de références).ResearcherID permet d’identifier un réseau d’auteurs travaillant sur une même thématique.www.researcherid.com/

- Évaluation du contenu :Degré de fiabilité de l’information, niveau de précision, degré de nouveauté, pertinence.

- Évaluation de la structuration du site ou du document :Logique de l’organisation, facilité de navigation, outil de recherche dans le site.

- Évaluation de l’accessibilité et des aspects techniques :Rapidité de chargement du site et des pages, référencement du site dans les outils de recherche.

Support de cours Master Chimie UPMC- Paris VI http://australe.upmc.fr/access/content/group/BUPMC_02/pdf_cours/master_chimie.pdf


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Evaluer la qualité des sources

• Livres : tenir compte de la réputation de la maison d'édition et de celle de l’auteur (publications antérieures, institution de rattachement…).

• Articles de périodiques : pour un travail de niveau universitaire mieux vaut consulter un article paru dans un périodique spécialiséque celui publié dans une revue de vulgarisation.

• Site web : l'adresse des documents (URL) peut servir de point de repère, en laissant entrevoir la nature de leur contenu. On y trouve en général le nom, le type d'organisation qui «héberge»les pages trouvées et le code du pays où se trouve l'adresse (ex. : insee.fr). Vérifier les liens externes qui sont offerts sur la page d'accueil et s’ils renvoient vers des renseignements biographiques.

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• Google Scholar

Créé en 2004, c’est un moteur de recherche spécialisé dans la littérature de recherche universitaire : il indexe des articles issus de périodiques, des thèses, des livres, des articles en pré-publication, des rapports. Ces documents proviennent d'éditeurs scientifiques, de sociétés savantes. Le classement des résultats est basé sur le nombre de citations. Préférer l’interface en anglais, qui permet de restreindre la recherche par sujet et d’obtenir davantage de résultats.

- Intérêt : simple d’utilisation, utile pour retrouver une référence bibliographique manquante, GS permet ainsi de retrouver des documents du web invisible indisponibles sur les moteurs de recherche généralistes.

- Limites : la couverture réelle de GS n’est pas connue précisément, il ne convient pas pour un véritable travail de recherche approfondi. Les algorithmes utilisés pour le calcul du classement sont confidentiels. On ne peut pas utiliser la troncature dans sa recherche. Peu de possibilités de tri.

Julien Sicot, guide d’utilisation Google Scholar, 2007 : http://fr.slideshare.net/jsicot/google-scholar-guide-dutilisation

Béatrice Foenix-Riou, Quelles alternatives à Google Scholar dans le domaine scientifique, 24/10/2013 : http://fr.slideshare.net/bfoenix/quelles-alternatives-google-dans-le-domaine-scientifique?qid=7a574652-3ad2-4c5a-8076-51d88f75c236&v=qf1&b=&from_search=11


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Présenter l’information

• Citation des sources et plagiat

Lorsque vous citez vos sources, vous prouvez votre capacité à rechercher des informations pertinentes.Absence de citations de sources = plagiat

PLAGIER (verb. transitif) : « Emprunter à un ouvrage original, et (…) à son auteur, des éléments, des fragments dont on s'attribue abusivement la paternité en les reproduisant, avec plus ou moins de fidélité, dans une œuvre que l'on présente comme personnelle. Synon. copier, piller, pirater (fam.).»

Trésor de la Langue Française Informatisé, consulté le 22/05/2012 http://atilf.atilf.fr/

Il est rendu très facile par le développement du Web, mais beaucoup d’outils sont disponibles pour le détecter (logiciel de détection de plagiat Compilatio)

Sources utiles : Cours de Rémi Bachelet pour Centrale Lille : http://plagiat.ec-lille.fr/Amphi_Plagiat.htmlBibliothèques de l’Université de Montréal : http://www.bibliotheques.uqam.ca/plagiat

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• Exemples de situations de plagiat :- Copier intégralement un passage d’un livre ou d’une revue sans le mettre

entre guillemets et sans mentionner la source- Insérer dans son texte des graphiques, des données provenant de sources

externes sans en indiquer la provenance- Traduire un texte sans en mentionner la source

• Sanctions prévue contre le plagiat : suspension temporaire ou définitive« Pour avoir intégralement copié le « projet personnel » d’une camarade de l’année précédente, M.B. s’est ainsi fait exclure, en 2003 de son université pour six mois. (…)Une étudiante n’ayant écrit que trois pages de son mémoire de maîtrise a, quant à elle, été condamnée à un an d’exclusion de son université, en juin 2004 »Luc Bronner, De plus en plus créative, la fraude aux examens est durement punie,

02 mars 2005, Le Monde

Charte anti-plagiat AMU 2012 : http://sciences.univ-amu.fr/sites/sciences.univ-amu.fr/files/charte_ant-plagiat_amu.pdf


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• Citation dans le texte

Les références peuvent être citées dans le texte par numéro :

On utilise l'exposant, ou le caractère normal entouré de parenthèses ou de crochets : ...en 1924 Heiss et Weistock² démontrent que…...en 1924 Heiss et Weistock [2] démontrent que …

Ces références dans le texte sont détaillées dans la bibliographie.


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• Quelques principes de base pour la rédaction de la bibliographie

- La bibliographie donne toutes les informations permettant de retrouver le document.

- Quand on décrit une partie d’un document (un article dans une revue, un chapitre dans un livre), on décrit d’abord la partie, ensuite le document dans son ensemble.

- On peut choisir de suivre une norme de présentation (par exemple la norme prescrite par l’éditeur American Chemical society, disponible surhttp://pubs.acs.org/userimages/ContentEditor/1246030496632/chapter14.pdf), mais quelque soit le choix de présentation, le plus important est de la suivre tout au long de son travail.

- Les logiciels de gestions de références bibliographiques permettent d’éditer une bibliographie sur Word ou Open Office en utilisant les normes prescrites par les différents éditeurs.Exemple : Zoterohttp://www.zotero.org/ ; Libguide BU AMU Zotero : http://bu.univ-amu.libguides.com/content.php?pid=588396


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• Référence d’un livre

Lehn, J.-M. Supramolecular Chemistry Concepts and Perspectives; VCH: Weinheim, 1995; pp 139-160.

AuteurTitre

EditeurLieu d’édition Date de publication

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• Référence d’un chapitre d’ouvrage

Rizzo, A.; Coriani, S. Birefringences : A Challenge for BothTheory and Experiment. In Advances in quantum chemistry; Sabin, J.R., Brändas E.; Elsevier : Amsterdam, 2005; Vol. 50, 142-184

Auteur du chap.Titre du chapitre

Titre de l’ouvrageEditeurs scientifiques de l’ouvrage

Editeur commercial de l’ouvrage


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• Référence d’un article

First, E.L.; Gounaris, C.E.; Floudas C.A. J. Chem. Inf. Model, 2012, 52, 84-92

Abréviations des revues utilisées par le CASSI, Chemical abstracts service source index : http://cassi.cas.org/

Auteurs de l’article

Titre abrégé de la revue

DateFascicule

Pages


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• Référence d’un article consulté en ligne

Bahr, S. S.; Ramana M. M. V. Novel Domino Reactionsfor Diterpene Synthesis. J. Org. Chem. [en ligne] 2004, 69, 8935–8937. Disponible sur :

<http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jo049616n> (consulté le 24/05/2012).

Adresse URL


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• Référence d’un site web

Royal Society Of Chemistry. RSC Conferences. [en ligne]. Disponible sur <http://www.rsc.org/ConferencesAndEvents/RSCConferences/> (consulté le 24/05/2012)

Auteur ou Organisme Titre de la page d’accueil

Adresse URL


Avantages du choix du logiciel Zotero

- Plug-in Firefox, gratuit, open source et extensible, installation facile- Utilisation individuelle et/ou collective (poste et/ou serveur), 300 Mo

d’espace de stockage- Logiciel libre- Fort dynamisme de développement (mises à jour automatiques très

fréquentes)- Intégration à d'autres logiciels (traitement de texte, sites, etc.)- Stocke des références sur le disque dur et / ou en ligne

Synchronisation

- Stocke et gère des références, les documents qu’elles décrivent, des captures de pages Web et des annotations de pages Web, et des liens vers des pages Web.

- Développement pérenne assuré par des institutions reconnues (Centre for History and New Media ; George Mason University) et financé par des partenaires importants (United States Institute of Museum and Library Services, les fondations Andrew W. Mellon et Alfred P. Sloan).


Installer ZoteroUtiliser une version à jour de FirefoxDernière version Zotero : 4.0.

http://www.zotero.org/download/

Si nécessaire, autoriser l’installation du programme


Présentation générale de l’interface locale


Barre d’outils : ajouter, importer, modifier une référence

Ajouter un élément :

• nouveau• à partir d’une page web • À partir de son identifiant (ISBN, DOI, PMID)• depuis la page d’un site compatible (Koha, Sudoc, Google

Scholar…):

Attacher un fichier à une référenceImporter des données par fichier


Collecter des références en ligne à partir de sites compatibles

Si l’icône Zotero apparaît dans la barre d’URL, cela indique que le site est compatible (liste des sites compatibles: http://www.zotero.org/translators/)

Ex: catalogue Koha (BU Aix-Marseille)


Collecter des références en ligne sur des sites non compatibles

Ex : Reaxys, importer le fichier de références téléchargé avec l’icône « Actions »


Collecter des références à partir d’une page Web

On peut ajouter un lien vers une page Web et une capture de pageWeb avec l’icône« Créer un nouveau document à partir de la page courante » :


Collecter des références: récupérer les métadonnées d’un PDFOn peut rajouter des PDF à la bibliothèque Zotero en les

faisant glisser depuis leur emplacement d’origine, vers la collection de la bibliothèque souhaitée.


Gestion des références : organiser sa bibliothèque en collections

« Ma bibliothèque »

Les collections: créer une nouvelle collection

Classer / déplacer

Une référence peut être classée dans plusieurs dossiers, mais elle existe en un seul exemplaire dans la bibliothèque


Gestion des références : affichage et tri

Définir dans la barre d’outils les critères de tri des références :


Gestion des références : rechercher des références dans sa base

Zotero a un moteur de recherche interne capable de rechercher des références à l’intérieur de "Ma bibliothèque" ou d’un dossier en particulier.


Gestion des références : supprimer des références

Clic droit sur la référence à supprimer:

Les références supprimées sont conservées dans la poubelle.


Citation rapide

Insérer rapidement une citation et créer une bibliographie par glisser-déplacer (ou insérer seulement la référence en appuyant sur Shift)

Paramétrer le style bibliographique, etc. dans « Préférences », puis « Exportation »


Interaction avec un traitement de textePlug-in Word/Open Office: http://www.zotero.org/support/word_processor_plugin_installation

Dans Word 2007 les icônes Zotero apparaissent dans l’onglet « Compléments »

Insérer et modifier des référencesInsérer et modifier une bibliographie Choisir le style bibliographique et la place des notes (bas de page et/ou fin du document, en fonction des styles)

Style à définir dans les Préférences de Zotero :

Liste complète des styles bibliographiques disponibles, comme ACS par exemple, sur le site : http://www.zotero.org/styles(7121 styles disponibles le 16/09/14)


Installer un style bibliographique

A partir du site : http://www.zotero.org/styles Cliquer sur le titre du journal sélectionné > Cliquez sur

« Installer»


Interaction avec un traitement de texte

Insertion de référence: lors de la 1ère insertion dans un document, il faut choisir son style.

Choix de la référence et prévisualisation:


Interaction avec un traitement de texte

Générer une bibliographie à partir de tous les éléments référencés (NB : si le style l’autorise)

Éditer une citation insérée dans le document

Éditer une bibliographie insérée dans le document (ajouter une référence non citée dans le texte par ex.)

Refresh : mise à jour des citations et de la bibliographie pour répercuter les modifications faites dans la bibliothèque

Modifie le choix de la norme bibliographique.


Synchronisation avec l’espace serveur ZoteroLa synchronisation permet :

- la copie des données d’une instance locale de Zotero vers un serveur distant- une utilisation nomade (sur plusieurs ordinateurs)- le partage de ses références avec des groupes privés ou publics

Création d’un compte sur le site Web Zotero :


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N’hésitez pas à poser des questions aux bibliothécaires : ils sont à votre service toute l’année, et peuvent vous former à l’utilisation et la gestion des différentes ressources.

Vous pouvez nous retrouver en ligne sur le site de la bibliothèque http://bu.univ-amu.fr/

Ou sur la page Facebook des BU sciences :https://fr-fr.facebook.com/busciencesamu

Mon contact : [email protected]

Education

Master chimie 2014