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Atelier 2 Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture Laurent Audeguin, IFV Patrice This, INRA Loïc Le Cunff, IFV Montpellier le 6 novembre 2009 Photo Nicolas Jegouic Domaine La Tapy

Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

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Laurent Audeguin (IFV), Patrice This (INRA) et Loïc Le Cunff (IFV) présentents la problématique de l'amélioration génétique au niveau de la viticulture.

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Atelier 2Quel est le rôle de l'amélioration génétique

pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Laurent Audeguin, IFV

Patrice This, INRA

Loïc Le Cunff, IFVMontpellier le 6 novembre 2009

Photo Nicolas JegouicDomaine La Tapy

Page 2: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

La viticulture en France :

872 000 ha en 2000 (dont 475 VQPRD et 397 autres)Source Vitisphère

1 Catalogue Officiel National : 321 variétés

� 234 variétés de cuve (dont 20 hybrides producteurs directs),� 234 variétés de cuve (dont 20 hybrides producteurs directs),

� 52 variétés de table (dont les variétés à double fin),

� 4 variétés d’agrément pour amateurs,� 1 variété pour la conserverie,� 30 variétés porte-greffe.

Arrêté du 20 février 2009 : les variétés de cuveinscrites au catalogue sont classées sur l’ensemble du territoire national(suppression du classement départemental).

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Conditions d’inscription d’une variété :Règlement technique – Section vigne du CTPS , arrêté du 21 mars 20083 listes distinctes:Liste A1 : Commercialisation au sein de l'UE, et en France.Liste A2 : Commercialisation au sein de l'UE, mais non éligible en France.Liste B : Plants produits en France et exportés vers les pays tiers

Pour être proposée à l'inscription au catalogue fra nçais, une variété doit Pour être proposée à l'inscription au catalogue fra nçais, une variété doit obligatoirement :Etre reconnue DHS (distincte, homogène et stable)

Etre désignée par une dénomination conformément aux règles applicables.

Examen VAT : valeur agronomique et technologique . Minimum de 3 années de production normale - Au moins 2 implantations - Au moins 1 variété témoin.

- Variétés de cuve : au moins 3 répétitions, nombre total de pieds au moins égal à 90

- Variétés de table : au moins 3 répétitions, nombre total de pieds au moins égal à 24.

.

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Conditions d’agrément de clones

Un clone est la descendance végétative d’une souche choisie pour son identité indiscutable, son état sanitaire et ses ca ractères phénotypiques (OIV)Viroses : graves et transmissibles au greffage.

Sélection sanitaire : dépistage de viroses (Court-noué, Enroulement, Marbrure), Sélection sanitaire : dépistage de viroses (Court-noué, Enroulement, Marbrure), méthode officielle : indexage.

Sélection génétique : définition du profil agronomique et technologique (dégustation) dans zone de culture traditionnelle du cépageSuivi viticole : 5 années – Vinifications : 3 années

.

Page 5: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Organisation de la sélection et de la création vari étales :

2 centres de sélection officiels : IFV (ENTAV-ITV France ) et INRA

Un réseau de 32 partenaires conventionnés (Chambres d’agriculture, Interprofessions, …) : la CTNSP Interprofessions, …) : la CTNSP

Une UMT dédiée à la valorisation des ressources génétiques Vigne :Géno-Vigne®

.

Page 6: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Baisse des intrants phytosanitaires et solutions gé nétiques

Grenelle de l'environnement

Plan Ecophyto 2018 : diminution de moitié de l'usage des pesticides d'ici 10 ans et suppression des molécules les plus dangereuses du marché.

Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ?

Les axes de recherche de la viticulture

Sélection clonale : prise en compte du Botrytis, observatoire des maladies du bois

Créations variétales : Variétés de tableVariétés destinées à l’élaboration de jus de raisin Variétés de cuve : constructions monogéniques vs pol ygéniques

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Sélection clonale

Botrytis cinerea : différence intra-variétale prise en compte dans les critères d’agrément des clones

Exemple des clones de Sauvignon

Autres maladies (mildiou, oïdium, maladies du bois) : pas de différence intra variétale observée actuellement : sensibilité variétale

Page 8: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Le Genre Vitis

L’utilisation des ressources génétiques

Page 9: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Utilisation de Muscadinia rotundifoliadans la sélection de variétés résistantes à l’oïdiu m

et au mildiou = Gènes Run et Rpv (A. Bouquet)Gène dominant assurant une résistance totale

sur feuilles, tiges et grappes

Créations variétales

Run1 - Run1 +Run1 -Run1 + Rpv1+ Rpv1 -

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VMC4F8

ACA/CTA-A

ACA/CTG-OVMC8A7

PGM

VVIQ57VMCNG2G7 ACA/CTC-UVVIP60AAG/CTT-BAAC/CTT-S

VVIM25AGC/CAA-FVMC4D2VMC8E8VMC9F2AGG/CAA-RVVIF52

C01

68.6 cM

AAC/CAT-I

VVIB01

VVMD34 AGG/CAA-SACA/CAA-I

VMC6F1

VrZAG93 ACT/CTG-IVVIO55VMC2C10.1

VMC6B11VMC5G7COLORVMC8C2AAG/CAA-TVMC7G3

C02

79.8 cM

VVS112VVMD28AAG/CTA-AAAG/CAA-OVVIH02bVMC1G7 VVIH02cVMC9F4A VMC9F4CVMC9F4B AAG/CAA-UVVMD36

AAC/CTA-EVMC2E7VMC8F10

C03

47.2 cM

ACA/CTG-L ADH2ACA/CTA-KACA/CTT-P ACA/CTT-IACA/CTT-HVrZAG83AAC/CTT-IVVMD32 ACA/CTA-DAAG/CTT-RVMC2B5

VH43VMC7H3AAG/CTT-IVMC4D4ACC/CTT-AACA/CTG-KVVIR46VVIQ58VMCNG1F1.1

C04

64.5 cM

ACT/CTG-BVMC4C6ACA/CTG-QVVMD14AAAC/CTA-PVVMD14E AAC/CTT-FVVMD14GAAG/CTG-IAAC/CTT-WVVMD14F ACA/CTC-DAAG/CTG-B ACA/CAA-DVVMD14B VVMD14CVMC6E10AAC/CAA-TVMC5E11 ACA/CAT-CACC/CTT-HACA/CTC-WVVIT68AGG/CAA-DVrZAG79VVMD27VMC3B9

C05

56.9 cM

VVIM43VVIN31VMC4G6VMC5G1.1AAG/CAA-FVMC4H5 ACC/CTT-PAAG/CTA-JAAG/CTT-PAAG/CTG-TACA/CTC-FVMC2F10a

VMC2G2 VMC2H9AAG/CTG-R

AAC/CAA-A

C06

51.6 cM

ACC/CTT-Y

VVIN56

VVIV04

VMC1A12

ACA/CAA-GVMC8D11ACC/CTT-MACA/CAA-P AAG/CTT-AAACA/CAT-Q AAC/CAT-BVMC9A3.1VMC1A2 ACA/CTG-JVMC7A4AGC/CAA-PAGC/CAA-HAAG/CTA-RVVMD31VMC5H5AAG/CAA-HVVMD6ACC/CTT-G ACA/CAA-X

VVMD7VMC16F3

C07

91.8 cM

VMC2H10

VMCNG2B6

AAC/CAT-D VVIB66A47DVMC3F8VMC1E8 VMC3C9

VMCNG2E2

VMC1B11

C08

VMC2D9

AGC/CAA-RVMC2E11ACA/CAT-DACA/CAT-F AAG/CAA-SAAG/CAA-K AAG/CAA-LACA/CTC-E

C09AAC/CAT-NAAC/CAT-OACC/CTT-OAAC/CTT-KAGG/CAA-PAAC/CTT-LAAC/CAA-KVVIV37AAC/CTT-E

VMC8D3

C10

AAG/CTA-VVVIP36AACA/CAT-GVVIV35AGG/CAA-EVVIP02 AAC/CAA-Q

VMC6G1 AAG/CTT-AD

C11ACA/CAA-JACA/CAA-MVMC8G9AAG/CTA-S AAG/CAA-YVVIV05VMC4F3.1VVIT65 VMCNG2D11ACA/CAA-N ACC/CTT-IACA/CTT-G AAG/CAA-BACA/CTC-GACT/CTG-CAAG/CTG-O ACT/CTG-E

C12

VVIN70

VMCNG1G1.1 VVIS70AAC/CAA-P AAC/CTT-AAA27EVVMD24VMC2A5VMC5B3AGG/CAA-L

C14AGC/CAA-NVVIN62AGC/CAA-LVVIH54AGC/CAA-GACA/CAA-KAAC/CAT-MVVIM01 AAG/CTG-EACA/CTC-MVMC3D12

C13

Run1

Rpv1

Résistance

Oïdium : 1 QTL majeur (C12), 1 QTL mineur

(C15)

Mildiou : 3 QTLs majeurs (C12, C18), 3 QTLs

mineurs (C04, C05, C18)VMC1B11

VMC5G6.1VMC9F4DVVIH02aAAG/CAA-AVVIV15b VVIV15aAAG/CAA-JACA/CTA-BAAG/CTT-A AAC/CTT-AACA/CTC-BVMC6G8ACA/CTT-FVMC2F12VMC1F10

84.9 cM

ACA/CTC-EVMC2E2 VMC5C1VMC4H6

VMC3G8.2

VMC1C10

72.4 cM

VMC8D3VrZAG25VMC2A10 ACA/CAT-XAAG/CTA-LVVIN85VMC4F9.1VrZAG64AAC/CAT-CAAC/CTT-G

VVIH01AAG/CTT-KAAG/CAA-XVMC3D7

64.8 cM

VVIB19 ACA/CAT-SAAC/CAA-H

VVS2 ACT/CTG-KACT/CTG-F

AATVMC6C3VVMD25VMC2A12VMC3E12

62.9 cM

AAG/CTG-O ACT/CTG-EAAC/CTA-BAAG/CTT-HAGC/CAA-KVMC2H4 AAG/CAA-VAAG/CTA-BVMC8G6

58.3 cM

AGG/CAA-LVMC6C10VMC2C3AAG/CTT-OACA/CTA-MAAC/CAT-H AGG/CAA-BAAG/CAA-C AAC/CAT-U

SKACA/CTT-CVMC2H12 AAG/CTT-MAAC/CAT-EVMC1E12VMC8H10 ACA/CTT-LVMCNG1E1

73.2 cM

ACA/CTC-S AAC/CAT-PAAC/CAT-LACC/CTT-XAAC/CTA-NAGC/CAA-JAGG/CAA-G AAC/CAA-DVVS16VVIV67 AAG/CAA-DAAG/CAA-EVVIQ61 ACA/CTA-LACA/CTG-HAGG/CAA-AVMC5G8VVIV24 VVMD30ACC/CTT-RACC/CTT-WVMC8G3.2AAC/CTA-FAGG/CAA-CACT/CTG-HACA/CAT-R

C15

65.1 cM

VMC4B7.2VMC5A1

VVMD5VVMD37

AAC/CAA-R

AAG/CTG-MVMC1E11 AGG/CAA-MAAG/CTA-TAAC/CAA-S ACC/CTT-DACA/CAT-IACA/CAT-L ACC/CTT-CACA/CAT-O AAC/CTA-KACC/CTT-V

VVIN52 AAC/CTA-LACA/CAT-P

C16

72.9 cM

AAC/CTT-ABACA/CTA-C AAC/CAA-GAAC/CAT-KAAC/CAA-M ACC/CTT-EVVIB09VMC9G4

ACA/CTG-N

VMC3A9VVIQ22BACA/CTA-HAAG/CTT-U

VMC3C11.1

C17

49.0 cM

AAG/CTA-KVMC2A3AAC/CAA-B

VMC8B5VVIV16

VMCNG1B9AAG/CTA-P

VVIM93

VMC8F4.2GPI

VMC2A7AAG/CTA-FVVMD17 AAG/CTG-LAAC/CTA-AACC/CTT-JAGG/CAA-XVMC6F11 AAG/CTG-PC08-1020 SCC8SdIVMC7F2AAG/CTG-DAAG/CTG-CAAG/CTA-O P18-530ACA/CAT-KAAG/CAA-IAGC/CAA-I ACC/CTT-TACA/CAT-W

C18

117.8 cM

ACA/CAT-AAAAG/CTA-QACT/CTG-A

VVIV33 AAG/CTA-DACA/CTC-H AAG/CTT-ACAAG/CTT-QAAC/CTA-G AAC/CTT-VAAC/CTA-DVVIP31VMC3B7.2VMC5D11

VMC5H11VMC9A2.1VVIP17a

C19

53.3 cM

VMC3D12VVIV61 ACC/CTT-UACA/CTT-Q AGG/CAA-UVMC5G11ACC/CTT-N VMC2F10bACA/CTC-QVMC9H4.2AAG/CTT-SVMC2C7

AAG/CTG-SVMC8E6

72.2 cM

Rpv1

Rpv2

mineurs (C04, C05, C18)

Rpv3

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Résistances monogéniques

Résistances polygéniques ou « pyramidales »

Utilisation de Muscadinia rotundifolia dans la sélection de variétés résistantes

à l’oïdium et au mildiou = Gènes Run (résistance à Uncinula necator) et Rpv

(résistance à Plasmopara viticola)

Création de variétés résistantes

Utilisation de Muscadinia rotundifolia associée à d’autres sources de résistance

(mildiou, oïdium)

Travaux de l’INRA Montpellier et Colmar : Résistance polygénique

3 sources de résistance :

• Muscadinia rotundifolia

• et autres Vitis américaines : co-évolution avec les parasites (mildiou, oïdium)

• Vitis asiatiques : évolution indépendante des parasites

Page 12: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Création en 1970

Les schémas d’introgression : la

recherche de quelques

caractéristique d’une espèce sauvage

Plantation en 2006

espèce sauvage éloignée

Un process long pour aboutir à une variété

offrant une résistance monogénique

Page 13: Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture

Arômes Pépins Résistances

Mtp3197-78

Mtp3181-24-9

Mtp3197-233

Mtp3197-469

Arôme

Non

Arôme léger

M1

Run1

Oui

Oui

Oui

Exemple des constructions polygéniques cas des variétés de table

Amandin

Villard-blanc

Primus

Roucaneuf

Mtp3184-47-9

Himrod

Non Oui

Muscaté

Foxé

Simple

Sauvage

Assez aromatique

Oui

Oui

Oui

Très petits

S

MR mildiou/R oïdium

R mildiou/AS oïdium

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Objectifs

Obtenir environ des variétés de raisin de cuve et de table présentant :

• des résistances durables et des qualités • des résistances durables et des qualités organoleptiques incontestables

• une bonne adaptation aux conditions pédo-climatiques du vignoble français