Upload
others
View
7
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
Examen final
CHMI 2227F – Biochimie I
Prof: Eric R. Gauthier, Ph.D.
TON NOM: ____________________________
TON NUMÉRO D’ÉTUDIANT(E):_______________
LIGNES DIRECTIVES: 1) Durée: 3 heures
2) 90 questions sur 19 pages.
3) Total de 220 points. Compte pour 45% de la note finale.
4) Questions 1‐89 (choix multiple/vrai ou faux): utilisez la feuille‐réponse qui vous est fourni.
5) Question 90: inscrivez votre réponse directement sur ce questionnaire en vous limitant à
l’espace qui vous est alloué.
6) L’utilisation de la calculatrice (modèle approuvé par l’université seulement) est autorisée.
7) L’utilisation de livres ou notes est strictement interdite.
1
8) Passez de belles vacances d’été!
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
2
CHOIX MULTIPLE. SECTION A. Sélectionnez l’unique meilleure réponse parmi celles proposées. 2 points par question.
1) Le dernier ancêtre commun des organismes modernes devait utiliser A) Des acides aminés D ou L. B) Des acides aminés L. C) Des acides aminés D D) Des acides aminés D et L.
2) Les acides aminés avec une chaîne latérale non‐ionizable sont des zwitterions lorsqu’ils sont
placés ________. A) Dans des solutions alcalines seulementB) Dans n’importe quelle solutionC) Au pH physiologique, pH = 7.4 D) Dans des solutions acides seulement E) Toutes ces réponses sont bonnes
3) La tyrosine et le tryptophane sont moins hydrophobes que la phénylalanine parce que A) La phénylalanine ne possède pas de groupe polaire dans sa chaîne latérale. B) La phénylalanine est un phénol. C) La tyrosine et le tryptophane possèdent un groupe R plus petit. D) La phénylalanine possède un groupe indole. E) Toutes ces réponses sont bonnes.
4) Les protéines peuvent être modifiées en ajoutant ces groupes à des résidus d’acides aminés. A) Sucres et phosphates B) PolypeptidesC) Cystine D) A and B E) Toutes ces réponses sont bonnes
5) Quel acide aminé est idéal pour transférer des protons au sein du site actif d’enzymes dû à la
présence de quantités significatives de la forme protonée et déprotonée de sa chaîne latérale à pH physiologique? A) Lysine B) Cystéine C) Histidine D) Asparagine E) Tyrosine
6) Les valeurs de pKa des groupes α‐carboxyl, α‐amino et de la chaîne latérale de l’arginine sont
de 1.8, 9.0 and 12.5, respectivement. Quel est le point isoélectrique de l’arginine?
A) 7.2 B) 10.8 C) 5.4 D) 7.8
7) La valeur du pKa de certains acides faibles est de 4.0. Quel sera la quantité relative de la forme base conjuguée vs acide à pH 7.0?
A) 3:1 D) 1000:1B) 20:1 E) Impossible à calculer sans connaître la structure de l’acide faibleC) 1:1
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
3
8) Le point isoélectrique de l’alanine est pH = 6.15. On mélange de l’alanine avec de la proline (pKaCOOH = 2.0; pKaNH2 = 10.6), et une goutte de cette solution et déposée sur un papier filtre et soumise à un champ électrique à pH 6.15. Quel énoncé parmi les suivant est vrai?
A) Les deux acides aminés s’éloigneront du point de dépôt de la goutte et seront séparés. B) Aucun des acides aminés ne se déplacera sous l’effet du champ électrique. C) Les deux acides aminés seront séparés. D) Les deux acides aminés ne seront pas séparés.
9) Selon l’équation d’Henderson‐Hasselbalch, lorsque les concentrations des donneurs et accepteurs de protons sont égales, alors :
A) Un sel est formé. B) pKa = log[accepteur de proton]/[donneur de protons]. C) pH = pKa. D) L’acide carboxylique est complètement neutralisé.
10) La structure primaire d’une protéine décrit ________. A) Les angles Φ et Ψ pour chaque acide aminéB) Le nombre de chaque acide aminé (composition en pourcentage) C) La séquence linéaire des acides aminés D) La forme tridimensionnelle globale
11) Le lien peptidique consiste en: A) liaison ester B) liaison éther C) liaison amide D) liaison amine
12) Quelle est la charge nette du dipeptide Arg‐Pro à pH 9.0? Le tableau ci‐dessous donne les pKas des groupes ionisables de la forme libre de chaque acide aminé.
Acide aminé libre pKa
groupe α‐carboxyl pKa
groupe α‐amino pKa
chaîne latérale Arginine 1.8 9.0 12.5 Proline 2.0 10.6 ‐‐‐
A) 0 B) +0.5 C) +1 D) ‐1 E) ‐0.5
13) Sur quel principe est base la séparation des protéines par chromatographie d’affinité? A) La charge nette et le pI de la protéine à la valeur de pH de la colonne. B) La masse moléculaire de la protéine. C) La liaison sélective de la protéine à un ligand présent sur la matrice de la colonne. D) La densité de la protéine.
14) La/le ________ est l’unique forme adoptée par une protéine sous des conditions physiologiques.
A) Énantiomère le plus stable B) Configuration minimale C) Structure primaire D) Conformation native
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
4
15) Quelle est la masse moléculaire approximative d’une protéine contenant 200 acides aminés? A) 20,000 B) 22,000 C) 11,000 D) 222,000
E) Aucune de ces réponses.
16) Les protéines structurales qui s’assemblent en de longs câbles ou cordes afin de fournir un support structural aux cellules ou organismes sont désignées :
A) Enzyme B) Protéines fibreuses
C) Protéines globulaires
D) Sandwich β
17) Que veut‐on dire lorsqu’on affirme qu’une protéine est multimérique?
A) Elle établi in vivo un équilibre entre deux conformations ou plus. B) La forme active de la protéine implique l’association de 2 polypeptides ou plus. C) La protéine possède plusieurs hélices α. D) La protéine possède plus de 50 acides aminés.
18) Quel énoncé n’est pas vrai concernant le lien peptidique?
A) Le lien peptidique est plus long qu’une liaison carbone‐azote habituel. B) La rotation est restreinte autour du lien peptidique. C) L’oxygène du carbonyle et l’hydrogène de l’amide sont plus souvent qu’autrement en
configuration trans un par rapport à l’autre. D) Le lien peptidique possède un caractère double partiel.
19) Lequel des choix suivants représente le mieux le squelette d’une protéine? Note: R = chaîne latérale de l’acide aminé N = azote Cα = carbone alpha C = carbone carbonyl
A) Répétition de N‐Cα‐C B) Répétition de Cα‐C C) Répétition de N‐C D) R1R2R3R4R5
20) Ramachandran détermina les valeurs “valides” des angles phi et psi en considérant principalement ________.
A) L’hydrophobicité des acides aminés B) Les valeurs de pKa des acides aminés C) L’effet des ponts hydrogène D) L’encombrement stérique
21) À quoi vous attendriez‐vous quant à la formation d’une hélice α pour un segment de protéine
qui possède des résidus lysine à tous les quatre acides amines, tous les autres résidus étant principalement hydrophobes?
A) L’hélice ne se formera pas, peu importe le pH. B) La formation de l’hélice sera favorisée à pH élevé. C) La formation de l’hélice sera favorisée à pH faible. D) La formation de l’hélice sera favorisée à pH neutre.
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
5
22) Les structures supersecondaires contenant des combinaisons d’hélices α, de brins β et de boucles
(e.g. clé grecque) sont appelées________.
A) Régions homologues B) Repliements C) Domaines D) Motifs
23) Laquelle des structures supersecondaires suivantes représente une clé grecque?
A B C D E
24) Laquelle parmi les structure montrées ci‐dessous indique la façon correcte selon laquelle les ponts hydrogène se font entre les acides aminés d’une hélice α? (Les lignes pointillées représentent les ponts hydrogènes).
A) I B) II C) III D) IV
25) Les forces principales maintenant ensemble les sous‐unités de protéines oligomériques sont ________.
A) Interactions hydrophobes B) Ponts disulfure C) Liaisons covalentes D) Liens peptidiques
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
6
26) ________ est utilisé pour déterminer la masse moléculaire de protéines oligomériques, alors
que________ est utilisé pour déterminer la masse moléculaire de chaque chaîne.
A) Point de fusion; PAGE‐SDS B) PAGE; Focalisation isoélectriqueC) PAGE‐SDS; RMND) PAGE‐SDS; chromatographie de filtration sur gelE) Chromatographie de filtration sur gel; PAGE‐SDS
27) L’hémoglobine consiste en: A) Un dimère de sous unités, chacun étant formé de deux molécules de myoglobine. B) Un érythrocyte. C) Un tétramère de quatre chaînes de globine et un groupe prosthétique hème. D) Un tétramère de quatre molécules de myoglobine. E) Un dimère de sous‐unités, chacun étant constitué de deux chaînes protéiques distinctes
(alpha et bêta).
28) Contrairement aux réactions de chimie organique classique, les réactions enzymatiques sont A) Généralement stéréospécifiques. B) Modulées par des changements de niveaux d’activité. C) Spécifiques à une réaction particulière. D) Essentiellement efficaces à 100%. E) Toutes ces réponses sont bonnes
29) Un enzyme catalysant la conversion d’acides aminés de série L en acides aminés de série D est appelé ________.
A) Hydrolase B) Isomérase C) synthase D) Synthétase E) Lyase
30) Au tout début d’une réaction catalysée par un enzyme, la ________ est négligeable. A) Disparition de ES B) Formation de ES C) Formation de E + P D) Conversion de ES en E + S
31) Quel enzyme parmi les suivants est le plus rapide? A) kinase, kcat = 103 B) catalase, kcat = 107
C) carboxypeptidase, kcat = 102 D) papaine, kcat = 10
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
7
32) L’enzyme anhydrase carbonique catalyse la réaction suivante: En vous aidant des données réactionnelles suivantes, déterminez le nombre de molécules de CO2 produites par l’enzyme par seconde: [HCO3‐] = 3 mM ; Vmax: 0.12 moles /min ; anhydrase carbonique: 5 x10‐9 moles; Km: 2.6 x 10‐2 M; volume réactionnel: 1 ml.
A) 4 x 105 s‐1. B) 2.4 x 107 s‐1.
C) 6.67 x 102 s‐1 D) 0.08 s‐1
33) Plus la valeur du Km est (faible, élevée), plus l’affinité de liaison de l’enzyme pour son substrat sera (faible, élevée).
A) faible, faible B) faible, élevée C) élevé, faible D) élevé, élevée E) B et C
F) A et D
34) Quel énoncé parmi les suivant est véridique quant à l’élimination d’inhibiteurs réversibles présents dans une solution d’enzymes?
A) On utilise souvent la dialyse ou la filtration sur gel. B) Ces inhibiteurs ne peuvent pas être séparés de l’enzyme sans un traitement avec le
diisopropylfluorophosphate. C) On utilise l’électrophorèse PAGE. D) L’élimination d’inhibiteurs réversibles est extrêmement difficile et ne peut être achevée
qu’après plusieurs étapes de purification.
35) Lequel des équilibres suivants décrit l’inhibition noncompétitive?
A) I B) II C) III D) IV
HCO3- H2O + CO2+ H+
Bicarbonate
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
8
36) Quel type d’inhibition est révélé par le graphique ci‐dessous?
Avec inhibiteur
Sans inhibiteur
A) Noncompétitive B) Compétitive C) Irreversible D) Incompétitive
37) Les données suivantes furent obtenues en présence et absence d’un inhibiteur. De quel type d’inhibition s’agit‐il? Concentration substrat (millimolaire)
v sans inhibiteur (mmol/min)
v avec inhibiteur (mmol/min)
0.100 2.5 1.6 0.200 4.2 2.9 0.500 6.6 5.1 0.750 7.4 6.2
A) Incompétitive B) Irréversible C) Noncompétitive D) Compétitive E) Impossible de trouver le type d’inhibition avec les données fournies ici.
38) Quelle est la valeur du Ki pour l’inhibiteur utilisé dans le problème 37 si [inhibiteur] est de 0.01 mM?
A) 0.0045 mM. B) 0.0082 mM C) 0.022. D) 0.012.
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
9
39) Un enzyme est inhibé irréversiblement par le diisopropylfluorophosphate (DFP). Que peut‐on conclure?
A) Un résidu sérine est très probablement retrouvé dans le site actif. B) L’enzyme a été dénaturé par le DFP. C) Le DFP est un analogue du substrat de l’enzyme. D) Le DFP est un modulateur allostérique de l’enzyme.
40) Deux courbes montrant la vitesse d’une réaction enzymatique en fonction de la concentration de substrat sont présentées ci‐dessous. Une courbe montre la réaction enzymatique en présence d’une substance X. Étudiez ces courbes et indiquez lequel des énoncés suivants est faux.
Avec X
Sans X
A) X est un inhibiteur compétitif. B) L’enzyme ne suit pas une cinétique de type Michaelis‐Menten. C) X est un activateur de l’enzyme. D) X est probablement un modulateur allostérique.
41) Le remplacement de l’acide aminé ________ dans le site actif d’un enzyme a davantage de
chance d’affecter l’activité de l’enzyme que le replacement de ________ dans le site actif.
A) histidine; aspartate B) histidine; leucine C) leucine; histidine D) leucine; isoleucine
42) Lequel des acides aminés suivants n’est pas impliqué dans une catalyse enzymatique acide‐base? A) histidine B) aspartate C) tyrosine D) lysine
43) On détermine qu’résidu histidine est l’acide aminé critique impliqué dans une réaction catalysée par l’enzyme XYZ. Si le pKa de l’histidine est de pH=6.5 au sein du site actif, et que le pH optimal de la catalyse enzymatique pour cette enzyme est de 7.2, quel est le rôle probable de l’histidine dans la réaction catalysée par XYZ?
A) Agit en tant que donneur de protons B) Réduit l’entropie du substrat C) Stabilisation d’un intermédiaire chargé D) Forme un lien covalent avec le substrat
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
10
44) Le rôle de la sérine dans le site actif des protéases à sérine active est d’agir dans une
catalyse________, alors que l’histidine agit dans une catalyse________.
A) faible; forteB) covalente; acide‐base C) forte; faible D) anionique; ionique E) acide‐base; covalent
45) La triade catalytique de la chymotrypsine et autres protéases à sérine active consiste en : A) Trois acides aminés adjacents dans la structure primaire et qui agissent pour convertir un
résidu sérine en un nucléophile fort. B) Trois acides aminés suffisamment rapprochés dans l’espace pour convertir un résidu sérine
en un nucléophile fort. C) Trois enzymes avec des caractéristiques structurelles très similaires. D) Trois sous‐unités d’une enzyme. E) Aucune de ces réponses.
46) L’inhibition de l’ATCase par un nucléotide________ et l’activation de l’ATCase par un nucléotide ________ permet de maintenir l’équilibre dans les quantités de purines et pyrimidines chez E. coli.
A) purine; purine B) pyrimidine; pyrimidine C) purine; pyrimidine D) pyrimidine; purine
47) Lesquelles des bases azotées suivantes sont des purines? A) adénine et thymine B) uracile et guanine C) cytosine et thymine D) guanine et adénine
48) Lesquelles des bases azotées suivantes est la guanine?
N
N
N
N
O
H
H2N
N
N
N
N
H2NN
N
N
NO
H2N
H N
N
N
N O
H
A B C D
49) L’ATP n’est pas un nucléoside parce que________. A) Il n’est pas lié à un sucre B) Il possède trois groupes phosphate au
lieu d’un seul C) Il manque le groupe désoxyribosyl D) Il possède des groupes phosphates
50) Dans l’ADN, le lien phosphodiester est créé entre les groupes hydroxyl du carbone ________ et du carbone ________ des sucres désoxyribose.
A) 3ʹ; 5ʹ B) 2ʹ; 4ʹ C) 2ʹ; 3ʹ D) 4ʹ; 5ʹ E) 3ʹ; 4ʹ
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
11
51) Une grande partie de la stabilité de l’ADN double‐brin est attribuable à ceci : A) L’angle planaire des bases par rapport à l’axe de l’hélice. B) La formation de paires de bases entre purines. C) Les interactions d’empilement entre paires de bases adjacentes. D) Le squelette sucre‐phosphate.
52) Sachant que, pour l’ADN de type B, la distance linéaire entre paires de bases est de 0.33 nm et
que le pas de l’hélice est de 3.40 nm, déterminez combien de tours d’hélices seront présents dans un fragment d’ADN de 1 mm de longueur.
A) 330 B) 3030 C) 294 D) 0.0034 E) Impossible à calculer avec les valeurs fournies.
53) Les régions d’ADN qui peuvent être le plus facilement dénaturées possèdent A) Un plus grand contenu en A:T. B) Approximativement 50% G et 50% C. C) Un plus grand contenu en G:C. D) Une alternance de A et G.
54) Alors que, dans les protéines, les acides aminés sont liés les uns aux autres par un lien
peptidique, les nucléotides sont liés les uns aux autres dans les polynucléotides via :
A) Un lien phosphoanhydride. B) Un lien phosphodiester 5ʹ‐3ʹ. C) Un lien phosphodiester 3ʹ‐5ʹ. D) Toutes ces réponses sont bonnes
55) En référence à un ADN simple brin, l’expression ʺcinq prime vers trois primeʺ décrit :
A) La position des groupes hydroxyls. B) Le carbone 5’ phosphorylé d’un sucre et le carbone 3’ du sucre suivant. C) Le carbone 5’phosphorylé à une extrémité, et le carbone 3’ à l’autre bout. D) La liaison phosphodiester retrouvée dans l’ADN.
56) Lorsque l’ADN de type B est chauffé graduellement, son absorbance à 260 nm
A) Demeure inchangée. B) Diminue. C) Est égale à la moitié de celle observée pour les poly (AT) et poly (GC). D) Augmente.
57) Parmi les énoncés suivants, lequel ne décrit pas une véritable différence entre l’ADN de type B et
l’ADN de type A?
A) Ils forment tous deux une hélice, mais l’ADN de type B est droite, alors que l’ADN de type A est gauche.
B) Pour des ADN possédant le même nombre de nucléotides, l’ADN de type A est plus court en longueur qu’un ADN de type B.
C) L’ADN de type A se forme sous des conditions de déshydratation plus grandes que l’ADN de type B.
D) Les bases azotées ne sont pas perpendiculaires à l’axe de l’hélice dans l’ADN de type A.
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
12
58) Parmi les énoncés suivants, lequel ne décrit pas une véritable différence entre ARN et ADN? A) L’ARN est simple brin; l’ADN est double brin. B) Les sucres de l’ARN sont plus oxydés que ceux retrouvés dans l’ADN. C) L’ARN ne peut pas former de doubles hélices. D) L’ARN contient de l’uracile, alors que l’ADN n’en contient généralement pas.
59) Laquelle des paires de bases suivantes est structurellement correcte:
60) On utilise de l’ADN marqué au14C radioactive comme gabarit (i.e. template) dans une réaction de réplication. La réplication est effectuée dans un milieu réactionnel qui ne contient pas de nucléotides marqués. Après deux rondes de réplication, quel pourcentage des molécules d’ADN seront encore marquées?
A) 25% B) 50% C) 75% D) 100%
61) L’expérience de Meselson et Stahl impliquait la culture de bactéries E. coli dans un milieu contenant du 15N (azote lourd) qui augmentait la densité de l’ADN bactérien. Les cellules ont ensuite été cultivées dans un milieu contenant seulement du 14N. Les échantillons d’ADN ont été récoltés pour analyse après une, deux et trois rondes de réplication (i.e. générations) et centrifugés sur un gradient de densité. La double hélice d’ADN forme des bandes au sein du gradient d’une manière qui dépend de sa densité. Combien de bandes est‐ce que Meselson et Stahl ont obtenu après que les cellules furent cultivées pendant deux générations dans le milieu contenant du14N?
A) Deux, une avec de l’ADN contenant à la fois 15N et 14N, et une avec de l’ADN contenant seulement du 14N.
B) Deux, une avec de l’ADN contenant seulement du 15N et une autre avec de l’ADN contenant seulement du 14N.
C) Trois, une avec de l’ADN contenant seulement du 15N, une autre avec de l’ADN contenant à la fois du 15N et 14N, et une troisième avec de l’ADN contenant seulement du14N.
D) Une seule avec de l’ADN contenant à la fois 15N et 14N.
62) Lequel des ADN simple brin suivants constituerait la meilleure amorce pour la réplication du brin d’ADN ci‐dessous: 5’TAGATAGCTAGATGCGATCCTATCGATATCGCGATATCTAGATATTCTTATCTATCGGAGCG3’
A) TAGATAGCTAGATG B) CGCTCCGATAGATA C) TATCTATCGGAGCG D) CATCTAGCTATCTA
A B C D
N
N
N
N
H2N N
H2N
N O H N
N
N
N
H2NN
N O
O H2N
N
N
N
N
H2N N
N O
O
H N
N
N
N
H2NN
N O
H
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
13
63) Quel est le point de fusion (Tm) de la molécule d’ADN double‐brin suivante? CATCTAGCTATCTA GTAGATCGATAGAT
A) 38oC B) 46oCC) 76oC D) 92oC
64) L’ADN polymérase III requiert ________ pour que la synthèse de l’ADN puisse avoir lieu. A) Amorce d’ARN B) ADN parentalC) Bout 3ʹ‐OH libre D) Toutes ces réponses sont bonnes
65) La processivité de l’ADN polymérase III de E. coli explique tous les phénomènes suivants, sauf un. Lequel?
A) La direction de la réplication. B) Le nombre relativement petit d’enzymes nécessaires pour réplique le génome en entier. C) La vitesse de la polymérisation. D) L’habileté d’une seule molécule de l’enzyme d’ajouter plusieurs nucléotides à la molécule
d’ADN en croissance.
66) L’amorce d’ARN au début de chaque fragment d’Okazaki est éliminée par quelle enzyme? A) ADN polymérase I. B) ADN polymérase II. C) ADN polymérase III. D) La sous‐unité exonucléase 3ʹ 5ʹ de l’ADN polymérase III.
67) Les fragments d’Okazaki sont________. A) De courts bouts d’ADN formés sur le brin retardataire B) Les plus petites sous‐unités de l’ADN polymérase III C) Des fragments de l’ADN polymérase I possédant une activité 5ʹ 3ʹ exonucléase déficiente D) De courtes amorces d’ARN nécessaires à la polymérisation de l’ADN
68) Quelle est la longueur des amorces d’ARN synthétisées par l’ADN primase chez E. coli? A) quelques nucléotides B) 50 nucléotides C) 100 nucléotides D) 1000 nucléotides
69) Les fragments retrouvés sur le brin retardataire sont joints ensemble via l’enzyme ________. A) ADN ligase B) ADN primase C) ADN polymérase I D) ADN synthase
70) La méthode de Southern blot est utilisée afin d’analyser_________ A) Acides nucléiques B) ADN C) Protéines D) ARN
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
14
CHOIX MULTIPLE – SECTION B Sélectionnez l’unique meilleure réponse parmi celles proposées. 10 points par question.
71) Vous désirez déterminer la séquence en acides amine d’un petit peptide. Pour cela, vous digérez le peptide
avec différents réactifs, et vous obtenez les résultats suivants:
1) Hydrolyse avec HCl: A, D, I, K, M, S, T, V, W 2) Digestion au FDNB: A 3) Carboxypeptidase: T 4) Trypsine: a) A, D, K, M, S
b) I, T, V, W 5) Bromure de cyanogène: a) A, M
b) D, I, K, S, T, V, W 6) L’hydrolyse du fragment (5b) avec le FDNB donne: S 7) Thermolysine: a) V
b) W c) I, T d) A, D, K, M, S
8) Chymotrypsine: a) I, T b) A, D, K, M, S, V, W
Combien d’acides aminés retrouvera‐t‐on dans chacun des fragments obtenus après avoir coupé ce peptide avec la protéase V8: A) 4 et 5 C) 2 et 7 B) 3 et 6 D) la protéase V8 ne coupera pas ce peptide
72) Le tableau suivant présente des données obtenues pendant la purification de la lactate dehydrogenase. Quelle étape a permis d’obtenir la meilleure purification?
(Note: coefficient d’extinction molaire du NADH = 6.22 x 103 M‐1cm‐1).
Étape de purification Volume (mL)
Dilution Absorbance NADH @ 340 nm (réaction de 1 min)
Concentration en protéines (mg /mL)
Homogénat 10 1/100 0.323 33.02 Surnageant après précipitation avec 40% sels
8.9 1/100 0.316 31.84
Chromatographie de filtration sur gel
9.1 1/100 0.274 26.51
Chromatographie d’échange d’ions
5 1/100 0.345 12.07
A) Filtration sur gel C) Précipitation aux sels B) Échange d’ions D) La purification n’a pas fonctionné
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
15
VRAI/FAUX. Sélectionnez ʹAʹ si l’énoncé est vrai, et ʹBʹ si l’énoncé est faux.
73) Le point isoélectrique des acides aminés est la moyenne des valeurs pKaCOOH + pKaNH2.
74) Lors de l’électrophorèse en gel, les molécules les plus grosses migreront le plus rapidement.
75) La plupart des protéines contiennent des quantités à peu près égales de chacun des 20 acides aminés.
76) Les vingt acides aminés retrouvés dans les protéines sont les seuls acides aminés présents chez les organismes vivants.
77) Toutes les protéines possèdent une structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire.
78) Une fois dénaturées, les protéines ne peuvent pas se renaturer ou retourner à leur structure native.
79) L’acide ascorbique est nécessaire à la formation de résidus hydroxyproline et hydroxylysine avant que ces derniers soient incorporés dans la molécule de collagène.
80) Le groupe porphyrique (hème) est maintenu en place à l’intérieur des molécules de globine par des liaisons covalentes avec des résidus d’acides aminés spécifiques.
81) L’augmentation de la concentration d’un inhibiteur compétitif classique n’a aucun effet sur la vitesse maximale de la réaction enzymatique.
82) Les modulateurs allostériques forment une liaison covalente avec le site de régulation de l’enzyme, ce qui résulte dans une modification de la conformation de l’enzyme.
83) Les deux brins d’une molécule d’ADN ont le même contenu de chacune des bases A, T, G et C.
84) La grande crevasse et la petite crevasse sont identiques lorsqu’on compare l’ADN de type B et l’ADN de type A.
85) L’ARN ne possède pas de forme double‐brin.
86) Les sous‐unités β de l’ADN polymérase de E. coli forment la « sliding clamp » qui entoure l’ADN au niveau de la fourche de réplication.
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
16
87) Chez E. coli, la réplication débute à l’origine de réplication et procède dans une seule direction jusqu’à ce tout l’ADN soit copié.
88) Les enzymes de type ADN ligase utilisent l’ATP comme co‐facteur.
89) Dans le séquençage de l’ADN, la lecture du gel à partir du bas vers le haut donne la séquence dans la direction 3ʹ‐‐> 5ʹ.
QUESTION À DÉVELOPPEMENT. Donnez une réponse complète à la question suivante. Inscrivez votre réponse directement sur ce questionnaire, en vous limitant à l’espace qui vous est fourni. Compte pour 26 points. 90) Expliquez pourquoi la réplication de l’ADN ne peut se produire que dans la direction
Suite à la page suivante
5’ 3’ et jamais dans la direction 3’ 5’.
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
17
Question 90 (suite)
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
18
Examen final – CHMI 2227F – 21 avril 2007
19