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Epidémiologie de la résistance : la fin des antibiotiques ? Pr. Vincent CATTOIR Service de Bactériologie-Hygiène hospitalière, CHU de Rennes CNR de la Résistance aux Antibiotiques (laboratoire associé « Entérocoques ») Faculté de Médecine & Unité Inserm U1230, Université de Rennes 1 Email: [email protected] Session « Management du risque infectieux au laboratoire »

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  • Epidémiologie de la résistance : la fin des antibiotiques ?

    Pr. Vincent CATTOIRService de Bactériologie-Hygiène hospitalière, CHU de Rennes

    CNR de la Résistance aux Antibiotiques (laboratoire associé « Entérocoques »)

    Faculté de Médecine & Unité Inserm U1230, Université de Rennes 1

    Email: [email protected]

    Session « Management du risque infectieux au laboratoire »

  • Wright GD. Nature Reviews Microbiology 2007; 5,:175-186

    Découverte des antibiotiques

  • http://www.123bio.net/cours/antibio/modedaction.html

    Mode d’action des ATB

  • Mécanismes de la résistance aux ATB

  • Résistance naturelle : - Existe chez toutes les souches d’une espèce bactérienne

    - Définit le spectre d’activité d’un antibiotique

    Résistance acquise : - Existe chez certaines souches au sein d’une espèce normalement

    sensible à l’antibiotique � non prévisible

    - Peut être transférable ou non entre bactéries

    - Liée à la pression de sélection ATB

    Définitions de la résistance aux ATB

  • Rapport CDC 2013

    Développement de la résistance aux ATB

  • Corrélation consommation ATB et résistance

  • Source : ANSM

    Consommation des antibiotiques en France

    1er plan 2ème plan 3ème plan

    +5,6 %

    -9,3 %

  • http://www.futura-sciences.com/magazines/sante/infos/actu/d/medecine-resistance-antibiotiques-repand-rapidement-29414/

    Conjugaison

    Transformation

    Transduction

    Transfert de la résistance entre bactéries

  • Aux Etats-Unis (2011) :

    Rapport CDC 2013

    Conséquences de la résistance

  • En Europe (2007) :

    Rapport ECDC 2009

    Conséquences de la résistance

  • En France (2012) :

    Rapport ‘Tous ensemble, sauvons les antibiotiques’, juin 2015

    Conséquences de la résistance

  • Rapport CDC 2013

    Conséquences de la résistance

  • � Réseau européen créé en 1998 coordonné par ECDC

    � Participation (2012) : 27 pays de l’UE + Islande et Norvège>900 laboratoires, >1400 hôpitaux, >100 M hab.

    � Surveillance : 7 bactéries (souches invasives) :

    - Staphylococcus aureus (1999)- Streptococcus pneumoniae (1999)- Enterococcus faecalis, E. faecium (2001)

    - Escherichia coli (2001)- Klebsiella pneumoniae (2005)- Pseudomonas aeruginosa (2005)

    Gram +

    Gram -

    Surveillance de la résistance

  • -Souches invasives (méningites et bactériémies Ad/Enf, pleurésies) les années paires-Souches invasives et souches isolées d’OMA les années impaires depuis 2003

    Source : Rapport CNRP 2010

    Résistance chez S. pneumoniae

  • 26%

    S. Aureussauvage

    S. aureus R à lapénicilline (>90 %)

    S. aureus R à laméticilline (SARM)

    Vancomycin-resistantS. aureus (VRSA)

    Vancomycin-intermediateS. aureus (VISA/hVISA)

    Pénicilline G(1950s)

    Méticilline(1970s)

    Vancomycine(1990s)

    Evolution de la résistance chez S. aureus

  • Prévalence du SARM dans le monde (2015)

  • ECDC EARS-Net

    Prévalence du SARM en Europe (2016)

    13,8 %

    Nord

    Sud

  • Akova, Virulence 2016

    Evolution du SARM (2000-2014)

  • � Diffusion mondiale de souches de SARM communautaires PVL(+)(forte prévalence aux EU [USA300], faible prévalence en Europe – saufGrèce)

    SARM communautaire PVL(+)

  • Bensaci & Sahm, DMID 2016

    Sensibilité in vitro des bactéries à Gram + isolées aux EU et enEurope (2009-2013)

    SARM :46% aux EU24% en Europe

    Résistance aux nouveaux ATB

  • Premières souches d’ERV

  • Diffusion rapide des ERV aux EU

    Source : NNIS system, CDCSahm et al., AAC 1989Frieden at al., Lancet 1993

    1st National Guidelines (CDC/HICPAC)

    1st Assessment

    0

    5

    10

    15

    20

    25

    30

    1989

    1990

    1991

    1992

    1993

    1994

    1995

    1996

    1997

    1998

    1999

    2000

    2003

    ICU

    Non ICU

    Vanc

    omycin

    resist

    anc

    e (%)

    1ers cas d’ERV = E. faecalis en 1987 (Saint Louis, MO)1ères épidémies = E. faecium en 1989 (New York City, NY)

  • Prévalence actuelle des ERV aux EU

  • Prévalence actuelle des ERV en Europe (2016)

    Source: EARS-Net, ECDC

    0.7%

    2%

    12%

    39%

    44%

    17%

    *Only blood isolates

    * *

    13%

    2%

    28%

  • Bensaci & Sahm, DMID 2016

    Sensibilité in vitro des bactéries à Gram + isolées aux EU et enEurope (2009-2013)

    Résistance aux nouveaux ATB

    Pas de résistance chez E. faecalis

  • Entérobactéries

    Résistance aux C3GPrédominance des E-BLSE de type CTX-M (depuis 2000),

    notamment chez E. coli

    Résistance aux carbapénèmesEmergence des EPC

    (depuis 2010)

    P. aeruginosa

    Risque de souches XDR et PDR

    A. baumannii

    Diffusion inquiétante de souches ABRI

    Livermore et al. JAC 2007 ; Nordmann et al., EID 2011 ; Canton et al., CMI2012 ; Strateva & Yordanov. JMM 2009 ; Poirel & Nordmann, CMI 2006

    Résistance chez les BGN

  • Résistance aux C3G

    1,9 %

    E. coli K. pneumoniae

    2002 20055,1 %

    ECDC EARS-Net

    201612,1 %

    201630,1 %

    x 6,4 x 5,9Explications :- BLSE (CTX-M+++)

  • Evolution des E-BLSE

    Trystram & Jarlier, Enquête BMR AP-HP 2011

    E. coli hospitalier et communautaire

  • Rapport ANSES-ANSM-SpF, Nov. 2016

    � Disparité importante entre régions

    Prévalence d’E. coli BLSE en France

  • BLSE et tourisme

  • Résistance aux carbapénèmes

    E. coli

    ECDC EARS-Net

    2016

    0,0%0,1%

    2002

  • Résistance aux carbapénèmes

    K. pneumoniae

    ECDC EARS-Net

    2005

    0,1%

    2016

    0,9% 38,0%

    67,1%

    35,8%

    Explications :- EPC +++

    31,2%

  • Types de carbapénémases

  • K. pneumoniae : 59 %E. coli : 34 %E. cloacae : 12 %

    OXA-48 : 78 %NDM : 14 %KPC : 6 %VIM : 5 %

    23 % d’infections

    Bilan InVS 04/09/2015

    N = 2026 cas

    Episodes à EPC en France

  • Répartition des EPC en France

    Bilan InVS 31/12/2015

  • Episodes liés à un pays étranger (48%)

    Bilan InVS 04/09/2015

  • K. pneumoniae NDM-1

    Vers la pan-résistance…

  • Dortet et al., JAI 2016

    Résistance plasmidique à la colistine

  • Rapport CDC 2013

    Diffusion de la résistance

  • Concept One-Health

  • Plan EcoAntibio

  • Boucher et al., CID 2013

    Evolution du nombre d’agents antibactériens (à usagesystémique) approuvés par la FDA

    Nombre d’ATB commercialisés

  • Rapport anglais ‘Review on Antimicrobial Resistance’, Décembre 2014

    Perspectives en 2050

    >100 000 milliards de $

  • Rapport anglais ‘Review on Antimicrobial Resistance’, May 2016

    Thérapeutiques alternatives