Génomique des Plantes

Spécificités des plantes

Pourquoi les étudier

Génomes des Plantes

Génomique des régulations postranscriptionelles

Les plantes ne sont pas des animaux…

Différences plantes/animaux:- paroi rigide- clivage cellulaire incomplet, continuité cytoplasmique (plasmodesmes)- pas de migrations cellulaires- différenciation cellulaire déterminée par l’environnement (position) plutôt que par l’appartenance à une lignée clonale- morphogenése modulaire et indeterminée

Multicellularity occurs independently in the plant and animal lineages

Plant cells: Totipotency• Most plant cells and tissues can be cultured and organize in new plants

• somatic embryogenesis or organogenesis (shoots and roots)

• zygote not necessary

• not in vitro artefact but exists in nature

Embryon somatique

Cell proliferation

Cell expansion

Specific features of Plant growth: continuous organ production

La production de cellules se fait continuellement dans les meristémes qui produisent des organes de facon iterativeLes cellules subissent ensuite une croissance tres importante par expansion et deviennent photosynthétiques (différenciation) A la floraison, les meristemes végétatifs se transforment en meristemes d’inflorescence -> pas de lignée germinale

plasmodesmata forms symplasmic connections by trapping the endoplasmic reticulum by the cell plate:

Specific features of plant cells: division

Construction de la paroi a milieu de la cellule en division

Cytoplasmic connections: macromolecular (RNA, proteins trafic

promoteur GFP

protein-GFP

Biotechnologie végétale

Les végétaux (algues, plantes terrestres) sont, avec les bactéries photosynthétiques, les seuls organismes capables de faire rentrer le

carbone dans les chaînes trophiques: ils sont donc à la base de toute la production alimentaire (y compris élevage), et d’une bonne partie des

productions énergétiques (bois, énergies fossiles, huiles) et industrielles (bois, papier, fibres, composites, sous-produits divers)

Biocarburants: colza, palmier à huile, microalgues

Domestication ex: le maïs (zea mays)

La domestication à porté sur la sélection de peu de caractéres et s’est accompagnée d’une importante réduction de diversité génétique.Souvent sélection de polyploïdes (plus grande taille des organes) -> perte de la capacité de croisement avec variétés sauvages (blé, hexaploïde; pomme de terre: tétraploïde)