Zotero pour les médecins (3h)

Votre bibliographie facile avec Zotero

Formation – internes de médecine BrestSCD UBO – 2011

Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentationJan 2011 2

Au programme

1.Découvrir2. Installer3. Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager

1. Découverte

Démonstration en direct ou visionnage de la vidéo.

Comment ça marche?

En quoi Zotero peut m'être utile?

Veille

Gestion de références

Sauvegarde de références

Édition de bibliographies

Partage de références

Présentation du logiciel

Une extension de Firefox, gratuite

Un équivalent performant aux logicielsprofessionnels payants (EndNote, Refworks)

1.Découvrir2. Installer3. Importer une

référence4.Organiser5.Exporter une

bibliographie6.Partager

Exercice

Installer Zotero sur Firefox

Installer Zotero

http://www.zotero.org

Installation terminée!

Exercice

Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur.

Zotero affiché

Zotero masqué

Zotero en pleine page

Exercice

Créez votre compte personnel sur http://www.zotero.org[clic sur « register »]

1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager

Importation de références bibliographiques depuis le web

Exercice

http://www.sudoc.abes.fr

Trouvez dans le catalogue SUDOC la notice de l'ouvrage suivant

Huas D, Rueff B. Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale. Paris: Springer; 2005.

Exercice

Importez cette notice dans votre liste de références Zotero.

Correction

Correction (suite)

Exercice 3

Trouvez et importez depuis le SUDOC dans Zotero trois références d'ouvrages sur le sevrage tabagique.

Correction

Correction (2)

On peut importer dans sa bibliothèque Zotero une liste de plusieurs ouvrages à

la fois.

Correction (3)

Correction (4)

Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer...

Correction (5)

Remarque : dans cet exemple, deux des références importées sont des thèses.Les thèses sont représentées par une icône spécifique

Exercice

Trouvez puis importez depuis la base PubMed la référence suivante

Dubar G. et al. « French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women ». PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n°10.

Correction

Quand on importe un article, l'icône à droite de la barre d'adresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille.

Correction

Exercice : import d'une page web

Importez dans votre bibliothèque Zotero l'article de blog suivant

Flahaut, Antoine. « Grippe, la France Sentinelle de l'Europe? » in Le Blog d'Antoine Flahaut, 24 septembre 2009.

Exercice : modifier une notice

Ajoutez à l'ouvrage de Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale (déjà dans votre bibliothèque Zotero) les éléments suivants

- son résumé (disponible sur Google Books)

- une note comportant la cote de l'ouvrage à la BU Santé.

Import d'un livre via son numéro ISBN

Entrez l'ISBN du livre (numéro disponible sur la 4e de couverture) sans les tirets.Zotero va chercher automatiquement la notice sur le catalogue en ligne WorldCat.

Nota Bene

Il est toujours possible dans Zotero de créer manuellement une notice.

Exercice

Trouvez dans le CisMef un guide de recommandations de bonnes pratiques pour le traitement de l'otite moyenne aiguë chez l'enfant. Créez manuellement la notice de ce document dans Zotero.

Récapitulatif des icônes d'importation

Importation d'une référence d'ouvrage

Importation simultanée d'une liste de références d'ouvrages ou d'articles

Importation d'une référence d'article

Importation d'une page web

Importation d'une référence de thèse

Quelques sites Zotero-compatibles

http://www.zotero.org/translators

Sites compatiblesCatalogue UBOCatalogue BIUMCatalogue SUDOC (thèses)MedlineEbscoHost (Pascal)Science Direct

Partiellement compatiblesUbodocCochrane LibraryHAL (archives ouvertes CNRS)

IncompatibleCisMef

1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6. Partager

Interface : les trois panneaux

1 : L a bibliothèque (possibilité d’organiser en dossiers et sous-dossier,

2 : Liste des notices du dossier sélectionné,

3 : La fiche de l’élément (article, ouvrage, page Internet etc.) sélectionné.Source : Mathieu Poujol

La barre d'outils

Créer un dossier ou un sous-dossier

Importer, exporter une bibliothèque, réglage des préférences etc...

Annoter votre bibliothèque ou vos dossiers ou sous-dossiers

Faire une recherche dans les éléments de votre bibliothèque

Saisir manuellement une notice

Joindre un fichier à une référence

Créer une notice à partir de la page web en cours

Organiser sa bibliothèque

Par dossiersPar marqueurs (« tags »)

Source : Mathieu Poujol

Exercice

Enregistrez vos références sur le sevrage tabagique dans- un sous-dossier intitulé « sevrage tabagique »- qui se trouvera lui-même dans un nouveau dossier de la bibliothèque intitulé : « Tabacologie ».

Correction

Correction (2)

Correction (3)

Exercice

A l'ouvrage « Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale » (déjà dans votre bibliothèque Zotero)- enlevez le mot-clef : « alcooliques – soins médicaux »- ajoutez le mot-clef « thèse2012 »

Exercice

- Ajoutez le mot-clef « thèse 2012 » à 3 références de votre bibliothèque Zotero

- Affichez ensuite tous les documents qui contiennent le mot-clef « thèse 2012 »

Associer un fichier à une référence

On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier en ligne

On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier qui se trouve sur l'ordinateur

Exercicehttp://hal.archives-ouvertes.fr

Dans l'archive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la référence de la thèse suivante

Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thèse] Université de Nantes, 2008.

Exercice (suite)

Associez à la référence importée le fichier PDF du document (texte intégral de la thèse – version 1).

Correction

Afficher le pdf dans Firefox

Sélectionner la référence du document dans Zotero

Cliquer sur « capture de la page » (menu Zotero > trombone)

Correction

1. On sélectionne la référence d'abord

2. On enregistre le pdf qui est affiché dans Firefox

Correction

Il sera possible, même sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier.

Exercice : annoter un document

- affichez la capture d'écran de l'article de 2009 d'Antoine Flahaut sur la grippe A (déjà importé).

- surlignez une phrase de texte et ajoutez-y un commentaire

Correction

(Malheureusement cette option ne fonctionne pour l'instant que pour les pages html, pas pour les pdf)

1.Découvrir2.Installer3.Importer une référence4.Organiser5.Exporter une bibliographie6.Partager

Exportation d'une bibliographie dans un document texte

Bibliographie simple

Bibliographie intégrée

(dans le traitement de texte)

Exercice

Exportez l'ensemble de vos références traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style « Vancouver »

Correction

Correction (2)

Correction (3)Coller le presse-papier dans un document texte.

1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul.

2. Metzger-Flock A. Particularités de l'aide au sevrage tabagique en médecine générale : à propos d'une enquête réalisée auprès des médecins généralistes de la région mulhousienne. 2005 ;89 f.

3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003.

Exercice

Installer le plug-in Zotero pour Word depuis le site Zotero.org

Correction

Zotero.org> Support

> Word Processor Integration > Installation

> Word pour Windows plug-in

L'outil de citation (avec Word ou Open Office)

Source : Daniel Bourrion

Bibliographie intégrée : 2 étapes

Insérer des citations – références

Insérer la bibliographie complète

Exercice

Dans un nouveau document Word, insérez trois références de votre

bibliothèque Zotero sous forme de citations avec le style « Vancouver »

Correction

Exercice

Insérer la bibliographie complète des références déjà ajoutées en citation.

Exercice

Ajouter à cette bibliographie une référence qui ne fait pas partie des citations du document.

De nombreux styles sur Zotero.org

http://www.zotero.org/styles

1. Découvrir2. Installer3. Importer une référence4. Organiser5. Exporter une bibliographie6. Partager

Sauvegarde de données

On peut sauvegarder manuellement sa bibliothèque Zotero sur un disque dur

Pour l'utiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero

Pour l'importer dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on décide d'en changer : EndNote, Mendeley etc

Exercice

Exportez votre bibliothèque Zotero en format RIS sur votre disque dur.

Envoyez vous le fichier par mail.

Sauvegarde de données (2)

Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothèque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne.

Exercice

Depuis votre boîte mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (créé en début de séance)

Exercice (suite)

Dans les préférences de Zotero, entrez les paramètres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos références avec votre compte en ligne

Correction

Exercice

Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligne

Correction

Vous avez dorénavant 2 bibliothèques Zotero

Une bibliothèque locale

Une bibliothèque « en ligne »

Ces 2 bibliothèques sont synchronisées.

Ma bibliothèque Zotero (Library) en ligne

Ma bibliothèque Zotero locale

Synchronisation

Exercice

- Connectez vous sur le site de Zotero (« login ») afin de pouvoir visualiser et gérer votre bibliothèque Zotero en ligne.

- Modifiez les paramètres de visibilité de votre page selon votre convenance

Paramètres de confidentialité : un exemple

Exercice : travail en commun sur Zotero

- trouvez puis rejoignez sur Zotero en ligne le groupe « Médecine UBO »

- ajoutez 3 références à la bibliothèque du groupe

Zotero People, le futur Facebook des chercheurs?

Merci de votre attention!

Pour aller plus loin http://delicious.com/phelly/zotero

Ce diaporama est visible et téléchargeable sur http://slideshare.com/phelly

Pour toute question sur Zoteroperrine.hellyATuniv-brest.fr

Crédits photographiques

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Education

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