UE ISSM 7.30 Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale GC Faure 08/10/09 Faculté de...

UE ISSM 7.30Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale

GC Faure 08/10/09Faculté de Médecine et CHULaboratoire d’Immunologie, EA 4369Chargé de mission à la documentation UHP

Filière Médicale Francophone Nancy-Wuhan

2008 Un nouveau diplôme

universitaire (DU) associant Nancy et Wuhan

Diplôme d’Université (DU/DIU)

Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale Intégré dans le cursus de Master Objectifs:

Acquérir ou conforter les connaissances de base des méthodologies utiles à la pratique de la recherche médicale

DU: Thèmes abordés

3 modules de base Information scientifique et techniques de

communication Bases de données, publications, projets de recherche

Méthodes en biologie moléculaire, génomique, protéomique

ADN, ARN, gènes, protéines… Méthodes en biologie cellulaire, d’organes et

d’organisme Isolement, imagerie, cellulaire, de tissus, modèles

animaux

DU: Illustration par le biais de projets en cours à Nancy

3 modules applicatifs Applications en recherche médicale

Hémato-oncologie, Nutrition, Pathologies du vieillissement

(cardiovasculaire, articulaire) Pathologies inflammatoires aigues et

chroniques Applications en recherche chirurgicale

Chirurgie robotique, coeliochirurgie, microchirurgie

Greffes et transplantations Applications dans les biothérapies

Thérapies cellulaires et génique Thérapies moléculaires innovantes

Programme 2009 (1) 8 octobre

GC Faure Introduction, Chercher et Trouver, Lire et écrire

J. Mistral Accès à la documentation au SCD 15 octobre

C Philippe Génomique B Chenuel Physiologie et Systèmes biologiques

22 octobre C Nemos Transcriptomique/Protéomique J Felblinger Imagerie

29 octobre T Lecompte Hémostase P Rossignol Recherche clinique

Programme 2009 (2) 5 novembre

MC Béné Cytomique (1) GC Faure Cytomique (2)

12 novembre T Lecompte Recherche clinique dans le SAPL J Hubert, P Eschwège Chirurgie robotique et Urologie

19 novembre C Baumann Santé publique B Namour Biochimie

26 novembre P Gillet Pharmacologie N Tran Chirurgie expérimentale

Chercher et trouver

Des exemples, des méthodes Quelles recherches

Recherche Médicale Recherche Chirurgicale Recherche Clinique Recherche Biologique Recherche Imagerie

Où fait-on de la recherche? Universités, Facultés, UFRs

EPST (Inserm, CNRS, INRA, Inria…) EA (AERES)

CHUs CIC, CEC, CIT, CICancer, CIB CRB, Thèques… Cancéropôles

Industrie Laboratoires Pharmaceutiques Laboratoires Biotechnologies, Imagerie

Qui soutient la recherche? Les états

Les organismes publics Les Ministères (Recherche, Enseignement

supérieur, Industrie, Innovation) Les Régions L’Europe

Les organismes privés Industrie Associations charitables

Ligue, ARC, x Associations

Que fait-on en recherche médicale et chirurgicale?

Faire des expériences? Faire des manipulations? Travailler dans un laboratoire? Travailler avec des animaux? Travailler avec des patients? Travailler dans un service hospitalier? Recueillir des données et faire des

statistiques? Lire et écrire

Lire… et écrire

Accéder à l’information Papier ou numérique

Centres de documentation, bibliothèques, En ligne, via internet

Sélectionner l’information Stocker l’information

Utiliser l’information

Information scientifique et technique:Information scientifique et technique:

Matière première du médecin, du scientifique, du malade,

du consommateur Produit fini

du médecin, du scientifique, du chercheur

Produit à haute valeur ajoutée Produit à valeur stratégique

Un peu d ’histoire L ’information scientifique et technique

un phénomène récent, un siècle environ du « savant fou »... aux équipes

pléthoriques de la monographie, à la publication avec plusieurs centaines

d ’auteurs Quel futur au 3ème millénaire?

Circulation de l’information scientifiqueCirculation de l’information scientifique

Analogue au circuit de l’eau dans la nature les récepteurs reçoivent l’information sous

forme variée, pluie, neige, grêle... les émetteurs produisent de l’information… celle-ci s’accumule dans des réservoirs,

mer, lacs, neiges éternelles, glaciers les conservateurs stockent l ’information

Quelques questions

Quels outils de recherche d’information utiliser???

Quelles bases de données? Quels journaux?

VULGARISATION SCIENTIFIQUE

En images

MASSE d'information en croissance exponentielle

INTERNATIONALISATION évidentel’anglais est devenu la langue vernaculaire

Influence de la NUMERISATION

Evolution des OUTILS d’accès à l’INFORMATION et des SUPPORTS

LES DOCUMENTS PRIMAIRES

L'INFORMATION SECONDAIRE

LA LITTERATURE GRISE

La littérature scientifique

Littérature en noir et blanc: les documents primaires

Littérature en couleur: journaux et magazines

Littérature grise Littérature multicolore: les catalogues

commerciaux,

LES DOCUMENTS PRIMAIRES LES DOCUMENTS PRIMAIRES

JOURNAUX (25 000) ET ARTICLES

•ARTICLES ORIGINAUX

ANATOMIE D'UN ARTICLEANATOMIE D'UN ARTICLESCIENTIFIQUESCIENTIFIQUE

•LETTRES•REVUES GENERALES

Journaux de REVUESLIVRES ou Book series

DIDACTIQUES...TEXTBOOKS

Quelles fonctions pour une revue scientifique?

La dissémination de l’information Le contrôle de qualité de la recherche la constitution d’archives

« canoniques » la reconnaissance portée aux auteurs

La forme JOURNALest apparue la plus adéquate

Regroupement d’articles dans un ensemble diffusé en bloc aux abonnés

Parution à dates données, régulières Traitement des articles, qualité

typographie, langage non modification après publication garantie de retrouver un

article/référence

Apprendre à lire, à écrireApprendre à lire, à écrire

Ce qu’on ne nous a jamais appris à la Fac!

Apprendre à trouver connaître les bases de données apprendre à interroger ces bases

Lire, sélectionner... sur les bases de données:

TITRE, auteurs, mots-clés, résumé… Classer et retrouver...

Anatomie macroscopique d’un article scientifique:Anatomie macroscopique d’un article scientifique:

Titre «self-explaining» Auteurs (Noms, prénoms, titres...), Adresses Résumé (structuration)

Mots Clés (indexation) Abréviations (etc!) Introduction (rationale) Matériel et méthodes (reproductibilité) Résultats (statistiques) Figures et tableaux (légendes, PAO, visibilité) Discussion (des résultats aux hypothèses)

Références (normes à respecter) Remerciements (collaborations, financements)

Un exemple d ’article

Format pdf, exemple

Apprendre à lire, à écrireApprendre à lire, à écrire

Lire un article:Désordre de Lecture remerciements!, fin de l’introduction, ou début de la discussion, méthodes, références, légendes des figures et tableaux, introduction ou discussion, résultats

Ecrire:..... au maximum 4 pages double interligne à l ’heure

LA PRODUCTION D'INFORMATIONLA PRODUCTION D'INFORMATION

Physiologie d'un article scientifique

ConceptionDéveloppementNaissanceVieet Mort

Le concept d'EVALUATIONLe concept d'EVALUATION

Développement et physiologie d’un article scientifiqueDéveloppement et physiologie d’un article scientifique

Conception Fécondation in vitro ou sexualité de groupe

Embryologie beaucoup plus long que chez les éléphants les avortements sont fréquents, et

l’accouchement difficile beaucoup de partenaires, quelques bonnes fées et

des accoucheurs

Vie et mort d’un article beaucoup d’appelés, peu d’élus

EmbryologieEmbryologie

Bibliothèques et paillasses lecture, expérimentation, observation

consignation dans un cahier Ordinateur, postes et publishers

rédactions et écritures un manuscrit, soumission, éditeur, Peer

Review, referees, refus ou! révisions, manuscrit, éditeur, referees,

accepté! imprimeur, bon à tirer, publication,

diffusion, bibliothèques

Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sertPhysiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert

Lieu de naissance Vie personnelle d’un article

Etre lu par des chercheurs, médecins, journalistes, étudiants

Etre compris Etre évalué, être CITE

Rester inconnu, être oublié, ressusciter

Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sertPhysiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert

Vie sociale des articles Etre utile à ses auteurs (DEA, Thèse,

Titres et travaux... position) Etre utile à son environnement (équipe,

unité, université, ville, hôpital)

ETRE EVALUE

Le Concept d’évaluationLe Concept d’évaluation

Distribution des fréquences de citation des articles scientifiques

1 citation: 56% 2-4: 24% 50-99: 1% cumulé: 99.56% 1000: 1300 / 32 728 729=0.00004

Facteur d’impact… durée de citation...

L'information SECONDAIREL'information SECONDAIREou TERTIAIREou TERTIAIRE

ou PLUSou PLUSJournaux Médicauxquotidienshebdomadaires

MAGAZINES d'actualités

Journaux non médicauxquotidienshebdomadairesmensuelsautres

AUDIO-VISUEL: RADIO, TELEVISION

INTERNET: sites spécialisés

L ’information grise Les Thèses Les Brevets et Normes

Sites spécifiques Les Rapports publics Les Rapports privés

Internet? Trop d’information tue l’information

La littérature multicolore

Les catalogues des fabricants ex: SIGMA, R&D

Les revues «interface»

Les sites internet spécialisés

LES ACCES A L'INFORMATIONLES ACCES A L'INFORMATION

ABONNEMENTS

BIBLIOTHEQUES

PHOTOCOPIES

TIRES A PART

SOMMAIRES de Revues

Index de SommairesREVUES de Sommaires

... + Résumés (Summaries)

Bases de données:Medline, PuBMeDPascalCurrent Contents, Web of Science Scopus

PubMed: le site est encore amélioré

Les opportunités de l ’électronique

indexation en texte intégral outils de recherche intelligents inclusion de données actives liens hypertextes vers d’autres ressources open peer comments…living seminar multimédia utilisation du réseau

Numérisation: intérêt pratique A Nancy et

ailleurs... des étagères et

du PEB aux périodiques en texte intégral…

marcher feuilleter

«cliquer»

Sans bouger de chez soi! Regarder en haut à droite Elsevier, Academic Press,Wiley... Open access

Les Revues électroniquesLes Revues électroniques Qu’est ce qui a changé?

l’accès au réseau, dans les universités, dans les Hôpitaux

l’accès aux bases de données PUBMED (références, et résumés)

l’accès aux éditeurs et aux instructions aux auteurs Qu’est ce qui va changer?

le réseau les accès au document primaire ? et son format? les BU /SCD

A qui sont ces articles ? QUI PAYE? Qu’est ce qui ne change pas?

les end-users ! les nécessités:

de lire d’avoir des résultats, d’écrire... d’un peer-review

L’UMVF: Fédération Inter-

Universitaire pour l’Université Médicale Virtuelle Francophone GIP FIU-UMVF

MEN, MESR, MEFI JO 13 Aout 2003

33 Universités

http://www.umvf.prd.fr/info/qui/presentation.html

L’UMVF: ses missions

mettre en œuvre les technologies de l’information et de la communication pour l'enseignement (TICE) de la médecine en formations initiale et continue. Centre de ressources interactif dans le domaine de la santé Centre d’information et de prévention pour le public Diffusion et de promotion de la science médicale française dans le

monde.

produire des ressources documentaires venant en complément des cours. Etudiants de 2e cycle préparant les Epreuves Classantes Nationales

(ECN)… une banque de données Plus d'une trentaine de campus numériques disciplinaires

soutenue par la Conférence des Présidents d’Université la Conférence Nationale des Doyens des Facultés de Médecine.

Les Campus Numériqueshttp://www.umvf.prd.fr/ressources/campus.php

Plus de 45 en fait, Toutes disciplines

du premier cycle Histologie-

embryologie Microbiologie Statistiques

à l’ECN Néphrologie Neurologie Rhumatologie…

ASSIM: RAISIL Réseau d’accès à l’information scientifique en lignehttp://www.assim.refer.org

Les questions du module 8 Immunologie De 112 à 127 Une structure en

briques de connaissance

Des cas cliniques Des réponses Pas de QCMs

Doc’UMVF Nouvelle Page ECN 2010

345 items Plus de 2000 documents

pédagogiques

CISMEF Rouen S Darmoni JP Thirion

Autres ressources d’intérêt en langue française CNCI

http://www.cnci.univ-paris5.fr/welcome.html Concours Médecins étrangers

Annales QCM 2005-2007: 3x120 http://www.cnci.univ-paris5.fr/medecine/

Annales_ETR.html Les pages ECN de l’HAS +++

http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_646948/examen-classant-national-ecn-mot-du-president-sommaire-mode-d-emploi

Mise à jour mensuelle ORPHANET++

Aimez vous les vidéos? Utilisez vous les podcast?

UMVF: canal U http://www.canal-u.tv/themes/scienc

es_de_la_sante_et_du_sport

Au NIH, cela dépasse l’internat NIH videocasting and podcasting http://videocast.nih.gov/

Les moteurs de recherche

Google, Yahoo, Bing… Wikipedia?

Nature Medicine 2007;13: 231-233

Other resources (en anglais)

emedicine by WebMD http://emedicine.medscape.com/

Sur PubMed OMIM Books PubMedCentral (Free archives)

Méthodes de travail! À L’Ecole

Programmes… Examen

En Recherche Cahier de laboratoire Electronic-lab-book

A l’Université et tout au long de la vie Logbook Portfolio E-portfolio

Workplace-Based Assessment

Assessing a trainee’s progress Assessing competences in laboratory

procedures and clinical skills Assessing trainee’s skills in clinical

examination Case-based discussions

An hindrance: duration (5years) and diversity of training

How to help trainees in acquiring skills and competences?

Portfolio: old and new words, evolving concepts in training

From « Titres et travaux » to portfolio Logbook.. Book Portfolio

a tool for training and legitimation

E-portfolio: the future Usage of internet

and web 2.0 Access anywhere

anytime

UK: Wales Europe:Elfel project