CV + activités recherches + Publications O. MESTE

Nom : MESTEPrénom : OlivierGrade détenu :PR 2E CL Section :61

Etablissement d’affectation au cours des deux dernières années : Institut Universitaire deTechnologie de Nice-Sophia Antipolis (Dept GEII)

Laboratoire ou école doctorale :Laboratoire I3S

Lieu de préparation du doctorat : Université de Nice-Sophia Antipolis, Laboratoire I3S

Date d’obtention de la thèse :15 Septembre 1992

Lieu d’obtention de la thèse :Université de Nice-Sophia Antipolis, Laboratoire I3S

Directeur de thèse :PR Hervé RIX

Domaines de spécialité scientifique au sein de la section :Génie Biomédical, Traitement dusignal

Liste des 5 publications caractéristiques des domaines de spécialité :

O. Meste, B. Khaddoumi, G. Blain, S. Bermon. Time-varying analysis methods and modelsfor the respiratory and cardiac system coupling in graded exercise.IEEE Trans. Biomed. Eng.,52(11) :1921-1930, 2005.

G. Blain, O. Meste, S. Bermon. Influences of breathing patterns on respiratory sinus arrhyth-mia in humans during exercise.Am. J. Physiol., 288 :H887-H895, 2005.

G. Blain, O. Meste, Blain A., S. Bermon. Time-frequency analysis of heart rate variability re-veals cardiolocomotor coupling during dynamic cycling exercise in humans.Am. J. Physiol.,296(5) :H1651-9, 2009.

A. Cabasson, O. Meste, G. Blain, S. Bermon. Estimation and analysis of the PR intervals du-ring exercise and recovery.IEEE Trans. Biomed. Eng., 56(11) :2675-2683, 2009.

S. Boudaoud, H. Rix, O. Meste. Core shape modelling of a set ofcurves. Elsevier,Computa-tional Statistics and Data Analysis, 54 :308-325, 2010.

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Titres et diplômes :– Baccalauréat série E (1984)– DUT Génie Electrique option électronique-UNSA (1986)– Licence EEA (1987)– Maîtrise EEA (1988)– DEA Automatique et traitement du signal (1989)– Thèse de Doctorat en Sciences avecLabel Européen, soutenue le 15 Septembre 1992

à l’Université de Nice-Sophia Antipolis et intitulée “Contribution à l’analyse de signauxnon-stationnaires : application à l’étude de signaux biomédicaux”. Financement : bourseMENSR, Mention très honorable avec félicitations du jury Directeur de thèse : Pr. H. RixComposition du jury : Pr. F. Dubus, Pr. G. Alengrin, Pr. P. Caminal, Pr. F. Castanié, DR P.Flandrin

– Maître de Conférence (titulaire-61 EME section) en 1993. Etablissement d’affectation :Ecole Supèrieure des Sciences Informatiques (ESSI) de Sophia Antipolis

– Diplôme d’Habilitation à diriger des Recherches, soutenule 21 Nov. 2003 à l’Université deNice-Sophia Antipolis et intitulé "Modélisations et Traitements de Signaux Biomédicaux".Composition du jury : DR J.L. Coatrieux (Président), Pr. J. Duchêne (Rapporteur), Pr. J.Le Roux (Rapporteur), Pr. L. Sörnmo (Rapporteur), Pr. H. Rix(membre), MCF (habilité)E. Thierry (membre), Pr. J.P. Camous (membre invité)

– Professeur des Universités, département GEII (61 EME section) en 2006. Etablissementd’affectation : Institut Universitaire de Technologie

Synthèse de la carrière :La présentation de mon activité de recherche a pour but de montrer que tout en étant diversifiéequant aux méthodes et aux applications, elle se focalise surle thème "Traitement des signauxbiomédicaux" qui est une spécialité du Génie Biomédical (GBM).En guise d’introduction, ma position au sein de l’équipe de recherche BIOMED est présentéeafin de préciser quelles sont les bases historiques sur lesquelles repose mon activité de rechercheet dans quel contexte l’encadrement de stages de DEA et de thèses a pu s’effectuer.J’ai mené cette recherche dans le contexte scientifique proposé par l’axe BIOMED (H. RIX-PR,V. ZARZOSO-MCF, O. MESTE-PR), équipe qui regroupe des chercheurs du laboratoire I3S etdes médecins : F. RAYBAUD jusqu’en 2009 et G. SUISSE, Praticiens Hospitaliers, ayant uneformation scientifique complémentaire (DEA ou Doctorat SPI). Cette association permet d’abor-der des problèmes réels posés par la Médecine ou la Physiologie concernant l’interprétation dessignaux biomédicaux. Mon activité au sein de cette équipe sesitue dans le domaine du Traite-ment du Signal pour ce qui concerne l’élaboration de nouveaux concepts ou outils et en amont duGénie Biologique et Médical pour les applications. Dans le même type d’activité, nous pouvonsciter les équipes de Lotfi SENHADJI (INSERM- Rennes 1), Catherine MARQUE (CNRS-UTC),Jacques DUCHENE (UTT), Paul RUBEL (INSERM- INSA Lyon) avec lesquelles j’entretiensdes relations suivies. Les principaux domaines d’application actuels sont l’électrocardiographie(ECG), les signaux électriques cérébraux (EEG et PE) et l’électromyographie (EMG) de surface.

Les signaux étudiés sont donc des transitoires bruités souvent répétitifs. Ce sont soit des

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signaux 1D soit des signaux vectoriels constitués d’enregistrements simultanés provenant decapteurs diversement positionnés ou d’enregistrements successifs d’un même capteur.

Les problèmes généraux rencontrés sont l’estimation de signaux moyens associés le plussouvent à des phénomènes permanents ou stables au cours du temps, la caractérisation de lavariabilité naturelle et enfin la mesure de variations significatives de paramètres ou plus généra-lement de formes, liées à un agent extérieur tel qu’une pathologie, un effort ou un médicament.Les approches théoriques relèvent de la détection, de l’estimation de modèles paramétriques,semi-paramétriques ou non paramétriques et de la classification dans le cas non stationnaire.

Dans ce contexte, mon travail de recherche et d’encadrementa été orienté par les différentesmissions et collaborations auxquelles j’ai participé. Cesmissions (1-30 Oct. 89, 1-31 Sept. 90,15-23 Sept. 91) ont été effectuées dans le cadre d’actions intégrées (responsable Pr. H. Rix) entrel’I3S et l’Institut de Cybernétique de Barcelone-ESPAGNE (responsable Pr. P. Caminal). Lesthèmes de recherche motivant ces déplacements étaient la détection et l’estimation de potentielsretardés dans les électrocardiogrammes, en utilisant des méthodes mises au point par la colla-boration des deux laboratoires. Ces déplacements ont également permis d’initialiser un projetsubventionné par l’OTAN (1992-1995) réunissant l’I3S (responsable Pr. H. Rix), l’institut deCybernétique de Barcelone-ESPAGNE (responsable Pr. P. Caminal) et le département GBM del’Université Johns Hopkins de Baltimore-USA (responsablePr. N. Thakor). Le thème principalde ce projet était la surveillance d’opérations chirurgicales à partir de résultats obtenus par untraitement adaptatif des signaux que sont les Potentiels Evoqués cérébraux. Ces collaborationsanciennes sont maintenant remplaçées par de nouveaux échanges internationaux, impliquant laPologne et différents partenaires européens (cadre des projets européens, collaboration CNRS-Académie des Sciences de Pologne) et nationaux (Action Concertée Incitative, Action Spéci-fique).

On pourra remarquer que la présentation est orientée par lesapplications plutôt que par lesméthodes. Ce choix personnel, correspondant à mes véritables motivations, reste en adéquationavec les orientations thématiques du laboratoire d’accueil et de la section 61, les méthodes exis-tantes de traitement des signaux ne permettant pas de résoudre tous les problèmes rencontrés enGBM, je me suis donc investi également dans des domaines plusthéoriques.

Cette diversification des axes de recherche se retrouve également dans les thématiques d’en-seignement, de même que dans les filières associées. Comme l’atteste la liste des enseignementsprésentée dans la section "Activités pédagogiques", j’ai pu enseigner devant un large spectred’étudiants, du niveau BAC +1 jusqu’au Master.

Bien que restant localisé sur l’Université de Nice-Sophia Antipolis, l’évolution de ma car-rière révèle là aussi une diversification des tâches, quelles soient administratives ou scientifiques.La tâche administrative actuelle correspondant à mon statut de directeur adjoint de l’I3S (undes plus gros laboratoire de l’UNS) est à une étape importante de ma carrière. Elle me permetde façon privilégiée de mener des projets en tous genres, au niveau de la politique scientifique,budgétaires ou bien simplement dans le bon suivi du déroulement des activités des membres dulaboratoire.

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Activité scientifique :

1.Thématiques de rechercheMon activité de recherche, trés diversifiée dans le passé quant aux applications (ECG, EMG,EEG, PE), se concentre depuis quelques années sur les domaines de l’Electrocardiographie. Cedomaine apparaît comme étant le moteur (le coeur♥) de mon activité de recherche c’est pour-quoi seule cette application sera développée dans cette section.Ce thème de recherche a été abordé initialement pour l’analyse et la détection de potentiels tardifsdans les Electrocardiogrammes (ECG) (un ECG est représentéschématiquement dans la figure(1)) en collaboration d’abord avec le Laboratoire de Cardiologie de l’Hôpital Pasteur, Nice (Dr.A. Varenne) et ensuite avec le Service de Cardiologie (Dr. J.P. Camous) du même établissement.

- -��R-R(1) R-R(2)

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FIGURE 1 – Définition des ondes et des périodes de l’ECG. R-R(i) correspond au ième intervalleR-R, P-R(i) correspond au ième intervalle P-R

A l’analyse des ondes P (hors épisode de fibrillation) dans les ECG de patients souffrantde fibrillation auriculaire s’ajoute la caractérisation deces mêmes ondes pendant l’effort [64]ou lors d’épisode d’apnée du sommeil [68],[76]. La transformation de ces ondes P en ondes Flors des épisodes de fibrillations auriculaires est traitéeen s’intéressant au problème de sépa-ration des activités auriculaires et ventriculaires. Cette séparation est abordée à la fois à l’aidede techniques de soustraction spatio-temporelle [72] et deséparation de sources (aveugle ousemi-aveugle) [6]. Pour la travail présenté dans [86], Mr. P. BONIZZI, un doctorant que j’en-cadre actuellement, a reçu leprix du meilleur poster à la conférence internationale "ComputerIn Cardiology" en 2009. Une récente collaboration avec le Centre hospitalier Princesse Grace(CHPG) de Monaco et l’Université de Valence (Espagne) a permis de développer des méthodesde mesure de complexité basée sur des décompositions en composantes principales [28]. A l’aidede cette technique, nous avons pu mettre en évidence le caractère prédictif de cette mesure sur lesuccés de l’opération d’ablation (communications soumises ). En parallèle, j’étudie les signauxde fibrillation ventriculaire recueillis en interne (via uncathéter) par l’équipe du Professeur J.P.CAMOUS (Hôpital Pasteur de Nice) lors de la pose de défibrillateurs implantés. Les épisodes defibrillation sont provoqués pour diverses fréquences du stimulateur cardiaque et une évaluationde la période réfractaire (plus petit intervalle de temps entre deux stimulations déclenchant la

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réaction du coeur) est réalisée par le médecin. Ces signaux sont généralement modélisables parun fondamental et des harmoniques. Les enjeux sont l’interprétation et l’utilisation clinique desrelations existant entre la fréquence fondamentale, la fréquence du stimulateur et la période ré-fractaire [115]. Cette application a permis une collaboration ponctuelle avec le CHU de Rangueil[30], [93] en particulier avec le docteur G. LATCU, qui est maintenant au CHPG de Monaco etqui a été l’élément déterminant pour l’établissement du partenariat avec le CHPG. L’apparitiondu phénomène d’alternance des ondes T étant un signe précurseur d’épisodes d’arythmie (parexemple la fibrillation ventriculaire), je me suis intéressé au problème de la détection robustedes instants d’apparition de ce phénomène [79],[84] en collaboration avec l’équipe polonaise duProfesseur R. MANIEWSKI, Institut de Biocybernétique et Génie Biomédical de Varsovie.

Récemment, j’ai abordé un nouveau domaine d’application encollaboration avec le labora-toire de Physiologie de la Faculté de Médecine de Nice (Dr Stéphane BERMON) sur l’analyseet la modélisation de la variabilité du rythme cardiaque en présence d’exercice [55], [59], [62],[63], [63], [20], [22],[26]. Cette problématique est, en fait, étudiée depuis de nombreuses annéespar la communauté des Traiteurs de Signaux en biomédical mais essentiellement pour des sujetsau repos. Il s’avère que les protocoles que nous proposons permettent de mettre en évidence lesmodèles sous-jacents de l’influence de la respiration sur lerythme cardiaque (Arrhytmie sinu-sale respiratoire). Pour cela, j’ai proposé aux médecins des approches temps-fréquences baséessur des modèles évolutifs associés à des méthodes de pistages de fréquences. Un des résultatsnovateurs est la remise en cause du modèle IPFM (Integral Pulse Frequency Modulation) utiliséjusqu’à présent pour expliquer la modulation observée du rythme cardiaque (mesuré à partir desinstants d’apparition des ondes R de l’ECG, voir Figure 1) à partir de la respiration. Un aspectégalement novateur est l’analyse de l’intervalle P-R (voirFigure 1) qui permet de mesurer l’in-tervalle P-P à partir de R-R. La construction de la courbe P-R(i)=f(R-R(i)) a mis en évidence uneffet appelé hystérésis, lorsque l’on distingue les intervalles "effort croissant" et "récupération".La mesure de l’effet d’hysteresis est délicate car ses valeurs sont faibles et les ondes P enregis-trées au plus fort de l’effort sont superposées aux ondes T. L’utilisation de méthodes généralisantl’approche "Woody" en prenant en compte explicitement tousles types de bruits enregistrés si-multanément, a permis d’obtenir des mesures d’hystérésis fiables et précises [67], [70], [27]. Deplus, ce travail orienté par une application biomédicale a mis en évidence la sous optimalité dela méthode de Woody et a permis d’améliorer cette dernière [25].

D’autres analyses des intervalles P-R ont montré que les propriétés de conduction atrioventri-culaire permettent de distinguer les sujets sportifs très entraînés comparés aux sujets sédentairesou moyennement entraînés [73], [77]. Pour le travail présenté dans [73], Mlle A. CABASSON,une récente doctorante, a reçu leprix du meilleur poster à la conférence internationale "Com-puter In Cardiology" en 2006.

Les résultats de ma collaboration avec S. Bermon (CHU Pasteur et maintenant Institut Mo-négasque de Médecine et Chirurgie du Sport-IM2S) et G. Blain(étudiant que j’ai encadré offi-cieusement en thèse) ont permis à cet étudiant de rejoindre l’équipe internationalement reconnuedu Professeur DEMPSEY (Madisson-USA) pour un travail post-doctoral qui s’est transformé enposte de Maître de Conférence à Lille. Ce travail a égalementété sélectionné en partie (extraits del’article [20]) pour apparaître dans le livreYear Book of Sport medicine 2006, Ed. Elsévier. De

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plus la qualité des résultats a permis à G. BLAIN de recevoir le prix "Louis AURIACOMBE"lors du Congrés Coeur et Sport en 2006. Un résultat original récent met en évidence une nouvelleinfluence mécanique provenant de l’action de pédalage [26].

Thèmes de recherche théorique

En relation avec les domaines d’application précisés ci-dessus, ma recherche m’a amené àrencontrer divers problèmes théoriques qui sont énumérés ci-dessous (les thèmes écrits en ita-liques font l’objet d’un intérêt particulier à cette date).Ces problèmes théoriques intervenantdans le domaine du Traitement du Signal, les résulats majeurs sont donc publiés dans des re-vues correspondantes (Signal Processing, IEEE Trans. Biomed. Eng.rubriqueSignal Processing,Computational Statistics and Data Analysis).

– Estimation de temps de retards entre signaux dont on ne possède pas de modèle a priori :dans le cas d’une barrette de n capteurs équidistants (EMG) des hypothèses plus ou moinssimplificatrices peuvent être émises. Le signal est identique ou variable d’un capteur àl’autre ; les retards entre capteurs consécutifs sont identiques ou variables (vitesse de conduc-tion constante ou non).

– Estimation de rapports d’échelle temporelle entre deux signaux.– Estimation conjointe de facteurs d’échelle et de retards.– Estimation de fréquences "significatives" de faible amplitude (microstructure du som-

meil) ; estimation du fondamental (lentement variable) et des harmoniques d’un signal(fibrillation ventriculaire); suivi de fréquences évolutives (variabilité de l’intervalle RRen présence d’exercice).

– Etude d’un filtrage dépendant de la forme des signaux (filtrage polynômial) pour la détec-tion de micro-potentiels en ECGHA.

– Recherche de méthodes de sommation de signaux répétitifs présentant des fluctuationsd’échelle, de position ou plus généralement de forme.

– Classification et analyse des formes de signaux transitoires.– Séparations aveugles de sources– Filtrage temps-fréquence

2.PublicationsO. Meste, B. Khaddoumi, G. Blain, S. Bermon. Time-varying analysis methods and modelsfor the respiratory and cardiac system coupling in graded exercise. IEEE Trans. Biomed.Eng., 52(11) :1921-1930, 2005.Cette publication est fondatrice et correspond à un travailde collaboration réunissant des trai-teurs du signal (nous) et des chercheurs en physiologie sportive. Nous avons montré qu’à partirdu rythme cardiaque pouvait être déduites des informationssur la respiration en utilisant denouvelles méthodes de suivi de piste fréquentielle. En plusdes méthodes proposées, un mo-dèle mathématique permettant d’expliquer l’influence du phénomène respiratoire sur le rythmecardiaque a été proposé. Ce travail théorique a permis de produire les résultats présentés dansl’article ci-dessous.

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G. Blain, O. Meste, S. Bermon. Influences of breathing patterns on respiratory sinus ar-rhythmia in humans during exercise.Am. J. Physiol., 288 :H887-H895, 2005.Cet article a été publié dans une des meilleures revue du domaine de la physiologie. Cette publi-cation contient des aspects de modélisation mathématique qui permettent d’expliquer la variabi-lité cardiaque au maximum de l’exercice physique par rapport à la respiration. Les observationset le modèle que nous proposons ont permis pour la première fois d’établir une relation lineaireentre cette variabilité et le volume respiratoire.

G. Blain, O. Meste, Blain A., S. Bermon. Time-frequency analysis of heart rate variabi-lity reveals cardiolocomotor coupling during dynamic cycling exercise in humans.Am. J.Physiol., 296(5) :H1651-9, 2009.Les résultats font suite à la publications précédente sur l’analyse de la variabilité cardiaque. Al’aide de techniques de filtrage temps-fréquence (la fréquence d’intérêt varie dans le temps), nousavons montré que par un effet mécanique le mouvement cyclique des jambes a une influence in-directe sur la variabilité cardiaque. Ces résultats, tout àfait nouveaux, reposent dans ce cas sur lamodélisation à l’aide d’un processus stochastique du mouvement des jambes [106],[110].

A. Cabasson, O. Meste, G. Blain, S. Bermon. Estimation and analysis of the PR intervalsduring exercise and recovery.IEEE Trans. Biomed. Eng., 56(11) :2675-2683, 2009.Cet article est un exemple de développement d’algorithme detraitement ad hoc du signal. Bienque le problème d’estimation de temps de retard soit classique, nous avons développé un esti-mateur adapté à la présence de l’interférence constituée par la superposition d’ondes. Les trésbonnes performances de cet estimateur ont produit des résultats originaux dans l’analyse desintervalles P-R (cf Thématiques de recherche). Cet estimateur est basé sur un modéle générali-sant l’observation d’ondes inconnues retardées. Il faut noter que dans le même ordre d’idée, lapublication [25] correspond à une formalisation et amélioration d’une methode empirique d’es-timation de temps de retard bien connue dans le génie biomédical (méthode de Woody).S. Boudaoud, H. Rix, O. Meste. Core shape modelling of a set ofcurves. Elsevier,Computa-tional Statistics and Data Analysis, 54 :308-325, 2010.Ce travail contient à la fois des aspects théoriques et pratiques concernant une des particularitésde notre équipe de recherche. Là aussi, la volonté de résoudre des problèmes biomédicaux ne sefait pas au détriment des aspects théoriques, en particulier sur les problèmes d’analyse de don-nées.

3.Encadrement et animation recherche

– Directeur Adjoint du Laboratoire I3S depuis Janvier 2008.Dans la période de transition(2007-2008) en tant que futur directeur adjoint j’ai participé à la restructuration de l’I3S età l’élaboration des différents documents attachés à la proposition d’UMR pour le contratquadriennal 2008-2011. Le laboratoire, dans sa nouvelle structure, accueille 92 membrespermanents, 17 membres associés et 125 membres non-permanents (étudiants). Les docu-ments associés sont disponibles aux adresses http ://www.i3s.unice.fr/I3S/Rapport.pdf et

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http ://www.i3s.unice.fr/I3S/Rapport2006-2007.pdf.Mon rôle est d’assister le directeur dans ses choix et de representer le Laboratoire dansdifférents projets (mise en place du Campus STIC à Sophia Antipolis par exemple). Cetravail concerne aussi bien la politique scientifique du Laboratoire que la gestion du per-sonnel, des bâtiments, des outils d’information (participation à la conception d’outils decommunication).

– Responsable de la thématique "Traitement du signal pour lebiomédical" depuis 2008.Cette thématique fait partie du pôle "Signaux, Images, Systèmes" du laboratoire.

– Membre du Conseil Scientifique CNRT Télius jusqu’en 2005, en tant que représentant dela thématique STIC-Santé.

– Co-organisateur avec F. Donzé (Hewlett-Packard) du symposium "Stic-Santé" dans lecadre du CNRT Thélius, qui se déroula à Sophia Antipolis le 12Juin 2005.

– Co-organisateur avec G. Bernot de la journée BioSTIC de l’I3S en 2008. Le but de cettejournée était de présenter l’actvité de l’I3S dans la thématique de la Biologie/Biomédicalà travers des exposés de membres de l’I3S mais également en invitant des orateurs d’autresLaboratoires. Le programme se trouve sur le site http ://www.i3s.unice.fr/EVENEMENTS/archive.php

– Co-organisateur avec R. Maniewski du séminaire international de l’institut de Biocyberné-tique de Varsovie-Académie des sciences de Pologne, intitulé "Variability of BiomedicalSignals" qui s’est déroulé à Varsovie pendant deux jours en Novembre 2008.http ://www.i3s.unice.fr/EVENEMENTS/archive.php

– Dans le cadre des conférences IEEE EMBS et Computer In Cardiology, je fais chaqueannée partie du comité de sélection et participe aux congrésen tant que Chairman. Jeserai, par exemple, ChairTrack de "Algorithms for Data Mining and Data Processing" duthème "Biomedical Signal Processing" à la conférence IEEE EMBC en 2010.

– Directeur de 8 thèses (E. Bataillou-30%-, M. Perrone-30%,G. Suisse-50%, W. Muhammad-50%, B. Khaddoumi-70%, G. Malherbe (non terminée)-100%, S.Boudaoud-50%, A. Cabasson-100%) plus 2 en cours (P. Bonizzi-50%, G. Laouini-100%).

– Participation aux GDR ISIS et STIC-SANTE. A ce titre laco-responsabilitédu thème"Signaux et image en Santé" du GDR STIC-SANTE m’a été proposée et je devrais exercercette fonction pour l’exercice 2011.

4.Valorisation de la rechercheLes actions de valorisation actuelles et futures correspondent à des collaborations thématiquesdans des cadres nationaux et internationaux. Elles font suite à desActions Intégrées(Espagne),Projet OTAN (Espagne, USA, France),Action Concertée EuropéenneSENIAM, plus an-ciennes ou à des actions qui viennent de se terminer, telle qu’une action concertée incitative(Classification automatique de l’onde P d’un ECG en vue du dépistage de la fibrillation auricu-laire) et une action spécifique (Interprétation de signaux biomédicaux conduite par modèles)

Les actions en cours sont :– Projet national de recherche espagnol"Applications biomédicales du traitement du si-

gnal dans le suivi, l’interprétation et la modélisation multimodale de signaux cardiorespi-

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ratoires et polysomnographiques".Ce projet réuni 13 chercheurs de différents pays, j’en suis le représentant français et 7 espa-gnols en font partie. Il vient de se terminer. Je suis membre d’un nouveau projet du mêmetype qui vient d’être soumis et dont le titre est "Multimodalbiomedical signal processingfor analysis and characterization of cardiovascular, respiratory and autonomic disorders".

– Partenaire d’un projet Européen Marie Curie Fellowship finançant une thèse (P. Bonizzi)intitulée "Atrial activity extraction in atrial fibrillation episodes". Ce projet permet de fi-nancer 16 bourses de thèses réparties sur 4 pays (France, Portugal, Belgique, Danemark)ainsi que des sessions de cours.

– Un PICS CNRS/académie des Sciences de Pologne (Institute of Biocybernetics and Bio-medical Engineering, Warsaw) dont je suis coordinateur côté français vient d’être acceptépour une durée de 3 ans. Il fait suite à un programme bilatéralentre ces deux organismes.Le titre est "Variabilité des signaux biomédicaux : analyseet interprétation pour l’aide audiagnostic non invasif". Ce projet financera intégralement3 missions de 15 jours, par an etpar partenaire en plus de l’organisation de séminaire sur lethème.

– Partenaire d’un projet Européen Marie Curie Fellowship finançant une thèse intitulée "Atrialactivity extraction in atrial fibrillation episodes"

– Projet ANRsoumis jeune chercheur (responsable V. Zarzoso) PERSIST (Caractérisationmultidimensionnelle du signal électrocardiographique pour prédire le succés de la thérapied’ablation par radiofréquence chez les patients souffrantde fibrillation auriculaire persis-tante)

5.RayonnementLes collaborations actuelles sont :

– Service de Cardiologie (Pr J.P. CAMOUS, Dr F. RAYBAUD), CHUde Nice. Sujet : ana-lyse de la fibrillation ventriculaire et auriculaire

– Service d’Explorations Fonctionnelles du Système Nerveux (Dr G. SUISSE, Dr M-N. MA-GNIÉ), CHU de Nice. Sujet : Analyse du sommeil.

– Service de Psychiatrie (Pr. PRINGEY), CHU de Nice. Sujet : Analyse du rythme cardiaquechez les dépressifs.

– Institut IM2S de Monaco (Dr S. BERMON). Sujet : Variabilitédu rythme cardiaque enprésence d’exercice

– Centre hospitalier Princesse Grace de Monaco (CHPG) (Pr. N. SAOUDI). Sujet : Analyseet caractérisation du phénomène de fibrillation auriculaire dans le cadre de son ablation.

– Institut de Biocybernétique et GBM de Varsovie (R. MANIEWSKI). Sujet : Etude de si-gnaux biomédicaux (ECGHA, Mapping cardiaque, Laser-Doppler). Contrat bilatéral CNRS/Acad.Sci. de Pologne depuis 1997.

– Université de Valence, Espagne (P. CASTELLS). Sujet : Analyse et caractérisation duphénomène de fibrillation auriculaire en BSPM.

– Université de Saragosse, Espagne (Pr. P. LAGUNA). Sujet : Modélisation du couplagecardio-respiratoire à partir de l’enregistrement des ECG.

– De façon moins formelle avec L. SORNMO (Université de Lund,Suède) dans le cadre du

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traitement du signal électrocardiographique.Les autres actions sont :

– Invité (séjours 2 à 3 jours) dans les Universités de Saragosse, Valencia, Lund, Dublin. Cesséjours correspondaient également à des invitations pour séminaires ou pour répondre àdes appels à projet.

– Expert depuis 2 ans pour l’école doctorale MATISSE (Univ. Rennes).– Participation à 11 Jurys de thèse (1 fois président) dont 3 fois à l’étranger. Rapporteur de

6 thèses (3 Universités étrangères).– Membre du comité de lecture des revuesIEEE transaction on Biomedical Engineering

(voir lettre ci-jointe),IEEE transaction on Signal Processing, Medical Engineering & Phy-sics

– Membre du Technical Committee BISP de IEEE Signal Processing Society depuis 4 ans.A ce titre je fais partie du comité de sélection des congrés ICASSP et ISBI.

Activités pédagogiques

1.Présentation de l’activitéPar soucis de clarté, l’activité est présentée ici en détailuniquement depuis l’année 2004. L’ob-tention d’un poste de Professeur à l’IUT GEII a entrainé une modification importante des en-seignements dispensés mais également un changement des pratiques pédagogiques. En effet, leprogramme de l’IUT est basé sur une canevas national ne permettant pas une réelle souplessedans l’orientation des enseignements à la différence des écoles d’ingénieurs. La possibilité quim’est donnée d’intervenir à l’EPU (Polytech Nice) et en Master, me permet de retrouver cettesouplesse et d’enseigner au niveau maîtrise (M1 et M2).

Année 2004-05

1. Automatique (deuxième année de l’ESSI) : responsable du module “Introduction à l’esti-mation de paramètres, application à l’Automatique”

Dans ce cours, la théorie de l’estimation sera présentée sous un aspect pratique ayant pourbut l’utilisation de moyens informatiques. Les méthodes générales seront présentées ainsique des exemples d’applications. Les estimateurs ainsi introduits nous permettrons d’iden-tifier les paramètres de modèles classiques utilisés en Automatique.– 24 heures de cours intégrés

2. Signaux et Systèmes pour l’informatique (première annéede l’ESSI)– 32 heures detravaux dirigés relatifs à l’analyse de systèmes du 1er et second ordre,

à l’acquisition des signaux, au filtrage numérique, au codage en sous-bande, aux sérieset transformées de Fourier, à la transformée en Z. Ces travaux dirigés font appels aulogiciel de simulation MATLAB

3. Architectures des ordinateurs (première année de l’ESSI)

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– 32 heures detravaux dirigés sur les machines d’états finis, les structures de contrôles,les langages machines, les micro-instructions, la hiérarchie mémoire

4. Langages Assembleur (première année de l’ESSI) : responsable du cours dont le contenupeut se résumer à une présentation des langages assembleur reposant sur une architectureRISC telle que l’ARM7. Cette mise à jour permet de proposer une architecture plus mo-derne, trés riche en terme de contenu pédagogique et qui s’interface trés bien avec le cours"Architecture des Ordinateurs".– 6 heures decours

– 14 heures detravaux dirigés sur simulateur EmBest (les modes d’adressages, les ins-tructions, les structures de contrôles, les appels de procédures, les passages de para-mètres aux fonctions : C –> assembleur, ...)

5. Réseaux (deuxième année de l’ESSI)– 12 heures detravaux pratiques et travaux dirigés sur la programmation réseau

6. Son Image Réseaux (responsable de ce module de 10 heures decours et 30 heures TD etégalement intervenant) (troisième année de l’ESSI)Programme : Les aspects classiques du codage de la voix et desimages sont rappelésafin de s’adapter aux contraintes imposées par le type des réseaux traversés. En ce quiconcerne la technologie des réseaux, nous abordons la problématique des réseaux de com-munications principalement au travers d’Internet en nous intéressant aux protocoles TCP.L’aboutissement de cette partie étant la programmation "Socket" en essayant d’adapter aumieux le choix des protocoles (UDP versus TCP par exemple) autype de données. L’aspect"temps-reel" ou "au fil de l’eau" (streaming en anglais) est pris en compte. Une extensiondu type de données transmises aux document tels que SMIL est également proposée.– 3 heures decours (partie audio et réseaux)

– 12 heures detravaux dirigés (partie audio et réseaux)

7. Traitement du signal : responsable du module “Représentation temps-fréquence”Cet enseignement se déroule en quatrième année de l’école d’ingénieur ESINSA de SophiaAntipolis. Cours commun au MASTER SICOM– 15 heures decours. Le cours présente une approche différente quant à la manière de

représenter les signaux non stationnaires. La représentation choisie fait appel au plantemps-fréquence. Une orientation “pratique” est proposéeen insistant sur les représen-tations des signauxdéterministes

– 15 heures detravaux dirigés faisant appel au logicielMATLAB

J’ai encadré dans le cadre de la troisième année de l’ESSI un projet orienté "maintien à do-micile de patients" permettant le suivi de l’évolution du rythme cardiaque à travers l’acquisitionet le traitement de signaux produits par du matériel POLAR, sous la technologie DirectX.

Année 2005-06Les cours dispensés sont identiques à ceux de l’année 2004-2005.J’ai crée un nouveau cours intitulé "Traitements numériques des signaux Electrophysiologiques"

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en troisième année de l’ESINSA (maintenant Département Electronique de l’EPU) (9 heures decours et 12 heures de TD). Ce cours présente les traitements spécifiques au domaine Biomédi-cal et donne un aperçu de la génèse des signaux electrophysiologiques. Ce cours est commun(option) avec le Master STIC.

J’ai encadré dans le cadre de la troisième année de l’ESSI un projet orienté "maintien à do-micile de patients" permettant le suivi de l’évolution du rythme cardiaque à travers l’acquisitionet le traitement de signaux produits par du matériel POLAR, sous la technologie JAVA. L’objec-tif était la portabilité et l’analyse fréquentielle en temps-réel de la variabilité du rythme cardiaque.

Année 2006-10La majeure partie des cours est maintenant dispensée (charge complète) à l’IUT départementGEII. Je participe aux enseignements (TD et TP, premiere et seconde années) d’Informatique(Langage C), d’électronique analogique et numérique, de traitement du signal (Filtrage). J’en-seigne également en Licence Professionnelle IRI 30h de cours "Panorama des réseaux" et Li-cence ISE 16h de cours de programmation (Langage C)Je maintiens mes enseignements de "Représentation temps-fréquence" et "Traitements numé-riques des signaux Electrophysiologiques" respectivement en ELEC4 et ELEC5 respectivement,à l’EPU. S’ajoute à cet enseignement de référence une chargede TD sur le module "Chaîne detransmission et d’acquisition" en 2007 qui s’est transformée depuis 2008 en responsabilité dumodule complet (Cours et TD) avec gestion des intervenants associés.En résumé, pour l’année 2009/2010 mes responsabilités de modules sont :

– Responsable du module (C 15h/TD 15h) "Représentation temps-fréquence". Quatrièmeannée ecole d’ingénieurs EPU

– Responsable du module (C 15h/TD 9h) "Traitements numériques des signaux Electro-physiologiques". Cinquième année ecole d’ingénieurs EPU.Commun Master "BiologieComputationnelle". Le volume de ce module est passé à 24h, avec gestion des différentsintervenants

– Responsable du module (C 13h/TD 18h) "Chaîne de transmission et d’acquisition". Deuxièmeannée IUT GEII.

2.Présentation synthétique

Une synthèsede la répartition des différents enseignements est présentée dans la figure 2.Tous les enseignements sont en formation initiale et présentielle.II1 : carte 68000 et Pascal ;II2 : assembleur 8086 ;II3 : architecture des ordinateurs (structurede données, structure de contrôle, pipeline, micro-instructions, hiérarchie mémoire, ...) ;II4 :langages assembleur (80XX et 68XXX) ;II5 : assembleur ARM7, sur simulateur ;II6 : LangageC

AU1 : automatique (continu, discret), représentations dans l’espace d’état et TP sur maquettes ;AU2 : automatique (continu, séquentiel), fonction de transfert, régulation, transformée de Fou-rier, ... ;AU3 : Théorie de l’estimation, identification de paramètres pour l’automatique ;AU4 :

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automatique système discret, transformée en Z, filtrage, ...

TS1 : représentations temps-fréquence des signaux déterministes ;TS2 : détection de ruptures demodèles ;TS3 : modélisation des signaux non-stationnaires ;TS4 : traitement du signal, systèmespremier et deuxième ordre, acquisition, filtrage, codage sous-bandes, transformée de Fourier, ... ;TS5 : traitement numérique des signaux biomédicaux, les signaux électrophysiologiques, ...

TR : transmission ;UN : Unix ; RE : réseaux et protocôles de communication, programmationSocket ;TE : télécom ;SC : outil SCILAB ; SI : sons, images et réseaux,téléphonie sur Internet, ...

La lettre à la fin de chaque abréviation signifie le niveau (L, M, D).GL : GEII ; EL : ESSI1 ;EM : ESSI2 ;EM : ESSI3 et ESINSA2 ;SM : ESINSA3 ;DM : DEAARAVIS ; MM : Maîtrise Ingéniérie MathématiqueLa répartition des cours par nature est donnée dans la section précédente sur la période 2004-2010.S’ajoute à cette charge d’enseignement des suivis de projetde fin d’étude, de stage (niveau Ingé-nieur et ouvrier). J’ai encadré 11 stages de Master recherche (DEA). Je co-encadre actuellementdeux stages M2 (Master BioComp Sophia Antipolis et Master Neurosciences Lyon 1) : "Elabora-tion of analytic techniques for the measurement of ciliary beating frequencies" en collaborationavec le laboratoire IPMC et "Analyse polysomnographique des sujets dépressifs" en collabora-tion avec le CHU Pasteur Nice.

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89 92 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03 04 05 06 07 08 0992 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10

II1 GLII2 EL EL ELII3 EL EL EL EL EL EL EL EL EL ELII4 EL EL EL EL EL EL EL ELII5 EL ELII6 GL GL GL GLTR EM GL GL GL GLUN EL ELRE EM EM EM EM EM EM EM GL GL GLTE EM EMSC MMSI EM EM EM EM EM EM

AU1 EM EM EM EMAU2 EL EL EL ELAU3 EM EM EM EM EM EM EM EMAU4 ELTS1 SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SM SMTS2 EM EMTS3 DM DM DM DM DMTS4 EL EL EL EL EL EL GL GL GL GLTS5 SM SM SM SM SM

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2.Direction et animation de formation

– Responsable des relations internationales à l’ESSI pendant 6 ans.– Responsable des stages du DEA ARAVIS de l’école doctorale SPI de l’Université de Nice-

Sophia Antipolis de 1997 à 1998 (deux ans).– Responsable de la filière Vision Image et MultiMédia de l’ESSI de septembre 2002 à

septembre 2005.– Responsable de la filière Traitement Numérique du Signal dudépartement Electronique de

l’EPU de l’UNSA de janvier 2005 à septembre 2006.– Membre du comité de création du parcours international "Biologie Computationnelle"

(http ://www.computationalbiology.eu/) du Master d’Informatique : Fondements et Ingé-nierie. Je fais également partie du comité scientifique de ceparcours. Je suis responsabledesProjets de fin d’étude(PFE) des étudiants inscrits dans ce Master.

– Dans le cadre d’un accord entre des départements d’IUT (Aix-Marseille et Nice) et le MFI(Malaysian French institute), je serai le responsable de ladélégation qui se rendra à KualaLumpur en Mars 2010. Ce séjour permettra de sélectionner lesétudiants malaisiens quiviendront dans les IUT mais aussi d’harmoniser les enseignements.

Responsabilités collectives

1.Présentation généraleLes responsabilités que j’ai eu à assurer lors de ma carrièresont assez diverses. Elles se situentessentiellement au niveau des établissements de rechercheet d’enseignement. La responsabilitéactuelle la plus lourde correspond à ma fonction de directeur adjoint du laboratoire I3S. Elle neconcerne pas uniquement les aspects scientifiques mais également administratifs, en passant parla gestion de projets internes au laboratoire. Une brève description de cette tâche est donnée dansla section "Activité scientifique" mais aurait pu apparaître dans cette section.

– Membre du Conseil d’Administration de l’ESSI pendant 4 ans.– Membre de la Commission de Spécialistes de la 27ième section de l’Université de Nice-

Sophia Antipolis pendant 2 ans, en tant que membre extérieurà la section.– Membre titulaire (membre du bureau) de la Commission de Spécialistes de la 61ième

section de l’Université de Nice-Sophia Antipolis pendant 4ans puis membre suppléantpendant 2 ans.

– membre de la Commission des Relations Internationales de l’Université de Nice-SophiaAntipolis pendant 4 ans

– Membre du Conseil de Laboratoire de l’I3S pendant 10 ans.– Membre supléant du Comité des Projets de l’I3S pendant 7 ans.– Membre du Conseil du Département GEII de l’IUT de Nice Sophia-Antipolis (2006-2008).– Membre du comité de suivi des thèses de l’Université de Bourgogne depuis 2 ans, en tant

qu’exterieur. Dans ce cadre j’assure actuellement le suivide deux thèses.– Membre du conseil scientifique de l’école doctorale EDSTICde l’Université de Nice-

Sophia Antipolis depuis 2 ans.

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– Membre élu du Conseil de l’Institut (équivalent d’un CA) del’IUT de Nice Sophia-Antipolisdepuis 2010.

– Je m’occupe depuis 2009 des comités de sélection de l’I3S enveillant à ce que l’informa-tion circule au sein du laboratoire. Je participe égalementaux comités en tant que Présidentou simple membre.

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Annexes

Liste classée des publications

Ouvrages de synthèse ou participation à des ouvrages de synthèse

[1] Olivier Meste. Contribution à l’analyse de signaux non-stationnaires. application à l’étudede signaux biomédicaux. Septembre 1992.

[2] Hervé Rix and Olivier Meste. "fine structure of ecg signalusing wavelet transform" danswavelet theory and harmonic analysis in applied sciences. Ed. C. E. d’Attelis et E. M.Fernandez-Berdaguer, birkhauser press edition, 1997.

[3] R. Maniewski, T. Mroczka, P. Lewandowski, M. Fereniec, Olivier Meste, K. Steinbach,and Hervé Rix. Influence of myocardial infarction localization on high-resolution ECG intime and frequency domain. Electrocardiology, 2001.

[4] Variability in biomedical signals. In R. Maniewski, O. Meste, and H. Rix, editors,Lecturesnotes of the ICB seminar. Polish academy of sciences, 2008.

[5] Olivier Meste, Hervé Rix, and Gregory Blain. ECG processing for exercise test. InAd-vanced Signal Processing. Springer, 02 2009.

[6] Vicente Zarzoso, Ronald Phlypo, Olivier Meste, and Pierre Comon. Signal extraction inmultisensor biomedical recordings. InAdvances in Biomedical Engineering, pages 95–143. Elsevier B. V., 2009.

[7] Ronald Phlypo, Pietro Bonizzi, Olivier Meste, and Vicente Zarzoso. Using spatial diver-sity in the estimation of atrial fibrillatory activity from the electrocardiogram. InRecentadvances in biomedical signal processing. Bentham Ed., 2010. à paraître.

Publications dans des revues Internationales spécialisées avec comité de lecture

[8] Pablo Laguna, Raimon Jané, Olivier Meste, Peter Poon, Pèrè Caminal, Hervé Rix, andNitish V. Thakor. Adaptive filter for event-related bioelectric signals using an impulsecorrelated reference input : comparison with signal averaging techniques.IEEE Trans.Biomed. Eng., 39(10) :1032–1044, 1992.

[9] Olivier Meste, Hervé Rix, Péré Caminal, and Nitish V. Thakor. Ventricular late potentialscharacterization in time-frequency domain by means of a wavelet transform.IEEE Trans.Biomed. Eng., 41(7) :625–634, 1994.

[10] Eric Bataillou, Eric Thierry, Hervé Rix, and Olivier Meste. Weighted averaging usingadaptive estimation of the weights.Signal Processing, 44 :51–66, 1995.

[11] Olivier Meste and Hervé Rix. Jitter statistics estimations in alignment processes.SignalProcessing, 51(1) :41–53, 1996.

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[12] Piotr Lewandowski, Olivier Meste, R. Maniewski, T. Mroczka, K. Steinbach, and HervéRix. Risk evaluation of ventricular tachycardia using wavelet transform irregularity of thehigh-resolution electrocardiogram.Med. Biol. Eng. & Comput., 38(6) :666–673, 2000.

[13] Olivier Meste, Wrya Muhammad, and Hervé Rix. Estimation of scale factors in presenceof multiple signals : application to SEMG analysis.Methods of Information in Medicine,Special Issue on Biosignal Interpretation III, 39(2) :138–141, 2000.

[14] Dario Farina, Wrya Muhammad, Elena Fortunato, OlivierMeste, Roberto Merletti, andHervé Rix. Estimation of single motor unit conduction velocity from the surface EMGsignal detected with linear electrode arrays.Med. Biol. Eng. & Comput., 39(2) :225–236,2001.

[15] Wrya Muhammad, Olivier Meste, and Hervé Rix. Comparison of single and multipletime delay estimators : application to muscle fiber conduction velocity estimation.SignalProcessing, 82(6) :925–940, 2002.

[16] Olivier Meste, Hervé Rix, and R. Maniewski. An alternative to the classical filtering ofthe ECG signal : a polynomial approach based on shape features. Biocybernetics andBiomedical Engineering, 23(1) :29–41, 2003.

[17] Wrya Muhammad, Olivier Meste, Hervé Rix, and Dario Farina. A pseudo joint estimationof time delay and scale factor for M-wave analysis.IEEE Trans. Biomed. Eng., 50(4) :459–468, 2003.

[18] Hervé Rix, Olivier Meste, and Wrya Muhammad. Averagingsignals with random timeshift and time scale fluctuations.Methods of Information in Medicine, 43 :13–16, 2004.

[19] G. Blain, O. Meste, and S. Bermon. Influences of breathing patterns on respiratory sinusarrhythmia in humans during exercise.Am. J. Physiol., 288 :H887–H895, 2005.

[20] Gregory Blain, Olivier Meste, and Stephane Bermon. Assessment of ventilatory thre-sholds during graded and maximal exercise test using time-varying analysis of respiratorysinus arrhythmia.British Journal of Sports Medicine, 39 :448–452, 2005.

[21] Sofiane Boudaoud, Hervé Rix, and Olivier Meste. Integalshape averaging and struc-tural average estimation : A comparative study.IEEE trans. on Signal Processing,53(10) :3644–3650, 2005.

[22] Olivier Meste, Balkine Khaddoumi, Gregory Blain, and Stephane Bermon. Time-varyinganalysis methods and models for the respiratory and cardiacsystem coupling in gradedexercise.IEEE Trans. Biomed. Eng., 52(11) :1921–1930, 2005.

[23] Balkine Khaddoumi, Hervé Rix, Olivier Meste, Malgorzata Fereniec, and Roman Ma-niewski. Body surface ecg signal shape dispersion.IEEE Trans. Biomed. Eng.,53(12) :2491–2500, 2006.

[24] S. Boudaoud, H. Rix, O. Meste, C. Heneghan, and C. O’Brien. Corrected integral shapeaveraging applied to obstructive sleep apnea detection from the electrocardiogram.EUR-ASIP Journal on Advances in Signal Processing, 2007 :Article ID 32570, 12 pages, 2007.

[25] Aline Cabasson and Olivier Meste. Time Delay Estimation : A New Insight Into theWoody’s Method.IEEE Signal Processing Letters, 15 :573–576, 12 2008.

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[26] G. Blain, O. Meste, Blain A., and S. Bermon. Time-frequency analysis of heart ratevariability reveals cardiolocomotor coupling during dynamic cycling exercise in humans.Am. J. Physiol., 296(5) :H1651–9, 2009.

[27] A. Cabasson, O. Meste, G. Blain, and S. Bermon. Estimation and analysis of the PRintervals during exercise and recovery.IEEE Trans. Biomed. Eng., 56(11) :2675–2683,2009.

[28] P. Bonizzi, M. S. Guillem, A. M. Climent, J. Millet, V. Zarzoso, F. Castells, and O. Meste.Noninvasive assessment of the complexity and stationarityof the atrial wavefront patternsduring atrial fibrillation. IEEE Trans. Biomed. Eng., 2010. première version corrigéesoumise.

[29] S. Boudaoud, H. Rix, and O. Meste. Core shape modelling of a set of curves.Elsevier,Computational Statistics and Data Analysis, 54 :308–325, 2010.

[30] D. G. Latcu, O. Meste, A. Duparc, M. Delay, and P. J. Maury. Temporal and spectralanalysis of ventricular fibrillation in humans.Heart Rhythm, 2010.soumis.

Publications dans des revues Nationales spécialisées aveccomité de lecture

[31] Olivier Meste, Hervé Rix, Raimon Jané, and Pèrè Caminal. Détection battement par bat-tement de potentiels tardifs dans les électrocardiogrammes à hautes amplifications.ITBM,12(5) :517–531, 1991.

[32] Olivier Meste, Alberto Amargos, Georges Suisse, and Hervé Rix. Détection automatiquede fuseaux du sommeil à l’aide de représentation temps-fréquence.ITBM, 19(5) :191–202,1998.

Communications dans des Congrès Internationaux avec acteset comité de lecture

[33] Olivier Meste, Hervé Rix, Raimon Jané, and Péré Caminal. Detection of late potentialsby means of wavelet transform. In11th Annual International Conference of the IEEEEngineering in Medicine and Biology Society, pages 28–29, Seattle, USA, 1989.

[34] Raimon Jané, Pablo Laguna, , Péré Caminal, Olivier Meste, Hervé Rix, and Nitish V.Thakor. Estimation of event-related bioelectric signals using adaptive filtering and signalaveraging techniques. InProc. Intern. Symposium on Biomedical Engineering, pages 316–317, Peniscola, Spain, 1991.

[35] Olivier Meste and Hervé Rix. Recurrent signals variability analysis : application to cardiacmicropotentials. In13th Annual International Conference of the IEEE Engineering inMedicine and Biology Society, pages 637–638, Orlando, USA, 1991.

[36] Olivier Meste, Hervé Rix, and Mario Perrone. Alignmentprocess using correlation- in-fluence of template estimation. In14th Annual International Conference of the IEEEEngineering in Medicine and Biology Society, pages 2730–2731, Paris, 1992.

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[37] Mario Perrone, Barbara Oficjalska, Olivier Meste, and Hervé Rix. Signal averaging en-hancement by jitter deconvolution. InIn 20th International Conference on Computers inCardiology, pages 803–806, London, UK, 1993.

[38] Eric Bataillou, Olivier Meste, and Hervé Rix. Estimation of cardiac action potentialswavefronts. In17th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicineand Biology Society, Montréal, Canada, 1995. CD-ROM.

[39] Olivier Meste, Eric Bataillou, and Hervé Rix. Scaling factor and jitter characterization : anunified approach using mean and variance. In17th Annual International Conference of theIEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Montréal, Canada, 1995. CD-ROM.

[40] Olivier Meste, Eric Bataillou, and Hervé Rix. Statistical study of the delay variance es-timation for the individual and global methods. InIn EUSIPCO Conference, pages 411–414, Trieste, Italy, 1996.

[41] Olivier Meste. Bispectral reconstruction using incomplete phase knowledge : a neuroe-lectric signal estimation application. InICASSP Conference, pages 1913–1916, Munich,Germany, 1997.

[42] Florence Raybaud, Hervé Rix, Vanessa Bodrero, OlivierMeste, and Jean-Pierre Camous.Estimation of shape and scale variations of ECG waves. InWorld Congress on MedicalPhysics and Biomedical Engineering, page 524, Nice, France, 1997.

[43] Georges Suisse, Olivier Meste, and Hervé Rix. Time-frequency analysis of sleep EEG :Application to arousal reactions. InWorld Congress on Medical Physics and BiomedicalEngineering, page 520, Nice, France, 1997.

[44] Piotr Lewandowski, Olivier Meste, Roman Maniewski, Hervé Rix, and Ter Mroczka. Ana-lysis of high-resolution ECG signals using wavelet transform. In XXVth InternationalCongress on Electrocardiology, page 46, Budapest, hungary, 1998.

[45] Olivier Meste, Wrya Muhammad, and Hervé Rix. Estimation of scale factors in presenceof multiple signals : application to SEMG analysis. In3rd International Workshop onBiosignal Interpretation, pages 119–122, Chicago, USA, 1999.

[46] Wrya Muhammad, Olivier Meste, Florence Raybaud, and Hervé Rix. Detection of shapevariation in noisy signals : application to P waves coming from HR ECG records. In3rd International Workshop on Biosignal Interpretation, pages 234–237, Chicago, USA,1999.

[47] Hervé Rix, Wrya Muhammad, Florence Raybaud, and Olivier Meste. Classification ofsignal shapes by two methods : application to electrocardiography. InWorld Congress onMedical Physics and Biomedical Engineering, Chicago, USA, 2000. CD-ROM.

[48] Elena Fortunato, Hervé Rix, Georges Suisse, and Olivier Meste. Combining time-frequency representation and parametric analysis for the enhancement of transients insleep EEG signal. In23rd Annual International Conference of the IEEE Engineeringin Medicine and Biology Society, pages 1800–1803, Istanbul, Turquie, 2001.

[49] Olivier Meste, Wrya Muhammad, Hervé Rix, and D. Farina.On the estimation of musclefiber conduction velocity using a co-linear electrodes array. In 23rd Annual International

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Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, pages 1101–1104,Istanbul, Turquie, 2001.

[50] Wrya Muhammad, Olivier Meste, Hervé Rix, and D. Farina.A novel approach for jointestimation of time delay and scale factor with applicationsto the M-wave analysis. In23rd annual international conference of the IEEE Engineering in Medicine and BiologySociety, pages 1093–1096, Istanbul, Turquie, 2001.

[51] Balkine Khaddoumi, Olivier Meste, Hervé Rix, and Jean-Pierre Camous. Estimation of thefundamental component in ventricular fibrillation signal.In 4th International Workshopon Biosignal Interpretation, pages 283–286, Como, Italie, 2002.

[52] Gilles Malherbe, S. Gallego, Olivier Meste, and Hervé Rix. Digisonic cochlear implantand phonak microlink FM system combination : interest for children. In7th InternationalCochlear Implant Conference, Manchester, Grande Bretagne, September 2002.

[53] Gilles Malherbe, S. Gallego, Olivier Meste, and Hervé Rix. Direction discriminationsystem implementation on the digisonic cochlear implant : adouble microphones speechintelligibility enhancement system. In7th International Cochlear Implant Conference,Manchester, Grande Bretagne, September 2002.

[54] Gilles Malherbe, S. Gallego, Olivier Meste, and Hervé Rix. Noise reduction for cochlearimplant : an overview of the performances of various noise suppression techniques imple-mented on the digisonic cochlear implant. In7th International Cochlear Implant Confe-rence, Manchester, Grande Bretagne, September 2002.

[55] Olivier Meste, G. Blain, and Stéphane Bermon. Analysisof the respiratory and cardiacsystems coupling in pyramidal exercise using a time-varying model. In29th annual confe-rence on Computers in Cardiology, Memphis, USA, September 2002.

[56] Olivier Meste, Balkine Khaddoumi, Hervé Rix, and Jean-Pierre Camous. A comparisonstudy of stationary and non stationary analysis of signal during ventricular fibrillation.In 4th International Workshop on Biosignal Interpretation, pages 107–110, Como, Italie,2002.

[57] Hervé Rix, Sofiane Boudaoud, and Olivier Meste. Clustering signal shapes : applicationto P-waves in ECG. In2nd European Medical & Biological Engineering Conference,Vienne, Autriche, December 2002.

[58] Hervé Rix, Olivier Meste, and Wrya Muhammad. Averagingsignals with random timeshift and time scale fluctuations. In4th International Workshop on Biosignal Interpreta-tion, pages 19–22, Como, Italie, 2002.

[59] Grégory Blain, Stephane Bermon, and Olivier Meste. Assessing dynamic changes in res-piratory and cardiac systems coupling in non-stationary exercise. InIIIrd Federation ofEuropean Physiological Societies Congress, 2003.

[60] Sofiane Boudaoud, Hervé Rix, Jean-Jacques Blanc, Jean-Claude Cornilly, and OlivierMeste. Integral shape averaging of the P-waves applied to AFrisk detection. In30thannual conference on Computers in Cardiology, Thessalonique, Grece, September 2003.

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[61] Gilles Malherbe, Olivier Meste, and Hervé Rix. Acoustic synthesis and methodology forimproving cochlear implant speech processing techniques.In 25th Annual InternationalConference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Cancun, Mexique,September 2003.

[62] Olivier Meste, Grégory Blain, and Stéphane Bermon. Validation of the IPFM model forthe heart rate variability analysis. In30th annual conference on Computers in Cardiology,Thessalonique, Grece, September 2003.

[63] Gregory Blain, Olivier Meste, and Stephane Bermon. Influence of ventilation on respi-ratory sinus arrhythmia (RSA) during exercise. In9th Annual Congress of the EuropeanCollege of Sports Science, Clermon-Ferrand, France, July 2004.

[64] Sofiane Boudaoud, Olivier Meste, and Hervé Rix. Curve registration for study of P-wavemorphing during exercise. In31th annual conference on Computers in Cardiology, Chi-cago, USA, September 2004.

[65] Balkine Khaddoumi, Olivier Meste, and Hervé Rix. Spatial variability analysis of ecgmapping : A shape approach. InISCCSP, Hamamet, Tunisia, 2004.

[66] Balkine Khaddoumi, Hervé Rix, Olivier Meste, Magorjata Fereniec, and Roman Ma-niewski. Measuring spatial variability of P and T wave shapes, through multi channelrecords. Poznan, Poland, 2004.

[67] Olivier Meste, Grégory Blain, and Stéphane Bermon. Hysteresis analysis of the PR-PP re-lation under exercise conditions. In31th annual conference on Computers in Cardiology,Chicago, USA, September 2004.

[68] Sofiane Boudaoud, Conor Heneghan, Hervé Rix, Olivier Meste, and Conor O’Brien. P-wave shape changes observed in the surface electrocardiogram of subjects with obstructivesleep apnoea. In32th annual conference on Computers in Cardiology, Lyon, sept 2005.

[69] Sofiane Boudaoud, Hervé Rix, and Olivier Meste. Providing sample shape statistics withFCA and ISA approaches. InSSP’05, Lyon, sept 2005.

[70] Aline Cabasson, Olivier Meste, Gregory Blain, and Stefane Bermon. A new method forthe PP-PR hysteresis phenomenon enhancement under exercise conditions. In32th annualconference on Computers in Cardiology, Lyon, sept 2005.

[71] Balkine Khaddoumi, Hervé Rix, Olivier Meste, Magorjata Fereniec, and Roman Ma-niewski. Spatial shape variability of ECG waves. InConf Biomed Europe, Prague, Nov2005.

[72] Olivier Meste and Natacha Serfaty. QRST cancellation using bayesian estimation forthe auricular fibrillation analysis. In27th IEEE EMBS Annual International Conference,Shanghai, 2005.

[73] A. Cabasson, O. Meste, G. Blain, and S. Bermon. Estimation, analysis and comparison ofthe PR and RR intervals under exercise conditions and recovery. In IEEE, editor,Compu-ters in Cardiology 2006, Valencia, Espagne, Sept. 2006.

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[74] Vincent Jourdes, Thomas Leroux, Jean-Claude Repetto,and Olivier Meste. Signal proces-sing and stimulation strategies for the digisonic SP and digisonic SP’K cochlear implantsystems. In8th European Symposium on Pediatric Cochlear Implantation, Venezia, March2006.

[75] P. Bonizzi, O. Meste, and V. Zarzoso. Atrio-ventricular junction behavior during atrialfibrillation. In IEEE, editor,Computers in Cardiology 2007, Durham, USA, Oct. 2007.

[76] S. Boudaoud, H. Rix, O. Meste, and Y. Cazals. Ensemble spontaneous activity alterationsdetected by CISA approach. In IEEE, editor,29th IEEE EMBS Annual InternationalConference, Lyon, Sept. 2007.

[77] A. Cabasson, O. Meste, G. Blain, and S. Bermon. A new modeling of the overlappingT wave for the efficient estimation of the P-R intervals during exercise and recovery. InIEEE, editor,29th IEEE EMBS Annual International Conference, Lyon, Sept. 2007.

[78] O. Meste, G. Blain, and S. Bermon. Influence of the pedalling frequency on the heart ratevariability. In IEEE, editor,29th IEEE EMBS Annual International Conference, Lyon,Sept. 2007.

[79] O. Meste, D. Janusek, and R. Maniewski. Analysis of the Twave alternans phenome-non with ecg amplitude modulation and baseline wander. In IEEE, editor,Computers inCardiology 2007, Durham, USA, Oct. 2007.

[80] Pietro Bonizzi, Olivier Meste, and Vicente Zarzoso. Spectral analysis of atrial signalsdirectly from surface ECG exploiting compressed spectrum.In Proceedings of Computersin Cardiology 2008 Computers in Cardiology 2008, volume 35, pages 221–224, BolognaItalie, 2008.

[81] Pietro Bonizzi, Olivier Meste, Vicente Zarzoso, and Ronald Phlypo. Atrial signal extrac-tion in atrial fibrillation ecgs exploiting spatial constraints. In Proceedings of Eusipco2008 Eusipco 2008, volume 16, Lausanne Suisse, 2008.

[82] Pietro Bonizzi, Ronald Phlypo, Vicente Zarzoso, and Olivier Meste. The exploitation ofspatial topographies for atrial signal extraction in atrial fibrillation ECGs. InConferenceproceedings : Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine andBiology Society., volume 1, pages 1867–70, Vancouver, 2008.

[83] Aline Cabasson, Olivier Meste, Gregory Blain, and Stephane Bermon. A Time DelayEstimation Technique for Overlapping Signals in Electrocardiograms. InProceedingsof the European Signal Processing Conference, EUSIPCO European Signal ProcessingConference, EUSIPCO, Lausanne Suisse, 08 2008.

[84] Olivier Meste, Romain Alegre De La Soujeole, and Omar Tala. Hybrid Detector for theTWave Alternans Challenge. InProceedings of Computers in Cardiology 2008 Computersin Cardiology, pages 765–768, Italie, 2008.

[85] Pietro Bonizzi, Maria Guillem, Francisco Castells, Andreu Climent, Vicente Zarzoso, andOlivier Meste. Significance of mixing matrix structure on principal component-basedanalysis of atrial fibrillation body surface potential maps. In Computers in Cardiology,pages 41–44, Park City, UTAH France, 09 2009.

23

[86] Pietro Bonizzi, Martin Stridh, Leif Sornmo, and Olivier Meste. Ventricular Activity Re-sidual Reduction in Remainder ECGs Based on Short-Term Autoregressive Model Inter-polation. InComputers in Cardiology Computers in Cardiology, pages 45–48, Park City,UTAH France, 09 2009.

[87] A. Cabasson and O. Meste. Low-complexity autoregressive modeling of the fast andslow QT adaptation to heart rate changes.Conference proceedings : Annual InternationalConference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society., 1 :5340–3, 2009.

[88] Ghailen Laouini, Aline Cabasson, G. Blain, Pietro Bonizzi, O. Meste, and S. Bermon.Evidence of the Influence of Respiration on the Heart Rate Variability after Human HeartTransplantation : Role of Observation Model. InComputers in Cardiology, pages 409–412, États-Unis d’Amérique, 09 2009.

[89] Olivier Meste, Gregory Blain, and Stephane Bermon. Analysis and processing of heartrate variability by time-frequency representation : Quantification of the pedaling frequencymodulation.Conference proceedings : Annual International Conferenceof the IEEE En-gineering in Medicine and Biology Society., 1 :5–8, 2009.

Communications dans des Congrès Nationaux avec actes et comité de lecture

[90] Eric Bataillou, Olivier Meste, and Hervé Rix. Estimation de multiples différences de tempsd’arrivées à l’aide d’une fonction d’intercorrélation sous contrainte. In15ieme CongrésGRETSI, pages 173–176, Juan-Les-Pins, 1995.

[91] Olivier Meste, Eric Bataillou, and Hervé Rix. Comparaison de deux estimateurs de lavariance relative à des fluctuations d’échelle de transitoires, en présence de bruit coloré.In 15ieme Congrés GRETSI, pages 173–176, Juan-Les-Pins, 1995.

[92] J.P Camous, F. Raybaud, I. Lesto, Ph. Benoit, R. Dauchez, M. baudouy, B. Khaddoumi,O. meste, and H.Rix. Relation entre la période réfractaire effective ventriculaire droite et lafréquence fondamentale de la fibrillation ventriculaire induite chez l’homme. InJournéesdes Groupes de travail de la Société Française de Cardiologie, Paris, March 2003. Parrudans les " Archives des Maladies du Coeur et des Vaisseaux, 2003 ; 96 (3) : 269" (ArchMal Coeur).

[93] D. G. Latcu, P. Maury, O. Meste, A. Duparc, and M. Delay. Organisation intra-cardiaquede la fibrillation ventriculaire chez l’homme - résultats del’analyse spectrale et temporellemulti-sites. InJournées Européennes de la Société Française de Cardiologie, Jan. 2008.

Communications sans actes ou à diffusions restreintes

[94] Olivier Meste and Hervé Rix. Analyse des signaux biomédicaux par les transformées enondelette. InJournées d’étude sur les ondelettes à l’observatoire de Nice, Nice, France,1989.

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[95] Hervé Rix and Olivier Meste. Premiers résultats sur lessignaux tests. InCommunicationau GDR TDSI-GT2, Paris, France, 1989.

[96] Olivier Meste. Détection battement par battement de potentiels tardifs dans les electrocar-diogrammes à hautes amplification. In5ième Forum des Jeunes Chercheurs GBM, Paris,France, 1990.

[97] Hervé Rix and Olivier Meste. Derniers résultats sur lessignaux tests de nice (ecg) et denantes (emg). InCommunication au GDR TDSI-GT2-GT1, Paris, France, 1990.

[98] Olivier Meste and Hervé Rix. Lissage adaptatif de la ptwv. In Communication au GDRTDSI-GT2-GT1, Paris, France, 1992.

[99] Georges Suisse, Olivier Meste, Hervé Rix, and Charles Dolisi. Analyse en ondelettes dusignal eeg ; apport à l’étude de la microstructure du sommeil. In 9ième Journée du groupede Traitement de signal EEG, Rouen, France, 1997.

[100] Olivier Meste, Wrya Muhammad, and Hervé Rix. Estimation of scale factors in presenceof multiple signals : application to semg analysis. In3rd Topical Workshop on SignalProcessing of SENIAM, pages 226–233, Nice, France, 1998.

[101] Wrya Muhammad, Olivier Meste, and Hervé Rix. Estimation of conduction velocity fromsurface emg signals with and without constraints. In3rd General Workshop of SENIAM,pages 107–114, Aachen, Germany, 1998.

[102] Wrya Muhammad, Hervé Rix, Olivier Meste, and A. Liebert. Modélisation du test d’oc-clusion en doppler-laser. In10eForum des Jeunes Chercheurs en Génie Biologique etMédical, pages 96–97, Tours, France, 2000.

[103] Wrya Muhammad, Hervé Rix, Olivier Meste, and A. Liebert. Modélisation du test d’oc-clusion en doppler-laser. Technical Report 2000-14, I3S, 2000.

[104] Elena Fortunato, Hervé Rix, Georges Suisse, and Olivier Meste. Amélioration de l’estima-tion des fréquences pour la détection des transitoires dansl’EEG de sommeil. In11eForumdes Jeunes Chercheurs en Génie Biologique et Médical, Compiègne, France, 2001.

[105] Olivier Meste, Hervé Rix, and Roman Maniewski. Filtrage de l’ecg par approche poly-nômiale adaptée aux caractéristiques globales du signal. Technical Report 2002-39, I3S,2002.

[106] Olivier Meste. Framework for the heart rate variability analysis. modelling the pedallingfrequency : Effect of the jitter and the lack of synchronization. Technical Report RR-07.04,I3S, 2007. http ://www.i3s.unice.fr/%7Emh/RR/2007/RR-07.04-O.MESTE.pdf.

[107] Olivier Meste. Mechanically induced heart rate variability : Analysis andprocessing. In 100th ICB Seminar on Variability of Biomedical Signals.http ://www.i3s.unice.fr/EVENEMENTS/archive.php, Varsovie, Pologne, 2008.

[108] Olivier Meste. Traitement du signal pour le biomédical : Quelquesexemples en ECG qui intéressent la cellule. InJournée BioSTIC de l’I3S.http ://www.i3s.unice.fr/EVENEMENTS/archive.php, Sophia Antipolis, France, 2008.

[109] Olivier Meste. Variabilité dans les ECG. InGDR STIC-Santé, Paris, France, 2008.

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[110] Olivier Meste and Gergory Blain ans Stephane Bermon. Effect of cycling on theheart rate variability : a simulation study. Technical Report RR-08.13, I3S, 2008.http ://www.i3s.unice.fr/%7Emh/RR/2008/RR-08.13-O.MESTE.pdf.

Direction de thèses

– Nombre de thèses soutenues : 7– Nombre de thèses en cours : 2– Liste des thèses soutenues :

[111] Eric Bataillou.Analyse de signaux transitoires bruités : traitement séquentiel et trai-tement vectoriel. Application aux signaux biomédicaux.Thèse de doctorat sciences,mention « sciences de l’ingénieur », Université de Nice-Sophia Antipolis, Octobre1994. 30%.

[112] Mario Perrone.Contribution à la déconvolution de signaux monodimensionnels :méthode de restauration fondée sur l’analyse de forme. Application à la sommationsynchrone de signaux biomédicaux. Thèse de doctorat sciences, mention « sciencesde l’ingénieur », Université de Nice-Sophia Antipolis, Février 1994. 30%.

[113] Georges Suisse.Analyse temps-fréquence des signaux électriques cérébraux. Thèsede doctorat sciences, mention « sciences de l’ingénieur », Université de Nice-SophiaAntipolis, mars 1999. 50%.

[114] Wrya Muhammad.Estimation de retards, de facteurs d’échelle et de variationsde forme de signaux vectoriels : application aux signaux biomédicaux. Thèse dedoctorat sciences, mention « sciences de l’ingénieur », Université de Nice-SophiaAntipolis, mars 2001. 50%.

[115] Balkine Khaddoumi.Analyse et modélisation de l’activité électrique du coeur dansle cas de pathologies ventriculaires. Thèse de doctorat sciences, mention « sciencesde l’ingénieur », Université de Nice-Sophia Antipolis, Juin 2005. 70%.

[116] Sofiane Boudaoud.Analyse de la variabilité de forme des signaux : Applicationsaux signaux électrophysiologiques. Thèse de doctorat sciences et technologies del’information et de la communication, spécialité automatique traitement du signal etdes images, Université de Nice-Sophia Antipolis, Dec 2006.50%.

[117] Aline Cabasson.Estimation et analyse des intervalles cardiaques. PhD thesis,Université de Nice Sophia-Antipolis, 12 2008. 100%.

Leur devenir : [111] (professeur des écoles), [112] (professeur des écoles), [113] (EtantPraticien Hospitalier lors de la thèse, il a conservé cet emploi), [114] (Ingénieur Paris),[115] (Maître de Conférence Université de Tunis), [116] (Maître de Conférence Univ.

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Tech. Compiègne), [117] (Post-doc EPFL).

– Liste des thèses en cours :

[118] Pietro Bonizzi.Atrial activity extraction in atrial fibrillation episodes. PhD thesis,Université de Nice-Sophia Antipolis. 50%.

[119] Ghailen Laouini.Analyse et modélisation du couplage cardio-respiratoire àl’effort.PhD thesis, Université de Nice-Sophia Antipolis. 100%.

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