Biobanking dynamique en oncologie - canceropole-idf.fr · U900 Laetitia Chanas Julien Roméjon Philippe Hup

18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau

Partage de données cliniques

pour la recherche sur le cancer

Biobanking dynamique

en oncologie

ATGCACGACAGU UGCTTGUGCATCGAUTGCA

TUCGAUCGATCACGACGATCGATCGACAGCATGCATCGAGTCGATGCACGA

GTCGATCAGCATCGTGGTCTCTGACTAGTCTATCATGCATCGACTAGCTACGATCGACTAGCTA

GCTACGATCGATCGATCGCTATCGACAGCGACGGFCGTACGCTACGATCGACTAGCATGCTGACTAGCTACGATCGATCAGCTATCGGTACAGCGGA

AGTCCGCGCGCGCGTAACAGTCAGCTAACTGCATCATATCAGCATAGCATCATCC

TCAGCATCAGCATCAGTAGCTCTAGCATCAGCAG

Clinique et recherche : rassembler 2 mondes

Hôpital Centre de Recherche

Institut Curie

Cancer du sein carcinocanalaire inf. RO+ RP- HER2

trastuzumab bevacizumab nivADN ARN 4 tubes de tissus tumpatiente ayant une sœur atteintsans récidive à 5 ans pneumop

mastectomie totale le 18/10patiente incluse dans l’

essai SHIVA


Tube de tissu

Tumoral(Prélevé le 10/10/2013, 2mg)

Patient(e)

53 ans

67 kgs / 1,65m

Vivante

Diabétique

Caractéristiques tumorales

Cancer du sein

Carcinome canalaire infiltrant

Taille : 4 cm

75% de cellules tumorales

Analyses

RO-

RP-

HER2-

Ki67 (%)

Mutation exon 12

Chirurgie

Tumorectomie + CA

Chimiothérapie adjuv.

TAXOTERE /

HERCEPTIN

Radiothérapie

Oui

L’échantillon : lien entre clinique et recherche

Evénements pathologiques

Tumeur primitive en 2013

Récidive en 2015

Métastases hépatiques en 2016

Un échantillon biologique


Biobanque virtuelle(MBioLIMS® / Modul-Bio)

CRB

> Tumorothèque Paris

55.000 prélèvements

soit 180.000 échantillons

> Sérothèque Paris

160.000 échantillons

Génétique somatique

et constitutionnelle



Pharmaco

Génomique



Tumorothèque

St-Cloud


Sérothèque

St-Cloud



Rassembler le patrimoine virtuellement


Annoter cliniquement les échantillons

Patient

Traitements

Echantillonbiologique

AltérationsgénomiquesPMSI

Résultatsexamenscliniques

Orbis PMSI

Elios NGFilemaker Pro

Chimio

Biothèque

ARIANE


Images

ConSoRe

Le dossier médical : pivot de l’annotation


Aujourd’hui

Méta.

2013

Diagnostic

Première

consultation

Traitement

MAJ

annotations

2015

Rechute

MAJ

annotations

Dossier médical

BioMEDICS

Osiris: Un modèle commun

• Proposition de 2 modèles : un clinique et un « omique »• Présentés par l’équipe du SIRIC Curie et validés par le groupe OSIRIS en 2014• Promouvoir le partage de données en cancérologie• Financement d’une preuve de concept en cours par l’INCa

Neoplasm

PrimaryNeoplasm

Relapse Metastaticrelapse

Co-morbidity and Adverse Events

Related diseases

Antecedents and Risk Factors

T0

Patient history


BIOMEDICS : visualisation des données


BIOMEDICS : visualisation des données


Anonymisation

Question scientifique ?

BIOMEDICS : APIs vers les équipes de recherche

Données cliniques

Résultats d’analyses :(genomique, immunologie, micro environnement tumoral)


Hôpital

Centre de

Recherche

BIOMEDICS : APIs pour les collaborations externes

Dénombrements


CLCCConSoRe

Direction des Données – Institut Curie

CDO

Xosé Fernandez

Adjoints

Alain Livartowski

Emmanuel Barillot

Team « Intégration »

Julien Guérin

Thomas Balezeau

Team « Bases de données »

Marie-Christine Falcou

Mari-George Christophe

PMSI

Julie Perlbarg-Samson

Florence Bachelot

CRB

Odette Mariani

U900

Laetitia Chanas

Julien Roméjon

Philippe Hupé

Sponsors

DSI

Philippe Rizand

Christophe Mattler

Maël Priour


Documents

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