CARREFOUR ADN FORMATION 2: TECHNIQUES AVANCÉES · 2018. 4. 24. · CARREFOUR ADN • Deux...

CARREFOUR ADN FORMATION 2: TECHNIQUES

AVANCÉES

• Pour les personnes plus avancées, nous aborderons des techniques telles que : • 1. L'arbre miroir • 2. Le navigateur de chromosomes • 3. La triangulation • 4. La distribution sur le X • 5. L'utilisation des tests Y et MT • 6. Les transferts de votre ADN et de vos arbres (Gedcom) • 7. Exercices, témoignages, expérience vécue

• Animation • Lucien Provost et Line Lachance

• Pour information additionnelle, communiquer avec : • Lucien : provost@oricom.ca Line : linelachance22@hotmail.com

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28 avril 2018 Québec Collège F.X.Garneau

CARREFOUR ADN

• Deux personnes, Line et moi, avons mis nos connaissances en commun à l’automne 2017 pour aider les autres.

• Notre but: créer un lieu d’échanges avec des formations pour bien utiliser les tests d’ADN, pour les adoptés et les généalogistes.

• Des activités de formation depuis octobre 2017. • Un nouveau site Internet: https://carrefour-

adn.weebly.com/ • Une page Facebook : CARREFOUR ADN

https://www.facebook.com/groups/844825525683204/

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Table des matières

• Sujet page • 1. L'arbre miroir 4 • 2. Le navigateur de chromosomes 51 • 3. La triangulation 68 • 4. La distribution sur le X 78 • 5. L'utilisation des tests Y et MT 96 • 6. Les transferts de votre ADN 137 • 7. Les transferts de vos arbres (Gedcom) 151 • 8. Témoignages, expérience vécue 157 • 9. Questions 160 • 10. Références 162

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1. Arbre miroir d’Ancestry

• Un outil informatique disponible seulement

sur Ancestry au client détenteur d'un abonnement.

• Permet de mieux visualiser nos concordances génétiques.

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Trois principales applications

1. Valider une concordance génétique avec

une personne en particulier.

2. Trouver où se situe notre concordance

avec un individu. Branche paternelle ou

maternelle.

3. Découvrir le MRCA (most recent commun

ancestor = l’ancêtre commun le plus

rapproché)

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• 1. Valider une concordance génétique.

• Existe-t-il une concordance?

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• L'arbre miroir DOIT être PRIVÉ

1. Gérer l'arbre

2. Paramètres de confidentialité

3. Arbre privé

4. Enregistrer les changements

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Conclusion : aucune parenté avec

Mme Simard

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Si vous arrivez sur cette page, cela signifie que votre compte est inactif.

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• 2. Trouver où se situe (côté maternel ou paternel) notre concordance avec un match .

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Trouvons la concordance ? – côté maternel ou côté paternel

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On crée un arbre avec les

données de l’arbre d’Huguette en

vérifiant l’ensemble des données.

On branche cet arbre ainsi créé

sur notre ADN.

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Cette information nous confirme

le branchement entre notre arbre et

notre ADN

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Premier ancêtre commun

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Deuxième ancêtre commun

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On vient de faire le processus avec 2 personnes Maintenant Refaire le processus avec l’ensemble des ancêtres communs (42)

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Ce processus permet

d’identifier une ligne d’ADN.

On voit donc que notre filiation avec cette concordance se situe

de son côté maternel.

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• Endogamie

• Mariages entre cousins dans un petit milieu.

• Fréquents dans la communauté

canadienne-française

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• Le couple :

• Roger Fortin et Félicité Gagné

• se retrouve du côté maternel et paternel de notre concordance.

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• 3. Découvrir le MRCA

• Most recent commun ancestor

• L’ancêtre commun le plus récent

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● unUn autre cas:

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• On crée un arbre ascendant avec

Michel G. jusqu'en 1750 environ.

• On relie l'arbre à notre ADN.

• On attend quelques jours.

• On regarde tous les ancêtres communs.

• On met un signe distinctif pour pouvoir

identifier les ancêtres communs.

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• On peut conclure que le MRCA :

• Roch Gauthier et Vitaline Saucier

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• On peut donc raisonnablement conclure qu’un de nos parents

se trouve parmi les descendants de ce couple

• sauf que ....

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Un autre exemple de MRCA

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• MRCA :

• Napoléon Alain et Marie Gauvin

• Environ 1870

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Un autre exemple de MRCA

• .

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• MRCA :

• F.Brunelle et G.Lanoix

• 1755

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Synthèse: Créer son arbre miroir

• 1.Identifier cousins proches avec des informations fiables (arbres)

• 2.Sélectionner le cousin le plus proche avec le meilleur arbre. • 3.Créer un arbre qui copie l’arbre du cousin le plus rapproché.

(The home person (la personne d’accueil) sera le cousin que vous avez choisi au point 2.) Idéalement compléter son arbre jusqu’en 6, 7 ou 8e génération pour obtenir davantage d’indices.

• 4.Attacher (lier) votre ADN à l’arbre de votre cousin. • 5.Attendre que les algorithmes d’Ancestry donnent des

résultats (min. 5 jours actuellement). Ensuite vous commencerez à voir les ancêtres que vous avez en commun avec ce cousin.

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2. Le navigateur de chromosomes

Permet de visualiser LES SEGMENTS COMMUNS D’ADN

sur les chromosomes que nous partageons avec nos cousins.

Cet outil permet aussi de réaliser des triangulations

Disponible sur

FTDNA, Gedmatch et maintenant My Heritage

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Les segments de chromosomes et leur redistribution aléatoire

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L’utilité du navigateur

• Lorsque l’on veut voir la longueur et l’emplacement (le début et la fin) des segments sur les chromosomes

• Voir les segments communs ou non avec des cousins

• Pour confirmer ou non un lien biologique maternel ou paternel par triangulation

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LE NAVIGATEUR DE CHROMOSOMES CHEZ FTDNA

23 paires de chromosomes de longueurs différentes

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Boivin Vous pouvez aussi chercher Les correspondants ayant un nom de famille dans leurs arbres Les correspondants seront alors différents!

Résultat: Des segments d’ADN communs entre moi et ma cousine sur un ou plusieurs chromosomes

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Résultat: Des segments d’ADN communs entre moi et 5 personnes sur un ou plusieurs chromosomes

On peut aussi voir Les segments en commun en détail: Nombre et lesquels début et fin Longueur en cM

Pas de longueur minimale de cM 60

Avec Gedmatch www.gedmatch.com

Un site Internet gratuit et indépendant des cies

où on peut comparer notre ADN

avec celui d’autres cousins

et utiliser le navigateur de chromosomes

pour analyser les segments d’ADN communs pour aussi pour réaliser des triangulations.

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Plusieurs outils gratuits sur Gedmatch* pour analyser et comparer son ADN avec les autres.

• Comparaison avec 10 personnes à la fois

sur l’ADN autosomal

• Comparaison avec 10 personnes à la fois sur le chromosome 23 ( le X)

• Et beaucoup plus…

• *www.gedmatch.com

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Gedmatch, page one: to many matches

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Sur Gedmatch, minimum ajustable!

La longueur minimale totale en cM est ajustable. Par défaut elle est fixée à 7 cM minimum

Détails:

Ident. du chromosome

Adresses

Début et fin

Longueur

Nombre SNP

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Visualiser les segments communs sur les chromosomes!

Match avec mon frère Très beaux matchs longs ..voir détails En bleu : le match En vert : sur 2 paires En jaune: sur 1 paire En rouge : rien

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3. La triangulation

• Définition en généalogie génétique: Trois (3) personnes qui ont le même segment d’ADN sur un chromosome* Une triangulation nous confirme un ancêtre commun entre vous et

deux autres cousins Utile pour confirmer une lignée généalogique, paternelle ou

maternelle *De Blaine Bettinger www.isogg.org wiki triangulation

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La triangulation:

• L’ARBRE MIROIR D’ANCESTRY: est un outil de triangulation simplifié mais nécessite un abonnement.

• Le navigateur de chromosomes permet aussi de découvrir des triangulations avec nos correspondants, sans besoin de s’abonner.

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On va utiliser Gedmatch pour rechercher une ou plusieurs triangulations

parmi nos cousins

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À la recherche d’une ou de plusieurs triangulations à partir de mon ADN

Cousin 1 Cousin 2

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À la recherche d’une ou de plusieurs triangulations

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À la recherche d’une ou de plusieurs triangulations

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Une triangulation nécessite une confirmation de UN(1) à UN(1)

• On doit faire une vérification du segment commun sur le chromosome

de UN à UN avec chaque cousin de la triangulation

pour être certain que c’est le même ancêtre

et du même côté maternel ou paternel

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Preuve faite avec l’outil : (one to one ) sur Gedmatch sur chromosome 3 : de 19,570,906 à 31,835,062

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Ancêtres communs avec Dennis

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Ancêtres communs avec Canloup

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